2FGLA

An alkali thermostable f/10 xylanase from alkalophilic bacillus sp. ng-27
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
VQPFAWQVASLADRYEESFDIGAAVEPHQLNGRQGKVLKHHYNSIVAENAMKPISLQPEEGVFTWDGADAIVEFARKNNMNLRFHTLVWHNQVPDWFFLDEEGNPMVEETNEAKRQANKELLLERLETHIKTVVERYKDDVTAWDVVNEVVDDGTPNERGLRESVWYQITGDEYIRVAFETARKYAGEDAKLFINDYNTEVTPKRDHLYNLVQDLLADGVPIDGVGHQAHIQIDWPTIDEIRTSMEMFAGLGLDNQVTELDVSLYGWPPRPAFPTYDAIPQERFQAQADRYNQLFELYEELDADLSSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNDGVGKDAPFVFDPNYRVKPAFWRIID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of native and xylosaccharide-bound alkali thermostable xylanase from an alkalophilic Bacillus sp. NG-27: structural insights into alkalophilicity and implications for adaptation to polyextreme conditions.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords alkaline thermostable endoxylanase
total genus 142
structure length 354
sequence length 354
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2005-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2fglA00
4JHOA 1V0NA 4M56A 5GQBA 4AZ7A 2J78A 3FN9A 5AYIA 2VX4A 2EPMX 1U33A 4DWSD 3UG5A 3VGEA 1H0IA 1DTUA 2ZOXA 3VOCA 1J9YA 1UWSA 1BYBA 1XYFA 1ISZA 1HP4A 1SMAA 2WVTA 4B9YA 1JG9A 3AHTA 3VDCA 3MANA 1W32A 4W5ZA 2QPSA 1MQQA 5A6AA 1E0VA 4Q7NA 1B9ZA 2WMHA 3U7VA 4EAMA 1G94A 1FH7A 1NP0A 2ZX9A 1JZ2A 3ZO9A 3ARYA 3CIVA 3BAJA 2ZXDA 4V27A 5JBDA 4R27A 1UYQA 4TVDA 2GJXA 3N11A 3TONA 2CESA 1QNPA 1UWQA 3VGGA 1B3ZA 1W2PA 1PAMA 3AS1A 3TTSA 1EOKA 2V5DA 1XRVA 4JCMA 1QNQA 2PB1A 3ZJKA 1OGSA 5DO8A 2WC3A 4NZCA 3AMLA 3GDBA 4P7NA 4YHEA 3PZIA 1E43A 1MFUA 1W9XA 4JFTA 1UD3A 1HT6A 1J18A 1DWGM 4AY1A 4XUYA 4X0VA 2XVKA 2ZWYA 4PMXA 1NM9A 4UTFA 1S46A 2CKRA 4ACZA 3VD5A 5LYRA 2WMJA 2QMJA 1KXQA 3VIPA 2EJ1A 2EXOA 3CBWA 1J0KA 1MW0A 4PTXA 1KCLA 1CGYA 5AC5A 2VT0A 3SUTA 3WNMA 4HOWA 3WL1A 3ZQ9A 1GNXA 1KBBA 4D1JA 5DT5A 3ZM8A 4BA0A 1XGZA 2WCGA 1HKIA 3NUKA 1V0LA 5AC4A 1JZ8A 6A3HA 3VMNA 2AOSA 1ZB5A 4HMCA 1J10A 2D0FA 3VX0A 1C90A 8A3HA 1NWSA 4W5UA 5FD0A 3WQ5A 4HPHA 1IZJA 1R85A 5F7UA 1MQRA 2YL6A 3UG4A 3N12A 1JZ7A 5BXPA 1SMDA 1G9HA 3W38A 2DH2A 3DYOA 2D3NA 4W86A 3GXIA 4J3VA 4OZOA 1JYVA 2E9MA 4FK9A 1HXJA 1UOKA 4D72A 1VJZA 2QHAA 4UQDA 4H8HA 4BQ4A 2XFYA 1MQPA 1FH8A 5LA2A 3RPMA 3U7BA 3WL0A 2VO5A 4GXPA 4P8XA 1VAHA 2VURA 3OLEA 4CD8A 1V0MA 5AY7A 3BCDA 3HMCA 2VQTA 4D6HA 2BVTA 3AIWA 4UFMA 4PTVA 3WNLA 2D20A 3J7HA 4OOUA 3M7SA 1MWOA 1J01A 4OKDA 4HPGA 1AQ0A 3ARPA 1OINA 1CLXA 2CIPA 2XVLA 3SUWA 4IM4A 4KH2A 3F4VA 3WH9A 4XX6A 2GUYA 1V3HA 1CDGA 4AZHA 2PI6A 5E6ZA 1MW1A 1O7AA 1JI2A 4D6EA 2WCSA 3WQ4A 5EMYA 3B9DA 2ZUSA 5A6BD 3QHOA 2E40A 2WHLA 3UG3A 2VZVA 4CCDA 3K4AA 1TVNA 2YA1A 1JGIA 1BLIA 3AHZA 3VPLA 5E70A 3BSGA 3T0AA 1C93A 1BPLB 4MNKA 3RCNA 1YHTA 1DWAM 2XPKA 4J3UA 4QLJA 2ZX5A 5EFFA 2DIEA 1FP9A 2V3FA 2XIBA 1BGAA 2DSWA 3WUBA 3WD2A 4BS0A 4Y7EA 5D9MA 3WMBA 3MUAA 3CGTA 1Q4NX 1V6XA 4PMZA 3WUFA 3WF3A 2WMIA 1TA3B 1VBRA 3ARZA 3ZMRA 3L4TA 4P8VA 1IZKA 1QVBA 3K8KA 1TG7A 5DT7A 1HKKA 1HN1A 3SCRA 2G4FA 1ZBKA 1YQ2A 4W88A 1CXEA 4ZE5A 4PTWA 2J7FA 2VQUA 2YJQA 2J8GA 1B90A 3WEMA 1WKYA 1HVXA 2VRKA 2EPLX 2J8FA 3OG2A 2WLYA 4GI9A 1VB9A 5E6YA 5BCAA 4CN6A 3POHA 3ZJ7A 1ZBVA 1HJSA 3VIMA 3U57A 2EBNA 2WMFA 1QBBA 2GFTA 5ECUA 1UD8A 2YLLA 3FHAA 1J0YA 4UQ9A 1QPKA 3MUZ1 2XJ7A 2YIHA 4BQ3A 5IHRA 2Y8KA 1CYGA 3MUIA 5CPSA 1QI3A 1JYNA 4N42A 5CPQA 4WLCA 4UZUA 1U2YA 2QLYA 4UNIA 3CLWA 4U2ZA 1HJXA 3N15A 4CCEA 1PZ3A 1Q6CA 2E4TA 2X8RA 2JE8A 5CLTA 1D3CA 2BVDA 4ATLA 2JALA 3ARVA 3U5YA 4GZIA 2CKSA 4UQBA 1H0GA 1CXIA 1M7XA 4BQ5A 1GOMA 4PSPA 1GOIA 5I77A 2AMGA 4JZ5A 4F8XA 1TCMA 1EGZA 4BQ2A 4J3SA 2VRQA 3AIVA 1W9UA 1UZ1A 3HN3A 2VC9A 2Y5EA 3W29A 1VFOA 3NSXA 1E0WA 3WDRA 3BSHA 1E40A 2FH6A 1HJUA 4UOZA 1WPCA 4QFUA 1UR2A 1UKOA 1CLVA 1UH2A 5TD4A 3FY1A 3AS0A 2E3ZA 2VR4A 4EKJA 2CXGA 1OT1A 4E4PA 2YDQA 4LYQA 4CD5A 1E4MM 3GXDA 4UOQA 1PX3A 1UUQA 2BHUA 4GI8A 4UR9A 5A94A 3TTQA 1JYWA 1GUVA 1X6LA 3GM8A 3NDZA 1X1NA 3VINA 5FL1A 3GBDA 4AYSA 1E73M 4J3WA 1EXPA 3ZR5A 1DP0A 5CGTA 4IPLA 1MYRA 1EA9C 5KEZA 3MO4A 5M5DA 4EK7A 3VO0A 1UR8A 2A3CA 3MS8A 1E56A 3AIEA 2D24A 1TVPA 1JD9A 1M03A 3PZGA 5JIWA 4JIEA 4KWUA 5C70A 2WWDA 4KMQA 4HZ8A 3ARQA 2YA2A 4CU8A 4ATDA 2E8YA 3WENA 5GNXA 4JL2A 1TR1A 1NOUA 1RP9A 2A3HA 1BSIA 2WKLA 4GQQA 2WWCA 2WANA 1DWJM 1AVAA 1HKJA 1QW8A 1JZ4A 4AD5A 2WSKA 4MAZA 2O9PA 2DSVA 4MB1A 5GPRA 1Y7VA 4AWEA 1VBUA 3ALGA 5IHSA 5HPCA 1CBGA 2OYLA 1UZ4A 3QR3A 3PZUA 3PZQA 4P8UA 3IAQA 1UD5A 4PMUA 4RE4A 1GQIA 3B9EA 4HOZA 1ZBCA 1UH4A 4HOXA 4N0RA 3MSGA 4HMDA 4IPNB 4Z2JA 1BVNP 1E1FA 2XTKA 3EDFA 3WMSA 1WCGA 1PBGA 1MXDA 2XSBA 1OBAA 4M29A 4PSRA 3PZ9A 3WMCA 2Z1SA 1EO7A 1PEZA 2QMKA 1WNOA 2EQDA 2F8QA 4AIEA 1WDQA 4TX8A 4J7RA 3WNKA 4J3TA 3BXWA 4JFSA 1CXLA 3K8MA 1V6UA 3T2PA 3IJ8A 3OLIA 5I79A 1K9EA 3OLGA 1J0IA 1QI5A 5GNYA 5A8OA 3WF1A 1UR0A 1CGXA 1E5NA 5A2CA 2XFRA 1XH0A 5KZ6A 3CHDA 4CD7A 1JDAA 4PRWA 1KGXA 2YBTA 1PZ2A 4JCLA 1JFHA 2CBUA 2O92A 1EQCA 3G6MA 2VI0A 4F66A 1VEMA 3WY1A 3WEOA 3OBAA 3VTRA 5FCZA 1JZ6A 1CXKA 3ECQA 1ISYA 4D71A 2XVNA 2J7BA 5FKYA 2FDMA 3MMUA 4QCFA 2BV9A 1TZ7A 2JIEA 3VGHA 3WD1A 3IJ7A 3PTQA 2CEQA 4XZWA 3RJYA 2ZXAA 5BRQA 1BQCA 1B3YA 1JXKA 5A8QA 1OT2A 1V6YA 3THCA 1G1YA 5JIPA 3VIIA 1W9PA 5DFAA 3VGBA 1ODZA 1J12A 3BAYA 1BG4A 3F5JA 1CGVA 2NT1A 4W89A 2DT3A 4AD3A 3GH7A 3AXXA 3WD4A 3ARRA 1PX8A 1EH9A 3BMWA 1ZL1A 3SUUA 1WAWA 3EMZA 5C8BB 2W63A 3SCOA 2BVYA 3D3AA 3E1F1 4UFKA 1GOKA 1VENA 4PUEA 2VZSA 4B15A 3CZKA 2JIWA 1XSIA 3T0DA 1VF8A 3DECA 4GKLA 1JZ3A 5ABHA 3WBAA 3AMGA 4CN1A 1ZU8A 1QNOA 2VL4A 2WVVB 1H3GA 1Q6EA 1MVYA 1V02E 3CMJA 1UD2A 5I23A 4AISA 2Y4SA 3EMQA 1NWRA 3DHPA 2BY1A 4S3JA 3AJ7A 2YOCA 1E0XA 4AEEA 4V2XA 4PUDA 4P8WA 1HJWA 1XD1A 3L4XA 1KWKA 2WYSA 3WBEA 1UR1A 2WC7A 3AI0A 1QW9A 5JBFA 1UR9A 4H2CA 3CZGA 3ZSSA 1NWUA 3A4WA 4ZENA 1W1TA 3OLDA 2WVUA 5D4YA 3WKZA 4FLSA 2Y24A 5DEZA 4LYRA 4WKHA 4PBGA 3WNPA 1DHKA 1QBAA 1UG6A 5FOOA 1EO5A 3GZAA 3M46A 4MB3A 4B3LA 1CWYA 1BGGA 1LL7A 1QOXA 1BVZA 2CITA 1V3KA 1US3A 3RMEA 4TUFA 2ZX8A 5IFTA 1C8YA 4UOJA 4D1IA 1LJYA 2YL5A 3IK2A 1B30A 3ARSA 2WLZA 4M82A 2ESCA 3ZR6A 5BXRA 4JL1A 3N17A 3OZPA 2WW5A 5D8WA 1W91A 1WZMA 3OGSA 2XWDA 1GCYA 1LWJA 4UFJA 4WJXA 1W9VA 4JHZA 4U31A 1XH2A 3VU2A 3CMGA 1H49A 4W84A 1GOQA 3UERA 5I5RA 3WEZA 4WIWA 4OJYA 1HX0A 3NYDA 3AIBA 4TOQA 3UESA 2D2OA 5HBFA 1V3IA 1FHDA 3GH4A 3PTMA 3ZSTA 3BAWA 2VMFA 4D6IA 1B3WA 3ZT7A 1LF1A 3PZTA 3AZRA 3SURA 1EQPA 1OM0A 2WMKA 5A6LA 5A2BA 2GJRA 3AIQA 1L8NA 2J7DA 2VCBA 5HPOA 1KQYA 1W9BM 2WVVA 4J27A 2J47A 2W91A 1RPKA 4E2OA 1E55A 4A4AA 2D23A 3CHCA 5D9NA 4K68A 3GNOA 1QHPA 3AQUA 4FMVA 3VM7A 2TAAA 1V6VA 1O6IA 3AMCA 3WF2A 4BZYA 4ZE4A 2D0HA 1J0ZA 2GK1B 2BFGA 4ZEPA 3LPPA 3VKKA 3MSDA 4JFWA 1C7SA 3W6MA 1TMQA 2PBGA 4Z2GA 1LL4A 2VX5A 1MW2A 4MJ4A 3RM9A 5CSUA 2VX7A 3PZMA 4F79A 4P7RA 1E6SM 2UY3A 3B9AA 3OGRA 2G3JA 4AD2A 2DSKA 4CVUA 2XFFA 2VRJA 1KGWA 3KL0A 3VGDA 2DSUA 4ZXOA 1E6NA 5A69A 3JUGA 2V3GA 2Y8VA 3SIMA 1N82A 4J28A 2UY5A 1W2VA 1HL8A 3EMCA 4H7VA 4MPKA 3G6LA 1GVYA 3ARXA 3PZOA 4AZCB 3FW6A 1E3XA 1JZ5A 3U5UA 3RM4A 2W5FA 4CCCA 1P6WA 4IISA 4AC1X 3WF0A 5FIPA 2O9TA 4OBRA 4JKLA 1NQ6A 1L0PA 5AYBA 2E0PA 3VDBA 2Y2WA 1TE1A 1ITXA 4CN4A 3FXYA 3WELA 4LYPA 1LG1A 2CPUA 3RDKA 1FH9A 5A6BA 1A3HA 5JBEA 3LPOA 3WQVA 1ISXA 3VNZA 4X9YA 3VIKA 2W4XA 2OSXA 5ABGA 3VX1A 2JF7A 2DIJA 1MFVA 2BY3A 1KBKA 4PCTA 4UFLA 3QOKA 3L2MA 1R8LA 3AS3A 1XYZA 1E9LA 4MJ2A 5M3WA 3ZT5A 3GNPA 4BCEA 2WHMA 3SCUA 3VDAA 1XV8A 2OLHA 1CXFA 1GQJA 4JKMA 4NSBA 2JEQA 1C92A 3SCQA 1KXTA 4U5IA 2Z1KA 1WZAA 1NOFA 3W28A 5GNZA 4LQ1A 2GDVA 2GJPA 3FAWA 3CZEA 4F9DA 2ZIDA 5CSYA 4DUVA 4P7QA 1ITCA 1NARA 4GI6A 3CUFA 3W53A 3OA5A 5A95A 4E8CA 2Q8XA 5DF0A 1R7OA 2CBVA 5BXTA 2CHNA 4UFIA 1ZBWA 1QI2A 2CNCA 3TTOA 5CGMA 2VZUA 3SUVA 2WHJA 3L4YA 1B31A 3D5HA 1PIGA 1XSKA 3PZNA 3L4UA 2D1ZA 4GZEA 2DH3A 3MKKA 2WHKA 2WAGA 4MADA 2E9BA 2G3IA 4D6GA 3M6DA 3N13A 4PYSA 1E1EA 2BHZA 1QNRA 2WNWA 2X2YA 4AZCA 1M01A 5JUVA 1EHNA 5HOSA 1RD6A 1B2YA 1E5JA 1H11A 1WE5A 3A3HA 3VILA 1JYXA 5HXMA 2CERA 2E9LA 3VMOA 3RILA 1RH9A 1TA3A 3VIOA 3SCVA 2VNCA 4ML4A 4H8VA 3GH5A 4HZ7A 1CZ1A 2VCAA 2PWGA 1C8QA 3W82A 2PWEA 2FH8A 2BS9A 3GYCA 1KWGA 1WB0A 1V3LA 3NJ3A 4WSKA 2QPUA 3KL3A 4UQEA 4M81A 4ACYA 2FGZA 3W81A 2PWDA 2D22A 1KGUA 1F4HA 1GZJA 4AMCA 1NOWA 2OWCA 4D6CA 4MB5A 3W25A 2UY2A 1C3FA 1KCKA 3PBGA 1CECA 1HIZA 3VNYA 2OYKA 1AQHA 2X05A 2OSWA 1QHOA 3SCNA 3KEHA 2WBKA 3ARTA 4H8UA 4A3YA 3AYRA 4HA3A 1BTCA 4GPNA 3KL5A 3VD7A 1HNYA 3W6LA 4KRUA 4AZIA 4XZBA 4HA4A 1G5AA 2VVNA 1B0IA 3EDKA 1B3VA 4AD1A 1H4PA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4JHO A;  1V0N A;  4M56 A;  5GQB A;  4AZ7 A;  2J78 A;  3FN9 A;  5AYI A;  2VX4 A;  2EPM X;  1U33 A;  4DWS D;  3UG5 A;  3VGE A;  1H0I A;  1DTU A;  2ZOX A;  3VOC A;  1J9Y A;  1UWS A;  1BYB A;  1XYF A;  1ISZ A;  1HP4 A;  1SMA A;  2WVT A;  4B9Y A;  1JG9 A;  3AHT A;  3VDC A;  3MAN A;  1W32 A;  4W5Z A;  2QPS A;  1MQQ A;  5A6A A;  1E0V A;  4Q7N A;  1B9Z A;  2WMH A;  3U7V A;  4EAM A;  1G94 A;  1FH7 A;  1NP0 A;  2ZX9 A;  1JZ2 A;  3ZO9 A;  3ARY A;  3CIV A;  3BAJ A;  2ZXD A;  4V27 A;  5JBD A;  4R27 A;  1UYQ A;  4TVD A;  2GJX A;  3N11 A;  3TON A;  2CES A;  1QNP A;  1UWQ A;  3VGG A;  1B3Z A;  1W2P A;  1PAM A;  3AS1 A;  3TTS A;  1EOK A;  2V5D A;  1XRV A;  4JCM A;  1QNQ A;  2PB1 A;  3ZJK A;  1OGS A;  5DO8 A;  2WC3 A;  4NZC A;  3AML A;  3GDB A;  4P7N A;  4YHE A;  3PZI A;  1E43 A;  1MFU A;  1W9X A;  4JFT A;  1UD3 A;  1HT6 A;  1J18 A;  1DWG M;  4AY1 A;  4XUY A;  4X0V A;  2XVK A;  2ZWY A;  4PMX A;  1NM9 A;  4UTF A;  1S46 A;  2CKR A;  4ACZ A;  3VD5 A;  5LYR A;  2WMJ A;  2QMJ A;  1KXQ A;  3VIP A;  2EJ1 A;  2EXO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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