2G3I | Genus

Total Genus 124

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	124
sequence length	303
structure length	303
Chain Sequence	AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSAQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWASGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure-based engineering of glucose specificity in a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86 doi rcsb
molecule tags	Hydrolase
source organism	Streptomyces olivaceoviridis
molecule keywords	Xylanase
total genus	124
structure length	303
sequence length	303
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2006-02-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2g3iA00

2WB5A 2DGAA 4U3AA 4Z2JA 4PCTA 2Y24A 5C70A 3GTNA 2DT3A 1E3ZA 4NSBA 4GI6A 5A8QA 2UY4A 1GQLA 2CHNA 1V02E 2YBUA 3NCOA 2XFYA 2CBIA 2W62A 3T2OA 4AZIA 3ARRA 1XYZA 4JL1A 1HJVA 1UWRA 1VB9A 1TZ7A 4GQRA 1KR0A 2W91A 3POCA 2QV4A 1C7SA 3T09A 1E6XM 3WNPA 3VNYA 3WSUA 1OD0A 3TOPA 3AZTA 4UFKA 5EMYA 1KXHA 5CPSA 3UEQA 5I24A 2D0GA 2PWHA 7CGTA 2OWXA 1QBBA 4MDOA 2WHKA 4WKHA 4JKMA 3B9AA 1UD5A 4UZSA 1QHZA 3IJ7A 1UWTA 1QI3A 3W38A 2WHJA 2XG9A 5DFAA 2WW5A 2J7FA 3G6MA 4PYSA 4Z2GA 1TCMA 4J3WA 4P7LA 1CENA 2JFEX 1W32A 2VURA 2BHYA 2DSZA 4OKDA 2VNCA 2JEPA 2WXDM 2CBJA 4E8DA 5A6MA 1QNQA 4BA0A 2XM1A 3M07A 5A6KA 1JYXA 4NI3A 1DEDA 1MQRA 4H8VA 2JEQA 1H0GA 4HA1A 4W7WA 1BVNP 1EO5A 4LQ1A 3W27A 2ESCA 3AI0A 2PWEA 1XRVA 1J0JA 4D6JA 3VDHA 4PTMA 2O9PA 2WCAA 1IT0A 2CNCA 1JFHA 1NOWA 1TG7A 4D6EA 4TUFA 4QLKA 1NWUA 1LJYA 2BVTA 1BSIA 4U33A 4AZBA 1UR8A 3AMGA 4FK9A 1KQYA 3DHUA 3ARXA 4LYQA 3PZUA 1GW1A 3I3EA 1XHGA 1XV8A 1CNVA 3GBDA 2VC9A 1ITXA 1E5NA 3SCTA 1K9TA 1HP5A 2FGLA 2WZIA 2G8ZA 2PWFA 5D4YA 1VFOA 4JAWA 5GNZA 4DWSD 2WNWA 3AHZA 1JNDA 2FHCA 2ZXAA 2CKRA 3TTQA 1FH9A 2VMFA 4IM4A 1JYWA 4D6CA 3NDYA 1V3LA 1ZJBA 3GNRA 4S3KA 3BMVA 1TA3A 4IUGA 4HP5A 2J4GA 4W93A 5DMYA 3VD9A 3BSGA 1J10A 3WDIA 2BVDA 1YHTA 2JIEA 3U57A 1EA9C 1GJUA 3B8SA 2BXYA 4AEFA 1CXLA 1UH4A 3W6LA 2ZX9A 3RM9A 2V3DA 1WDPA 1XD1A 1OT2A 2CERA 2PWGA 1KXQA 2VTFA 1QI0A 3GYCA 3U7BA 2DDXA 2J25A 2YJQA 1XH2A 3AIUA 3AISA 4AY1A 1OBAA 1NWTA 1UYQA 2EPLX 2W63A 4LGXA 3PHAA 2CXGA 1NM9A 3GXIA 4Y7EA 1GOIA 1TA3B 1GPFA 5CQ1A 1V3IA 2F61A 3OG2A 1HJWA 5A6JA 3VIGA 4D1JA 1E0WA 2CPUA 5E0FA 3II1A 1FH7A 2E8YA 5HXMA 1G1YA 4CGTA 2XJ7A 2XWDA 2WCSA 2EXOA 3W6MA 1B3VA 3QHOA 1B3ZA 2Y5EA 4TX6A 3SCWA 1J11A 2D24A 2F2HA 1KBKA 2EQDA 3VDAA 2DT1A 4Z2LA 3AS3A 1WDSA 2X0YA 4E2OA 2GDUA 2BFGA 3VGGA 2YL8A 2VR5A 3AIQA 1C8QA 3DECA 3WD0A 3N17A 1UUQA 4W8AA 3OZPA 3VVGA 2E40A 4CD5A 2CKSA 4MB3A 4HZ7A 2YL6A 2DH2A 1W9DM 1ZBVA 5JIWA 4QDMA 3ZSSA 1UWUA 1G94A 1E43A 1OCQA 2J7GA 2VOTA 3AQUA 1KGUA 3A4AA 3L4UA 3NDZA 4LYRA 4PTWA 4N0RA 3UG4A 4HA4A 1UR4A 2G4FA 2V3FA 4QLLA 2J7CA 2MANA 1BGAA 3BSHA 3LMYA 3ALFA 4XZBA 3VUPA 2O92A 3AZRA 5ABHA 3VGHA 1VFUA 2CHOA 3AS1A 2YL9A 3WBAA 3HJEA 3WQ5A 4AIUA 1C8YA 1JZ6A 3DHPA 5BXSA 3FNDA 2RGLA 1LG2A 1QOXA 1MQPA 3WDRA 1E56A 5BWFA 2G3NA 4ZFMA 1XH1A 5I78A 5EFDA 5KZ6A 4UOZA 2W5FA 2BY1A 3ZOAA 2WWCA 2YDSA 4RE3A 1ZBCA 3CMJA 5CPQA 1KCKA 3A4WA 2A3EA 3WMSA 3HN3A 1GHRA 4BQ2A 4J3TA 2XTKA 3VX0A 2A3CA 2GVYA 4QP0A 1SFSA 4TTUA 1HVXA 1BGGA 4P7NA 2UY5A 1ODZA 3SCSA 4D6HA 3VDBA 1VBUA 4UQCA 1CXFA 3BGAA 4AW7A 3POHA 3N13A 3AIWA 3L4TA 1KCLA 1WDQA 5JIPA 4GI8A 1D7FA 5IHSA 5BRQA 4JHOA 4V2XA 2ZUVA 1FFRA 2GUYA 1E40A 2BS9A 2O9TA 1VF8A 4MB4A 5DEZA 1QNOA 1CECA 2ZWYA 4AD5A 2TAAA 1C92A 1V6UA 4CU6A 3PZMA 3SIMA 4D6FA 2Z1KA 4LPCA 1CPUA 3L4ZA 4KRTA 3WUBA 2ZUSA 3ARSA 3NSNA 3WL1A 3CUJA 1H4PA 1W9VA 3BAWA 3U5UA 4ZEPA 3BMWA 2OSXA 1HKKA 1GQKA 3FW6A 4U5IA 3VIOA 1JZ8A 3BC9A 4UZUA 1UQZA 4PUEA 4U2ZA 2BVYA 3N15A 3LPOA 3MV01 3WEOA 1BTCA 4DUXA 1JG9A 2E9MA 3VIPA 1GOWA 3D5HA 3WEMA 1LF1A 1JZ2A 2YA0A 5IXEA 4P8UA 1MFUA 1CGWA 1JD7A 1BHGA 1TVNA 3VX1A 3PBGA 2QPUA 1CTNA 4BQ3A 1OWQA 1QW8A 2A3AA 3UR8A 3VM5A 1EHAA 4DUWA 4JIEA 1G5AA 4MB5A 1GOKA 4NRRA 2XUCA 1CBGA 3DYOA 2E9LA 4MPKA 4V27A 3VIMA 5IDIA 4JKKA 2J75A 2UWFA 3J7HA 5CLTA 2J7DA 2J74A 2J47A 1JAKA 1WE5A 3VD5A 4CU7A 3AYSA 1WP6A 2J78A 3AXHA 4EE9A 1EQCA 1HKJA 1GNXA 2O9OA 4S3JA 2EEXA 4KWUA 1V0NA 1UZ4A 4MDPA 3WF4A 3F5LA 3IJ9A 4OOZA 5HBFA 2X1IA 2AOSA 3BLKA 3CTTA 1NP2A 4UQ9A 8CGTA 5BXTA 4W85A 4BQ4A 1CZ1A 2NT1A 2ZX6A 4ML4A 4UQBA 3CZGA 2WVSA 2DIJA 4P8XA 4HOWA 2WM0A 3LPGA 2YLAA 3ZMRA 4PMUA 3OGVA 2J7EA 1XD0A 2VZSA 5I79A 5ABEA 1E4LA 3MMWA 3VGBA 3EMQA 3GXDA 2WMHA 1EXPA 1JF5A 3KZSA 3AHVA 4ZENA 3SUVA 3KL5A 2G41A 3AROA 2YLLA 1D3CA 4ATDA 2G3JA 4Q7NA 3WQ6A 4H8HA 3WENA 2WPGA 3CUGA 3GDBA 4GZIA 3VNZA 1G9HA 2OLHA 1JAEA 5C71A 1BPLB 1E73M 1VJZA 1MW1A 5A8NA 1E0VA 1JI2A 1TMQA 1B1YA 5ABGA 1PX8A 1V08A 2V5CA 2DSVA 4RL3A 1FP8A 2EJ1A 4BF7A 4D72A 4PMOA 1UKPA 2W67A 1BF2A 4WJXA 2O9RA 4LX4A 4C7GA 4Q22A 2WMIA 4URIA 3WH6A 3O2LA 1VIWA 4B16A 2DT0A 1EDQA 4NZCA 3B9DA 2WSPA 4X0NA 1DWGM 2ZWZA 3AMCA 3AMLA 4OBRA 1UD4A 3BCFA 3IAPA 3VPLA 5D9NA 1L0PA 3IJ8A 4KMQA 3VMNA 4B9ZA 1BFNA 1AVAA 3PTQA 3ZIZA 5BRPA 3PZGA 4QFUA 1KQZA 1E6SM 1FHDA 4KGLA 2WVUA 3BLPX 2IXVA 5BCAA 2DEPA 1QNSA 1XC6A 2PWDA 4C7DA 4AZCA 4J3XA 1R7AA 5AYIA 2WHMA 1V6YA 1OGSA 2GJRA 3FHAA 4YN5A 1FH8A 3THCA 2WMIB 2Y2WA 2WC7A 2VUYA 3CGTA 4P7QA 1NQ6A 1GZJA 4TVUA 4MJ2A 1MW2A 2XM2A 3SCVA 2ZUNA 3OIHA 4MNMA 5AC5A 1MQQA 1PJ9A 3CBWA 2X05A 4A3HA 2PC8A 4AMCA 1H41A 2J7BA 3MU7A 2Q8XA 1VENA 3N11A 5CGTA 1PX4A 4JFSA 4JFTA 1LL4A 1H3GA 3T0AA 2W66A 2ZX5A 1QI5A 3FHQA 2XPKA 4XUYA 3WH9A 4D1IA 2WCGA 1HF6A 3FXYA 2WANA 3TTOA 3RM8A 4ACZA 4PMQA 1DWFM 4XZWA 3VO0A 3VINA 3UERA 1UD2A 4AZCB 1PIFA 1DWHM 1CGTA 1MWOA 4CKQA 1JYNA 1UHVA 5M5DA 3CUFA 5A1AA 1C8XA 3MO4A 1EOKA 4M81A 6TAAA 3WQ8A 3FAWA 3AIEA 1OB0A 1AQMA 1WCGA 3FN9A 4UR9A 1U2YA 4W88A 4AEEA 3PZQA 3PZ9A 1E6RA 1DWAM 2E0PA 3EMZA 5GNXA 1O6IA 3CZLA 5EB8A 2XYLA 3MMUA 4CCEA 5A8PA 4UFIA 1B31A 1I1XA 4U3CA 1VFMA 1UWQA 1PPIA 4PSRA 4ACZB 4AC1X 4FLOA 2ZUWA 3VIFA 1W1YA 4UCFA 1HNYA 4H04A 4AWEA 4JCLA 1W9PA 1QBAA 3LPPA 4TVCA 5A6SA 2ZXBA 2GFTA 4J3VA 3VIHA 5I77A 4WKFA 1E9LA 4QAWA 3ZJ6A 4JFWA 2Z1SA 1HJSA 4UQEA 3B9EA 3ZJKA 2D23A 2V3GA 1EQPA 3GNPA 2J7HA 2DSWA 5BXRA 4WIWA 3HU7A 1E72M 2WZEA 1RPKA 1PZ2A 1JZ7A 5I23A 1MW0A 5LYRA 2AAAA 3GXMA 1ECEA 1UD8A 2YA2A 1QI4A 1US3A 2EBNA 3SCPA 4AZ6A 1UZ1A 2UY3A 3K46A 4DM2A 2QMKA 1X6LA 1UQYA 1WAWA 5CSYA 3NIYA 9CGTA 1I75A 1JZ3A 3T2PA 1H11A 1R7OA 2WLYA 1EH9A 3OLIA 4W84A 5CPTA 1QPKA 3ZM8A 3ZQ9A 4XX6A 3VOCA 2WHLA 3VM7A 3A4XA 3GNOA 2NSXA 1CXHA 3AMDA 2VCCA 3WH8A 4WKAA 3RMEA 4UTFA 2BY0A 3VIIA 4CVWA 4MJ4A 3I3DA 3T08A 3QGVA 1UD6A 3BAIA 1CGXA 1XYFA 1KBBA 4M8UA 3W37A 2ZICA 2AMGA 1LQ0A 2FHFA 4E4PA 3TA9A 2PF0A 3W24A 3MS8A 3ZO9A 3CZ8A 1R87A 4BCEA 1KGXA 2GJPA 4PMVA 6CGTA 1KR1A 3VDCA 2V3EA 3W25A 3SEPA 2D1ZA 5M03A 2GDVA 1GHSA 3VKKA 3CIVA 2DH3A 2E4TA 4U2YA 1MXDA 3BAYA 1KFWA 1GVIA 3UCQA 4M29A 1W9XA 3N18A 5GQBA 3WMBA 2X8RA 1CYGA 1V3HA 4A4AA 4MTVA 4GO8A 4AD0A 1IV8A 1RP9A 4HZ6A 1TR1A 3OLGA 2W4XA 4M24A 3WH5A 2C8NA 1GORA 6A3HA 2X2YA 5IHRA 4OJYA 1UR0A 3WNOA 1A47A 1K9DA 1K9EA 1SYTA 4GZEA 3EDKA 2XIBA 2DT2A 1WNOA 3M7SA 1W1TA 1V3JA 4ATWA 5A6LA 4PMNA 1J0HA 5HDRA 4XB3A 1AMYA 1EIBA 3WDPP 4CD7A 1U33A 4P8WA 3CHEA 3VIKA 3AXXA 2JE8A 3UG3A 2CYGA 2W61A 1SR0A 1R86A 5DT5A 4J3UA 2G3IA 2WMJA 1KXVA 3VD3A 2YDQA 1V3KA 1J01A 1UR1A 3F5KA 1E6QM 1XSJA 4IPLA 5FL1A 2XVPA 2BV9A 1CWYA 1HVQA 2RGMA 4B3LA 5HPOA 3MUZ1 1W1VA 3A6OA 1E4MM 3BAJA 3UR7A 5A69A 1WKYA 3WQ4A 5A2CA 1MFVA 1B3WA 4V28A 1CLXA 1WB0A 5C8BB 2ZXQA 1GQIA 2BNJA 1FP9A 1BYCA 1TE1A 3FY1A 3L4WA 2C7FA 5DO8A 1OIFA 3RILA 1VBRA 1GOOA 2OSWA 4H2CA 4CN1A 3ZT5A 3SCOA 4UFLA 3SUWA 1UWSA 5E6YA 1OSEA 1G01A 3L4YA 1WZKA 4N42A 1M04A 3NSXA 1DTUA 1Q6DA 5A2AA 1W3JA 1UH2A 3WIJA 3CO4A 3CHFA 2A3HA 3MUY1 1MW3A 5BROA 3CLWA 3I3BA 4UFMA 1HKMA 2CETA 1DWIM 4LYPA 1E6NA 1ISVA 1H09A 2VT0A 1WZMA 3EDJA 5E09A 4UOJA 3RCNA 2E9BA 2J79A 2WC3A 1E15A 3ECQA 2OYKA 1VAHA 3OZOA 4WLCA 2BY2A 4F79A 3JUGA 1CEOA 1V03A 3WF0A 4HU8A 2WKGA 3VGFA 1RD6A 1V0MA 4PBGA 4GIAA 3BH4A 3MANA 4DWSC 3PTMA 3PZOA 5A95A 4U5KA 3AS0A 3U5YA 1HIZA 4ZXOA 5BYWA 1JDCA 1XSIA 2XVLA 1KWKA 2J62A 3A3HA 1OGGA 1WO2A 3VIJA 4YPJA 2VX4A 1UR2A 2WAGA 4GO9A 5FL0A 5JBEA 2ZOXA 3PZNA 3N1AA 2V5DA 3QR3A 3K8KA 1UA3A 4UQDA 1GJWA 1I1WA 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1WDRA 2VL4A 3DC0A 3SCNA 1B9ZA 1ESWA 2QLYA 4EANA 3S2CA 3OLEA 3RO8A 2DPEA 1NP0A 5A94A 4OZOA 2DIEA 3THDA 1SMAA 1QW9A 1C3FA 3T0DA 1E55A 1QNPA 1B3YA 3AS2A 3UETA 1VFFA 3W29A 1E70M 3LPFA 1E4IA 2VZVA 4HMCA 4HMDA 1BYBA 4W86A 5D8WA 1CXIA 1B30A 2JF6A 1E4NA 1JI1A 1KWGA 4P7OA 3DYPA 3GXFA 1HJUA 3WD3A 3ARYA 1FHLA 4MNLA 4EAMA 5I5RA 2HISA 5M3WA 1RP8A 1UKSA 4BS0A 1LWHA 2CIPA 2BHZA 4AD2A 1HXJA 2QPSA 1C90A 3SCRA 4CD6A 4HU0A 4W87A 2DSKA 3K4AA 3SURA 4AD4A 4AD3A 1PX3A 4GZJA 2WBGA 4QCFA 4HPGA 4AZ5A 2GK1A 2JIWA 4FLRA 1JZ5A 3GM8A 2VX6A 1OGBA 1M01A 1UG6A 4D71A 4OBSA 1AQHA 4CN6A 2DQXA 1F4AA 1JYVA 4B9YA 3NUKA 1X6NA 4Z2IA 1JDDA 2FDMA 4JFUA 5ABFA 1JFXA 1WZAA 1ZL1A 4H7VA 4JCMA 3CUIA 3RDKA 3AICA 3VMPA 3N9KA 1O7AA 2G3MA 2XVNA 3AZSA 3WY1A 3W28A 3ZT6A 3TTYA 4C7FA 3SUTA 2YOCA 4OOUA 1K6AA 4W7VA 5FIPA 1V02A 4W5UA 3WF1A 1OD8A 3W26A 2FHBA 3CZJA 4F9DA 2VZOA 1CGYA 2VCAA 2WSKA 1V0KA 2W92A 1ISZA 3NYDA 1IZJA 2D22A 3WFZA 2OYMA 1L8NA 2GK1B 3ARWA 3WEZA 5TD4A 1BG9A 2CBUA 5IFPA 1C7TA 1KXTA 5D8ZA 3ZSTA 2YA1A 2YKKA 3VILA 4PEEA 1D2KA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2EPM X;  2VRQ A;  1HL8 A;  3ARV A;  4W8L A;  3KWX A;  3QOM A;  2X09 A;  1K9F A;  4EK7 A;  3ARU A;  3L4V A;  1H1N A;  3AIV A;  3CHC A;  1E1F A;  5CLW A;  1UD3 A;  1VRX A;  2YIH A;  1E1E A;  1LL7 A;  1J0I A;  2PI6 A;  1FA2 A;  5CZK A;  3NSM A;  3RPM A;  3RM4 A;  4FLQ A;  2WVT A;  1R8L A;  2WWD A;  3UES A;  1V0L A;  3MKK A;  1GOM A;  5I6S A;  2WLZ A;  1BVZ A;  4AIE A;  3SCQ A;  5GNY A;  1OIN A;  4P7R A;  1Q6G A;  2B31 A;  3SUU A;  4L4P A;  1CGU A;  3IAQ A;  3ARZ A;  4MNJ A;  2D0H A;  5E70 A;  3RJY A;  5D9P A;  2EPK X;  4NRS A;  2VX7 A;  1MXG A;  1NOU A;  3AMK A;  2OWW A;  1X1N A;  2XFR A;  4CD4 A;  4F9J A;  1VEO A;  4NF7 A;  3MSD A;  3WNM A;  3MV1 1;  3F5J A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2G3IA

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Chord Diagram

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