2G4FA

Structure of s.olivaceoviridis xylanase q88a/r275a mutant
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSAQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWASGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based engineering of glucose specificity in a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
molecule keywords Hydrolase
total genus 130
structure length 302
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2006-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2g4fA00
1C7SA 1V6VA 1VFFA 1UWIA 5LA2A 1EHAA 4PBGA 2V3FA 2JFEX 2YL6A 1P6WA 1HP5A 4GPNA 1U30A 1VAHA 2ZXDA 3MANA 3BSGA 4GQRA 1BYBA 3OGVA 5A8OA 1KR0A 3I3EA 1TA3A 2YDRA 1DWAM 3G6MA 1ODUA 1EDQA 1WO2A 4CU6A 4W93A 1V03A 3MMUA 2ZUWA 3FHAA 1GVYA 3VIMA 1XH1A 3IAQA 3ARZA 1CGXA 1ZU8A 3U57A 9CGTA 3WUBA 4TVCA 2BY0A 3L2LA 3RCNA 1E56A 3QOMA 1JIBA 3VD7A 2D20A 5JBFA 3VTRA 5JIPA 1QNOA 4KRTA 1PEZA 4J28A 1W9VA 2FH6A 1UH2A 3M46A 4HA3A 1NQ6A 3WQ6A 1NWRA 4ATDA 4YPJA 3AICA 2YBUA 2D23A 3CH9A 3CUFA 5I79A 3AHYA 1E4MM 1QNSA 2X2YA 3SUWA 4U33A 4AZCB 1X6NA 5IDIA 3OLDA 2ZX9A 5D9PA 3VX1A 1NM9A 3A4WA 3O6AA 3GM8A 1XHGA 1BFNA 5AYBA 1K6AA 3WQ8A 3W37A 1SR0A 2HISA 5E9AA 2V3EA 1LWHA 3VINA 1J0ZA 4H41A 4JFTA 1JAKA 1VENA 4B3KA 4D1IA 2BS9A 3QHNA 1CTNA 3ZR5A 2WWDA 2ZX7A 3NYDA 4LYRA 2DSWA 1BTCA 5D9MA 4QCEA 2CBUA 2W61A 5M03A 3CUIA 2J7DA 1PJ9A 2VVNA 3WEMA 4H8HA 4AXNA 2WVSA 5A8NA 3HMCA 4GZIA 1UKPA 3VIOA 5JBEA 5F7UA 3CHCA 2JIEA 3W27A 2XM2A 4QDMA 1MWOA 3T2PA 3CIVA 2A3HA 1J11A 2QV4A 2W66A 1PX8A 4AISA 3KE0A 4UFMA 4RE3A 3N15A 3CZKA 2E4TA 3II1A 1NOFA 3AMKA 3ZMRA 1PZ2A 3WNPA 3WD2A 5A1AA 4QAWA 4U5IA 1UOKA 5DF0A 2DSUA 1DWGM 5FCZA 3ECQA 4H04A 1OGBA 4S3JA 1D7FA 4AEFA 3EDFA 4PUDA 5EMYA 1CNVA 5BRPA 4HA4A 1BYCA 2A3CA 1X1NA 3N04A 1C8QA 1UKOA 4P7RA 3AMGA 3AXIA 2A3BA 3T0AA 1Y7VA 3GXIA 4JHZA 1J9YA 1AMYA 2XVLA 1KWGA 1CWYA 4MB5A 1YHTA 3FNDA 4MNMA 3W24A 1R7OA 1TFVA 1HJSA 1FP9A 4A3HA 3K8LA 3WKZA 1DWJM 3PBGA 3AZTA 2W91A 1W2VA 1HNYA 1V0MA 3VX0A 3WFLA 3AFBA 1E1FA 4OKDA 2IXUA 1E15A 3T2OA 3HN3A 4JKLA 4JFVA 1H5VA 1JXJA 7A3HA 4Z2KA 4JKMA 3VPLA 2EPNA 3OG2A 4IUGA 4JCMA 3T09A 1C7TA 1C91A 1Q6GA 1JZ6A 1WPCA 1BLIA 5A6LA 2GJXB 1VFMA 3N18A 3WUFA 3F5LA 3KZSA 4W89A 1JI1A 2E9LA 4CUCA 4J3VA 1GZJA 1CEOA 3T2QA 3AHTA 1G1YA 1W32A 3OBAA 3AIQA 4UZSA 4J27A 1EOMA 3FAXA 4UOQA 4ATWA 3WF3A 4JHOA 1R87A 1E5JA 2PBGA 4AIUA 4NZCA 1DHKA 3AHXA 3L4VA 1UD2A 3VGHA 1B30A 4E8CA 2EPOA 1XH0A 3POCA 4UOZA 4PYSA 2WB5A 1L0PA 3VD9A 1VF8A 4JKKA 1I75A 1UD3A 1OCQA 3N9KA 2GDUA 2J7FA 4OBSA 3RPMA 1LG2A 3POHA 1JFXA 1JDAA 4GO8A 2FH8A 2FGZA 3WSUA 3QHMA 1NP0A 1XV8A 2XG9A 3A3HA 1CXHA 4W8LA 4W8AA 2GJPA 3WDPP 1UR8A 1ISZA 3WF1A 1M03A 5CLTA 3APGA 2IUZA 1H0GA 2WCAA 1W3HA 1TVNA 2G8ZA 4AD4A 1UD8A 3PN8A 2PB1A 2GK1A 4HTYA 4H2CA 4CCDA 1FH8A 4MB1A 4A3YA 1V6YA 3MV01 1PBGA 1VFUA 1H3GA 1KGWA 5D8WA 1H41A 4M82A 1E6XM 4B15A 1OIMA 3VIPA 6TAAA 3WDHA 4UQBA 3MUZ1 2CBVA 1M01A 4CN1A 4X0VA 1SMDA 3M07A 4YHGA 1DWFM 1BVNP 3L4YA 3I3DA 4QLJA 5DO8A 1MQRA 5HNNA 1BG4A 1XD0A 2O9TA 1QVBA 4HU0A 1U2YA 1BAGA 3CBWA 3CO4A 5JBDA 1V3IA 4M56A 4R27A 2FHFA 1UWUA 3CHEA 1HN1A 4D6IA 4V2XA 2E9MA 2ZUTA 3W38A 2B31A 2J74A 1I1XA 5I2UA 3ZM8A 2XJ7A 4PSRA 4U3AA 4C7GA 2JF7A 3L4WA 3AS0A 2J4GA 3UETA 3PZIA 2CESA 2PWFA 2XYLA 5HPCA 4CCEA 2VX7A 2D3LA 3BMWA 5FD0A 4BQ4A 1HIZA 1E4NA 3ARVA 1E55A 1UUQA 4ACZB 4DM1A 3ZO9A 3ARYA 2W63A 2CYGA 5A6KA 1GOQA 1IZJA 2VQTA 2FHCA 4KGJA 3RJYA 1KXTA 3AMLA 4QFUA 3BAXA 2WZIA 2DT0A 2WANA 1TE1A 4AZCA 5D9NA 2VQUA 1EOKA 1B0IA 1QI5A 2BY2A 3CUJA 5CJ5A 6A3HA 4UQCA 1UR1A 1E9LA 2VNCA 1OD0A 3MU7A 1QBAA 3EMCA 3WMBA 3PHAA 5IXEA 3BAWA 3UESA 3G6LA 1UA7A 4JL1A 3T08A 5CQ1A 2E8YA 4UQAA 4DWSD 1ISWA 1BQCA 2WM0A 2C7FA 4CN6A 2CHNA 4EE9A 1XYFA 4XZWA 5AY7A 3VIFA 2VL4A 5EBAA 4F9JA 1OGGA 2WWCA 1J0JA 3EMQA 1AVAA 1C92A 2WLZA 2DIEA 2VVSA 2WC3A 4HMDA 3AIRA 5BCAA 3QGVA 2YL8A 1OT2A 2CHOA 5IHSA 4P8VA 2E0PA 4A4AA 2WMGA 3GNPA 4AZBA 1R8LA 4QLLA 1X6LA 1CPUA 3SUUA 1O6IA 2F8QA 4NSBA 1GQLA 2XVKA 1CGUA 1E3XA 1JGIA 1GJWA 2QHAA 3UG4A 2W92A 1AQMA 2NSXA 3CLWA 3FXYA 1H4PA 4PMOA 4WKFA 3SCOA 4Z2GA 5EFFA 3NJ3A 1JNEA 3MMWA 1ZL1A 1CYGA 1DP0A 3WH7A 3WNNA 3WH8A 2YOCA 4W5UA 4DWSC 2VZSA 3SCUA 2YDQA 3FW6A 3CTTA 2Y5EA 4LYPA 3SCSA 4WKAA 1YQ2A 2WMIB 1J0KA 4PMDA 2XUCA 2E9BA 4P7QA 2J8FA 2WVVB 1R86A 1GVIA 1L8NA 1NOUA 4AW7A 3IAPA 2XTKA 3U7VA 2VZUA 1UD6A 2D24A 2DSVA 4W8BA 5KEZA 4FLSA 1B3XA 3CZLA 4WLCA 3HU7A 2JEQA 4C7DA 2BVDA 5BYWA 3WNOA 2YLLA 1CBGA 2GJXA 4GO9A 1CXEA 3UERA 1UZ1A 1BSIA 4IISA 4P8WA 2WZEA 3PZVA 3VIKA 1MW3A 1DWIM 3CUHA 1DWHM 4H8UA 1ISYA 1QNQA 1LJYA 2XGIA 3IANA 3AROA 4CVWA 1V0KA 1W9PA 4EAMA 2WHMA 1HX0A 3PZQA 2O9RA 5DT7A 3MKKA 3K46A 3EDJA 3OIHA 1QW9A 2ZXQA 1GOIA 3OZOA 4HZ7A 1E3ZA 1JXKA 2WKLA 3SCVA 3RDKA 3WQ4A 4HZ8A 2J78A 2DH3A 2CITA 3MS8A 4MPKA 1HKKA 1ZJAA 1WP6A 2QPUA 3SCRA 1FP8A 3ZJ6A 7TAAA 3OLIA 3EBVA 3UR7A 5HXMA 2J79A 2VMFA 4GI9A 3PZNA 1GNXA 2VCCA 3AQUA 2DPEA 2WSKA 3BSHA 2XVNA 5A8MA 1E4LA 1JF5A 1TZ7A 1GQIA 4D6FA 5HPOA 5GNXA 4F9DA 3T0DA 3LMYA 4D1JA 2GVYA 3WDQA 1LL4A 4UFJA 4UZUA 3WY1A 1W9BM 3WF0A 3SURA 2YIHA 1PIFA 2YA1A 4P7LA 4M81A 1QW8A 1GOMA 2PWHA 3MUIA 2BVYA 2ZOXA 4ZE5A 2EQDA 4N42A 3FHQA 3EDEA 4YN5A 3VIJA 1K9TA 2XVPA 3AIUA 3CUGA 2VUYA 1GCYA 3IJ7A 1CIUA 3WIJA 3DECA 4U2ZA 1BPLB 4D6HA 2NW0A 2XVGA 1C90A 1HT6A 2JALA 4ZE4A 2DEPA 1GJUA 1F4AA 3WEZA 1LG1A 2X05A 2Y4SA 1KQZA 1WZAA 2YA2A 3BAYA 4CVUA 5I78A 5IFTA 2D2OA 3WUEA 3N12A 3U7BA 3VGGA 2YJQA 1JDDA 3VKKA 1PAMA 3F5JA 3S6TA 1V02A 3W29A 3K4DA 4CD4A 3BXWA 2CKSA 1ZJBA 2WVUA 3VGBA 5CPTA 1TMQA 1HJVA 1V08A 3VDAA 3CZGA 1V3HA 1H2JA 2VRKA 3MV11 1CXIA 2FHBA 5A2BA 3WNMA 4Z2HA 3AISA 5A6BA 4ACZA 1E0XA 2DT2A 3UG5A 3AIEA 3DYOA 3SUTA 1E6QM 1HKIA 4MTVA 4PMVA 1VBUA 2EEXA 3AJ7A 5AYIA 2J7GA 1E43A 3KL3A 2DSKA 1FFRA 4UTFA 1EHNA 3RO8A 1H09A 3AXHA 1HXJA 1NH6A 2OSYA 1HJWA 4YHEA 1M53A 1J01A 5HOSA 3GNRA 3BAKA 1XCWA 3AIBA 2WC4A 2UY3A 4AD3A 4PTWA 5JIWA 4AC1X 3SCWA 2AAAA 5D8ZA 2PWEA 1RD6A 1OD8A 3W0KA 1FHLA 2QF8A 4W87A 3L4UA 1CGTA 5A8PA 3A6OA 1RP8A 2XGBA 3WEOA 3WD3A 1KCKA 3AZRA 1JZ7A 4CKQA 4JIEA 2DT1A 3GZAA 2MANA 2VCBA 1E4IA 2CBIA 3UR8A 1UR2A 2BHZA 2J7BA 1UR0A 4OJYA 1B1YA 1IV8A 1XC6A 5BXSA 3L4XA 3VM7A 4GZJA 1UWSA 3N13A 2J77A 3THDA 3SIMA 1JF6A 4PMRA 2J75A 1OIFA 1C3FA 1GOKA 1BVZA 3WMSA 1Q6EA 3ZSTA 2OWWA 5E6ZA 3VIGA 1E6ZA 5D4YA 2AOSA 2J25A 3WUGA 5KZ6A 3BGAA 4D72A 1M04A 3KL5A 4AD0A 5A6JA 1G01A 4NF7A 2CCRA 4FK9A 1ODZA 3NSMA 1HP4A 2WMIA 4NRRA 1LLOA 2OSXA 1O7AA 2PI6A 1HJQA 5I0DA 2OYMA 1WE5A 2WVVA 1MVYA 4BA0A 1A3HA 1UR9A 3M6DA 1JYNA 3BLKA 3ARQA 3OLGA 4UFKA 2ZICA 5C71A 2WSPA 3WF2A 1VB9A 4MNLA 4AZ6A 2VT0A 3HJEA 4BQ3A 3LPFA 5FL1A 1UA3A 3AYSA 3GH4A 2WK2A 3FN9A 2QMKA 4LX4A 4TX6A 5CPSA 1LQ0A 3DYMA 2OWCA 1RP9A 3KL0A 5A95A 3AXXA 5JUVA 4TVDA 5D9OA 2WPGA 3ZJKA 4P7NA 4Q7NA 3VMNA 1EH9A 1GHRA 2VOTA 3WL0A 3J7HA 3F4VA 3TOPA 3OGRA 2EXOA 1E1EA 5CXPA 3S2CA 3VOCA 4NI3A 4GKLA 2WKGA 1PZ3A 5I77A 1CGYA 2BHUA 4PTMA 4UFHA 1DTUA 2WHKA 4HA1A 3IK2A 4CD5A 2EBNA 3CMJA 1W9UA 1ZBVA 2BNJA 3WN6A 5CGTA 4AEEA 5IFPA 2D0GA 3ALGA 3WBAA 4CU8A 2G3IA 5ABHA 3KWXA 2WMKA 4M29A 1HJUA 4UR9A 2D3NA 3CZJA 3W25A 3DHPA 1JZ5A 1UD5A 1H49A 1I1WA 3VUPA 1GW1A 3LPPA 2WMJA 3NDYA 3VGFA 2X8RA 4URIA 1W9XA 2VX4A 1KR1A 1CZ1A 1ITXA 5I23A 1B3YA 2QMJA 2JIWA 1NARA 3U5UA 4BS0A 3MUY1 2F61A 2DGAA 2E3ZA 3ARSA 1QI3A 2VRQA 5HDRA 5CG0A 1JAEA 1MW0A 2W62A 2VZOA 3UG3A 3TTOA 2Y2WA 3KEHA 3ARWA 1QNRA 4HOZA 1FH9A 2EPMX 3NDZA 1FHDA 4E8DA 3L4ZA 2DQXA 3EDKA 3W26A 4QCFA 4XZBA 4DUXA 1J0YA 1BGAA 3A47A 1G9HA 1F4HA 1OT1A 1C93A 1RH9A 4W85A 1HKMA 4ZEPA 4WSKA 4RL3A 4PMXA 4JAWA 1WZMA 4BCEA 1TCMA 4D6CA 3W6MA 4BQ5A 1B9ZA 1HVXA 3PTKA 1UQYA 4WKHA 3TONA 4AD2A 4HPHA 1QBBA 3SCPA 2ZIDA 3RJXA 5BXRA 2DDXA 5TD4A 1V0NA 4Z2LA 2XPKA 3IJ9A 5DT5A 1VEMA 4RE4A 3WFZA 2CEQA 5CSYA 1XRVA 2V3GA 1V3KA 2YKKA 2CNCA 3WQVA 3F5KA 1QOXA 4LQ1A 3NUKA 3QR3A 1B31A 2J8GA 4CD6A 1QI4A 3AYRA 5GNYA 1V6XA 4KMQA 1VRXA 1KCLA 1V6WA 4XV0A 1E6NA 4FF5A 1J0IA 2BXZA 5FOOA 2WVTA 4ZFMA 1PX3A 2NT1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1C7S A;  1V6V A;  1VFF A;  1UWI A;  5LA2 A;  1EHA A;  4PBG A;  2V3F A;  2JFE X;  2YL6 A;  1P6W A;  1HP5 A;  4GPN A;  1U30 A;  1VAH A;  2ZXD A;  3MAN A;  3BSG A;  4GQR A;  1BYB A;  3OGV A;  5A8O A;  1KR0 A;  3I3E A;  1TA3 A;  2YDR A;  1DWA M;  3G6M A;  1ODU A;  1EDQ A;  1WO2 A;  4CU6 A;  4W93 A;  1V03 A;  3MMU A;  2ZUW A;  3FHA A;  1GVY A;  3VIM A;  1XH1 A;  3IAQ A;  3ARZ A;  1CGX A;  1ZU8 A;  3U57 A;  9CGT A;  3WUB A;  4TVC A;  2BY0 A;  3L2L A;  3RCN A;  1E56 A;  3QOM A;  1JIB A;  3VD7 A;  2D20 A;  5JBF A;  3VTR A;  5JIP A;  1QNO A;  4KRT A;  1PEZ A;  4J28 A;  1W9V A;  2FH6 A;  1UH2 A;  3M46 A;  4HA3 A;  1NQ6 A;  3WQ6 A;  1NWR A;  4ATD A;  4YPJ A;  3AIC A;  2YBU A;  2D23 A;  3CH9 A;  3CUF A;  5I79 A;  3AHY A;  1E4M M;  1QNS A;  2X2Y A;  3SUW A;  4U33 A;  4AZC B;  1X6N A;  5IDI A;  3OLD A;  2ZX9 A;  5D9P A;  3VX1 A;  1NM9 A;  3A4W A;  3O6A A;  3GM8 A;  1XHG A;  1BFN A;  5AYB A;  1K6A A;  3WQ8 A;  3W37 A;  1SR0 A;  2HIS A;  5E9A A;  2V3E A;  1LWH A;  3VIN A;  1J0Z A;  4H41 A;  4JFT A;  1JAK A;  1VEN A;  4B3K A;  4D1I A;  2BS9 A;  3QHN A;  1CTN A;  3ZR5 A;  2WWD A;  2ZX7 A;  3NYD A;  4LYR A;  2DSW A;  1BTC A;  5D9M A;  4QCE A;  2CBU A;  2W61 A;  5M03 A;  3CUI A;  2J7D A;  1PJ9 A;  2VVN A;  3WEM A;  4H8H A;  4AXN A;  2WVS A;  5A8N A;  3HMC A;  4GZI A;  1UKP A;  3VIO A;  5JBE A;  5F7U A;  3CHC A;  2JIE A;  3W27 A;  2XM2 A;  4QDM A;  1MWO A;  3T2P A;  3CIV A;  2A3H A;  1J11 A;  2QV4 A;  2W66 A;  1PX8 A;  4AIS A;  3KE0 A;  4UFM A;  4RE3 A;  3N15 A;  3CZK A;  2E4T A;  3II1 A;  1NOF A;  3AMK A;  3ZMR A;  1PZ2 A;  3WNP A;  3WD2 A;  5A1A A;  4QAW A;  4U5I A;  1UOK A;  5DF0 A;  2DSU A;  1DWG M;  5FCZ A;  3ECQ A;  4H04 A;  1OGB A;  4S3J A;  1D7F A;  4AEF A;  3EDF A;  4PUD A;  5EMY A;  1CNV A;  5BRP A;  4HA4 A;  1BYC A;  2A3C A;  1X1N A;  3N04 A;  1C8Q A;  1UKO A;  4P7R A;  3AMG A;  3AXI A;  2A3B A;  3T0A A;  1Y7V A;  3GXI A;  4JHZ A;  1J9Y A;  1AMY A;  2XVL A;  1KWG A;  1CWY A;  4MB5 A;  1YHT A;  3FND A;  4MNM A;  3W24 A;  1R7O A;  1TFV A;  1HJS A;  1FP9 A;  4A3H A;  3K8L A;  3WKZ A;  1DWJ M; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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