2E09A

Structure of mutant tryptophan synthase alpha-subunit (e74a) from a hyperthermophile, pyrococcus furiosus
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
248
structure length
244
Chain Sequence
MFKDGSLIPYLTAGDPDKQSTLNFLLALDEYAGAIELGIPFSDPIADGKTIQESHYRALKNGFKLREAFWIVKAFRRHSSTPIVLMTYYNPIYRAGVRNFLAEAKASGVDGILVVDLPVFHAKEFTEIAREEGIKTVFLAAPNTPDERLKVIDDMTTGFVYLVSLYGTEEIPKTAYDLLRRAKRICRNKVAVGFGVSKREHVVSLLKEGANGVVVGSALVKIIGEKGREATEFLKKKVEELLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of mutant tryptophan synthase alpha-subunits from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pyrococcus furiosus
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 94
structure length 244
sequence length 248
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2e09A00
4RXFA 1JR1A 3WJZA 4JGDA 1IXNA 4GWEA 2EAWA 4WY0F 2ZTKA 4M6VA 4NJJA 3CLMA 1FDZA 1IIHA 1YPFA 1SZFA 4OWGA 5AHLA 4FB7A 5BW6A 1BWKA 4AEOA 1FCBA 3NEVA 3W7CA 3T44A 2IQTA 1TB3A 1OFPA 1GQNA 1GWJA 1ZAJA 4AB4A 3S8HA 3O63A 2YFNA 3P8IA 3L0KA 1OF8A 2WSRA 2ZZ5A 4OT7A 3G22A 1XDLA 1BEUA 3G0SA 3GNNA 3NNTA 5BRBA 4UTUA 2C19A 4UR7A 4CCDA 3LXCA 5U4NA 4K8HA 2W79A 1TSIA 4N6EA 2C15A 4UMCA 1L9WA 3EX6A 3I65A 3INPA 4I7UA 3S0CA 4Z1DA 1FY6A 4LNYA 1FCQA 1PV8A 2X2GA 3UXAA 4LWWA 3TK7A 4WY0A 5CZTA 4HKPA 2DZVA 4GBUA 4C1KA 1GG1A 1YDNA 2A0NA 2QR6A 1I2NA 4QITA 2OJPA 4O0ZA 3STGA 2TMDA 4YLWA 3FEMA 1NF7A 4AAJA 1RV8A 2ISSA 3TQKA 1S5WA 3H54A 3LTSA 4TIMA 4JEQA 4RR4A 1S3HA 1R2TA 2E09A 5C6MA 1OX4A 3M1ZA 1M6JA 4NX5A 3OIXA 1LYXA 4GE8A 4GJ1A 5D2VA 2DU2A 1LZOA 2FPYA 1EWEA 3QSRA 3EX3A 2Y7DA 4LTSA 1SSGA 2TYSA 4IMCA 2ZRWA 5HJLA 1HFBA 5F1VA 1G4SA 4BK9A 1AW2A 4JIPA 3LLFA 2NWRA 5EA9A 2X1RA 2R94A 5G2WA 3DFQA 3LOTA 1GVRA 1SW7A 1ML1A 3KHJA 2C0AA 3W2MA 1YPIA 3GDLA 3G1HA 4HN4A 1K7FA 2JGQA 1ZALA 4O52A 2Y85A 1U5JA 1X6UA 1SO5A 3LCFA 1VLWA 4JY8A 3HOJA 4M7SA 1EPXA 5K9XA 1M7PA 5C55A 1S5TA 2CU0A 5F4WA 5C5YA 3LHZA 3MP3A 5DBUA 4M19A 1EUAA 4G1KA 3BG3A 4UTLA 3TW6A 4NNAA 3WK0A 1NFBA 3G0XA 1TPDA 1ZAHA 5DCEA 2JKEA 3L67A 3W7GA 1PCWA 1RQEA 2YSWA 4O54A 2BXVA 1W31A 5TBOA 1TPEA 1SW0A 3TSMA 4M7TA 5F2LA 3LI1A 1LOQA 3TC7A 4QISA 4NJIA 1W3TA 4WXZA 4AWTA 1DOSA 3CQ0A 1XCFA 2NV2A 2QJHA 5KITA 5CZSA 1I2RA 4O4WA 4O12A 5I3FA 3UQNA 1TPUA 2DORA 4EOUA 4S2BA 4JTGA 1MEWA 1SO3A 5AC8A 4MFDA 3PC0A 3L9CA 2HMCA 1KTCA 1JRCA 2V9DA 2JKPA 3TUUA 5K9DA 1KFKA 3CTLA 4NJGA 3LCWA 1UUMA 3W1AA 2WJZA 1OFQA 3CC1A 1JCYA 1UCWA 4HNVA 1W5MA 1SZNA 4O17A 5CGQA 4JN6A 1G67A 3UY7A 4ZQRA 3TW7A 4ZQOA 5KZDA 1KFJA 1LCOA 5FF4A 1H7NA 2ZRYA 4GFSA 1ADOA 3CT7A 3S42A 2QUVA 3VFLA 3GXTA 3CEUA 2ZDRA 4LV4A 3V75A 5H91A 3N2MA 3CPRA 3R89A 3DKLA 2OT1A 3AO0A 3PUDA 4JTJA 5I3HA 3LHUA 5D38A 1HG3A 2QCEA 5KSWA 3L0NA 3NO5A 3C2OA 2V30A 1OK4A 2QCDA 3TC6A 3IVSA 4MYAA 1OX6A 4CQ8A 1OFOA 2EF9A 3W75A 4N9BA 3USBA 1JULA 2QEZA 4O11A 4PL1A 1ZCOA 2ZA2A 1BTMA 2ZRXA 4WZHA 3NAVA 3W85A 1G4PA 3P84A 5HWNA 1IF2A 1KTBA 4AXKA 3MHGA 1ZNNA 3QFEA 5G4EA 1K03A 1NSJA 1DBTA 4FNSA 4ZQCA 4K7YA 1PVNA 4K39A 1T0OA 3LDVA 3K30A 1AL7A 3KFTA 4I9AA 1KM3A 3M44A 2GVGA 3IGSA 4H4IA 4MJMA 3NL6A 1FUYA 2B0MA 4RK8A 4MZYA 4WJEA 4K37A 5CPOA 4BFAA 5IM51 3TROA 1M7OA 2A1YA 1TV5A 2R91A 1A5SA 3EB2A 3NA8A 1I2OA 3TXVA 3PVFA 3IEBA 2DZXA 5EMUA 1AL8A 3G1SA 3QC3A 3EKZA 3W6YA 1Z41A 4K38A 3O1NA 2E6AA 2YR1A 3NXFA 4PEKA 1L6WA 4HSOA 5AHFA 4FEZA 1RPXA 3D0CA 4GUHA 3BW4A 3KVJA 4ALDA 1F74A 4DPPA 1W1ZA 4NZJA 4M5PA 1OYCA 2CZEA 4Z08A 1OABA 1BKSA 2HS8A 3F1QA 5EBUA 4NXKA 2J6XA 1DJNA 3HG5A 3G1VA 4YWIA 4GRSA 1W56A 2Z1BA 2WSQA 4FIRA 2NWSA 1Z42A 3LX9A 2V8ZA 3NQ7A 3C2FA 3DFOA 3E0IA 3W74A 3W1MA 5LGZA 3R8RA 3I6RA 1N55A 3ABRA 4N02A 1D3HA 2NV1A 1OFRA 3GK0A 4DF0A 4NX0A 1HO4A 3QEZA 3C8FA 4ORMA 4UTIA 3UWZA 2E5BA 4MOZA 3KVKA 2FB3A 3O07A 1XUZA 4AWSA 4NVTA 2VENA 2QJGA 2VFEA 4ML9A 3RLVA 5D33A 4Z0SA 3LHTA 3M5XA 4NQ1A 3QSTA 2VKZG 1QPNA 4ADSA 1FWSA 1F6KA 2NZLA 2VFDA 3DFPA 3NDOA 4QJ1A 1HUVA 3B0UX 4W9TA 4IMEA 3N19B 3CEPA 3PF3A 2CW6A 3ZWSA 4YCPA 2CZDA 3QZEA 1OFBA 5L9FA 4NUWA 4C1LA 5MHBA 3THAA 2WNZA 4DXVA 4QM1A 4FIQA 3BV4A 5HUPA 2DZSA 3P74A 4E38A 3NQDA 2W0UA 2PCQA 3TCEA 3KRZA 3W88A 3CHVA 2NLIA 1KLZA 5CKSA 3W2NA 1FXQA 3FJ6A 3GNDA 3W7JA 1DL3A 4IXHA 2J9YA 5AFDA 3OBKA 3GLCA 5BMWA 1W5NA 4LC6A 1I45A 4N4QA 1QCWA 3SFKA 3FKKA 1VHCA 2DZWA 3DFTA 1SU5A 3GR8A 1GVQA 3M5ZA 3MI2A 4LOCA 5FI8A 4Q32A 2TSYA 3LCIA 2NUYA 4GNJA 3W9ZA 3EEGA 4TMBA 2JK2A 2ZYFA 2GQ8A 3B4UA 4JTSA 2VEIA 3W83A 3N34A 3I7SA 3T78A 2NX1A 3IIPA 3NL2A 3UWVA 4U28A 4JYEA 3O06A 1YTKA 2A21A 4DO6A 4MYXA 4Z1AA 3MUXA 3TSBA 1T8XA 3S5OA 3W7OA 4IPJA 4EVZA 2PRHA 1SZGA 4IXXA 3T7VA 3L5LA 3OEXA 2Y7FA 3VNDA 3MHUA 4NT0A 3SW6A 4UFMA 1UUOA 1JCMP 2GUUA 2OT0A 4LW7A 5IBXC 1TPH1 5LSMA 3W2JA 4FF7A 2E77A 1B3OA 1K8ZA 4FX7A 1XBVA 4XTIA 1W0MA 3H55A 4X9SA 2BSLA 3W1QA 2P0OA 2J27A 1KFBA 4O15A 3M16A 5D04C 2CLLA 1DKWA 2VEKA 3G1YA 1F76A 4NXSA 1L6YA 1P5BA 3FJLA 4O1CA 1Q45A 4HNNA 3S5NA 3HBLA 3G24A 1F05A 3DXIA 2R14A 3VCRA 3OHIA 3UPBA 4RZ6A 4GXMA 3M47A 1ME9A 1A50A 2QCFA 1UASA 5AOUA 3BW2A 2Q8LA 1YTDA 2E5CA 2YZRA 4N4PA 1OFDA 1GTHA 3KX6A 4LRSA 4WUIA 4UFIA 5D2WA 1K7XA 4MVAA 3NG3A 2O7QA 4BWLA 1OX4B 2ATMA 3L5MA 2A85A 5DCDA 5D09A 2Z6IA 1TPFA 3WFAA 4LC8A 3OVQA 1KTNA 3E49A 4IPIA 3GKFA 1YXCA 1NAL1 1WV2A 5CPMA 4HPJA 1WOBA 3L2IA 1KM2A 3EWWA 5KZMA 1JUEA 1VJIA 3MWAA 3N2XA 2X1UA 1THFD 4UUIA 3NQ8A 1RQBA 3LHVA 1LLWA 4A21A 2XFWA 4OE7A 4FNTA 4EWND 1TQJA 3NL3A 3SSJA 2D73A 3RFAA 3S1UA 3EKLA 3I7QA 3IRDA 4O13A 1Q6RA 5AHIA 3HGOA 5DY3A 2C3ZA 1ICPA 3TIMA 3E9AA 5I3IA 4DO4A 1N8FA 4O8RA 4DELA 1LM1A 1VYSX 3DFNA 3EWYA 4UNLA 3FYOA 4K6AA 3A5VA 1GT8A 4NJKA 4FNUA 4GUFA 2RFGA 3WJWA 3B03A 3M6YA 3LM7A 3FOKA 1E51A 1SSDA 4JIQA 2VFFA 1LOSA 3VE9A 2E5DA 3W2UA 4JR5A 3PR2A 1SW3A 1TV8A 1EP2A 5D2XA 1ZHAA 4DF2A 3LHWA 1GYLA 3BLFA 5AYXA 5HNRA 4O53A 3QMSA 1QOQA 5HULA 3KRUA 1EP1A 4R33A 3PY2A 3MW7A 2WKJA 3OG3A 3TU9A 5I3GA 2ALDA 4ORIA 3QQ1A 3TJXA 2YYUA 3KOFA 4LUJA 1WQ5A 1YYAA 5K4ZA 1R46A 5AN7A 2G5WA 3IIVA 3W7MA 3W7EA 2VC6A 2J24A 3TR2A 1GEQA 3IGXA 2PRMA 4FHAA 2B7PA 1X1OA 3EX2A 1XBXA 4O10A 2WQPA 2RKXA 1Z48A 4XBSA 4IOTA 1DORA 3PBYA 5L6UA 5D30A 1H7WA 5C54A 1UBSA 2A7PA 4A22A 3B05A 1B57A 4RLIA 2DJLA 5E1QA 3W7LA 2OMAA 1W8SA 1KW1A 4IMFA 1DJQA 3QJAA 1F5ZA 1PL9A 1LROA 3NQ2A 4XZ9A 3KVMA 1G6CA 2FPTA 2V2HA 1B9BA 4XQ6A 5AYYA 5BNKA 1ME7A 4D2JA 3MYOA 2F7FA 5LNVA 4J9JA 2CZFA 4YCOA 3PB2A 2OCZA 3LLDA 2NUWA 2G96A 4X3ZA 4HNUA 1LBFA 4O1BA 1FXPA 4X2RA 1TO3A 3W71A 4OU1A 1WDWA 1X8FA 3O15A 2QCDB 1AK5A 3HO8A 4ADTA 1FDYA 2V5BA 3MI6A 4E2BA 2CLFA 4WX2A 3MP5A 3NPVA 2WO5A 3NYZA 1SFJA 6TIMA 5LGXA 1OYBA 3NQMA 1WXJA 4LVAA 3W1NA 5K3VA 4EF8A 1XDMA 2X30A 3S5YA 3FYPA 3GDTA 4O4VA 1PHQA 1GG0A 1LP6A 1EWDA 3BW3A 5AYZA 4S1FA 5HWJA 3M7WA 2A7RA 3PWAA 5TIMA 1KLYA 3W7DA 5D2YA 1VYPX 3YPIA 1TPVA 2B7QA 3SGUA 3ATYA 3NQCA 2KZHA 3NGJA 1NF0A 3DH7A 1EB3A 2OX1A 3UWQA 4WOQA 3TFXA 1W5PA 5LKYA 1CI1A 3UD6A 2YW4A 1JQVA 3W7IA 1R47A 2VFGA 4DPQA 5A5WA 1J4EA 3TFCA 4MJZA 1I8JA 1ZFJA 3M41A 5F2IA 4XKYB 1GTEA 1D3GA 1KFEA 4BI6A 5A8GA 5G2IA 4N2YA 3U2OA 1TCDA 4LS2A 5DY2A 4P2VA 2JGYA 1RQHA 5HR7A 4NNBA 3LXBA 4KFNA 1EA0A 3N73A 3B0PA 5LNRA 1H62A 1U83A 3NPXA 2Z6JA 1GJPA 3EWXA 3QPYA 4PL2A 1W54A 4DO5A 3WJYA 4UTKA 2G95A 4S2CA 1IIGA 1GYNA 3PUEA 2E68A 1YTEA 4Y9AA 1WX0A 3MHFA 4IX0A 3P5YA 2C6QA 1KBIA 2X16A 3CU2A 2H3BA 2RH9A 3HG3A 5G1TA 1YLVA 3PB0A 5GVJA 2FQIA 3E12A 1TREA 2A6LA 2ZCGA 3LV5A 2ZZ4A 1Q3NA 1TQXA 3DGRA 2WOQA 3C61A 2Q3RA 3UXDA 2Q8ZA 3BPWA 3W87A 2NUXA 3RMJA 4DBDA 2J9ZA 3G18A 3UPWA 1TJRA 3EWBX 3NVTA 3W07A 3MYPA 4PODA 4RX0A 3C2EA 1VH7A 3JR2A 4MY9A 3C0JA 3KRSA 3L68A 3PG8A 3FLUA 3SR7A 4XKYA 4KFOA 4MUZA 3DENA 4UTWA 1XUUA 4UMAA 2Q3OA 3SZ8A 3EXSA 3T40A 5FF0A 4RV8A 2HSAA 5K2ZA 3ANYA 3SI9A 3W22A 4WOZA 3QRHA 1UB3A 3HPXA 2QCGA 2RHGA 3M5YA 1TTPA 3C3NA 4GC4A 4FXRA 2F84A 1TJPA 3BGJA 2A2IA 4AHOA 5EYWA 3TKFA 5J5DA 4PC8A 3S5ZA 5BOOA 3HG4A 4R7JA 3ZWTA 5AHMA 3QW3A 4WXYA 3EXTA 1QWGA 1QAPA 4K8EA 4JNMA 3DU0A 2FTPA 1OFAA 2GVLA 4OV4A 4B5NA 2DJXA 5CPNA 2A5HA 2FB2A 2FLIA 2ZZ2A 3GAYA 3MBDA 3BG5A 1ZAIA 1OF6A 2QUUA 3GAKA 1MZHA 3C56A 3P62A 3W23A 3JS3A 1TPC1 3QYQA 1IXOA 3PULA 2DZPA 5F4SA 2ISVA 3GIYA 2JBMA 1VCVA 3EWZA 1VS1A 2FDSA 3S1VA 2JKAA 3JRKA 5D37A 3AJXA 4AHPA 3BLEA 3HPSA 1ZENA 2ABBA 3S9YA 1H7OA 4MLJA 3HGRA 4IMDA 1KM5A 2NX3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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