2OCZA

The structure of a putative 3-dehydroquinate dehydratase from streptococcus pyogenes.
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
224
structure length
218
Chain Sequence
AMRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLGQVTLNDMKRIIEVLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title The Structure of a Putative 3-Dehydroquinate Dehydratase from Streptococcus pyogenes.
rcsb
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
total genus 73
structure length 218
sequence length 224
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2006-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2oczA00
3EEGA 1G69A 4UC5A 2PURA 3O1NA 1ZAHA 3LCGA 2VEPA 2ZTJA 1FDYA 2A5HA 3GDKA 4X22A 1OYBA 3W7DA 2Q3OA 3QSTA 4MKNA 1ICQA 4HSNA 4O14A 4UTIA 2ZRYA 3GXNA 4WOZA 1UUOA 1FCVA 3K30A 1KLZA 4GE8A 4ADUA 4O10A 1EUAA 3G0UA 2CLEA 2ISWA 2YFNA 1KBJA 3G1YA 1W8SA 3G1SA 3W76A 4CLMA 4O57A 3IGSA 3TSMA 1SZNA 8TIMA 2P10A 3B0VC 5FI8A 5I3IA 4UTTC 5AHMA 3NQ7A 3L5LA 2PRHA 4FIRA 4OQVA 3BGJA 5AHFA 3G1HA 3SJ3A 1JQVA 2VFGA 1H50A 7TIMA 1AW1A 1L2UA 4WY0A 1JCJA 4DXVA 1VS1A 3WJZA 3TMLA 2Y70A 3W87A 4TR9A 1R2SA 3O07A 1R2TA 3FKRA 5F4SA 4DQWA 3HPSA 2CU0A 3T55A 1FX6A 5IBXA 2ZTKA 4O1BA 3NYZA 2A0NA 3FOKA 4M7SA 3FJ6A 1LOLA 1Z42A 3E49A 1ME7A 4IPJA 4JTUA 1NAL1 1VC4A 1YTKA 2OT0A 5LNVA 1XUZA 1VYRA 2FLIA 3KXQA 3W1LA 4C1KA 1RV8A 3W7NA 3UWVA 3IIZA 4RJEA 2NV2A 1EA0A 2YXGA 3QMSA 3M9YA 4IWWA 4IOTA 5C55A 1LORA 3O16A 3NO5A 4O1DA 3NQ8A 1OFDA 3DFOA 4QIUA 1OFQA 1R47A 2HS8A 3UWYA 4WY0F 1W31A 2RH9A 4LV4A 2C18A 2VFIA 1VH7A 4FXRA 4M5PA 5AC6A 3T4CA 4AB4A 3GNDA 1X7FA 3MHFA 1KM6A 2CLMA 3TAKA 4JTLA 2DZXA 3UXDA 4MJZA 3USBA 3BARA 1K03A 1PV8A 4Z1AA 1W5NA 3W7JA 2A21A 5AHIA 1QNVA 1W37A 4N6EA 2G5WA 3B4UA 3CT7A 1KFKA 3UY8A 1OF6A 5CSRA 1EIXA 4HKPA 3TDFA 3QPZA 5C54A 1PHWA 3WK1A 2JGQA 4BF9A 1KTCA 2YDAA 2F7FA 4TX9A 1WOAA 5AOUA 1THFD 2YZRA 1QPNA 5D33A 2FIQA 3LXCA 5KZMA 4GWEA 3UYCA 1DVJA 1IF2A 4QISA 4TO8A 1K8XA 4DF1A 1YDNA 3S0CA 1S5VA 4MLJA 4OT7A 4O0ZA 5BNKA 3DFQA 3S9YA 4N4QA 4WX2A 3OHIA 1KFEA 3OA3A 5AFDA 3MJYA 3NZRA 2HMCA 4CQ9A 2Q8LA 4JTIA 1TIMA 1YPFA 4LU0A 1JCXA 4I7WA 4RXGA 1H62A 3PG8A 5K4XA 2EKCA 1GG1A 2C6QA 3L68A 1GZGA 4AWSA 5KITA 1TPUA 1DORA 4ZZ9A 1HL2A 2C3ZA 3UXAA 3GVGA 5E1QA 3BG3A 3LTPA 4RLIA 3GK0A 3IVSA 1I45A 1TPVA 1BWLA 3MP3A 3L2IA 2F84A 5AN7A 4JIPA 3W1AA 2E5BA 4XQ6A 2XN2A 4D2JA 4PH6A 2ZYFA 3LBMA 4RXFA 4LVDA 4UR7A 5IBXC 4CCCA 3C0JA 4AF0B 4JYEA 1H7WA 1UCWA 5TQLA 4UTKA 4UCGA 3GDTA 3M1ZA 4JN6A 4BK9A 2I14A 4JXCA 2OJPA 1SO5A 1V5XA 1JVNA 1KLYA 4IXHA 3OBKA 3EB2A 5LKYA 2FQIA 4LNYA 3EWYA 5I3FA 2YCEA 3N14A 3PM6A 4IMCA 1GVSA 2Y7EA 3W2LA 3R89A 4AWUA 4LVAA 1VJIA 4BR1A 3TCEA 3FYPA 3HGRA 1A53A 1YTDA 1VCGA 4KWWA 4YXGA 3PF3A 1I2OA 1KFCA 4IQLA 3EX1A 1WQ5A 2Y7DA 5K3VA 2QCMA 3W7KA 5F1VA 2GJLA 1I2PA 5G1YA 4DBDA 3TJLA 5CPLA 3HG5A 2ZZ3A 4EWND 3MO7A 1AW2A 4GBUA 3STCA 4XKYB 5F2IA 2P0OA 3WK2A 4O17A 3F4WA 3LV6A 4LOCA 5FF3A 5F2LA 4H6KA 1KBIA 4AVFA 2EPHA 3KRUA 3Q94A 4PA8A 3W7IA 2TSYA 4E2DA 3UPWA 3LOTA 3SZ8A 4MFDA 1ALDA 2ZDRA 3IIXA 3IEBA 1W3TA 5D37A 2PC4A 2V81A 3L5AA 4JTJA 3GXTA 1P5BA 3G1VA 3TE9A 3W72A 4B5NA 1F74A 2X1TA 4L4LA 4O4VA 3O6DA 4MPQA 4S1FA 4NT0A 3UPBA 4NX0A 4MUZA 4K6AA 3STGA 3NQCA 3Q37A 4OV9A 3V1PA 4AAJA 1KFBA 4Q4KA 3D0CA 3L21A 3LX9A 1SZEA 1G4EA 5F4WA 1WV2A 3FFSA 3I6RA 3NQMA 4DEFA 4A3UA 2NX3A 3B03A 3C61A 2CLKA 4W9TA 5LHEA 3MI6A 4HIBA 3W1MA 5AHEA 1OF8A 3OVQA 5U4NA 3O15A 1S5WA 2QAPA 3EWBX 4MIMA 1F2JA 3GKAA 3GR8A 4Y6GA 4IGHA 4UTUA 4UFIA 1NVMA 2CW6A 4IMDA 3EWXA 2HTMA 2WNNA 2Y89A 4O1CA 1F73A 3HB9A 1PVNA 3W07A 1OK4A 1LBLA 3N19B 4Y8FA 5FEPA 3M44A 6TIMA 4Z1DA 1YDVA 4ORIA 1G4SA 1H7NA 1KM5A 1TRDA 4LUJA 1M5WA 1QFEA 4AF0A 1BEUA 2YX0A 1RQBA 4Z1CA 2NX9A 1QOQA 1LLZA 2Y7GA 4UMAA 4NQ1A 2E6YA 5SWUA 4FHAA 3QJAA 4HT3A 3CIXA 2J88A 4WXYA 5D02A 3M5YA 4GXMA 2EAWA 3IVTA 4JY8A 2WSYA 2ZRZA 1FDZA 1G67A 2CZDA 4N9EA 2H3BA 3LTSA 4JGDA 2CLHA 1X1OA 4FF7A 2C16A 3UQNA 4JTSA 4UFHA 1T0OA 4UXDA 3WK0A 4O54A 3QYQA 1LM1A 2ZFAA 2A6LA 4O19A 3TK7A 4LW7A 4AWTA 2CZ5A 2ZCGA 1F5ZA 1KTNA 4O11A 3SW6A 1H7OA 4HHPA 3CWOX 4JDYA 2FPYA 1HFBA 1UUMA 1O95A 1Q6RA 2Y6ZA 3EX6A 2QAFA 4J9JA 1DKWA 1T8XA 5U7SA 5A8GA 3PWAA 4A2SA 3IRDA 4XKYA 1S3HA 4RZ4A 2ZRUA 3ATYA 4QJ1A 3E96A 3W70A 4UFKA 1EB3A 4XTIA 2QCDA 4TMBA 3L9CA 5D32A 1NF0A 1HTIA 4OBTA 2W6RA 5C5YA 1ML1A 3C2VA 3BLFA 3TMQA 3NZ1A 3MP5A 1YXDA 1E51A 2J24A 3W84A 4ADSA 1HUVA 4Z08A 5AYYA 1N8FA 1TTJA 3TUUA 4O28A 4IXXA 2R14A 3CM4A 1OFRA 3A21A 4O53A 2Y61A 2B4GA 2FDSA 1SR9A 2QF7A 1EP3A 3A22A 5CZSA 3E02A 5EPDA 4I9AA 1OFAA 1SZGA 2QCLA 3S5ZA 1U5JA 3G1DA 3CPRA 2WJZA 3MHGA 1VPXA 1UASA 4H4IA 1JUEA 1GPWA 2YPIA 5L6UA 1ADOA 1FWWA 3GB6A 3NQ2A 3S1XA 2VXNA 5LGXA 3P81A 2E6FA 2PRLA 3RFAA 3GNNA 3P67A 4M6PA 3I7SA 2JKEA 1N7KA 3LCIA 3MI3A 4G1KA 4QNWA 2EHHA 4DPPA 1OYCA 3STEA 4ZQNA 2GQ8A 4ZQRA 3EX4A 4HPJA 3HGOA 3HPXA 4UNLA 2Q3RA 1ME8A 1X1ZA 2DJLA 4NZFA 4AH7A 2QCCA 1XI3A 1YYAA 1GYNA 3QMTA 1EWEA 3TSBA 3U6WA 2O7SA 2Y63A 3S5YA 2Y85A 2DU2A 5L9FA 4AHQA 1LP6A 1ZFJA 1Q6LA 2QCNA 3TAOA 3HGSA 3STFA 3W2KA 3H53A 3LI1A 3P84A 4JTEA 2CLIA 3PR2A 4PTNA 2V5LA 4ZVJA 3SR7A 1KFLA 1V7YA 4N9BA 3PVFA 2CLOA 4BWLA 2ZZ2A 3NA8A 1TV5A 4KWVA 2YYUA 3PULA 5K9CA 3CLMA 4X2RA 5C6MA 5LZLA 1OX4B 3R2GA 1GVQA 1Q6QA 1JJKA 5DXYA 2FB3A 3N2MA 1YLVA 4YMZA 3HG4A 4OV4A 3V75A 1XFBA 4JD4A 1ME9A 4QAIA 3C2FA 4LVBA 5TBOA 4AHPA 1IGSA 3CU2A 4WUIA 2W0UA 2GOUA 1F05A 1PCKA 3G1FA 1GEQA 1GWJA 5I3KA 2VOMA 2QCGA 3W7CA 5D04C 1TYGA 2E77A 1OG0A 3NL2A 4A29A 3MW7A 3SGUA 3QQ0A 4GNJA 4UNKA 2WO5A 1JULA 4JTGA 4O15A 1KA9F 3PBUA 1H7PA 1NFBA 1ZNNA 2ISVA 3NM1A 3CHVA 2C13A 3M16A 2V2DA 3S5NA 3EXSA 4DPQA 1B3OA 3RF9A 1B4EA 4NJHA 1C29A 2VC6A 4MYAA 5A5WA 3ZR4A 4DBEA 1NF7A 1GVFA 2ZA3A 4UFMA 5KZDA 2V8ZA 1VHNA 1J5TA 3L5MA 3QW3A 3TFXA 2QKFA 1TMHA 5IM51 3G0XA 2NWSA 3NG3A 1O60A 1SQ7A 1RD5A 3G1AA 2X2GA 2OZ0A 3W7RA 5H2ZA 1PE1A 3PAJA 2RHGA 2ZRVA 1Q3NA 1WYIA 5J5RA 2NWRA 3F03K 3CIWA 4FX6M 1KW1A 2V2CA 5FF0A 2XN0A 1DL3A 1L6WA 3PY2A 1AG1O 3TR2A 1P0NA 4MZ8A 3KRZA 1W5OA 3M6YA 4IUOA 4O0KA 4ADTA 1SPQA 3I7QA 1OFPA 2J9ZA 1MEHA 5D2WA 2J27A 3KAOA 1B4KA 3FKKA 4M6VA 2XFWA 4NZJA 2WSRA 3CEUA 4QM1A 1EX5A 3TQ0A 5LNRA 4GUFA 5F2MA 5EA9A 1SSGA 3AO0A 3N3MA 4WQ6A 1KV8A 1WXJA 4DF2A 2CZEA 2TPSA 5K4ZA 5HWJA 3PUOA 3OVPA 3BO9A 3NEVA 5EKYA 3BGGA 3NQEA 4EOUA 3GKFA 1ZJIA 5KINA 1EP1A 1H1YA 4IX0A 4XTDA 2QDHA 1JR1A 4BWLC 4HNTA 2V30A 1DOSA 1LRQA 2C14A 1YXCA 4FX7A 3DU0A 2DZWA 1EWDA 3OVRA 1OX4A 3E9AA 4PC8A 5D2TA 5LGZA 3G3MA 1S5TA 1B57A 1F76A 1U83A 2GVGA 2QCHA 3TIMA 1G7VA 5HWNA 2AQWA 4ICNA 3TC6A 3VNDA 4X3ZA 4Z0JA 4CQ8A 3NL3A 5K7JA 1M7OA 3PC0A 1VR6A 1IIGA 5D03A 2WSQA 3RU6A 5HJLA 1IIHA 1LLWA 2FTPA 5T26A 4KKXA 4RR4A 2DZVA 4CNPA 2GJNA 1G4TA 1NSJA 4N9DA 3WJYA 3KFTA 3CQ0A 3RMJA 2O7QA 4JIQA 1X8FA 4CNNA 3CWNA 3ZFHA 3IIPA 4QSHA 3NM3A 1TJRA 5HR6A 5MHBA 3W86A 3T44A 1W5QA 1UJPA 4CQAA 3W7HA 3CTLA 4LT9A 4JNMA 1OK6A 4JTKA 3PG9A 1SFJA 1UBSA 3B0UX 3O06A 1OABA 2DZSA 1RZMA 2ATMA 1L9WA 3G0SA 3HBLA 2LLEA 1C8VA 3W71A 5CG7A 4UIOA 3EWWA 2H3DA 3S5OA 3W1TA 3C6CA 5CZTA 1GTEA 3E0IA 4ZMGA 1XM3A 4NJJA 2CWNA 2P1FA 1XBZA 4IJBA 1OX6A 4JX5A 3TXVA 4O13A 1SW7A 3IGUA 4N02A 1YPIA 3GXPA 1ZALA 3UD6A 4R7JA 2VEIA 3MYOA 2AGKA 5BMXA 3UWQA 3MP4A 3RNDA 1G6CA 5AHLA 1OFEA 4ZQCA 2EF9A 3JRKA 3E12A 3LCLA 1QPRA 4AXKA 2E68A 4E2BA 3PSWA 2FPTA 1H5YA 3FS2A 3UWUA 3H55A 1P1XA 4FNTA 2ZZ1A 2BLEA 2E6AA 1SO4A 2NXGA 4H3DA 1JUKA 3N9SA 2UV8G 1JQXA 1KM3A 3RK8A 2WPBA 3QMRA 3UZJA 2DZPA 3Q2DA 3R8RA 1W5MA 2C15A 1G7UA 4LS1A 3RLVA 3DGRA 3LRMA 3NQAA 3QZEA 4NJIA 3NPWA 4AHOA 2YGYA 2QEZA 3HQ1A 3CC1A 4FX8A 5AC8A 3DHDA 1CX9A 2BZNA 4MOZA 3HOJA 2QJGA 3M5XA 3SECA 3TC7A 1JUBA 1MEIA 1I2QA 1O4UA 1DJQA 3GLCA 1P4CA 3S42A 5CZJA 1JCYA 2ABAA 4JDBA 3W7MA 3P74A 2WNZA 5KTLA 4JTHA 5G2HA 3MMTA 1QWGA 3SGZA 2JKPA 4JTTA 5DBUA 1TQJA 3N9RA 2H90A 3EWUA 3LXAA 1WOBA 4JX6A 3R13A 2EGZA 2E5DA 3FJLA 2NV1A 1QO2A 5DCDA 5K9XA 2J9XA 4O18A 2CZFA 5HUPA 3DFNA 3GX9A 2VKZG 2C0AA 3TNOA 5HWMA 3W23A 3O6CA 3P8IA 4AEOA 1RPXA 1PCWA 3A23A 3FYOA 4CCDA 1WAUA 3NOEA 4DO6A 1FXPA 3A24A 1YXYA 3DKLA 1WA3A 3C4UA 1KM4A 4PODA 3QC3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EWC A;  3O1N A;  1ZAH A;  1FKX A;  3EDD A;  1R0M A;  4X22 A;  3RPM A;  2DT2 A;  3BJS A;  4MTV A;  1AFS A;  3CHD A;  3U2C A;  3LEP A;  4OZO A;  1UUO A;  2CKR A;  4W8L A;  3K30 A;  2O4Q A;  2C0H A;  2R1K A;  4B4F A;  4Q7B A;  1OIM A;  3AML A;  1FWJ C;  4CLM A;  3TSM A;  4PRW A;  4ATL A;  2P10 A;  5FI8 A;  4UTT C;  5AHM A;  3TTS A;  1RUS A;  3NQ7 A;  3U2E A;  1CLV A;  4OQV A;  3PNZ A;  5A2A A;  5JVL A;  2D3N A;  5DF0 A;  3UZX A;  3H7V A;  4C6F A;  2VFG A;  4J3W A;  1H50 A;  5FKY A;  3CQI A;  4WY0 A;  3GVR A;  2IKH A;  1E0W A;  3W87 A;  2CC0 A;  1R2S A;  4YYF A;  3FKR A;  1E1E A;  2G50 A;  4C6C A;  1LWJ A;  2CU0 A;  3ECQ A;  2Z28 A;  3T55 A;  1FX6 A;  2HQA A;  2A0N A;  2XVL A;  3FJ6 A;  1LOL A;  1Z42 A;  3E49 A;  1ME7 A;  1YTK A;  4IIE A;  4IQJ A;  1T7L A;  2OT0 A;  2C8N A;  4NRR A;  2VCB A;  1XUZ A;  3UEQ A;  3MQT A;  3KXQ A;  3UWV A;  2BXZ A;  3WL0 A;  3GXD A;  3NZQ A;  4HNL A;  1E70 M;  3P14 A;  3IWP A;  3N9K A;  1V08 A;  2VRJ A;  1XRF A;  4DWS A;  1ZZM A;  2YA1 A;  2ZX9 A;  4QIU A;  4FOU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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