2DZSA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (e103a) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAAAKASGVDGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 91
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzsA00
1TYGA 3C61A 4POCA 3MHFA 1OFPA 1VHNA 3O63A 3PUOA 4W9TA 1WBJA 1YPIA 3KVLA 3QF0A 5I3GA 3P5YA 1KBIA 1FUYA 3W2NA 1TRDA 4MFEA 4CCDA 1ME9A 4NJJA 2W6RA 3M16A 2TPSA 2WSYA 3THQA 5DCEA 3KAOA 3FS2A 5CKSA 4DELA 2CWNA 3MP5A 4G1KA 4Z1DA 1GVQA 1OK6A 3LCGA 3LOTA 3TSDA 4O12A 2VFFA 3W74A 3W86A 5K3VA 2YSWA 2C15A 2CLMA 3OA3A 3C4UA 3S5YA 2WV8A 1EP3A 2NX3A 4K38A 3HBLA 1ZAJA 4O13A 4RZ6A 1JCXA 1VPXA 4MZ8A 1JJKA 3NG3A 3TK7A 3ATZA 4IMFA 3PS7A 4A22A 3MP3A 4FEZA 2WKJA 4C1KA 3G1FA 4NQ1A 4S2BA 5ABTA 2WOQA 1OF6A 1K8YA 3O15A 3Q94A 1ICQA 3QC3A 1JCYA 2WNQA 1JCLA 2VFHA 3IGXA 1I2OA 5BNKA 5K2ZA 1K3UA 4KKXA 4O10A 2B7OA 1W8SA 3HG5A 4WXYA 1OX4A 5EA9A 1TPEA 1WOAA 3DFOA 3TR2A 5BMWA 4BI7A 3TJXA 3B05A 3I6RA 2V81A 1FCUA 4O54A 2J9YA 1OFEA 3GAYA 3NR0A 1G4PA 4N02A 5BMXA 4ZMGA 3PY2A 3T78A 1IXQA 1P4CA 3MI3A 1G4EA 1TPC1 3PBYA 3DH7A 3C2FA 1W1ZA 5F4SA 4E2BA 1OF8A 3LHVA 1DQXA 1R2RA 3TXVA 4RJEA 4Z1CA 4Q4KA 3S1XA 4WX2A 3G3MA 1JUKA 4FX6M 1OFOA 4UFMA 4RR4A 3KRSA 3R13A 2WNZA 3MJYA 1XI3A 2JKEA 4GBUA 4N9EA 1W3IA 1A5CA 2XFWA 3NO5A 2X2GA 3A22A 4BF9A 1GPWA 1PL9A 4HSNA 3O07A 1QMLA 4D2JA 4GNJA 5F4XA 4MJZA 4CCEA 5HWNA 5IM51 3E9AA 3ABOA 3MUXA 4EVZA 5U4NA 1O60A 2OJPA 5A8GA 3FEMA 4DBEA 5LSMA 2VXNA 2Y61A 3TE9A 3LCHA 3W2LA 5CSRA 5K9CA 5F2MA 3LHYA 3TQVA 3W7OA 1JQXA 3PB0A 3W2KA 2BWGA 3QQ0A 4ML9A 1T8XA 3HO8A 4U28A 4NUWA 5K4ZA 3GAKA 5AC8A 1W5QA 1LRQA 1FY6A 3GLCA 1OG0A 1OYAA 5FF4A 4LT9A 3WK2A 2YYTA 3B0VC 1RZMA 2IQTA 2HSAA 2B7PA 3NYZA 4IWWA 3W7JA 1BWKA 4UNLA 5CZJA 3NZRA 2W0UA 3F1QA 3BG5A 4WJEA 1VJIA 4DQWA 2CLHA 3TQ0A 2EKCA 4UUIA 3G0SA 1VYPX 3C2RA 3LXBA 1FXPA 3B4UA 3SZ8A 4O16A 5CZ0A 3UZJA 3GNNA 1A5AA 1F2JA 2QAPA 2V8ZA 4UTHA 1EWEA 3LCLA 1TREA 1A53A 3L5AA 1UBSA 3RFAA 1FXQA 2VC6A 3TDFA 3HGSA 1WBHA 3M5ZA 5LKYA 3N2XA 1XXXA 4UTIA 4GUIA 1GEQA 1XUZA 1IXNA 3CWOX 5KSWA 1OHLA 3ABRA 4JTGA 1JCNA 4P61A 3LI0A 5D2WA 1HG3A 2WJZA 4ZZ9A 1XBXA 5AHNA 1HL2A 3Q58A 3U8GA 3UWWA 2Z6IA 3NM1A 2PRLA 1DL3A 1JCMP 3S0CA 1WXJA 1G7UA 1YLVA 4IMEA 5CPLA 1H1ZA 3QPYA 4IXXA 4RKAA 4JICA 2XN2A 4JTLA 1T96A 1XC4A 3NPUA 2VEMA 4IMDA 2Z0IA 1VQTA 2OX1A 2J88A 3KRZA 3OEXA 3TV8A 1TTJA 2E77A 1OX6A 4UFHA 4JIPA 4IX2A 3PUEA 3IGSA 1RVGA 3C2OA 3GXPA 4O28A 3O06A 3W84A 1QFEA 1QWGA 2J9XA 2FLIA 3GR7A 3C2VA 3S1UA 3LRLA 5HUPA 1JRBA 4GXMA 4LUJA 4E38A 1KV8A 4MLJA 3HIJA 2QCMA 2VEIA 3RLUA 2GJLA 4IOTA 2I9EA 2ABBA 3MWAA 1EIXA 1YADA 1QPRA 1D3HA 4JX6A 1KFEA 1MSSA 5EY5A 2VFDA 4QQ3A 1TSIA 3W7DA 1W5NA 4NNBA 5LGXA 1F05A 4FF7A 5E0KA 4NNAA 3W6YA 3FYOA 1YXYA 5HJLA 1TB3A 4OT7A 1VCFA 3HG3A 4CQ9A 2QCEA 2NXIA 3QJAA 1TTPA 5LHFA 1X6UA 2TSYA 4O8RA 2JK2A 3C52A 3MYOA 1RD5A 2A6LA 2OT0A 4N9BA 5IBXA 3M6YA 2BSLA 4FXRA 4NZJA 1L2UA 4IMCA 3WK0A 3OVRA 2ZZ1A 4IPJA 5KTLA 4UIOA 4YMZA 3NQEA 2EPHA 3DKLA 1A50A 1ALDA 3BLFA 3EKLA 4UTWC 2ALDA 3JR2A 3W7MA 1A5SA 1VZWA 3B06A 1H63A 4LVBA 4RZ4A 3FKRA 3YPIA 1CI1A 4A2RA 1VCGA 4I7UA 1KFLA 4UFLA 4WY0B 1ME7A 1LOLA 1CW2A 1XBZA 3T40A 1GG0A 3W07A 1KM1A 3DFSA 3UNDA 3UWVA 1EA0A 1KFBA 2CZFA 3LCFA 5A5WA 5LNVA 2C13A 2CLEA 3T44A 1M6JA 2NV2A 1P0KA 3MW7A 1KLYA 1ICSA 4OV9A 4PODA 4UXDA 3I65A 2QJHA 3LCWA 1G67A 5AYYA 2WQPA 3W7EA 4BI5A 3HGRA 5FF2A 3FA5A 5IBXC 1SO4A 3NQ6A 3IEBA 3LHTA 2A5HA 3EWXA 4MY1A 3W70A 1YTEA 3DKJA 3GX9A 1AW5A 3W72A 2ZZ6A 2YXGA 3GDKA 5LHEA 1XDLA 2QAFA 1JVNA 4JTEA 2VEPA 3I7SA 4KFNA 1H60A 1N8FA 3P61A 3QEZA 3IRDA 1VC4A 3G1AA 5E93A 2GQ9A 2ZBTA 2OZ0A 2C18A 4R34A 2A4AA 5C54A 1K8XA 1KFCA 3W7NA 1VGAA 3EKZA 3NQFA 5DBTA 1ONRA 1LRNA 3CQ0A 3OIXA 2DP3A 4FIRA 1SW3A 3CLMA 4O53A 5FF3A 2GVLA 1AL7A 4JGDA 1YDVA 3G1YA 3LERA 1LOSA 3SFKA 1VYRA 2FQIA 2BXVA 3W76A 4AH7A 5LGZA 5DCBA 1THFD 3SW6A 2WPBA 4H3DA 1BEUA 1FWNA 5F2LA 4JEQA 4UFKA 1O95A 3CHVA 2H3BA 4LC8A 2E6YA 1ZHAA 5FF7A 2VENA 2ZRUA 3CIWA 1S3HA 3NNTA 3CB8A 1NF0A 2OT1A 1KM0A 4A29A 4IUOA 2ZRZA 3W88A 2H90A 1DKWA 2C19A 2FPYA 3S5OA 1HO1A 3M1ZA 2FTPA 3N73A 4MPQA 2QCFA 1TPDA 3LGEA 4LVFA 4LWWA 1H7RA 5HINA 5FI8A 4CCCA 5AC6A 2O7QA 4B5NA 3G8RA 4Z0JA 4AF0A 2NWSA 1TPFA 1B3OA 5G1TA 4O18A 2CZEA 1OABA 1NFBA 1P5BA 2DZVA 4NXSA 1XUUA 2E5BA 2V30A 3AJXA 1TPB1 2DZSA 2DZXA 3G1SA 4JY9A 5DN1A 3RMJA 3NQ8A 1IIHA 2Z6JA 3HPZA 4FNTA 3NXFA 2ISVA 3TFXA 2V5LA 1PS9A 1RV8A 3T55A 3STFA 1PCWA 2Y63A 1QR7A 3LV5A 1I8JA 3PWAA 4OWGA 4DBDA 4DF0A 3TFCA 3KVMA 1ZENA 1KM4A 3BW2A 2XN1A 4AWTA 3ZWSA 1ZCOA 3LM7A 3O6CA 3ZR4A 4DO4A 3MI6A 4XUGA 2NX1A 1O94A 2WSRA 1YXDA 3P67A 4BFAA 5D05A 3LI1A 3NQGA 4GFSA 5HWJA 1TQXA 3N19B 1ZAIA 2Q8ZA 3H55A 4DF2A 3OVQA 4BWLA 3U6WA 2GQ8A 4Z08A 4ZQNA 2YYUA 4ONVA 2G96A 4XZ9A 3M5VA 4UNKA 2QCDA 3QRHA 2ZCGA 3KVJA 3NGJA 4FIQA 4Z0SA 4I9AA 1GTEA 3GDLA 4IJBA 1ZAHA 4O4WA 1D3GA 1WOBA 1H51A 1ZALA 3HGOA 4JNMA 5CG7A 4AB4A 3QMSA 1YYAA 2ZZ3A 4ZVJA 1KTNA 4NJKA 1T0OA 4UTJA 4CNPA 4GUGA 1OFBA 3R89A 3TW7A 4HKPA 2GPTA 3BGJA 4UMBA 4X2RA 4LVDA 4K39A 4FNQA 3PG9A 4AHOA 1EP2A 5G2WA 5KINA 3UWQA 5F1UA 4CLMA 3DXIA 5DELA 5DY3A 5D33A 3PAJA 2YR1A 5I3JA 3IIPA 1QO5A 4HHPA 2A85A 4XBSA 4BWLC 1DORA 1KLZA 1W3TA 2C14A 3DFPA 5G2IA 1XBVA 3BLIA 4AHQA 3NZ1A 4KFOA 4QNWA 4WZHA 3F4NA 2NXHA 3NL2A 4YCOA 1QAPA 2F84A 2V0TA 3DI1A 4IX0A 4H4IA 2V2CA 4O11A 5K9XA 2GVJA 5DLCA 4UC5A 4GE8A 2Y7EA 4AWUA 3W1RA 3FFSA 3NQVA 2RFGA 3LRKA 5T26A 4WUIA 2X16A 1F6KA 4FX7A 1FWTA 4JTIA 1SFLA 4JTFA 4FNPA 3UWYA 3PF3A 1I4NA 3W1AA 1K7XA 4X22A 2G95A 3W9ZA 1SO5A 4IQLA 2V82A 1Y0EA 2YW4A 1Q6LA 3QMTA 3PULA 1LRTA 1FWWA 4XKYA 4HNTA 2NV1A 2NUXA 2C16A 5D04C 4ADUA 2D73A 3IGUA 3W1LA 2VOMA 5FEZA 1KM5A 4FX8A 3C8FA 3BLEA 4L4LA 4UTKA 3EWUA 3STGA 1UJPA 1H7NA 3DI0A 3P74A 3NQCA 3PC0A 3IVTA 3R2GA 4OHQA 1RQHA 2TYSA 2ZA2A 2R91A 2Y89A 3W7GA 5DY2A 4O17A 2A1YA 5FEWA 1EPXA 1JCJA 1G6CA 3HJZA 3NQ7A 1LM1A 1DHPA 1LLZA 3HOJA 5CPNA 4YWIA 5D30A 3ELFA 3CPRA 2V9DA 3QW4B 3CWNA 4R7JA 4NNCA 3DFQA 5HNRA 3TAOA 4JN6A 2ISWA 1XL9A 4QISA 1LOQA 4WY0F 1MO0A 1TTIA 2E5DA 1KBJA 1OFRA 2QR6A 3HQ1A 4JIQA 1FWRA 3DU0A 3UY8A 3LDVA 4HSOA 3PVFA 2ZZ2A 1DBTA 1K03A 3TAKA 1ZNNA 1W54A 3P62A 1GTHA 2TMDA 6ALDA 1R30A 4MIMA 4BK9A 2RH9A 4ORMA 3S5NA 4GRSA 2PRHA 1QDSA 3W7IA 1X8FA 4UTLA 5HUOA 3TROA 3L0GA 3OG3A 2CLFA 1IGSA 2DJLA 2VFIA 5C2XA 5FEXA 4JYFA 2J6XA 3CC1A 3W73A 1B9BA 2QDGA 4UTMA 2DZTA 2XN0A 4IGHA 3EXTA 3BO9A 1LBLA 1H7PA 1JRCA 1DJQA 3SJ3A 3NPXA 1NAL1 4DXVA 2J9ZA 5EYWA 2Y7DA 4H6KA 1NVMA 4ZQCA 4E2DA 3EWBX 3TIMA 5C5YA 1FCBA 3SGZA 4K37A 4MYXA 2FPTA 1O5KA 3FKKA 4HNUA 1FQ0A 1W5OA 1J5TA 2NUWA 1WAUA 4N2YA 1UASA 1HUVA 3IV3A 4PC8A 2Y88A 1N7KA 4OE7A 3TU9A 1M7PA 2X1RA 1Z42A 1RQBA 3M9YA 4PA8A 5FF0A 3CEUA 4LUIA 4A2SA 1G7VA 1IXPA 1F5ZA 1TPH1 1DV7A 1W37A 5CZSA 3S1WA 3SECA 1JUEA 1Z41A 4R33A 3L9CA 4NT0A 4PH6A 2JKPA 1QOQA 3LXCA 3K30A 4M6VA 2WO5A 4WXZA 2Q3RA 1FDZA 3UXDA 2ZA1A 2YGYA 4NJGA 3HG2A 3NM3A 1PHWA 5SWUA 1GT8A 3BPWA 3Q2DA 3O16A 1PV8A 3PM6A 4EF9A 2CLOA 2YDAA 1VHCA 4RV8A 3H53A 5TIMA 4Y96A 4FO4A 4X3ZA 3I7RA 2GQAA 3M41A 1H1YA 4JTJA 1KM2A 3W7RA 1OFDA 3M44A 2FB2A 4JTTA 2R94A 2E09A 3I7QA 3LX9A 2VKZG 3PR2A 4MVAA 3QM3A 1MEWA 2C0AA 1TRIA 2ZRVA 1LROA 3PG8A 5AYXA 4ADTA 3WJXA 3TMLA 1TMHA 1K7FA 1JULA 1S5WA 2ISSA 3GDRA 5CPMA 4EF8A 1UUMA 3P8IA 3QPZA 3W7QA 3W7PA 5D2XA 1UB3A 2DU2A 3N2MA 3L21A 3TMQA 1BWLA 4GUJA 1HTIA 3MO7A 2LLEA 2ZYFA 3EWYA 4DO5A 4HNVA 3KX6A 3THAA 1DVJA 4LS2A 4JDYA 5FESA 3MI2A 4UR8A 3SR7A 3N9RA 3TA6A 5HWMA 3NPVA 2BLEA 1F74A 1O4UA 1KV5A 1DQWA 2RKXA 1V5XA 1TIMA 3IVUA 4O0KA 2PCQA 5HMSA 3PSWA 1FCQA 4AEOA 4I7VA 4YL2A 4ZQOA 5AHIA 3OHIA 1TCDA 1PE1A 3L67A 1S5TA 1DJNA 3W23A 5KZEA 1IF2A 2X1SA 2ATMA 4LOCA 4LRTA 3TQKA 3M5YA 3S8HA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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