2ISVA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
321
structure length
298
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGARLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization, kinetics, and crystal structures of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from the human parasite, Giardia lamblia.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Giardia intestinalis
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
total genus 110
structure length 298
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2isvA00
3LCXA 1D3HA 1KM2A 4UR8A 3G1DA 2B0MA 4MY8A 3UXDA 4DPQA 2R91A 4JN6A 3CEPA 3C52A 3W2UA 3TC6A 3N14A 3GDLA 3O63A 4TMBA 3KRSA 3VKJA 2Y7DA 4IPIA 1VC4A 4X9SA 4CNPA 2DZXA 1QPNA 4ZMGA 3ABQA 2ZDRA 1GEQA 3LGEA 4Q33A 3NQEA 2V8ZA 4IXHA 4A2RA 3M5ZA 4C1LA 5LNRA 3UWWA 2B7QA 1V5XA 2A7RA 2OJPA 3BW4A 4MUZA 3N19B 4QSHA 5LNUA 4NX5A 5CPLA 4P61A 1YXYA 3DH7A 2WOQA 3ZR4A 5DY3A 1Z48A 3BGGA 1KTCA 5DBTA 5AC8A 4UXDA 3NYZA 3FKKA 2VEMA 5AB3A 1A5BA 3Q58A 4WY0F 3USBA 1OX5A 2QUUA 1TIMA 4MYAA 2YFOA 4HSNA 4R33A 2Y61A 3BARA 3P8IA 5BRBA 3EXRA 1KFKA 2NUXA 3LHUA 1O95A 1QPOA 4YXGA 2CZFA 4RKAA 4MOZA 5HR6A 1Y0EA 2QCFA 3NDOA 1W56A 2WV8A 3EKZA 4LY8A 4GC4A 4AHPA 2WSQA 4UTWA 3U2OA 1L9WA 4IUOA 4AWSA 4ZQNA 2QCDB 3UXAA 1M7OA 4XQ6A 3IIVA 1YDNA 1FDYA 4HT3A 3W7GA 1VYPX 5HWMA 3W22A 4LVDA 3LV6A 1JUKA 1TQJA 2HS8A 3NQVA 2YXGA 3EWWA 1S5WA 4OWGA 3LM7A 3G1VA 1I8JA 4JIQA 3TAKA 2C1HA 1CI1A 4LU0A 1J4EA 3MBFA 3LDVA 1OX4A 3TJLA 5LGZA 1KTNA 4MZ8A 1X1ZA 2ZZ6A 1K3UA 1H50A 3IVUA 3VCRA 3G8RA 3NL2A 3TX9A 1KFCA 3EWBX 3S5NA 3W7IA 5H2ZA 4FNSA 3G0XA 3FLUA 4UCGA 1TQXA 3MI6A 1OYBA 1KTBA 2BTMA 2BZNA 3BPWA 1C9DA 1OFEA 4EWND 1ZAHA 2QCMA 1YPFA 1IXQA 2H3BA 4QM1A 4DF1A 1DORA 4M19A 3CB8A 3GYEA 2Z0IA 3Q37A 3VFLA 5DELA 4M5PA 3SFKA 3W87A 3M16A 2NWRA 1SQ7A 1W3TA 2TRSA 4PA8A 3WJSA 1OX4B 2P1FA 3P60A 2GQ8A 3G18A 2VFFA 1LTDA 3SGUA 4ZZ9A 2B7PA 3DFPA 3PG9A 4UMCA 1WDWA 3M5VA 1JQVA 3NPUA 1PIIA 2QUVA 1OFRA 1KM6A 3ATZA 3EKLA 3GVGA 4UFIA 1G4EA 3UZJA 1JCJA 4DO5A 1AL7A 2NX9A 3FYOA 3R12A 1H62A 4Y6GA 2YZRA 3L65A 5U7SA 5DCDA 3QF0A 2Y89A 3W7CA 3F1QA 4ZQRA 1DJQA 3N73A 2NWSA 4OE7A 4O0KA 1SFJA 3NL6A 3SECA 3W7EA 2XN0A 3O06A 2YW3A 3LCIA 5D03A 1ZCOA 3TC7A 2HTMA 2KZHA 4RXFA 4YLWA 2DZTA 1EUAA 3WK3A 2FQIA 2C16A 2Z6JA 4O13A 1A5CA 4UUIA 1LRTA 1KFJA 2WNZA 4HN4A 4A22A 2XN1A 2YFNA 3IEBA 3QPYA 3TAOA 1K7FA 1V7YA 3L21A 3LBMA 2E5DA 3P82A 3LCHA 2BXVA 3PG8A 3W7RA 3AO0A 1KBIA 1EP3A 3MHUA 5G1YA 3T40A 1RZMA 4WD0A 4E2DA 1XCFA 3C2OA 1G67A 3R89A 3W75A 1TV7A 5D2TA 4JYEA 2FJKA 3P81A 3BGJA 2I9EA 5C2XA 2RHGA 3NO5A 2OCZA 2CZ5A 1Q6LA 2X1RA 4S2BA 1LZOA 3I7SA 3N2XA 2EGZA 1MSSA 3TU9A 1GG0A 1YDOA 3GDTA 3T55A 4LUIA 3DFOA 3L5MA 1JULA 3L5LA 2FIQA 4DO6A 3HGRA 1EP1A 4JTIA 1AW5A 4JTUA 4MIMA 1W31A 4O53A 1TPEA 4RXGA 3MMTA 4C1KA 3BLIA 1FY6A 1HL2A 4BF9A 2AQWA 3OVQA 1OK6A 3TUUA 4ORMA 4O16A 5L6UA 3UY7A 2A4AA 1J5TA 4IMDA 3L0GA 2Q8LA 3ZS4A 2ZRUA 4CQAA 1Z44A 4NJJA 3QYQA 1DJNA 4QITA 1Q3NA 5EMUA 1R2RA 4AWUA 5G2IA 3L0KA 3P61A 1N55A 3GKFA 1FDJA 1CW2A 3VI2A 3ELFA 2Y6ZA 4N4PA 1LCOA 1HUVA 4KFPA 4TR9A 4BI5A 2A7NA 3DZ1A 3WJWA 4B5NA 2VFIA 2CFFA 3C3NA 4I9AA 1PS9A 1TV5A 1UASA 4I7VA 1LORA 1QWGA 3W86A 3UD6A 3KVJA 3BK0A 1I2NA 3JR2A 4GXMA 4AWTA 1ZALA 2ZZ1A 1W5OA 3S1UA 1B9BA 4IGHA 1LROA 4KWWA 2CU0A 3B8DA 5DY2A 1F74A 1Q6QA 1ME9A 4JY8A 5HWJA 4O15A 1SO5A 4OU1A 3W1MA 5AC7A 3N9SA 4EF8A 4HKPA 2WNQA 3A21A 1EEPA 3M44A 1SU5A 2WO5A 3DGRA 4PTNA 3EWUA 4O18A 3CT7A 3DFNA 4QNEA 2W6RA 4WUIA 3KXQA 4JYFA 4O4WA 4QISA 3C61A 4GUFA 1DV7A 3S5OA 3QZEA 2ZRVA 4JTGA 1KA9F 1TTPA 2ZRYA 3EX2A 4ORIA 4ADSA 2PRLA 2OZ0A 1UCWA 4IMGA 2PCQA 3V1PA 1ME8A 1FCVA 2ZTJA 4POCA 1HG3A 1H1ZA 1G7VA 2BSLA 4FHAA 5FEWA 3MO7A 4IMCA 1W5MA 2B7NA 3BVJA 4K7YA 1BWKA 1KM4A 3QEZA 1QO5A 3CU2A 3B06A 1F73A 5D2VA 3P62A 5G4EA 5EY5A 2YYTA 4JTHA 3W3OA 3DFQA 1RQBA 1ICQA 5D2XA 3NQDA 4RJEA 3PB2A 2QAFA 5BW6A 2C18A 1SSDA 5FI8A 5AHEA 4MY9A 2A21A 4PH6A 2F84A 5CKSA 3TSDA 3QMSA 3KVMA 4GBUA 2DZSA 4UTWC 3TSMA 3L9CA 1O94A 5HMSA 2G97A 2ALDA 1LLWA 4J9JA 4Q4KA 2YPIA 3MHGA 2RFGA 4FX6M 1X6UA 4PCFA 3NM3A 2E5CA 1VZWA 5I3GA 2BLEA 3P84A 4Y96A 1VR6A 4PC8A 1SW0A 4LC6A 4CCEA 4Q32A 3INPA 3O15A 4UTHA 3I65A 1P5BA 4O8RA 1IXOA 5E1QA 1MEWA 3PWAA 2CLEA 4JX6A 3W2MA 4S1FA 3MYOA 3QM3A 5AHMA 2E77A 4XTIA 3QFEA 3C2EA 1TPB1 1F6PA 1K8ZA 2V5LA 2E09A 2DJLA 3EWYA 1KW1A 1FUYA 1AG1O 1PL9A 3SY5A 3QH2A 1OJXA 3S5YA 5G4WA 1VPXA 3EWZA 3TW7A 4HPXA 2FDSA 2YDAA 4MFEA 4XBSA 2VEIA 3N3MA 4Z1CA 3A5FA 3BV4A 1D3GA 3R2GA 1ZHAA 3EX3A 3C4UA 1ZAJA 1J2WA 4YWIA 1NF0A 5F4WA 1LM1A 3MUXA 1SFLA 5KITA 4NNBA 4O50A 1DHPA 2Q3OA 3HG5A 4G1KA 5DBUA 3BW3A 2GPTA 4M6QA 3B04A 5CZJA 4A2SA 2C6QA 1LP6A 1JRBA 1R46A 1WA3A 3H54A 1I4NA 2B4GA 3GIYA 4LV9A 4LC8A 1KFBA 1NAL1 2A0NA 1QAPA 2CLFA 2TPSA 2WSYA 2JKAA 5IBXC 3STEA 4K6AA 1IIHA 4IWWA 2ATSA 5EL1A 2CLOA 1GVRA 1NVMA 4GUHA 5D02A 2B7OA 3W7QA 3O6YX 5HINA 5AHIA 3GX9A 4HPJA 3W83A 4BI7A 3IGUA 3RMJA 3F03K 2QCCA 1H7WA 4JTFA 1LOLA 3W1AA 3GAKA 4UNKA 3B4UA 4CQ9A 1XBZA 3MI2A 1W37A 4HNVA 1SO3A 4AVFA 3SSJA 3CIXA 5EKYA 4E2BA 2C14A 3PB0A 4N9BA 1LBLA 3DI1A 3L66A 4WOQA 5LKYA 4NUWA 5LHFA 1GZGA 3LERA 4I7WA 4CNOA 1YTEA 1ICSA 1FBAA 4LVGA 1C8VA 3OVRA 2CZEA 4TMCA 3L68A 4LRSA 3ZFHA 4PL1A 3M1ZA 1TJPA 3R13A 4LTSA 3UWVA 5CZSA 1XBVA 5G2WA 3LCWA 2E68A 1EUNA 3OBKA 3R8RA 2A1YA 4NXSA 3GXTA 1HFBA 1NF7A 2YSWA 1GTEA 2DORA 1TPVA 1KM3A 3KX6A 3MP4A 3HF3A 1DVJA 3MWAA 1TPUA 1F7BA 1TMHA 4JYDA 4GJ1A 4LUJA 2ZTKA 1PV8A 3LI0A 4DXVA 1OFBA 3PUDA 3P5YA 4MLJA 1LRQA 3W1NA 2V2HA 4LRTA 3EXSA 3W2KA 5K4ZA 3DHFA 3HG3A 2LLEA 4UTIA 3WJYA 1A53A 1OFQA 3HG4A 4X22A 2VFDA 3NA8A 3WK1A 2VKZG 3P5ZA 1MO0A 3GKAA 1G4SA 5KSWA 1XC4A 3I68A 1ALDA 3PBYA 4M6PA 3NL3A 4NNCA 1XDLA 3M43A 4Z0SA 3B0UX 1F6KA 1TPFA 2C13A 5D37A 4E38A 4HNNA 1LRNA 3QPZA 3UPBA 1A5AA 4R7JA 5AFDA 1DQWA 3W1UA 4OGZA 4A29A 4JEQA 5AYXA 2A5HA 3OEXA 4TX9A 4WJEA 3NQCA 4UTUA 4UTTC 1LYXA 4QQ3A 4JIPA 3C6CA 2J9ZA 1S5VA 1G4TA 5CZ0A 3G1YA 2R8WA 4ADUA 4EIVA 4YCPA 4FIRA 3DAQA 4RX0A 3KHJA 1M6JA 2I1OA 1DBTA 5HUPA 4JR5A 5D33A 4QJ1A 2QCHA 4N6FA 5DCBA 1GVQA 3D0CA 4UR7A 1GVOA 3GLCA 1TO3A 2RDWA 2Y70A 2ZA1A 4NXKA 3K30A 4N4QA 3W7HA 2IQTA 4IOTA 3NAVA 5HUOA 1C29A 3HO8A 2HMCA 3C2VA 2A6LA 2PC4A 2TYSA 1AW2A 1T99A 3PSVA 2O7SA 1G4PA 1OVDA 2CLLA 3SGZA 3LRLA 1VGAA 4XTDA 3TQKA 5DCEA 1SZFA 2NV2A 1BKSA 2VFGA 1QCWA 4RCXA 1SO6A 3W73A 2JGYA 1W5PA 3UPWA 5KZDA 3NQMA 2Y88A 1EA0A 1L6WA 3F4NA 1ICPA 2RDTA 4Z1DA 3T78A 2OT1A 5G2HA 3KFTA 4MZYA 3EX1A 4MVAA 1KFLA 2YYUA 1EIXA 3G22A 3DI0A 5FF0A 3TQVA 1FWTA 1RV8A 1WYIA 1FQ0A 2NXHA 3DFSA 4KKXA 5T26A 1WAUA 4RZ6A 3PULA 1BTMA 3FEMA 4ZQMA 1SZEA 3E96A 2V30A 3P8JA 4N2YA 1I45A 5TBOA 3TFCA 3LCGA 1SPQA 2HS6A 3LRMA 3LTPA 5D32A 5K7JA 3S1WA 1EPXA 4K38A 4ICNA 1FX6A 3TNOA 1G69A 2QCLA 3V75A 1PVNA 3T44A 3UWUA 3WFAA 4DQWA 5I3IA 4FB7A 4UFMA 1ZNNA 3QMRA 2C3ZA 3O1NA 1ME7A 5J5RA 1H63A 1QDSA 4WY0A 2CWNA 4UFHA 3O6DA 3ABOA 2Q3RA 3LXCA 1PHWA 2JGQA 2VOMA 2QCNA 2YW4A 2ZRWA 3R5EA 3HPXA 4NT0A 4O11A 3QQ0A 3W7KA 3MHFA 5F2LA 2DZVA 5K3VA 1X1OA 3NZRA 3PBVA 3VNDA 2OX1A 4QIUA 2EKCA 5CPNA 5D2WA 2GJNA 5AOUA 3S42A 5DXYA 3LTSA 5DXXA 5LNSA 3U6WA 4MJZA 2O7QA 3NGJA 4WY0B 4TO8A 6TIMA 1F76A 2JK2A 3W2JA 1MZHA 1QFEA 1KM1A 1H1YA 1OHLA 2FPTA 2VC6A 5I3JA 5CSSA 4NJIA 4O19A 2P10A 5BOOA 2QDHA 3HIJA 4U28A 5CSRA 3C56A 1GVFA 1OYCA 3N9RA 2CW6A 3CTLA 4LS0A 4ZQOA 3UY8A 3LOTA 4HIBA 4CQ8A 1K02A 1EWDA 3E0IA 1Q45A 5EYWA 1OFDA 3SZ8A 1GWJA 4O14A 1X7FA 5LNVA 1L6YA 3I7RA 1RR2A 2V81A 1LOSA 5C5YA 3O05A 3THQA 3OVPA 2GVGA 4FNTA 4GE8A 5H91A 1I2RA 1TTIA 5MHBA 2VFEA 4LW7A 4UNLA 3HB9A 2WPBA 3S8HA 4QNWA 4JDYA 1B3OA 3KAOA 2QKFA 3PSWA 2PRMA 4LWWA 4R53A 1SW3A 1VLIA 2V2DA 1MXSA 3WK2A 4LT9A 2ZCGA 5TQLA 1JCNA 5FF7A 1ZFJA 4RK8A 1GG1A 1GJPA 4DO4A 1U5JA 1OABA 3W7NA 1TRIA 4ML9A 1TTJA 3NQGA 5EBUA 3HMJG 1YLVA 3JRKA 1X8FA 4O1CA 3L67A 2A7PA 2G95A 4K36A 3G1HA 2R14A 3M9YA 3LI1A 3W1QA 3W85A 1W8SA 2VEPA 3HG2A 4FNPA 1P0NA 3M0ZA 4OHQA 3L0NA 3FA5A 3MBDA 3GDMA 3FIGA 3VE7A 3W7MA 2Y63A 5K9DA 1EB3A 1T96A 1FCBA 3TH6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1Q8A A;  5M1T A;  3EPN A;  4UQB A;  2WHL A;  4HMC A;  1B90 A;  3ITX A;  3GDL A;  4H2H A;  3VKJ A;  1IGW A;  1P48 A;  2WMK A;  4HCD A;  4RL3 A;  1XHG A;  2G3I A;  3MZ2 A;  4FXJ A;  2V8Z A;  1JNE A;  4S3F A;  2OJP A;  3BW4 A;  4KWS A;  4QSH A;  5CPL A;  3CXO A;  5IFP A;  3DH7 A;  3E2Q A;  2QHA A;  5IRP A;  1PYM A;  3DBN A;  5JBD A;  2PWE A;  4PZV A;  3P0X A;  3QOK A;  5DBT A;  5AC8 A;  1EC8 A;  1I1X A;  3OHM B;  1NJJ A;  4A05 A;  5AB3 A;  1A5B A;  4FOK A;  3USB A;  3HJE A;  4EAN A;  3WF1 A;  4D6E A;  2QUU A;  1Q5M A;  1XLF A;  4MYA A;  1SFT A;  1W9P A;  4LYK A;  4R33 A;  1EQC A;  4IL0 A;  5FAJ A;  4PYS A;  5JUV A;  3L4Y A;  1ZSX A;  2BOF X;  3SUW A;  1MUW A;  3B3D A;  4KCU A;  5BXT A;  2OLA A;  3BLK A;  4GC4 A;  4YN5 A;  2WSQ A;  3U2O A;  3ARP A;  4OZO A;  4ZQN A;  1E6Q M;  3RR1 A;  3LPO A;  1I6N A;  5A8Q A;  4HT3 A;  4MHB A;  3W7G A;  1W9D M;  2E67 A;  5HWM A;  3FA3 A;  4LVD A;  3NQV A;  3TJ4 A;  1XP3 A;  5BCA A;  4GIA A;  1UD5 A;  4GCX A;  3LM7 A;  3G1V A;  4O8A A;  1XQK A;  4AG0 A;  3HV8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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