2PC4A

Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from plasmodium falciparum in complex with trap-tail determined at 2.4 angstrom resolution
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
364
structure length
359
Chain Sequence
HCTEYMNAPKKLPADVAEELATTAQKLVQAGKGILAADESTQTIKKRFDNIKLENTIENRASYRDLLFGTKGLGKFISGAILFEETLFQKNEAGVPMVNLLHNENIIPGIKVDKGLVNIPCTDEEKSTQGLDGLAERCKEYYKAGARFAKWRTVLVIDTAKGKPTDLSIHETAWGLARYASICQQNRLVPIVEPEILADGPHSIEVCAVVTQKVLSCVFKALQENGVLLEGALLKPNMVTAGYECTAKTTTQDVGFLTVRTLRRTVPPALPGVVFLSGGQSEEEASVNLNSINALGPHPWALTFSYGRALQASVLNTWQGKKENVAKAREVLLQRAEANSLATYGKYKGGAGASLYEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Aldolase provides an unusual binding site for thrombospondin-related anonymous protein in the invasion machinery of the malaria parasite.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
total genus 126
structure length 359
sequence length 364
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2pc4A00
1W5QA 3TUUA 1TJRA 3KVMA 2OZ0A 2A21A 1PE1A 3T40A 2O7QA 3P61A 4UC5A 4HSOA 4EWND 3S1WA 1AL7A 2IQTA 1TB3A 2OJPA 3KRUA 1QWGA 3W23A 1JCJA 3CIXA 3UZJA 3ABQA 3LTSA 2OMAA 2X1UA 4FX6M 3SI9A 4FNUA 5U4NA 4CLMA 5F2LA 4Z1AA 3HG5A 4RZ6A 2RDUA 2Q3OA 4A2RA 1A5CA 1TPFA 1NAL1 2E6YA 2Q8LA 3W6YA 3JRKA 3E0IA 4UTHA 5E1QA 1MEHA 3KFTA 1SZNA 2GVGA 1S5WA 2H8ZA 2XFWA 3TCEA 1B57A 2CLMA 2BLEA 3M41A 2NX1A 3QSRA 2YX0A 3Q58A 1A50A 3NL2A 1EWEA 3N19B 3ZR4A 4NT0A 3TQVA 1DORA 2V5BA 3CM4A 1EB3A 4ML9A 2B7NA 3GR8A 3BG5A 2ZCGA 4S1FA 5AFDA 1LBMA 1QAPA 4N9BA 3L68A 3FJ6A 1TV7A 3PC0A 4HNTA 3NZ1A 3EB2A 1W56A 5BRBA 4O54A 2X1TA 4FHAA 5KITA 3VKJA 4GUJA 3HO8A 1KM3A 4AHOA 1VGAA 1F76A 3NGJA 3LM7A 2V81A 2ZTKA 1MZHA 1Z48A 3W7NA 1KV8A 3SGZA 1AL8A 1YXCA 2XN1A 1L6SA 4ZMGA 3LBCA 4LVFA 5K7JA 5CSRA 5J5RA 2CLKA 1YXDA 1FX6A 3MJYA 1AW1A 1DKWA 2WNNA 3GKAA 1RZMA 2RDWA 4ORIA 4JNMA 3PB0A 3E9AA 1TQXA 3DHFA 5D30A 2YCEA 1VYPX 1R2RA 1LRNA 1O94A 2Y7EA 5FEPA 2G95A 2B4GA 4H3DA 1F5ZA 3HGRA 1TRIA 1I2NA 3LXAA 4NJGA 3DHDA 5IBXC 4NJKA 3IVUA 2EF9A 5D37A 4LC6A 3TMLA 2QDHA 1GVFA 1CX9A 3B06A 4OT7A 1JUKA 3I6RA 4O52A 3SZ8A 3TNOA 3LRKA 2VFFA 2YDAA 1G6CA 4N4QA 4IX0A 2FB3A 1JUEA 2NXIA 1SQ7A 4QITA 2A7RA 3VFLA 3B4UA 2GPTA 2J9YA 3GAKA 1QR7A 1XC4A 3BK0A 3W83A 1FBAA 4ZQCA 1KTNA 2QUVA 3FKKA 1VHCA 2Z2UA 1PS9A 4UTIA 3EEGA 2ZFAA 1OX6A 3NQ6A 3QSTA 3QYQA 2CFFA 1IGSA 3W7LA 7TIMA 1TYGA 3W9ZA 4JTEA 4RJEA 2C3ZA 4TO8A 2CZDA 2W0UA 3NPUA 4BK9A 1K7XA 2TSYA 1M7OA 2C18A 1GOXA 2V9DA 1QOPA 3KVKA 2A6LA 1F7BA 3PF3A 1P0KA 1SO6A 3L67A 4UMCA 1LLZA 4O15A 1KBJA 3KVJA 5BMWA 1JRBA 3UY8A 2WNZA 4BI6A 2FPYA 4O57A 3NQEA 2CZEA 1VCVA 2V30A 3A22A 5LNUA 3G1HA 2NUYA 3A24A 5KTLA 2EPHA 3MP4A 5DLCA 2ABBA 5FF7A 2RKXA 4K37A 5BNKA 3NQ7A 3LXCA 5FEWA 3FLUA 3S9YA 3IGXA 3T78A 4A21A 1TTPA 1LORA 1WQ5A 4IMEA 3LTPA 1ZHAA 1MEIA 3W1TA 3EWYA 1SUXA 1RQHA 3TR2A 1I2PA 3MHGA 3W2MA 3NO5A 2BZNA 1FXQA 1RQEA 4XTIA 3CTLA 3M43A 3UWYA 1F74A 3LTYA 3PSWA 5U7SA 1R2SA 5TBOA 4MJZA 2Y63A 2Y85A 1UASA 3MI6A 3Q94A 3W1NA 3W72A 4JX4A 3VNDA 5FEZA 1OYBA 4JYDA 2EGZA 1XUZA 1T0OA 3G1DA 3SGUA 1EP1A 1F73A 5H2ZA 3STGA 4PA8A 3OIXA 3WJWA 1WBJA 3FKRA 4O10A 2GQAA 5T26A 1D9EA 4LS0A 1JJKA 4UR7A 2J24A 4HT3A 1XXXA 1JCMP 2RDTA 4O28A 1KLZA 1AW5A 4O16A 5I3FA 2DZVA 3E02A 3DI1A 2BSLA 2QF7A 5DBTA 2QCHA 2Y7DA 2NXHA 4JTJA 1G7UA 2VELA 3BVJA 4AWUA 2I9EA 2YW4A 5AN7A 1YPIA 1KM0A 1OX4B 3W7GA 1K7FA 4NNBA 3LB0A 4JICA 4HN4A 1QDSA 3PY2A 1ME9A 3B0UX 2ZRUA 2QAFA 3QM3A 3PSVA 2VFGA 3PR2A 5A5WA 4MLJA 4S2BA 3ZS4A 3GAYA 5LZLA 4XZ9A 3DFOA 1YXYA 4BWLA 3IRDA 5D2YA 2ZZ2A 1ME8A 3G8EA 1GYNA 2DZWA 2DZUA 3M5XA 2C14A 2H3DA 3RLVA 3T4CA 1DQWA 3W7OA 1F05A 4TR9A 5CPOA 1OFPA 1KFBA 1Q6RA 1DL3A 4DQWA 2H6RA 3E49A 1ADOA 4DBDA 2AAMA 2RH9A 2JGYA 1LDCA 2E5DA 3O8AA 2V5LA 1ZNNA 4RV8A 3EWXA 4UFKA 1KTCA 3WJSA 4HNVA 4NXSA 4DPPA 2X30A 2ZZ5A 3CIWA 4A22A 2CLEA 3EXRA 1S5VA 2P1FA 2ZA2A 2X2GA 1XKYA 3ABOA 3TIMA 1TTIA 1XDLA 2FPTA 1EWDA 1UUMA 3OVPA 4MZ8A 5I3KA 3W7HA 4GC4A 3LDVA 3HGJA 5ABTA 3DXIA 3N14A 1TPDA 4OWGA 4UTLA 1ZFJA 3P67A 1GT8A 1H60A 2C1HA 5AHMA 2A7PA 3O16A 1ME7A 4FNTA 3LXBA 1EUNA 5EA9A 3TROA 4IUOA 4ZQOA 1OFEA 1H63A 3L5LA 3NR0A 2FJKA 4IGHA 4HNNA 3R13A 1DJQA 1OX4A 3QMSA 5BW6A 4K38A 3GDRA 3W2LA 4UTWC 4H4IA 4NX5A 3LHZA 1Q3NA 2J6XA 1YADA 1G4PA 2QJGA 2YYUA 1ZY9A 2D73A 3PWAA 2GVLA 4LT9A 2A0NA 1ZAJA 3HIJA 3PM6A 1NEYA 5HINA 4OE7A 1XDMA 1WX0A 3O07A 2FIQA 2ZRXA 2A7NA 4OV9A 3TXZA 1OFQA 4K39A 1L9WA 1MXSA 1OFBA 1ICQA 3BARA 2ZZ1A 4M6QA 2Y89A 4UIOA 2QCLA 3D0CA 3FOKA 3QF0A 1W3NA 1FXPA 3F03K 3GIYA 4O14A 1C9DA 4RR4A 1FWTA 2R14A 3CWOX 3N34A 1OF8A 4HPJA 1NF7A 3DH7A 5D05A 2NUWA 1PIIA 4ONVA 4JTTA 4NZJA 1WAUA 4ADUA 4MY9A 3W7DA 2YXGA 1FWNA 4Z0SA 2ZRYA 5AC7A 3DAQA 1H61A 3G22A 3M47A 3TXVA 5HMSA 2NZLA 1RVGA 4O0ZA 4UXDA 5BOOA 4GWEA 3IIZA 4W9TA 3N73A 2OCZA 2H3BA 4M7TA 2GQ8A 3FA5A 3LLDA 4HIBA 3OVRA 5CZ0A 1GTHA 2Z6IA 5D2TA 2V2HA 5AHLA 2Y62A 4JTKA 3M1ZA 4GUIA 3BW3A 4J9JA 3S6DA 1XCFA 1TCDA 5DXXA 4LTSA 5AYZA 1QPNA 3W1LA 1N7KA 4ADTA 4BWLC 2QR6A 3CEPA 5TIMA 1VLWA 3C61A 2Y88A 4DF1A 2WQPA 3C2EA 3L65A 1B3OA 3TJLA 3C2FA 3LV6A 3BG9A 1HFBA 3GXNA 2Y61A 2C19A 1TPH1 1WDWA 4YCOA 3YPIA 3NQFA 5A8GA 3L0KA 2ZRZA 3GR7A 3QC3A 4AMAA 1YTKA 5K3VA 1G67A 2VFDA 2ALDA 4UNKA 1K8ZA 3M0ZA 2WPBA 3W1AA 4Y90A 1GTEA 4UFJA 3DFNA 4YMZA 4DF2A 3QPYA 5CPNA 3GXPA 3MP3A 2VXNA 3PBYA 4XWUA 1QMLA 4HKPA 3DI0A 2CLOA 3NM1A 4UNLA 1ICPA 3TW7A 5DCBA 1EP2A 1PL9A 3QQ1A 4XKYA 3B0VC 4JTGA 1L6WA 3NPWA 5K4ZA 3K30A 1OYCA 3M9YA 4CQ9A 2Y7FA 5HQEA 5G4WA 4DO6A 3FJLA 5HWNA 2GUUA 4IXHA 2V0TA 3VE9A 1JQVA 3W7KA 3W2UA 4A3UA 1G69A 1P0NA 1VH7A 3P82A 3SY5A 3W74A 1O5XA 3GDMA 4M6PA 4ADSA 4IMGA 1DJNA 4C1KA 1OK4A 4K36A 2QCCA 3RK8A 3T44A 4MZ1A 3W85A 1IIHA 1W5MA 3L5AA 2V2CA 3O6YX 2ZZ7A 1LP6A 2Z0IA 4WJEA 1EPXA 1RPXA 3O15A 5FF0A 3CHVA 3HF3A 4FIRA 4I9AA 1OK6A 1QFEA 1PV8A 4JXCA 3SR7A 3TDFA 4WY0A 2E68A 4UFLA 3W7CA 5D2XA 4UFHA 5SWUA 1ZJIA 1JCYA 4UTKA 1DV7A 3TC7A 4RKAA 4IQLA 2GJLA 1UJPA 2E77A 1FDYA 3DKJA 3GK0A 4IJBA 1G4TA 1LM1A 3LI1A 4Q32A 1HO4A 1FDJA 5HULA 4AF0A 3BPWA 3I65A 1FUYA 3EXSA 3UQNA 3KAOA 1A5BA 4EF8A 3NEVA 1B9BA 3CT7A 3EKZA 3N2XA 3GYEA 3HBLA 1TIMA 5D2WA 3LHVA 3NQ8A 4IMFA 1TV8A 2YZRA 2UV8G 3AJXA 1W5OA 1JCLA 5AYXA 5HUOA 3TFXA 1MEWA 4N9DA 5CZSA 3UWVA 3VE7A 3TH6A 4P2VA 3OHIA 3B03A 1W31A 1LOSA 4Z08A 4OV4A 3V1PA 4UTUA 1AG1O 3LX9A 3UWWA 1TQJA 4N9CA 1SZEA 4E0CA 3W86A 6ALDA 1OABA 3EWUA 2WSQA 5LGZA 3CPRA 2VEMA 3N9SA 3LRLA 4QJ1A 3EX2A 3G1SA 2NUXA 3HPSA 3GNDA 4MUZA 4N9EA 4LRTA 6TIMA 2QCNA 3DGRA 1H62A 3H53A 3GVGA 2YPIA 5G4EA 1V5XA 2OT0A 1KFKA 4Y6GA 3LCGA 3RLUA 4N6FA 3TV8A 2FFCA 3P74A 3FIGA 4ZQNA 5AYYA 4MKNA 1W1ZA 1FCQA 5I3GA 1TPWA 1VC4A 1GVOA 3VCRA 4O17A 2Q8ZA 1ZENA 4O19A 4Y96A 1K7EA 1JCXA 3P84A 1WYIA 4HPXA 1I8JA 1JULA 5C54A 5CGQA 1TO3A 5K4XA 3W7JA 1UUOA 4JYFA 2DU2A 1XM3A 4JR5A 4P61A 2A1YA 3BO9A 3G0UA 2KZHA 1UBSA 2O7SA 3C2OA 4TMBA 4PC8A 5H91A 1X7FA 5GVJA 4FNRA 4U4MA 2JKAA 4IWWA 4UUIA 4D2JA 2DZSA 4WZHA 1BTMA 3KVLA 1SZFA 4O0KA 2QCEA 4Y9AA 1O5KA 4X2RA 1W8SA 4UCGA 3P81A 2NLIA 3BLEA 1FWSA 4ZL1A 1JR1A 1T8XA 3IIVA 3PB2A 1W5PA 4GNJA 3L5MA 3IEBA 3A21A 1H7PA 1SSGA 5DCDA 4QNWA 3M44A 5KZMA 2DZPA 1YDVA 1KLYA 2B0MA 2GQ9A 1WOAA 1XUUA 4E2DA 2ABAA 4K8EA 2NWSA 1GZGA 5F2IA 1P5BA 2G5WA 4MJMA 5FF4A 4AB4A 3MYPA 1TREA 4AAJA 1YLVA 2TMDA 2ZQ0A 5I3IA 3STFA 3SJ3A 1RV8A 4WXZA 4CNOA 1FCUA 4ICNA 4KFPA 5C2XA 1FDZA 3CU2A 4QIUA 1SFLA 3HJZA 4IX2A 3BLIA 4KWVA 1TJPA 2ZZ4A 2QUUA 3UXDA 4ZQRA 3ATYA 2ZRWA 2ZA1A 3LLFA 4GXMA 2JKEA 2PRLA 3EX1A 3ELFA 1CW2A 5E0KA 3W7IA 2E6DA 4FX8A 3ABSA 3LOTA 1TPB1 5FESA 4KFOA 2QCFA 5I3HA 1ZCOA 3BGGA 2XN0A 3G24A 3TU9A 4KKXA 3S5NA 3GZ3A 2CZ5A 4HHPA 3HPXA 4JTSA 5BMXA 2QCDA 1OFRA 3NQGA 3S1XA 1I2QA 4TU1A 4R33A 1OFAA 2J9XA 3L9CA 1T99A 2HS8A 2Y6ZA 1LROA 3L0GA 3NG3A 1N8FA 5LNVA 1AW2A 2YW3A 3GB6A 1V7YA 1MSSA 3WK3A 4AH7A 1P1XA 1U83A 5EYWA 5HR7A 3FS2A 3TK7A 2YYTA 3A23A 2HSAA 1ZAIA 3UWQA 4TX9A 4FB7A 1VYRA 1TRDA 1ONRA 2B7QA 3P80A 4I7VA 5F4SA 3N9RA 4AXKA 1J4EA 3GNNA 4WXYA 3LCIA 1Q6LA 2BXVA 1SW0A 4EOUA 3MBFA 2VKZG 4M19A 4WUIA 4GRSA 5LNRA 3B04A 1WBHA 1ICSA 1DBTA 4X9SA 2WSYA 1QPQA 3UD6A 4MIMA 3TC6A 3O6CA 1OVDA 2FLIA 3ZWTA 4UTMA 3FEMA 4YWIA 1ALDA 4PTNA 3C6CA 1HO1A 1R46A 3DZ1A 1KM1A 3LBMA 5L6UA 4MFEA 5DXYA 2DJLA 4JTIA 2QUTA 1IXQA 1W5NA 3SW6A 4RZ5A 2WO5A 2XN2A 4PH6A 4XQ6A 1LOQA 1EEPA 1XBYA 5KZDA 2WNQA 4NJJA 2G97A 4O1BA 4PODA 2WOQA 4WY0F 1TMHA 4U28A 3S5YA 5EBUA 3TSDA 3LV5A 1ML1A 4O4VA 4O18A 2JKPA 4IMDA 1B4KA 1LBFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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