2J9ZA

Tryptophan synthase t110 mutant complex
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
267
structure length
251
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Betaq114N and Betat110V Mutations Reveal a Critically Important Role of the Substrate Alpha-Carboxylate Site in the Reaction Specificity of Tryptophan Synthase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 95
structure length 251
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2j9zA00
1SSGA 2DJXA 1H7NA 4RZ6A 3MWAA 3HB9A 2E6AA 3B0VC 1IGSA 5IM51 3M43A 3QQ0A 1QPNA 5DXYA 4UR8A 4WZHA 2VXNA 1SPQA 3LI0A 1J2WA 3EWYA 5G1TA 3G3DA 4JDYA 3CWOX 5I3IA 1KBJA 1Q45A 4FXSA 3LRLA 3N3MA 2A6LA 1R30A 3LHUA 1QR7A 3NNTA 3N2MA 3IIVA 3LGEA 2A4AA 3TA6A 5CGQA 3MW7A 4JTIA 3C2EA 4MZ8A 4DQWA 3S5OA 5D04C 1B4EA 2VC6A 2Y63A 5KSWA 1KLYA 1QOPA 2CLEA 3G1SA 5EYWA 1GZGA 1OYCA 3PBWA 2E09A 4IXXA 3F1QA 3HG4A 4IWWA 4JS3A 2GVJA 2NV1A 1I2PA 5KZMA 4JTEA 4FNTA 4ADTA 3PS7A 4QNWA 1WBHA 3LHWA 4GBUA 3KOFA 2W0UA 3OVQA 1AW1A 3L5AA 3MBDA 1G4TA 3RLUA 4UFLA 1D3GA 3W7RA 3NZRA 5K4XA 2Y62A 4JICA 2VFDA 3I7RA 1X8FA 3LRMA 1LYXA 5EMUA 4YCPA 3RF9A 4EF8A 3ZWSA 3B03A 4MY8A 4AF0A 1OABA 1B57A 3LERA 3LTPA 1JQXA 3UZJA 2G96A 3GLCA 4PL1A 4UC5A 3L0GA 1EUAA 2EGZA 2QCNA 5HINA 3HPSA 1NAL1 1QPRA 3Q94A 3CC1A 5D03A 4FB7A 1QAPA 1R46A 3W84A 3MHUA 4NJGA 3UXAA 4I7VA 3ELFA 4E2DA 1NF0A 4L4MA 2FTPA 3A23A 1K02A 4O17A 4Z0SA 1PE1A 3PF3A 4N9CA 1TPVA 1S5WA 1X1OA 2ALDA 2B7OA 1LLWA 4RK8A 3NL2A 3MUXA 3C0JA 1I2NA 1L9WA 2DZSA 2GVGA 2I14A 1YDOA 3BW4A 3PAJA 3S6DA 2CU0A 2NLIA 4XBKA 1G7VA 3QZEA 1OFBA 4O4VA 1TPUA 3NPXA 4MKNA 3VE7A 5HR7A 3H55A 3QPZA 1LBFA 4O11A 1XUZA 2Y7FA 3NGJA 3LCWA 1Q6OA 3G8RA 1H7PA 1DORA 1ZCOA 3RFAA 1OK4A 3BW3A 5I3FA 4TU1A 1VCFA 1SO5A 3WJZA 2HS6A 1MEIA 4LUJA 4PEKA 1L6YA 4LVDA 1DKWA 1RQHA 4FX8A 1GQNA 2JKEA 3S5YA 1PL9A 1YTEA 3S9YA 4O4WA 3TH6A 1O5XA 1PHQA 2YYUA 2ZRZA 1T99A 3L66A 4Z1BA 2XN0A 1F6KA 4WOQA 2DZXA 2BSLA 3B0UX 3NVTA 3CU2A 1IXPA 1TMHA 4PTNA 2E5DA 3O6DA 2QR6A 4PA8A 1KM2A 5IBXA 2A21A 1FDJA 4OGZA 3M5VA 3BW2A 3GKAA 2ZZ7A 3IVTA 5G5IA 3IVUA 3FJLA 6TIMA 1H60A 1H7OA 3E02A 3EX2A 3NOEA 3CTLA 4HSOA 4QITA 1JCYA 3EEGA 1BTMA 1GOXA 4NJKA 5LNRA 4XTDA 3BLIA 3W2MA 1SZFA 2ZA3A 4RZ5A 2Q8LA 3PUDA 2ATMA 3FJ6A 4AAJA 1NVMA 4OU1A 1WOBA 4FXRA 3C52A 3NA8A 1N7KA 4RR4A 3L67A 1TTJA 3W72A 3W1UA 3M9YA 3C56A 2QUUA 1OFAA 2C6QA 1Y0EA 3LDVA 2ZQ0A 1TTPA 1WX0A 1TPFA 3W7HA 1QO2A 3LM7A 4HNNA 5F4WA 3G1YA 3NXFA 2VFGA 3MP5A 4R53A 5I3GA 3BARA 3FLUA 4NNCA 3L5MA 1H50A 3WJYA 4AHOA 2J9YA 3PSWA 2ISVA 1ADOA 3T40A 3U6WA 2WSRA 1VR6A 3ABSA 4YXGA 3VKJA 3NM3A 1OHLA 4O52A 2EKCA 3GDRA 1YDNA 3TXVA 5LGXA 2CZEA 3NQEA 3V75A 3G18A 2QUTA 3GDLA 4IPIA 1OJXA 1R2SA 1EB3A 3NQMA 3DH7A 1OVDA 2PRLA 3W7DA 3LCGA 1RQBA 1NFBA 1DJQA 1Q6LA 3DZ1A 3UPWA 1IF2A 2AAMA 4JY8A 4YL2A 1RZMA 1YTKA 4X3ZA 2X16A 2JGYA 3M6YA 2H3BA 3A24A 3NQ2A 1IIGA 1AL8A 1OF6A 4Y8FA 1E51A 2DP3A 2CLHA 2Y88A 3S1XA 3SSJA 1SW7A 1L2UA 4BFAA 4K37A 4S2CA 3TX9A 4XKYA 5AHNA 1XFBA 1VHNA 1WBJA 5DXXA 3C61A 2QJHA 3W7JA 1M5WA 1A5SA 1DVJA 3BLEA 3KRZA 5D32A 3DU0A 5G4EA 5CPNA 3NPUA 3ATZA 1SFJA 3IVSA 1NF7A 3W83A 1LRTA 2OT1A 3W86A 3GKFA 1GEQA 1K03A 2CWNA 1GJPA 1HG3A 3DFTA 4CNPA 1LOQA 1TSIA 4LVFA 4QQ3A 4ZQRA 4M6QA 5FEWA 4W9TA 2GQ8A 1G69A 4S2BA 3SR7A 2E68A 4LV4A 2V5LA 4HIBA 3ABQA 3WJWA 4AHPA 1WXJA 4A22A 4FNRA 1O60A 2QCCA 3DENA 4AEOA 4MIMA 4HNVA 1B3OA 4EIVA 4QAIA 3O8AA 3NQCA 1KFEA 3W1LA 3NQ7A 2H3DA 1R2RA 4K38A 2ZTKA 2P0OA 3C4UA 4N4QA 5I3KA 3MI3A 1ZALA 2EHHA 3A21A 3GB6A 5GVJA 4FX6M 3GVGA 3I68A 3CB8A 5AHLA 1GVFA 1HTIA 3PUOA 4X22A 3OA3A 1VYPX 5F1UA 3PR2A 4PODA 4IX0A 3TC6A 4N9DA 5FF4A 2CFFA 3NYZA 3MHGA 5DCBA 5KINA 2F84A 4HSNA 1TPC1 3EWXA 1ZHAA 3RU6A 1VLIA 3IV3A 3SJ3A 3QFEA 2NZLA 2Y85A 1QNVA 4WY0F 3CIXA 3F03K 1YDVA 3E49A 1HL2A 3DAQA 3SIZA 4WY0B 4GNJA 5CZ0A 3EXRA 2QDHA 5K9DA 2Y70A 3C6CA 5HUPA 5LSMA 4UFKA 2JKAA 3S42A 3UWUA 2QCDA 4JNMA 2AQWA 3LI1A 5HWNA 3S0CA 4TX9A 5CKSA 1XDLA 1WA3A 4K6AA 1FCQA 1HUVA 3PVFA 1I2QA 2VEMA 3P5ZA 1DQXA 2V81A 4POCA 2QCFA 2ZYFA 2C15A 4RCXA 4ZQOA 2ZFAA 4O16A 4XTIA 4K8HA 3UXDA 4DBEA 3QW4B 1G4PA 3QH2A 3TU9A 5HNRA 5TBOA 3FYOA 2R8WA 5DBTA 4ML9A 5FF3A 4R34A 3HGRA 1S5TA 1MXSA 3P84A 3QSRA 4YCOA 1IXQA 1SZEA 1OFPA 1TJRA 1X1ZA 5C6MA 4OT7A 2CZ5A 4MY1A 4MYXA 3GZ3A 4O57A 5T26A 4QIUA 1V7YA 2A7NA 4O50A 4TO8A 2EAWA 4LS2A 2ABBA 2OX1A 3PB2A 4NJJA 4JYEA 4MZ1A 4NZJA 3GR8A 4A29A 3M5ZA 3W7MA 2GJLA 1VYSX 2J88A 4WY0A 1QDSA 1LM1A 5A5WA 5U7SA 4BI5A 5J5RA 4OHQA 2YR1A 3W88A 2ZCGA 3G0SA 1EP3A 2A85A 1W56A 1I4NA 2JKPA 3SGUA 3DFNA 4CCDA 3W07A 3FFSA 1KFBA 3RK8A 2WQPA 3LOTA 1RQEA 4NX5A 4Z1CA 1K7EA 2E77A 2WSYA 1T0OA 4KFPA 3UYCA 2ZTJA 2CLOA 4ADUA 2ATSA 5K7JA 3TNOA 4IJBA 3NQGA 3QYQA 3N2XA 3W9ZA 2I1OA 2C1HA 2J6XA 1IIHA 3G3MA 4N9BA 3HGSA 1FWRA 4BI6A 4MJMA 4MY9A 1KV8A 3LCLA 1A50A 4YWIA 4CLMA 1B9BA 1KA9F 1P0KA 2BWGA 3Q37A 3BGJA 1ML1A 3W76A 2G95A 3LTSA 2FPVA 2ZZ1A 1SR9A 2NV2A 3I7QA 1A53A 1PCWA 1AG1O 3ZS4A 4MZYA 3G0XA 1YXYA 1UB3A 1H61A 1QPQA 3UY7A 4IX2A 3C2OA 4NUWA 1F05A 4N6EA 4WXYA 3W1XA 1GYLA 1KLZA 1VHCA 3P82A 1Z48A 3GXPA 3HG2A 5LZLA 3SZ8A 4Y96A 1OX4B 1ICQA 2VELA 1LTDA 2Q8ZA 3H53A 1F6PA 1BWLA 4UMAA 1VH7A 4MFDA 4NJIA 4A2RA 1XUUA 3CT7A 2BXVA 2TPSA 4LS0A 1SZGA 4JR5A 1XBYA 1SO6A 3W73A 3M44A 1JQVA 5K2ZA 2Y7GA 4LW7A 4G1KA 3W7CA 3C3NA 3W70A 3EB2A 3EX6A 3TCEA 3NQFA 4WOZA 2CZFA 3STEA 1FXQA 1O5KA 5FEZA 1CW2A 1XBVA 1GG1A 2ZA1A 1GPWA 2R91A 4C1KA 3MHFA 3CM4A 2V30A 4D2JA 1ME7A 1I2OA 3C2VA 1OX5A 3TW6A 5LKYA 4LU0A 4J9JA 4NU7A 2V82A 5EBUA 4NNAA 1P5BA 4WXZA 1KFJA 1QO5A 4ZQPA 2C0AA 1F74A 1FX6A 1LROA 4FEZA 4LY8A 5D2XA 4JTSA 3LB0A 4JYFA 3TV8A 3M1ZA 3VE9A 4DEFA 4TMBA 5HQEA 4ZZ9A 1JR1A 4IQLA 2PRHA 1GYNA 1YXDA 1H7XA 3NZ1A 1LP6A 3BG5A 3SY5A 5AFDA 3G1FA 4FIRA 3EKZA 3O15A 1I2RA 4BF9A 3ANYA 1GVSA 4QNEA 3V1PA 2OZ0A 4NX0A 2C3ZA 3G22A 4ADSA 1OX4A 4M5PA 4Q4KA 2Q3RA 1KTBA 1J5TA 1CI1A 1QWGA 1PS9A 2ISSA 3NPVA 4HKPA 2IQTA 4ZVJA 2R94A 3B05A 5H2ZA 4R33A 3PB0A 2ZA2A 1QFEA 4GUHA 2UV8G 2H90A 2WOQA 3DKJA 3W2NA 1WAUA 5F2GA 1TTQA 1VJIA 4FNPA 1XL9A 3M16A 1N8FA 3TSMA 2E6FA 3DFPA 3W7LA 5F4SA 4DBDA 3BG3A 2Y89A 2QCEA 4MOZA 4O28A 1H7RA 2OT0A 3VFLA 3PY2A 5F1VA 3SGZA 2ZRVA 4HHPA 1P0NA 3C2FA 3PBUA 1AL7A 1H1ZA 2QEZA 2ZRWA 1OK6A 5IBXC 4RXFA 4CQAA 5BMXA 1GTHA 4HNUA 2QJIA 1VLWA 4AH7A 3UQNA 2X1UA 1P4CA 3NO5A 2Y7EA 3N14A 3U8GA 2WSQA 3GIYA 3FEMA 2ZZ2A 1A5CA 1XXXA 1P1XA 3W7NA 4IPJA 5AC6A 3LX9A 2V5BA 3L65A 4EOUA 2Y6ZA 1F76A 1KFLA 1I45A 3L9CA 4ZQCA 1C8VA 4PFMA 2X30A 1FCUA 3W2JA 1SUXA 4CCEA 2DZPA 4GFSA 1PHWA 3B0PA 2C14A 2X2GA 1DOSA 1W54A 1WDWA 1W3IA 5D2TA 4UTMA 3I6RA 2WNQA 4A3UA 2ZRUA 1UCWA 3EWBX 3KAOA 2GJNA 1H51A 4I9AA 3KFTA 4M19A 3YPIA 2E6YA 3PULA 2B0MA 4JX6A 1VZWA 4JIPA 2WKJA 4DF0A 4GRSA 2G97A 5C55A 1EWEA 5E1QA 3GR7A 3PBYA 4KWWA 5L6UA 1KM0A 3MI2A 3M7WA 1TYGA 1O4UA 2QCMA 1VC4A 5FEPA 4XKYB 4ORIA 1K8XA 1TIMA 1TJPA 3BV4A 5G2IA 4O14A 4HN4A 1UUOA 3F4WA 4UTIA 1THFD 1R2TA 2WJZA 3NDOA 4UTLA 4O10A 1TPH1 3P5YA 5AHIA 3TSBA 1JCLA 4FNQA 5DELA 1S5VA 1UUMA 1ZY9A 5KZEA 1JUBA 3EXSA 3G1DA 4IMEA 3OHIA 3VNDA 5AHEA 2YDAA 1OX6A 3BK0A 1BWKA 3LLDA 4MJZA 1GWJA 3IIPA 4FO4A 2B7PA 1JRCA 3GNNA 3W7QA 1KM6A 1WV2A 4MYAA 1VRDA 3EWZA 3STCA 3N34A 3VI2A 1G7UA 5BW6A 4IMGA 4NNBA 1ZAJA 1A5AA 4UFJA 2CLKA 3UPBA 5FF7A 1VYRA 1FWNA 1YPFA 5TIMA 1Q6RA 3N19B 5CZSA 1U5JA 4DF1A 3NR0A 2VENA 4U4MA 1DBTA 2B7QA 2NWSA 3CEUA 3W87A 2E5BA 4LVBA 2BTMA 3SW6A 3DBPA 4JX5A 5CSRA 3SFKA 1B4KA 3R89A 4BK9A 2YX0A 1G4SA 3I7SA 1L6WA 2GQAA 4UTTC 3W1AA 3QPYA 4JD4A 4QSHA 2RDTA 3BLFA 5L9FA 2X1SA 3MO7A 3GAKA 3WK0A 4UTWA 1XCFA 3HPXA 3LXCA 3N9SA 3O16A 4KFOA 2WV8A 4KFNA 1YXCA 3G24A 2YW4A 1DQWA 5SWUA 2R14A 1EUNA 3DI1A 3G1HA 4UTTA 3K30A 2WO5A 2A0NA 3A5VA 3LV5A 4UMBA 4MFEA 2QCDB 3INPA 3JR2A 5DCDA 3WJSA 3UWZA 4MLRA 1QMLA 3S5NA 4AHQA 1RV8A 5FI8A 1YTDA 3R5EA 3TR2A 4B5NA 4AXKA 4K8EA 1AK5A 2ZZ6A 4AB4A 1BEUA 3T7VA 3UZ5A 1Q6QA 2QJGA 4OQVA 3LHZA 3NQ8A 4C1LA 3G1XA 4QISA 4JX4A 3IGUA 3IIOA 3NL3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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