2EAWA

Human ump synthase (c-terminal domain- orotidine 5'-monophosphate decarboxylase)
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human UMP Synthase (C-terminal Domain - Orotidine 5'-Monophosphate Decarboxylase)
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
total genus 98
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2eawA00
3FYPA 2NZLA 2DU2A 3NPVA 2NWSA 3MHGA 3MMTA 2J27A 3GXNA 5LNUA 1KFEA 2A5HA 1ME8A 4WQ6A 1WBHA 3O8AA 1TO3A 3W7RA 4YWIA 4C1KA 5BOOA 5CG7A 3EX4A 1NAL1 1W5PA 2NUWA 3I65A 1D9EA 4N02A 4UTIA 1TPFA 2Y63A 3QYQA 3KRUA 2OT1A 3ABSA 1SZFA 1Z41A 3FEMA 5FF0A 1VQTA 4IGHA 3IEBA 3TE9A 2X30A 3A5VA 3CEPA 4DF2A 1K7XA 4QISA 1VH7A 3M1ZA 3V1PA 4O0KA 5E93A 4ZZ9A 2NX9A 4JTTA 1Q6OA 5BMWA 3DENA 3SW6A 1W54A 4ZQCA 3Q58A 4MLRA 5AHNA 1LCOA 3LCIA 3TMLA 1FCBA 4K7YA 4X22A 2ZRZA 4FNRA 1VGAA 4EVZA 1FXPA 4BK9A 1KM6A 5BW6A 3NQ2A 1GG1A 2Y70A 2YW3A 4GNJA 1VYPX 2VEMA 3M47A 3TXVA 2A7NA 1LBLA 1K8ZA 4GC4A 2DJXA 3E0IA 4J9JA 3BO9A 2O7QA 4O1CA 4JTKA 4ZVJA 5DXXA 5AB3A 1JVNA 1ML1A 3IVSA 1XBVA 3STFA 3GNNA 3NPXA 3UPWA 3TC7A 1SO6A 3B4UA 2HTMA 3I68A 3HG3A 3A23A 3QW4B 5D2XA 3W74A 3T4CA 1TV8A 2CLKA 3YPIA 4O8RA 1H61A 3NXFA 5K4ZA 3GDTA 3SGZA 3S42A 1SQ7A 4AEOA 3EXRA 2TSYA 3TMQA 2G95A 1MEWA 3LCGA 2WPBA 3W2JA 3PVFA 4JDYA 3EX1A 5H2ZA 2EF9A 3GX9A 4HT3A 3MYPA 4UNLA 1WX0A 3QPYA 1W5MA 3W7MA 3P60A 1D3GA 3BGGA 4N4QA 2V9DA 1OK6A 1R46A 4CQ8A 1VC4A 3VFLA 1XBZA 3ATZA 4DBEA 5KINA 4H3DA 3WK0A 1DV7A 3C2EA 2CW6A 3PBUA 3MW7A 3QRHA 1N55A 3G8EA 4ADUA 4Z1AA 4EWND 1EWDA 3H54A 2ZCGA 5F1VA 1IXOA 3GR8A 4FIQA 5F2MA 4W9TA 1B4KA 4OGZA 2AAMA 1LRTA 4O57A 1DL3A 4PC8A 3KVLA 4DEFA 3CIXA 3IGUA 3W7PA 1WYIA 2V30A 2VFFA 2BX7A 4HNUA 1FBAA 5HJLA 2WSYA 1QOPA 1GPWA 3HB9A 4HPJA 4MIMA 1GJPA 3DGRA 4DPQA 1IXPA 3QMRA 1T0OA 4M19A 3DH7A 3W6YA 3INPA 2I9EA 2CLFA 3GZ3A 3LXBA 2NV1A 4OE7A 1W0MA 3DFOA 1WV2A 1G4PA 1M5WA 4MZ8A 1OFRA 5IBXA 5HULA 3L21A 1ME9A 3QPZA 4O54A 2C15A 3MBFA 1LLWA 1E51A 2VC6A 3CC1A 1BEUA 3DFNA 2YFOA 2Q8ZA 1RR2A 3EB2A 4HKPA 4AHPA 1OFDA 2Z2UA 3WJYA 3WK2A 1PCKA 4ICNA 5CPMA 3VCRA 3C4UA 3S1XA 3FKKA 1W5NA 3G18A 4LV4A 3KRZA 1TSIA 3DI1A 1A5SA 3T40A 4E2BA 5C5YA 3O6YX 3EKZA 2V5BA 4M7SA 3P8IA 5EL1A 3NG3A 1AG1O 3SI9A 2TPSA 1JCJA 4DELA 4TX9A 4NUWA 3C52A 2YGYA 1S5WA 1DORA 4AXKA 1YTEA 1TIMA 4IWWA 2J9XA 2GVJA 3TA6A 5HWJA 5K4XA 1YDNA 4Z1BA 4LS2A 1VS1A 2C18A 4NZJA 1VHCA 3OVQA 3A24A 3HBLA 4HNTA 2QCFA 2ZRXA 1MXSA 5U4NA 2B7PA 1W37A 1GTEA 1TB3A 5AYZA 1VLWA 4AVFA 4OBTA 5LNSA 2QUTA 1ONRA 4RK8A 5FF7A 4ML9A 4Y8FA 1AW1A 3C6CA 2H90A 3DHFA 3GAKA 2VFHA 5AOUA 4QIUA 4RXGA 3Q94A 1ZHAA 3W2LA 4XWUA 2DZXA 5D37A 1KM1A 1TCDA 3ZR4A 3GK0A 1BWKA 4NT0A 2H8XA 3M43A 3IIZA 3QM3A 3QJAA 1TQXA 3M5YA 5FEXA 4FNSA 4AWSA 2G5WA 1AW5A 3LX9A 3W1TA 4BWLA 3PUDA 3IVTA 4ZQMA 5AN7A 3G22A 3TSMA 3OEXA 1YDVA 4UXDA 3L5MA 4YL2A 4LOCA 2R94A 1AL7A 4N9DA 4O52A 1J4EA 1O60A 4OV9A 2CLEA 3CM4A 2ZZ4A 5DCEA 4FO4A 1YPIA 1HUVA 5CGQA 3L66A 4ZL1A 3M5ZA 1R30A 5F4WA 1AK5A 5FF2A 2NXIA 1J2WA 5F4XA 3E9AA 3NQVA 5HWMA 5J5RA 1EUNA 2YCEA 2PE4A 1WOBA 4RR4A 4LS1A 1IIGA 2ATMA 3UY8A 1W3IA 1MO0A 2NLIA 1VR6A 3B0UX 1W1ZA 1BKSA 4NNBA 4MUZA 3G0XA 3G1DA 5HUOA 3HG2A 3HGSA 1WBJA 3LHUA 2CFFA 3L67A 4MFDA 4LRSA 3MUXA 1K7FA 2C0AA 4LVDA 3MP3A 4CCCA 1F5ZA 1HO4A 4Y9AA 4FX8A 2R8WA 1TQJA 2R91A 2YYTA 4MY8A 3E12A 5DELA 3UWUA 1N7KA 5D38A 3HF3A 1KTCA 3PY2A 4OQVA 3L2IA 4EF9A 2QCLA 2QCDB 1QO5A 1YXDA 1EP2A 2HSAA 4UTLA 5CSRA 1QPQA 3CQ0A 2A1YA 3HO8A 3P61A 4UFHA 1RV8A 5KZMA 1VYSX 1A50A 6ALDA 1B57A 5AFDA 2Y61A 3A22A 1OJXA 1YPFA 1VCVA 5I3HA 3M41A 1PHQA 2ZBTA 4O4VA 5U7SA 4OT7A 4X2RA 3BV4A 1FDZA 2Q3OA 2EHHA 3HPSA 3MP5A 2PURA 2Y6ZA 4O50A 5FEPA 3THAA 4GUIA 3C56A 3TC6A 1Q6RA 3AJXA 4HNNA 1FCQA 3STGA 1LRQA 3C2FA 3O1NA 2ZZ5A 4RZ5A 1SZNA 1JCYA 3BW2A 2RDWA 4FX7A 4JR5A 4WD0A 2DZSA 3HGOA 2QUUA 5BRBA 3TSBA 1KLYA 1TV7A 2CZFA 2J6XA 2PC4A 3NQ8A 4K8EA 2V81A 2VEPA 1G4EA 4UTJA 4ADTA 2A4AA 4MZYA 4LUJA 4AF0B 3TFXA 1GOXA 5CPNA 1KM3A 4XUGA 3F1QA 3OA3A 5CZJA 1NEYA 1Z42A 2YDAA 3QMTA 2DP3A 3FFSA 5I3GA 4WX2A 3RF9A 1FDYA 1EP1A 4LVGA 3DFPA 1BWLA 1OX4B 5GVJA 4AAJA 3NGJA 2CWNA 3LRKA 1GVOA 4QSHA 4PL1A 2YYUA 1W8SA 3ATYA 3PB2A 3M5VA 2V2DA 1K3UA 1TPVA 3TFCA 3DZ1A 5AHMA 4WJEA 4CCDA 5F2IA 3VI2A 5I3IA 1OFOA 4DQWA 4NX0A 3W2UA 2B0MA 3L0KA 2FPYA 2CZDA 4M5PA 2Q3RA 2C19A 3NR0A 3TIMA 2YFNA 3B05A 5CSSA 3CWNA 1TPDA 4UMAA 4S2CA 5I3FA 5KSWA 2V8ZA 1M6JA 3G1YA 2ZRUA 3PM6A 4UC5A 4JY8A 3UWQA 1SW3A 3TH6A 1JUKA 3DFTA 3WK1A 3CTLA 1NF7A 3LHYA 4O28A 3W7GA 1TRIA 3EXTA 4I7VA 2VOMA 5DXYA 1VRDA 2G96A 2TYSA 3EEGA 3PAJA 1TRDA 2J9YA 1TPC1 4O15A 1N8FA 2ZA1A 1Q6LA 3L0NA 1EIXA 1RQBA 3KHJA 3HPXA 3GKFA 3LTYA 2ISSA 3LTPA 4TMBA 3GR7A 2BTMA 2PRLA 4K38A 3EWXA 2CLOA 3BLFA 1FY6A 1KA9F 1I2PA 3QMSA 1HFBA 1GVSA 4UR8A 4JNMA 5SWUA 2FIQA 3EXSA 4TR9A 5HINA 3N3MA 3KOFA 2RHGA 2Z6IA 3RMJA 4M6VA 1I4NA 3P67A 5FI8A 3W07A 4HN4A 1VCGA 1AMKA 2ZRVA 1KFLA 1BTMA 3K30A 5L6UA 2ZRYA 2E5CA 4BI5A 2X1UA 1XKYA 2GPTA 4CNOA 2P10A 1OABA 1DQWA 4UR7A 3UD6A 1THFD 3N9RA 3GXTA 1TJRA 2CZ5A 3UNDA 1QPNA 2ZYFA 3DXIA 4KKXA 4UFKA 2H6RA 4JTLA 5K2ZA 3G3DA 4Z1DA 1K8XA 3KRSA 4CQAA 1JCXA 1T99A 3PSWA 4I7UA 3CU2A 2EGZA 5I3KA 3RK8A 1QMLA 4IX2A 3ZFHA 3G1FA 3NZ1A 2E09A 1VZWA 3WFAA 3GIYA 1LRNA 1F76A 4EOUA 4PTNA 1LORA 3ANYA 1JCLA 3ZWSA 3C2OA 3P7YA 4KWWA 4LTSA 3CB8A 1IXQA 3PG8A 2TRSA 4WOZA 1V5XA 4O1BA 4JTEA 3Q2DA 1RQEA 1GWJA 2CLIA 4JTUA 1QPRA 2RDTA 2NXHA 2I1OA 5D33A 1KM0A 4O16A 2B7NA 2XN0A 3PBWA 3NQMA 5KZDA 1OX6A 5E1QA 1TREA 3HJZA 1Z44A 2E6DA 1P0KA 1OYAA 3MO7A 3W85A 3T78A 2WQPA 3KVKA 5D05A 5KTLA 4NX5A 4LUIA 2VFGA 2JKPA 3W7IA 3GB6A 4FX6M 3U8GA 1R47A 3O07A 5AHFA 1KW1A 3HOJA 3LM7A 5D02A 1T8XA 4M6QA 2G97A 3HIJA 1ZCOA 4NJKA 1WA3A 2VELA 4ZQOA 1LBFA 3LXAA 4UTWC 2AGKA 1ICSA 3FJ6A 2ISVA 4LWWA 4MVAA 4IQLA 3LERA 3W7OA 3I7RA 3S1VA 5DY3A 2DZWA 5LGXA 4NNCA 1DOSA 1OHLA 4U4MA 1FXQA 3LCLA 1D3HA 4ZQPA 2QF7A 4IPJA 4EIVA 4JDBA 1YXYA 3QSRA 1SW0A 3QC3A 5G4EA 3AO0A 4RV8A 2ZZ2A 3TQVA 1F73A 1S5VA 4L4MA 4WY0B 3CWOX 2PRHA 1JRBA 3W88A 3F4NA 3N9SA 4IMDA 4KFNA 3CHVA 1ALDA 5KITA 4XZ9A 3W1MA 1UCWA 2DZPA 1K03A 1T96A 4N9CA 3PBVA 4GE8A 3HQ1A 4Y90A 5DLCA 1AW2A 3UWYA 2FDSA 4O11A 3IVUA 5G1TA 5AYYA 4ADSA 3BVJA 2QCNA 4MY1A 1CX9A 3LTSA 4UTTC 2WO5A 5K3VA 5DCBA 4NXKA 1LOLA 2NXGA 4O17A 1H7XA 3BARA 3NVTA 3MP4A 3RLUA 1H1ZA 1RQHA 4K39A 3TQ0A 2JKEA 4JYDA 4DF0A 4P2VA 3G3MA 4Y6GA 5F1UA 3NNTA 4IMGA 4JY9A 3TR2A 4MYXA 4RCXA 2OZ0A 1IIHA 2BWGA 5TQLA 4UMBA 2QR6A 1O5KA 1ZENA 4AB4A 5CPOA 1OX4A 3P80A 2A85A 5D2TA 3TQKA 4R34A 1O95A 3PC0A 3NQEA 3LI0A 2EAWA 2FB2A 1S3HA 2FLIA 5CZSA 3N14A 1L6SA 2ZZ3A 4I9AA 1NVMA 3FIGA 4FNQA 4H6KA 1QDSA 3ABQA 3W7HA 3MI2A 3LXCA 3VE9A 3L65A 5FF4A 1KTNA 3NL5A 1GYNA 3NEVA 1SR9A 1KFCA 4ORMA 3W87A 4B5NA 2FJKA 3LRLA 5T26A 1I2NA 2Y7DA 4JYEA 1FWSA 3S1WA 1XXXA 3I6RA 4GWEA 2DZVA 2FFCA 3R5EA 2QCEA 2ABBA 1XBXA 3W75A 2UV8G 3BG9A 1MEIA 2X1RA 3FYOA 1LTDA 3SGUA 4RJEA 2X1TA 1P1XA 3SJ3A 3B04A 2VEIA 1SSGA 2YPIA 1PCWA 2HS8A 1OFEA 4FHAA 4FF7A 2Y88A 3FS2A 3E49A 2ZA2A 2ZDRA 3NL3A 5C2XA 2A0NA 3V75A 1WXJA 1EP3A 4MKNA 4D2JA 1JCNA 3L9CA 4OV4A 4JX4A 5F2GA 4O19A 4Y96A 1LDCA 1X8FA 3RLVA 3W76A 4QAIA 3N2MA 4O0ZA 3G1XA 1L9WA 4RZ6A 2QCHA 3LLFA 1O4UA 4JTSA 2A6LA 4JICA 1UASA 2P1FA 1I45A 3NZRA 1QFEA 5H91A 3WJZA 1H50A 3O6DA 1EX5A 2C14A 2OT0A 2GVLA 2RKXA 4A22A 4O14A 5L9FA 4FB7A 1YTKA 2ZA3A 3KFTA 2JBMA 3S5NA 1SO5A 4XKYB 1B3OA 4K8HA 1GG0A 3OVRA 4DF1A 4UTMA 3LRMA 3DBPA 5DN1A 1H7NA 2C6QA 1V7YA 4BFAA 3FKRA 3P5YA 2QCGA 2JGYA 1SPQA 2HMCA 4IJBA 2Z0IA 1GEQA 3TCEA 3ZWTA 4FNPA 5LGZA 5CPLA 3PG9A 2J9ZA 4LU0A 4JX5A 1Q6QA 4PFMA 1IGSA 3MBDA 3HGJA 4M7TA 4JTGA 1G6CA 4I7WA 4JTIA 3DFQA 1CW2A 4R33A 3P5ZA 2ATSA 2CU0A 1QWGA 2YW4A 1RPXA 4N9EA 5D2VA 1DQXA 4QNWA 1VPXA 1FWNA 4QM1A 4U28A 3UYCA 3P74A 2R14A 4WOQA 2E6YA 4IPIA 2DJLA 5D2YA 4G1KA 4UFJA 3S5ZA 4JN6A 1HL2A 2BSLA 3ZS4A 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 2WSQ A;  1S5T A;  1OVD A;  4Z1C A;  1KM2 A;  4AWT A;  4CCE A;  3IIO A;  4GXM A;  3P81 A;  1VHN A;  3LDV A;  4DO5 A;  3M5X A;  1PV8 A;  4DO4 A;  4C1L A;  1ZY9 A;  3D0C A;  1I2O A;  4HPX A;  1OFB A;  3MI3 A;  2LLE A;  2WNQ A;  1ZAJ A;  2WOQ A;  3BG5 A;  4LVA A;  3KX6 A;  3NPU A;  1LZO A;  1ZAL A;  3G1H A;  3LHZ A;  1Y0E A;  1XDM A;  4IXH A;  4Z0J A;  5K9C A;  5DCD A;  4Q33 A;  1YAD A;  3TXZ A;  3GXP A;  2Y89 A;  4MJZ A;  3FOK A;  3W1N A;  2BXV A;  3RFA A;  4NJI A;  3USB A;  1WAU A;  1ICP A;  2D73 A;  4KWV A;  2QJH A;  5LSM A;  8TIM A;  1ZAI A;  3OHI A;  4CLM A;  3WJS A;  1F74 A;  3RND A;  5EYW A;  2V2H A;  2ZFA A;  1DHP A;  2XN2 A;  1H51 A;  3UZJ A;  1F6P A;  2BZN A;  4KFO A;  4LVF A;  2W6R A;  4GUF A;  3L68 A;  1OF6 A;  4E2D A;  1YXC A;  5HNR A;  2RFG A;  3LCX A;  4O1D A;  2NX3 A;  1KFK A;  2YSW A;  2GJN A;  2QAP A;  3N19 B;  4GBU A;  3RU6 A;  1OF8 A;  1OK4 A;  1Q3N A;  2ZRW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NZ3 A;  2V5D A;  2NWS A;  3MHG A;  3VYL A;  3AFB A;  1YQ2 A;  3AHV A;  2A5H A;  3H70 A;  4WQ6 A;  4RL3 A;  3BLD A;  5CG7 A;  1EXP A;  1UC5 A;  3EX4 A;  2NUW A;  4NYU A;  5ECU A;  4UTI A;  1XG4 A;  4C60 A;  3KRU A;  4BF5 A;  1Z41 A;  5LXX A;  4IGH A;  2V3D A;  4Z2H A;  4U2Y A;  3RXZ A;  4JEJ A;  1BXN A;  4OUE A;  4BS0 A;  1VH7 A;  3PPH A;  3V1P A;  2NX9 A;  1Q6O A;  4MKV A;  1E6Q M;  1F3W A;  1CCW B;  2WCA A;  5EMY A;  1G5A A;  4ZQC A;  1GQK A;  1LCO A;  1X39 A;  3GYC A;  5M3W A;  4DM2 A;  1VGA A;  4EVZ A;  4BK9 A;  1GG1 A;  1DXI A;  2Y70 A;  3AIQ A;  4GNJ A;  2VEM A;  3WBX A;  3TXV A;  1QU4 A;  1PPI A;  1XIE A;  4O1C A;  4ZVJ A;  3STF A;  2H9A A;  1Z7A A;  3NPX A;  3LLX A;  3TC7 A;  2BP1 A;  1SO6 A;  1VIW A;  1EDG A;  2WKL A;  3A23 A;  2XVN A;  3QW4 B;  1QBA A;  3GS6 A;  3KTX A;  1K4G A;  1XLE A;  1TV8 A;  3LPO A;  4DJD C;  3V0T A;  2XH7 A;  1SQ7 A;  2TSY A;  4PMX A;  4F2B A;  1DXF A;  4Z2K A;  3W2J A;  4JDY A;  5FAJ A;  1VJZ A;  1NAR A;  4U2Z A;  1OBA A;  1KO0 A;  1PX4 A;  3QPY A;  3OLE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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