2QUTA

Dihydroxyacetone phosphate enamine intermediate in fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
363
structure length
350
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title Stereospecific proton transfer by a mobile catalyst in mammalian fructose-1,6-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 141
structure length 350
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qutA00
3KVLA 3W2JA 1FDYA 3W7QA 2J6XA 2E6DA 1KV8A 2B7PA 4O0KA 2ISWA 3NQ8A 4FX8A 4MZ8A 1O5KA 5I3KA 5TIMA 2NUWA 2YW3A 3W1RA 3LOTA 4OBTA 3UZJA 3YPIA 4AF0A 3RNDA 4GJ1A 3A23A 3P80A 1LYXA 2VFDA 2GVGA 1FCUA 1K3UA 1LORA 3KAOA 4FF7A 4IGHA 1GYLA 3ABOA 5AYXA 5T26A 1SO4A 1H1YA 3G1DA 1QAPA 1GVFA 4A2SA 4HKPA 4O12A 1UB3A 4Z0JA 4ORMA 2TYSA 4IUOA 5LNRA 2BWGA 3S0CA 4RCXA 5D2VA 1J4EA 5FI8A 1QPRA 3O6CA 4UMAA 2YR1A 4O1BA 5HWJA 3PBVA 1XBZA 3OG3A 3R89A 2VOMA 1GWJA 3HGSA 5KMYA 3U8GA 3UWVA 3OA3A 3G0XA 1TRIA 2QCGA 1DJQA 3G1HA 3M5YA 5I3GA 1NEYA 2NX3A 2FB2A 3LLFA 1FQ0A 1QNVA 2Q3RA 3SJ3A 4PC8A 4EVZA 4O13A 1H1ZA 1NAL1 3BG9A 3TH6A 1TREA 3KXQA 4K7YA 4JTGA 1KTNA 5LKYA 4JIQA 4GBUA 5J5RA 3BARA 3HQ1A 2J24A 2CZDA 3LXBA 1C9DA 5L9FA 1RQEA 4ZQMA 3L5AA 3SY5A 1R47A 3LERA 5HR6A 2FPTA 3GX9A 1W5OA 3UWYA 1BWKA 3B0VC 5D09A 2QCFA 4JX6A 3G8RA 1LOSA 1S5VA 3W74A 4WQ6A 3NPXA 2QJIA 1SZFA 4WZHA 4UTHA 3C4UA 4MY1A 4QNEA 3EWZA 3RLVA 1MEWA 4LS0A 1XI3A 4KFOA 2X1RA 4WXZA 1A5AA 4DF0A 1OABA 2E5CA 3E96A 4K38A 5G4WA 3TR2A 3W7IA 1OX4B 2VFGA 3BW4A 2YXGA 3IVTA 3WJYA 3RK8A 4O11A 1TTPA 3A21A 2HSAA 3CWOX 3LTYA 5D30A 3PVFA 3W7GA 1LM1A 2GOUA 4M6QA 4N9DA 5AHMA 4YWIA 4GUGA 3OVRA 2YYUA 2ZYFA 3UWWA 2H90A 1G7VA 1AW5A 1RQHA 3UWZA 1W8SA 3LBMA 1AW1A 4N4PA 1VLIA 2OCZA 2RDUA 2V82A 2Z1BA 1YLVA 2QCEA 1G6CA 2JKAA 4OE7A 5BMWA 1VZWA 4AF0B 5CPNA 1TV8A 1LBMA 4Q33A 1ZAIA 1XUUA 2ZRVA 2QJHA 2Y7FA 3W86A 3GDKA 3QFEA 1UBSA 4R34A 3QRHA 3JRKA 5G2IA 3OEXA 2OT1A 3NEVA 3P8JA 4UFHA 2KZHA 3W7RA 2Y88A 4K8EA 4ZQCA 4GUHA 1FY6A 1SSDA 5DN1A 1R30A 4GWEA 4Q4KA 1IXPA 4XWUA 1HO4A 2GVLA 3DFSA 3STCA 5D33A 5HULA 3DGRA 2Y6ZA 3DAQA 3USBA 2DU2A 4QM1A 3W1NA 3GVGA 3S5YA 3H54A 1AK5A 4GC4A 2ZDRA 1W5NA 3M1ZA 1WQ5A 3C8FA 4N02A 4IMGA 2CZ5A 3MI2A 2PE4A 1K7EA 1AW2A 3UQNA 5CZTA 3MWAA 3NOEA 4P2VA 5AN7A 5FF7A 3L21A 1WOAA 1PHQA 5AC6A 4GUFA 5DY2A 3EWYA 4CQAA 3FEMA 1W5PA 5CZ0A 4Z1CA 1ONRA 5DBUA 3NM1A 1VYRA 1A50A 2DZSA 2A7RA 1YXYA 4Z08A 3G1XA 2VFEA 3ABQA 5G2WA 3MI3A 4KKXA 4LTSA 1PVNA 4AWTA 3M44A 2NZLA 3IIPA 1EB3A 2OJPA 5AFDA 5AC7A 1QWGA 3P8IA 3W85A 3W76A 4HNVA 1WXJA 3QMSA 3C3NA 1ZFJA 3TFXA 4IXXA 1TMHA 2Y7EA 4HPJA 3LHYA 3QF0A 2WNNA 4D2JA 2CLLA 3HJZA 3PBUA 3VFLA 2ZRZA 4M5PA 5AHLA 2C0AA 1F74A 4O0ZA 3CIXA 3ABRA 3LCIA 5KZDA 5K7JA 1EP1A 5BOOA 2ZTJA 2BSLA 4NJIA 1GVSA 1VRDA 3LM7A 3O06A 1SQ7A 2HMCA 4FO4A 3QYQA 4CCDA 2HS8A 5C2XA 3W71A 4I7VA 1SFJA 1TV7A 5EPDA 2WPBA 2PRHA 4HPXA 3W23A 2A7NA 1B9BA 3LTPA 2NWSA 2CZEA 2GUUA 5EMUA 3KOFA 5DXYA 3LV6A 1UASA 1U5JA 2CLIA 3UYCA 4JGDA 1KM2A 2ZRUA 1TV5A 4NT0A 4NQ1A 3W1LA 4DO6A 3KVMA 3IV3A 3CHVA 1A5BA 5ABTA 3W1TA 5DXXA 5FF0A 2CLEA 3EWBX 1BWLA 3DBPA 2A21A 4OQVA 2X1UA 1H50A 5F4SA 1GPWA 4KFNA 1Q45A 4PL1A 4AMAA 2CZFA 5G4EA 5TBOA 3NQDA 5AB3A 1EIXA 2ZBTA 5IBXC 1H51A 6ALDA 1PIIA 2E5BA 3UXDA 4N9EA 2WSYA 1EA0A 4TIMA 4RR4A 1JQXA 5AHFA 4GUJA 3TJLA 3O15A 4BK9A 1WDWA 4JX4A 4UXDA 2CW6A 2A5HA 3NQFA 1ICPA 2GQAA 1YXDA 4UTJA 4LRSA 1DBTA 3PM6A 4QIUA 1RPXA 2Z6IA 3A22A 3R5EA 4OU1A 1T0OA 3LRLA 2QF7A 1AL7A 3TJXA 4GE8A 4GUIA 2FPVA 1FCBA 5HUOA 4TMCA 3D0CA 1VQTA 4MFEA 2A6NA 3HPZA 1WA3A 3EKLA 4Y96A 5D2YA 2EPHA 4JY8A 1QO5A 1ME7A 1DVJA 3E02A 1QPOA 4Z1DA 1VPXA 3M47A 5E1QA 3E49A 3EWWA 2NUXA 4O1CA 3L67A 4K8HA 1P0KA 3FOKA 4ADUA 1SPQA 4WY0A 1Q6LA 4MVAA 1MZHA 2V9DA 5LNVA 1JRBA 1X1ZA 1Z44A 3P74A 2BXVA 2DZXA 4MJMA 5CGQA 1YDOA 1G4PA 4DEFA 4N4QA 1PV8A 1TPWA 2H6RA 2QDHA 1HG3A 4RKAA 3SFKA 3CPRA 4DBEA 4O57A 3WJXA 5HWNA 3QQ1A 1CW2A 4JYEA 4JTIA 3SZ8A 1T8XA 4UFJA 1SZNA 5HQEA 4JS3A 4BWLC 4BFAA 4MOZA 2A6LA 2DORA 2E6YA 3BW2A 3L65A 1F73A 5G1TA 5C5YA 4QNWA 1TJRA 4BF9A 2GQ9A 5LHFA 4ZQPA 4Z0SA 3QSTA 2TMDA 1AMKA 1ZALA 2V0TA 3NM3A 4Y9AA 4ZMGA 3P67A 3EXSA 1F05A 4AWSA 2E6FA 3KRZA 3MYPA 3W73A 3NQAA 5F2GA 3S8HA 4UNLA 2VKZG 4RV8A 3TFCA 3JS3A 3T55A 2Y85A 1SZEA 4NXKA 3IGXA 3NL5A 4ZL1A 3BG5A 3W1QA 1KM3A 3F4NA 2V8ZA 4UR7A 3NPUA 2VEMA 1XFBA 3L0KA 5G2HA 3W7MA 1KFCA 4LVGA 3EXTA 1P5BA 1OYBA 3S1XA 5K3VA 3S1VA 3QJAA 2GQ8A 3NPVA 5I3FA 1UCWA 2NX1A 4QITA 4FIRA 2R94A 1GTHA 2YGYA 2RH9A 3NQEA 5E93A 4LS2A 3N14A 3I65A 3O6YX 5AHIA 1CX9A 3W1PA 2RKXA 4RZ6A 3PBYA 2JKPA 2QJGA 1VGAA 4G1KA 2ZRYA 4LY8A 1OJXA 2W79A 3P5YA 5DCBA 3R2GA 1PL9A 3HBLA 5CPLA 3B0UX 4O50A 1I2RA 3T40A 3DFPA 3SSJA 4MZ1A 3M43A 5K4ZA 5SWUA 1ML1A 1VCGA 1I2NA 4N6EA 3M5ZA 2C16A 3LDVA 2NV1A 4NXSA 3N19B 1OX4A 4TR9A 1FWNA 4UC5A 4A29A 1PCKA 1EWDA 1K8YA 5HUPA 1XBVA 5CSRA 4I7UA 3ZFHA 3B4UA 2H8ZA 3H55A 1FWTA 3NA8A 5D37A 3W1AA 3EX3A 3BGJA 3PUOA 2G95A 2V2HA 1R46A 3BPWA 1ZAJA 1P0NA 4TO8A 3BVJA 4EWND 1RR2A 2IQTA 4OT7A 2Z6JA 3LXCA 2A85A 4LRTA 4MY9A 3W7LA 1KM4A 2ZCGA 1KM1A 4DF1A 3FYOA 3W9ZA 2A7PA 1VCFA 3QPYA 1S5WA 4K7VA 4IX0A 1QFEA 2C15A 2NWRA 4WY0F 1J2WA 1TPEA 3L0GA 3P62A 3KFTA 4FB7A 1QMLA 5K9CA 1FDZA 1LRNA 2HS6A 1OFRA 1TTQA 4RJEA 4TMBA 1GT8A 3KVKA 3HG3A 2OZ0A 3W6YA 3S5OA 3F1QA 3N2XA 1RD5A 1WAUA 4FHAA 3P7YA 1VCVA 1O94A 3E9AA 3STGA 3VE7A 3L5MA 4R7JA 5EA9A 3THAA 3LHVA 1IXQA 2CFFA 3LRMA 1JCYA 4LC8A 2A4AA 2V81A 3W2KA 4HSNA 3PUDA 1YXCA 2V30A 3TC6A 2X1TA 3TV8A 2Y7DA 1KLYA 1ADOA 1S3HA 4MLRA 1Q3NA 4C1LA 4E0CA 4DXVA 3EXRA 2RDTA 1GTEA 1SZGA 3TKFA 4FX6M 3L68A 4IMFA 2Q8ZA 3M5XA 2ABAA 1RZMA 1KA9F 3LCLA 4IMEA 4HN4A 3TQ0A 1N55A 3NQCA 4UMCA 3IIOA 3GR8A 1DQXA 4O54A 5KZEA 1OHLA 3W2UA 2E1DA 4J9JA 1GEQA 1JR1A 3QQ0A 3W7KA 3IGUA 4UTWC 1H62A 1T96A 1HFBA 3G1FA 4LUIA 2E68A 3SIZA 4A22A 3S1WA 3MJYA 4MPQA 1CI1A 2WKJA 1W5MA 3NDOA 3GKFA 3ZR4A 2FTPA 3TDFA 4Y90A 3PB0A 3HOJA 3DFOA 5LZLA 3W7EA 4RXFA 3AJXA 5D05A 4UR8A 5U7SA 2V2DA 3ZWTA 5E0KA 4ADSA 3M41A 4GNJA 1I2PA 3BLEA 2QCMA 4N9CA 1HO1A 1LBLA 3HPSA 2ZZ3A 4CCCA 1D3HA 1OK6A 4BI6A 2QUVA 3ATYA 5EBUA 1GJPA 2J88A 3GNNA 4LVBA 4WUIA 4ML9A 1D3GA 2WNQA 4ZZ9A 2ZZ2A 3HMJG 3IIVA 5AHEA 3W7NA 5C55A 5F4WA 5BRBA 4NNAA 3PWAA 3QPZA 1KM0A 4PTNA 2ZZ1A 4Z1AA 1Y0EA 1EX5A 1H60A 4DQWA 5IBXA 1OYCA 1B4KA 4AHPA 2QUTA 3B04A 1K7FA 3GZ3A 1JUEA 4S2BA 1L2UA 2C14A 3ZWSA 2QCHA 4DPPA 3W7CA 4ZVJA 4QAIA 1TQXA 5EYWA 1G4SA 3PUEA 5H91A 1FWWA 3N3MA 1LROA 1QCWA 3E0IA 3TE9A 4JTLA 5FF2A 1KFEA 1Z48A 4JIPA 1UJPA 3OIXA 4I9AA 2H3BA 2X30A 4HSOA 4EF8A 1SFLA 1DHPA 3C2FA 4JTHA 4FEZA 5EL1A 2X16A 4LVAA 1HL2A 2VEPA 4JICA 5EKYA 3FKKA 2FPYA 5K2ZA 3P60A 1IIGA 2Y7GA 4M6PA 3M6YA 2YCEA 2AAMA 3QW4B 4FNUA 3SGUA 3DHDA 4O53A 1SU5A 3TAOA 3QW3A 4CQ8A 1ZJIA 1W56A 4MYXA 4MIMA 4LNYA 4IMDA 1RV8A 1KBJA 1XDMA 3SI9A 3UZ5A 4S2CA 2WSRA 2ISVA 1ZAHA 2QR6A 3CU2A 2J27A 1EP2A 1XUZA 4EF9A 1R2TA 1VHCA 1XDLA 3W87A 3QH2A 5HR7A 1SW3A 5DCEA 2YFNA 4BWLA 4MZYA 1YDVA 3G1YA 3QZEA 4DPQA 3C56A 2QAFA 1ZY9A 1OFBA 3HO8A 3LBCA 1KLZA 1OVDA 2C6QA 1M7OA 1IXNA 3G3DA 5FF3A 3UD6A 2WQPA 1QO2A 2E5DA 1E51A 1XCFA 4IOTA 4JXCA 4K39A 2C18A 4A3UA 2XN2A 3U2OA 2QEZA 2YYTA 3CC1A 2Y63A 3FJ6A 1VH7A 1TIMA 3WK3A 3NQGA 4NNCA 4LOCA 3FIGA 4YL2A 1THFD 1S5TA 2ZRWA 5CKSA 4MJZA 3B03A 4JTEA 4WD0A 3EX4A 4UCGA 3QEZA 4KWWA 1EUAA 4ZQRA 1SUXA 3UNDA 1V5XA 3DI0A 3LHUA 1LRQA 3WJWA 1LBFA 4Y6GA 2QCNA 1YTDA 3MBDA 1OFQA 1OFAA 3R12A 1KW1A 3Q58A 5KITA 1C8VA 3MBFA 4QISA 3DXIA 3O16A 3EX6A 5J5DA 4LVDA 1QDSA 2JKEA 4NZFA 3UXAA 3VI2A 4UMBA 3ABSA 3HIJA 3W72A 5LNSA 3TIMA 3DFQA 1IXOA 3NPWA 4JTSA 2G5WA 4LWWA 3TW7A 2NXGA 3K30A 3O05A 4LUJA 2PCQA 3DENA 1I4NA 5A5WA 5I3JA 3CIWA 4MY8A 1SO3A 2Y70A 4M19A 4N9BA 4R53A 2DZWA 3B06A 4O18A 2BX7A 2NUYA 1TPDA 3GNDA 3W22A 2P0OA 1I2OA 3PULA 2RDWA 1H63A 2DZPA 1EP3A 4LW7A 3HG4A 2EF9A 4JDYA 2P10A 1YTKA 4YLWA 4DELA 4O17A 1DORA 4H3DA 1KTBA 1KM5A 4YCOA 2JGYA 4IPIA 4K6AA 5D2WA 3PG9A 3W7OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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