2QDGA

Fructose-1,6-bisphosphate schiff base intermediate in fbp aldolase from leishmania mexicana
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDDDASSSSLYV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Carboxy-Terminus Recruitment Induced by Substrate Binding in Eukaryotic Fructose Bis-phosphate Aldolases
pubmed doi rcsb
source organism Leishmania mexicana
total genus 135
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qdgA00
4JYDA 1VC4A 3CC1A 3LTYA 3UWYA 3FA5A 1SZEA 3WJWA 3DI1A 3G1YA 4ADTA 1YXCA 4GUFA 2ZZ4A 3KVMA 3MWAA 1IXNA 3CT7A 3W7PA 2X1TA 2GQ9A 3P74A 1PE1A 3W2MA 1LRQA 3W72A 3HPSA 3W23A 4FNSA 3W1UA 3F4WA 1D3GA 3G1HA 5DY3A 4O17A 1ZFJA 1H1ZA 1ZY9A 2V9DA 1NF0A 4M6VA 1I2NA 2Y70A 1H51A 1S5WA 1OYBA 3BVJA 2X1SA 2FB2A 3ELFA 5KSWA 3AO0A 1KFBA 2A6LA 3UXDA 3GVGA 5U7SA 5KZEA 4QNWA 3LLDA 2DJXA 3W2NA 3FJLA 4WX2A 1EIXA 3THAA 4JTSA 5HWNA 3BPWA 5DXXA 3STCA 5KMYA 1TV5A 3P61A 3C8FA 1W8SA 4MYAA 1OFBA 1V5XA 2TRSA 3PC0A 4WJEA 3EXRA 4A22A 3P81A 4AH7A 2A2IA 4E0CA 4QISA 1JCNA 4FO4A 2R94A 4R7JA 3A24A 1QO5A 4JX4A 4GFSA 5BMXA 2YFNA 5EA9A 4E38A 4FXSA 2PURA 2E68A 4MLJA 3W2LA 3QPYA 4Q33A 4IQLA 1H50A 3NL6A 2V30A 2BWGA 1F05A 1DJNA 2O7QA 5DBUA 1KM6A 4K7VA 3W1NA 3S0CA 4LC6A 2O7SA 3DZ1A 1SW3A 3CM4A 3L5AA 3G1SA 2A1YA 1K8XA 4FNQA 3KRSA 1OVDA 1X8FA 1H7NA 3Q58A 2B7OA 3OBKA 1FCBA 1GZGA 2HTMA 3SZ8A 3DFSA 3N19B 1O5KA 3KAOA 2ZRZA 2LLEA 4UTWA 4XQ6A 3EB2A 4JTEA 1WOAA 4E2DA 2G97A 1UUMA 1K7XA 5DCEA 1EP2A 3PVFA 2VKZG 3RNDA 4CQAA 3SI9A 2YW4A 1ICSA 4C1LA 1PCKA 2A4AA 1TTIA 3BG3A 4NU7A 3K30A 3IV3A 5TIMA 5AYZA 3CIXA 2R14A 4K8HA 3MI2A 2ISWA 1SO4A 1Z41A 3E49A 2DORA 3GR8A 4MFDA 1JQXA 3PWAA 3SY5A 1Z42A 4Y8FA 1QNVA 1RVGA 1JCMP 3QW4B 2Y6ZA 3IEBA 1QR7A 2ZZ7A 4ADUA 1XC4A 2C6QA 3DENA 1L2UA 2E1DA 4RKAA 3B4UA 5DBTA 3LLFA 1WOBA 2ZRWA 2H3DA 4IJBA 1Q3NA 1RD5A 1OK6A 1T96A 3L5MA 1F2JA 2ZA2A 3TSBA 3PUEA 3S1WA 1H7OA 3A22A 5L6UA 3G1XA 1R2TA 4KWVA 1J5TA 2B0MA 5LKYA 3TX9A 1VZWA 4LTSA 3ABRA 3LXBA 1ZAHA 1DQXA 3MP4A 1VLWA 4CCEA 1IXPA 1TO3A 2YSWA 5KZDA 5EBUA 1EX5A 5FEPA 5DXYA 2C13A 3W7DA 1I45A 3HG2A 3I6RA 4IGHA 2FB3A 2QDHA 3L21A 3ATZA 1D9EA 1S5TA 5AYXA 2E6FA 2J9XA 1F73A 1GYNA 3HG4A 5D2TA 2ISVA 3GB6A 4ZQCA 1NVMA 1WA3A 4TU1A 2VOMA 3UY7A 1MZHA 1YADA 4OGZA 1ZALA 4HPJA 4JTHA 3TQKA 3C2RA 1A53A 1KM1A 4NJKA 1OJXA 1GVOA 2QCFA 5ABTA 1YTEA 2Q8ZA 1YTDA 1TMHA 1GYLA 3PR2A 5F1UA 2Z6IA 4NX5A 3W7RA 3NL3A 4O53A 3B8DA 1T8XA 5F2LA 1G4TA 2YCEA 4JTIA 3LOTA 1O60A 4KKXA 4O1AA 2C0AA 2CLHA 5C5YA 1TQJA 1CW2A 1TIMA 4AF0A 4PH6A 5DN1A 4O28A 3E12A 5HNRA 3RLUA 1OX6A 3N9SA 3FOKA 1H63A 2VEKA 1TJPA 1HO1A 3VI2A 4P2VA 2ZDRA 4JXCA 4QIUA 2PRMA 4GWEA 4RZ6A 4N9EA 3UXAA 3ZR4A 4FIRA 5AHNA 2IQTA 3ZWSA 1GG1A 3I65A 1KBJA 2RHGA 3W7GA 3QFEA 1ZAJA 4MJMA 2WOQA 1JVNA 3PUDA 4DBDA 2H3BA 3TAOA 3NQVA 1SPQA 1O4UA 2GVJA 3WK3A 3MMTA 3EEGA 3DI0A 2V82A 1QOQA 3HPXA 3GX9A 4XBKA 1PS9A 5CSRA 1RQEA 5LHFA 3W1QA 4MPQA 2H8XA 1SW0A 4PCFA 5T26A 2CLIA 5CPNA 4FIQA 1UB3A 1FQ0A 1W3IA 4FNPA 5D37A 1NEYA 3WJYA 3QSTA 3CTLA 3LHWA 2CLOA 1DJQA 1W37A 3FKKA 2WO5A 1VRDA 3G1FA 1B9BA 3P82A 4UMBA 1W5NA 3LCHA 4OBTA 3ZS4A 4UTWC 5MHBA 1O94A 3P84A 1SZNA 3E02A 1W5QA 3W87A 3STGA 1OF6A 2AQWA 4LNYA 3LRLA 4CNOA 1XBVA 4X2RA 2QAFA 1MEHA 1KTNA 5K9DA 1YDNA 2QF7A 1YLVA 1A50A 3QW3A 4FXRA 4UTIA 2Y7GA 3UWZA 4E2BA 1XL9A 3UZ5A 2WNQA 3MW7A 2ZZ6A 5AHMA 2B7QA 1DQWA 5BOOA 4MY9A 1FCQA 3R12A 1O95A 1S5VA 1F5ZA 5AC7A 3NQMA 1B57A 3ABQA 4S2CA 4PODA 1GWJA 2X1RA 2QJIA 1JCLA 5FF7A 1ZENA 1SFJA 4GUGA 3SGUA 3VE9A 3N2XA 1H5YA 1F6PA 2H90A 2OT0A 2B7PA 1RV8A 4DF1A 1FDJA 4L4LA 3EWWA 1VQTA 2HS6A 5IBXA 2YYUA 5HINA 4JTKA 3NQ8A 2B7NA 1E51A 2CZDA 5E1QA 3UZJA 1SZFA 2ABBA 2VFEA 3KRUA 2YPIA 3W70A 3GK0A 3A5VA 1TCDA 4DPQA 4UFLA 2PE4A 2AAMA 4ALDA 3LB0A 1FXPA 3NM3A 5AC6A 3IIXA 4O54A 3TFCA 3PG9A 1FWNA 1XBZA 1GTEA 2CFFA 4GUHA 5DCBA 3IVUA 3Q37A 1KM2A 5D32A 3GDMA 1JUBA 1KV5A 4JN6A 4FNRA 1LCOA 1TRDA 4UC5A 2FJKA 4W9TA 3TNOA 3HOJA 1AL8A 4CNPA 1ZJIA 4UTJA 3NZ1A 5FEWA 3OEXA 1EUAA 3IVTA 3MP5A 1P4CA 1FDYA 3M16A 5LSMA 4UNKA 1Q45A 5LGZA 2X30A 3V75A 4N4PA 4LUIA 5G2IA 2XN2A 4POCA 1M6JA 3LRMA 3I7RA 4EWND 4M19A 1K02A 1KBIA 1KFLA 1QPQA 1SR9A 4XZ9A 5BRBA 1CI1A 2EKCA 2JK2A 4LS2A 1L6YA 1I2PA 3GZ3A 4GXMA 4N02A 3A9IA 3L0NA 3W86A 4K8EA 1F6KA 5AFDA 3HO8A 2YZRA 3DU0A 4NJHA 1N55A 4PC8A 1JUKA 3M1ZA 2P0OA 1R46A 1XXXA 2Y7EA 2QR6A 4O4VA 3S5ZA 5G5IA 2ABAA 3QRHA 1MXSA 3UWVA 2X16A 4LVFA 2PRHA 2QUTA 1TTJA 2VEIA 3C52A 4JS3A 3SW6A 3VNDA 4JR5A 3OIXA 3HGOA 1W0MA 5KZMA 4AB4A 3G0SA 3F1QA 3T4CA 1W5PA 4LRSA 4BI5A 3KRZA 3W74A 2ZRXA 3GAKA 4DELA 4ADSA 5LNVA 4TIMA 1OYCA 3G3DA 3NQFA 1NF7A 4ORIA 7TIMA 2G5WA 2Y89A 4BR1A 4ZMGA 1JCJA 1EB3A 1LOLA 4AF0B 1TPFA 1TTPA 3USBA 5J5DA 3LHUA 3T78A 1I2OA 1C29A 1TQXA 3KOFA 3O63A 1AMKA 4JIQA 2HS8A 3GXTA 3B0UX 2FDSA 2Z6JA 4YLWA 1RQBA 4LVAA 2VEMA 1FXQA 4BI7A 3HGJA 4O52A 5I3FA 2YFOA 4BWLA 2BTMA 3T44A 5DY2A 3O1NA 1GQNA 3R2GA 4CQ8A 5FESA 3LXCA 4RZ5A 2R8WA 2ZZ2A 3ZWTA 4X9SA 1PHQA 1TPVA 2FIQA 1FUYA 1G7VA 4UMCA 3WFAA 2CW6A 3C0JA 4IUOA 1AW5A 1WQ5A 3W7JA 2P1FA 3BW3A 3QYQA 3PBVA 1P1XA 4OV9A 1PCWA 3S42A 1B4EA 5K3VA 2JGQA 3C6CA 4PL2A 3STFA 4RX0A 5L9FA 3L0KA 2A7NA 3MBFA 3LCWA 4I7WA 5CG7A 2Y63A 3JRKA 3MHUA 1W31A 4FHAA 4YCPA 4AWSA 2V81A 4GE8A 3U8GA 4RZ4A 1W56A 5AHFA 3JR2A 4K37A 1K8ZA 3U2OA 1GVSA 1ME8A 4WD0A 3IIOA 3IRDA 1MO0A 4M6QA 4XTIA 4JTGA 1GVFA 2YYTA 3B0VC 3NZRA 4WY0F 4GC4A 4K39A 5BW6A 3TH6A 5IBXC 1C9DA 4QJ1A 5HUOA 5HMSA 3S1UA 2ZZ1A 2CWNA 4KWWA 1Q6OA 3UWWA 2Q3RA 1AW1A 1VCVA 4UFKA 4NNAA 2GJLA 2VFDA 4N6FA 1DKWA 1AW2A 3HB9A 3SGZA 3FKRA 4O0KA 4QNEA 4ZQMA 3ABSA 2RFGA 4IOTA 4EF8A 1WXJA 4K6AA 5CZ0A 4I7VA 3LX9A 3NQ6A 4OT7A 3O06A 2G95A 4DPPA 4Y96A 1EP3A 1LM1A 3M6YA 4NVTA 1DOSA 3I68A 3N34A 3DGRA 1FWWA 3R89A 3S1VA 1VGAA 4IPIA 3TU9A 4ZQPA 4WXZA 3DKJA 1ML1A 2BX7A 4EOUA 2Y7FA 4MIMA 4UTKA 3LRKA 1G69A 5GVJA 4RCXA 1A5AA 1IF2A 3M9YA 1EA0A 4UFMA 1VCFA 3CEUA 1UCWA 3W85A 1TPWA 2A7PA 3QMTA 2A85A 5G4EA 5K7JA 3O07A 3PBUA 1GJPA 1KM5A 3FEMA 1OABA 4IMCA 3FS2A 1KLZA 3W22A 5C54A 1OFPA 4B5NA 4QM1A 1KFJA 3HBLA 4MZ8A 2WKJA 1F7BA 3L65A 4JDYA 4JYEA 2C14A 4XTDA 3LXAA 4AAJA 2QCMA 3B03A 2DP3A 4S2BA 2Z1BA 3W1TA 2TYSA 1CX9A 2VXNA 3GLCA 3PB2A 1GTHA 3UWQA 1C8VA 2YR1A 5HQEA 3TK7A 1OFDA 2R91A 3G22A 3DFTA 3PBWA 3MJYA 3IIVA 1W5OA 3BG5A 4WY0B 5E0KA 3EWZA 3PF3A 1KFKA 1SO6A 3W83A 1LRTA 2CLEA 3NNTA 3HGRA 3TV8A 5A8GA 2BSLA 4GBUA 2JBMA 4IX2A 4NZFA 1OK4A 3DHFA 5LHEA 4BFAA 3NL5A 4IMDA 1DV7A 2NV2A 1LP6A 2ZTKA 3MUXA 4ORMA 3BARA 4N2YA 1YXDA 2V0TA 1TV8A 1VCGA 3QQ1A 3NPXA 2CLLA 2H6RA 3G3MA 2GUUA 2X2GA 3HF3A 3G1DA 3CLMA 4GNJA 4UUIA 4LVGA 5HWJA 5EMUA 3LHZA 4BWLC 3RF9A 2A7RA 3PBYA 4NZJA 3VE7A 1XBYA 1H60A 2FLIA 3H53A 2ZA3A 2JGYA 4M6PA 4UCGA 3HGSA 1AL7A 3OHIA 2RDWA 3BO9A 5CSSA 3BLIA 1EEPA 3BK0A 5EYWA 1TRIA 3TW7A 1A5BA 5K2ZA 2HSAA 3W7HA 1L6WA 4KFNA 5D30A 3LCFA 3RK8A 3L66A 1LBLA 3OG3A 4IXHA 3MP3A 5KTLA 1OHLA 3FJ6A 2CLMA 3GKAA 1ICPA 4FX6M 1VHNA 4Y90A 3DFPA 2CLFA 2V8ZA 3MI6A 4Y6GA 1LBMA 2NV1A 2FTPA 3F03K 3DFOA 2QJHA 3O8AA 3P8IA 4RK8A 5D2YA 5CZSA 3GNDA 4DO4A 5DCDA 3DBPA 2JKEA 1KV8A 1ONRA 2A5HA 2QCGA 5LNSA 3PM6A 3W2KA 1G4EA 2EPHA 1HL2A 1UUOA 1U5JA 4O50A 3GDRA 3E96A 1K03A 3W7NA 3NQ2A 4LY8A 3T7VA 2P10A 4NUWA 3GXNA 5D38A 4XKYA 4NJGA 1IGSA 1Q6QA 1M5WA 3YPIA 1PHWA 4DQWA 1FWTA 3NQCA 4LW7A 3PY2A 1QMLA 4Y9AA 3BGJA 1D3HA 3BLFA 3TA6A 4IXXA 4TMBA 4IMEA 5EPDA 2ZCGA 4LT9A 5AHLA 1ZAIA 3LCLA 4HPXA 3B06A 1JULA 2D73A 3QPZA 4CCCA 2XN1A 3MI3A 4MZ1A 3W7IA 5FEXA 2QAPA 2AGKA 5CPOA 2ZTJA 1A5CA 1PV8A 1RR2A 4K36A 4LC8A 2VC6A 3QH2A 3CHVA 2DZWA 2CZFA 2B4GA 5E93A 3P67A 1KLYA 3GR7A 3L2IA 5KINA 4IX0A 3O16A 2I1OA 3LBCA 3GKFA 2X1UA 2I14A 3NQDA 4O1BA 4JY8A 4BF9A 1W54A 4M7TA 5AOUA 4XWUA 5BNKA 1DHPA 3LTPA 1M7PA 2ATMA 4FNTA 3DFQA 4LV9A 4OE7A 5C55A 3NQEA 3LV5A 3L0GA 2VFGA 2FFCA 4ZZ9A 3FIGA 4FF7A 2KZHA 3LERA 3C61A 4K7YA 5HWMA 3QMRA 3W6YA 1VS1A 4O1DA 2YXGA 1W3NA 3PAJA 3TMLA 4QSHA 4MVAA 1AK5A 3EX6A 4RJEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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