2DZUA

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (d110n) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKEFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVNGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 93
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2dzuA00
3P80A 3GNNA 1DQXA 1VGAA 5FESA 1AL7A 3NAVA 1KBJA 1TSIA 2DZXA 4PCFA 4IPJA 5I3HA 1ICSA 2DJXA 1FWTA 1KV8A 4DF0A 2TMDA 1G6CA 2QCNA 4J9JA 5LGZA 1XBZA 2EPHA 1Z44A 3BO9A 2XN0A 2NUXA 4OE7A 3QH2A 3UXDA 1B4EA 3M5YA 2IQTA 2PRMA 4MOZA 4UFIA 3EXSA 4EWND 3Q58A 3W73A 3DFSA 3VNDA 3BLFA 3MI3A 3PWAA 4O53A 3LM7A 4UTWA 1JCJA 6ALDA 2TYSA 3C2EA 4UNLA 2CZEA 2WOQA 3LRMA 1VCGA 2J6XA 3UZJA 1XKYA 1TPFA 4MZYA 3W2KA 3GKFA 3G24A 1Z42A 1OFRA 3W6YA 1DHPA 4Z08A 3BG3A 1OK6A 2QAPA 3TFCA 5EKYA 1FCUA 3O16A 4MFDA 4ZQNA 1G67A 5D03A 1LTDA 2A7PA 5K4XA 1YXDA 3PB2A 2I9EA 3W7CA 2E6DA 2BWGA 1Y0EA 1VHNA 1QCWA 1PL9A 4AEOA 2YW3A 3RU6A 1LP6A 5AHFA 4YCOA 4TU1A 4Y8FA 2QDGA 3W23A 1UUMA 2E68A 4QM1A 2ATSA 3EWXA 3M16A 3HF3A 3STFA 1CX9A 1LRTA 3MMTA 3V1PA 3MWAA 3RMJA 3STGA 3LHTA 2I1OA 5HR7A 2A4AA 1ZY9A 3RF9A 1WDWA 1ME9A 1XBXA 4QQ3A 4BFAA 4QAIA 3TC7A 2CW6A 4FNTA 3TCEA 1WX0A 2CWNA 4ADTA 1TPB1 3ZWTA 1UJPA 2GVJA 1IXPA 1EWEA 4XKYB 4N2YA 3QMTA 1ADOA 1I2PA 1W56A 3GIYA 4OHQA 2DP3A 1I4NA 2QCHA 2ZRWA 1N7KA 5DBTA 4AF0A 4XBKA 3GZ3A 4BI5A 1AW5A 1JCNA 1GVOA 2Y70A 3CLMA 1WYIA 4KWVA 5FF2A 4HT3A 3FIGA 4DELA 4NJHA 2QUUA 3H53A 4PTNA 1L2UA 4GBUA 3FKKA 2JGYA 3S1XA 4M6QA 1LBMA 4QJ1A 1LRNA 3G8EA 3WFAA 1I2RA 1OX6A 3UWUA 3QW4B 1EP1A 1JR1A 3B8DA 2QCDA 5CPLA 5D2YA 4U28A 3LXAA 4Z0JA 4NQ1A 4FB7A 5K7JA 4XUGA 2E09A 3TAOA 4UR7A 3W3OA 4UTWC 2QCLA 4RXGA 2C14A 4HNTA 5D05A 5I3FA 3I7RA 3QPZA 2C1HA 1A5CA 3W7RA 5AC8A 1W3IA 4AH7A 1EUAA 1X7FA 5DCDA 3S9YA 3L21A 1VCFA 4FNSA 1MEWA 4MVAA 5AN7A 2QJHA 2QJGA 4ADSA 4AHQA 2D73A 3M41A 5F2MA 2X1TA 3MBDA 4GE8A 1I2OA 2ZYFA 4RLIA 4NX5A 3R13A 2C16A 2DZSA 3FLUA 1C9DA 3DENA 5EMUA 3T78A 4ZL1A 2A5HA 3JRKA 1LOSA 1JQVA 1T99A 3NR0A 4JTIA 3L0KA 2B7PA 1V7YA 4LVFA 3HGJA 1LZOA 5AYZA 1X1ZA 5LNUA 4KWWA 1NF0A 4HIBA 1TPVA 1NEYA 3PVFA 3W1QA 3LHVA 3IVUA 1MEIA 3H55A 5K9CA 3A5VA 4GRSA 2QUVA 2BXVA 5TBOA 3W2LA 1RQBA 1PCWA 4UTIA 2CU0A 3LCXA 4JYFA 3UPWA 4JICA 1GT8A 3BLEA 1W31A 3O15A 4O50A 4RZ4A 1FDJA 3W2NA 3A23A 3MP3A 3NGJA 3CC1A 4UCGA 4NT0A 5D30A 1LOLA 3QYQA 2DZWA 4EF9A 1SO5A 2E6AA 4LY8A 5MHBA 5CZSA 5C2XA 5LNVA 3U2OA 2O7QA 3IEBA 1W1ZA 2OMAA 3N19B 4A2SA 3S5ZA 1TO3A 3LBCA 4Y96A 4AMAA 2XFWA 4FIQA 1TCDA 1VLIA 3EX4A 3ABQA 3QMRA 3I7QA 3G1YA 2A85A 4AAJA 1ZALA 1IGSA 2HS6A 3HB9A 5HJLA 2FPYA 2A6LA 4O19A 2ZCGA 3G0UA 1O95A 2Y61A 3AO0A 1VZWA 4EIVA 2TSYA 3N2MA 3CIWA 2C15A 3TIMA 1WBJA 1KM1A 1R2TA 2NX1A 3M0ZA 2TRSA 4M6PA 5HR6A 1JULA 3TR2A 1I45A 3W7QA 1DVJA 3C2RA 1IXNA 2E77A 3QSTA 3G18A 2B7NA 1G4TA 2QEZA 3W76A 4O54A 2YSWA 3EXTA 4L4MA 2QCEA 3DI1A 4FX7A 3GDTA 3UY8A 1W3NA 3SECA 3UWVA 2C19A 1UB3A 3FEMA 4NNCA 1TMHA 2FTPA 2V5LA 4JTUA 3DU0A 3KVMA 1V5XA 1ZAIA 1KFBA 2TPSA 4IMDA 3UPBA 3NYZA 2QCFA 1KLZA 4IUOA 1T0OA 1GYNA 1GYLA 2QCMA 1QPOA 1LLZA 3A22A 5J5RA 3A21A 1EA0A 5LNSA 3HO8A 5D2WA 4JDYA 1TTIA 4FNQA 3L0GA 3HJZA 2QF7A 2WO5A 3LCLA 3EEGA 1PHWA 3RFAA 3TU9A 1A5SA 4POCA 3NPUA 1LORA 4YMZA 5LHEA 4Z1DA 2GQ9A 4N6FA 3N9RA 1K7FA 2A2IA 3MP4A 2DZTA 5DXXA 5K9XA 3STCA 2ZRUA 1EP2A 1S5TA 1SO4A 1RR2A 3KFTA 5BW6A 4FNUA 4ZQCA 1KBIA 3SGZA 2YYUA 3W1TA 1K8ZA 2GVGA 1LOQA 5C55A 4Z1AA 1LBLA 3GXNA 4OBTA 1GEQA 3W74A 2JKEA 4FEZA 2PC4A 4N9DA 3WJZA 1SPQA 4IJBA 2EF9A 2B7OA 4Q32A 4Z1CA 2FQIA 1GPWA 2WSYA 4EOUA 1QPNA 5F2LA 1SW7A 3HQ1A 2DJLA 4JTSA 2FB2A 2ABBA 5DY3A 1FY6A 1OFBA 2QUTA 1AL8A 4IMGA 5G2WA 5AB3A 5KZDA 5CG7A 1TV5A 1DL3A 2R14A 1ALDA 1XBVA 1GVFA 4IMCA 4NNBA 4ZQRA 3T55A 2Y63A 4LUJA 4CQ8A 3PUOA 1JJKA 2ISSA 3FYPA 3L5LA 2WJZA 4NNAA 4FX8A 3G1XA 2WNZA 4BF9A 5D2XA 1ZENA 1HFBA 2X30A 1XUZA 1JCMP 3GB6A 2VEPA 4MUZA 3NQAA 2QDHA 3N3MA 3N2XA 4FF7A 3W2UA 3C56A 1YDNA 4CQ9A 3N73A 4AHOA 4JDBA 4W9TA 1TIMA 1XXXA 3NDOA 4GUJA 1F2JA 3TH6A 2PURA 3W22A 3TSBA 1I2NA 4HNNA 4ZQPA 5CSRA 1K8XA 1P4CA 2Q8ZA 3ATYA 1SQ7A 1X1OA 3KX6A 4WX2A 1ZFJA 4NXSA 3CWNA 1JCLA 1W8SA 3HIJA 3MHUA 3W7IA 3BGGA 3PBYA 3PY2A 3DGRA 3PBWA 4TX9A 2ZDRA 4GJ1A 3VE7A 2PRHA 3NQVA 1A5AA 2FJKA 5FI8A 3SR7A 4H4IA 1ZNNA 1KFJA 1SU5A 1VLWA 4IGHA 3C0JA 4IQLA 4JY8A 4UXDA 2VXNA 5CSSA 1AW2A 2KZHA 1DOSA 3M5ZA 3DHDA 8TIMA 2Z0IA 3DH7A 4NJJA 2NLIA 1O4UA 3I6RA 3F1QA 3MYPA 1VH7A 4CCDA 2G97A 1YLVA 5KITA 4UFHA 1KFKA 4Z1BA 3B03A 3THQA 3QPYA 3E9AA 3RK8A 4ML9A 3LDVA 5FF7A 2GOUA 1B9BA 2Q3OA 2ZBTA 3M44A 4JNMA 4C1KA 3W86A 3UWQA 5TQLA 2A21A 3C2FA 5LSMA 1EIXA 3EWBX 1SW3A 1I2QA 4UMCA 2NXIA 4RX0A 1AW1A 3TXZA 2YZRA 4X2RA 1KFCA 3W72A 3L66A 3P67A 3DXIA 1HG3A 3NQGA 1LLWA 5F4SA 4UTJA 3HBLA 5DXYA 1FWRA 4K6AA 3M47A 4CLMA 1YADA 3TQ0A 4N6EA 5U4NA 5D02A 2YR1A 1KTNA 1G69A 3S0CA 3HGSA 5G4WA 4IMFA 3QEZA 2E5BA 2YDAA 3OVPA 2B7QA 2NV1A 3PSVA 1M7PA 1KTBA 2GJNA 3W88A 3NNTA 2JBMA 2OT1A 3LV6A 4LT9A 4FXSA 2WKJA 3OVQA 2CLMA 3G1AA 3G22A 3PAJA 5EL1A 5DELA 1HL2A 3N34A 4LVAA 1LBFA 1H51A 2J24A 2QCCA 2ZRXA 4NJIA 2NUWA 1E51A 3E12A 1GTEA 3SSJA 1RQHA 1FCBA 4TIMA 4LW7A 1EB3A 4KFNA 1K03A 1F7BA 4N4QA 4O1BA 3NM1A 3A5FA 3KAOA 2BSLA 3EKLA 3GYEA 4NZFA 5D2VA 3CWOX 2E6YA 3MO7A 1J4EA 3EKZA 3S6DA 4O15A 3GDRA 1NAL1 3ABRA 1EP3A 1XM3A 2YFNA 3G1FA 3EWUA 5SWUA 4E0CA 4CCCA 3TJXA 1AK5A 3TMLA 1UASA 4U4MA 4PODA 1OX4B 2ZQ0A 3LCIA 4QIUA 4JD4A 2V2DA 4C1LA 5DCBA 1B57A 1Q6QA 1SO6A 1W5MA 4NXKA 3GVGA 4JTGA 4IPIA 4OWGA 4WOZA 1TTQA 1OFPA 1GQNA 3ABSA 3UQNA 3QZEA 5BRBA 3V75A 1W0MA 3FA5A 1K02A 1TTJA 4OV4A 5HULA 3NQCA 1K3UA 1YTDA 1OFAA 5DCEA 3P5YA 4JTJA 3FJLA 3TV8A 3DFTA 3O6CA 3BV4A 3G0SA 1XBYA 1QOPA 5G1TA 2Z1BA 3KHJA 3L68A 3LB0A 2Y7GA 3L0NA 4CQAA 5TIMA 3SIZA 1GZGA 5IBXA 1G7VA 3P60A 2P0OA 3FYOA 4FNPA 3IIPA 2YFOA 3MW7A 4LS1A 1FXQA 2H90A 3EWZA 3W1LA 4MYAA 2BZNA 3EXRA 1PIIA 2Y7DA 4RR4A 2YPIA 1FCQA 4K36A 3TC6A 5K2ZA 4IOTA 3BW3A 3BPWA 1OF6A 3EX6A 1BTMA 2DORA 3H54A 5L9FA 4CNNA 3UYCA 2DZPA 3LERA 4LVDA 1MSSA 2ZZ7A 3QRHA 1AG1O 1HTIA 2YGYA 3ABOA 4XBSA 1TPH1 3TQVA 4JYEA 3W83A 4DBDA 2A7RA 3NZ1A 4GUIA 3HG2A 3LCFA 4Q33A 2XN2A 1OJXA 4HSOA 2H8ZA 1TPUA 3E49A 1F05A 1WXJA 1Q6LA 4GXMA 5DBUA 3HG5A 1Q45A 4LS2A 1KM6A 2VEKA 3GR7A 1JUBA 1YDOA 2J88A 4DEFA 4G1KA 3QM3A 1PHQA 1LRQA 3WK1A 2OX1A 3MBFA 5F4XA 4LVGA 3KOFA 4AXKA 5AHEA 1DBTA 2ABAA 3W71A 3UD6A 3BW4A 3TMQA 1SZNA 3NQ6A 1H61A 2NXGA 3PF3A 3DFQA 2NX3A 4IXHA 4AHPA 1G4EA 1G4PA 3NQ7A 3OHIA 3TKFA 4LWWA 3OIXA 3PB0A 4PEKA 4FHAA 4N02A 1OFDA 1ZAHA 5I3JA 4NVTA 4K39A 2X2GA 5D33A 1VPXA 3LRLA 1VS1A 2AAMA 3S1WA 1OHLA 3BGJA 4AF0B 2G5WA 1D3HA 4LC6A 4TO8A 3UWZA 4XZ9A 3ELFA 2YXGA 3BLIA 3LLDA 3QMSA 5CPNA 1GG0A 1YTEA 1KM5A 3DZ1A 3PR2A 3HPZA 1JUEA 1OX5A 2X16A 4NUWA 1D3GA 5EPDA 3PM6A 3BARA 1SSGA 2NUYA 3L9CA 4O8RA 2VFGA 3LTSA 3LLFA 4Q4KA 2GJLA 1QNVA 5AHIA 4O52A 2QCDB 2B0MA 2VENA 5GVJA 2A6NA 3W7PA 5D37A 1DJQA 2WNNA 3O6YX 5IBXC 3R8RA 3NZRA 4UTTA 3M1ZA 1LM1A 1IIHA 2BTMA 4IX2A 5BMXA 4UTHA 4WY0F 3T7VA 1PVNA 3DHFA 4JX4A 2V30A 4UFKA 3Q2DA 2RDUA 5CZTA 3P8JA 4LRTA 4BWLA 3W1RA 3G1HA 5K4ZA 1JQXA 3IRDA 1OFEA 3NL5A 3SZ8A 3NL2A 3M5XA 3U6WA 4WD0A 4WUIA 1SFJA 3WJYA 4RJEA 4EVZA 2H3BA 4O12A 5AHLA 2Y62A 4UFMA 4LV4A 3KXQA 3W87A 1DKWA 4MZ8A 5ABTA 1RQEA 3EX1A 2VFIA 3TROA 4RKAA 4O1DA 1TQXA 3C8FA 2ZFAA 3WJSA 3LOTA 1FBAA 3NO5A 2CLLA 1XCFA 3T4CA 1EEPA 1XC4A 5LKYA 1TV8A 2A1YA 3G1VA 4NU7A 2ALDA 4EF8A 5H2ZA 2C3ZA 3IIXA 2ZA3A 3UY7A 4GFSA 4LV9A 2BLEA 2E5DA 1G7UA 4Y6GA 2VFFA 4O14A 2GUUA 2NWRA 4M7TA 2R94A 1WOBA 1TPC1 5KZMA 3O06A 2Z6IA 3UWWA 3C2OA 3BK0A 3G0XA 4XTDA 4LVBA 4R33A 4PL2A 3T40A 1F74A 4FNRA 3EX3A 1QOQA 4JN6A 3CTLA 5HQEA 1A50A 4MJMA 4O13A 4DBEA 3CU2A 3HG3A 5T26A 3ZR4A 3B0PA 3R2GA 2CZDA 3LHUA 4JX6A 2PRLA 1WQ5A 4TMCA 4JTEA 3N9SA 4O10A 3QQ0A 1SR9A 2ZZ5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GNN A;  1DQX A;  3K1D A;  5FES A;  1O12 A;  4Y2W A;  1Q13 A;  1XDJ A;  1EZW A;  3AXI A;  4PCF A;  3AWN A;  4KIR A;  1ICS A;  1TJ0 A;  3HPF A;  2VGG A;  3CK5 A;  1FWT A;  2WVV B;  4W5U A;  1W1V A;  2QCN A;  2EPH A;  1Z44 A;  1JG9 A;  2NUX A;  4J3T A;  3UXD A;  1UR9 A;  1B4E A;  1W9P A;  2IQT A;  2PRM A;  4UFI A;  3W73 A;  3G6M A;  3BLF A;  3PWA A;  4XD4 A;  3ZR6 A;  1DPM A;  4AD3 A;  5CLT A;  2O9R A;  2J6X A;  3FAX A;  5M17 A;  1EJW C;  1XKY A;  1Z8A A;  1J8V A;  1UD5 A;  3PZV A;  5XIM A;  3F5K A;  1XYF A;  3TFC A;  2PLM A;  1PZ0 A;  2REQ A;  5LXE A;  1WDS A;  3UR7 A;  1NAR A;  4G7F A;  1CIU A;  4EE9 A;  5A2B A;  4MWA C;  5D03 A;  2XM2 A;  8CGT A;  3SSZ A;  1LTD A;  3KRB A;  3GC5 A;  1Q6G A;  1SMD A;  3W82 A;  1Y0E A;  1VHN A;  3IJQ A;  1MXG A;  4GIN A;  4AEO A;  1UHV A;  3EWC A;  5AHF A;  4YCO A;  3APG A;  3W23 A;  4C91 A;  2PDI A;  2ATS A;  3TN6 A;  2VRK A;  1F3W A;  3STF A;  1E6Q M;  2WC7 A;  1XLL A;  3MWA A;  4YS1 A;  3UFY A;  1P7T B;  2A4A A;  2VEF A;  3T42 A;  1XBX A;  3VKA A;  4H41 A; 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