2PC4A

Crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase from plasmodium falciparum in complex with trap-tail determined at 2.4 angstrom resolution
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
364
structure length
359
Chain Sequence
HCTEYMNAPKKLPADVAEELATTAQKLVQAGKGILAADESTQTIKKRFDNIKLENTIENRASYRDLLFGTKGLGKFISGAILFEETLFQKNEAGVPMVNLLHNENIIPGIKVDKGLVNIPCTDEEKSTQGLDGLAERCKEYYKAGARFAKWRTVLVIDTAKGKPTDLSIHETAWGLARYASICQQNRLVPIVEPEILADGPHSIEVCAVVTQKVLSCVFKALQENGVLLEGALLKPNMVTAGYECTAKTTTQDVGFLTVRTLRRTVPPALPGVVFLSGGQSEEEASVNLNSINALGPHPWALTFSYGRALQASVLNTWQGKKENVAKAREVLLQRAEANSLATYGKYKGGAGASLYEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Aldolase provides an unusual binding site for thrombospondin-related anonymous protein in the invasion machinery of the malaria parasite.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 126
structure length 359
sequence length 364
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2pc4A00
1RPXA 2WNZA 2G96A 4EIVA 3QEZA 4AHQA 4KFNA 1XXXA 1F2JA 3S8HA 4RZ5A 1WOBA 5I3GA 3LRKA 2ABAA 1GEQA 3W7KA 3DKJA 2J9YA 4LV9A 2Y85A 3QPZA 4CLMA 3DFQA 4N9BA 1FDYA 3QMTA 1OYAA 4PODA 2YYUA 5T26A 4RKAA 3U6WA 1FCBA 3GXNA 2EAWA 5EKYA 4JTKA 3B06A 3R8RA 3L2IA 2E6AA 3IIVA 3NOEA 3G0SA 2E5CA 3FA5A 1OFOA 1YXCA 3DHDA 5DXYA 4UTMA 3DH7A 2A7PA 3L5MA 5A5WA 3GR8A 2Q3RA 3IIPA 4IMGA 1UASA 3R5EA 4LWWA 5D05A 3B4UA 4WOZA 4A21A 3R2GA 2NX3A 1MEWA 4FF7A 1JUKA 5CZ0A 4O8RA 3RMJA 5HWMA 3WK1A 1FWTA 1XDLA 4E2DA 3CM4A 3IEBA 1CX9A 1N7KA 3HG3A 3TC6A 1LROA 3MI2A 4YCOA 4ZQPA 2HS8A 2ZBTA 1DJQA 2NLIA 3ZR4A 5AC6A 2WSRA 5CPLA 5LHFA 2X1UA 5AYZA 1MZHA 1TPUA 2GUUA 2C0AA 2JK2A 4AWUA 4DF0A 1XUZA 1Q45A 1ME9A 5A8GA 1U83A 4N2YA 4CQAA 3DKLA 2X1RA 3H53A 3E12A 3SY5A 5KZMA 3S5YA 4OT7A 4MOZA 1I2OA 3NM1A 4CCCA 5DY3A 1LRTA 1VJIA 3ZS4A 3L66A 3YPIA 2E5DA 2ALDA 1S5TA 2VEMA 4R34A 2C15A 5DLCA 3CU2A 1R46A 1R2RA 1JQVA 4UTWA 2Z0IA 1YPIA 1FXPA 4IX2A 4LT9A 2A85A 4OHQA 5C2XA 4EOUA 3V75A 4NJKA 2ATSA 3GVGA 2WSQA 3NM3A 2J9XA 2YYTA 3I7QA 1I2RA 4I7VA 1B4KA 5LKYA 4R33A 1KM6A 4MYAA 4WD0A 1XL9A 2QUVA 3ATZA 3KHJA 4X9SA 4DELA 4DF1A 4Z1AA 1KTCA 2VFEA 1WAUA 4EF8A 1B57A 4K36A 2OT0A 1B3OA 5D2TA 5K9DA 2V0TA 3I68A 4QITA 2OCZA 1VCGA 4M6VA 3PUOA 2VEIA 5ABTA 1UB3A 3LCIA 5EA9A 3TFXA 3Q37A 4XQ6A 2YFOA 3GDMA 2CLIA 1OFQA 2NX1A 2DZUA 1UJPA 5KITA 4Y8FA 1HO4A 2D73A 4I9AA 3MYOA 1TCDA 2GQAA 1DQWA 1TO3A 4AXKA 3PSVA 1VLWA 3O16A 2OMAA 4JY9A 3W1QA 4MY8A 1BKSA 3W7IA 1KFEA 2BSLA 1ADOA 2QCNA 1WBJA 2V2CA 4OU1A 1JCMP 1LLWA 5KTLA 5SWUA 5G4WA 4LW7A 3W7EA 3Q94A 3HJZA 3LTSA 1Y0EA 1LRQA 3NQFA 3LV6A 1OFRA 2P0OA 3PF3A 3PWAA 5LGZA 3AJXA 5TQLA 1H60A 3PM6A 4PL1A 3B05A 3F4NA 4Q32A 4UFHA 4E38A 3AO0A 5DCDA 1RQBA 2NV1A 1I45A 4JN6A 3QW3A 3UWUA 2TRSA 4BI5A 5D30A 3TA6A 4BWLC 4UTHA 4DO6A 3L0GA 1L6SA 3UPWA 3C2EA 5D33A 4HT3A 2NXGA 5TBOA 3OVRA 4TO8A 5K7JA 3G3MA 3UZ5A 4O12A 2B4GA 4K37A 5AOUA 4Z0SA 3I65A 2UV8G 1RQEA 4GUFA 2QUUA 4PEKA 4W9TA 3NXFA 4LU0A 3L9CA 3TXZA 2A6NA 4MJZA 4GUGA 1YDNA 4FEZA 2VOMA 3LHWA 3W07A 2QCDB 5LZLA 3IIOA 4MZ8A 2W0UA 3GDTA 2WJZA 1U5JA 5AC8A 2H6RA 1O4UA 2Y63A 3CQ0A 4DBEA 3NR0A 3B04A 4LV4A 3B0VC 2WV8A 1KM3A 2ZFAA 5F2GA 3W2MA 3DXIA 1FCUA 2J88A 5U7SA 1EB3A 1OFBA 1K7EA 3G22A 5I3FA 3P62A 5L6UA 1TSIA 1TTIA 5FF7A 2GPTA 2YR1A 3S6DA 3L65A 2CLKA 4IXXA 1JCLA 1TPB1 5EMUA 2WSYA 4YL2A 4IMDA 1EWEA 2R91A 3PG9A 1ONRA 1IXQA 1H51A 1RV8A 4GC4A 2GOUA 2E77A 3E9AA 2OT1A 4ZQNA 3G1FA 3N14A 4GRSA 3W1NA 2GQ8A 3HIJA 2P1FA 3DFNA 1VZWA 4OGZA 2TSYA 4WZHA 3IGUA 1BEUA 1H7WA 2XN1A 3LXCA 2G5WA 5HR6A 2ZRUA 3NQEA 1XKYA 3QSRA 4NVTA 3A9IA 4N9EA 4O16A 4MZ1A 3EX2A 1E51A 3W73A 3O63A 5DBTA 2B0MA 3WJWA 4N02A 4WX2A 4WUIA 3W1LA 2DJLA 3PBWA 1LP6A 4MY1A 5DELA 2C18A 4UTWC 1NF0A 3LDVA 3LERA 2TMDA 3EX3A 4A2SA 4UTIA 3EX6A 4M19A 2W6RA 4EVZA 3G18A 4Y9AA 1OX6A 2DZWA 5AFDA 1TYGA 4OQVA 4HNUA 1YPFA 1OK6A 2E6DA 3C61A 3BLIA 1KV8A 5FEPA 1H7NA 3KAOA 1NVMA 1R2SA 3LHYA 3S9YA 2YW4A 3GDLA 1BTMA 1QCWA 2EGZA 2DZVA 4JY8A 4LNYA 1Z48A 2QJGA 3TXVA 4UTLA 3WJYA 4EWND 4M6PA 3NPVA 2X2GA 3SGZA 4D2JA 1CW2A 2ZYFA 5FEXA 1GG0A 3LHTA 1HG3A 3I7RA 1RR2A 1TRIA 2PRMA 1DKWA 1JRCA 1A5BA 1HUVA 1Q6OA 4L4LA 4LS1A 1ZAIA 3O8AA 3E49A 5HULA 3C8FA 4JTSA 5IM51 3WK2A 2C14A 4AH7A 1QOQA 1N8FA 1M7OA 1W0MA 4O0KA 4EF9A 3HGSA 2ZZ3A 4U4MA 3EWWA 4JX6A 5FF2A 4MLJA 5LNVA 3OG3A 5D38A 2QJIA 4JTJA 2XN2A 5I3KA 2VFDA 3C2RA 2H8ZA 4WXZA 1LM1A 2KZHA 4AWTA 4MKNA 2RHGA 4AAJA 3GYEA 3CWNA 3EKZA 2DORA 4JTFA 3NQGA 2ZRVA 2PC4A 3HO8A 1SW3A 3O05A 3TK7A 3MP3A 4DPPA 1G4PA 2HTMA 4O54A 5D09A 3RU6A 1VHCA 1XBYA 1WA3A 2CU0A 4GNJA 3PBYA 3OVPA 2VFFA 3O6YX 2QCDA 4NX0A 3A23A 3HB9A 3PR2A 2C3ZA 2QCMA 4UNLA 3E0IA 1B9BA 2NWRA 4FXRA 1THFD 3OHIA 3L67A 1H7XA 3IGSA 1OABA 4FB7A 1UCWA 3MO7A 1OFEA 2CWNA 2JBMA 2ZTKA 4LVGA 5F1VA 1ZJIA 5G1YA 3GIYA 1MEHA 1O5KA 1OFPA 1SSGA 1LBFA 2RH9A 3HGOA 1LBMA 2PRHA 3TFCA 3GXPA 4GXMA 1LLZA 4DF2A 1SO4A 1KA9F 1PCKA 3W84A 3C6CA 2Y6ZA 3MHFA 4QAIA 3PC0A 3CWOX 5TIMA 1N55A 1FDJA 4JTLA 1G4TA 1XFBA 1Z44A 3GXTA 4HN4A 1I2PA 2BTMA 2JGQA 4QNWA 2ZA1A 4JTHA 2CFFA 1OX4B 5LHEA 3N2XA 1X1OA 4JX4A 5AHNA 3GDRA 1OF8A 4S2BA 3NPXA 3W72A 4K8HA 1VH7A 4LVFA 1SUXA 2PE4A 3BGJA 3L5AA 4O50A 3D0CA 3LGEA 1DOSA 1XM3A 4FO4A 4GUJA 5HWNA 3NZRA 2ISVA 3VKJA 3UNDA 4FX6M 4CCDA 1XCFA 1EWDA 2RKXA 4RLIA 3P61A 4BWLA 1XBXA 1NAL1 4NJIA 5AB3A 5LGXA 4ALDA 1L2UA 2WOQA 1W3TA 3EKLA 1DBTA 3SJ3A 5CPNA 3QZEA 2JKPA 3M43A 1S3HA 3HMJG 3FLUA 4YWIA 3CB8A 1AW1A 4ZQCA 1QPOA 3LLFA 4IQLA 2RFGA 1XC4A 2FLIA 1TB3A 4LS0A 1ZENA 2FQIA 5K9XA 1QO5A 2AAMA 2GQ9A 1HO1A 3WJSA 1GYNA 4MYXA 3C2FA 1YXYA 1R2TA 1S5WA 2X16A 5FF4A 2FJKA 3CIXA 4JTUA 3NQ7A 2WNNA 5LSMA 4UXDA 3B8DA 1W5NA 2CLFA 4O18A 3N73A 4NJGA 3GKFA 3SSJA 5FF3A 2BX7A 4HPJA 3WJZA 3TSMA 3UY7A 1TTJA 3FKRA 1W56A 1K7FA 3BW3A 2NZLA 3NQ2A 1HL2A 2W79A 1IGSA 1WQ5A 4WOQA 3PUDA 2VFIA 4A2RA 1H1YA 4P61A 2Z6IA 3NL6A 1YDVA 4AMAA 2YDAA 3MW7A 4P2VA 1PHQA 3M47A 3DI1A 1CI1A 1GYLA 5KZDA 4TMCA 3TMLA 4N9CA 1JCNA 3M9YA 1KV5A 4ORIA 4H6KA 1FWNA 5U4NA 3S5ZA 3W7OA 1P5BA 2X1TA 4R7JA 1IIHA 5AC7A 1JCYA 2DJXA 3TNOA 3FYPA 3UY8A 4ONVA 3W7CA 4NZJA 1AW5A 4JD4A 1QDSA 2EHHA 5G1TA 5G4EA 1EIXA 3UWYA 3A22A 1W5PA 1J4EA 3C0JA 4IMCA 4LS2A 3R13A 3W7HA 1YTDA 5IBXA 2V2HA 6TIMA 3PBVA 1VCVA 3KVMA 3NL2A 1EPXA 1VYRA 1H5YA 3WK3A 1GVQA 4JYDA 1ALDA 2ZCGA 3FJLA 4FNTA 5CZJA 2A1YA 1KBIA 1GZGA 3ATYA 4IUOA 1Q6LA 3HOJA 5C54A 4L4MA 1SZNA 4JYEA 2CLMA 4MY9A 2ZRWA 1JR1A 3BO9A 5LNUA 2QR6A 1DJNA 2YZRA 1TTPA 2WNQA 3ZFHA 4JXCA 4UTTA 1GVFA 3EX1A 2A2IA 5FESA 4AEOA 2I1OA 4GUIA 1KM1A 3HPXA 3KX6A 3G24A 4NT0A 1W8SA 3TC7A 2GVJA 1GJPA 4ZVJA 4XTIA 2PURA 3PSWA 2AQWA 4A29A 3LCLA 4LC8A 3ABRA 5CPOA 4MPQA 3TSBA 3VE9A 2Y7FA 1VRDA 3SIZA 3FYOA 4N4PA 3KRUA 3UXDA 3LHUA 4UTKA 1YLVA 1OX4A 4N6FA 1TMHA 1AMKA 3DU0A 3G1YA 5G2HA 1QNVA 2CZFA 3NQVA 4X22A 3L21A 1XI3A 3QW4B 2B7QA 3HGRA 3GX9A 1TPC1 4XWUA 3OEXA 3W22A 4PH6A 3SZ8A 4FNSA 2ZZ6A 1QPRA 3W1PA 3W7QA 2E09A 1SFJA 4Q33A 4UFLA 4FNQA 1LOQA 1XDMA 4TX9A 4QQ3A 1NEYA 1A5SA 1VQTA 3PBUA 3OBKA 2RDWA 1G67A 3STGA 3TQVA 1I4NA 1KTNA 3B0UX 3RK8A 2G97A 3W88A 3G1SA 4CQ8A 5HQEA 3UWVA 3LTYA 1QO2A 5BRBA 3CIWA 1AL8A 1TQXA 2NUXA 4UTUA 3LXAA 1ZHAA 5KSWA 2ATMA 3U2OA 2Y7DA 1TV5A 1W54A 3MBFA 3C56A 3M5VA 2EKCA 1YYAA 3W7PA 2GVGA 3DFSA 3CLMA 4WY0B 2V30A 4K38A 1VCFA 3HQ1A 4H4IA 1VGAA 1W1ZA 1SO6A 1KFCA 3FIGA 4OBTA 3LBCA 4NNCA 1YTEA 3W1RA 3DENA 3BVJA 1PE1A 1P1XA 1EP1A 3VE7A 2Q3OA 1T99A 5D2WA 3WFAA 4IGHA 4FNPA 4I7WA 2FFCA 4TU1A 3NNTA 1RD5A 4NZFA 1FDZA 3S1WA 1K03A 3MP5A 4JTIA 4E0CA 5EBUA 3HG4A 3CT7A 1JQXA 3BG5A 2QCCA 1PS9A 1DQXA 3C2VA 4G1KA 3GAKA 1J2WA 1F05A 1G7UA 3TW7A 1L6WA 1HTIA 2QJHA 4MIMA 2QCEA 4N9DA 2CLHA 3LTPA 4IMFA 1GT8A 3TMQA 3JS3A 1K02A 2Y7EA 4HIBA 4S2CA 1D3HA 1O94A 1P0NA 3TKFA 1K8YA 2QCGA 5BNKA 1JULA 2NUWA 3VI2A 3QRHA 4YLWA 3MWAA 2H8XA 4O0ZA 3W7NA 4AWSA 2NUYA 1TPDA 5LNWA 1WDWA 3B03A 3NQCA 2YW3A 5CGQA 3SECA 2WO5A 3QMRA 3W1UA 1IXPA 1DVJA 2J24A 1OX5A 3VCRA 4JEQA 2Y88A 1ZFJA 3N9SA 5J5DA 1LRNA 2Z2UA 3HG5A 3EXSA 4Z1CA 4M7TA 2YGYA 1OYCA 2Y62A 5I3HA 1ME8A 2CLOA 2QAFA 3EWYA 2HMCA 3VNDA 3TCEA 1TV7A 2YPIA 5FEWA 1ZAJA 4PL2A 3ANYA 3RNDA 2ISSA 3P5YA 1H50A 3W2KA 2OX1A 4BR1A 1GVSA 2V5BA 4O1DA 1T8XA 2VC6A 5IBXC 3BPWA 4ORMA 3QH2A 4JS3A 2PCQA 3N3MA 3USBA 4E2BA 3C2OA 5DCBA 1LORA 4NUWA 4RX0A 1M7PA 3NL5A 1VYSX 1PVNA 4A22A 4XUGA 1YTKA 1OFAA 1G6CA 1AL7A 3MMTA 4JTGA 1JUBA 2GJNA 2J6XA 1GPWA 2I9EA 4JR5A 1WX0A 1TRDA 4UTTC 2H3BA 3TQKA 3TIMA 3EB2A 2ZZ7A 3QJAA 1WXJA 4LVDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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