2FJKA

Crystal structure of fructose-1,6-bisphosphate aldolase in thermus caldophilus
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
MLVTGLEILRKARAEGYGVGAFNTNNMEFTQAILEAAEEMKSPVILALSEGAMKYGGRALTRMVVALAQEARVPVAVHLDHGSSYESVLKALREGFTSVMIDKSHEDFETNVRETKRVVEAAHAVGVTVEAELGRLAGIEEHVAVDEKDALLTNPEEARIFMERTGADYLAVAIGTSHGAYKGKGRPFIDHPRLARIAKLVPAPLVLHGASAVPQELVERFRAAGGEIGEASGIHPEDIKKAISLGIAKINTDTDLRLAFTALVRETLGKNPKEFDPRKYLGPAREAVKEVVKSRMELFGSVGRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Stereoselectivity of fructose-1,6-bisphosphate aldolase in Thermus caldophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus caldophilus
total genus 102
structure length 305
sequence length 305
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2fjkA00
3DFPA 1OF8A 3G24A 3KVKA 1OYBA 4NJGA 4O17A 4UCGA 2CZFA 5IM51 2R8WA 4XKYA 1LLWA 2V81A 4EIVA 2OT0A 5CZJA 5HR6A 1ZALA 4OGZA 1UB3A 2CWNA 4I9AA 4YWIA 3OEXA 3QMRA 5F2MA 4PODA 4KKXA 1UBSA 3W7NA 2H6RA 1I45A 5U4NA 1IIGA 5D2XA 3MP5A 3FKRA 4UTMA 2VFHA 2ZCGA 1QCWA 1ME8A 1UJPA 4OE7A 1RR2A 1H60A 2ATSA 3KOFA 3DFNA 2CLOA 3LBCA 1FX6A 4LVFA 2AAMA 4UTHA 3NPXA 5F2LA 1TPH1 5D2YA 3C56A 1ZNNA 1K02A 3G8RA 5E0KA 4MZ8A 3L9CA 3NM1A 3Q2DA 1A5CA 4Z1BA 4O53A 3LRLA 1FUYA 3HG3A 1TIMA 4EF8A 4QJ1A 1M5WA 4BI6A 3KXQA 4N4PA 1Q6QA 3UPWA 4WY0B 1OHLA 4JY9A 3PM6A 4Z1AA 2DJXA 1TCDA 3TR2A 3BPWA 2QCFA 2QDHA 4MJZA 5I3IA 4UTJA 5MHBA 3UZ5A 1EPXA 3E12A 3L5LA 1ZJIA 2RHGA 3QMTA 2PE4A 3P74A 5CPLA 4UMBA 1PL9A 4Y8FA 1XDLA 5GVJA 4TMCA 2F7FA 1MEWA 1MXSA 3B8DA 1TPC1 5DCBA 1GYNA 3P67A 2E5BA 1ALDA 5D38A 2GQ8A 3PB2A 1K8YA 4IQLA 3C2RA 5EA9A 2C18A 3QRHA 5CSSA 4YL2A 2CLHA 3E02A 4UNKA 3VE9A 3S5OA 4UMAA 2ZA3A 3TE9A 2E6DA 4O57A 2V2CA 4JTLA 4O0KA 1XBVA 1O60A 3BLEA 3EX6A 1H7OA 1TV7A 3RU6A 3M6YA 5EYWA 3KVMA 1ME9A 4MPQA 3STGA 1H1YA 3BARA 4EWND 3W1NA 3W6YA 2X30A 1Z42A 2NX1A 3U8GA 2YW4A 4UR7A 3GDRA 5G5IA 4QITA 2ZZ4A 1LLZA 5K9CA 4NU7A 3GX9A 2R94A 3EXRA 2FIQA 5LGXA 1SFLA 1OVDA 4JX4A 5L9FA 1I2RA 3PR2A 2VXNA 4QISA 3HG5A 5AYYA 4IMDA 4S2CA 4JTEA 4UMCA 1RD5A 3WJZA 4ADTA 3SI9A 1AK5A 1VYRA 3G0UA 3MYOA 3PULA 1WBJA 5FEWA 2FQIA 2NXGA 1QO2A 1KM6A 3TC7A 4N02A 2J9ZA 1LROA 1DJQA 1ZY9A 3W7KA 5K4ZA 3TIMA 2Q3RA 3F03K 2BXVA 2P10A 1D3GA 4UFLA 3PG8A 1GG1A 1SW3A 1T0OA 1GG0A 2Y7GA 4K37A 4GUIA 4LNYA 3W88A 3GNDA 1VLIA 2Y7DA 2PRLA 3STFA 3CTLA 1KTCA 1H51A 4I7UA 3KHJA 3W70A 1KV5A 4NXSA 3T44A 3NQ8A 3PUOA 4I7VA 1XBXA 1F6KA 1TRIA 5K2ZA 2E5CA 4LY8A 3SSJA 3B05A 4TX9A 3DFSA 3LCFA 3W83A 4UXDA 4JTKA 4HSOA 2CLFA 2O7SA 3SZ8A 4L4MA 4IPIA 4IX2A 1GVOA 2E1DA 3NL5A 3DFQA 1KTNA 1OX4B 3TXVA 3EKLA 3N73A 4UTIA 1XXXA 2VEMA 3IGXA 4UC5A 2X1RA 3MI6A 4ZQPA 1GQNA 5LNRA 2YFNA 1GJPA 1K3UA 4R7JA 3I7RA 3TMQA 1DOSA 4ZQNA 3B0UX 6TIMA 4UUIA 4L4LA 3PBUA 2ZA2A 1QPQA 1B57A 4IMGA 5IBXA 4C1KA 4PH6A 4A3UA 1PHWA 3PS7A 3GB6A 5FF0A 4ZVJA 1KM0A 3JR2A 1G67A 1I4NA 1LCOA 4NJJA 4AWTA 1B4KA 4RR4A 4MY9A 2NWSA 3M0ZA 3TUUA 5AC7A 4XTDA 5F1VA 1J2WA 3DKJA 1QNVA 3IIPA 1VS1A 4K8EA 1K8XA 4MZYA 2NZLA 4A21A 5C54A 2YYTA 4IJBA 2W0UA 3KFTA 1LOLA 2H3DA 1PIIA 3MJYA 3LTSA 4MIMA 3W75A 2CLIA 4BWLC 2A4AA 2WNZA 7TIMA 4XKYB 2Y70A 4FXSA 3IIZA 2Y62A 1S5WA 4NXKA 3IVTA 2A2IA 4QSHA 1JCJA 3W2UA 3GDLA 1VHNA 3KX6A 3HB9A 1P0KA 1VCGA 2QKFA 1Q6LA 1VR6A 2FB2A 1T8XA 3LXCA 1OX6A 4BK9A 1U83A 1AG1O 3W1UA 4MJMA 1H5YA 1A53A 1KBIA 1SZFA 3O05A 4H6KA 4O15A 5CZTA 5BMWA 1HUVA 3HPZA 4Z08A 1WV2A 4TR9A 3W7EA 2NV2A 2TYSA 3EXSA 3LB0A 2WSQA 3Q94A 4LV9A 3W1AA 3P84A 3SGUA 4EF9A 4JTHA 1SZGA 1TPEA 3TA6A 1TPVA 4IXHA 2V5LA 4O4WA 3TCEA 5CKSA 1J4EA 1FWRA 2WKJA 2RH9A 3ZR4A 5BMXA 4RLIA 1TB3A 2QJIA 4LRTA 3QPZA 5AOUA 1TPDA 3W7LA 1TO3A 1YDOA 2ALDA 3GK0A 3G1HA 5KITA 3KVJA 3MBFA 1KFEA 2YR1A 4OV9A 3O8AA 3I7SA 4XWUA 1LOSA 4O14A 3W23A 2QCEA 2NUWA 3IRDA 1YDNA 5I3GA 1F76A 4LTSA 1AW5A 2OT1A 3G1VA 1HFBA 4QIUA 5DELA 5LHFA 1ME7A 3C8FA 3CT7A 3NQFA 3EXTA 4TU1A 1WDWA 3LCXA 3CWNA 2QCMA 1VH7A 1ICPA 2EF9A 3DENA 4NX5A 3ZFHA 1KLYA 4JICA 5F4SA 3S1VA 4PL1A 3BGGA 1YXCA 4X3ZA 1WOAA 2ZRYA 1L6YA 1VZWA 3HGSA 5LSMA 4LVAA 3M5XA 4N2YA 3TH6A 2PURA 3PUEA 3MI3A 1LBLA 4JNMA 4MY8A 1QPNA 1B9BA 1LORA 4PCFA 3RF9A 3STEA 2A1YA 2AGKA 1A5AA 1JCLA 2OX1A 2Y7FA 4JEQA 1MEIA 3QQ1A 3PVFA 4Y6GA 4UTKA 1OFPA 4JS3A 3BLIA 5DCDA 3WJSA 1YPIA 1KW1A 2QR6A 2G96A 1OABA 3U6WA 3S5YA 2NUXA 3LHZA 3CIWA 4RJEA 4EOUA 4R33A 2CU0A 3EWYA 5A8GA 3O1NA 3LI0A 2NV1A 1JQXA 4FNQA 3QZEA 1Q6RA 3Q37A 4JR5A 4UTWC 2BTMA 1XFBA 4IGHA 3TV8A 3S5NA 4IOTA 5TIMA 2C15A 1F73A 3NL2A 2GPTA 5KTLA 2AQWA 4OT7A 4YLWA 3P61A 3K30A 1O5XA 1V5XA 1VLWA 4A22A 4JXCA 3EWUA 2YPIA 1QOQA 1VHCA 1TTPA 1GTEA 2QCDA 3W22A 3LV6A 4HPJA 1LRTA 1YXYA 3S1UA 2TPSA 3RLUA 5J5RA 3C52A 1JCXA 4N4QA 2CW6A 3LTPA 1ML1A 2DZWA 4OHQA 3R12A 3TSBA 2XFWA 3DFTA 3I6RA 4P2VA 5T26A 1OFQA 2C13A 1YTDA 1SU5A 2HSAA 4RZ4A 1JCNA 4LS2A 3ATYA 4Z1CA 3E49A 2YSWA 2ZRUA 3HPXA 1FDJA 1OF6A 3INPA 3S1WA 3C3NA 3MUXA 4HIBA 1W1ZA 3LCLA 2V9DA 4O0ZA 2DZPA 2BLEA 4JGDA 1OX4A 1BKSA 3NA8A 4NJIA 5A5WA 1E51A 5AB3A 3I65A 3E0IA 3NQ2A 4JX6A 4NJHA 1G4TA 4M6QA 4LS1A 2DU2A 5K4XA 4KFOA 5AHEA 1DBTA 3GXNA 4A29A 1KM3A 3NYZA 4K38A 2JKAA 2C6QA 3KRZA 3CEUA 3DH7A 5K7JA 3UQNA 3HG4A 1H50A 4ONVA 3GR7A 3EKZA 2JKPA 2ZZ6A 4IX0A 3Q58A 5LNWA 1BWLA 1SFJA 4O16A 4X22A 3TQVA 1HO1A 3YPIA 3MHUA 2QCGA 5DXXA 1W5QA 4PEKA 3WK1A 5C2XA 2YCEA 3O6CA 3T78A 4O1AA 4IXXA 3IGSA 4JTFA 3OG3A 2R14A 2QCLA 4GUGA 1L6SA 5D30A 4YCPA 3LV5A 2EHHA 3TNOA 3UWZA 3UWWA 1LZOA 1EUNA 1W3TA 1JQVA 1ZAHA 4YMZA 2C3ZA 2QJGA 6ALDA 4K39A 4XUGA 2HMCA 2TMDA 1XUZA 1S5TA 4M7SA 1HG3A 4RXFA 3W7HA 1WQ5A 2B7OA 1H63A 3MO7A 1RPXA 1TSIA 4LC8A 3IVUA 1Q45A 1XUUA 3M5YA 1R46A 3DFOA 5CPOA 1W56A 4POCA 2GJLA 4AHPA 1KFKA 1EWEA 3BG5A 3FFSA 4MKNA 5K3VA 3C2VA 1N7KA 3C2FA 4N9BA 1YTKA 4AMAA 4MVAA 4GFSA 5BW6A 3DHDA 4CQ8A 3S42A 3O63A 5D32A 3T40A 1SW7A 1O4UA 5EL1A 5CSRA 1EIXA 1JULA 1WBHA 2P0OA 1YLVA 3WK2A 3L21A 3P81A 4UIOA 3PBYA 1K8ZA 1W54A 2EKCA 4OQVA 5I3KA 3R13A 1MSSA 4NX0A 3W1XA 3NQDA 3QC3A 1XDMA 1G69A 3IVSA 4C1LA 1PHQA 1OK4A 2Y63A 5C55A 3W7QA 4LV4A 5LNSA 3A9IA 2ZRVA 2EPHA 1DJNA 5I3FA 3DAQA 4DO4A 3A5VA 5BNKA 3LHUA 5F2GA 4N9CA 1H7NA 2NX9A 3CC1A 1OFRA 3GKAA 3E96A 2D73A 4WOQA 3LHVA 3M43A 1BWKA 2VEPA 5AN7A 2QJHA 1XC4A 4ALDA 3HGRA 5FEPA 3TW6A 4N9DA 4O52A 3QMSA 1JJKA 1AL7A 2YXGA 3FLUA 4Q32A 4WZHA 1SUXA 3T7VA 3M5VA 1BEUA 4KFNA 2F84A 5G4EA 3WK0A 3EWXA 2V2DA 2E5DA 3LI1A 3VE7A 1GYLA 1XCFA 2YGYA 3IGUA 2A7RA 3GAKA 1K03A 3LHTA 2H8XA 3DHFA 1GT8A 1KM1A 4MLRA 5D37A 3EX2A 1VC4A 4UFHA 2Z1BA 2G95A 2CLMA 3NGJA 1QDSA 4XQ6A 2NUYA 1JCMP 2GVLA 1R2RA 3P8JA 1F7BA 3UWYA 3IIXA 4YCOA 1W5MA 5LNUA 3O15A 5CG7A 2GVJA 4Y9AA 2E6FA 4AWSA 3G0SA 4I7WA 3NQ7A 2Y61A 1SSDA 2QCDB 4UTWA 4CCDA 3NQGA 3PWAA 1TREA 3SJ3A 3R5EA 2VEKA 2UV8G 4E0CA 4MLJA 2VFIA 3TSMA 1DQXA 2QDGA 1H7PA 2QAPA 3MHFA 3W1PA 1I2QA 3NPWA 1DORA 4HNVA 4AEOA 4LVGA 2RKXA 1OYCA 2OCZA 4IUOA 3TMLA 3GXPA 1A5BA 2FJKA 4X9SA 2PCQA 1SPQA 4AF0A 1PV8A 1G4SA 3M47A 3N19B 3TROA 1C9DA 4FHAA 3IIVA 4Z0JA 1RZMA 2HTMA 1UUOA 1P0NA 5HJLA 1FBAA 3BW3A 4GUJA 1GVRA 2J9YA 4MFDA 5F4XA 3P5ZA 1U5JA 5D03A 1GVSA 2HS8A 4DF1A 4WY0F 1IF2A 1XBZA 3LHWA 3P62A 3W1RA 1O5KA 1VYPX 1VRDA 3W84A 2X2GA 4PFMA 1XBYA 1QAPA 3W07A 3R89A 1TPWA 3ZWTA 1GEQA 1DHPA 3O06A 3S8HA 1KFLA 2WO5A 1OYAA 1PCKA 1GTHA 3UYCA 4M5PA 3ANYA 2V82A 3W76A 2VOMA 4AXKA 2C19A 1GPWA 4LOCA 3HBLA 1EP1A 3UPBA 4WQ6A 2I14A 3B4UA 3FA5A 1VGAA 3G1AA 4D2JA 4DF0A 3LLDA 3NO5A 4FB7A 1IXNA 3KRSA 4FNPA 3NQMA 1O95A 2GQ9A 1FWWA 2B7PA 2VFEA 4X2RA 1G7UA 2DZXA 3W1MA 1GZGA 5HWNA 1I2NA 4NJKA 3TXZA 3W73A 3BW2A 1FCBA 1R2SA 4UTTA 5LGZA 2XN0A 4R53A 4XZ9A 4UFMA 1H62A 4CQAA 4DO5A 4FNRA 5FI8A 1DV7A 1GVFA 3TK7A 3S6DA 1OFBA 2YX0A 4LWWA 3SR7A 3NR0A 1XKYA 4U28A 1FCQA 5LNVA 1JVNA 1W3IA 4GNJA 3GYEA 2WPBA 5CPMA 2WNNA 4TIMA 2GQAA 4O12A 4MYAA 1TQXA 2H3BA 2OZ0A 2Z0IA 3W72A 2TSYA 1KTBA 3N2XA 4LRSA 3W1TA 3DZ1A 4ORMA 1SZEA 1ZAJA 3EWBX 1SO5A 3NXFA 4AH7A 3NZRA 3FYOA 1EP3A 3T55A 1N8FA 5DY2A 1ZFJA 4O54A 2W6RA 2FPVA 1I8JA 3ZS4A 3LLFA 4AAJA 2YYUA 5EY5A 3F4WA 2ZYFA 2QUUA 4WJEA 1YTEA 3OBKA 1FCVA 4OWGA 4FX7A 1NSJA 3GZ3A 4NVTA 1VCFA 4RZ6A 4R34A 3IIOA 4O13A 1V7YA 5KINA 3C61A 1G7VA 2FDSA 3W7IA 4LC6A 1H7XA 2QF7A 1NF7A 2NXIA 4CCEA 4TMBA 3BGJA 3WK3A 1JCYA 3FIGA 5KSWA 4LS0A 5J5DA 5HUOA 2O7QA 1EX5A 2E77A 3GNNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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