2I9EA

Structure of triosephosphate isomerase of tenebrio molitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
ARKFVVGGNWKMNGDKKQINEIIGFLKSGPLNQDTEVVVGVPAIYLELVRTCVPASIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDVGADWVILGHSERRQIFGESDELIAEKVCHALESGLKVIACIGETLEEREAGKTEEVVFRQTKAIAAKVNDWSNVVIAYEPVWAIGTGKTATPQQAQDVHKALRQWICENIDAKVGNSIRIQYGGSVTAANCKELASQPDIDGFLVGGASLKPEFVDIINARQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title A coleopteran triosephosphate isomerase: X-ray structure and phylogenetic impact of insect sequences.
pubmed doi rcsb
source organism Tenebrio molitor
total genus 89
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2006-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2i9eA00
2E5BA 2ZRWA 1B9BA 3KRUA 3QEZA 4JS3A 4Z08A 1SW0A 1TPFA 2ZA3A 5CPLA 3H53A 3BPWA 2WQPA 5C2XA 4JTLA 4FIQA 1PV8A 3DU0A 4WXZA 4LRTA 4MKNA 1RR2A 1TTJA 4EOUA 2PURA 1Z44A 3D0CA 3MBDA 3G1XA 1QPNA 1VHCA 2ZTKA 5KINA 1YPIA 2XN1A 1LP6A 3LB0A 3TUUA 5BMXA 2TMDA 4PL2A 1DV7A 2GVJA 2ZQ0A 3LCLA 2VFGA 3DGRA 1D3HA 4AVFA 3M0ZA 2RH9A 4IX0A 1ZALA 4I9AA 3EX4A 2C6QA 4TMCA 2DU2A 4IPJA 3MI2A 4W9TA 1WAUA 2C13A 1NEYA 4FNPA 4FB7A 4Z1AA 3RNDA 4LOCA 3JS3A 4OV9A 1TSIA 1GOXA 1LZOA 3SGZA 4TO8A 4FNQA 3NQ8A 3RK8A 3IIXA 4O14A 5DBUA 1VRDA 2JKAA 3LI1A 4RCXA 5G1TA 3EB2A 4GUHA 2ISSA 2I1OA 1FCBA 1OFOA 4UNKA 1GVOA 3L5LA 1QOPA 2WO5A 3KX6A 1I2RA 3R89A 2QJGA 1KV8A 3QW4B 1JRCA 4PA8A 1HO4A 2VEMA 4ZQOA 2NXIA 4O12A 4O0ZA 2UV8G 3NG3A 5BMWA 4M5PA 3L65A 5I3GA 1ZY9A 3VKJA 2V5LA 2WSQA 3DKLA 5FF7A 1Q6LA 3PG9A 3EWUA 2WV8A 2JGQA 4BWLA 3HJZA 1FY6A 1L6YA 4OT7A 2DORA 3CWOX 2BXVA 1VH7A 4GUGA 2EKCA 3QPZA 3WJWA 4N4QA 4NXSA 1SZEA 3NQGA 1LLZA 4O50A 5H2ZA 4JTJA 3O16A 4JIQA 3ZWTA 1VYPX 2F7FA 5EA9A 4DPPA 3MYOA 3G8EA 2C3ZA 1YTDA 4QISA 3E12A 4IMCA 3W23A 1VLIA 2VXNA 3UQNA 1H1ZA 2ZRZA 4LNYA 4AEOA 3THAA 1O95A 4AMAA 4RZ5A 3WJSA 1QO2A 3P80A 1PS9A 3BK0A 4R33A 1JCMP 4KFPA 2VEPA 3E49A 2QCMA 4UFHA 1ME8A 3CHVA 4R34A 2DZVA 3L67A 3MHUA 5J5RA 3O8AA 1FWSA 2JKEA 1H5YA 3T44A 3NZRA 2NWSA 4LVBA 3LXCA 3QRHA 1X8FA 4X22A 4NVTA 5D38A 1Q6RA 2H8XA 1KTNA 4WJEA 1Z48A 3GKAA 3W1TA 1A5BA 3QSRA 4XQ6A 4Z1DA 3G8RA 5D2YA 2YPIA 1HTIA 1TJPA 1TIMA 2OMAA 3NO5A 3HF3A 5LHFA 1K7FA 1G4SA 5K2ZA 3LCIA 3NQVA 1B4EA 1XFBA 3I6RA 4LS1A 3G3MA 3I7SA 4KFOA 4ADTA 1C29A 1FBAA 2GJNA 3GAKA 4K7YA 3NR0A 5D03A 1H1YA 3BLEA 3LDVA 4WY0A 3P84A 4K37A 3TFCA 2WOQA 2ISWA 2J88A 1TRIA 3HG2A 1R30A 3LLFA 1I8JA 1K8ZA 4XTDA 3E96A 4PEKA 3MYPA 4FO4A 3QYQA 3NL6A 3STCA 3AJXA 2WPBA 2VEIA 2NUWA 3SSJA 3BG5A 4QSHA 4CNOA 1OABA 2CLOA 4OQVA 1KW1A 4IWWA 4H4IA 3T40A 4H6KA 2O7SA 3DFTA 3TV8A 2VFHA 2HSAA 2XFWA 5KZEA 3I68A 5HULA 4NUWA 1KM0A 2H3DA 1VCGA 3NL5A 2A21A 4CCDA 4FHAA 4N6EA 1KM4A 4N9EA 4QIUA 3W2NA 4WZHA 3NDOA 2YX0A 3P8JA 3NM1A 3L68A 3S1UA 1RPXA 1AL8A 2R91A 4K8HA 3MW7A 1J5TA 3NPUA 1A5CA 3W7PA 3GXNA 2C0AA 3WK0A 2DZTA 3LBCA 3W7CA 4K7VA 1EUNA 1FCQA 3PB2A 2JBMA 3KVJA 3L5MA 1RZMA 1U83A 3FS2A 3EX1A 1P0NA 4AWUA 3C52A 5D02A 3M43A 1H7PA 4JTEA 2A1YA 4JTKA 1ML1A 3ATYA 4POCA 4GWEA 1ADOA 3QM3A 4TX9A 4CQ9A 1U5JA 2QUTA 3S6DA 3HPZA 1N7KA 3MHFA 3G0SA 1MEHA 1JQVA 2ZRVA 4MJMA 4M6VA 4HPXA 4FNUA 2EAWA 2Y62A 5EKYA 5HNRA 3W74A 5AHEA 1F2JA 5F4XA 1SFJA 2DZPA 3QMRA 3TSBA 5HUOA 3RLUA 6TIMA 3M9YA 2ABAA 4GRSA 3UY8A 4Y9AA 2CWNA 3UYCA 4YMZA 1KA9F 3PVFA 1T0OA 3NA8A 3ZR4A 2G5WA 4XUGA 1XBYA 4HNUA 1PCWA 3P82A 1F05A 1O60A 1EB3A 1TPWA 3BG9A 4HNVA 3BVJA 1TPEA 1J4EA 3G18A 4UR7A 3ZFHA 4JNMA 4RXGA 4DXVA 1OX4A 1K8YA 3GDLA 4HPJA 1HUVA 2FTPA 4NJHA 3TH6A 2GQ9A 1R47A 5AYYA 3TROA 2J9YA 3PSVA 4ZVJA 4AB4A 2ISVA 3MMTA 3WJZA 4QNEA 3U6WA 2FLIA 3EWXA 2VFFA 2GQ8A 3P61A 1M7PA 4QAIA 5HINA 1VCVA 3N9RA 4CCEA 1VGAA 2YXGA 1W5OA 3V1PA 5L9FA 3R12A 4JX5A 4QNWA 2J9ZA 1TO3A 1DOSA 3MP3A 2PRMA 4UR8A 4MZ8A 2TYSA 3KAOA 5AHLA 1QCWA 2WJZA 1W3IA 3W1UA 1SSDA 4UFIA 2ABBA 2BZNA 5K9DA 5CG7A 1A5AA 3UXDA 5LKYA 3FEMA 3TU9A 2FFCA 1Y0EA 3F1QA 1FWWA 1LTDA 1FWNA 2Q8LA 3N34A 4GUJA 4HSOA 1P4CA 1KLYA 2GOUA 1FDZA 2FB3A 3T4CA 3L0GA 4IMEA 3GLCA 5ABTA 1ZHAA 1TREA 2Z2UA 3G24A 4JX4A 1UJPA 5K9CA 4JTSA 3W7DA 3L0KA 3KRZA 4JTUA 1L6SA 1UBSA 3LCFA 3QF0A 4JICA 4M6QA 4UTHA 2A4AA 4LT9A 3TQKA 2E68A 2NX3A 3VE9A 4DO4A 1I2OA 1XBVA 5F1VA 5FEXA 5CKSA 3W2LA 4XBKA 1JR1A 3N9SA 3A5FA 1ZCOA 4BI7A 2CZ5A 3Q94A 3TSMA 5D2VA 3W2KA 5G2HA 3QJAA 1JCNA 4WY0B 1WBJA 3GB6A 3PUOA 3TAOA 3N3MA 3LXBA 3QSTA 5D2WA 3S5NA 2CU0A 2A0NA 3TIMA 3QMSA 2G96A 3HGSA 4FNTA 3CT7A 4UFLA 1TPUA 2OT1A 2CFFA 5D37A 1ALDA 4MY8A 4KFNA 3LV6A 1EEPA 4FF7A 1UCWA 4LS2A 3CU2A 1M7OA 2X1TA 2G97A 2NV2A 3NM3A 3PB0A 3YPIA 3DXIA 5EBUA 4BR1A 3UPWA 4P61A 3DI0A 4OBTA 5LNSA 1SW7A 4B5NA 5EPDA 3B06A 5KZMA 5CGQA 3MI6A 1TPB1 4GUIA 1A5SA 4JTHA 4NNCA 1MEIA 1G7VA 2NUXA 3GNNA 4A2RA 2Q8ZA 2OT0A 3STEA 3VI2A 1MSSA 1KM3A 4XKYB 1FWTA 2QUVA 2C15A 5AOUA 4IUOA 3W7LA 3W7KA 2DJXA 5F4SA 1KFJA 3NPXA 3W1LA 3NYZA 2BX7A 2PCQA 3FJLA 4GE8A 5EL1A 1FX6A 2TPSA 4FEZA 2YCEA 4JYEA 1SPQA 2X1RA 1HL2A 1W5MA 3EX6A 1SUXA 4ORIA 1LYXA 2CLKA 3W2MA 1W37A 2E1DA 2YZRA 4JXCA 2FJKA 1FWRA 3FYPA 2H6RA 3LXAA 3UXAA 2OJPA 1KFEA 3GR8A 2WSRA 3C4UA 1TTIA 1KM6A 2HTMA 5I3IA 2H3BA 4JTTA 5U4NA 5LGZA 5FEZA 3CIWA 4YCPA 5AC6A 4A22A 2Y85A 3W2UA 4A3UA 4ZQMA 4WX2A 4U28A 3LBMA 3CEPA 3FJ6A 3TR2A 3IIPA 3MP5A 2FQIA 3M5XA 2NXGA 4WOZA 3PUDA 1H60A 2X16A 1NFBA 3GYEA 1OX4B 3HG4A 4OV4A 3R5EA 3VE7A 3NXFA 4EF9A 3IGXA 3DFNA 3GKFA 5LNRA 5H91A 1BEUA 1L9WA 5C54A 2B7PA 1ZAJA 4UFMA 5C6MA 1GG0A 1I2QA 4JTIA 1KLZA 5D32A 3FA5A 3ABRA 1R2SA 1N55A 3EXTA 3N73A 1I2NA 3W83A 1TPVA 4LUIA 4ZMGA 3P60A 1OJXA 2FPYA 1VYRA 2YGYA 4LVFA 1P1XA 4O4WA 3UWWA 1IGSA 2YSWA 4CNNA 2DZSA 1OG0A 3W7JA 1HG3A 4AHOA 2QEZA 4AWTA 5CPNA 1ICPA 1CX9A 2EPHA 2EF9A 3N19B 2CLEA 2ZRXA 1B3OA 4YXGA 3RLVA 4FX6M 1QPRA 3MO7A 1Z41A 4M7SA 2V8ZA 4Y6GA 3NQCA 1VS1A 1TRDA 1MEWA 2CW6A 3ANYA 3C2RA 1AG1O 3HIJA 2C1HA 1FQ0A 4HSNA 3KFTA 3LM7A 1XBXA 4K39A 4O13A 5F2MA 5D2XA 1ME9A 5EMUA 1KM2A 1YLVA 4MFEA 5E93A 2QJIA 4NJIA 3BW2A 1V5XA 1ICSA 5AYZA 2A6LA 3P5YA 2GJLA 2J24A 2ZZ3A 4JYDA 1SQ7A 1DVJA 1DQWA 1G4TA 2E77A 4AF0A 3IV3A 4JY9A 1GTEA 4GBUA 3C2OA 4FXRA 4UCGA 1GVRA 5K3VA 2QCLA 3M41A 2QR6A 1Z42A 2P10A 3PWAA 4RJEA 1XUZA 4UTLA 1OF6A 3HG5A 5K4XA 1YXYA 4PL1A 3QQ1A 3P8IA 2Q3OA 4JR5A 2G95A 3GDMA 3SW6A 1X7FA 5G2IA 3DFQA 3LRMA 1SO3A 5K7JA 3OG3A 3W07A 4O0KA 2V2DA 3C2FA 1EP1A 3Q58A 5FF3A 3LHVA 1YADA 1XKYA 3GXPA 1DQXA 3BW4A 1QPOA 4O52A 2ZZ2A 5FESA 2ZRUA 3P5ZA 2GVLA 3GIYA 1DL3A 3Q37A 2ATMA 5KZDA 2YW4A 1RQBA 2CZFA 2NLIA 3G0XA 5BOOA 1NF7A 5LNWA 3S1VA 1O5XA 3OIXA 2E6AA 4PFMA 1SO4A 1W54A 2NZLA 1CI1A 2FPVA 5AB3A 2ZFAA 2ZZ4A 1EX5A 4N9CA 2GUUA 2XN2A 4A21A 3RFAA 2QF7A 1TPH1 5MHBA 3O6CA 3LX9A 3ZS4A 1OFPA 3B05A 1OYAA 3GDKA 1F73A 3O6YX 5FI8A 3G22A 3UZ5A 4JIPA 3EXSA 2ZDRA 4MJZA 1XDMA 3VCRA 1QMLA 3BLIA 2RDWA 3M5YA 5AHMA 1L6WA 1KBIA 3FLUA 3NQMA 4UMBA 7TIMA 4N2YA 4U4MA 2YW3A 3EX3A 1G6CA 3EWBX 3PBWA 5G5IA 2WNNA 2ZBTA 1F6PA 1DJQA 4NNAA 1PCKA 4UUIA 2TRSA 3LERA 2ZTJA 1QFEA 2E6DA 3S42A 1A50A 1X6UA 5IBXC 3CB8A 3OA3A 2GPTA 5AHFA 3W7NA 3LHTA 3PG8A 5FEWA 3W1AA 2F84A 3CLMA 4UTWC 5CSRA 4ML9A 1XDLA 4O19A 4LU0A 3S9YA 5T26A 3MUXA 3C61A 1LOSA 4OU1A 1EP3A 1WDWA 4Q33A 3UPBA 2PC4A 4BI6A 3USBA 1VJIA 1TTQA 5EYWA 3T78A 1JULA 3E9AA 1VQTA 3TJLA 3C56A 3DI1A 3A23A 2QCDA 4NT0A 5DY2A 1SZNA 4S1FA 4QQ3A 4S2CA 1EP2A 1K02A 1G7UA 3GX9A 1DKWA 4MY9A 2NV1A 4XKYA 3W1XA 1LROA 4NZJA 2B7OA 1G4EA 1R46A 5D04C 4DBEA 4JTGA 3DH7A 4BK9A 3W7EA 1XUUA 5HMSA 5CZSA 3OVQA 1QPQA 5E0KA 3W1NA 1JUKA 2X1UA 1PIIA 3UZJA 1EIXA 1VCFA 3W7HA 4J9JA 3SR7A 1T96A 4NNBA 3G1VA 4IXXA 1UB3A 1ZFJA 3HG3A 4HNTA 4UXDA 3SI9A 5DXXA 3NQ6A 2B7NA 4O1BA 4RZ6A 3PSWA 2Y7EA 5KITA 1IXPA 4GXMA 1FCVA 1YXDA 3FFSA 4LRSA 3S5OA 1W31A 2V30A 2VELA 4GFSA 2VFDA 4LTSA 2H90A 4JY8A 4R7JA 1G69A 5I3HA 1F6KA 5HWNA 1JCJA 4MY1A 2RFGA 3W2JA 4XBSA 4AF0B 4I7UA 3CTLA 1SR9A 1RV8A 4LWWA 4UFKA 4GJ1A 3W75A 4R53A 1WXJA 1EPXA 1M6JA 3GK0A 2JK2A 2YFNA 3E02A 4JX6A 5HR7A 4UMAA 3LTYA 5LZLA 1G67A 2VC6A 3B0PA 4NJGA 5CZTA 4K8EA 4ONVA 3TQ0A 2QAPA 4RLIA 4O18A 1DHPA 5LSMA 1QWGA 4IJBA 3W1RA 2QCFA 4MZ1A 1LM1A 3SY5A 2A7RA 2ZZ1A 3LCWA 1OYCA 2H8ZA 4MOZA 4PODA 3LOTA 3VNDA 4N02A 3H54A 4M6PA 4I7VA 2A85A 1OK6A 2B4GA 4K6AA 2X1SA 2Z1BA 2EHHA 4PCFA 4TIMA 3WK1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Y9P A;  4EPD C;  3AS0 A;  1ISZ A;  1UR1 A;  2E5B A;  1B9B A;  2PP0 A;  1SW0 A;  1E1C B;  1JDC A;  3VNJ A;  4C6D A;  2ZA3 A;  3H2A A;  3VZY A;  3BPW A;  3UGV A;  4JTL A;  5C2G A;  3DU0 A;  4ML4 A;  5AVH A;  4DBU A;  1MZR A;  4QLK A;  1HJQ A;  2OQH A;  3ZLF A;  1Z44 A;  2Y8V A;  7CGT A;  1CXL A;  5EMM A;  1VB9 A;  3HQP A;  2PCE A;  2NVD A;  4EPE C;  1UUQ A;  3WX7 A;  1WKE A;  1XS2 A;  2GVJ A;  3LPO A;  1VFO A;  3LCL A;  4KQN A;  5AKQ A;  2RH9 A;  4IX0 A;  4I9A A;  1KRB C;  1LWI A;  2DU2 A;  4IPJ A;  3VD4 A;  1WAU A;  2C13 A;  1NEY A;  5CBB A;  1VFU A;  1PYF A;  1C93 A;  3RND A;  3APT A;  1GOX A;  1A49 A;  4CN6 A;  3SGZ A;  3RK8 A;  3NQ8 A;  1WKY A;  4O14 A;  4H9V A;  4PRT A;  3KTS A;  4RCX A;  5G1T A;  3WCZ A;  3H2E A;  2NQ9 A;  3LUT A;  2ZVR A;  3AYV A;  1GVO A;  1ZJB A;  2GGJ A;  3CAK A;  4PMY A;  3F4D A;  4IPP A;  1O1Z A;  3TJ4 A;  5I07 A;  1HO4 A;  1SM9 A;  4CGT A;  5A6B D;  3LN3 A;  3NEH A;  5BMW A;  4G56 A;  3VDB A;  3VKJ A;  1PAM A;  2V5L A;  5BU6 A;  5C9U A;  5FF7 A;  3P0X A;  2GUY A; 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