2IQTA

Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase, class i from porphyromonas gingivalis
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
NAMNKEQLQQMRQAPGFVGALDQSGGSTPKALKAYGIQPDAYQSEEEMFDLIHQMRTRMITSPAFATGKIIGVILFERTMRGKIEGMPTADFLWEKRHIVPFLKVDKGLQDEANGVQLMKPFPELGKLCEEAVGYHVFGTKMRSVIKQANEQGIRDIVEQQFQWGKEILSHGLVPILEPEVDIHCPEKAKAEEILKRELLAQLDKMTEPVMLKITIPTVDNFYKEIIEHPMMLRVVALSGGYSREQANELLSRNHGVIASFSRALVEGLSARQTDAEFNAMLEASIEDVYQASIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase class 1
publication title Crystal Structure of Fructose-Bisphosphate Aldolase, Class I from Porphyromonas gingivalis
rcsb
source organism Porphyromonas gingivalis
total genus 95
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2iqtA00
3UQNA 4IQLA 4NVTA 3OG3A 4JX5A 1FWTA 2Y88A 3M5YA 3IVTA 5I3FA 1NAL1 4R33A 3QF0A 2YGYA 3P80A 1I8JA 3PBYA 4NX5A 1SZFA 4WZHA 4O1CA 4ZQPA 1XI3A 1KTNA 1A5CA 5CSSA 4AAJA 1TTJA 3HG5A 1G4EA 2HS8A 2EF9A 3I7QA 4ZZ9A 5LNSA 4HNNA 3NYZA 3QFEA 5I3IA 1LRQA 4JTSA 1ICSA 3C2VA 1SO6A 4DEFA 3LI1A 3M41A 3GDTA 2A5HA 5CZ0A 2C15A 1ZHAA 3QQ0A 2W6RA 3CPRA 1HG3A 3S8HA 3HO8A 2VOMA 3S6DA 3W74A 2NLIA 4D2JA 3TC6A 3QEZA 3E96A 5F4SA 2YFOA 4GC4A 3KVJA 1GVOA 2O7SA 4AXKA 1DL3A 3LTPA 5HINA 2ABAA 2PURA 4O0KA 4EF9A 4JEQA 3PAJA 4N4PA 3E9AA 2CLLA 5E0KA 5DLCA 4TMBA 3LTSA 2W79A 3TAOA 2XN1A 5BW6A 3M6YA 4XTDA 1LTDA 3DENA 4AEOA 4NZJA 3TR2A 4XKYA 1Q6LA 3LDVA 2E1DA 1U5JA 2E5BA 5KZDA 2OJPA 4BI5A 2V81A 3UY8A 1LORA 4PTNA 3P8JA 2Y85A 3LOTA 2A21A 5EMUA 2UV8G 1SZNA 1I2QA 2QR6A 1XM3A 3V75A 1H51A 3A24A 2VFEA 1H7RA 4MOZA 3T40A 3F4WA 1F6KA 4R34A 3B0UX 3EKLA 4WXYA 2Y61A 1L6YA 3B0PA 1WOAA 1W3NA 5EPDA 4K36A 3VI2A 3OBKA 4Y9AA 3ZFHA 4WXZA 3O06A 3LHVA 4NNAA 4BR1A 4O11A 2QCDB 4DXVA 1PS9A 1VHNA 5DXXA 5U7SA 4IMGA 3GLCA 1F74A 3LCLA 3DHDA 4N02A 4BK9A 3DXIA 4GE8A 1FUYA 3NAVA 4JY9A 3TK7A 2HMCA 3NPUA 5CPNA 3CT7A 1I2RA 1LYXA 4DO5A 3W84A 4O1BA 2H3DA 1AMKA 3CLMA 3H53A 3RMJA 2I9EA 4FX6M 1W5MA 4ZMGA 4C1LA 3LB0A 1H60A 1NF0A 1SSGA 1B9BA 1LOSA 1ZALA 3FOKA 4MZ1A 4S2CA 3USBA 1R46A 2ZA2A 4JTLA 4RXFA 5D2XA 4WUIA 3NVTA 2A2IA 4Z1BA 2Y7DA 1RV8A 4NXSA 1TPB1 3O6DA 5G2WA 5J5RA 3W1XA 5D32A 1DQWA 4JTFA 3W7NA 3LCIA 1C8VA 1W5NA 3C56A 1H50A 3W7LA 3T4CA 1OVDA 2ZZ6A 1H7WA 2J9YA 2CWNA 4IOTA 3SI9A 2OT0A 4LW7A 5AYZA 1R30A 3VNDA 4CQ8A 3W9ZA 1S5TA 2QJGA 1QPRA 3LBCA 1R2SA 2Z6JA 3BGJA 4RX0A 3E0IA 4M7TA 1TV5A 2C0AA 1XUUA 4M6QA 1H7NA 1GT8A 3A22A 3W7CA 5A5WA 4UFJA 5FEZA 3I68A 1FDJA 3IGUA 4BF9A 3PB2A 1G7UA 5CKSA 5DELA 4JYEA 4IMFA 1X1OA 3UZ5A 3HPSA 2V5BA 3GXNA 3QRHA 4Y96A 1W3IA 1G7VA 1P0NA 4LC8A 4O13A 4E0CA 3MHUA 3QZEA 3LXCA 3LCFA 2ZZ3A 4Q32A 3TJLA 4LWWA 4NT0A 4CQAA 3NA8A 1JCJA 1UBSA 4UR8A 2Q8ZA 2NWRA 3DFPA 3NOEA 2B7PA 4K8EA 3T7VA 4YL2A 1G69A 1TRDA 2YR1A 3TH6A 2XN2A 1K8ZA 4IJBA 3TQ0A 1PL9A 1RZMA 1JUKA 1MSSA 1VLWA 3M16A 2B7OA 5LNVA 1ZAHA 2ATMA 2FIQA 2X1RA 4CCCA 1VCFA 3TDFA 3IIZA 3I6RA 3NM1A 2PRLA 2WSQA 3L0KA 3W7HA 3B0VC 4UFIA 4CCDA 4LNYA 5F2GA 4AF0A 2J9ZA 3R89A 3G22A 3EX1A 1TPVA 2DJLA 1GVQA 3HB9A 1PE1A 2Y62A 3L2IA 4GFSA 3M1ZA 1SQ7A 1OF8A 3IIOA 4UIOA 3TA6A 3BG3A 2V5LA 5DBUA 1TPEA 2PC4A 4UTUA 4QJ1A 1CI1A 1JRBA 4AVFA 5K4ZA 4W9TA 1DV7A 3N34A 5TIMA 4TO8A 5G4WA 3L5MA 2YW3A 1OFDA 2OX1A 5DBTA 2ZTJA 1ML1A 4LS2A 4FO4A 3KVLA 2A0NA 3NQ8A 4UUIA 2CZEA 2NX9A 4MYAA 1H62A 3WK2A 4Z1CA 5G1TA 2CLFA 1B3OA 3QYQA 4RXGA 2GUUA 2R91A 3W1UA 3L65A 4FF7A 4PL1A 4UTTC 3DH7A 1F7BA 1QDSA 3M0ZA 4IPIA 1G4TA 2DORA 3HJZA 2J88A 3S42A 5LHFA 1VCGA 1YLVA 3A5VA 4HHPA 3VE9A 3HOJA 2QCEA 1VQTA 4LVBA 1H7PA 2QCFA 3HQ1A 4JS3A 1NFBA 2NZLA 3C52A 2TYSA 3G0XA 5MHBA 3W1LA 3QPYA 1GYNA 3JR2A 4Y6GA 1JCLA 3EKZA 3FKRA 3GKFA 4GNJA 1TJPA 4IPJA 3THAA 4UTWA 1AG1O 4WOQA 3HGSA 2FPVA 4GRSA 3HPXA 1XDMA 1KTBA 1OJXA 2RHGA 1ONRA 1Z42A 1ZY9A 4JNMA 3CU2A 3STEA 2YZRA 2GOUA 3W7GA 3MMTA 1UJPA 3C2EA 3NQEA 3IIPA 4M5PA 3O07A 1OABA 4NX0A 1DJQA 3SGUA 5BRBA 2E68A 3LHUA 3UWVA 4RJEA 2J27A 3NPVA 4FNRA 2FDSA 3G18A 1FWNA 1TB3A 2ZRVA 3P67A 2NX3A 3N2MA 3TROA 3L0NA 3I7RA 2FJKA 3W2LA 1XKYA 4G1KA 5BMXA 2VENA 3HIJA 3M5VA 4UFHA 4BWLC 3T55A 1RR2A 2EGZA 4GUFA 3HG2A 4A3UA 3P81A 5D09A 3BVJA 2DJXA 3KAOA 3NGJA 3U2OA 5CPLA 4MUZA 3W71A 2YFNA 5LNUA 1TPUA 3S5YA 1I4NA 1TPDA 1K8XA 2NV2A 4LRSA 4X22A 1OFRA 3R2GA 4MKNA 2WO5A 4MIMA 1W0MA 4I7UA 5AHNA 3W1NA 5DCDA 4KFOA 3LRKA 4IMDA 4AWUA 1KM5A 3DZ1A 1RPXA 1RD5A 5D02A 1OX4A 1AL7A 3WK3A 2QDHA 4DBDA 3TFCA 3Q58A 1WX0A 1UCWA 3GXTA 5EL1A 1SFJA 4AHPA 4NU7A 1SO3A 1VS1A 2LLEA 2TRSA 1W3TA 3PBUA 4PEKA 3W2NA 4H3DA 3R12A 2EHHA 1GVSA 4J9JA 2YSWA 3WFAA 3W2KA 2ISSA 4IX0A 4ZL1A 5K4XA 1OK4A 1VHCA 2X2GA 4JICA 3G1VA 1KBJA 3MYOA 5DY2A 3NPWA 3NL2A 1JQVA 1UB3A 3EWWA 3NL6A 1FBAA 5FEPA 2EPHA 1LCOA 2GVJA 1G4SA 2Y7GA 1OFPA 3W7IA 1QAPA 4KWWA 2ZCGA 1YTEA 5FF2A 4E38A 1V7YA 4LV4A 3S1WA 2CW6A 3TXZA 1K7EA 4UMBA 3RK8A 1W5PA 2F7FA 1CX9A 3VKJA 4EIVA 3UNDA 1LOLA 3NQGA 3P5ZA 2E6AA 4CCEA 1O5KA 2JK2A 5DY3A 4Z0JA 3PUDA 3RNDA 1YXYA 5U4NA 4GJ1A 3WJZA 4UTJA 3W23A 3KX6A 4WOZA 1TREA 2B4GA 5CSRA 3NM3A 5KSWA 4YMZA 2WJZA 3FYOA 4Z0SA 2RDWA 3W3OA 5EKYA 1IXNA 3DFQA 3MP5A 2QCCA 3MUXA 2O7QA 5BOOA 2ZA1A 3LLFA 1IXQA 4LVGA 1TSIA 1H1ZA 1PV8A 1S5WA 4I9AA 5D2TA 4O16A 1VC4A 1ZNNA 3G1FA 3LXBA 1TV8A 3KRSA 4JXCA 1H63A 2NV1A 3MWAA 5LGXA 2E6FA 4P61A 1VGAA 3W7MA 3QM3A 3EWZA 3TAKA 4FNTA 3JS3A 3QJAA 4Y8FA 2R8WA 3A9IA 1T99A 5CPMA 1I2NA 1SPQA 1YPFA 3Q94A 1X1ZA 1JCNA 4BI7A 4S1FA 3W1TA 1FWSA 2ZRYA 3HPZA 3TQKA 3TSBA 3EX3A 4OWGA 4XBKA 2KZHA 3MI3A 4Y90A 1AL8A 4PA8A 1VLIA 4JTTA 1YDVA 3JRKA 1EP3A 4AWSA 4IWWA 2E5CA 1FCUA 1KFJA 5D2WA 3C6CA 1A53A 4XUGA 1YTDA 4ADUA 1CW2A 1QPNA 1TTIA 4MFEA 1VH7A 2HS6A 3BLFA 3UPBA 1W37A 4NJGA 3FIGA 4Q33A 4JTEA 1NEYA 1BWKA 4MY9A 3EWUA 1WQ5A 5CGQA 3GDRA 2ZTKA 1OHLA 3KRUA 3UWZA 5SWUA 4FXRA 1GTEA 2AAMA 3FLUA 4DF2A 4FNQA 1B57A 3ANYA 4QAIA 1XBYA 1KW1A 1OFAA 2GQ8A 2W0UA 5KITA 3MHFA 1QMLA 3STCA 3QMRA 3TE9A 3TIMA 4A2RA 3L67A 5HUPA 3LI0A 3PY2A 5C2XA 3KVMA 2Y63A 1P0KA 3LTYA 2VFIA 1F73A 4L4MA 3GZ3A 2WOQA 1AW5A 4OHQA 4U4MA 3MBDA 5IBXC 2R94A 1IGSA 1QOPA 2H8XA 2YW4A 1ZENA 3FFSA 4GUHA 1PCWA 3N19B 3FEMA 1XBVA 2P1FA 1TV7A 4UR7A 1TMHA 3PVFA 1TCDA 4EWND 1U83A 1S5VA 3UWYA 2ZRZA 4ICNA 2YYTA 2HSAA 4UMCA 5AFDA 2R14A 4EF8A 3W72A 3FKKA 1KA9F 2CLKA 2GJNA 4LS1A 2NXIA 4NNBA 1PHWA 1LRTA 1QO5A 3LERA 3S0CA 2J9XA 1V5XA 4IMEA 1MEWA 1D3HA 3S1VA 3GR7A 3RU6A 1EUNA 4HSNA 5AYXA 4Z1AA 3O8AA 1JUBA 5G4EA 3PB0A 2ZQ0A 3W75A 5BNKA 1KFKA 3GNDA 1OX5A 5J5DA 1I2OA 1IF2A 3LHYA 5CPOA 2XFWA 2C1HA 2V8ZA 3GKAA 4PODA 4GXMA 1DORA 5HJLA 3PM6A 2B7QA 4TX9A 3GAYA 3NDOA 2GQ9A 1R2TA 2ATSA 1EP2A 4NJHA 1AW2A 3BARA 1AW1A 3G0UA 5HWMA 4I7WA 4JIQA 2VFHA 5HULA 4U28A 4GBUA 1W54A 3ZWSA 1C9DA 5TQLA 1K03A 1TQJA 1P5BA 3G8RA 2VC6A 4M7SA 4FNPA 3WJWA 1TQXA 3GAKA 4R7JA 1VYRA 1XFBA 3STGA 5CZTA 5LSMA 2E6DA 1BEUA 3NZ1A 1Z41A 3LCWA 4HN4A 3HGOA 1ZCOA 4M6VA 3SECA 4AB4A 3TUUA 2G95A 5LGZA 2H6RA 4S2BA 1SFLA 4AH7A 4MY8A 2H3BA 2BLEA 3C4UA 1UUOA 1JQXA 4AMAA 1W31A 2QEZA 3QSTA 4O18A 1XL9A 4O4WA 1PIIA 3BG5A 2C14A 3U8GA 3W83A 4JIPA 3SZ8A 2WNZA 3EX4A 3B4UA 3MI6A 4DPPA 1JRCA 1LM1A 1GZGA 2CFFA 3PUOA 5F1VA 1WAUA 5LNRA 1L2UA 3Q2DA 4FX7A 4LS0A 1YDNA 3ABSA 4JY8A 2F84A 2WKJA 4XWUA 4X2RA 1K3UA 4WY0B 3NL5A 4PFMA 1G67A 2Z1BA 2OZ0A 4N6EA 1DJNA 3GIYA 3W7RA 4ORIA 4TMCA 2ZRXA 4DQWA 3MHGA 4RR4A 5DCEA 5HQEA 5AC6A 1PVNA 3DKJA 2PRMA 3LCXA 1X8FA 4PL2A 4RLIA 4IUOA 1SUXA 3EX2A 1HO4A 5AOUA 2RFGA 3P60A 3A23A 3NQVA 3TCEA 3QC3A 1B4KA 3MBFA 3UY7A 3IVSA 1DBTA 4UNKA 3B05A 3AJXA 1J4EA 3TXVA 4LT9A 1N55A 4WD0A 4B5NA 4O50A 1OFQA 4O57A 3WJYA 3E02A 3PSWA 1WXJA 1X6UA 3T78A 3ABRA 2Y7EA 2ALDA 3QMSA 5C55A 3BO9A 2DU2A 2P10A 5KZEA 2B0MA 4LVDA 3M5XA 4UTLA 3KOFA 4P2VA 3W87A 3EX6A 1GQNA 2V82A 4NZFA 1OF6A 2Q3OA 1YPIA 4UC5A 1O4UA 2JKPA 1QOQA 4FXSA 1EWDA 5L9FA 1GEQA 3R13A 4YWIA 5G2IA 4JTHA 3DU0A 5DXYA 3FA5A 3BW2A 2RKXA 5D33A 4FHAA 3EWXA 4O17A 3DGRA 5K3VA 1J2WA 4BI6A 3WJXA 4LVFA 3SW6A 2CLEA 3LX9A 3DHFA 4N2YA 5C6MA 2V0TA 2QDGA 4TR9A 3OA3A 3INPA 4KFNA 5K9CA 1FDYA 3PULA 2A4AA 3TMQA 4NXKA 1SZEA 1GTHA 2X16A 4FB7A 2X1SA 1KM4A 4O19A 5E93A 2DP3A 2CLMA 2ISVA 5AHIA 1Q6RA 3O16A 4K38A 2NXGA 3R5EA 4ZQOA 3P84A 4OGZA 4O10A 2OCZA 3EEGA 4JX4A 1WDWA 5H2ZA 1ICPA 3GVGA 5CZSA 5EYWA 3DAQA 2QF7A 1YXCA 1K7FA 2Q3RA 3W2UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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