2QDHA

Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from leishmania mexicana in complex with mannitol-1,6-bisphosphate, a competitive inhibitor
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
MSRVTVLQSQLPAYNRLKTPYESELIATVKKLTTPGKGLLAADESIGSCTKRFQPIGLSNTEEHRRQYRALMLEAEGFEQYISGVILHDETVGQKASNGQTFPEYLTARGVVPGIKTDMGLCPLLEGAEGEQMTEGLDGYVKRASAYYKKGCRFCKWRNVYKIQNGTVSESAVRFNAETLARYAILSQMSGLVPIVEPEVMIDGKHDIDTCQRVSEHVWREVVAALQRHGVIWEGCLLKPNMVVPGAESGKTAAPEQVAHYTVMTLARTMPAMLPGVMFLSGGLSEVQASEYLNAINNSPLPRPYFLSFSYARALQSSALKAWGGKESGLAAGRRAFLHRARMNSMAQLGKYKRSDDDASSSSLYV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphate aldolase
publication title Carboxy-Terminus Recruitment Induced by Substrate Binding in Eukaryotic Fructose Bis-phosphate Aldolases
pubmed doi rcsb
source organism Leishmania mexicana
total genus 140
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qdhA00
1DQWA 3GAYA 2RDTA 3LHZA 4CQ9A 3GDRA 1TSIA 4OE7A 4IPJA 4LS1A 4DELA 2V5LA 4LVGA 1TTIA 4JYEA 2GPTA 3C6CA 2FPYA 1SO4A 3DI0A 3VE9A 4HN4A 4R7JA 1T96A 2QCHA 2A4AA 3S42A 1VCGA 2G97A 1XBYA 3BO9A 1M7PA 3L21A 2DZWA 2E1DA 3LBMA 4JIQA 4ADUA 1OABA 3I68A 3QSTA 5EPDA 3W7LA 1N55A 3IIVA 4LUJA 2Z6JA 1SZFA 2GJLA 1W3TA 2QAFA 1TJRA 1MSSA 4WUIA 4JGDA 1LROA 2OCZA 3TKFA 4UTWC 4Z1AA 2PRLA 1EPXA 3GDTA 3PG9A 4FIQA 1P0NA 4PH6A 5BW6A 2PCQA 3TJXA 1VS1A 1JCLA 1LBFA 1HUVA 3G3DA 2QDHA 3KHJA 4MFDA 1XBZA 2CLOA 3P82A 1EWEA 3S6DA 3GDMA 3W7QA 3BV4A 1OFAA 2KZHA 2R14A 5CPOA 3LRKA 2VFIA 3ABQA 4DO6A 5LGXA 2P1FA 1BKSA 3PSVA 4UFLA 4OU1A 2X2GA 3GKAA 2WV8A 5AC8A 1DBTA 5LNRA 2YGYA 4WY0A 5LNUA 5LHFA 2C19A 1FWSA 3MWAA 3NM1A 4I7UA 2VEMA 3N3MA 5CZTA 5AHEA 3L65A 3L67A 4ZMGA 2GVLA 4LRSA 5E0KA 3LLDA 3ZR4A 4NJGA 3ATZA 3KFTA 5HWNA 4JTSA 3L9CA 2X1TA 1MO0A 4GNJA 1ZAJA 1U83A 3R12A 4JEQA 1LOLA 1YTKA 2BZNA 2BX7A 4K7YA 3IGXA 3G1VA 1SPQA 3GNNA 4H3DA 1AK5A 1OX4A 4JTTA 2EKCA 1P5BA 4OV4A 2RDUA 1TPWA 4AEOA 5AB3A 4LY8A 4LC6A 1FWNA 2NX1A 3CTLA 5HWMA 1LRNA 3O16A 4M7TA 4U4MA 2G95A 3EXSA 3QPYA 3THAA 3WJZA 2W0UA 4IMGA 3LLFA 1QFEA 3VE7A 2ZFAA 4POCA 3L0KA 1XUUA 2FJKA 2IQTA 3UWZA 3NEVA 1DORA 1G6CA 5E93A 2OZ0A 2NXGA 4GUIA 2YZRA 1ZAHA 1FCBA 5D04C 5G2HA 2Y6ZA 4NNCA 3G3MA 3N73A 4AWSA 1EP3A 4GUHA 3NA8A 4DO4A 2J9YA 4NU7A 1GOXA 4N2YA 4P61A 2B7QA 3KRSA 2EGZA 1WYIA 3NL2A 1VJIA 1TMHA 1TPDA 2C0AA 3LCXA 2RFGA 3VKJA 3INPA 4UNLA 3NXFA 2TRSA 2WSQA 3W7EA 4KFNA 2ZZ2A 5G2IA 1FX6A 3O07A 3EXRA 1HTIA 3M5XA 4EIVA 1ME8A 4WJEA 5LGZA 3TQVA 3MI6A 1SSDA 3W7OA 1TJPA 3VNDA 4FNPA 4N6EA 4O13A 1Q45A 4GC4A 1I2PA 2C1HA 2E5BA 2PRMA 1A50A 1TPUA 4WXYA 1W1ZA 3WK0A 1VHCA 3SW6A 1HFBA 5FEXA 1NSJA 1BEUA 1X7FA 2HS8A 3S1WA 4E2BA 1VGAA 3DFSA 2AGKA 3R89A 4BF9A 4FXRA 5D09A 3SY5A 5K9CA 2X1UA 2WOQA 1GVRA 3S5OA 2CLFA 1QCWA 4WQ6A 5C54A 2DZXA 3DHDA 3GXTA 4DBEA 4TU1A 4MUZA 5K9DA 1DJNA 4NJHA 5HINA 2BWGA 3HGOA 5HUOA 4NXSA 3IIPA 2QAPA 1M6JA 1W5NA 3T55A 4IMEA 3MHUA 4JNMA 4XTDA 1PHQA 3E02A 1GEQA 4CQAA 5I3KA 3IV3A 3W7HA 5G1TA 4Z1DA 1W56A 2V81A 4FNQA 3MUXA 2E6DA 3LX9A 1WV2A 3LTSA 3FKRA 3WJYA 3VCRA 3UQNA 4E0CA 3QQ0A 3W83A 1HO1A 4QISA 3TCEA 5CPLA 3N14A 3LCHA 3FEMA 1W5QA 2YSWA 5I3FA 1VCVA 3HMJG 1PV8A 3IGSA 3IIZA 3THQA 2V2HA 3QEZA 1YYAA 4JTHA 3QPZA 1Y0EA 3RU6A 3GXPA 1RZMA 3OA3A 3RMJA 4S2BA 1OF8A 2ZRWA 5KMYA 3S5NA 3CU2A 3EWWA 4UTJA 4GRSA 4UTMA 3TMQA 1O60A 1WBJA 3CIWA 3TMLA 1Q3NA 3QQ1A 4X9SA 5D03A 1SUXA 1OYCA 1RPXA 1G4EA 2VC6A 4MZYA 5D2TA 3D0CA 3PAJA 1VYSX 3UXDA 3LXCA 4LVAA 5AHLA 2C14A 4MFEA 4XUGA 3BW3A 4ML9A 1KA9F 2J9ZA 4GWEA 2FLIA 1K7XA 4ADSA 3FIGA 2WNZA 1UBSA 3HBLA 3TW6A 3MP5A 3NR0A 3C56A 5LZLA 3HIJA 3HOJA 1B3OA 5D05A 5E1QA 1M5WA 3ZFHA 5KTLA 2ISSA 3S5ZA 4NX5A 3E9AA 3GVGA 4JTUA 4CCDA 2EF9A 4GE8A 3KXQA 2Q8LA 5D02A 4TMCA 3GLCA 2I14A 3M7WA 4GXMA 1P0KA 2UV8G 1L9WA 3MP3A 2H6RA 3T7VA 5FF7A 5K9XA 3UPBA 5HQEA 1H62A 2GJNA 3STCA 1G69A 4O19A 4ALDA 3R13A 1NFBA 3PVFA 4HHPA 4JIPA 5IM51 3C2OA 3JR2A 1EUNA 3QW4B 5IBXA 4DF2A 2ZYFA 3GYEA 2CLIA 3B06A 1ZALA 2JGYA 3P5ZA 4N4PA 2WSRA 2VEPA 4XWUA 1ME9A 1O5XA 1JVNA 3NQAA 3TAKA 3B04A 1ONRA 2ZA3A 1JCJA 4KKXA 5DBTA 4PCFA 1MZHA 2B0MA 1AL8A 1GZGA 5HMSA 2OMAA 1FBAA 1LBLA 3O05A 2YXGA 4QSHA 4JTJA 2DZTA 5BNKA 1PCWA 3A21A 3PUDA 1D9EA 4UNKA 1Q6OA 4GBUA 2WPBA 1H5YA 4DF0A 4IQLA 5BMWA 3HQ1A 1X1ZA 3MMTA 3QMTA 3HPSA 2C3ZA 4CLMA 3STFA 3BGGA 3M47A 4MZ8A 3MI2A 4MLRA 4HNNA 1KTNA 4NQ1A 3T4CA 4LW7A 1FQ0A 2OT1A 3P81A 3QW3A 5I3JA 2CLEA 5BMXA 4NNAA 2R8WA 1RR2A 1OFBA 2OX1A 5D2YA 1EUAA 4N4QA 3TIMA 5DBUA 4M19A 2P0OA 1G7VA 5L6UA 3LI0A 3TROA 1GTEA 1YXCA 2J9XA 3NAVA 4JR5A 5CSSA 3GKFA 4M6QA 1A53A 1YDVA 3SR7A 3QRHA 1B57A 3QJAA 4JTFA 3TX9A 1P4CA 1PCKA 4O8RA 5DELA 5EBUA 4UTHA 2A7PA 2F7FA 5I3IA 5KZEA 3TSBA 4TO8A 1YTEA 3NL5A 4Z1BA 1OFQA 2XFWA 2QJIA 3A23A 2NX9A 2FPTA 4MIMA 4BR1A 1FXQA 4EWND 1QPOA 2TSYA 3P8IA 3L5LA 3L5MA 1TV5A 1F74A 1F76A 3M5ZA 1THFD 4HIBA 2WQPA 4UFKA 1VPXA 1GPWA 4RZ4A 5LNSA 1CX9A 3S1VA 3LBCA 5U4NA 1T99A 2VEKA 3KVKA 4BI6A 4FNTA 3W85A 5FF4A 4PODA 2E77A 1FDYA 3O06A 1IXQA 1EIXA 1UASA 2V30A 3W2LA 3C3NA 1KBIA 1M7OA 1VZWA 4RX0A 2J6XA 3M41A 4FNSA 1PS9A 3P62A 1W5MA 3NGJA 5HWJA 2CU0A 3S5YA 2CLHA 4UTTA 2E68A 2VENA 1I2QA 2E6YA 4NZFA 3P61A 4RLIA 1ZCOA 2LLEA 3KRZA 1Z48A 4ZQOA 3W7DA 4UMCA 1R2RA 1TQXA 3MHGA 5FF3A 3EWUA 2WSYA 2YR1A 2VEIA 4ZL1A 2QCGA 1G4TA 4TR9A 2Y7DA 3NQCA 3C2EA 1OYAA 1K8XA 1TPEA 3EKZA 3PB2A 3VI2A 3W74A 4YXGA 4HPJA 4Y6GA 2NV1A 1KTBA 1QOQA 1TV7A 5KITA 5LNWA 3S1XA 3OVPA 3LCIA 2QF7A 1I45A 4UFMA 5TIMA 1OK4A 3TK7A 4KWVA 4N9CA 3NVTA 5CGQA 2H3DA 3F4NA 1SO6A 5F1VA 4JTKA 5HULA 1CW2A 2VFDA 4O18A 3T44A 3FLUA 3TJLA 3E0IA 2V9DA 3A9IA 3GNDA 2GOUA 2QR6A 4OWGA 3NZRA 4TIMA 1S5TA 1WDWA 3P80A 4IMDA 4K7VA 3CQ0A 4Q33A 2YFOA 1OF6A 2H8ZA 2VKZG 2QCFA 1YPIA 3SGUA 3P67A 3C2FA 2Q3OA 2ZRZA 5TBOA 3TC6A 4O4VA 4E38A 3CLMA 1PL9A 2ZQ0A 3W1QA 1K3UA 3TAOA 1LYXA 2AQWA 3NZ1A 2O7QA 4AHPA 4E2DA 4XKYB 2CWNA 4RR4A 2QEZA 4QJ1A 4AAJA 1KM2A 2RDWA 4OBTA 1FCQA 4UFHA 2GVJA 3CPRA 5DCEA 2YFNA 1XKYA 4QAIA 1IF2A 3O15A 1OVDA 4JXCA 4FHAA 4ONVA 3CC1A 3KVJA 3LHTA 1IGSA 3W7NA 3EX3A 3IIOA 3USBA 4JTEA 1K8ZA 2Y7FA 1Q6RA 4HPXA 2ZTKA 3KAOA 2D73A 4R33A 1S5VA 3DFQA 4X22A 4RXGA 1H1YA 3U8GA 3C2VA 4HKPA 3M0ZA 3DFPA 4WOQA 5FEZA 1VYRA 4K38A 1D3HA 3R5EA 3TNOA 4M6PA 1OFEA 2V8ZA 2YYTA 1W8SA 3EB2A 4N6FA 5I3HA 3UWWA 3IIXA 1GVQA 3LRMA 1NF0A 3P60A 5FI8A 1H1ZA 1UUOA 4RCXA 4PA8A 3W1TA 2Y89A 1W3IA 1SO5A 2A85A 3FS2A 1J2WA 1U5JA 3SI9A 5FEPA 2QJHA 2CLMA 2QDGA 5K4XA 4UTLA 2O7SA 1SSGA 3PF3A 3DAQA 3Q2DA 5DY3A 2VOMA 4AF0B 3BW4A 2ZA1A 3GR8A 1D3GA 4FIRA 3W1RA 2YYUA 4N9EA 3MO7A 3SFKA 2G5WA 4O50A 1VCFA 4PL1A 1I2NA 4BWLC 1EEPA 3WK2A 4NUWA 2TYSA 3N19B 3KRUA 4JY8A 1Z44A 4DEFA 3P7YA 1L2UA 4WX2A 5DN1A 4HNTA 2RHGA 1TPC1 3EEGA 1TPFA 4PFMA 2ZZ4A 3RK8A 1SZNA 3RNDA 3MJYA 1XC4A 5AN7A 2E5DA 2A6NA 4Y8FA 2JBMA 4O0KA 2GVGA 1IIHA 4LVFA 3TC7A 3FYOA 3HPXA 3QMRA 4OGZA 3FFSA 2C16A 1PVNA 2NXIA 3NL3A 3CM4A 3AO0A 3EWYA 3WK1A 5U7SA 4N9BA 3TFCA 2A2IA 3OG3A 1OX5A 3M44A 3YPIA 3E49A 4UIOA 1G67A 4QIUA 5F1UA 3W7RA 4K8HA 5HR6A 2C6QA 5HR7A 2ABAA 2H90A 2CW6A 2FFCA 2JKAA 3W2NA 4KFOA 5IBXC 4IWWA 4CNOA 3F4WA 3B03A 4S1FA 3W7IA 4Y90A 4Z08A 3ZWTA 4EF8A 1SR9A 5ABTA 3W07A 2YW4A 1AG1O 3TFXA 1KV8A 5SWUA 4Z0JA 3PC0A 1FXPA 3GB6A 3FA5A 2FDSA 2WO5A 4CQ8A 4OHQA 3OHIA 4DQWA 5G4EA 5CZJA 5EKYA 2NWSA 2QCCA 2A1YA 1G7UA 1ZY9A 2G96A 4U28A 3TR2A 3C4UA 3EWZA 3PG8A 3NPXA 1WQ5A 1OG0A 1Q6QA 3O6YX 3W86A 1GJPA 3C8FA 2H8XA 3STGA 2I1OA 1SFLA 3UY7A 4LT9A 4XBKA 3A5FA 4I7WA 1L6SA 1JCYA 5FEWA 3QF0A 2QUVA 3G8EA 3G1DA 7TIMA 3LB0A 1VC4A 3E96A 4NZJA 1JCMP 3U2OA 1LM1A 3M5VA 1DKWA 1V5XA 2A7RA 1F6PA 1BWLA 4H4IA 2VFHA 3C0JA 1XXXA 5KZDA 1KM3A 1RQBA 2A6LA 3LRLA 2Y70A 2Z6IA 4A21A 3O8AA 1J5TA 2QCEA 1XBXA 3WJSA 4O1AA 4XTIA 5G2WA 1IXNA 5EMUA 1GVSA 4JDYA 3JRKA 3LDVA 3F03K 1PE1A 2XN1A 4AVFA 4CNPA 1YDOA 3Q37A 3L68A 3GXNA 2HSAA 4ZVJA 2ZZ7A 5D2XA 3TQKA 2B4GA 1JCNA 5AYXA 4AWUA 3G24A 4OV9A 2W6RA 1N7KA 3O6DA 2RKXA 3W1LA 5K7JA 3EX2A 2TPSA 4EVZA 3O63A 1DJQA 3UWVA 1H63A 1WAUA 1DVJA 2YW3A 1R30A 3GDKA 2OJPA 3W1AA 4BWLA 4FX6M 3GX9A 2ZZ1A 2Y7GA 1ME7A 1FDZA 1K8YA 1XUZA 2EHHA 2QJGA 3IRDA 2QUUA 4UC5A 3L66A 3HB9A 4KFPA 1TPVA 3CT7A 2X16A 4N02A 1W54A 4P2VA 3PWAA 3FKKA 2V0TA 1OYBA 4LVBA 1B4KA 2NWRA 3DU0A 2QCNA 2CLKA 5G1YA 1ZHAA 3DFNA 4O28A 3BVJA 3G0UA 3B0UX 3QMSA 4QNWA 1FDJA 1Q6LA 3NQMA 2J88A 3LCGA 4MOZA 2A7NA 4PL2A 4LV9A 3TE9A 1KTCA 4ZQMA 4DPQA 3OBKA 2B7OA 3S1UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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