2QDG | Genus

Total Genus 135

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	135
sequence length	366
structure length	366
Chain Sequence	MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDDDASSSSLYV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Carboxy-Terminus Recruitment Induced by Substrate Binding in Eukaryotic Fructose Bis-phosphate Aldolases pubmed doi rcsb
molecule tags	Lyase
source organism	Leishmania mexicana
molecule keywords	Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
total genus	135
structure length	366
sequence length	366
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2007-06-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2qdgA00

3CM4A 3B03A 3M5YA 5HUOA 2QCFA 3N19B 4DELA 4LC6A 4LS0A 1SSGA 2I1OA 3GXPA 1KTCA 4GBUA 4RV8A 3TXZA 3EWZA 4HNTA 1FWRA 1K03A 3ATYA 1TPB1 5G4EA 1BEUA 1NEYA 4IUOA 3WJWA 1J4EA 1SZGA 3C2EA 4LRSA 4QJ1A 2ZRZA 3NQFA 1VYPX 3W7PA 1NVMA 3KRUA 5L6UA 3NL2A 3W74A 4AWUA 1LROA 3ZS4A 3QEZA 2R8WA 1TYGA 3TU9A 2WJZA 4Q33A 5E1QA 3PAJA 1XBXA 3TAKA 3O63A 3LBMA 4O52A 3KAOA 4O19A 1T8XA 4N02A 1W3TA 4FEZA 2ZFAA 1GTEA 1ZAHA 4J9JA 3TCEA 3HG2A 3BVJA 4MKNA 1G4SA 1F6PA 1GQNA 3QC3A 5LHFA 2QCLA 3UD6A 4ADUA 2V9DA 3HPSA 1RPXA 5TIMA 4H3DA 4IXXA 4XKYB 1O4UA 4LUIA 2NWRA 2TMDA 1ADOA 1ICQA 2JBMA 3DI1A 3TUUA 3MP4A 4WXZA 2RDTA 1P1XA 3T4CA 1TB3A 1B4EA 3N9SA 1X1OA 3PG8A 4A22A 5I3FA 3KHJA 3GB6A 3KRSA 5HR6A 2YSWA 4MYAA 3F4NA 3IIVA 3TFCA 3MMTA 4LWWA 5G2HA 1KBIA 2CWNA 4LNYA 2C18A 4UFHA 3NPWA 5CPMA 1H7WA 3G1XA 3W7OA 5AB3A 1MEHA 4MVAA 3NR0A 2QCCA 3N73A 1KW1A 6TIMA 1TRIA 5D2VA 5LNRA 4FNPA 3W7QA 3IIPA 3NXFA 2BLEA 4PEKA 5A5WA 3NM3A 4ZQPA 2FLIA 3MYPA 1XXXA 5DCDA 3NQAA 3W3OA 3IVTA 4CNOA 1AMKA 1GYLA 3UXDA 1W5PA 4Y90A 5EBUA 4Z1CA 3AO0A 1VHCA 1OX4B 4KWWA 4LV4A 2TYSA 5DCEA 2V5BA 1VLIA 1D3GA 5CSRA 3P62A 1ZAIA 2ZRUA 4O15A 3TJLA 5FF2A 5J5DA 4RZ5A 4NNBA 3HB9A 3L5MA 3G0XA 5H2ZA 2ZDRA 4N9DA 3NQ7A 5LZLA 3IRDA 1VCFA 3E96A 2A5HA 3O8AA 2B7QA 4BFAA 1YTKA 2Y7GA 4ADSA 2V2CA 3I68A 3W1UA 3RFAA 1XCFA 4TR9A 4K36A 4ICNA 3F4WA 1ICPA 5G1YA 2CZFA 2JK2A 2QKFA 5FESA 3G1AA 1SW0A 2YXGA 2B7OA 2E77A 3DFOA 4NJGA 1TV5A 2C6QA 2E68A 2V81A 2ZTJA 3KVMA 4N6FA 2C0AA 3ZWSA 3L5LA 1HG3A 2A7RA 4UTHA 4XTDA 3EX3A 1Q6OA 3LB0A 3W7HA 5HQEA 3NL6A 3TMQA 3WK2A 3C2VA 1JUKA 2QUTA 2VEIA 3PY2A 3B0UX 2GQAA 1G7UA 4O50A 1LOLA 3W84A 1XBYA 1O5XA 3HQ1A 4WY0A 2X1RA 3A23A 3G1VA 3LCFA 1KM2A 2FPVA 1ALDA 1QR7A 1U83A 3USBA 2OMAA 5IM51 5AC8A 3KOFA 1KA9F 2E09A 1I2NA 3S1WA 5F2LA 2CLEA 2OX1A 2VEPA 3TFXA 4O57A 4MZ1A 1X7FA 4CLMA 4M5PA 2PURA 3W1QA 3STGA 1PHWA 3TSMA 4NJJA 4CCDA 3MO7A 1LRNA 4Y9AA 3IVSA 4IOTA 2E6FA 4OV9A 5AFDA 3HPXA 1W37A 1HFBA 1Q45A 5F2GA 4DPPA 2J6XA 4EIVA 2XFWA 1WYIA 3DGRA 2CZDA 3LXBA 5KTLA 3CQ0A 1VHNA 4JYDA 1O5KA 1O95A 1EX5A 1W0MA 3TSBA 2J27A 4FF7A 3S5OA 3P84A 5CPOA 3S1XA 1K8YA 4YLWA 5LSMA 4EVZA 1OFAA 3V75A 2LLEA 4TU1A 4IPJA 3NQ2A 1MXSA 1KV8A 1Y0EA 3N9RA 4OE7A 3UNDA 4JEQA 3QPZA 2GOUA 1H50A 1S3HA 1Z42A 4X3ZA 4OHQA 4MY9A 1NF0A 4IJBA 4Z1AA 3KFTA 4LRTA 3W1TA 3HJZA 1VS1A 1A5CA 5D38A 3LXCA 3C2OA 1A53A 5FF3A 1LYXA 1Q3NA 1TPDA 3P74A 4TO8A 2C1HA 2WNNA 3RK8A 1SW3A 1X8FA 2YX0A 4WD0A 1I45A 1RD5A 3G0UA 3FYOA 3PF3A 3L21A 3NZ1A 1G69A 3W22A 1GVQA 3MYOA 3LV5A 4GRSA 5DY3A 2QAPA 3DFTA 3PS7A 3M16A 3LCHA 1W5NA 1VJIA 6ALDA 2QDGA 4O0ZA 3NL3A 3DENA 4NU7A 4NVTA 4MFDA 1JQXA 1H60A 1KFLA 2WPBA 1LLZA 4OT7A 3S5YA 1L6WA 2FTPA 4RLIA 1FXPA 1H5YA 1MZHA 2W79A 3TE9A 3WK3A 3M41A 3FIGA 4BI5A 4UNKA 1ZCOA 4RXFA 1XM3A 4NX0A 3WJZA 3N2MA 2E5BA 4M6QA 3DHFA 1K8ZA 3ANYA 4YXGA 3EEGA 2TRSA 2A7NA 2QCNA 3M5XA 1L6SA 2ZA3A 4U4MA 2C19A 3BG3A 2Y62A 2E6YA 3ZFHA 4JY9A 4MLRA 5D2YA 3G0SA 1QWGA 1S5WA 4XKYA 1RV8A 2YW4A 1KFEA 4JTJA 3W2LA 5K4XA 3Q94A 4FNSA 1KFCA 2JGYA 2VKZG 5CG7A 5FEWA 4QSHA 3C56A 3QH2A 3CB8A 2ZRWA 5LHEA 2ISVA 5FI8A 1SW7A 1KV5A 1SSDA 1J2WA 3FJ6A 2R94A 1DQWA 5G2WA 1CW2A 2FB2A 1UJPA 5AC7A 1SO5A 4W9TA 3MP3A 5F4SA 2WKJA 1R47A 1VH7A 4HNUA 4IX0A 3GX9A 5HMSA 3SSJA 3TKFA 4OBTA 1A5AA 1JCMP 2OT0A 3IIXA 1W5OA 1DV7A 5F2MA 4DF1A 1FX6A 3HGOA 4H4IA 3NO5A 5E93A 1HUVA 2OZ0A 3TMLA 3TDFA 4OU1A 3BGJA 5H91A 1AK5A 3K30A 2UV8G 1FCUA 3KXQA 5F1UA 1H7OA 3C6CA 3TC6A 4A2RA 1OX4A 1ME9A 3G3MA 1TJRA 3G1DA 4LU0A 4N2YA 4C1KA 4AH7A 2BWGA 2ISWA 2VELA 1JJKA 1EP1A 3OVPA 5HULA 1TIMA 1VGAA 2X1TA 3F1QA 4DO6A 2DORA 1YXDA 4K8EA 3KRZA 1J5TA 1QOPA 4LVGA 3DH7A 4AWTA 5K3VA 1GVFA 4RX0A 4LUJA 1O94A 1H63A 4UMBA 1W3NA 4WXYA 1EIXA 4JTEA 4JTHA 1OYAA 4IMGA 3TQ0A 4JGDA 3BARA 4IMEA 1IXNA 3T44A 4GJ1A 3SGZA 3W76A 4ZL1A 2EKCA 1K7XA 3CLMA 4JN6A 1FDYA 3PWAA 1TPWA 3N14A 2VFIA 1JRBA 3GLCA 5E0KA 4LOCA 1H61A 4JTGA 1OF6A 4O18A 1W3IA 3GIYA 4FIQA 1UUMA 4AMAA 2ZZ2A 4HPXA 1TPUA 1L2UA 3NEVA 4DBDA 1RQEA 1EUAA 1V7YA 3PUDA 3QJAA 1XBZA 2G5WA 3A5VA 3W75A 4JS3A 1PV8A 3L68A 5DN1A 4YMZA 3CT7A 5D03A 3PG9A 1QCWA 3W7LA 3O06A 4AWSA 1EA0A 3W72A 3QFEA 7TIMA 2W6RA 2DZSA 3E9AA 4FHAA 2PE4A 4UTTA 3W9ZA 2V30A 3ABOA 3PUEA 5T26A 2BXVA 1YDOA 3P82A 5J5RA 2WQPA 1WOAA 3IGUA 4UMCA 2QCEA 3MBFA 4YCPA 2Z0IA 4RCXA 3C8FA 1ICSA 2CU0A 1FWSA 1QMLA 3TV8A 5I3HA 3WJSA 2J9XA 4FX6M 2ZZ6A 3LTSA 2J9ZA 3HGRA 5EYWA 5FF0A 3G24A 3BW4A 2CLOA 4HT3A 1SO6A 5I3JA 1AL7A 3L65A 2VXNA 3DAQA 4MZYA 3GR8A 2QCDB 3UZJA 1TTPA 3S6DA 5CPNA 3P8IA 1CI1A 3I7RA 1QNVA 1G4EA 2CLLA 3T55A 4BWLA 1C9DA 3SECA 2DZWA 1SFLA 3C2RA 3B0PA 1QOQA 2ZRXA 3E49A 4TMBA 2TPSA 1F76A 1OFPA 3G1SA 5F4WA 1EB3A 3MP5A 4O12A 2CLHA 3GYEA 3O07A 1ZHAA 4MUZA 2ABAA 5LNWA 3LHVA 2X1SA 1N8FA 3UY7A 1OFBA 1Q6LA 4P2VA 4JNMA 4JX6A 2O7QA 4WZHA 1TQXA 4M19A 2X2GA 4MLJA 4O4WA 1H7PA 1SR9A 2DZXA 3A24A 3NAVA 4YWIA 4JTIA 3W2UA 4LVDA 3IIZA 3W7JA 4HPJA 4X9SA 3DFPA 3LM7A 4PL1A 3IEBA 4UFJA 3TC7A 1IGSA 1LBMA 2Q8ZA 3M43A 1W54A 1H1ZA 3CWOX 1UASA 4N4QA 1IXOA 1HL2A 4I7UA 2GVGA 1SO4A 3YPIA 5DY2A 3DHDA 1MSSA 4HSNA 3OEXA 2DZTA 1QPRA 3EWWA 1F2JA 1GOXA 1KFBA 3L9CA 5K2ZA 4MYXA 1OFDA 4TMCA 1UBSA 3EKZA 3LDVA 4K37A 4WOZA 1EPXA 3QYQA 2C3ZA 3LHZA 1W5MA 2AAMA 2NXGA 1ZAJA 5AHMA 3EX1A 5KZDA 1QDSA 3NYZA 2ZCGA 3OVRA 4RZ6A 3G22A 4QNEA 3PBYA 3PBUA 4PA8A 3TH6A 3M0ZA 2Y61A 2QJGA 4PCFA 3E02A 3IVUA 4RKAA 1C29A 1XBVA 3S1VA 1JCJA 1F05A 4GE8A 4LVFA 2YFOA 5IBXA 3W7DA 1TPVA 3TNOA 3WFAA 4UFLA 5AHLA 3EWXA 1WA3A 3LLFA 1DJQA 3LBCA 4RZ4A 3BV4A 2C13A 3O05A 1DL3A 2QJHA 1UUOA 1I4NA 1T0OA 3O6CA 1FBAA 3SIZA 5D09A 5CKSA 1KBJA 3RNDA 2NX3A 4AB4A 1THFD 1OVDA 3NPUA 1OABA 3DKLA 4GUFA 1ME8A 2ZA1A 3NQ6A 4UTWA 3PC0A 1GPWA 3NQ8A 1FCQA 1AW2A 3LCWA 1GG0A 5GVJA 1DOSA 2Y70A 3W2JA 4GC4A 4MJMA 3OA3A 1EP2A 3W7KA 5AHFA 1XC4A 1PCKA 1KLZA 4UFKA 3QRHA 2JKEA 3C2FA 3G1HA 1JCNA 5IBXC 2GPTA 3IGXA 3SGUA 1QO2A 1F74A 3P8JA 4DPQA 3SR7A 3CEPA 1XDLA 1AG1O 4AF0B 5L9FA 3QW3A 1TO3A 2QAFA 1UB3A 2Z1BA 1TMHA 3HGJA 5AOUA 4YL2A 2V2DA 2FQIA 3TIMA 1X6UA 3UPBA 3P60A 3STCA 3W1MA 5BRBA 3LCGA 3B8DA 1FCBA 4UTWC 3LCIA 1AW5A 2ZZ3A 2Q8LA 3SZ8A 3W85A 1PHQA 1SU5A 1PL9A 1RVGA 1RZMA 5K9DA 4GUHA 3PBWA 3NQMA 4BF9A 2R91A 3W2MA 3BLIA 4O4VA 1OYBA 4LTSA 3ABQA 3DKJA 4DEFA 1OF8A 5G1TA 3HPZA 2ZZ7A 3S9YA 2NUWA 3L5AA 4UMAA 2Y85A 2ZYFA 1JCYA 4I9AA 4KFPA 3UWVA 3G8EA 1K8XA 4BR1A 3O6DA 3LV6A 1JR1A 2VFEA 2BSLA 4JIQA 3BG9A 4AHQA 5C2XA 3GDMA 1LBFA 1P0NA 1YLVA 4ZQCA 1FDZA 5HUPA 3OIXA 4UFMA 1W1ZA 3UWZA 1I2QA 4NX5A 5AYXA 4WOQA 5DXYA 4S2CA 5D02A 2VENA 3UWUA 3QMRA 3UY8A 2DZUA 4KWVA 1DORA 3HO8A 1T96A 1TPH1 2PRMA 2OT1A 3W7GA 1NAL1 2E1DA 3T40A 1OK4A 3I7SA 5F2IA 3W7MA 5KZMA 1GZGA 3LTPA 1N55A 1KLYA 2A7PA 1JCXA 3LHYA 3GKAA 4MY8A 3OBKA 2A0NA 3CIXA 3NPVA 4DF2A 4AAJA 5I3IA 3ELFA 2NLIA 4ML9A 4ONVA 3LI1A 3W1LA 3BW2A 1ML1A 4CQ8A 3M6YA 1GT8A 2YR1A 3UXAA 4RK8A 3R5EA 4GXMA 4IWWA 2RDWA 3KVLA 4JYFA 2XN2A 4HSOA 4IMCA 4ADTA 3G3DA 3MBDA 3RU6A 1EP3A 1Q6RA 3F03K 3E12A 4K8HA 2ABBA 1MO0A 5D04C 2QCDA 4WJEA 4ZQRA 2B0MA 1VYRA 1M7PA 2QCHA 4K7YA 1SZNA 1TV7A 3GDKA 2QEZA 4XWUA 2P0OA 5D2TA 4EOUA 2G97A 3HBLA 4QNWA 1VLWA 3MHGA 2VEKA 5G5IA 2YPIA 1KTNA 4UR8A 2YFNA 2C16A 3QMTA 1CX9A 1LRQA 5BMWA 4D2JA 3G1YA 3GK0A 5LNVA 3LRKA 3MJYA 1R30A 3BG5A 2VEMA 2ZQ0A 1LRTA 3EWBX 1V5XA 1KM5A 3DZ1A 1H7XA 3NPXA 3EX2A 2A6NA 4UNLA 2R14A 1H7RA 3LRLA 1KM1A 1VZWA 3A22A 3LLDA 5LGXA 4FX7A 2QJIA 4BK9A 3HGSA 4O11A 5AHNA 1OK6A 3WK1A 2J9YA 4I7WA 1KTBA 2C14A 1L6YA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2QDGA

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