2EPHA

Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from plasmodium falciparum in complex with trap-tail determined at 2.7 angstrom resolution
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
363
structure length
358
Chain Sequence
TEYMNAPKKLPADVAEELATTAQKLVQAGKGILAADESTQTIKKRFDNIKLENTIENRASYRDLLFGTKGLGKFISGAILFEETLFQKNEAGVPMVNLLHNENIIPGIKVDKGLVNIPCTDEEKSTQGLDGLAERCKEYYKAGARFAKWRTVLVIDTAKGKPTDLSIHETAWGLARYASICQQNRLVPIVEPEILADGPHSIEVCAVVTQKVLSCVFKALQENGVLLEGALLKPNMVTAGYECTAKTTTQDVGFLTVRTLRRTVPPALPGVVFLSGGQSEEEASVNLNSINALGPHPWALTFSYGRALQASVLNTWQGKKENVAKAREVLLQRAEANSLATYGKYKGGAGASLYEKKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Aldolase provides an unusual binding site for thrombospondin-related anonymous protein in the invasion machinery of the malaria parasite.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 125
structure length 358
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ephA00
4Q32A 4IUOA 1F76A 5KMYA 4WOZA 4AB4A 3D0CA 1T96A 4X2RA 1TV5A 3TCEA 3W84A 4XTIA 4NNCA 3UZ5A 2V0TA 2GUUA 1QWGA 1NF7A 3BV4A 1DVJA 1MZHA 1SO5A 3A22A 1ME7A 4UFLA 4RXFA 4AWTA 2VELA 4XKYA 3FA5A 3BVJA 3DFQA 3DI0A 3S8HA 3GAKA 3ABQA 4CNPA 1ME9A 3L21A 1FDJA 3NPVA 4FX6M 1R2TA 3FFSA 2QR6A 4MZYA 4TX9A 1PL9A 3TDFA 3C8FA 1SZNA 4LOCA 3G0SA 1GVFA 4E0CA 1W5MA 1XUZA 4YCPA 3SJ3A 2YZRA 1N55A 1XCFA 2J88A 3S5YA 5FI8A 3O63A 3GB6A 2FIQA 3QPYA 3S0CA 3CQ0A 5FEWA 3B04A 3GXPA 3QMRA 4JXCA 3DFSA 2E5CA 5LNVA 1JUBA 2AAMA 2B0MA 1H60A 4MVAA 3HG4A 2Z0IA 2NWRA 2JGQA 5G1TA 2DORA 1A53A 4M6PA 3PY2A 4ML9A 4IWWA 2BX7A 4M7SA 1XDMA 4XWUA 1EB3A 1NFBA 3S6DA 5G2WA 4LUJA 5DELA 2C19A 4H6KA 3GXTA 4S2CA 3EXRA 3QZEA 3W1UA 2WNQA 4IMGA 3EX3A 5LNUA 4FF7A 1R2SA 3P8JA 2ZRYA 5U7SA 1RQHA 5H2ZA 4IPJA 2V2HA 4H3DA 1VRDA 3WJXA 3SGZA 4K6AA 3QRHA 1Z48A 4EF9A 2O7QA 1JCMP 5DY3A 2H3DA 1KW1A 3A9IA 4DELA 5LGXA 2FLIA 1LBMA 2Y7FA 4RCXA 4LWWA 4KFOA 1YTKA 5AHNA 2VFEA 3S5NA 4R7JA 3M9YA 4I7UA 1O94A 4EF8A 1KM0A 3AO0A 3ABOA 1TYGA 5E93A 5K9DA 1NEYA 1G7VA 7TIMA 3W75A 5C55A 2B7NA 5BW6A 4MJZA 5D03A 4PEKA 4NQ1A 5F4XA 1K3UA 3DAQA 5HJLA 1B9BA 2E09A 2VFIA 5DCBA 3S1VA 1W54A 1L6WA 1IIGA 1XKYA 2WV8A 4H4IA 4RXGA 5FEPA 3LHTA 3NR0A 1EEPA 3U6WA 3W7EA 1FX6A 2GVGA 3G1XA 3TU9A 1PIIA 3C6CA 4PL1A 2X1TA 3TW7A 2J6XA 3L2IA 2QDHA 3NZ1A 4TIMA 4MJMA 2P1FA 2B7QA 4OU1A 3HBLA 1QPQA 5CPNA 3UWUA 2QJGA 2CU0A 3QJAA 4LUIA 1TTJA 5D2XA 1A5BA 4DO6A 4AH7A 1QNVA 1GTEA 4O8RA 4R53A 5CPLA 1XXXA 3JS3A 3G1SA 1YLVA 2H6RA 1VCFA 2CWNA 2YDAA 3TSBA 3LTSA 5U4NA 4Z1CA 2EAWA 4FIRA 1F5ZA 2Q8ZA 4NXSA 4AWSA 4LVAA 3IIOA 2HS8A 3THQA 3MP3A 1TTQA 2J24A 3B05A 3BW2A 5DBTA 2J9YA 2X16A 2C6QA 2AGKA 5D05A 1F6KA 2OT1A 1OG0A 4WUIA 1KM6A 1K8YA 2A7NA 5DLCA 3CIWA 4O1CA 3QSRA 3W2JA 1TV7A 4K38A 2VC6A 4RV8A 1A50A 2A7PA 1TJRA 2R14A 3T44A 2WQPA 1UUMA 2BWGA 3CT7A 1GYLA 4CQAA 4K36A 1G7UA 1JCNA 3DHDA 1L2UA 3G1VA 1BEUA 3O6DA 2WSRA 1SW0A 3ZWTA 5I3IA 3A21A 1X8FA 4LS0A 2ZZ7A 4J9JA 3W1PA 4LTSA 4U4MA 3BW3A 1PCWA 2VFFA 3EX1A 5DXYA 1OFEA 5KTLA 3VE7A 3PBYA 3DH7A 1DQWA 3UWVA 3OBKA 5CSRA 5LKYA 3NL5A 3PF3A 2XN2A 3OHIA 1DV7A 3L0KA 3C2FA 1I4NA 2NUWA 3N73A 4GC4A 1I2OA 3E49A 1CX9A 1FCBA 3NPXA 1SSDA 3IRDA 4QITA 2ZZ2A 4O4VA 5F4SA 5HINA 3EKLA 5D2WA 3W7CA 2CLEA 3HGRA 4NU7A 4JGDA 3RU6A 5HWMA 2W79A 3QW4B 1THFD 4E2DA 3SZ8A 4UTUA 1TREA 2ZZ3A 1Q45A 4MKNA 4Z0JA 1QOQA 3GDKA 3G3DA 3HQ1A 3CHVA 3NQEA 3NQDA 3BLFA 3EWBX 3BO9A 3NAVA 1W1ZA 1WYIA 3W7MA 4KKXA 2HS6A 2E6FA 3NQGA 1LBFA 2WPBA 3UY7A 1WA3A 3BGGA 1HL2A 1GWJA 3KRSA 2CLKA 5KSWA 3N34A 1YXYA 2Z2UA 3TJLA 3MO7A 4DXVA 2Y70A 4O10A 3W7DA 2A21A 3UWQA 2VFHA 5TBOA 4N6EA 3PSWA 3EXTA 3N3MA 1OK6A 4JTFA 3IGUA 3N14A 2RDTA 2CFFA 4M5PA 3PG9A 3MBFA 1EUNA 4HPJA 3W87A 3FYOA 2ABAA 2CLFA 4O4WA 1FCUA 4NNBA 3QC3A 1BKSA 3IIPA 4LVFA 4FO4A 1W5OA 2ZTJA 4N9DA 1IXNA 2V82A 1RVGA 1TPDA 1XI3A 2RHGA 4O53A 1OFAA 5G1YA 3I65A 1YXCA 4M19A 3I68A 2ZZ4A 1TQXA 4HNUA 5FEZA 1W56A 2WNZA 3DFNA 4OE7A 1QAPA 3NQVA 3O1NA 4IMDA 3PB2A 1AL7A 1D3GA 4G1KA 1Z42A 3YPIA 1H7XA 2EHHA 3N19B 1OFBA 4TR9A 3K30A 4HKPA 4PA8A 1WBJA 1YTDA 1DORA 2ISWA 4UTLA 2JKEA 2QUTA 2Z1BA 3B0VC 3A23A 1JCYA 1B4KA 1QDSA 3NQAA 5D2YA 2CLIA 1FWTA 4N9CA 3P5YA 4K39A 2TRSA 1TPFA 1LRQA 1GPWA 4JN6A 4UR7A 1GJPA 2X30A 1W37A 3CEUA 3WJYA 3AJXA 2OX1A 4OQVA 4LV4A 3KFTA 3WK2A 2R94A 4EOUA 2CLOA 1ZAJA 3M41A 1ADOA 5FF2A 4MLJA 2VEPA 3STCA 4GE8A 4HSOA 1G4TA 4NJIA 3GR7A 3FIGA 4UMAA 1I2PA 4RJEA 2Y6ZA 5L9FA 1JRBA 2RDUA 1M7PA 2FPTA 3CWOX 3KRZA 1TPH1 2OMAA 3IGSA 4LRSA 4LV9A 4LNYA 2DU2A 1NVMA 2J9ZA 4ONVA 3TE9A 5HR6A 5HUOA 1WX0A 3R12A 1EX5A 2ATSA 2V2CA 4JTGA 4FNUA 2C0AA 3O05A 3W2MA 4FNTA 3OVRA 4AMAA 5DY2A 4Q4KA 1JCXA 3LHWA 1EIXA 1LRTA 1XBZA 4RK8A 2GPTA 4POCA 3HG3A 1KM3A 2CZDA 3HO8A 2VXNA 4RZ6A 3NQ6A 1Q3NA 3BLEA 3NPUA 1FWNA 1XDLA 4RKAA 1YXDA 4NT0A 5BMWA 3IIZA 2V5LA 3N9RA 5EA9A 3EWUA 3B0PA 4UCGA 3RLVA 1YDNA 4E38A 2DZTA 2ISSA 4LVGA 1EA0A 4NJKA 3TMLA 3GYEA 4AHQA 2FB3A 5D30A 4O28A 1F73A 3LHUA 3NVTA 4QIUA 1VZWA 1PS9A 4TMCA 4ZMGA 1F6PA 4O1AA 3GKFA 1Q6QA 2PC4A 3W83A 1W5PA 2X1UA 2ZZ6A 2NXIA 1LOQA 3U8GA 3TQKA 2E6DA 1S5TA 2V9DA 3STGA 1R2RA 1W31A 3CTLA 3NYZA 4JTUA 3E96A 5F2LA 5AHMA 1IXQA 4WY0B 1T8XA 2NUYA 3L66A 5CZ0A 5J5RA 2ZFAA 4HT3A 2TSYA 3W7QA 3UWYA 3HPSA 1A5CA 4UFKA 4NX5A 3NQFA 2QUVA 1R46A 4WXZA 4JIPA 3M1ZA 1F05A 1KTCA 2PE4A 2ZA3A 1OFRA 4IMEA 5LGZA 3RLUA 1FCVA 3DXIA 3G1FA 3M0ZA 2UV8G 4UTMA 1ZAHA 1VGAA 4RZ4A 1X6UA 1I2QA 3CC1A 3NA8A 4ZQOA 2NZLA 4IOTA 1TQJA 5HNRA 3LB0A 2A85A 1XFBA 4JS3A 2I1OA 1PHQA 3LBCA 3PC0A 4O0ZA 5EBUA 1YTEA 3PUOA 2YFOA 3G8EA 3OG3A 3NEVA 3W7JA 2C3ZA 2QCNA 3WJSA 3DBPA 3W1XA 4IPIA 1GVSA 2IQTA 4TU1A 3L67A 1W8SA 3EX2A 1O5XA 4DBEA 4OT7A 4O57A 1KFJA 1UBSA 3EKZA 1GTHA 3FKKA 1W5NA 3BG3A 4S2BA 3Q58A 3G18A 2YGYA 3PULA 1X1ZA 3W1MA 1HO1A 1OF8A 4RR4A 1MXSA 5D02A 1OJXA 4RX0A 3P80A 3LOTA 4IQLA 3S1UA 3HGSA 2QEZA 4QQ3A 1SZFA 3BPWA 2VEMA 1XBXA 2GOUA 4N02A 4YMZA 4AAJA 5C2XA 1ZFJA 5EMUA 1GQNA 1KBJA 3B8DA 1EUAA 3RFAA 1EP1A 2E6YA 4A2RA 4CQ8A 3FEMA 3DFPA 3DI1A 1B4EA 3SFKA 1Z44A 3W1AA 1C9DA 2GVLA 3LI1A 3L5LA 1I45A 1I2RA 2JKAA 4ORMA 1DKWA 1VH7A 4EIVA 1OYBA 4QNWA 1VPXA 4JX5A 3NL6A 3LHZA 1EWEA 1KTNA 2Y88A 3SGUA 5KZEA 4FNRA 5C54A 2GQ8A 5D37A 3NPWA 4Y8FA 4OV9A 3W23A 4LT9A 2E6AA 2A7RA 3O6CA 5F1VA 3TX9A 1O5KA 1ONRA 5MHBA 4JTEA 2ZTKA 4JY8A 4K8HA 1O60A 3TH6A 5D09A 2YYUA 1IGSA 3R8RA 2QCFA 3UWZA 1GG1A 1XBYA 3KVJA 3LRMA 3MHUA 3LV6A 5HR7A 3LHYA 4NZFA 4EWND 4L4LA 4JDYA 3ATYA 3R5EA 2Q8LA 4FNSA 2QJHA 2E1DA 3KXQA 1WXJA 3W7LA 2TMDA 1LOSA 3LM7A 4CLMA 3FS2A 3M43A 4I7WA 3PUEA 2I9EA 3TJXA 2Y85A 2NLIA 3MWAA 1KA9F 1TTIA 3PBWA 3F03K 5AC6A 1AW2A 4MZ1A 2F84A 3FKRA 5K7JA 5AYZA 4WY0A 4WD0A 1H63A 1VCVA 1P0KA 4DPQA 3W6YA 3LLFA 3N9SA 3C0JA 5LZLA 1TRIA 2FPYA 1XUUA 4UUIA 5BRBA 3KVLA 1M7OA 4K7VA 3G1AA 3SIZA 2ZQ0A 3IIXA 4UTKA 4HNNA 5G2IA 1KM1A 3KRUA 2ATMA 3BG9A 4HPXA 5K3VA 3MHGA 3QH2A 1ICQA 5KITA 1TPVA 3W7RA 3B4UA 2DZVA 5C5YA 2P10A 4ORIA 5LHFA 3QMSA 4KFNA 2VOMA 2Y7DA 4UC5A 4IXHA 4NJHA 4ZQCA 3BGJA 2B7PA 4QSHA 4AF0A 4N6FA 3P84A 2ZCGA 1QR7A 3TW6A 2BLEA 3LTPA 4I7VA 1VR6A 1G67A 2NUXA 3MMTA 4ZQMA 5HULA 3TKFA 3R89A 4X22A 3EX6A 5D32A 3QSTA 3W70A 5K9XA 4JX6A 3L9CA 1KFLA 3SECA 3W1NA 3CU2A 4A2SA 1VCGA 3DFTA 1LROA 4MZ8A 3PBUA 1H61A 2ZYFA 4JD4A 2CLMA 4YXGA 1R30A 4WXYA 1TV8A 2LLEA 4GFSA 4PFMA 2EF9A 1UJPA 5AC7A 3Q94A 2A6NA 1VS1A 3GIYA 1SPQA 4DF2A 4O18A 1N8FA 4K7YA 3MYPA 5D38A 1SO4A 2WKJA 4IX0A 1TPUA 4A21A 1DJQA 3W22A 3WK1A 5HMSA 2PURA 4HN4A 2JGYA 4BR1A 1LDCA 1RD5A 5AHIA 3IIVA 4CCCA 2FTPA 2QDGA 4PH6A 3TXZA 1H51A 3T4CA 4BFAA 1A5SA 1ZAIA 4NVTA 1DHPA 1ZCOA 5I3KA 2OCZA 1LTDA 3LCFA 4O19A 4XQ6A 5EYWA 3W85A 5DXXA 4HSNA 4NNAA 2E68A 3MI3A 4D2JA 1EP3A 5EKYA 5GVJA 4N9BA 2YCEA 2WNNA 3TNOA 3L0GA 1VHCA 3FLUA 3C2VA 5AN7A 4JDBA 6TIMA 3W1QA 1IIHA 3IVUA 4UFMA 4Y96A 2YW4A 1Q6OA 3MW7A 3M5VA 5D04C 1UASA 4PC8A 4BF9A 3M6YA 3NL3A 3CIXA 2A6LA 1HTIA 5LNRA 1TSIA 4YCOA 3C56A 3TQVA 3VNDA 2DZPA 3W88A 1XL9A 3LERA 3UYCA 1FQ0A 1J4EA 1OFPA 3QEZA 4NJJA 1AG1O 1Q6LA 1WOBA 4C1LA 1JUEA 2FJKA 3QF0A 1SW7A 1OFQA 1FCQA 5F4WA 5I3GA 1LZOA 2A1YA 3G8RA 1OF6A 2FDSA 4I9AA 3ZFHA 3GDLA 4DO5A 3HMJG 4RZ5A 2G97A 1K03A 3W7PA 2YXGA 3G0UA 3W71A 2E5DA 1ZNNA 3G1HA 1YYAA 4FX8A 3A5VA 1ZENA 2YW3A 5AHFA 3MJYA 3VI2A 4Q33A 2C14A 3C3NA 1VC4A 5AC8A 3UD6A 5FESA 1FXQA 1RZMA 3WK3A 4GUFA 1TB3A 2Y89A 4AWUA 1YDOA 1S5VA 4EVZA 1QMLA 5K2ZA 4YL2A 1H1YA 1JUKA 2TPSA 4XUGA 1PHWA 3PSVA 3IVTA 1FDYA 4HNTA 3BARA 3MUXA 4MY9A 2QAFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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