2G3JA

Structure of s.olivaceoviridis xylanase q88a/r275a mutant
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSAQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWASGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based engineering of glucose specificity in a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
molecule keywords Xylanase
total genus 126
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2006-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2g3jA00
1GQIA 2BY0A 4PTMA 2XSAA 3AHYA 4GINA 4UQAA 2VQTA 1BGAA 4IISA 5TD4A 2OYMA 2QPSA 3WUFA 4U5IA 1PEZA 2VR4A 1I75A 4WSKA 3OB8A 3SUUA 2D24A 2DT3A 1WDQA 3PZNA 3T2QA 2DPEA 2XYLA 2D0HA 3GH7A 1VB9A 1C91A 2ZUMA 1OM0A 4WKAA 5EB8A 3OLGA 1DWAM 4EANA 2EO7A 4GXPA 4EE9A 2CHOA 4A3YA 1TZ7A 4GQRA 4HA1A 3D3AA 4TXEA 3EYPA 1V3IA 2G8ZA 2WW5A 5CGTA 2E9BA 1QI0A 3AS0A 3WD3A 5E6ZA 4H7VA 3WF0A 4B9ZA 2WBKA 2NT0A 4LX4A 3SCWA 2GFTA 1C7SA 2E9MA 2CEQA 1ECEA 3WDRA 2WVTA 5EFDA 3SEPA 3UG4A 3IAQA 3EDEA 1E6QM 1OB0A 4H8UA 2Y8VA 3VDHA 1C93A 1GOKA 1UWIA 1UR4A 3MUY1 1UKPA 3W0KA 1BYAA 3WD2A 4D6CA 3EMZA 3T08A 2CCRA 5A8QA 3ZR6A 1TMQA 3AIBA 1J0IA 4PN2A 1E3XA 4UCFA 1OIFA 4AIOA 4TX6A 3VVGA 3KE0A 1WNOA 2YA2A 3SCQA 4UFIA 1H11A 4BF7A 1ZS2A 4J28A 4X0NA 1DEDA 4F9JA 4WSJA 4PEEA 4QAWA 1V03A 1NM9A 2VQUA 1D3CA 4R27A 2UY3A 2DSZA 1J0YA 5GNYA 4BCEA 3BCDA 4PCSA 3KL3A 2W5FA 3L4XA 1TCMA 4CD7A 1RP9A 4XUYA 1QHPA 3VX1A 1CEOA 1QI2A 1Q6FA 2WBGA 1MWOA 4HOXA 1UQZA 4NI3A 1R85A 1UYQA 1UWUA 5BCAA 4P8XA 3AFBA 1UD3A 1R86A 3WD4A 5CJ5A 2VJXA 3AQUA 5AC4A 4U2YA 3UG3A 2WMIA 2Y4SA 3VGDA 2J8FA 4DWSB 1HKMA 1B3WA 1TFVA 4URIA 4CD4A 2J25A 3ZOAA 1E4MM 2WMJA 2CBJA 1E6PA 4FLRA 1W3KA 2VL4A 2F2HA 4AWEA 3GXIA 1UKTA 3ZJ6A 2BXZA 2D3LA 1WDPA 1E1FA 2PBGA 4D71A 3VNYA 4M81A 3K4AA 4NRSA 2XSBA 1HJVA 1W9PA 3SCNA 3WL0A 5GNXA 2V3DA 1CDGA 4ZFMA 4AZ5A 2WCSA 1V6XA 7TAAA 1LL7A 1JG9A 1H4PA 1JXJA 3VGHA 3A4XA 4BQ3A 4CVWA 3W28A 3PZQA 5CXPA 5JUVA 3GH4A 1US2A 5D8WA 1UZ4A 5FL1A 1C90A 5M03A 3WKZA 1BQCA 1W9BM 3VMNA 1VF8A 4U5KA 1VFMA 2ZUTA 2VCCA 1GOQA 1GHRA 3B9AA 4P8UA 3WEZA 2ZUUA 2J7FA 3ARTA 4U33A 3APGA 3ARWA 2OWCA 2E8YA 1WB0A 3SCTA 3BLPX 4MNJA 1B9ZA 1JZ7A 2WHLA 4KH2A 4DUVA 4E8DA 2ESCA 3WN6A 8A3HA 4M82A 2W67A 2PF0A 5BWFA 3GDBA 2XFFA 3AZRA 3A47A 5I77A 3AI0A 4W86A 2ZIDA 4P8WA 4AY1A 1ZBKA 1TG7A 3K8MA 2D2OA 5ECUA 1LL4A 1VEPA 3L4WA 1FA2A 3AYSA 3FNDA 3K46A 3WF4A 4UQDA 1TA3A 4FLOA 2J7HA 1XH1A 3BAKA 2A3HA 1JI1A 2PWFA 1HN1A 1K9FA 1E4LA 3VINA 1R8LA 3SCSA 4FLQA 3AIUA 2W61A 3GZAA 1W9XA 2DT2A 4KWUA 5EMYA 2OWXA 4CD8A 4YHGA 4HOWA 1OD0A 1YHTA 2IXVA 1DHKA 4QCEA 1UG6A 1CGUA 1DWIM 1B2YA 4WKHA 4LQ1A 1MW1A 3VOCA 5D9MA 1H49A 1V6YA 3ARSA 2C8NA 1J18A 1XH0A 3CMJA 4CVUA 3VD3A 3N11A 4WF7A 1MW3A 3NDYA 4DWSA 1W9UA 4M80A 1DTUA 3W38A 1DP0A 1UKSA 4M24A 5D9OA 4PMQA 2V3EA 4ACYA 6TAAA 4JFTA 4ATLA 1BHGA 3BGAA 5A8PA 3MUIA 4CCDA 5IFTA 3O2LA 1MQPA 1XYFA 2GK1B 4D1JA 2JIWA 3DYMA 4P7NA 4D6DA 1JNEA 3RMEA 1S46A 2CBUA 1XCWA 2XVNA 1R7OA 5A2CA 1GW1A 4U3AA 3VIKA 3ARUA 5E0CA 2EBNA 2C7FA 4S3KA 2J4GA 2IXUA 2VMFA 4EAMA 4OOZA 2WWDA 2WHKA 1E43A 3KL5A 1KXQA 3OLEA 1QBAA 3THCA 1NARA 1B3YA 5JBDA 1FP9A 4W85A 1E72M 4PMNA 3WH6A 5I6SA 2WPGA 2G41A 4LGXA 3W24A 1M03A 2RGLA 2Y5EA 4W7VA 4WJXA 1JD9A 2WCGA 4GO8A 3MMWA 2WK2A 2FHCA 5I23A 2UWFA 1IV8A 4AD4A 3AS3A 3IJ8A 1A47A 3SUSA 2J77A 1ITXA 1VIWA 3GYCA 1WPCA 3LMYA 4U31A 4QLKA 1H09A 5F7UA 3AZSA 2ZX7A 3VNZA 1MYRA 2XGIA 3K8KA 4P7OA 3TTSA 5D9PA 4D6EA 3NJ3A 1BF2A 5AY7A 3DYPA 1AVAA 2EXOA 2VCAA 1OCQA 3I3EA 3ZIZA 3M6DA 4TTGA 2BVDA 3AXHA 5A1AA 1BYDA 1G01A 4D6FA 5A6KA 3NSNA 1QHZA 4ZXLA 2XTKA 2BY3A 2ZX9A 2JALA 4ZEPA 3CZ8A 5D9NA 3UCQA 3TA9A 2VZVA 4OZOA 2ZWYA 3WNNA 5DEZA 1J11A 4JHOA 2WVVB 1SMDA 2YL5A 3TOPA 1EA9C 2QMKA 1SFSA 3CZJA 4CN1A 3L2LA 3N13A 2E9LA 3ZO9A 1HJWA 1VFUA 2YLLA 1ODZA 2WYSA 1TE1A 2Y24A 4PCTA 3OIHA 2Q8XA 5IDIA 4GI6A 1GVIA 4S3JA 4BQ5A 3U7VA 2IUZA 3AHTA 4HTYA 4W5ZA 2VT0A 1CNVA 1EIBA 1UR0A 3QGVA 3TONA 4AW7A 2QF8A 1VBUA 4X9YA 1X1NA 1XH2A 3MANA 4AZCA 4KMQA 4GZJA 4RE3A 1W1VA 5CPSA 1GHSA 3CUGA 3RM8A 5BXSA 2D23A 1US3A 4A4AA 4P8VA 2WLZA 2JEPA 5A2AA 4J3WA 3ZSTA 1CGXA 2ZOXA 2VX5A 1X6NA 4JL2A 2VI0A 3FAWA 3TP4A 2G3MA 5I78A 5C71A 2GK1A 3EDFA 2J62A 3BSGA 2X1IA 4AXNA 3II1A 4JHZA 2D1ZA 3ZSSA 1BG9A 1CIUA 4DUXA 2DIEA 2E8ZA 1QNOA 2ZUWA 1GNXA 1MXGA 5JBFA 1VJSA 3ZJ7A 5A6BA 3VMPA 4DWSD 4GIAA 5A6AA 2A3AA 5GNZA 1KFWA 3VM7A 3WSUA 7CGTA 2FHFA 1JZ3A 4JL1A 3RJYA 4AISA 1MXDA 2WANA 3CBWA 1Q6DA 3F4VA 4H8VA 2FHBA 3BAYA 1LL6A 1HP5A 3AIWA 2DH2A 1XD1A 5DT5A 4CN4A 1FP8A 1PIGA 3WEMA 1U2YA 3SUTA 5CSYA 3UR8A 4B3LA 2VURA 3TTYA 3CUIA 3BC9A 1W1TA 1UR2A 5HXMA 5HOSA 1K9DA 1BLIA 2J7BA 2GJXB 2W66A 1EHAA 4AZBA 3CO4A 4PUDA 2NSXA 3I3DA 3WF3A 5CLTA 1W3JA 1HKIA 1WZMA 2OSXA 8CGTA 1XYZA 3EDJA 1W91A 3W82A 5A3HA 1HX0A 3LPFA 4JFVA 1TR1A 1NP0A 4P7LA 4OIFA 2ZE0A 3AS1A 3WENA 3FHQA 4W88A 1XHGA 4UNIA 1PX3A 4PRWA 5I3DA 5A6MA 3T0DA 3F5KA 2V5DA 5HDRA 1HJSA 3VPLA 1G5AA 2WMKA 4JAWA 4TX8A 3CPUA 4WIWA 4JFUA 4C7GA 1V6UA 3WMCA 2BY1A 1JFXA 3MSDA 3WQ4A 2JE8A 4AIUA 1AQMA 2EEXA 5IFPA 4OUEA 3S2CA 4HA3A 4HMCA 4HU8A 2V3FA 1E0XA 1JDDA 4MADA 4E2OA 1FH7A 2NW0A 4D6JA 3CUJA 3BCFA 3WDIA 4MNKA 4PBGA 2G3NA 4E8CA 1MFVA 4UFHA 1JZ5A 2VZTA 3I3BA 3ZM8A 4CCCA 1PJ9A 4TVCA 1QVBA 4J7RA 4W8LA 1A3HA 4CCEA 1JYWA 1ZBVA 3WEOA 1M7XA 2VUYA 4MB5A 1GJWA 2J7DA 2BHZA 3ZT6A 3F5LA 4QP0A 1V08A 1B90A 1E6ZA 1J0KA 4D72A 3VUPA 1E6NA 3T09A 4BZYA 2ZICA 3WELA 1JD7A 2JIEA 3JUGA 2ZX5A 1BAGA 2E40A 3AROA 1CXLA 1XSJA 1UR9A 4PMVA 1HJQA 2AMGA 4H41A 3A4WA 4W8AA 4XV0A 1HF6A 1OWQA 1L0PA 3D5HA 4JKMA 5D4YA 1XRVA 1HKKA 4AD3A 4GI9A 1VAHA 1JYVA 1K6AA 4BS0A 4CD6A 5I5RA 2WKGA 3NDZA 3CIVA 4UQBA 4RL3A 3VGEA 1C3FA 4CD5A 3KEHA 3VIPA 3BMWA 2PI6A 1RPKA 3IK2A 3GNRA 4HZ6A 1H1NA 3FAXA 5CLWA 2WXDM 4CU6A 4UOQA 1WDSA 5ABFB 3WQ6A 4HMEA 1D7FA 1H2JA 4NF7A 5A6BD 2XIIA 3A3HA 1W32A 1LJYA 2G3IA 1NP2A 1PX8A 2XVPA 1FHLA 3N04A 1BSIA 1J0JA 2UY2A 4ATDA 1DWGM 2QMJA 1X6LA 2CERA 5EFFA 2Y2WA 1W3HA 4FF5A 3BAXA 3HN3A 5E0FA 3W4RA 3WF1A 4PMRA 3OGVA 1BYBA 1JF6A 1WCGA 4AC1X 4W7UA 4W84A 3OBAA 5I2UA 1W2PA 1MQRA 2G3JA 3AXXA 2F61A 4PTWA 3GBDA 1KWGA 4Z2KA 1J01A 3QHNA 3BMVA 1LLOA 2FDMA 1UWQA 3QR3A 3VIGA 5GQBA 3CH9A 1HVXA 1XSIA 4W8BA 4GQQA 3WQVA 4BQ4A 4Y7EA 1CPUA 1E1EA 2CESA 4LYQA 4U2ZA 3L4VA 3MV01 1Z32X 3U7BA 1UA7A 3T0BA 4Z2GA 3MUAA 1JZ2A 3W27A 3UEQA 1SR0A 5JBEA 4V27A 3ZR5A 2PB1A 4AD1A 3WNMA 4ZE4A 3OA5A 4ACZB 3SURA 4JCMA 2WAGA 1K9EA 2ZXDA 4J3UA 3GNPA 4RE4A 4DWSC 1KGUA 4MB1A 1BG4A 2WC4A 2XPKA 1VBRA 1WO2A 3OGRA 1O6IA 2EPMX 3L4YA 1VRXA 3AHZA 2ZUVA 3CZGA 2WNWA 1W1PA 1QI4A 1ISWA 1CXHA 4NZCA 3PZIA 1EQPA 1UD2A 3WF2A 4D6HA 1CENA 3N12A 3WD0A 3VILA 3POHA 1EDGA 1CGTA 4YN5A 3VO0A 2WMFA 3SCUA 4GZIA 3NSXA 3AIEA 3MO4A 2FGZA 2X0YA 2AAAA 5DO8A 4ML4A 1OINA 3BXWA 1KCKA 1KR0A 2QV4A 1C8YA 3RCNA 3WD1A 1GJUA 2BHYA 3CTTA 1C8XA 1HXJA 2YJQA 2WCAA 1OSEA 3WH8A 1SYTA 5M17A 3CZLA 4JCLA 2HVMA 1HVQA 3PZGA 1UKQA 1HJXA 2J78A 2HISA 4B9YA 1NOUA 4PSPA 1ZB5A 1E0VA 1EDTA 1UWSA 2MANA 3VIOA 4ATWA 3W29A 2YOCA 2YBUA 2W92A 2JF6A 1CZ1A 1E4NA 4AD5A 3U5UA 3GH5A 3UERA 1EHNA 2WZIA 3NSMA 3SIMA 1QNPA 5I0DA 1H5VA 5FKYA 4UOJA 3N17A 6CGTA 1E5NA 1UKOA 2O9OA 1B1YA 4CGTA 3WDQA 1C8QA 2XM1A 3GM8A 4PMYA 3GBEA 2JFEX 2WVUA 1J10A 4W93A 3ZT7A 3CMGA 4W5UA 1MW2A 3L2MA 2J79A 1B0IA 2GDUA 3AMGA 1U30A 2JEQA 5CSUA 1JL8A 1EOMA 1QNSA 2XHYA 2YL6A 4PSRA 4FK9A 3WMBA 5CGMA 3LPOA 4UOZA 1KB3A 1HJUA 5CPTA 1Y7VA 3EMCA 4GI8A 3N18A 4HP5A 3M07A 2DIJA 4LYPA 1G1YA 1MQQA 1HKJA 3ARXA 5A95A 4MTVA 3IANA 1FOBA 3GXMA 4CU8A 4HA4A 4JIEA 1JGIA 4TVUA 3QOKA 4J3TA 3TTOA 1E70M 5FL0A 1NWSA 1UH3A 2WMGA 3NUKA 3PHAA 4IUGA 1V0LA 1VEMA 3T0AA 3WFLA 1UQYA 4XB3A 3UETA 1J9YA 1JNDA 3RIKA 1KQYA 1OGBA 5CZKA 3RM9A 1KQZA 1OGSA 3WFZA 1KBBA 5AYIA 3MKKA 1GCYA 1LWJA 1PIFA 4CUCA 4XZWA 1V6VA 2CYGA 5IHRA 3BAWA 3MU7A 3O9NA 2XVKA 2X0HA 1G0CA 1GOMA 3WL1A 5CPQA 2OYKA 4J3XA 4CN6A 1W9DM 5HPCA 1B3XA 4HZ7A 5ABGA 3AOFA 2WZEA 1H0IA 4LYRA 5FCZA 3EMQA 5A6SA 3AIRA 1OT2A 3MMUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GQI A;  2BY0 A;  4PTM A;  2XSA A;  3AHY A;  4GIN A;  4UQA A;  2VQT A;  1BGA A;  4IIS A;  5TD4 A;  2OYM A;  2QPS A;  3WUF A;  4U5I A;  1PEZ A;  2VR4 A;  1I75 A;  4WSK A;  3OB8 A;  3SUU A;  2D24 A;  2DT3 A;  1WDQ A;  3PZN A;  3T2Q A;  2DPE A;  2XYL A;  2D0H A;  3GH7 A;  1VB9 A;  1C91 A;  2ZUM A;  1OM0 A;  4WKA A;  5EB8 A;  3OLG A;  1DWA M;  4EAN A;  2EO7 A;  4GXP A;  4EE9 A;  2CHO A;  4A3Y A;  1TZ7 A;  4GQR A;  4HA1 A;  3D3A A;  4TXE A;  3EYP A;  1V3I A;  2G8Z A;  2WW5 A;  5CGT A;  2E9B A;  1QI0 A;  3AS0 A;  3WD3 A;  5E6Z A;  4H7V A;  3WF0 A;  4B9Z A;  2WBK A;  2NT0 A;  4LX4 A;  3SCW A;  2GFT A;  1C7S A;  2E9M A;  2CEQ A;  1ECE A;  3WDR A;  2WVT A;  5EFD A;  3SEP A;  3UG4 A;  3IAQ A;  3EDE A;  1E6Q M;  1OB0 A;  4H8U A;  2Y8V A;  3VDH A;  1C93 A;  1GOK A;  1UWI A;  1UR4 A;  3MUY 1;  1UKP A;  3W0K A;  1BYA A;  3WD2 A;  4D6C A;  3EMZ A;  3T08 A;  2CCR A;  5A8Q A;  3ZR6 A;  1TMQ A;  3AIB A;  1J0I A;  4PN2 A;  1E3X A;  4UCF A;  1OIF A;  4AIO A;  4TX6 A;  3VVG A;  3KE0 A;  1WNO A;  2YA2 A;  3SCQ A;  4UFI A;  1H11 A;  4BF7 A;  1ZS2 A;  4J28 A;  4X0N A;  1DED A;  4F9J A;  4WSJ A;  4PEE A;  4QAW A;  1V03 A;  1NM9 A;  2VQU A;  1D3C A;  4R27 A;  2UY3 A;  2DSZ A;  1J0Y A;  5GNY A;  4BCE A;  3BCD A;  4PCS A;  3KL3 A;  2W5F A;  3L4X A;  1TCM A;  4CD7 A;  1RP9 A;  4XUY A;  1QHP A;  3VX1 A;  1CEO A;  1QI2 A;  1Q6F A;  2WBG A;  1MWO A;  4HOX A;  1UQZ A;  4NI3 A;  1R85 A;  1UYQ A;  1UWU A;  5BCA A;  4P8X A;  3AFB A;  1UD3 A;  1R86 A;  3WD4 A;  5CJ5 A;  2VJX A;  3AQU A;  5AC4 A;  4U2Y A;  3UG3 A;  2WMI A;  2Y4S A;  3VGD A;  2J8F A;  4DWS B;  1HKM A;  1B3W A;  1TFV A;  4URI A;  4CD4 A;  2J25 A;  3ZOA A;  1E4M M;  2WMJ A;  2CBJ A;  1E6P A;  4FLR A;  1W3K A;  2VL4 A;  2F2H A;  4AWE A;  3GXI A;  1UKT A;  3ZJ6 A;  2BXZ A;  2D3L A;  1WDP A;  1E1F A;  2PBG A;  4D71 A;  3VNY A;  4M81 A;  3K4A A;  4NRS A;  2XSB A;  1HJV A;  1W9P A;  3SCN A;  3WL0 A;  5GNX A;  2V3D A;  1CDG A;  4ZFM A;  4AZ5 A;  2WCS A;  1V6X A;  7TAA A;  1LL7 A;  1JG9 A;  1H4P A;  1JXJ A;  3VGH A;  3A4X A;  4BQ3 A;  4CVW A;  3W28 A;  3PZQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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