2OX1A

Archaeal dehydroquinase
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
196
structure length
196
Chain Sequence
MKLVATLSSPEELELAEKADVVELRIDLFDFSGARVDKEKILTCRRVSDGGKFEGDERERIEKMKRAFDSLNPDYVDLESDLPDSAFDFNCRIIESYHNFIRTPDYSELKGIVEGRRGDLVKIATMGKSKRDVETIVRILTNYDDVVAFLMGERFSFTRVLAAYLGSPFIYCYVGSPKAPGQISLDDAREIISRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title Structure and lability of archaeal dehydroquinase.
pubmed doi rcsb
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 62
structure length 196
sequence length 196
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2007-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ox1A00
3W23A 3LCLA 1AL8A 4BK9A 5F4SA 4FNPA 4RCXA 3HF3A 1RZMA 2C14A 3QPZA 5D04C 4UFIA 4FHAA 4OWGA 3T4CA 3TQKA 1FCQA 3CT7A 1JCNA 1A5BA 2CLIA 5T26A 3HPZA 1MZHA 4LVBA 1ME8A 3FJ6A 4M6PA 3W70A 1GG0A 3OG3A 2QCEA 3FFSA 3MYPA 1H51A 4N9DA 3EKZA 2YYTA 2A21A 1Z41A 1EUAA 4O50A 4WY0A 3HG4A 1VYSX 4BI5A 2ABAA 2RFGA 3DFQA 3OVPA 3TQVA 3SGUA 3P82A 3BLIA 1X1ZA 4AB4A 4JYDA 3OIXA 1LRNA 4O4VA 4QJ1A 4JS3A 1OVDA 1C8VA 4WZHA 5D09A 3M7WA 4YL2A 1G4PA 1TB3A 3WJSA 1GOXA 3W2KA 1XBVA 4K7VA 4ZQOA 2YDAA 5F2MA 3EKLA 4FF7A 1H62A 4XBSA 2NWRA 1FCBA 1L6YA 2BX7A 3IRDA 3NDOA 2FPVA 1FDJA 3R12A 3MWAA 4RJEA 2B7QA 3GDLA 1OK6A 3GDRA 1XXXA 1ZAHA 2QR6A 1A50A 3ABSA 3G3MA 5AYZA 4DPPA 2XN1A 1GVOA 1J5TA 2WPBA 3G3DA 4O12A 1TPVA 3NQ6A 1BKSA 2O7QA 3TIMA 1YDOA 1GVQA 4TU1A 2VELA 3WJZA 3GDTA 3HGOA 1HUVA 3DHDA 1SW3A 3I65A 3A9IA 1ZAIA 4TX9A 2GQ9A 3FOKA 2VOMA 5FI8A 1KM5A 2FLIA 1OFDA 1ONRA 2C0AA 2VEPA 1G7VA 3C0JA 2YX0A 1LBLA 3MW7A 5HJLA 4CLMA 4FXRA 3NQAA 1TPUA 4AHQA 1FWSA 1LLZA 4MZ8A 1JR1A 4FNTA 3GX9A 2CW6A 3DKJA 3OVRA 4LY8A 3DU0A 2QUVA 4IMGA 4LUIA 1LP6A 1U83A 2E5BA 4N9BA 3P61A 3R5EA 4K36A 1M7OA 4LC6A 5EMUA 4WOZA 3MO7A 3ZS4A 5CSRA 1ZY9A 1W37A 1QOPA 5LGZA 4JYFA 3KRSA 1KTBA 3DFSA 4HNUA 4JTTA 5D2XA 5LHEA 1EEPA 1DOSA 4GC4A 3EX3A 4Y6GA 3UWVA 3NYZA 4XTDA 4AVFA 4JDYA 1PIIA 2V8ZA 1DBTA 1LOSA 4IX0A 1R2RA 2Q8ZA 2H3BA 5U7SA 1HG3A 3PY2A 1LZOA 3ZWSA 4UTHA 4IPIA 4L4LA 4ORMA 4NXSA 2KZHA 1F05A 4JXCA 1ML1A 2QCDA 1KA9F 4JEQA 3IEBA 3HO8A 5FESA 1EUNA 3A5FA 2C18A 4K6AA 1H1ZA 2VXNA 1AW5A 3OEXA 3S9YA 1H63A 3G1YA 1VRDA 2A6LA 1JJKA 1W3NA 5BMWA 3TV8A 2V30A 3EEGA 3LXBA 3O15A 3TJXA 1EP3A 3QEZA 4UFLA 2ZDRA 3W87A 1MSSA 4OE7A 4CQ9A 1TRDA 1ME7A 2TPSA 1RQBA 4BWLC 1VCVA 1QCWA 2CLFA 1OF8A 3E0IA 5C55A 3W7NA 3NQDA 1WX0A 5HMSA 3UXAA 4M6QA 4QQ3A 1FWNA 2FB3A 4CCDA 3FS2A 4LVFA 4NX0A 3NAVA 1O4UA 5DCBA 2WSYA 1AK5A 4E0CA 1SZNA 2OX1A 3UWZA 4YXGA 2QCCA 3HGRA 5GVJA 4KFOA 2Z2UA 3SJ3A 2E5CA 1Q3NA 1P0NA 1H1YA 3L5MA 1H7PA 1RPXA 2J27A 2EGZA 3U6WA 3SIZA 4HHPA 1FUYA 4NQ1A 3PBYA 1TPWA 3O1NA 5CPOA 3EWZA 4DO6A 3T55A 5BNKA 2YYUA 4ZL1A 3NQ8A 3IGUA 4JYEA 5AC7A 3O63A 3L68A 1AMKA 3R8RA 2F84A 1IXQA 4FNRA 1FX6A 3C3NA 1BTMA 2ZZ2A 3TR2A 2JGQA 3C2FA 3W3OA 5CPLA 1MXSA 3PC0A 4BR1A 5H2ZA 4UIOA 3UWYA 4XQ6A 3P8JA 1JQXA 2G97A 3TJLA 4O19A 3G22A 4OV4A 3EXSA 3KVJA 3DFTA 1Z48A 5D2YA 3LM7A 1JULA 1I45A 2TSYA 3NPVA 3HG2A 4MYXA 1XBYA 4IPJA 1SO5A 1WOBA 3TAKA 4MLRA 5K9DA 1X8FA 2R14A 3BG9A 5IM51 2PRLA 3GIYA 2BZNA 1H50A 4M6VA 1JCYA 4A22A 2DP3A 1LRTA 3CWNA 3R89A 1UUOA 1DJNA 3NPXA 3S1XA 3KX6A 2NXGA 2PRMA 1JUEA 1F74A 1TV8A 4O0KA 4JTGA 3W88A 4O57A 3IGSA 1SW0A 2P0OA 3TFXA 4Z1BA 2ABBA 3AO0A 4YCPA 1XDLA 3W07A 1AL7A 2H8XA 2X2GA 4C1LA 4ZQNA 1VGAA 1KM4A 1OHLA 2V9DA 1OX4B 1VZWA 4X22A 2CZFA 4UR8A 3USBA 5G1TA 4GUHA 3W1UA 3PWAA 1XBZA 2EAWA 4GBUA 5F1VA 3W76A 3PB2A 2E09A 2NV2A 3HG3A 3LERA 3O6CA 1YXYA 4HNTA 3W2NA 5C5YA 3RLUA 3NQVA 3UPBA 4HPXA 4NUWA 1A53A 5AHEA 1XCFA 2OJPA 1R2TA 3W1QA 2YZRA 4RLIA 3O16A 2FQIA 4Y9AA 1WBHA 3PG9A 4FEZA 3ATYA 3PAJA 4JTSA 3M43A 3NL5A 1PS9A 4TR9A 5CZ0A 1CX9A 4ONVA 3S5OA 1B4KA 1HO1A 4O53A 1XUZA 1W5MA 4AHOA 4BFAA 4UR7A 2QJIA 5AHMA 4JD4A 2DZVA 1VLIA 4X9SA 5LNSA 3HMJG 4O54A 2P10A 3NOEA 3MBFA 3QF0A 1B9BA 2XN2A 3EX2A 4IOTA 2Q3OA 4O8RA 5FF0A 2Y7GA 3L66A 3W74A 2FDSA 3JR2A 3EB2A 1I2NA 2I1OA 3OA3A 3TAOA 4WX2A 1TJRA 2JGYA 3BO9A 3LX9A 3W85A 1W54A 3N9RA 4WJEA 3GDKA 3E9AA 3UY8A 1GVSA 3MJYA 4PEKA 3S1VA 2WNZA 3BW2A 3QW4B 3B0UX 1TTQA 1SSGA 3MYOA 1F6PA 1L6WA 3NG3A 4JX4A 5SWUA 1CI1A 2NUWA 1H5YA 1TTJA 1GTEA 1UBSA 1OJXA 1X6UA 3ZR4A 4Q32A 3BG5A 1W5PA 1T8XA 3LBMA 4WQ6A 2ZRUA 3WK1A 1L2UA 1OABA 4BF9A 2ZZ6A 4WY0F 1A5AA 1JVNA 2J9YA 4Y8FA 2ZFAA 3BK0A 3DENA 1HO4A 4MY1A 3LXCA 1KTNA 5F2GA 4R53A 2C1HA 3P74A 3TK7A 4JTUA 4FX8A 4ADTA 3TUUA 4OT7A 3AJXA 2YW3A 2IQTA 4K8EA 3DAQA 4JN6A 5EPDA 3O05A 4XTIA 5FEPA 5DELA 4N9EA 3GR8A 4FNUA 2V82A 3GNNA 2WKJA 1LOLA 3F4NA 1TV7A 1SUXA 5G2WA 1SO3A 3G24A 1SQ7A 5KTLA 3N73A 2DZTA 1VCGA 1KFKA 3LLDA 4LVDA 4UMCA 3TH6A 1TIMA 2ZA2A 4XKYB 2Y89A 3BW4A 2BSLA 3LHWA 1IF2A 4XWUA 1JCXA 3N9SA 3DFPA 3GR7A 5AC8A 2DU2A 2ISWA 2QCHA 2ZA3A 4UMAA 4KWWA 5TBOA 5LNUA 1K7FA 3W7JA 4UNKA 3PM6A 3SGZA 2GVLA 3W7MA 3UPWA 2EPHA 3LHVA 1HTIA 2QF7A 1E51A 3BLEA 4CCCA 4S2BA 3TX9A 3L5LA 1TCDA 5LSMA 4FNQA 4WOQA 4ADSA 3WK2A 4HPJA 4M7SA 5LGXA 1QR7A 1YXDA 1KM2A 3HPXA 2OMAA 3F03K 1KFLA 1C9DA 1P1XA 2JKPA 4RR4A 1LRQA 1OX4A 4PL1A 3BGJA 4JTFA 4FIRA 3M16A 1D3HA 4LNYA 1UASA 1MO0A 4AF0A 4Z1CA 4ZMGA 5A5WA 1HL2A 1VYPX 5D2WA 4NU7A 3LHUA 1B4EA 2ZRZA 4B5NA 1SPQA 3M6YA 2ZRXA 1Y0EA 4OV9A 1TMHA 2E6FA 4MFDA 4DQWA 1NAL1 1ZNNA 1DL3A 3G1AA 3PBWA 1LYXA 3ZFHA 5G5IA 4LVGA 4UFJA 1N7KA 2VC6A 4UMBA 1PL9A 4UTLA 3WJXA 3W73A 1XL9A 3C2OA 3IIXA 1XUUA 3BGGA 1LTDA 4UTWC 5H91A 3G1XA 1XBXA 5CGQA 4XBKA 3QH2A 4LVAA 3E96A 2A4AA 8TIMA 2AAMA 3RMJA 5HWJA 4CQ8A 1GTHA 4IMEA 1ICSA 4TIMA 1IXPA 1TRIA 3SI9A 3SECA 1OFEA 2NX9A 4O10A 3W86A 4MYAA 1GJPA 5F4XA 3MI2A 5LHFA 4M7TA 3C52A 4UTMA 3NL6A 2CLKA 3W2MA 1KBJA 5D05A 3TA6A 2D73A 3W1PA 2YW4A 3SZ8A 2FIQA 1K8ZA 1MEHA 1JRBA 1EIXA 4HSNA 3ABRA 3LV6A 3TCEA 4Z08A 1G4TA 1FDZA 4LS0A 5CZJA 1LORA 3QMSA 3LCIA 3PS7A 3L65A 4BI7A 1NF7A 3VKJA 2EKCA 1I8JA 2C15A 1TTIA 1U5JA 1W31A 2ZZ3A 1B57A 1OFPA 3LGEA 1FY6A 3TXZA 4X3ZA 3LOTA 3LI1A 5DCDA 5HQEA 1K03A 3ANYA 1VJIA 1MEWA 1YTEA 4KWVA 1ZHAA 3EWUA 4RZ5A 1WAUA 3Q94A 5G2HA 1UB3A 2Z6JA 5FEXA 3S5NA 3NR0A 1KLYA 3PG8A 4N2YA 3H54A 2QCLA 1RQHA 1H7OA 5IBXA 4NZFA 4AMAA 2O7SA 5LNVA 1W8SA 4JTKA 3B04A 3A22A 4FX7A 2HS6A 1OFRA 3S0CA 3DH7A 4PL2A 4GJ1A 3GK0A 1ZENA 1Z44A 2VEIA 2UV8G 2F7FA 2C16A 2H6RA 4IWWA 2VFEA 3TE9A 3G8RA 2DZPA 2ALDA 3B03A 4K38A 1FWRA 3B8DA 1UCWA 4FO4A 1K8XA 1DORA 1SZGA 1JCLA 3W71A 1PCWA 4G1KA 1EWEA 3F4WA 3A21A 3G0UA 4HN4A 3C2EA 1GZGA 2NUXA 1UUMA 1QPQA 3RFAA 1ICPA 4UXDA 4ML9A 3NVTA 3W7EA 3TW7A 2GOUA 1SR9A 2YPIA 3ABQA 2CLOA 2FJKA 4UTTC 4AH7A 3DGRA 4JNMA 4ALDA 1F5ZA 4GRSA 2G96A 1IXNA 1CW2A 3C2RA 4K39A 4N02A 1KFBA 3W2UA 5FF7A 3M0ZA 2WOQA 3A5VA 3F1QA 3GKFA 3TU9A 3UWUA 2CLHA 2VFHA 1PV8A 3C61A 3P8IA 4HSOA 1LBFA 3S42A 3HG5A 4CNPA 2B4GA 2AQWA 1TPDA 1X1OA 4KKXA 3M44A 4NVTA 3LRMA 4JTHA 1H60A 2ZQ0A 3BVJA 4QIUA 1O5XA 3W72A 1ICQA 2E6AA 3TMLA 3WFAA 1NEYA 2GQ8A 1O5KA 2DZWA 5D38A 4K37A 3W7PA 3FIGA 3P81A 1GVRA 1QWGA 2ZRWA 3C2VA 1G6CA 3MP3A 3N3MA 4H3DA 4NNBA 2ISSA 1V5XA 3O06A 3PBUA 2WQPA 1EWDA 4O52A 4ORIA 4N6EA 3O07A 2VFFA 3W83A 2QJHA 1T99A 2Y6ZA 4O13A 1G67A 3N19B 2NXHA 4UTJA 2ZBTA 3E12A 1KFCA 2QKFA 3NL2A 1EPXA 5K3VA 1P0KA 2DJXA 1VLWA 2NZLA 4S1FA 1PVNA 5I3HA 3VI2A 1B3OA 3W7OA 3M5ZA 3L21A 5G4EA 2I9EA 2ZTKA 5TIMA 5LNWA 4YMZA 3M5XA 4UFKA 2RDWA 2Z1BA 2HMCA 3PUEA 4E2BA 2C19A 1RQEA 3P67A 1VS1A 3NM3A 3M1ZA 3LLFA 4N4QA 5D03A 1GPWA 3VE7A 2ZA1A 2X16A 1WYIA 5EBUA 1KBIA 4O4WA 3NZ1A 2V81A 3TSDA 1OYAA 1FXQA 1FCVA 2Y70A 2XFWA 1SU5A 3HQ1A 1JCMP 3U8GA 3LI0A 1EP1A 4RX0A 4LRSA 4OU1A 3P62A 3W2LA 4QAIA 3PUDA 1GG1A 1ZALA 5HINA 1WOAA 3P5ZA 2Y7EA 3MP5A 4PCFA 5FEWA 2QEZA 3S1WA 3Q58A 3NM1A 5D37A 3HPSA 1YDVA 1YLVA 3I7SA 5K4XA 2VFIA 1FBAA 3CPRA 4TMBA 5AHIA 4GXMA 1D9EA 3THAA 3B0PA 3QQ1A 1N8FA 3CQ0A 1LDCA 2WNNA 1Q6LA 1GYLA 3G1HA 5AFDA 2VEKA 3TC6A 5HUOA 3W84A 3SY5A 4DF0A 3GYEA 1W5OA 4GUFA 5G2IA 3HJZA 1TPFA 1QPOA 4MFEA 2GVJA 4MVAA 3C8FA 2RH9A 1KM0A 3KFTA 3C56A 3HGSA 1ZAJA 3CC1A 1I4NA 5KMYA 2BTMA 5ABTA 4KFNA 2JK2A 1M7PA 3UD6A 3LV5A 4NNCA 2E1DA 3W1AA 5K4ZA 3BG3A 3W1RA 4U28A 5HUPA 1NSJA 1OF6A 3UY7A 4O28A 3A23A 4JY8A 3I7RA 4IJBA 1PCKA 4ADUA 2A0NA 2QDGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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