2J9YA

Tryptophan synthase q114n mutant in complex with compound ii
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
266
structure length
251
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Betaq114N and Betat110V Mutations Reveal a Critically Important Role of the Substrate Alpha-Carboxylate Site in the Reaction Specificity of Tryptophan Synthase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 92
structure length 251
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2j9yA00
1MZHA 4B5NA 3O63A 3QH2A 4NJHA 2C13A 3W83A 1K7XA 4JIQA 3CHVA 1TTPA 3U6WA 3WJWA 1ICQA 4AWSA 4FNQA 4ADSA 3UWWA 3UXDA 1OFDA 2R14A 5E1QA 2Y70A 3TV8A 2V2DA 1A5AA 3WK2A 7TIMA 2ISSA 2QDGA 1KFCA 2QF7A 3DAQA 4QISA 2ATMA 5HUOA 1KFEA 4LV9A 3IRDA 1GZGA 3DKJA 4IXHA 4MJZA 3P7YA 4WZHA 1B57A 2ZFAA 2Q8LA 2WV8A 4O17A 2WQPA 1OF6A 2ZQ0A 3MHUA 3TE9A 1C8VA 3OEXA 4NJJA 5HR7A 2I14A 3QM3A 3NG3A 3PR2A 1TYGA 5G1YA 1FX6A 3P84A 1Z44A 4JDBA 1SQ7A 3W7DA 4A22A 5DBUA 3M5VA 3NQGA 3UZJA 5FF3A 1Z41A 5SWUA 1OK6A 1QCWA 2WSRA 4KKXA 4K7VA 1YADA 5G2HA 4IMDA 3SGZA 4O1CA 3RLVA 3LX9A 1ZAJA 2H3DA 5D2YA 3C8FA 1VLWA 1R2TA 3EX2A 4I9AA 3TDFA 3GYEA 2GQ9A 2ABAA 4UMCA 5K4ZA 5DCBA 2VFIA 5DELA 1TPUA 1LOLA 3GXPA 3HPSA 1PV8A 2BZNA 1LDCA 4JTEA 2B7NA 2E77A 1FWNA 1W5PA 2LLEA 4BF9A 2J88A 3OVPA 5DN1A 4EWND 3W75A 1R47A 2R8WA 3CIWA 5G4WA 1QPNA 1XM3A 2H8XA 1WDWA 1HTIA 5AYZA 3NL3A 4LRSA 3O15A 3HOJA 1KFKA 1SSDA 3STFA 5I3GA 4FX7A 1PVNA 3KX6A 8TIMA 4LS1A 3W2UA 3LRMA 1QFEA 5C2XA 1D3HA 1TSIA 1XDMA 1AW2A 2AGKA 4QQ3A 3C56A 4C1LA 3P67A 3NQ2A 3UD6A 4YLWA 2VEPA 4XZ9A 4OHQA 3EKLA 1GTEA 1TRIA 2A21A 4KFOA 4UFMA 1RPXA 3GLCA 3TA6A 4BWLC 3E96A 3TX9A 4OT7A 4UTTA 1LRQA 4PODA 1OG0A 4Z08A 2E6DA 1TPFA 1QNVA 3B4UA 3CIXA 4QITA 4ALDA 1GT8A 3A24A 3VCRA 2YFOA 3F4WA 3PG8A 4M6QA 4ORIA 3T78A 1GTHA 4JTSA 3M9YA 4WX2A 3MI6A 3NQMA 5HWJA 1YXDA 3MP5A 1N7KA 2A7NA 3PF3A 1JQVA 4POCA 3INPA 4I7UA 1ZY9A 5LNSA 3BLFA 5FESA 3C6CA 2E5CA 1GJPA 1BEUA 2V5LA 4RXGA 1LOSA 5K2ZA 1W5QA 3ANYA 3BLIA 3DGRA 4M5PA 3MYOA 4PL2A 5AN7A 4UIOA 4XTIA 3ZR4A 1THFD 2QEZA 2DZVA 3C2EA 3CEPA 1H63A 2CLIA 1W5OA 2JK2A 4HPJA 2NWRA 2C15A 3LHZA 1DJNA 3BG5A 5G1TA 1AMKA 3PM6A 4DXVA 4O15A 1ML1A 1OX4B 3D0CA 1QR7A 1H1YA 3EX3A 3QPYA 2DU2A 1TV8A 1ZCOA 4XWUA 5DXYA 2TSYA 2VKZG 3L2IA 3G18A 2YSWA 1I8JA 3W1LA 4K36A 3SFKA 2G95A 1T8XA 3Q2DA 2WJZA 2FDSA 2VOMA 4XKYA 2BLEA 3SIZA 1GVFA 3NL2A 1XUZA 3HGOA 5FF2A 5EKYA 3E9AA 3DENA 1A5BA 4PCFA 3PC0A 4BK9A 2WNQA 4U28A 2O7QA 4IMFA 2F84A 4O16A 4N4QA 1G4SA 3L21A 5K9XA 3DXIA 4JD4A 3NQ6A 2W79A 4QNEA 4WJEA 3MP3A 2E09A 3T44A 1VGAA 3H54A 1GWJA 1EB3A 1M7PA 3GDKA 3W3OA 4LY8A 1TV7A 1T99A 3S5ZA 4K39A 1WQ5A 3E12A 2Y7DA 2F7FA 1H5YA 2X1TA 4OQVA 2FLIA 2WOQA 1ZALA 1YXCA 5D32A 2C3ZA 4JDYA 5TQLA 3C52A 4NXKA 1WA3A 3MBDA 4IGHA 3NL5A 4NNAA 4DQWA 4PL1A 5HULA 1IF2A 4LRTA 1UJPA 2V81A 2Y7FA 4JX4A 1DQXA 3LHUA 3ATZA 4HHPA 1OYAA 2CW6A 1H60A 2YFNA 4E38A 2CLOA 2ZBTA 1W3TA 3GKFA 1KFBA 1O95A 1K03A 3QQ0A 4UFJA 3S1UA 5T26A 2FB2A 3FEMA 4O1BA 2NUWA 3IGXA 1DQWA 3JS3A 1WOAA 2J27A 3QW3A 5HUPA 3OHIA 3BLEA 3P8IA 3M5ZA 4WD0A 1FY6A 3N2XA 2E6YA 3EWYA 3KRZA 4CNOA 4P2VA 3B06A 3QMSA 3KVLA 1R30A 1YDOA 4O57A 2ZRYA 2H8ZA 5F2IA 3E49A 2ZA2A 3HIJA 2QAFA 3LERA 3FYPA 4UTUA 3HG5A 1FBAA 1TQJA 1YTKA 2HS8A 3CEUA 3PB0A 1VLIA 1GYLA 4YWIA 3QZEA 3TR2A 1JRCA 5EY5A 5I3HA 1S3HA 3TSDA 3PVFA 1OFAA 1BWLA 2EF9A 3IIZA 5KZMA 3A5FA 3IIPA 1GOXA 3W1AA 3GAKA 4Y8FA 2CLFA 5EA9A 1VZWA 2NXHA 3RFAA 3LOTA 5GVJA 4ZQOA 2E5BA 3CT7A 3QYQA 1KV8A 5CZJA 5I3KA 1VJIA 1WX0A 2Q3OA 1VQTA 3F03K 3BK0A 3W1NA 3W1TA 1F5ZA 2XN2A 3S5NA 2V82A 4NJIA 4N2YA 3NQFA 4PH6A 4UTHA 4AMAA 2E5DA 4G1KA 3W1UA 1KFLA 4HN4A 5L9FA 3TW6A 3STGA 4LWWA 3W2MA 2V9DA 3C2OA 4CCCA 2A85A 3PBWA 4FNPA 4FO4A 1W54A 2X16A 3MI2A 3T4CA 2Y85A 5FEPA 2JKEA 2NUYA 1TV5A 2Z1BA 1M6JA 3C2RA 5D33A 3GDTA 3UXAA 2CZEA 1VHNA 4ZL1A 2YYUA 5F1VA 1A5CA 4R7JA 3KVMA 5D2TA 3JR2A 4A2RA 2DZUA 4NT0A 1D3GA 1TB3A 1SW0A 1WV2A 4S1FA 4LVGA 3M43A 1KBJA 5LNVA 4WY0A 3C2FA 4RR4A 3TAKA 4N9CA 1L9WA 1F73A 4HNNA 2YYTA 3TQKA 1DVJA 4RZ6A 3EWUA 3I7QA 3V1PA 2DZWA 1H7PA 4Y96A 1QWGA 2WPBA 1SW7A 3IIVA 5CKSA 5E0KA 1SPQA 3TNOA 3G8EA 1L6SA 4CQ9A 2QCDA 3L67A 5HR6A 1JUEA 3GXNA 2BXVA 5D38A 1VCFA 4MVAA 1PIIA 1W1ZA 3N3MA 2JKAA 1F6KA 3EB2A 4GNJA 4OE7A 2G97A 1SFJA 1PL9A 2GJNA 3G0SA 4KFPA 1B4KA 5LHEA 2XN1A 5KZEA 5F2MA 3W7CA 1H62A 1IXOA 3A23A 3RNDA 1PCKA 1I4NA 4NNBA 3DU0A 5HJLA 3Q94A 4QIUA 3QQ1A 3FOKA 5LGXA 3W7KA 3ZS4A 4RLIA 4O1DA 3DI0A 2V30A 3B0PA 1RR2A 3GK0A 1VH7A 2A7RA 4Z0SA 3TK7A 1ZAIA 2W6RA 1O94A 4WOQA 5F4WA 1JCYA 3W1QA 1SFLA 1WAUA 1I2PA 3UWUA 2J9YA 2ZTKA 3L5AA 2ZZ3A 3ABQA 3DKLA 3NQ8A 3CQ0A 4O11A 1YLVA 4LTSA 2VFHA 3M1ZA 4XQ6A 3TUUA 2QUVA 4GBUA 1H7OA 3LBCA 1Q6LA 1HO4A 5H91A 4UTKA 4WOZA 1G7VA 3L0KA 3M47A 3BO9A 3O07A 5KMYA 2QJIA 1KM4A 4MY8A 5F1UA 3IEBA 1SZEA 3FJLA 4FNUA 1AW5A 2YX0A 5D2XA 3IGUA 1W37A 4BWLA 4UNKA 4O1AA 4PEKA 3B0VC 3TQ0A 4H6KA 3PBVA 1QDSA 3O6YX 1AK5A 5G4EA 3HMJG 3B04A 3TKFA 2RHGA 4R53A 1YYAA 4AHOA 1PHQA 1ICSA 1ONRA 4O4VA 3M5XA 1EA0A 4FB7A 2BX7A 2RDTA 3G1FA 5HMSA 4FF7A 2FPYA 1P0NA 2YW4A 4C1KA 1MXSA 2Y62A 4X22A 3SW6A 3SJ3A 3GX9A 1K7EA 4JTTA 1DKWA 3PSWA 2FFCA 1KM5A 4NX0A 3P82A 5F2GA 1UASA 5AHMA 1RD5A 4O53A 4GUGA 3LCLA 5MHBA 2GPTA 1Q6RA 2BWGA 2QUUA 1LORA 1MEIA 1QMLA 1TPEA 5I3JA 3KFTA 3THAA 3W7JA 3W7RA 1KV5A 3R89A 1YTDA 2V0TA 4LNYA 2ZRUA 5K9DA 4MPQA 2EAWA 2GQ8A 3WJYA 3W7GA 2C18A 4WXYA 1Q6QA 5IBXA 2QCFA 3NM3A 4R33A 2A6NA 4UUIA 1OX5A 1SZNA 2ZZ4A 2QKFA 3P5YA 3G8RA 1C29A 3MMTA 4M7TA 1VYPX 1L6WA 4LUJA 2Z6JA 1TPB1 4JIPA 3DH7A 3RMJA 3OG3A 5LGZA 2O7SA 4JX5A 2WNNA 3NQVA 3EXTA 3W86A 4FNRA 4GJ1A 1ME8A 1MSSA 5LSMA 3W70A 4DO6A 1K8YA 2C6QA 3W7IA 3EX6A 3MHGA 4K6AA 3TSBA 4IMCA 5J5DA 4E2BA 5CG7A 3ZFHA 1IIGA 1FUYA 1ICPA 2ALDA 3IVSA 3HPZA 6TIMA 2CZFA 2OT1A 2FPVA 3HO8A 5J5RA 4JICA 2WKJA 3W6YA 3W2LA 1G4PA 1ME9A 2E6FA 2VFGA 3BV4A 2PURA 3PUDA 5KINA 3M7WA 3BG3A 4Z1AA 4NU7A 4X9SA 4NZJA 1QPRA 2X1RA 2FB3A 1N55A 3BGJA 4N9EA 2Y89A 4Z0JA 3WFAA 1G4EA 2CZDA 4HNVA 1EP2A 1HO1A 3M6YA 5LZLA 3G1XA 4QJ1A 1J5TA 1AL7A 3UY7A 3WK3A 1G7UA 3DBPA 3KOFA 1OABA 1SO4A 3NQAA 4CCDA 5CPMA 5DCEA 4E2DA 3QSTA 1OFRA 2QCHA 1OFPA 5D04C 4OV4A 3TXZA 5HWNA 3RK8A 2VFEA 4LVAA 4E0CA 1LLWA 3GZ3A 2GVJA 1K7FA 4LVFA 3GDMA 1VS1A 3KRUA 3T55A 5I3IA 3L9CA 4UFLA 3LGEA 3BPWA 4YXGA 2RDUA 3DFPA 2ZTJA 5TIMA 3H53A 2WNZA 2C14A 3LHVA 4O14A 3LRLA 1F74A 1TJRA 3BW3A 5BW6A 3HJZA 4K7YA 2ZRVA 4JEQA 2G96A 3LHWA 3DFNA 1GVOA 3O16A 4ZVJA 3LCWA 4TR9A 2B7QA 3W07A 3LCXA 5FF4A 4AHPA 2P10A 2C19A 4A3UA 3FLUA 3LXBA 1ZENA 3BG9A 3L5LA 2CZ5A 3W72A 1TPC1 3W74A 1NEYA 4ADTA 2EKCA 1LYXA 4IX2A 1SZGA 1NAL1 4OGZA 4Q4KA 1QPOA 1TIMA 1WOBA 4UCGA 4YMZA 1GG1A 4IXXA 3W76A 2A2IA 5EPDA 4IJBA 1J2WA 3UWYA 3C0JA 3W7OA 1M7OA 2QAPA 3EX1A 1O60A 4RX0A 1DHPA 2ZRZA 4EIVA 1DORA 3W1RA 1SR9A 2NXIA 3BW2A 4X2RA 4H3DA 4CQAA 4AB4A 1XL9A 2HMCA 1IXPA 3NQCA 1LROA 3LI0A 2B4GA 2V5BA 4K38A 4TU1A 2ZA1A 1JR1A 2FQIA 2QDHA 1FDZA 2GVLA 4ADUA 1KTNA 3IIXA 4LW7A 4M6PA 4O10A 3PS7A 3PBYA 1JCXA 3S1WA 1GVSA 3FFSA 2J6XA 2QCLA 3PG9A 5C54A 3G0UA 3R5EA 3N73A 2TRSA 5F2LA 3LM7A 4JTKA 3BW4A 1I2RA 4N6EA 3W7PA 3WJZA 3QPZA 2NX9A 4YCOA 3TC6A 3KAOA 1F2JA 2A1YA 3PSVA 1B4EA 3G0XA 1GPWA 4AHQA 1UUMA 3AJXA 1PE1A 1WBHA 1T0OA 2Y6ZA 3H55A 3V75A 1P1XA 4KFNA 5CSRA 1TTJA 3A9IA 2GUUA 3LDVA 3TMQA 1QO2A 3GR8A 3WJXA 3G1DA 3LXCA 4HSNA 3W7QA 3B05A 3OVRA 1TQXA 3P61A 3KRSA 3Q37A 5A5WA 1RV8A 1YPIA 2QCGA 3ELFA 1JVNA 3SECA 4M6VA 4ONVA 2RKXA 2VENA 4UR7A 4EF8A 3W1XA 5U4NA 4OWGA 4IPIA 3GXTA 2OCZA 4S2BA 1AG1O 1GG0A 3L68A 1Z42A 5L6UA 4AF0A 3NPVA 1S5WA 1YXYA 1QPQA 1Y0EA 2VXNA 5C55A 2ZCGA 1D9EA 3UPWA 3NAVA 3UZ5A 3DFSA 2ZYFA 4MIMA 3HGJA 4ML9A 1HFBA 1XFBA 2CLKA 4RV8A 2Q8ZA 3NQEA 3KHJA 4HNUA 3NXFA 2ISVA 3P5ZA 2NWSA 4LV4A 1OFBA 2ZZ1A 2XN0A 4CCEA 2AAMA 2JBMA 1ZFJA 4GFSA 1FWTA 4A29A 2H3BA 3G1VA 4GWEA 4O13A 3OVQA 1JCMP 3NQDA 3IGSA 4QNWA 4X3ZA 3TQVA 2CLEA 2FTPA 3TH6A 1AL8A 2FPTA 3E02A 3NZ1A 3NNTA 4JYEA 1LZOA 2P1FA 3R12A 1NF7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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