2OT1A

Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with naphthol as-e phosphate, a competitive inhibitor
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
349
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title A hydrophobic pocket in the active site of glycolytic aldolase mediates interactions with wiskott-Aldrich syndrome protein.
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 140
structure length 349
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ot1A00
1Q3NA 4Y8FA 4HHPA 1H1YA 4R7JA 1OFQA 2Q3OA 4R34A 2DU2A 3DHDA 3U8GA 4NNAA 2WNZA 5D30A 3S1WA 5EKYA 4JY8A 2C15A 2TRSA 2Z1BA 4KKXA 4JX4A 1VCVA 3G18A 4BF9A 2DZVA 1TTQA 2DORA 3L5MA 3MI2A 4DO4A 4O1DA 3KXQA 3W87A 3I7SA 4XKYA 1WYIA 3LCHA 3V1PA 2WJZA 3STEA 4UTTC 1JUEA 3P62A 5FEZA 5I3HA 4UNLA 4MUZA 2VFDA 4GWEA 5D03A 5C54A 3CQ0A 3PAJA 4O19A 1SU5A 3Q37A 3WK1A 1OYBA 2NXHA 5LKYA 4ADUA 3B04A 3NQ2A 3SGZA 3DU0A 1JCXA 5FF0A 1G7VA 3M5VA 5U4NA 4FO4A 4BI7A 3RK8A 2WNNA 5AN7A 3F4NA 3W23A 3QPZA 3QSTA 5G2WA 4O54A 4O53A 5BRBA 1RZMA 1OFAA 3NVTA 3OHIA 3TUUA 4IPIA 3L21A 3CPRA 5CZJA 3R12A 3MYOA 3ABRA 3WK3A 1W1ZA 4O0KA 3N2MA 3S1UA 3GB6A 3W1UA 1MEWA 1W5MA 4GUGA 4JTSA 3OEXA 5AHFA 1UASA 3A21A 1KM2A 5K4XA 5D02A 4ZMGA 1DQXA 3QF0A 4UTWA 2G95A 3DI0A 1KW1A 4DO5A 3NXFA 3TCEA 1LORA 1KM0A 1SO6A 4LVAA 1QAPA 4FNRA 3W86A 1XKYA 3S5YA 3W7JA 2BSLA 4I7WA 4LV9A 2B4GA 1X1OA 3IEBA 2A6LA 2WSQA 4MY9A 3UY7A 3CIWA 3W2KA 3D0CA 3TR2A 2QCMA 3MUXA 1DORA 1FUYA 3L0GA 5HUOA 1CW2A 5LSMA 2A21A 3BLIA 1H7PA 4MKNA 3VNDA 1S5WA 2KZHA 1VYRA 2A7NA 4JTGA 1Q6OA 2WNQA 3ZS4A 1PCKA 2CU0A 3C56A 3E9AA 4PA8A 1YDOA 2H3DA 3UQNA 3C2VA 2WQPA 2QCHA 4ZZ9A 2NLIA 2J27A 4UFHA 5F2MA 3I7QA 3QQ0A 3OA3A 3ABOA 2TYSA 2ABAA 3CT7A 3LXAA 4QQ3A 3KFTA 5E1QA 2C13A 3UY8A 3EX4A 3M44A 5DN1A 1OG0A 4WOZA 3ZFHA 1VPXA 1TIMA 1M5WA 4N4PA 3HIJA 1A5CA 4QIUA 3LCFA 1Z41A 5KTLA 1I2OA 1AMKA 5BOOA 3SFKA 1ZFJA 3TQVA 3W1MA 1K02A 1XDLA 1TV7A 3LHZA 3BVJA 1V5XA 4EVZA 4FNTA 2ZRVA 4YXGA 3IRDA 1RV8A 4MY1A 3B8DA 1XXXA 4LOCA 1RD5A 3TW7A 3W88A 2QUUA 3NOEA 4ALDA 3W76A 5LGXA 2Y62A 4X22A 4O14A 4MJMA 4NUWA 2B7OA 1DKWA 2RH9A 4JXCA 5AHLA 5EYWA 1B57A 3A5VA 5I3IA 3G0SA 2Y63A 1AW1A 5H2ZA 3L66A 2ZCGA 2EHHA 3C0JA 3P5YA 1ZHAA 2CZFA 1XUZA 5DCEA 3W2MA 2Y85A 3E12A 4HSOA 4IMGA 3G0XA 1XM3A 3P61A 3S5OA 4K39A 3BW4A 3GAYA 2Z0IA 5F2LA 3CTLA 1H61A 2QAFA 3IV3A 1Z42A 1TRDA 3BW2A 1BTMA 1XUUA 5DLCA 1B3OA 3U6WA 4UC5A 3W1PA 1ZALA 2GUUA 1SPQA 3S9YA 5G5IA 4JY9A 2VC6A 2FB3A 4NQ1A 4JR5A 5H91A 3CWNA 1YTKA 2Y88A 1QFEA 1JQVA 1HL2A 3NR0A 4XQ6A 2O7QA 2V8ZA 5FEWA 1UCWA 3HPXA 3E02A 2AQWA 2ZA2A 3OBKA 3HG3A 5HNRA 1FDYA 3QH2A 2XN1A 2GOUA 1RPXA 3M0ZA 3QM3A 1L6YA 5E93A 3C61A 2FB2A 5MHBA 3NZRA 3IIPA 4UTIA 2YW4A 3TW6A 4BI5A 5BMXA 3NQAA 4CQ8A 1DOSA 4AF0A 2VENA 1DJNA 1R2RA 2OCZA 2PRHA 4M19A 1LRNA 3JS3A 1AK5A 2VFFA 3N9SA 1SO4A 1H62A 1GYLA 4KWVA 4DPQA 2F7FA 4UTKA 3W2LA 2OT1A 3IVUA 1TCDA 2NX3A 4PODA 3B05A 5D2XA 1P5BA 4MJZA 5A8GA 5K4ZA 5K9DA 5KZDA 1F74A 1BEUA 1I2PA 3W3OA 2R94A 1GTHA 3QEZA 4IXXA 5D32A 1LBMA 2Y89A 3W1TA 5D2TA 4A21A 2RHGA 3R13A 1YLVA 3O05A 3UXDA 2BTMA 4NJJA 3EWBX 3UNDA 4WXZA 2GVJA 4O4WA 5F4XA 3GX9A 3L5AA 2Y70A 2YZRA 3GVGA 1ONRA 4RLIA 3C6CA 4QITA 3W70A 1L6SA 1WBJA 3TH6A 1MO0A 3VE9A 5K9XA 4O4VA 1O94A 5LNWA 1JCJA 3RNDA 3ZWSA 4S1FA 4UXDA 4LS0A 2C16A 1ZAHA 4MLJA 5DELA 1W3IA 3B06A 1DJQA 2ISWA 2RFGA 3TSMA 3UPWA 1VJIA 1W8SA 3SZ8A 4JGDA 3L2IA 1ME8A 1C29A 2BWGA 4X9SA 2BLEA 3Q58A 1WA3A 1SSGA 3GR7A 3MWAA 3JR2A 4FXRA 1TPFA 4OGZA 1K3UA 1MZHA 3LI0A 4NJKA 4EOUA 1ADOA 1FY6A 1FWWA 1DVJA 2LLEA 1JCNA 3GDLA 3O06A 4Z1AA 2I14A 3DHFA 2OMAA 3OIXA 4I7VA 2TSYA 5DY2A 1HFBA 2QEZA 3P81A 1ICQA 2QCDA 1SO5A 4GC4A 4HPJA 4K37A 1YDVA 4FB7A 3NAVA 3W7OA 4IX2A 3W9ZA 3M5ZA 1XDMA 2ZZ2A 3HF3A 2Y7DA 1TPEA 3W1AA 1QO2A 1X8FA 4S2CA 4GUHA 4Q4KA 1GTEA 3LCLA 4K7YA 4O18A 3BG3A 2WV8A 4DO6A 3QMTA 3KVJA 3W6YA 3MBFA 3KAOA 4LVBA 3WJWA 2WPBA 4N02A 5AC6A 3Q94A 4LVGA 4CCCA 4MYXA 1KFKA 5G4EA 3LXBA 5EPDA 1KFBA 1OFBA 3I6RA 2FPYA 3LBMA 3NQ6A 3FJLA 3F1QA 1OYCA 2YSWA 2CWNA 1XBZA 2QCEA 1FCVA 3L0NA 3W7RA 2YW3A 1EX5A 2ZRWA 4P2VA 3TMQA 3W7EA 4TU1A 4JYEA 1IXPA 2OT0A 1W5OA 3DFTA 3MHGA 1C8VA 1KM4A 4CNPA 1I2QA 3NPXA 1LBFA 4AVFA 4ORIA 3FS2A 4UTTA 2ISVA 3ABSA 5TQLA 3P60A 1OFPA 1WV2A 1LYXA 5BNKA 2CLFA 4BK9A 5T26A 1GPWA 5AYYA 3TSBA 5FF7A 1N8FA 1XCFA 1E51A 4Y96A 1K8YA 5DCDA 3GIYA 1KFCA 4O12A 1H5YA 1ZJIA 1SW7A 1ML1A 3NGJA 3RFAA 1KBIA 3W7DA 1QPOA 1G6CA 3FEMA 3HOJA 3IIZA 4IOTA 3KOFA 3PWAA 2Y61A 1OK4A 2GQ9A 1CI1A 4LS2A 3ATYA 4U28A 3L68A 2VFIA 5DCBA 4JTTA 1FCBA 1W5NA 3S1XA 2CLEA 4QM1A 1AG1O 2P0OA 2E6DA 3FYOA 3OVRA 4NJHA 3M6YA 2C14A 2Z6JA 1F6KA 3GAKA 2JK2A 4BI6A 1WQ5A 3UWUA 3QMSA 1EUNA 4JTFA 3O16A 1EP2A 1IIGA 1WXJA 1EWDA 3NM1A 3P82A 2NUXA 2GQ8A 2X1RA 3H53A 3B4UA 2G96A 1R30A 4A2RA 1JCYA 3IVSA 3MHUA 1AL7A 4OHQA 5HULA 3OG3A 5LNSA 1YXCA 4NNBA 2V0TA 3WK2A 4EIVA 1HO4A 2E5CA 4AHPA 2C0AA 3MI6A 4TR9A 2ZDRA 4NXSA 5CZ0A 4YL2A 1J4EA 1HTIA 3ANYA 4FHAA 3TU9A 2A6NA 5C2XA 2RDUA 5FF2A 4RX0A 2E68A 2NUYA 2DJLA 4CQAA 4O50A 2BX7A 4NX5A 5EY5A 1TQJA 5D33A 2R91A 4ADSA 1P4CA 2NXIA 2ZRYA 3CLMA 3S5NA 1PHWA 3JRKA 4Z0JA 1OK6A 3W7NA 4C1LA 2CLIA 2JKPA 1UB3A 3N9RA 1GG1A 1ZAIA 3W2NA 1PE1A 4UFJA 4JTKA 1GJPA 2RKXA 1IXQA 1JQXA 5AYXA 4HNUA 3P8JA 1EB3A 5DXYA 3HGOA 3W7PA 2CLLA 3BW3A 4QJ1A 5I3GA 5KZEA 2DZSA 2ISSA 4CCDA 2XN2A 3RF9A 4N9EA 3W72A 2VXNA 3NQGA 1JUKA 4YCOA 2C19A 1SW3A 3QMRA 1VLIA 4D2JA 3NPWA 3HG5A 1EA0A 3DKLA 3GR8A 4JYFA 3ZWTA 4N2YA 4AWSA 1EIXA 1TB3A 1T96A 2AGKA 3LI1A 2GVGA 5FF3A 1HUVA 1S5TA 3ELFA 1PS9A 1VHCA 3M9YA 4TO8A 3KX6A 1LRTA 4IMFA 5BMWA 2ZZ5A 1H7OA 4N4QA 4ML9A 4MLRA 4RZ4A 4GXMA 5KMYA 5LHFA 1YPFA 2FPTA 2ABBA 4LNYA 1TV8A 1OX6A 4NT0A 1TPWA 4K8EA 1XBYA 3DXIA 4DF2A 3UWYA 3O6DA 1MSSA 1PIIA 4JIQA 3G1VA 3W73A 4AEOA 4S2BA 1TTIA 1P1XA 4NX0A 2D73A 1W3TA 3NNTA 2Q3RA 2V2CA 3MJYA 3UZJA 1TPC1 3STFA 3PG9A 3M5XA 1OX5A 1OFOA 4K6AA 4UTJA 1VH7A 3R5EA 4IXHA 4AWUA 1G4SA 1XBXA 4CLMA 2XFWA 3FIGA 1ZAJA 4WOQA 3DFOA 3EWXA 3T4CA 3CEPA 1I8JA 1Q6LA 4M6VA 5IM51 1N55A 3W75A 3THAA 2W6RA 1ME7A 3DGRA 1B9BA 2YFNA 4O1AA 6TIMA 2WO5A 3EX2A 3LHTA 4YWIA 3A5FA 3PUEA 1IXOA 3MYPA 5HR6A 4O17A 3FFSA 5HR7A 3BG5A 3NZ1A 4N9DA 5TBOA 4WY0B 4JTUA 4TX9A 1DBTA 3N14A 4GUIA 4I7UA 1PV8A 2GPTA 3MW7A 3C2RA 1QOPA 1K7EA 2ZFAA 3O15A 5F2GA 3I7RA 4CCEA 4TIMA 2AAMA 1JJKA 1AL8A 4NZJA 2XN0A 4H3DA 4R53A 4XZ9A 4ZQMA 1XBVA 5ABTA 1LCOA 3HPZA 3MO7A 5G2IA 1U5JA 3PUOA 1ZENA 4JX5A 1FDZA 1U83A 2E77A 4A2SA 4Q33A 3F4WA 3G8RA 5CZTA 3VKJA 1GWJA 3N19B 3VE7A 1T8XA 4AHOA 4UFLA 3LCGA 4RV8A 3M7WA 3NG3A 1H63A 5D05A 3GXNA 4JNMA 2HSAA 1S5VA 1VYPX 1YTEA 2HS6A 2ATSA 2Y6ZA 5L6UA 3L9CA 1TYGA 1LROA 4E2BA 4M7SA 3LRKA 2QAPA 3G3DA 2Y7EA 2CZDA 2P10A 1KM1A 3A9IA 3NEVA 3PVFA 1ALDA 1FWSA 4JTHA 3PBYA 2CLHA 3SJ3A 8TIMA 2VOMA 4DF0A 1NF0A 3M5YA 3C3NA 3BG9A 2E6YA 5G1YA 4C1KA 2QJIA 2J6XA 4UR8A 3LLDA 1RQBA 3W7QA 3DAQA 2Y7FA 2ZYFA 5D2YA 3M16A 1W5PA 4ADTA 4FNQA 5D04C 1JULA 4NVTA 5DXXA 4Y6GA 4BWLA 3I65A 5KZMA 1MEHA 1FCUA 2ZZ3A 3N73A 4EWND 4OBTA 3BARA 3T40A 1LTDA 5D2WA 4QAIA 3HBLA 3QSRA 2ZBTA 3CHVA 2CW6A 1BKSA 1OF8A 3LGEA 4TMBA 4DF1A 4LUIA 1B4KA 4K8HA 4RR4A 3HO8A 3DBPA 2NWRA 3P67A 3G3MA 1I2NA 1F5ZA 2X2GA 1QPNA 3WJYA 2FJKA 2B7QA 1ICSA 1M7PA 2DZPA 3W7HA 5J5DA 1FWRA 2Z2UA 5F2IA 4UTMA 3DKJA 1XI3A 3PM6A 3SR7A 4WXYA 1X6UA 2I9EA 1TPDA 4UTUA 4JDBA 4GE8A 4M7TA 5KITA 1H7NA 3FLUA 1SUXA 1Y0EA 5I3KA 4DEFA 3YPIA 1G4TA 5CPMA 3L0KA 1FBAA 4FIRA 2JGYA 3BV4A 3G1DA 1F73A 5GVJA 2FPVA 3RLVA 3W1QA 5HWNA 2YFOA 4FX6M 4HIBA 4IGHA 3SGUA 4O10A 1VLWA 3EX1A 4FNUA 2NZLA 3CEUA 4QISA 3KRSA 4GNJA 4R33A 1YYAA 3RU6A 4ZQPA 3TNOA 3WFAA 3G1XA 5EL1A 3TE9A 3R2GA 3NQVA 1ZY9A 1VCFA 5AHIA 4ZQOA 2W0UA 3NQEA 3MMTA 4HNNA 4K36A 4O28A 3USBA 4IUOA 3KVKA 4A3UA 3H55A 4IMEA 5HWMA 2V81A 4IQLA 1EP1A 3M1ZA 3NL6A 2VFHA 3DFPA 3W7LA 3MBDA 1K7XA 1NSJA 4I9AA 1THFD 4RXGA 3TFXA 5AYZA 1KV5A 4JN6A 5K3VA 1OF6A 1Z44A 1SZEA 1TJPA 3S5ZA 5G1TA 3NQDA 3MP5A 4EF8A 1T99A 1SSDA 3UPBA 4OE7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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