2NW0A

Crystal structure of a lysin
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
GYIVDMSKWNGSPDWDTAKGQLDLVIARVQDGSNYVDPVYKDYVAAMKARNIPFGSYAFCRFVSVEDAKVEARDFWNRGDKDSLFWVADVEVTTMSDMRAGTQAFIDELYRLGAKKVGLYVGHHKYEEFGAAQIKCDFTWIPRYGAKPAYPCDLWQYDEYGQVPGIGKCDLNRLNGDKSLDWFTGKGEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The 1.6 A Crystal Structure of the Catalytic Domain of PlyB, a Bacteriophage Lysin Active Against Bacillus anthracis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Unidentified phage
molecule keywords PlyB
total genus 71
structure length 189
sequence length 189
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2006-11-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2nw0A00
1CGXA 2DSWA 4W87A 4FF5A 5A8MA 1H41A 2E9BA 2WHMA 1LL7A 1ODUA 1E6ZA 2ZUUA 3AMKA 1AMYA 5GNXA 3AHZA 2VCBA 5A6LA 3VIMA 2UWFA 3AS3A 1SR0A 1E71M 2ZX5A 1QNPA 1AQ0A 1BLIA 3OB8A 2V3EA 5E0CA 1JL8A 4QLKA 4PMOA 4UQDA 1E72M 1WDPA 1GCYA 1JDCA 2Z1KA 4P7RA 3KL0A 5ECUA 3AOFA 4ATWA 1M03A 3D5HA 1WCGA 4H8UA 1J10A 4JHOA 4WSKA 1OINA 4HMDA 5A8PA 1E6NA 2VZOA 3CLWA 3UG4A 5BRPA 3B9AA 1OT2A 1CGUA 3RIKA 5I23A 1MXDA 4UFIA 4GI8A 1JZ4A 4U2ZA 1V6VA 1MQRA 1UD5A 3T0AA 2JALA 2PWHA 1GZJA 5A6BA 3AJ7A 4W7WA 1JGIA 2XFRA 1GVIA 4ACYA 2ZIDA 2J7EA 1DWJM 4XZBA 2V5DA 1HF6A 1X1NA 3MV01 4MB3A 4OKDA 1JYVA 1DEDA 2OWXA 2J7HA 2JFEX 4J27A 1LLOA 3VPLA 1CYGA 1XV8A 1CLVA 4WJXA 2CBJA 2BY0A 4PMVA 4GI9A 1VB9A 1DWIM 1ISVA 1XRVA 2E3ZA 1IZJA 2JIWA 3RDKA 1KFWA 4X9YA 3K4AA 4UFHA 4AZIA 1CGVA 3VDHA 4D6JA 3WMCA 1UZ1A 2JF6A 2C7FA 5IDIA 3QGVA 3UCQA 5BYWA 4MNMA 2X0YA 4XZWA 3WFLA 4PBGA 2YOCA 3AIQA 4IPNB 4P8VA 3RM8A 2ZOXA 3CZKA 1WP6A 1Q6CA 3BSGA 1HKKA 2VI0A 3GNRA 5FCZA 4CU8A 1E55A 4N42A 5HBFA 3EDJA 4BQ4A 4PTVA 3CUFA 1UWRA 1V08A 4QCFA 2CKRA 5A2CA 2QPSA 2ZUVA 2VUYA 4UOQA 3SUWA 1S46A 2Y5EA 6CGTA 5ABEA 3VD3A 5EB8A 4D72A 4AD4A 5JIPA 1WKYA 2D0HA 2J7BA 3AI0A 3ARYA 3F4VA 4MJ4A 3WD3A 4XB3A 1E6RA 3VM5A 3J7HA 2CBVA 1B3ZA 3T2PA 5FD0A 3QHMA 1UA3A 4CCDA 4AW7A 3ZJ8A 4HP5A 3AIWA 1KBKA 1GHSA 1W1VA 1OIMA 3VGBA 5HOSA 1VJSA 5A6KA 4NZCA 2F2HA 1UD3A 4D6GA 3L4VA 1CGTA 4ZXOA 2QPUA 2WSPA 3WDIA 3ZSTA 2CESA 2ZWZA 1SYTA 5IHRA 1C7SA 1VFUA 5A6MA 2VOTA 1LL4A 1BFNA 2GSJA 4J3SA 1J0ZA 2VTFA 4WKFA 3SCSA 2IUZA 1WZLA 4TVUA 1TR1A 4HZ7A 1AVAA 1W1PA 4U2YA 4AY1A 2CITA 5I5RA 3VMOA 5IXEA 1UKPA 2YKKA 4PCTA 3T0BA 3WH5A 2WZEA 5CPQA 1QVBA 1LJYA 3E1F1 3WH8A 3WBEA 2GVYA 5JBFA 4AD0A 1WZMA 2OWWA 1K6AA 3CZ8A 4P7OA 3RMEA 1FP9A 2EO7A 1VJZA 3BAYA 1ZJAA 1EOMA 4UFKA 3RM9A 4AIEA 1L8NA 2UY2A 5CSYA 1GOQA 1H5VA 1XD0A 4F79A 1UH2A 2E8YA 3AXXA 2JE8A 8CGTA 1G9HA 3LPFA 2W66A 5HPCA 1V0LA 4Y7EA 3TTSA 4RE2A 3ARQA 2JIEA 2OYLA 1I1XA 1Z32X 2XVKA 1OGGA 5E9AA 4PTMA 3ALGA 3DYMA 4P7LA 2VZVA 4DWSA 2BNJA 3WUEA 3WDQA 5A6BD 1HJQA 3ARRA 4B9ZA 2IXVA 2OSXA 3WQ8A 2PI6A 5D8WA 2OYKA 1DTUA 2VRKA 4PMZA 4JKLA 2CBUA 4MNKA 4E2OA 3ZOAA 1X6NA 5ABHA 5A8QA 4CVUA 2W91A 4B3KA 2XFYA 1R7AA 1LQ0A 1VEOA 3MUAA 4AZGA 1H0GA 1E6QM 2WCSA 2BVTA 2WZHA 3B8SA 2OWCA 4MB1A 5EBAA 1CENA 2ZUTA 1D2KA 4YN5A 1F4AA 3VILA 4CCEA 2PC8A 3AHVA 4ZE5A 3VNZA 1NWUA 3GYCA 1GQIA 4Z2IA 1MFUA 2ZE0A 1HN1A 4DM2A 3TOPA 1V0NA 2G8ZA 2WLZA 5ABGA 1V6YA 4D6EA 3EDEA 2QF8A 2VR5A 4A3YA 3WD4A 4AZ6A 3CMJA 4CD8A 2XVLA 1CGYA 1EDGA 2YBTA 3NJ3A 4PSRA 3WD2A 2C8NA 1UR4A 1FHLA 1NM9A 3VIHA 2PF0A 1HJVA 5A8NA 1ISXA 4IM4A 4EAMA 1MQPA 2J8GA 2YDSA 3LMYA 4UQ9A 2VNCA 3HN3A 1JD7A 2NW0A 1E5NA 1E4IA 3VGFA 3UEQA 3WL1A 3AXIA 5ABFB 1TVNA 4CKQA 1JXKA 3FHAA 4NRRA 4AIOA 3ZR6A 1UOKA 4UZSA 5IFPA 2WANA 1XCWA 3AHYA 2ZUSA 1EO5A 1YQ2A 2CKSA 4CUCA 3IK2A 3MUZ1 3CHEA 4U3CA 1E4LA 1V3IA 1N82A 1V3MA 3VGEA 9CGTA 4FLSA 3WY1A 4CN1A 1C8YA 1GOWA 3GTNA 2WMKA 4MTVA 2WVVB 3ECQA 4QFUA 7A3HA 2VCCA 3WIJA 3WNPA 4AD3A 3AHTA 5AY7A 2CPUA 1QPKA 1PZ3A 5E6ZA 3BCDA 4BQ2A 1LG1A 1W9DM 2XHYA 3BXWA 1JNEA 2J77A 3SCVA 4HOWA 2BY2A 1US3A 4UFMA 3ZM8A 1TA3B 1CTNA 1UR8A 1QHPA 1W3JA 4YHEA 4Z2KA 3A6OA 4XV0A 3O2LA 1TUXA 5DF0A 4BZYA 3AMLA 3DECA 4WF7A 5BXSA 2DPEA 5LA2A 1TVPA 4D6HA 1W9VA 7CGTA 1NOFA 4CCCA 2ZXAA 5IFTA 1M7XA 2YDRA 2WMIB 1J0IA 4GKLA 1RP9A 1KWKA 2W63A 1JFXA 1MW2A 1R86A 1JI1A 1OGSA 1PX3A 1JG9A 4JAWA 1G0CA 2BFGA 1TG7A 2EPNA 4AZCA 3MMWA 4OOUA 1PZ2A 4S3JA 1R8LA 5D9MA 2DSZA 1V3LA 3UG3A 1JI2A 1E6SM 1GJUA 2HVMA 3VGHA 3AIBA 5A3HA 4HZ6A 1BPLB 4JKKA 4Q22A 4JIEA 1I1WA 5D9NA 1UZ4A 1BHGA 1C92A 3L4WA 1ISYA 2D20A 4BQ3A 5A94A 3WDJA 1EQCA 3L4YA 3OGSA 1CXFA 4TUFA 5D8ZA 1QI5A 3GZAA 4C7DA 3WSUA 1ZB5A 2PWGA 1LG2A 5GNZA 3WQ5A 2WW5A 4GZEA 1W1TA 2CCRA 1R7OA 3W6LA 5C8BB 1W9XA 3W6MA 1OD8A 1EA9C 1QW8A 5FL1A 1TMQA 3PZ9A 3DYPA 2VRJA 1HNYA 2QHAA 4WKHA 2D3NA 3CZGA 3HJEA 2WBKA 5LYRA 2WVUA 4U5KA 4TTUA 1JZ5A 3POHA 4JL2A 4FMVA 5FL0A 2WVVA 4JL1A 4AIUA 5CPSA 1E6PA 1J0YA 4W93A 1NQ6A 4QLJA 1C8XA 2W67A 3AS2A 1KXHA 3WQ6A 3BMVA 1VIWA 2PBOA 3AZRA 1MW0A 3ZT6A 4M29A 1BYDA 2WCAA 4KRUA 1TA3A 3WEZA 3T08A 3VD9A 1A3HA 1TE1A 4BQ5A 4MB4A 3WBAA 1DWGM 1YHTA 1EGZA 1QHOA 2CETA 4W8AA 5F7UA 1B30A 3AYRA 3NDZA 1KQZA 1UD8A 5I78A 4FLRA 3CHCA 2YIHA 3NYDA 2WMIA 2G3JA 4P8UA 4WKAA 1KQYA 1IZKA 2XM1A 5CPTA 1H1NA 3PZOA 1OBAA 4W7VA 2O9OA 5HPOA 3U5UA 3L4XA 3ARUA 4TVCA 3VIOA 4K68A 1AQMA 2W92A 2VZTA 2EPLX 2EJ1A 2ZUWA 3L4ZA 1A47A 1TZ7A 1E15A 1JDDA 2W61A 3OLDA 4HMEA 3RJXA 3BLKA 4HZ8A 3FXYA 1E5JA 1VF8A 1KR1A 1DWAM 3GH7A 4TX8A 1K9FA 4QCEA 1DHKA 5D9PA 1FOBA 4JKMA 1BYBA 3FN9A 2WM0A 4TTGA 1CIUA 3T0DA 2XWDA 2GJRA 1ZS2A 4H2CA 1LWJA 1BYCA 3B9DA 5EFDA 2J7GA 3AZSA 4AEFA 4AZ5A 2Z1SA 4V2XA 1HL9A 2V3FA 1JZ6A 3WF3A 3IAPA 1VFFA 1E70M 3L4UA 2JF7A 4A4AA 4KRTA 4PYSA 2WMFA 4AMCA 4W8BA 3T2QA 1KGWA 1CXLA 2EPKX 1B3VA 1VENA 3TP4A 3VIFA 1NP0A 5BXRA 2XIBA 1AQHA 4D6DA 5CG0A 1IT0A 1NH6A 4D1JA 5A6JA 2XPKA 4LQ1A 2X1IA 2DT3A 3NUKA 3SCQA 2DH2A 2WVTA 4M8UA 1NWRA 4DWSB 4UCFA 2W4XA 3SEPA 2VO5A 1CLXA 3UESA 1UKSA 2GFTA 4PUDA 4QDMA 1OGBA 2J79A 3GXFA 3MSGA 1JAKA 4LYRA 1E9LA 3QOMA 2YBUA 5GPRA 3VVGA 3VO0A 4HPGA 4M81A 4U31A 5BXPA 1WZAA 3BAKA 4PTXA 2ZXQA 4CN6A 3O6AA 5KZ6A 4H8VA 4OOZA 3GH4A 3QR3A 4J3UA 4DM1A 4MNLA 3HMCA 3UG5A 4DUVA 2AMGA 2XFFA 5DMYA 4AXNA 2A3HA 2V38A 1HT6A 4GXPA 4GZJA 3NSMA 2EQDA 1JYWA 1RD6A 2BXYA 1H09A 3WUBA 4AC1X 3SUSA 3L2LA 3A4XA 3ZIZA 2YL5A 1CWYA 2XSAA 1BVNP 4PMRA 1V0MA 3NDYA 3RM4A 1JYXA 4MADA 1GQLA 1E0VA 3N9KA 1FFRA 2VJXA 1V3JA 3K4DA 4ZENA 4HPHA 1ZBVA 3FAXA 4L4OA 3WF0A 2WLYA 3VDBA 4UTFA 1ITXA 2G3NA 4N0RA 5JBEA 1WDQA 3EDKA 3EDDA 1QNRA 2CIPA 3DHUA 1BGAA 3CIVA 4EE9A 5CJ5A 5C70A 2D24A 2XTKA 1WNOA 2QV4A 3CZEA 3SCWA 1UD6A 4PN2A 2ZUMA 4A3HA 1V02E 4NSBA 3EMQA 1V6WA 1EH9A 3AYSA 4AISA 3AHXA 3RILA 2VMFA 3WELA 1GVYA 2WHKA 5A6AA 3W24A 4S3KA 4F8XA 3VM7A 3WH7A 3AIVA 1WO2A 3L4TA 2YLAA 2QMJA 3N18A 5FOOA 3QHNA 4AZ7A 5I0DA 3WH9A 1H0IA 4MPKA 1JIBA 4RE4A 3ARZA 3WD0A 3KL5A 3OG2A 4E8DA 2UY3A 1GUVA 1NOWA 4EKJA 1QNSA 4BF7A 2V5CA 2CERA 3OIHA 1ITCA 4PMQA 1ISWA 4MJ2A 4DWSC 1FH9A 3ARVA 1B3WA 1ZJBA 2BXZA 3N17A 1OSEA 3GDBA 4U5IA 4P8WA 4P7QA 1NARA 2DIEA 3W0KA 2PBGA 4L4PA 3W53A 3ZJ6A 3BAXA 3ARPA 1KCLA 4UQAA 5DFAA 4QAWA 2OSYA 1VBRA 3A47A 1UA7A 1KR0A 3W82A 4IUGA 2V3GA 3VD7A 3WH6A 1TFVA 4WSJA 1JDAA 4MAVA 2XJ7A 1O6IA 3CH9A 1Y7VA 1UWIA 5M03A 1DWHM 2ZX6A 2ESCA 3S2CA 3VX1A 3FNDA 1E4NA 1EHAA 6TAAA 2TAAA 4HA1A 2X8RA 1XH0A 5GNYA 3WDRA 1WPCA 1CPUA 1XGZA 4CVWA 4AZCB 2CBIA 1QI0A 4GQQA 1BAGA 3PZTA 1GOKA 1GOIA 1XH2A 2RGLA 3W37A 5M3WA 1E4MM 1UD2A 2J7CA 3PHAA 1HVQA 3BH4A 5CGMA 3W29A 1VAHA 1BG4A 4CD5A 1W2PA 2WKGA 4TVDA 4HOXA 1UWQA 1K9DA 4XX6A 1H49A 3GM8A 1MXGA 3CZLA 1BGGA 2BVDA 2E40A 2CNCA 1OM0A 2EBNA 1H11A 3OA5A 2G4FA 4ZFMA 2J78A 1H4PA 1ZBCA 3AMGA 3W4RA 3WUFA 1V03A 1JXJA 5CLWA 2YL9A 4CU7A 1J01A 3SIMA 4NF7A 1QBBA 1Q6DA 3IANA 5BWFA 2XUCA 2W62A 1JD9A 2EPOA 3ZT5A 1VEPA 2A3BA 3IAQA 5I3DA 4BS0A 3K8KA 1JZ3A 1BG9A 2VRQA 3W25A 1E40A 2WCGA 3VIIA 4MB5A 1FH7A 3ZJKA 4HMCA 4M56A 3WQVA 2VVSA 3OLGA 3AMDA 2PWFA 2VX7A 3WDPP 2FGLA 1BF2A 1EXPA 1RP8A 2A3AA 3CMGA 1GPFA 2YA2A 4GINA 3EMZA 3VX0A 1SFSA 2DIJA 2ZX7A 1WE5A 4PEEA 3I3BA 5IHSA 3VGDA 1PIFA 3DC0A 3N11A 1QOXA 1MW1A 1JF5A 4B3LA 1B2YA 3A4AA 2XGBA 2WXDM 2VX4A 5AYIA 1HX0A 1CBGA 1W3HA 1TCMA 1MYRA 2WSKA 1GQJA 3ALFA 4W84A 1E43A 3OZPA 4KH2A 2VVNA 3APGA 3WF2A 1V6UA 5FKYA 2CXGA 2CYGA 2FHFA 1J12A 2CEQA 2WMJA 3WN6A 3VOCA 1J18A 3EBVA 1B3YA 1C3FA 2O9TA 4CD4A 1HKMA 3VDAA 4DWSD 2Y8VA 1L0PA 4J7RA 3CPUA 4X0NA 2ZX9A 4D1IA 1CXIA 1HJSA 5LA1A 1PBGA 3VIGA 3CHDA 3NIYA 1RPKA 3CUGA 2VC9A 3WF4A 3MUY1 1XSIA 1CECA 1Q6GA 5GQBA 3BLPX 2XSBA 1M04A 4YHGA 2D1ZA 1CXHA 4HOZA 3AICA 3AMCA 2F8QA 1UG6A 1XC6A 4LYQA 3RO8A 2ZWYA 4WIWA 1QW9A 1UD4A 2XYLA 4RL3A 4B9YA 1C93A 2D3LA 1H3GA 3VIKA 2VR4A 1FP8A 4GO8A 5DO8A 2FHBA 1Q6EA 3WFZA 5BRQA 3WNLA 1HIZA 3NSXA 4ACZB 2EEXA 3A3HA 5EFFA 3SCNA 5HXMA 3GXIA 1OB0A 3ZJ7A 1UH3A 4F9DA 2XIIA 1KXQA 1XSJA 1C90A 4AYSA 1CEOA 2Y4SA 1OD0A 4M24A 2XVPA 1MQQA 3G6LA 2EXOA 4D6FA 4FLOA 2WZIA 3PZNA 3SCUA 1BQCA 2DT0A 2DEPA 1D3CA 4ZXLA 4URIA 4JFTA 3SUTA 1XYZA 4JCLA 1UQZA 4KGLA 1MFVA 4FK9A 5E6YA 3AZTA 4W5UA 1JZ8A 2VCAA 2V3DA 4GI6A 1M01A 3AQUA 1V02A 3CUIA 4JFSA 1W91A 2WPGA 4W85A 1QBAA 2X09A 4HU0A 4LPCA 4PMXA 4QLLA 5M17A 1MWOA 4MDOA 3PBGA 2E4TA 3W81A 4MNJA 3CBWA 1XCXA 3CGTA 4PUEA 2GK1A 2BVYA 3VD5A 2IXUA 1W3KA 3N13A 5KEZA 3MMDA 3W28A 3DHPA 3A4WA 1KXTA 2PWEA 4WLCA 2GJXB 1J9YA 2E8ZA 1KB3A 2O9PA 3WNOA 5EMYA 5I77A 5CZKA 3F5LA 4LXFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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