2ISWA

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase in complex with phosphoglycolohydroxamate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
321
structure length
307
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLDHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARSVSVEAELGTLVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Characterization, kinetics, and crystal structures of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from the human parasite, Giardia lamblia.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 114
structure length 307
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2006-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2iswA00
1VH7A 2WJZA 3TQVA 3RFAA 4JGDA 4WUIA 4UFIA 2ZQ0A 4EWND 3TW6A 5G4EA 4IXHA 1VHNA 1TREA 3HGJA 5A8GA 5G2IA 4P2VA 4AHOA 2DZWA 1YXYA 2DZUA 1JR1A 5BNKA 2QR6A 1OFPA 3DI1A 1PV8A 5KITA 1KM6A 2ZRVA 3R13A 3TE9A 3IV3A 5F4XA 3WJYA 2EKCA 1HTIA 5F4WA 3LBCA 4KWWA 3C2EA 3LV5A 3RNDA 3L5LA 2YFOA 3GNNA 2OMAA 1MEIA 1S5VA 5KZMA 5HWMA 4MJMA 3O1NA 4MPQA 3TQKA 4LY8A 3P80A 1AG1O 2O7QA 3QW4B 3MO7A 3EWXA 2GOUA 5D2TA 3RU6A 3S1VA 3WJZA 1QO5A 2H8ZA 3C2OA 1J4EA 2E77A 4GUIA 4DBDA 1LBFA 5E1QA 2FDSA 4WZHA 1I2NA 3VI2A 1EIXA 4UNKA 2V30A 3GXNA 4N9EA 3EXSA 2X1SA 4RR4A 1R2SA 1QAPA 3EWWA 3UWUA 3W2LA 2GVJA 3NQVA 3NR0A 5HQEA 3MP3A 3EB2A 4N9DA 2QUVA 3KRUA 3QF0A 3TXZA 1ADOA 2FTPA 3KRSA 3RLUA 1R2RA 3L0GA 1KM5A 3G0UA 1TQXA 4UTTC 3GR7A 2VEMA 3TNOA 4JX6A 3TFCA 2G5WA 3H53A 4XBKA 4XWUA 2OX1A 2E6AA 2R94A 2NX9A 3A21A 5U7SA 2A6NA 1QPOA 1FDYA 2WOQA 1WDWA 1GJPA 1H7RA 5KZEA 1ZAIA 2V81A 2QUTA 3IRDA 4FO4A 3HG4A 3LRMA 4HPXA 1X1ZA 2JGQA 1OFAA 3W7QA 1I8JA 3DFPA 2RH9A 4NQ1A 2E68A 1GVQA 3NA8A 3RK8A 2GJLA 4QIUA 2GUUA 4NT0A 1VGAA 4ORMA 4JNMA 1GYLA 1ICSA 3OVQA 4UTUA 4D2JA 3AJXA 3IVTA 3PUOA 1SO6A 5C54A 3A5VA 1EWEA 4I7UA 3SGUA 2XFWA 4G1KA 1PS9A 3HPXA 4C1LA 3EWZA 3NEVA 4NJKA 2DZTA 2V5BA 1RD5A 3T78A 2J24A 1X1OA 3W74A 1EPXA 5G2WA 3NQ2A 3PBVA 1SO3A 4GUGA 3CIXA 4FNPA 2VOMA 4JIQA 3I68A 3NPWA 2BTMA 1ZNNA 4NZFA 1KBIA 1DQXA 2WO5A 2HMCA 2JK2A 1LRNA 1F6PA 2ZRYA 3GAKA 4PEKA 1TYGA 4OGZA 3UQNA 2H3DA 3V1PA 1TV5A 1F73A 3OVRA 3W2JA 4P61A 3SR7A 3MI6A 1B3OA 1EWDA 1LOSA 4O28A 3NQFA 5FI8A 3L5AA 4IPJA 4Z0SA 1TTQA 3GVGA 4Z1DA 4RZ5A 1TJPA 2ZRUA 3A5FA 3I7RA 2NXGA 4JTGA 4WOQA 5AYZA 1W3NA 4JS3A 1Q6OA 2RKXA 1AL7A 2R14A 3P67A 5AYYA 1YDVA 1OX4B 1G69A 2JBMA 3QJAA 3W88A 2JKAA 4JX4A 2QJGA 1NSJA 3LCGA 4GWEA 5U4NA 4XKYA 3G1VA 3KXQA 3E0IA 4O15A 1TPFA 4QNEA 3PUEA 5F1VA 4CCCA 4Z08A 3W1XA 1VLIA 3P81A 3PF3A 5AHFA 2YCEA 2VC6A 4WY0A 4JTHA 3TKFA 2PRHA 2ZTJA 4AVFA 3ATYA 1LRQA 3OG3A 4PTNA 3LGEA 2CLLA 1N55A 1O5XA 2CZDA 1LDCA 3W83A 3B05A 1WXJA 4OQVA 3Q58A 4UFHA 1LTDA 2I1OA 5D37A 4HNNA 1OF8A 3LLFA 3DBPA 3B04A 1BTMA 1FWTA 5DN1A 2WPBA 1BWKA 2ZCGA 3IIPA 2YYTA 2C3ZA 4N6EA 2WQPA 3KVKA 2FPTA 1FWRA 1RZMA 4WY0F 4RZ4A 1TTIA 3VNDA 5I3HA 3GIYA 1CW2A 3HB9A 4RX0A 1LORA 4O13A 1Q6RA 4AWSA 3OHIA 4O8RA 5L6UA 3CEPA 4C1KA 1EB3A 2V9DA 3WJSA 1A5AA 1JJKA 3PSWA 3QFEA 4HSOA 4DELA 3TSBA 4O4WA 3C2VA 3M16A 3PSVA 1TCDA 1OF6A 4FIQA 4MJZA 1IIGA 3W85A 3W7PA 1L6SA 5LNRA 3SFKA 3G0XA 4JTSA 4YCOA 2VKZG 1HO1A 1WAUA 1FY6A 5LSMA 4MFEA 3W1QA 4JY8A 2Y7EA 4UMAA 1RR2A 4AWTA 3NQ7A 1SZEA 4UTIA 1DHPA 5CGQA 3W07A 2BSLA 3HGRA 1XBYA 1TRDA 1GVFA 4LVFA 2D73A 3O05A 4UUIA 3GK0A 5FEPA 2YXGA 4BFAA 1GEQA 1Z42A 3EKLA 3HO8A 3G22A 4HPJA 3W3OA 2DZXA 3HG5A 2G97A 2QUUA 2Y88A 2FJKA 3UY7A 3USBA 1W8SA 4XZ9A 4OV9A 1QMLA 2QDGA 5LNUA 1QPNA 3A22A 3E9AA 3W23A 4LS2A 5A5WA 4WXZA 4UTWC 1ALDA 4GNJA 2QDHA 4H4IA 2ZZ6A 1O4UA 5D30A 3G1YA 4LC6A 4DO5A 3QSRA 4E38A 1QR7A 2ZRWA 1K03A 2IQTA 3NNTA 3TMLA 3ZWTA 2J9ZA 4DF1A 5K4ZA 1FCUA 1YTDA 5DXYA 2VFHA 4ZQRA 3W73A 1IF2A 3TFXA 2Y7GA 1V5XA 4A22A 2Y63A 3U2OA 2DU2A 1JULA 1H50A 4ADSA 2Y7FA 1HO4A 1L6WA 3RF9A 1QPRA 1X8FA 4UTTA 2O7SA 3LXAA 3C61A 2H90A 4R53A 3C2RA 1XUZA 1JCLA 1LRTA 3W76A 2NV2A 1VCGA 3ELFA 2TSYA 1G6CA 3LHUA 3SI9A 1F76A 1TPH1 3CU2A 4MZYA 3C56A 4O11A 3W7IA 3CWNA 1G7VA 3BGGA 4CNPA 4FX8A 4AHQA 1SR9A 1TPVA 3O15A 3R12A 4LTSA 5EMUA 1FQ0A 3LLDA 4PFMA 4RV8A 3S9YA 5LHEA 2J9XA 3M9YA 3R89A 4ORIA 1EX5A 1HL2A 5TIMA 5EL1A 2A1YA 5EBUA 4M6VA 2ZZ5A 4HNUA 1QPQA 2FFCA 1UASA 1T96A 2B0MA 3MUXA 3ANYA 1RQEA 3IGXA 1KFJA 1O95A 2G95A 3W87A 1TPEA 4IQLA 4AB4A 1IGSA 1T99A 4FNTA 1W5QA 1GOXA 3LB0A 3DAQA 2XN0A 3DFSA 1X6UA 3KRZA 3NQ6A 3M5VA 1XC4A 1PCWA 1SFJA 4N9BA 3T55A 1DORA 4QSHA 4O10A 1FX6A 3EWUA 3IEBA 4N2YA 3QMTA 2NUXA 1NEYA 5F2MA 2GQ9A 4UMBA 4XTDA 2J9YA 3UWZA 3EXRA 4LV4A 1B57A 1O94A 3GX9A 3L65A 1GVSA 1I2RA 1TQJA 5BW6A 2X16A 1C29A 3MHUA 1F05A 3GAYA 5C6MA 3HMJG 4TU1A 4PC8A 3W1AA 4YMZA 2J27A 2VELA 4CQAA 1X7FA 1I2QA 1I45A 2PURA 4CNNA 4HSNA 2ZRZA 5D05A 3O63A 3TROA 3BG9A 3EX1A 4K7VA 3EX2A 3UYCA 3HG3A 2PRMA 3W1TA 5CPOA 1JVNA 5DXXA 4IX2A 1F74A 4KFNA 2UV8G 1GT8A 3W7KA 1QO2A 1TO3A 5HJLA 3STFA 3ZFHA 4JTJA 2TYSA 4QISA 1KW1A 4O4VA 2QCDA 4ZQCA 1H5YA 4TIMA 3G1AA 3C2FA 5DCBA 3C3NA 1AW5A 4O14A 1SW3A 1YLVA 3MI3A 3CPRA 3S8HA 4NJIA 1QDSA 4O1CA 1IXPA 3TMQA 3QH2A 3QQ1A 4K8EA 4FX7A 3BW2A 1RPXA 1IXNA 4L4LA 4FXSA 2CZ5A 3PB2A 3NQDA 1VYPX 1W5OA 4AAJA 5C2XA 1T0OA 3KOFA 1KTBA 3W1UA 3BARA 3NVTA 1QNVA 1F5ZA 2X1RA 2DJLA 1QOQA 1GVOA 1OFEA 1G67A 3N2MA 2C0AA 4UTLA 4CCEA 4UIOA 1I4NA 3R5EA 1KFBA 2C6QA 2C19A 3U6WA 1JCNA 5K3VA 4NJGA 4JTTA 3VE7A 2W0UA 5DCEA 3W7LA 3IIVA 5HWNA 2A7NA 2GJNA 2PRLA 2Z6JA 4LWWA 1DOSA 2ISWA 1YPIA 1TV7A 3UPWA 4JX5A 4UTMA 3T44A 2YPIA 1F6KA 3INPA 8TIMA 3PBWA 3HIJA 1Z41A 3SECA 3SZ8A 5D2VA 3DFNA 4JICA 3NPUA 3C0JA 3BW3A 3TQ0A 2CU0A 4IX0A 4IPIA 4DO6A 3EX3A 1ZAJA 1ICPA 2F84A 2E6FA 4UTKA 4J9JA 3GDTA 3OIXA 4MY9A 5CPNA 1L6YA 3PB0A 3H54A 1VPXA 3W22A 2QAPA 2V8ZA 2VEIA 3E49A 3W75A 1H1YA 3LI0A 4UC5A 2QJHA 4HNTA 3BV4A 3FFSA 1FCBA 1H1ZA 3W7JA 2C13A 3IVUA 1LROA 2A85A 3BLEA 3W71A 4ICNA 5FF7A 3PR2A 4M7TA 1FDJA 2A7PA 3UY8A 2ISSA 3HPZA 3P7YA 1H7XA 4UTWA 3CHVA 1YXCA 4QM1A 1VHCA 3GDRA 1XM3A 1XDLA 4LV9A 4Z1CA 4ZQOA 3TDFA 3TC7A 3QEZA 1LBMA 3GR8A 5G2HA 2VENA 3QW3A 2GPTA 4W9TA 1SZNA 1P1XA 1FCQA 2E5CA 5CZ0A 3THAA 1XFBA 2V2CA 1DV7A 3MP5A 3LOTA 4DQWA 1W37A 3EX4A 2V0TA 4PODA 3JRKA 4N6FA 1MZHA 1H62A 2QJIA 3GDLA 4TX9A 3QMRA 5HINA 2R8WA 5J5DA 3VCRA 1NFBA 3QSTA 3GLCA 2AGKA 4LRSA 3L5MA 3HF3A 3FS2A 1KM4A 3UZJA 1YDOA 4FNRA 2FQIA 2ZA2A 5ABTA 4K6AA 4TO8A 2Y61A 3WK3A 5K7JA 1T8XA 2RDTA 2GQAA 2X2GA 1LLWA 2C18A 2OCZA 2R91A 4GUFA 4EF9A 1TPWA 1WOBA 5DLCA 3UWQA 1W3IA 1M5WA 2PC4A 3B03A 2E09A 4PL2A 4YXGA 4AXKA 3H55A 3QPZA 3OEXA 1VCVA 1GTEA 5T26A 1K3UA 3TSMA 1VYRA 4YLWA 1W5PA 2I9EA 3Q2DA 3TU9A 3WK0A 3D0CA 3B06A 3TR2A 4TR9A 3ABOA 3L66A 3DENA 4IJBA 1KTNA 2VFIA 3KAOA 4ZQNA 3FKKA 3PAJA 1EP2A 2Z0IA 3GB6A 5AN7A 2DJXA 3TJLA 2EAWA 2ATSA 3CTLA 2NX3A 3QM3A 5HNRA 3ABSA 1YPFA 3LCFA 3BLIA 3W1LA 2WSRA 1VRDA 1GG0A 3IGUA 5SWUA 5I3JA 2A2IA 2CW6A 4GFSA 4PCFA 3CIWA 2WV8A 1J2WA 2CLHA 1Q6LA 2VFFA 3NYZA 3HPSA 1K7EA 4EOUA 4JTUA 3NAVA 3TX9A 3DI0A 4LU0A 3M44A 4MYXA 3NZRA 3HGOA 3S5YA 2Z2UA 3NO5A 3TAOA 5LNSA 4O1BA 4MYAA 3O6CA 2ZDRA 5FF0A 2Y7DA 4FB7A 1KLYA 4YWIA 1RQHA 3UWYA 2ZA3A 3N9RA 3NZ1A 5D2YA 1EEPA 1XCFA 3NL3A 3TH6A 3MP4A 2DP3A 1FXQA 4R7JA 1W3TA 1IIHA 3SIZA 3IIZA 3NL2A 3TAKA 2Y62A 4MFDA 4O12A 2A5HA 1SW0A 1XBVA 1ZCOA 4UFJA 1UUOA 4IXXA 4QAIA 1OK6A 1SPQA 4JIPA 5C55A 1XI3A 4JDBA 4XUGA 3HG2A 3MJYA 4GUJA 1WOAA 2NWSA 4ADTA 1W1ZA 2CFFA 4U4MA 1SW7A 1R2TA 2YZRA 3O6YX 2VXNA 2CWNA 1ZAHA 1DJNA 3UXDA 1BWLA 3GZ3A 4AMAA 3WJXA 1VJIA 3I7SA 3U8GA 4H6KA 3G1SA 4M6QA 3TV8A 4E2DA 1HUVA 4NX0A 4RXFA 1KLZA 3LTSA 3W7DA 4Q32A 5FEXA 1FWWA 4ZMGA 4AHPA 4LVBA 1D9EA 3PS7A 3WFAA 2WNNA 3CM4A 1GTHA 1KV5A 2ISVA 3DXIA 3NQAA 5F2IA 1KFEA 3TJXA 3ABRA 1QWGA 3DHDA 3MI2A 2YYUA 3LTPA 2A21A 4UFMA 3UZ5A 5CZTA 1OYAA 4BI7A 4MY1A 1VCFA 3W72A 3MW7A 3GDKA 4NXSA 5LGZA 3W7EA 3O16A 5CKSA 1VQTA 2TPSA 4JXCA 2WNQA 1C9DA 3W2UA 4M5PA 1LP6A 3UPBA 2RDWA 2YW4A 2GVGA 3KX6A 4LW7A 4K8HA 1JRCA 2RDUA 4O0KA 1KTCA 4XQ6A 4FX6M 2DZPA 2EF9A 4UFLA 1TTJA 4M19A 4UMCA 5KSWA 2VFEA 3KFTA 4NXKA 3NQGA 1S3HA 4X22A 4O19A 4O53A 2Y70A 2ZZ4A 3DFTA 3F1QA 1OX4A 1D3GA 1R46A 1KFKA 1H63A 4LS1A 4LVDA 2AAMA 5FF2A 1F7BA 4MOZA 4AH7A 4QITA 1ZFJA 1ZY9A 2FLIA 4EVZA 1RV8A 1DQWA 3NPVA 1EUNA 1MSSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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