2HISA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase double mutant e127a/h205n with covalent cellobiose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNAAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSNLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into transition state stabilization of the beta-1,4-glycosidase Cex by covalent intermediate accumulation in active site mutants.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
molecule keywords CELLULOMONAS FIMI FAMILY 10 BETA-1,4-GLYCANASE
total genus 118
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1998-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2hisA00
3WEMA 1HKKA 3SCNA 1B3VA 4ZE4A 3BXWA 4LX4A 1KWKA 2DQXA 1GOWA 4AD2A 1UUQA 1TMQA 2X1IA 1VF8A 5DEZA 4GI8A 3F4VA 5GNZA 2IXUA 4TTGA 2XVGA 1FH7A 4Q22A 4H8HA 9CGTA 3WFZA 2XJ7A 4KRUA 5BCAA 3N15A 5JIWA 3AXXA 4BA0A 4ATDA 3CUHA 4CVWA 2CITA 2FHCA 3CUGA 5CZKA 3NCOA 4FF5A 2CKSA 1QNQA 4L4OA 3CUJA 2YL6A 4XV0A 1RPKA 3PZGA 5HPCA 2O9TA 5ABEA 1QBBA 1CLVA 1U33A 1WDSA 1E56A 4TUFA 1J0ZA 1JGIA 3ARYA 2JF7A 3WL1A 2WHLA 3AIQA 2J4GA 4J3XA 1GJUA 1R87A 2WMJA 3WD4A 1QVBA 3BSGA 3OZPA 5I77A 1E1FA 3OZOA 2YBUA 3ZQ9A 1QNRA 3RILA 2DT1A 1MW0A 1ISVA 1OGSA 3A47A 4JHZA 1UR0A 2VRQA 2CESA 1ZJAA 1UD2A 2DGAA 1KXHA 1QI3A 4D6JA 3DYOA 1V3IA 3VIGA 1C92A 1C90A 3MUIA 2ZXDA 4GIAA 1M03A 2J8GA 3AS2A 1KR1A 3HMCA 4E2OA 4MB4A 1V6YA 5JBEA 1CZ1A 3AOFA 2BY3A 1XV8A 3WNKA 2W66A 2WLZA 3TTYA 3ZSSA 1H1NA 5JUVA 1QW8A 3ZT5A 3MKKA 4YPJA 3ARTA 4B3LA 4PMXA 3AIWA 3MUZ1 1JI2A 1JG9A 2VI0A 3UESA 2E8ZA 3VIKA 1E4LA 1H0IA 4NZCA 4GO8A 3WF0A 4AIEA 3EMZA 2WLYA 5AC5A 4AIUA 2YDQA 1PEZA 4MTVA 3VDAA 2VURA 2VZTA 3MU7A 2VZOA 3NDYA 2PC8A 2VJXA 6A3HA 3VD9A 4AD0A 4BF7A 4PMYA 1E1EA 4UR9A 1XH2A 2ZIDA 1UHVA 1V02A 2VX4A 4M80A 1PZ2A 4JFUA 4D1IA 4DUWA 3NDZA 3MMUA 4B16A 4WF7A 4DM1A 3ZOAA 1W2PA 3WBEA 4D6HA 5BXTA 4HA4A 3LPPA 4BQ4A 1E5NA 3GZAA 2DPEA 2C8NA 3L4ZA 5FCZA 4RE3A 1WZMA 2J47A 4NRRA 4BQ2A 4PMDA 2ZUTA 3CH9A 4UFLA 4UQEA 1QI0A 1WAWA 3AHTA 3GH4A 3OGVA 3FAXA 2Y2WA 1BGAA 1KBKA 3W27A 4AC1X 1B3ZA 1JAKA 1UWQA 4PMRA 4X0NA 1HT6A 1EO7A 5A6KA 3SEPA 2G41A 5DF0A 4D71A 4HPGA 4XUYA 2W91A 3WUEA 4HMEA 5A2BA 4M1RA 3B9AA 2ZUWA 3VTRA 1BG4A 4IUGA 4HOWA 2BY1A 1OD0A 3L4WA 1JL8A 2CPUA 4D6FA 1UKQA 3CHFA 1ZJBA 3VMPA 1XSJA 3MMDA 3K4AA 3VNZA 3A6OA 3WDPP 3OBAA 2QMKA 3OA5A 4OZOA 4UOJA 1JZ6A 2WHMA 4FK9A 1HN1A 4PMZA 5HOSA 1Z32X 1BF2A 1W3JA 3ARPA 5BXRA 5JBFA 1W3HA 1UWTA 3VPLA 3MUAA 2BHYA 1V3LA 1FFQA 3RM4A 1XYFA 3FW6A 2E8YA 1E0VA 2V3EA 2W92A 2E3ZA 1NM9A 1DWFM 4W89A 1ISYA 3AYRA 3OLEA 2VC9A 5CJ5A 2VL4A 2JEQA 3N12A 3LPOA 1TA3B 5EMYA 3CUIA 4NI3A 5E6YA 4IPLA 2OWXA 4AD3A 2WMKA 3EMQA 1WDPA 1UH4A 3KL3A 3TOPA 3QOKA 1LJYA 4PTMA 1JZ8A 3T0BA 2F8QA 2WHJA 2VT0A 2ZWYA 3T09A 3OGSA 2OYMA 1LF1A 1KXQA 2WZHA 1UZ4A 3IJ7A 1ITCA 1V03A 3GNRA 1JZ3A 1G94A 1H49A 1NWSA 1W1TA 4XB3A 1QPKA 4Z2KA 1EQPA 1JYNA 3AMLA 5CLWA 3U7BA 3RM9A 2YDSA 1JNDA 2J7BA 1W9DM 3UERA 2V5CA 3AMCA 2WANA 2OWWA 4JAWA 3ZM8A 4BS0A 1K9DA 1WB0A 1OGBA 4W88A 4UOQA 1GOKA 3L2MA 4BCEA 3W29A 3WQ4A 1PX8A 3ARQA 2WK2A 1TG7A 2ZX7A 3KL0A 3BC9A 5ABGA 3CLWA 3EBVA 2QMJA 1E40A 1D2KA 3MV11 6TAAA 2X8RA 4EAMA 4AZCA 4A4AA 5D9OA 1E73M 4JHOA 1XC6A 2A3BA 1EDQA 4JKKA 3THCA 1XCWA 2WNWA 2G3IA 3FN9A 3AFBA 3BSHA 2OSWA 5A8PA 5ABFB 1QI2A 4DUXA 4ML4A 4D6DA 1SR0A 5HBFA 3VO0A 5A6MA 4V2XA 4GI9A 1JXJA 2ZUVA 3NSMA 4EKJA 2ZUSA 3MSDA 3RDKA 4M56A 2XGBA 1KQYA 3VINA 2WZEA 1BG9A 3ZSTA 3WD1A 4HMDA 1NOFA 5F7UA 4AIOA 3O6AA 4TVDA 2XIIA 4CD5A 2DSKA 3EDKA 2C0HA 1CBGA 4U33A 1GQKA 2VZVA 3GXFA 2ZUUA 1LL6A 4JL2A 3ZJKA 1UD8A 4HP5A 4HZ7A 4N42A 3BAYA 3MO4A 4LQ1A 4JKMA 1WDRA 2QPUA 3WD2A 1GNXA 1MQRA 3ZMRA 4UFHA 3D3AA 4AZ5A 2G3JA 1C3FA 2J79A 5E0FA 1CXHA 1J0JA 3IJ9A 5FOOA 2YLLA 4W5UA 5GPRA 3SUTA 4CD7A 5I5RA 1RH9A 4J3VA 3POHA 3ARZA 3L4YA 3PTQA 1XH0A 1KCKA 2ZICA 4TTUA 3ZR6A 2DSUA 3IANA 1CTNA 2BY0A 1W9PA 1HVXA 2ZX8A 3GM8A 2A3EA 2XHYA 3QHMA 4PMVA 1IZJA 4LXFA 4AZ6A 2E40A 4UQAA 1QHOA 1HP5A 1VIWA 1IT0A 1XH1A 4CU6A 5FKYA 1KFWA 3SCVA 5BXPA 1JFXA 2EBNA 1XD0A 1U2YA 3BLKA 2WVVA 3I3DA 2AAAA 1ZL1A 3K8KA 3AHXA 3WKZA 4KRTA 3BAIA 3QHNA 3VILA 5CXPA 2VRKA 2DIEA 5A6LA 3FNDA 4W7UA 3SCUA 1E43A 1HL8A 3W26A 4MB1A 2XGIA 1E3ZA 2WCSA 4ZXLA 5IXEA 2AMGA 3AYSA 1LL7A 1BYDA 3WH9A 1KBBA 3GBDA 4AD4A 3FHAA 1G1YA 1O6IA 2VX7A 4PMOA 1JF5A 4IISA 1PPIA 2XVKA 5LA2A 4OBSA 1C8YA 3CPUA 1V3MA 1DP0A 5DMYA 1D7FA 4WSJA 5EFDA 2WMIB 4ZXOA 2X2YA 2XM1A 1BLIA 1J0HA 5KEZA 2GVYA 4PUDA 5HNNA 1D3CA 2J7DA 1Q6DA 2QLYA 2CKRA 4QAWA 1OBAA 1W2VA 4Q7NA 2ZXQA 2PBOA 1NP2A 3PN8A 4CD8A 3NSNA 3NYDA 1W32A 4L4PA 4D1JA 1VFUA 4GQQA 4HTYA 3I3BA 2PB1A 3VGEA 1J0KA 1LG1A 2CYGA 3K1DA 4TXEA 3ZO9A 1Q4NX 2Q8XA 5C70A 4X0VA 4ZFMA 1JZ7A 1US3A 1K9FA 1KGWA 1C8XA 4ACYA 1B2YA 4PMQA 3BCFA 4HZ8A 2BVYA 4QLJA 3MANA 4CVUA 1DWJM 1VEPA 4B9YA 2D24A 3TTOA 3LPGA 3OIHA 4A3YA 4AW7A 2E0PA 4V27A 3T0AA 2EXOA 4QCFA 3VIJA 3S6TA 4WSKA 1QNOA 2DT2A 3VUPA 3VGGA 1B1YA 2Y24A 4C7DA 2XUCA 1PZ3A 2JIWA 3VIOA 3M07A 4WKFA 3N11A 3U5UA 2FGLA 3EDFA 2WB5A 4MADA 3VOCA 3UR8A 1GCYA 1XD1A 2XVLA 4M8UA 4CD6A 3TONA 2FH6A 8CGTA 4W93A 2FDMA 1GVIA 4KGLA 1BVZA 1BVNP 1HKIA 2FGZA 5EFFA 1UWSA 1EHAA 1UYQA 5A94A 3N9KA 1CWYA 2WXDM 1CXKA 1MYRA 1SFSA 5FD0A 1GOQA 2WBGA 1VJSA 5BRPA 1B3YA 2EO7A 3CZKA 3CZGA 2DDXA 4OKDA 2XWEA 3MMWA 2YLAA 5A6SA 1Q6GA 4JFTA 1GJWA 1JZ2A 3AHYA 4P7NA 1B3XA 1VJZA 4PSPA 3LMYA 1UKPA 2XPKA 3WH7A 1A47A 1MQPA 4MAVA 3VDCA 3K8LA 1B31A 3N04A 1BFNA 1SMAA 1JI1A 2WW5A 2VO5A 2PWDA 2WAGA 1E6RA 1ZBCA 3J7HA 3RO8A 2CXGA 3VX1A 5GNXA 1GHRA 2XVNA 1K9EA 3WEOA 3AS1A 1L8NA 1ZBKA 4TX8A 3WDQA 1OWQA 2DSVA 1E4MM 4CCDA 1Q6CA 2CBUA 4MNMA 1GOIA 3B9DA 1CGXA 1N82A 2XYLA 4CKQA 4UZSA 2WMHA 2OYLA 2YA2A 1V08A 4W7VA 1DTUA 1G9HA 5DT5A 1TR1A 4UFKA 5C8BB 4CCCA 1HJUA 5E70A 3BAXA 1BHGA 2UY4A 4PTVA 2JALA 1WO2A 4QLLA 5FIPA 4JKLA 4HMCA 2Y4SA 4QCEA 4UQBA 4JFWA 4S3KA 3AS0A 1UWUA 4ACZA 3W6MA 3TA9A 2XM2A 5A8QA 1H0GA 1BGGA 3U7VA 1GZJA 3OGRA 4R5EA 1LWHA 4JL1A 3W81A 1HF6A 4NRSA 5E9AA 3RMEA 1ZB5A 3L2LA 1WDQA 1HL9A 2WHKA 3W6LA 4Z2HA 2YDRA 1L0PA 7A3HA 2UWFA 2XSAA 2VNCA 3GYCA 3VGBA 2A3CA 2WKGA 3L4UA 4HA3A 5AC4A 2VX5A 3T2QA 3VNYA 4WKHA 4ZE5A 4WLCA 2J7CA 3WUFA 1CGWA 2CIPA 1FH9A 4UZUA 1AQMA 4F66A 2WMGA 1V0KA 2YOCA 2YBTA 2WM0A 4W85A 5FL1A 1EA9C 5BROA 4B9ZA 2WYSA 3WIJA 2PBGA 3SUWA 1B0IA 1UD3A 3ZJ7A 3N13A 3WN6A 1KGUA 3CTTA 3WNOA 1JDDA 2Y8VA 5CSUA 4J7RA 4LYRA 4H7VA 2ZUNA 2X0YA 5I24A 2XIBA 1W1VA 4JFVA 3WD3A 3AQUA 1YQ2A 1J12A 2X09A 2PWEA 1KB3A 4B3KA 2Y8KA 1KXTA 3FAWA 3VMOA 3AHVA 5HPOA 2JIEA 2ZWZA 3FXYA 4AZIA 1X1NA 3GXIA 2WPGA 5CPTA 3WF1A 1Q6EA 5LA1A 3PZMA 2J77A 2QPSA 1TCMA 1V3HA 3W38A 1KXVA 2WC4A 2YA0A 5A8OA 3L4XA 2VRJA 4OBRA 5ECUA 4R27A 1MW3A 1V0MA 1E55A 1TA3A 2DSWA 1UA7A 2J7FA 2V3FA 5DO8A 6CGTA 3BAWA 4MDOA 3A3HA 4UQDA 3AICA 3HN3A 1VENA 1H09A 1AMYA 2J7HA 3VKKA 1CXLA 1OINA 4D6GA 7TAAA 4K68A 3T08A 2NT0A 3ZR5A 2PWFA 1UD4A 4W7WA 2O9PA 1GORA 1V6XA 3CHDA 4F9DA 2OYKA 3T0DA 2BHZA 3VDBA 1KWGA 1PAMA 1JXKA 1V3JA 3WF3A 4QDMA 4ZENA 1M7XA 3HJEA 2D2OA 1CGVA 1HJSA 2OSYA 2VR5A 1HJXA 2RGLA 3WNMA 3UETA 3WQ5A 2DH2A 3KZSA 1EOMA 4H2CA 4PSRA 4QP0A 3VMNA 3AIUA 1E3XA 4AZGA 4YN5A 3THDA 1XSIA 1LG2A 3GTNA 1JF6A 4AEEA 4C7FA 4C7GA 1ZBWA 3O9NA 1E15A 1G0CA 1UKTA 2WWCA 2J78A 1E4IA 1H4PA 2JF6A 3WFLA 3VU2A 1E9LA 1AQHA 1YHTA 3CIVA 4WJXA 2EPMX 2ZX5A 1CGUA 1ODZA 2ZXBA 1JD9A 2XSBA 5ABFA 1E6QM 4W84A 1XCXA 1UQZA 2Z1KA 4J27A 1GONA 1TFVA 3GDBA 4GO9A 1OSEA 2UY2A 2VVSA 1G5AA 2VUYA 3RPMA 1W1PA 3B8SA 3WL0A 3GBEA 1LWJA 2XFYA 1GUVA 1OB0A 3EMCA 1UZ1A 2ZE0A 2CHNA 4MJ4A 1HP4A 2W61A 2GJPA 3ECQA 5D9PA 5A6BD 1C8QA 4HU8A 4UCFA 1KCLA 2J75A 2FHFA 2GJRA 1E6SM 1B9ZA 4PRWA 2CHOA 4PEEA 1VFFA 1BPLB 1OIFA 3BAJA 2B31A 5HXMA 2VVNA 2OSXA 4KGJA 2WCGA 2D22A 3WUBA 4PBGA 3D5HA 2DSZA 1ISXA 3ZT7A 4P7LA 2WC7A 2QHAA 2GSJA 1JNEA 3QGVA 4YHGA 5TD4A 3BMVA 1ZS2A 1JFHA 4W86A 3FHQA 3F5JA 3KL5A 4CCEA 4HU0A 2E9MA 4H8UA 4UQCA 4D6IA 5JIPA 5AYIA 2OLHA 1E5JA 3SCOA 3SUSA 3CUFA 3U57A 4LGXA 1J18A 4PTWA 4U2ZA 4CN4A 4JCLA 2BHUA 2WMFA 3WH6A 3VGHA 1UR2A 3N18A 2DIJA 4AMCA 1Y7VA 1H3GA 2YJQA 1CNVA 1R85A 3CMGA 3AIVA 1NOWA 4D6CA 4AD1A 1VEMA 1X6LA 3VD7A 5M03A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WEM A;  1HKK A;  3SCN A;  1B3V A;  4ZE4 A;  3BXW A;  4LX4 A;  1KWK A;  2DQX A;  1GOW A;  4AD2 A;  1UUQ A;  1TMQ A;  2X1I A;  1VF8 A;  5DEZ A;  4GI8 A;  3F4V A;  5GNZ A;  2IXU A;  4TTG A;  2XVG A;  1FH7 A;  4Q22 A;  4H8H A;  9CGT A;  3WFZ A;  2XJ7 A;  4KRU A;  5BCA A;  3N15 A;  5JIW A;  3AXX A;  4BA0 A;  4ATD A;  3CUH A;  4CVW A;  2CIT A;  2FHC A;  3CUG A;  5CZK A;  3NCO A;  4FF5 A;  2CKS A;  1QNQ A;  4L4O A;  3CUJ A;  2YL6 A;  4XV0 A;  1RPK A;  3PZG A;  5HPC A;  2O9T A;  5ABE A;  1QBB A;  1CLV A;  1U33 A;  1WDS A;  1E56 A;  4TUF A;  1J0Z A;  1JGI A;  3ARY A;  2JF7 A;  3WL1 A;  2WHL A;  3AIQ A;  2J4G A;  4J3X A;  1GJU A;  1R87 A;  2WMJ A;  3WD4 A;  1QVB A;  3BSG A;  3OZP A;  5I77 A;  1E1F A;  3OZO A;  2YBU A;  3ZQ9 A;  1QNR A;  3RIL A;  2DT1 A;  1MW0 A;  1ISV A;  1OGS A;  3A47 A;  4JHZ A;  1UR0 A;  2VRQ A;  2CES A;  1ZJA A;  1UD2 A;  2DGA A;  1KXH A;  1QI3 A;  4D6J A;  3DYO A;  1V3I A;  3VIG A;  1C92 A;  1C90 A;  3MUI A;  2ZXD A;  4GIA A;  1M03 A;  2J8G A;  3AS2 A;  1KR1 A;  3HMC A;  4E2O A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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