2EGZA

Crystal structure of the 3-dehydroquinate dehydratase from aquifex aeolicus vf5
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
219
structure length
216
Chain Sequence
MLIAVPLDDTNFSENLKKAKEKGADIVELRVDQFSDTSLNYVKEKLEEVHSQGLKTILTIRSPEEGGREVKNREELFEELSPLSDYTDIELSSRGLLVKLYNITKEAGKKLIISYHNFELTPPNWIIREVLREGYRYGGIPKIAVKANSYEDVARLLCISRQVEGEKILISMGDYGKISRLAGYVFGSVITYCSLEAPGQIPLEEMVELRKKFYRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title Crystal structure of the 3-dehydroquinate dehydratase from Aquifex aeolicus VF5
rcsb
source organism Aquifex aeolicus
total genus 86
structure length 216
sequence length 219
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2007-03-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2egzA00
3WK1A 3U8GA 1MEWA 4WXYA 3P61A 3G1AA 2FFCA 4FB7A 4YLWA 5FF3A 1SO4A 2EHHA 1EUAA 4M6PA 3A9IA 1TV8A 2EF9A 4OT7A 2R91A 4ICNA 3G1XA 2J9ZA 5F2MA 4LWWA 3W87A 4UTHA 1IF2A 5DLCA 4O14A 1SPQA 4N9EA 4AHOA 2RKXA 4O1DA 4LUIA 4TMBA 3LTPA 1EA0A 3LHYA 1JUBA 1NSJA 3GXPA 3MW7A 3ZFHA 2YGYA 4DO4A 4YL2A 2V5BA 3BVJA 4MJMA 4ZL1A 1KFLA 4NU7A 5TQLA 1YXDA 4MJZA 3WJWA 3G24A 3H53A 5KSWA 2H8ZA 2DJXA 4AF0B 1AK5A 2C13A 2ZA2A 4PA8A 3PG8A 3TDFA 3JRKA 1FCBA 5I3HA 4UTIA 3TKFA 2B7NA 4FNPA 4K37A 1DJQA 3P81A 4PFMA 5BW6A 1VYSX 4NJIA 5BNKA 3S1VA 3W7GA 1JJKA 3UXAA 1K7FA 3P8IA 6TIMA 3PBUA 3EWWA 3WJZA 4QSHA 4H4IA 3T40A 1SFLA 4FF7A 1JQVA 4ZQPA 2XN2A 3EXSA 1XUZA 2ISVA 1F6PA 1DQWA 2Z0IA 4O54A 3T78A 5KZMA 1QOPA 1OX4A 5LNWA 3GDTA 4WX2A 3L5LA 1D9EA 5LGZA 1O60A 3W1UA 5F2LA 2GJLA 3HG3A 3BG9A 3EX6A 4LVGA 3W1LA 1ZCOA 4BK9A 5TIMA 3DENA 1SZGA 2E6DA 2C18A 3PSWA 5LNSA 2ZBTA 4AF0A 2CLMA 3GX9A 3N73A 2QCFA 1I2RA 3HPSA 1YLVA 1KLZA 2ZZ5A 5AYYA 2YPIA 1QPRA 1G4SA 2ZA1A 4DF2A 2BLEA 4HIBA 4KKXA 3GDMA 3G1DA 3HGJA 3MYOA 3UXDA 2NX1A 1WA3A 4UCGA 2Y7EA 1R2RA 3W7LA 1QWGA 4K8HA 1SW3A 5FF7A 1KM3A 2HTMA 4K39A 3NQCA 1DV7A 5EBUA 1TPDA 4CCDA 3W2LA 2CFFA 1OK4A 2DU2A 4I7WA 4IMCA 4FX8A 4JTLA 4AWSA 4Q33A 1SUXA 3VNDA 2H6RA 3IIXA 3NM3A 3TJXA 1B9BA 4PCFA 5F4SA 3WK2A 2R14A 4O1CA 1NEYA 2CU0A 2NV2A 4LRTA 2ZCGA 2ZRVA 3TXVA 3GR8A 4Y96A 3CLMA 1TO3A 3C0JA 1LYXA 3GKFA 3IGXA 5AHEA 3IGSA 5D2XA 2ZZ3A 3TQVA 4OGZA 1EUNA 1VCVA 3Q37A 4O4WA 1FCVA 4AWTA 3C2RA 2A6LA 3LLFA 5G4WA 4AH7A 2CLEA 1ICPA 1W3NA 2GVJA 4JICA 4M7TA 1L6YA 4XUGA 3SGZA 2GQ8A 3THAA 1SU5A 1YDVA 2OZ0A 1P0NA 3I65A 1QOQA 4UNKA 2OJPA 1JRCA 1ZHAA 4TO8A 3TSMA 4NNCA 1ZAHA 1R47A 3CWNA 3PAJA 1QFEA 5CKSA 1O5XA 2PRMA 4BR1A 2X16A 2RHGA 1ML1A 4O8RA 5D2TA 3FA5A 4RR4A 1T99A 3NOEA 1RZMA 1P1XA 3QW3A 3STGA 4NQ1A 1OX6A 4GFSA 5BRBA 1WV2A 4P2VA 2GQ9A 2QKFA 2YZRA 3PUOA 1TQXA 4LY8A 3W2NA 3UQNA 4UFKA 4ADSA 1D3HA 5DCDA 2B4GA 4O19A 3PB2A 4RZ6A 2JBMA 1KM5A 3OEXA 4FNTA 5AHIA 1FDYA 2E6YA 1Q6LA 1WBJA 3O6YX 1W5MA 1J2WA 4Z1CA 5D30A 3GAKA 3G1FA 3RF9A 1P0KA 2WKJA 3PBVA 3RNDA 1H63A 1SR9A 4K8EA 1LCOA 3E96A 2A1YA 1L9WA 2DZPA 3SW6A 3QMRA 1MSSA 1CW2A 1LBLA 3O07A 2DZSA 3M5ZA 1WXJA 2DZWA 5BMWA 5G1YA 1RQHA 2C6QA 3M5VA 4JTGA 1ZNNA 2FLIA 3TMLA 1JR1A 1GYLA 2ZZ7A 4LTSA 3L0NA 4KFNA 2G95A 2V5LA 4IXHA 1OABA 2QCDA 5LHEA 1LRTA 2F7FA 1LOLA 3NL5A 2WNZA 2C3ZA 5U7SA 1O4UA 2JKAA 3FYPA 5KZDA 3WFAA 4WY0A 4IQLA 3W1NA 1Z41A 3C3NA 2QCLA 3GKAA 5D37A 3NQ8A 1OG0A 4PH6A 5HR6A 3RLUA 1FWNA 1JULA 2RH9A 3QM3A 3OHIA 1XXXA 3FFSA 3CIXA 1VJIA 4E0CA 5D2VA 4RXGA 1BWLA 5HQEA 3S9YA 1LBFA 1TPVA 2EGZA 2VFIA 3G3DA 1H60A 1F7BA 1ALDA 1B4EA 3LLDA 4O13A 1S5VA 1SSDA 3R2GA 2Z2UA 3P60A 1IXNA 3I7RA 2ZYFA 3LCHA 4DXVA 3GXNA 3SJ3A 5BMXA 3S1WA 4UTKA 2QAPA 5HNRA 4XZ9A 1RR2A 1G4PA 3GNNA 4N6FA 4IMDA 1VLWA 4JTJA 4PL1A 3LCWA 4GUHA 2Y85A 3B4UA 4BFAA 4QQ3A 2W79A 1Q3NA 1VCFA 1QPOA 1DQXA 3FLUA 3W70A 3IRDA 4RLIA 4JR5A 2IQTA 2V30A 2BSLA 3W1QA 1FXQA 5CG7A 4L4LA 3ATZA 1RQEA 3W76A 4MFDA 1WYIA 3HPXA 1X7FA 5AYZA 1XBYA 1GVFA 5LSMA 3L68A 4ZQNA 4E2DA 2YR1A 3QZEA 4WJEA 3TNOA 1FCUA 2G5WA 1EWDA 1EWEA 1GT8A 2OT1A 2X1TA 3EEGA 4O4VA 2ZFAA 3QRHA 5IBXC 4Z0JA 1TREA 2FB3A 5J5RA 4LC8A 1PHWA 3W2UA 2C14A 2CLFA 2YX0A 2Y70A 3QQ1A 4A29A 4LC6A 1HG3A 5KINA 3W7HA 4NJHA 3EX1A 3BK0A 3EKLA 3Q94A 1AL7A 5AHMA 2Y7GA 2FPYA 1KM0A 2QCCA 4AWUA 4AHQA 3EWYA 3QH2A 4MUZA 1EP3A 5C2XA 1FX6A 3LXBA 5D02A 1OF6A 4JGDA 3T44A 4OBTA 3S5YA 3GDLA 4JTEA 1TJPA 2EAWA 3KFTA 5IM51 3LRLA 3NNTA 4GUJA 3W7EA 2NWSA 1PCKA 3B05A 2OT0A 3KVKA 2LLEA 4GNJA 3DBPA 2Z6IA 3DFNA 3SY5A 4DF1A 1VHCA 2CLLA 1TTPA 2FJKA 1FWRA 1F6KA 5AC8A 3P67A 3AO0A 5T26A 1AMKA 1ZJIA 4GRSA 3EB2A 4LS1A 4HHPA 4TU1A 3UZ5A 3WK0A 4M5PA 4O52A 1H7XA 1RV8A 2H3DA 4IPJA 4DF0A 1WX0A 3A5VA 3BG3A 4UFLA 5AFDA 3KX6A 3NL6A 1R46A 3PSVA 1NAL1 3VCRA 2QJIA 4OQVA 1IXPA 4IMGA 5AOUA 3TH6A 4AEOA 3OA3A 3BW2A 4NZJA 5FEZA 3M9YA 3W07A 3H54A 3W2MA 1NF0A 4WUIA 1C29A 5AHNA 4WZHA 4FXRA 5EMUA 3ABOA 3PBWA 4DO5A 3HJZA 1M7OA 1YXYA 1KFCA 4K38A 3M0ZA 3O8AA 4MZ1A 1YYAA 2WSYA 1LOSA 5DCBA 1QR7A 3KVMA 4JY9A 5D38A 5C5YA 5LZLA 3CEPA 4N4PA 4OU1A 3PS7A 4FNRA 1VR6A 3DI1A 3W7OA 1YPIA 1RD5A 1S3HA 2NLIA 3RLVA 1C9DA 4BI6A 5I3GA 2QF7A 5CPNA 2ZZ2A 3NM1A 3O05A 4CCEA 4HN4A 4CQ9A 4MIMA 5FF0A 1TB3A 4NJJA 3GR7A 3BLEA 4LNYA 5AHLA 1PIIA 5EPDA 4UMCA 5FEPA 3LX9A 4IOTA 5DXXA 2EKCA 3V75A 2YW3A 3R89A 1XBZA 3W86A 3KVJA 4M6QA 4RJEA 5EL1A 3M5YA 4EF9A 5KMYA 2QEZA 2TYSA 3UWUA 1R2TA 1W5NA 4XTIA 4HPXA 1JCJA 1X6UA 5CZSA 2NUXA 3FS2A 4HPJA 4LV4A 4IUOA 3LHTA 1SFJA 3FJ6A 1LP6A 3YPIA 3NQ6A 3PF3A 4RXFA 4O12A 3KRZA 4UTUA 4MZ8A 1D3GA 2YSWA 4RKAA 5CGQA 3LV5A 2WO5A 1K8ZA 1FUYA 2QCEA 2W0UA 4GUGA 1FCQA 1JUKA 4JX6A 5EY5A 4YCPA 3W7PA 3HBLA 3BW4A 1J5TA 4A22A 3CB8A 2QDGA 1YXCA 2ATMA 4JD4A 3G1YA 4YMZA 3IEBA 5HINA 2C0AA 1TJRA 2E09A 2C19A 2ZRUA 4POCA 5FEXA 1VH7A 5D04C 4XKYB 2ATSA 2VEPA 4JYFA 1WDWA 2X1UA 3TK7A 1OYCA 5TBOA 3TW6A 5DCEA 4O1AA 2VEKA 1QMLA 3IIOA 3MI6A 3TCEA 3W2JA 1V5XA 3F4WA 3EWXA 5DY2A 2FTPA 1Q6OA 1TPUA 2D73A 2PE4A 4N2YA 3S1UA 4K7YA 3S6DA 3DFSA 2A2IA 3DFTA 4D2JA 2FIQA 3KXQA 2QR6A 2X1SA 3GXTA 2Q8ZA 5CSRA 4FHAA 3PB0A 4R34A 1I8JA 1LROA 2Q3RA 4WQ6A 4UTWA 2ZZ1A 2J9YA 4LS2A 3W7MA 5AC6A 1K7EA 2RDWA 2WOQA 3M44A 2PURA 1LRQA 5LNRA 2A85A 2QJGA 3STCA 3GB6A 3W9ZA 4IMFA 1AL8A 3TSDA 2VEIA 3W1XA 4MYAA 1W5PA 1TV5A 3O16A 2VXNA 2CZEA 1GVRA 3W83A 3M16A 4MY8A 3L2IA 4OV4A 3V1PA 4BI5A 7TIMA 2PRLA 4JX4A 4XKYA 4Y9AA 3MI2A 5J5DA 1TYGA 3DU0A 2YW4A 4E2BA 3DGRA 1TIMA 3FJLA 1OFPA 3GAYA 3MMTA 3GDRA 1K8XA 1TTQA 3MP4A 4NJKA 3RFAA 2E6FA 3ZS4A 3MHFA 3QYQA 3T55A 1R30A 2CLIA 1H61A 3O6DA 1ME8A 1WQ5A 3E9AA 3CC1A 4LT9A 4O50A 1L6SA 1VHNA 1YADA 3LCIA 1DVJA 1LLWA 1ME7A 4ONVA 5CPOA 3G22A 3C2EA 1KM2A 3LHWA 1T0OA 1BEUA 1ME9A 1EEPA 1V7YA 2CLHA 3C4UA 4MYXA 1ZENA 1SW7A 4B5NA 4NVTA 4CCCA 4BI7A 2DZVA 4JX5A 2NUWA 3IVSA 2Y61A 2J6XA 3JS3A 3MUXA 1DOSA 1X1ZA 5HJLA 3FKRA 2VOMA 3RK8A 2A4AA 2ZDRA 3LHZA 4PL2A 4UMBA 4KFOA 1GQNA 3DHFA 3NYZA 3LCFA 3W7NA 4FX6M 3STFA 4G1KA 3IIVA 4MY9A 2X2GA 3P8JA 3HG4A 4MZYA 3MHGA 3CTLA 2HMCA 4O11A 3N19B 1M7PA 4UMAA 1F73A 1FBAA 1KV8A 4RX0A 3N34A 1ZAJA 3W22A 1LORA 3LV6A 3HGRA 3P62A 4DQWA 2TRSA 4JTSA 3KOFA 2VKZG 3HB9A 1KFEA 2GPTA 3A24A 1H7PA 4UTWC 3TC7A 5F2IA 4JXCA 1ZAIA 5F2GA 1VPXA 5G4EA 3O15A 3L9CA 3NGJA 3B04A 4Y8FA 4ADTA 3IGUA 5AHFA 3LOTA 4M7SA 3LXAA 4GWEA 2NX9A 2NXHA 3GK0A 4QJ1A 5CZ0A 1IIGA 3N9SA 3WJXA 3CWOX 2BX7A 2Y63A 5C54A 2QCGA 3QF0A 2V0TA 4UFIA 4ZMGA 3W7QA 2B7OA 1SZNA 1YTKA 4O28A 4O15A 1S5TA 3LDVA 3QMTA 5D2WA 1H7NA 1KFBA 2E5CA 1G6CA 2YFNA 1T96A 2DZTA 2XFWA 4N6EA 2ISSA 1K03A 1JVNA 2OCZA 3NEVA 2ABBA 1VGAA 5I3KA 1EPXA 4AHPA 3M5XA 1H5YA 3NQ2A 1EIXA 1ZALA 4U28A 3LCXA 4PC8A 3FOKA 5H91A 3EX2A 5FI8A 2A6NA 4I7VA 5LNVA 2GOUA 3THQA 3I68A 5CPLA 3PC0A 1M6JA 3NZRA 2JKEA 5IBXA 2CZFA 3NPXA 4MLJA 4HNVA 4HT3A 5HMSA 4DO6A 3WJYA 2WQPA 4EVZA 2ZRZA 4Z1DA 1W3IA 1AW2A 4S1FA 4CNNA 4DELA 4KWWA 1WBHA 1OFQA 2GJNA 2A0NA 3A5FA 5G2WA 2B0MA 1A5BA 3N14A 1X8FA 3PM6A 2E68A 4NZFA 5AC7A 1JCXA 1GVOA 1IIHA 3O06A 2CWNA 2E5BA 3C56A 1W37A 3UPWA 3UWWA 4MY1A 4UNLA 3ABRA 1I2PA 3P80A 2QUUA 3MJYA 3M6YA 1XUUA 2WSQA 3NQVA 3LGEA 2OMAA 3AJXA 3O63A 3ZR4A 4AXKA 1RPXA 2V2DA 3U2OA 1RQBA 1Z42A 3B0VC 1TCDA 1A5SA 1SO6A 3I7QA 4DEFA 4OWGA 4FO4A 3EWUA 5DELA 5H2ZA 3JR2A 5SWUA 3OG3A 2I9EA 1QO5A 3I6RA 1GOXA 4UFMA 1S5WA 3LB0A 4WOQA 1N8FA 4GBUA 3M7WA 3TJLA 3CEUA 1Y0EA 3PY2A 1VCGA 1SO5A 3USBA 4X2RA 1FWTA 4FX7A 1VZWA 1W5QA 2GVGA 4MVAA 3RU6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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