2ISVA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
321
structure length
298
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGARLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Characterization, kinetics, and crystal structures of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from the human parasite, Giardia lamblia.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 110
structure length 298
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2isvA00
4UR7A 1H7XA 4I9AA 4ZQRA 1I2QA 3ANYA 1TJRA 1WYIA 2JKPA 4DBDA 4HKPA 3TU9A 3WJSA 3A22A 1PCWA 5F4WA 2B0MA 3WK2A 3BARA 3GAKA 5LZLA 2CZEA 3HJZA 5C5YA 1OK6A 5HQEA 4RJEA 4HSOA 2WKJA 4UTWC 4CNPA 2A1YA 3THAA 4QSHA 1TQXA 2C16A 4DQWA 4M7SA 5LGXA 1K7EA 4LY8A 5J5DA 3MMTA 3BGJA 1H7PA 2VFDA 1H50A 5T26A 4HSNA 4JTLA 1FDZA 4Q32A 3IGXA 1W3NA 5H2ZA 2NX3A 1HO1A 2P1FA 1KTBA 3RNDA 2DORA 1MO0A 5AC8A 3KVMA 2VKZG 5D2XA 4O1CA 4AEOA 4UTUA 4IXHA 1KBJA 3R89A 1DORA 3I7RA 3RLUA 1MEHA 4MJZA 3L0NA 3B06A 4AMAA 2RKXA 3HF3A 4NXKA 2J24A 4KFOA 3PUDA 4IMFA 3OVQA 5G2HA 3P60A 5I3KA 4NZJA 1XBXA 2ZRVA 1QO5A 1QOQA 3CC1A 1FXQA 1TIMA 2YW3A 2VFEA 5IBXA 2NXIA 1UB3A 1FWNA 2YW4A 5HR6A 1PVNA 4GE8A 5J5RA 3W1TA 4E2DA 5AYXA 3EXTA 3GX9A 4JTFA 3TFXA 2ZTKA 1TPH1 3S1WA 1OABA 3NL6A 3HG3A 5ABTA 3DKLA 4DEFA 3GKAA 3W9ZA 2Z6IA 5KZDA 3QQ1A 3NPWA 2DZWA 2WSYA 3GAYA 2JGYA 4NJJA 5MHBA 2A6NA 2C6QA 2VXNA 5F2MA 5CZSA 3G1AA 4FIRA 2AAMA 2OCZA 3S1VA 2I9EA 2XFWA 2JBMA 4IQLA 5FF2A 2QCMA 2VFIA 2YYUA 4UTWA 4JYFA 4IX2A 3E02A 3TW7A 3LRMA 3W7DA 2FPYA 2V81A 1RV8A 4MFEA 4QM1A 4U4MA 3LHWA 4DPQA 3M47A 4NZFA 4JTEA 2V5LA 4YLWA 5LNSA 1EUNA 2XN1A 4JX4A 3C2RA 3A9IA 2A85A 4NT0A 1RZMA 4NQ1A 4WX2A 4N02A 1EIXA 2RHGA 3JR2A 4GBUA 4EF8A 5FF0A 1K02A 1JCJA 1P1XA 2G5WA 5U7SA 4UCGA 3CHVA 3P61A 3PBUA 4N9BA 3QRHA 2NWRA 4H4IA 1Z48A 3M41A 2PRHA 1SSDA 3M1ZA 1OFEA 3OIXA 3F03K 1L6YA 5K9XA 3ZWSA 1EA0A 3MYOA 4ORIA 3MHUA 4AH7A 1WQ5A 5L6UA 5K3VA 1QOPA 1OVDA 3LOTA 3GNDA 1Q6OA 1L2UA 3FYOA 3PUOA 4LC6A 3L5LA 3W7HA 1H1ZA 3KXQA 3L9CA 5BMWA 1C29A 3P8IA 2C14A 1XKYA 2GQ9A 2Y7EA 5DY2A 4PC8A 1KM1A 2V9DA 3DHFA 1LBFA 2V30A 3HPSA 4GUJA 4RZ5A 5C2XA 3NG3A 1BKSA 4PEKA 2TSYA 3C8FA 4ADSA 3M5XA 5I3JA 7TIMA 4B5NA 4LU0A 1H7WA 3CWOX 3DU0A 4A2SA 1K8YA 2QR6A 2JGQA 4NNBA 5KZMA 1VYRA 4JTTA 2CLHA 4OGZA 2BTMA 4LVDA 4MZ1A 3SFKA 4DF1A 2LLEA 1JCMP 2P0OA 3OG3A 1QMLA 2Y85A 4UTHA 4X9SA 3P67A 4I7VA 1ZALA 1HG3A 3PVFA 3DXIA 1DOSA 2RDTA 1H51A 2PRMA 1SFJA 2F7FA 1SR9A 3W1XA 3ATZA 2ABBA 5K4ZA 1X1ZA 3TCEA 3U2OA 3CIWA 2JK2A 3UWVA 2GPTA 4W9TA 2OMAA 4TMBA 3A24A 2J9XA 1VQTA 1W5NA 1ZAJA 2HSAA 3ELFA 5DY3A 5TBOA 4C1KA 3NM1A 3W7EA 4X2RA 4XZ9A 3W84A 2FLIA 3N14A 3A21A 2WPBA 2A2IA 2HMCA 1ZHAA 2NX9A 3TMQA 3GIYA 4HPXA 1WOBA 3M16A 5H91A 3UQNA 4CCCA 3HGSA 5A8GA 2OJPA 4LW7A 1HUVA 1Z41A 2KZHA 1GOXA 3TE9A 3F4WA 3W1UA 3F1QA 3RMJA 1AW2A 4O53A 5KTLA 2YCEA 3EWXA 5DXXA 4MPQA 5FF3A 3THQA 2B7QA 3L67A 1JCLA 5KZEA 4FNUA 4XBKA 4ALDA 1K8XA 3CQ0A 3FIGA 1TPC1 3NQ7A 3R5EA 1O60A 4IUOA 1GTEA 3S8HA 1ZJIA 1OFQA 2QCFA 2E77A 5HWMA 2CLMA 3MBDA 4BI5A 4LS2A 1CI1A 1B3OA 4UTJA 5DELA 3PSVA 4AHPA 1Z42A 1OYAA 2ZYFA 3LRLA 1NF0A 4HNTA 2CW6A 1TSIA 3O06A 5G2IA 3W73A 3W87A 1G4EA 2DZUA 3W85A 3LTSA 3QQ0A 1A53A 2QCHA 2ABAA 3W7LA 5I3GA 3C2VA 3MP3A 2E5BA 3ZS4A 4A22A 4WQ6A 1OFDA 2CZFA 4NU7A 4O4VA 3B04A 3CWNA 1EEPA 3W7MA 3IIOA 2H8XA 3WK3A 3HIJA 3CTLA 3L66A 4RX0A 3KHJA 1J4EA 1W31A 1KV5A 4U28A 1JQVA 1VYSX 5HJLA 2Y62A 3TSDA 4FO4A 4P2VA 2FQIA 4EOUA 2A7RA 2C1HA 4QQ3A 1YXYA 1D9EA 1UCWA 3NQGA 1YXDA 1A5AA 2QCGA 3L5AA 2FB3A 2YGYA 3DZ1A 1L6SA 3UWUA 5K9DA 2C15A 2ZZ5A 1N7KA 1UUMA 3PG8A 4MZ8A 5AHMA 5CKSA 1KM2A 2QF7A 3L65A 5K4XA 1NSJA 4H3DA 1F6KA 2QCDA 2H8ZA 4JTUA 4O13A 2ZZ6A 3UXAA 2PE4A 2BLEA 1EP3A 2XN0A 3B8DA 3ZFHA 2DU2A 2ZRUA 5I3FA 1GVFA 4CCDA 1MZHA 3MI2A 1QDSA 1BWLA 2Z1BA 2YSWA 3CPRA 3N73A 4ZQCA 3NZRA 5EA9A 2X1TA 4K37A 3TJLA 1E51A 1V7YA 3C2OA 3FJ6A 1OX4B 4HIBA 3MO7A 2BWGA 3W7QA 2NV2A 3YPIA 3G0SA 1I2RA 4XTIA 3NPVA 3UWWA 1KM3A 3QSTA 4RLIA 3L5MA 4CQ8A 3EX3A 1FDYA 2CLIA 1UUOA 1SW7A 3SI9A 4JTKA 3DFTA 3PB0A 4UC5A 4YCOA 3HG4A 3MI3A 1OJXA 1W5QA 3VI2A 4LC8A 3MUXA 4FHAA 1IF2A 4Z0SA 1TTQA 2EGZA 1JQXA 1ML1A 1T96A 4K36A 3STEA 3QFEA 4MY1A 4G1KA 3UZ5A 5CSRA 3KX6A 2OT0A 3KRSA 4MUZA 1PL9A 3NQAA 3QYQA 4WZHA 2WJZA 4GC4A 3Q94A 4PFMA 3W88A 4K7YA 2FJKA 4Y6GA 3STGA 1LTDA 2UV8G 1JJKA 1VZWA 2NWSA 2VFGA 2J9ZA 5BMXA 4X22A 3IGUA 4FF7A 1XCFA 3DI0A 3LHZA 1ALDA 1JVNA 3C6CA 3LX9A 3A23A 4ZQPA 4X3ZA 3G3DA 2QDHA 1QAPA 1NF7A 3B03A 3LCGA 3T78A 2B7OA 1A5SA 3DBPA 1GYNA 1DHPA 3O6DA 4YWIA 6TIMA 3LHYA 2X1SA 4UXDA 3NQVA 3LHTA 4O12A 1EB3A 2E6AA 4A2RA 3A5FA 4GUFA 3M6YA 5CPMA 3W76A 1JRCA 1VLIA 4ZQOA 1BEUA 3O1NA 8TIMA 3S5YA 3O15A 2Y70A 2WNZA 3TQVA 5D2YA 4JEQA 4FNTA 1RQHA 1J2WA 3W72A 1R46A 3PM6A 3BW3A 5FEPA 1KM4A 3P84A 3QH2A 4FNRA 3DFQA 5KMYA 3NM3A 3BLFA 5AB3A 2Y61A 2A7PA 2QCEA 2YDAA 1WXJA 4WY0B 1R30A 1ZY9A 4LS0A 5HUPA 1AL8A 3NOEA 4HNNA 3LCFA 3CEUA 3STFA 1J5TA 3P7YA 2EAWA 3IV3A 1SO3A 3LCXA 2GVGA 3RFAA 3W2UA 1QCWA 4LTSA 2ZZ2A 1ME9A 2DZSA 2QJIA 3P82A 1R2SA 4CLMA 2X1UA 4O54A 3AO0A 2VENA 1T8XA 1H1YA 1TB3A 3EX1A 3QM3A 3BVJA 3O6YX 2TRSA 3TAKA 3RK8A 5D2TA 3PAJA 4GFSA 1TPDA 5F1UA 5C55A 4AF0A 4Y9AA 3BLIA 5BOOA 1AG1O 3H55A 2E09A 3W1MA 3LV6A 1F2JA 2O7QA 4XTDA 3NQCA 2VEIA 1FCBA 2PRLA 3GB6A 2A7NA 4JYDA 4WXYA 2QAFA 4UUIA 1PE1A 2B7NA 3FKRA 3C3NA 1IXOA 1HTIA 1Q6LA 5FEWA 1NFBA 3R2GA 5HNRA 2B7PA 2VELA 1JUEA 1A5CA 5F4XA 4MLRA 3IIXA 3RF9A 3QF0A 4GXMA 1S5TA 2XN2A 3M7WA 1ICQA 3M43A 3P62A 2V2DA 4JD4A 1B4EA 4GRSA 5C6MA 3M5ZA 1AW5A 5AN7A 1DL3A 5I3IA 4CQAA 3GXNA 5A5WA 1ICSA 1AK5A 3O6CA 1GT8A 1PHWA 3E0IA 4HPJA 3T40A 3M5YA 3GK0A 3WJXA 1XBZA 3N2MA 3MBFA 5L9FA 3ATYA 1M7OA 1VHCA 2V82A 3TXZA 1R2RA 4PH6A 5D2WA 5LGZA 2WO5A 3FJLA 5F1VA 4JYEA 2GQ8A 3SGUA 2R8WA 1DV7A 4ML9A 2EPHA 2ZBTA 5KSWA 4IMDA 1QWGA 4EIVA 1WV2A 5LNWA 3W71A 5D30A 1YPFA 3UPBA 2ZTJA 3PWAA 1DJNA 1XUZA 2VFFA 4UTTC 3I68A 1LRTA 4XKYB 2ZQ0A 3PS7A 1FUYA 1QR7A 5TIMA 1XFBA 3SSJA 2ZZ3A 1VYPX 2GJLA 3M5VA 2OX1A 1VPXA 1WBJA 3QMTA 4LVGA 2Q8ZA 3ZWTA 4TU1A 1KLZA 1A50A 3UY7A 1DBTA 4RZ6A 3H53A 2QCNA 1WA3A 1DQXA 1QNVA 1JUKA 1GTHA 4WOQA 1TTPA 3GZ3A 3S5OA 4GUHA 5CGQA 3W1PA 4Z1CA 1VCGA 3T55A 3QW3A 5CPNA 2CWNA 4HN4A 2EF9A 2YPIA 4DF2A 1L6WA 1KFEA 2CU0A 1D3GA 2ATSA 3Q37A 3QPYA 2V2HA 4KWWA 3CB8A 1HO4A 2J9YA 4PCFA 1I2NA 2FIQA 3LTYA 2D73A 3L68A 3MHFA 5DCBA 1KTNA 4YMZA 5DXYA 3VKJA 2BX7A 2Z6JA 3LB0A 5D37A 5CZTA 1QPQA 3WK0A 1OFPA 4LRSA 3OVRA 3KAOA 2TPSA 4NJHA 1K7FA 4AWTA 3L2IA 3P8JA 4TIMA 2QEZA 1H5YA 3IVUA 4CCEA 3NQEA 1KFKA 4R53A 3N2XA 3W7RA 3G3MA 3FLUA 5G1TA 3GYEA 3C4UA 4O4WA 1ONRA 1R2TA 5EMUA 5HWNA 1P0NA 1SO5A 3GLCA 4RV8A 4I7WA 4UFIA 3NZ1A 3PF3A 1X8FA 3TR2A 3S42A 3NYZA 3W6YA 3SGZA 1LZOA 4IOTA 4UTTA 5K7JA 3QZEA 3TIMA 4N9CA 4S1FA 4Z1DA 5D38A 4MLJA 1P0KA 3LV5A 5C54A 3PC0A 4MOZA 3D0CA 3B0UX 1N8FA 4QISA 2VEKA 1KFJA 4FNSA 3P5YA 4UTLA 1SU5A 4EVZA 1Q45A 2VEPA 1LDCA 1IXQA 3BGGA 2RFGA 5BNKA 1XUUA 2X16A 1IXNA 1H63A 2CFFA 4A29A 5CPLA 1EPXA 3KVKA 1RQBA 2HS8A 3P5ZA 5G2WA 1SO4A 3G0XA 3HBLA 4OV4A 3AJXA 3HGJA 1T99A 4IXXA 1GEQA 1G69A 2ZCGA 3GKFA 4DF0A 2O7SA 4IMGA 4DXVA 4ONVA 3G8EA 4JXCA 3B05A 3EWWA 3ZR4A 5AC7A 1NEYA 4OWGA 1P4CA 1RQEA 3UWZA 4LVBA 3LM7A 2NX1A 3TC7A 3W1AA 2NUXA 3E12A 3CM4A 1EUAA 5AOUA 1I2PA 1ADOA 1SSGA 4HNVA 1LOLA 5AHFA 1VJIA 4FNPA 2J88A 1JUBA 3LCWA 1KFBA 1OG0A 4L4MA 3N9RA 2Y63A 3GXPA 2RDWA 3O63A 4TR9A 3FOKA 4POCA 1TO3A 1S3HA 1DVJA 2QUVA 1QPNA 3C61A 1A5BA 3PY2A 4I7UA 2YR1A 4UTKA 4UMCA 2DJXA 5CZJA 5G4WA 2ZZ1A 3NPUA 3EWUA 2X2GA 3BW4A 1LOQA 2RDUA 3VE9A 1O95A 5D03A 4TX9A 1D3HA 3EXSA 5GVJA 1TTIA 5HR7A 4JTIA 4GWEA 4AHOA 3UXDA 4CQ9A 2NV1A 3HO8A 2GQAA 3MW7A 1CX9A 2YZRA 3TQKA 4E38A 2CLFA 1ZNNA 5D02A 1WOAA 4LVAA 4MJMA 1SQ7A 4JY9A 5D32A 3LLDA 4Y8FA 4RXGA 4BWLC 3TSBA 3W3OA 2Q3OA 2CZ5A 4N2YA 1OYCA 4QNWA 1XDLA 3GXTA 2J6XA 4KFNA 1AW1A 3GDRA 1X1OA 4LT9A 3DHDA 2PC4A 2EHHA 4JN6A 1ZENA 3LDVA 4O1BA 1TPVA 4M6PA 1IIHA 2BZNA 2R94A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ITG A;  4ILS A;  1I2Q A;  1TJR A;  4F8X A;  1QNO A;  4HKP A;  5LYR A;  3QV6 A;  1PCW A;  1UP3 A;  2PTW A;  3GWQ A;  2VCC A;  3GAK A;  3IWP A;  3KW3 A;  5C5Y A;  1OK6 A;  3GW3 A;  2OSX A;  3VDB A;  3RJX A;  4JBR A;  5E6Y A;  4UTW C;  3TON A;  4QSH A;  1KRB C;  4G7F A;  1PZ1 A;  3SRD A;  1K7E A;  1BQC A;  1MUW A;  3MMT A;  1VBU A;  2VFD A;  3QLL A;  5T26 A;  1FDZ A;  4Q32 A;  3ZLH A;  1HO1 A;  2CBI A;  4HU4 A;  3VZZ A;  3WLI A;  5AC8 A;  2QVH A;  1QT1 A;  1QNQ A;  5JBF A;  2YA0 A;  3VKC A;  3N9K A;  1PX4 A;  3QQW A;  1XIJ A;  5CLW A;  4ML4 A;  4IXH A;  1KBJ A;  3R89 A;  1HN1 A;  2QHA A;  4AZB A;  3RLU A;  1F8I A;  2XVN A;  2VCB A;  5E9A A;  1MEH A;  5FJO A;  4AMA A;  4NXK A;  3ZT5 A;  3MMW A;  4IT1 A;  5G2H A;  3WUG A;  3P60 A;  5FJR A;  5JH1 A;  1TUX A;  3CNY A;  4DN1 A;  2E0P A;  1YDY A;  1X97 A;  1AQF A;  3CC1 A;  2F6U A;  1TIM A;  1UWQ A;  2YW3 A;  2VFE A;  4CQB A;  3R0K A;  2E25 A;  2O56 A;  3OYX A;  5HR6 A;  1PVN A;  2GWG A;  1T5A A;  3W1T A;  3GX9 A;  4P7L A;  3TFX A;  1BYD A;  4GZE A; 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