2FJKA

Crystal structure of fructose-1,6-bisphosphate aldolase in thermus caldophilus
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
MLVTGLEILRKARAEGYGVGAFNTNNMEFTQAILEAAEEMKSPVILALSEGAMKYGGRALTRMVVALAQEARVPVAVHLDHGSSYESVLKALREGFTSVMIDKSHEDFETNVRETKRVVEAAHAVGVTVEAELGRLAGIEEHVAVDEKDALLTNPEEARIFMERTGADYLAVAIGTSHGAYKGKGRPFIDHPRLARIAKLVPAPLVLHGASAVPQELVERFRAAGGEIGEASGIHPEDIKKAISLGIAKINTDTDLRLAFTALVRETLGKNPKEFDPRKYLGPAREAVKEVVKSRMELFGSVGRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Stereoselectivity of fructose-1,6-bisphosphate aldolase in Thermus caldophilus
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Thermus caldophilus
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
total genus 102
structure length 305
sequence length 305
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2fjkA00
3M5YA 2BLEA 4E2DA 1JRCA 3F03K 4LUIA 4LRSA 4Y90A 3OVPA 2JKEA 4O1CA 3I7SA 4KFOA 5K9CA 4N4QA 2R8WA 1XXXA 4IPIA 1KM4A 4XBSA 5LHEA 4CLMA 1GVRA 4BF9A 1Q6QA 3GB6A 2EGZA 4AF0B 5K7JA 4EOUA 1OFRA 1Q3NA 2Y61A 4CCEA 1ZALA 3MUXA 3P81A 4J9JA 1H1YA 4RLIA 4CCDA 4LVGA 3SR7A 1PE1A 4O0ZA 3G1XA 2H3DA 3OVRA 3QSRA 2ZBTA 4HKPA 2GVLA 1FDJA 4LC6A 5LNVA 3SGZA 2Z0IA 4MFEA 3QMTA 2JKAA 3PBVA 2DZVA 3F1QA 5AN7A 3H53A 3T7VA 1T8XA 3O8AA 3W76A 3UPBA 3NQDA 3LCGA 3B0VC 3S1WA 1EP3A 1R2SA 5KMYA 3TJLA 2RH9A 1UJPA 1P0KA 3M5XA 1KM2A 4MFDA 5HMSA 3TKFA 3DU0A 1EIXA 4AWSA 2A21A 1AW2A 5AC8A 4R7JA 4O13A 4XTDA 2YFOA 4YWIA 3KVJA 3HBLA 5HUOA 2XN2A 2NZLA 2QCEA 3S0CA 4EWND 3T55A 3DFQA 3W7PA 1FXQA 1HO4A 2CZEA 5HUPA 2H6RA 3HOJA 4S1FA 3GLCA 2A7RA 2BXVA 5K3VA 5I3IA 3UWUA 2NUXA 2VFGA 4KWWA 2HTMA 4YXGA 2C3ZA 1IXPA 5I3JA 3B0UX 3G1HA 3WJYA 1TPDA 1RR2A 3CEUA 1OX4A 3N19B 3O05A 4PA8A 4N6FA 3R12A 2TRSA 3DFPA 3MI3A 4MY1A 3QPZA 1TSIA 3G3MA 4ORIA 1JCLA 1W0MA 3E12A 4E0CA 3LXCA 3HGRA 3GKAA 1F05A 4CNPA 1G7UA 2VEIA 3IRDA 3W9ZA 5AYZA 5D05A 1R47A 4N6EA 3LCIA 1VCVA 3P62A 2DJLA 1Y0EA 2A2IA 3UWQA 1NAL1 3A21A 4M7TA 2JGYA 3VE9A 3A9IA 3FYOA 3Q2DA 1QAPA 5LKYA 4XBKA 3LRKA 3G1SA 2NX3A 4OHQA 1M7PA 5CZSA 4OQVA 3TROA 2J9XA 4Z08A 4BK9A 3L5LA 1AK5A 3PSVA 5G2WA 4UFHA 3HGJA 3TFXA 1ZCOA 3BPWA 4NNAA 1TMHA 3DHFA 3N9RA 3MHGA 1L6WA 6ALDA 4UFIA 3GDLA 3BG3A 3W7OA 3TW7A 1B57A 1S5WA 3ANYA 3NPVA 1FUYA 1LOLA 4MOZA 1YPIA 5AHNA 2A6NA 3GAKA 3FFSA 2NUWA 2Y7DA 2X30A 5D32A 3OG3A 3U8GA 3C4UA 1VCFA 2WNQA 2A0NA 1LORA 5D2VA 3M7WA 5BOOA 3KRUA 1PS9A 2CLLA 1SSGA 1MXSA 1RQBA 2GQAA 5G1YA 4DPPA 4HNUA 2ZRUA 4MUZA 1KLZA 4D2JA 3PC0A 3JRKA 1SU5A 2HS8A 4HNVA 2ZZ4A 1W5OA 2JGQA 3E9AA 3IIVA 4LVAA 4O14A 1PVNA 2Y70A 1DJNA 2ZZ5A 5G5IA 4A22A 4HPJA 1K7FA 2VFEA 2I9EA 1KTBA 4QITA 4MPQA 2PRLA 1ZAIA 3NQGA 2AGKA 4UTWA 1WX0A 2ZRZA 1W5PA 5FF4A 2VENA 5E1QA 2QKFA 4JIQA 2UV8G 2QDHA 4PL1A 4RXFA 2ZRVA 5D38A 1ICQA 4YCOA 4LNYA 1Z44A 4QSHA 4RX0A 2WKJA 3M1ZA 4LS1A 1QO2A 2ZRWA 3PB2A 3C6CA 3C3NA 1WXJA 1YTDA 4KFPA 3L68A 1QCWA 5F2MA 5LNUA 2NUYA 3IGUA 3TXZA 4NJKA 3G1FA 2YFNA 3T78A 3WJXA 4ZQOA 1G4PA 4CNNA 4WJEA 1VLWA 4HT3A 1J2WA 1GVFA 1LBMA 3LRLA 2DZWA 2YYTA 3TNOA 3MHFA 1F2JA 4O53A 1WBHA 3G1YA 3BO9A 3LHVA 1TB3A 5CKSA 4MY9A 1WBJA 1VHCA 3L5AA 3Q58A 2EHHA 4Z1DA 1FXPA 3B03A 1O4UA 2QUVA 3NZRA 2VFHA 3C2FA 3G8EA 4ALDA 1OYBA 4XKYA 1X1OA 3TCEA 1N7KA 2CLKA 2TMDA 1R30A 3W73A 4M19A 1T99A 1TRIA 2NWRA 2V5BA 3KRSA 2XN1A 3VE7A 3WK0A 4EVZA 3NO5A 4FXRA 3DI0A 5AOUA 3S6DA 3N3MA 2B0MA 2A4AA 3BGJA 3C2OA 1AMKA 1RV8A 3TUUA 1LP6A 2C13A 2YGYA 2WPBA 3EX6A 2YCEA 1OK6A 1TPEA 4JTKA 4AEOA 1H7PA 2DZPA 3GK0A 4FEZA 3TDFA 3W7CA 1EUAA 3VNDA 2FB3A 2QCDA 1TCDA 2DZXA 1OFAA 3AJXA 3MO7A 4Y6GA 3RF9A 4ZZ9A 1MZHA 3EWXA 1H60A 2Y7FA 2XFWA 1HUVA 4MLJA 3M5ZA 2YX0A 3QW3A 4UUIA 3DXIA 4HNNA 1TYGA 3UY7A 4QAIA 3W1RA 3S9YA 4IX2A 3R13A 3HO8A 1L6YA 2CLHA 3UYCA 4GXMA 2Y85A 1W8SA 4W9TA 3N2XA 1W3NA 3NAVA 3ZS4A 4Z1AA 2G95A 4ZQCA 2VEMA 4FF7A 4EIVA 1VGAA 2GOUA 1L6SA 1O5XA 1OX5A 1SO6A 5D2TA 3GVGA 1WYIA 5LZLA 4O19A 5AFDA 4WXYA 3CU2A 3W7EA 3C2EA 4JS3A 4MJZA 1KFLA 3TQ0A 5HR6A 3NEVA 4FIRA 3O16A 2Q3OA 3R89A 2E5DA 3V1PA 4RKAA 1VR6A 2ZRXA 4M6PA 1VYRA 4NZFA 1AW5A 2BZNA 4TMBA 3STFA 1JR1A 1KM5A 2YR1A 3MI2A 4O57A 1XFBA 1JULA 4S2BA 3UWZA 3L0GA 5LNWA 2H8ZA 1P4CA 1TPUA 1PCKA 3PB0A 3BARA 4JY8A 2NXGA 1RQEA 1VLIA 4I9AA 3QMSA 3TR2A 1J4EA 3G0UA 3IIZA 1VQTA 4JTLA 1JCXA 1O5KA 2HS6A 4AB4A 1NSJA 3LXBA 4O28A 5L9FA 1O60A 3SI9A 2RDUA 2DJXA 2G97A 3ABRA 1S5VA 3P82A 1D9EA 2ABAA 1A5BA 2QCHA 3LI0A 1IIHA 3DKJA 5D03A 5LGXA 2O7QA 4JYDA 1TPWA 1TPVA 1S5TA 1VC4A 4UTTA 1W5QA 4NX0A 3LCXA 2NWSA 3GDMA 4CQAA 4Q4KA 3HF3A 4JTSA 2PE4A 3HQ1A 1F6PA 1I2PA 4LT9A 4GC4A 1CW2A 1MEIA 1OFQA 1YLVA 3BW3A 3FKRA 4UXDA 5DLCA 3VKJA 1SR9A 1VYSX 1ICPA 3ZR4A 4TX9A 2Y63A 3HG2A 3LB0A 4OV9A 3GDKA 3TJXA 3GZ3A 5I3KA 3W88A 1HG3A 2X1RA 1NEYA 1TREA 1Z41A 3TQVA 3SZ8A 3LHUA 3PUDA 3RLUA 4ZQRA 4O12A 4AWTA 3W7DA 3HG5A 5BRBA 3NQ6A 1PHWA 3FEMA 4QQ3A 4LS2A 4NX5A 4BI6A 2VKZG 2WSYA 5CZTA 3W7MA 2CLFA 3B04A 5C2XA 4AH7A 2Y6ZA 5FESA 2WO5A 4YL2A 1LRQA 1L2UA 4ADSA 4TU1A 4O4WA 3TMLA 3CLMA 3R2GA 4JX6A 1EB3A 1LROA 5F2IA 1TPFA 2QCGA 4O54A 4IJBA 4HN4A 3FJ6A 8TIMA 5LNRA 3F4WA 1XCFA 3M47A 5U7SA 4MYXA 2OT1A 4MVAA 2YYUA 3PG9A 5F1UA 1UUOA 1DJQA 3E96A 3BLIA 5AB3A 2GJLA 2FJKA 3KOFA 3G1DA 3P5ZA 3WK2A 1KW1A 5KINA 1RQHA 2E6AA 3PBUA 5K4XA 5IBXA 1H7OA 1FBAA 1DV7A 2FB2A 4Y9AA 3WJZA 2Z1BA 3O06A 4JTIA 1MO0A 2OJPA 4UCGA 4ZQPA 4UR7A 5FF7A 2F7FA 1B4EA 4H4IA 3USBA 4LY8A 3P74A 2QR6A 2V8ZA 3TIMA 4LVFA 3UY8A 5HJLA 3W7LA 2TYSA 2CZFA 1TQXA 1WAUA 1YXDA 2E5CA 1I2QA 1Q6OA 2AQWA 4MYAA 3THQA 5I3FA 1P5BA 1BTMA 5K2ZA 3BGGA 1QPNA 3TFCA 3W2MA 4LV4A 2YW3A 4WD0A 4FNQA 1R46A 1QOQA 1R2TA 4AMAA 1UUMA 1T96A 4ONVA 3CWNA 3PSWA 1OK4A 1Q6RA 4R53A 4JTFA 3QC3A 3FIGA 4IUOA 4NXKA 3W83A 4JIPA 4A2RA 1YYAA 3NL6A 4Y8FA 4MJMA 1GQNA 4KWVA 5BNKA 1HTIA 1GOXA 1TTQA 1ICSA 4IMFA 4JTTA 4DO4A 1W5NA 4FO4A 3PVFA 3ABOA 2WSQA 1JVNA 3B06A 4WY0B 4AF0A 4ZL1A 1NF7A 1AG1O 4KKXA 4TIMA 1KV5A 3W7QA 3TC6A 3KHJA 1ZJIA 4UR8A 3CPRA 3W1PA 5E93A 4BI5A 1MSSA 3L2IA 4N4PA 3W2LA 2ZTJA 1GJPA 3EXSA 1YXYA 3TSDA 2EPHA 4M5PA 4FHAA 4RZ4A 2VELA 5AHLA 4CCCA 3W84A 1PHQA 1FY6A 2GVJA 1MEHA 3KFTA 1X7FA 1QPQA 4NJIA 1IF2A 1F74A 2ZCGA 4L4MA 5FF3A 4A29A 3QYQA 2C16A 2JBMA 1KFCA 4DO5A 1OFOA 4UNLA 4HHPA 1SW0A 1FCVA 4QISA 1JUKA 4GBUA 3LV5A 2E1DA 1VCGA 2QCCA 4IPJA 5F1VA 5BMWA 4K8HA 2V30A 5D2WA 1Q6LA 4ORMA 3W74A 1JCNA 2YW4A 1RPXA 2QCMA 5CPNA 5DELA 3W23A 3O07A 3MYOA 4K37A 4BWLA 1TV8A 4WOZA 5HNRA 4FNRA 4MZYA 3G0SA 4IGHA 3STCA 5AC6A 2NX1A 3NPXA 3OA3A 3UZ5A 1WQ5A 3GXTA 3IVTA 3W2JA 4NNCA 3ABSA 2CLIA 3WK1A 2OCZA 1JJKA 2WV8A 1GWJA 2QCFA 2R94A 4PODA 5F4XA 5TIMA 4WUIA 5A5WA 2B7PA 4LS0A 1OABA 4OWGA 4JGDA 3L67A 3ZWTA 4C1KA 1SZNA 2ALDA 2JK2A 3M43A 5FEWA 3N73A 3W86A 3BLEA 1H63A 1G4EA 4A21A 4IMCA 1I8JA 1K8XA 3QFEA 1OFPA 5K9DA 3TAKA 2Z2UA 3EKZA 4O11A 1TTJA 2QJIA 1OVDA 2FDSA 2FFCA 4MIMA 4UTJA 3EXRA 4JTUA 4FNSA 2C14A 1QWGA 1H51A 4L4LA 1JCJA 3PUOA 1K03A 3NVTA 3N9SA 3WK3A 2X16A 1TV5A 5LNSA 4HIBA 4WXZA 1PL9A 2BSLA 2E77A 2BX7A 2E68A 2A85A 4JD4A 5G4EA 3LCFA 2YDAA 4G1KA 3S42A 4XUGA 3SJ3A 1SZEA 2R14A 4H6KA 2VFDA 2W0UA 3NM1A 4UTMA 1SUXA 4Z1CA 3HG4A 1VHNA 4AHOA 4IXHA 1YDNA 1RZMA 1FDYA 1TJRA 1K3UA 3DHDA 4JYEA 2WSRA 3TMQA 3U6WA 4OGZA 4IWWA 2E5BA 2A7NA 4XWUA 2WNNA 5FEXA 5KZEA 3EWZA 3MYPA 3INPA 5H91A 2CZDA 3NQCA 3NYZA 3DZ1A 4TO8A 5EKYA 3MP5A 4IMEA 4S2CA 4PL2A 2PURA 4JDBA 3LTSA 4NNBA 3MP4A 1YADA 3P84A 4LOCA 4AXKA 2D73A 4PEKA 4A2SA 4CQ9A 2WJZA 3VFLA 1W31A 1OF6A 3EKLA 1W5MA 3GR7A 1XBZA 2ISSA 1FCBA 1H7NA 4FXSA 4ZQMA 4IXXA 2C18A 1ME9A 1GEQA 3BVJA 5L6UA 1JRBA 2ATMA 1ZAJA 4NQ1A 5D37A 2I14A 1HL2A 3W2UA 4IOTA 2QCNA 3NL5A 1K7EA 4ICNA 3QEZA 3OIXA 4DPQA 4OBTA 1UCWA 3L66A 1TTIA 5HR7A 1F73A 1ONRA 5CPMA 3PWAA 3T4CA 3QPYA 2DORA 1OJXA 1WA3A 3CT7A 4H3DA 3LBCA 3W1NA 1IIGA 4O1DA 5F2LA 2FPVA 3W6YA 4LTSA 1SFLA 1UASA 2QAPA 3KXQA 4Y96A 1IGSA 5EBUA 2FLIA 3S5NA 1JQVA 3UXAA 1C9DA 5DBUA 4FNPA 2ZZ1A 1XI3A 3ABQA 4DF0A 4PH6A 1SQ7A 3GKFA 2V5LA 3T44A 1AL7A 3S1XA 2PRMA 3HPZA 2HMCA 5I3HA 5H2ZA 5DN1A 1SO3A 1LBFA 3DFNA 4N9EA 1G69A 1BKSA 4UTHA 5SWUA 4FX7A 5EL1A 3HIJA 1A5CA 3FS2A 3GDTA 1OG0A 2H8XA 2Y88A 2G96A 1LM1A 4UTWC 3GYEA 2QUUA 4UTIA 1WOAA 2J6XA 3THAA 4UC5A 4XQ6A 3OVQA 4NJGA 2X1TA 2VEPA 4UFMA 4JY9A 1QFEA 4I7WA 5K4ZA 4HSOA 4UMAA 1OX6A 4ZMGA 3RFAA 2DU2A 2ZRYA 3SECA 2G5WA 3AO0A 2TSYA 3LM7A 3QQ1A 4C1LA 5AHFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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