2QUUA

Dihydroxyacetone phosphate schiff base intermediate in mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
363
structure length
349
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAMWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Stereospecific proton transfer by a mobile catalyst in mammalian fructose-1,6-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
total genus 142
structure length 349
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2quuA00
3CLMA 5AN7A 2ZZ1A 1W37A 1NAL1 3W23A 2DZXA 2DORA 3DI0A 4LT9A 1KM2A 4HT3A 3TAKA 1PE1A 3M44A 2ALDA 4ZQNA 1VHCA 3W1AA 1F73A 1XKYA 2Y6ZA 4K8EA 3C4UA 1KTBA 3W7QA 2J27A 3DGRA 3P8IA 3PF3A 1A5AA 3P62A 5AYXA 3P81A 4IPJA 3W76A 4WX2A 3W1RA 5CPNA 2V5LA 3W1UA 1JQXA 1LBMA 4ADUA 4S2CA 2JK2A 3N9RA 2A21A 1A53A 2R14A 4M19A 1ML1A 3LRMA 3QQ1A 4TO8A 4ONVA 4IQLA 1RVGA 1PHWA 1GYLA 4HSNA 3TR2A 1WXJA 2J9YA 1OFAA 4DF2A 2YDAA 3C8FA 1FQ0A 3DBPA 4Y9AA 2QUUA 3DAQA 4OT7A 4IOTA 3W71A 5F1UA 5CKSA 1RQBA 4NX5A 4N4PA 3QH2A 3TSDA 3W3OA 4QITA 2A5HA 3G22A 1WOBA 3TDFA 1H63A 4UTTA 1OX4A 3BVJA 4ALDA 1K8YA 4X22A 3IIZA 3OIXA 2ZZ3A 2V2DA 4S1FA 1DL3A 2NWRA 4TIMA 3WJZA 3LCFA 3SW6A 1JVNA 1BEUA 1FDJA 3OA3A 1N55A 4LWWA 3C6CA 1GT8A 4X9SA 1G69A 3NQVA 2Y7EA 5TQLA 3PR2A 3NA8A 1YPFA 4Y8FA 2WSQA 1KA9F 3HIJA 3S1UA 3BPWA 1P0KA 2A6NA 4JTTA 3WJYA 4A2SA 3CU2A 4QNEA 3HBLA 2Y7FA 2Q8ZA 2C6QA 1ME9A 1WYIA 1TRDA 2QCDA 1IXOA 5EPDA 4M6PA 1XFBA 1ZAHA 1SW3A 3W83A 3LCGA 4O17A 3DFTA 5CPLA 3M5XA 3Q94A 1VPXA 4RCXA 4IJBA 1K7FA 2CW6A 2Y85A 4CQ8A 1K3UA 2E5DA 3R13A 3W7EA 2BXVA 3LBCA 1C9DA 1IIHA 4O57A 3W7DA 4JGDA 3KHJA 4NZFA 1WBHA 1HO1A 5CG7A 2FPYA 2PCQA 5D30A 1TV5A 4PL2A 4HNVA 5G4WA 3BV4A 4AVFA 1XCFA 4GUFA 2XN2A 1U5JA 3O07A 3MYOA 3PY2A 3A5VA 1LCOA 1JULA 1ZALA 1SW0A 3M9YA 2PRHA 1P5BA 3MWAA 2GVLA 1I8JA 4O10A 1HFBA 1F6KA 3FA5A 1BWKA 1GWJA 4KWVA 3O6DA 3SY5A 4O12A 5FF2A 4FX8A 4BI7A 3QMTA 1TTJA 3SSJA 5HNRA 2GVJA 3CM4A 2QF7A 3UWUA 2VFIA 3GXNA 1GVOA 5CZJA 1W5NA 3LLDA 1NVMA 5IBXC 5G4EA 2R91A 2VENA 2O7QA 3RLVA 3N3MA 2QCGA 1KM5A 4UTIA 3I65A 3FKKA 1JCLA 4NJGA 3PG9A 2G5WA 3UPBA 4AB4A 5LZLA 2VFHA 1Q6RA 3CIXA 1B4EA 1JUKA 1VRDA 3HG2A 5K4XA 1P0NA 4TU1A 4BFAA 4JTLA 4JEQA 1AW5A 1SZEA 3FYOA 1M5WA 2V30A 1J4EA 3M5ZA 4L4MA 1NF0A 3V75A 3S1WA 3R5EA 3P61A 3NQFA 3T40A 4NQ1A 3W7GA 2J9XA 3ABOA 4MLRA 2H8XA 2ZQ0A 7TIMA 4O53A 3EB2A 4U28A 2QJGA 3PM6A 1AW2A 5K9XA 2QUTA 4AHOA 3BK0A 5LHFA 4WY0A 4MY9A 4NT0A 3LHVA 1LBLA 1Z42A 2E6DA 2Y88A 3NDOA 4Q33A 3TXZA 5CZSA 4PH6A 2BX7A 1ME7A 1WV2A 3E96A 4ADTA 3PSWA 2ZTJA 1SO5A 1I45A 3LHWA 4DPQA 1EPXA 4IX0A 1KFKA 3P8JA 3DENA 4ZQRA 4PTNA 1LOSA 2A4AA 3W86A 4ZZ9A 2R8WA 4EIVA 3W7IA 3KVKA 1FXPA 3W22A 5BOOA 3FKRA 1NSJA 5C5YA 1BWLA 3P74A 1CI1A 3FS2A 3RNDA 2JKPA 1GVRA 5K4ZA 1Q45A 1MZHA 1JCYA 3F1QA 3IIOA 5KZEA 5CGQA 4XKYA 3G8EA 1FDYA 3QW3A 4ZL1A 5CSRA 2ZRXA 3LRKA 2CFFA 4JXCA 4N6EA 3BO9A 4JICA 2YFNA 1IF2A 2CZDA 1PV8A 4WOZA 1H1YA 2H8ZA 2YW4A 1ICQA 4O11A 1DQXA 1KFJA 1OFOA 2FJKA 5HWNA 1W54A 1FCVA 1T96A 5BRBA 3C3NA 3G8RA 1A5BA 1V5XA 3W84A 4FO4A 4K7YA 1H1ZA 1TTQA 4NNAA 3EWWA 1OFDA 1DKWA 3WFAA 3UD6A 1KTCA 4WZHA 3P5YA 1FX6A 4HNNA 4RXFA 4LVFA 3CB8A 3UWQA 4E38A 2QDGA 3TW7A 2I14A 2OZ0A 2RDTA 3HPSA 3UY7A 1OFPA 3W2MA 4O16A 3THQA 4O52A 1MEWA 1H50A 2Y7GA 5A5WA 1TCDA 1RV8A 3GR7A 2WV8A 1GYNA 3W6YA 3PBYA 2E09A 2C0AA 1BTMA 3W72A 1QOQA 3F03K 2ZA3A 1LBFA 2EHHA 3HQ1A 4QAIA 3L5MA 4IPIA 1YDOA 1ZAJA 1ZY9A 4YMZA 2ZA1A 5AHIA 4OV4A 1T0OA 5ABTA 1JUEA 1OFRA 2NV1A 3W7HA 2E5CA 1T8XA 4NVTA 4WUIA 3WJXA 2A7RA 3L2IA 1L9WA 3LGEA 3IGUA 1OX6A 5AC7A 1MXSA 2RKXA 3B05A 3M43A 1GTEA 5KSWA 1KM4A 4E2BA 5HUOA 2Z0IA 2HS8A 3I68A 3EXTA 5MHBA 2OX1A 1GVFA 1LROA 1PS9A 1MEIA 3PUDA 5A8GA 3OBKA 3GX9A 3K30A 3LBMA 4LS1A 5FEZA 1JCMP 5D37A 2QDHA 2V5BA 4I7VA 4R33A 5KZMA 3FJLA 3KRZA 5DBUA 3DFSA 2FFCA 1VYPX 1VH7A 3B0VC 3B0UX 2E6YA 3IIXA 3MJYA 3C2FA 3N2XA 3PC0A 4HIBA 1PIIA 3NPWA 1LRQA 1LOQA 3TMLA 3AO0A 3MI6A 3IGSA 4LRSA 4UCGA 2A2IA 3TSBA 4ADSA 2R94A 2ZZ7A 3G0XA 4GUIA 2RDWA 2UV8G 4IX2A 2QEZA 2GVGA 3LOTA 1RPXA 3KVLA 5HQEA 3B03A 3N2MA 2A7NA 4E2DA 5K7JA 4AHQA 3GAKA 1LDCA 3W9ZA 1KLZA 1XM3A 4XWUA 3UPWA 2ABAA 3S6DA 1GEQA 2J24A 4UTKA 3USBA 1R46A 2FPTA 2YSWA 1K8ZA 4JTGA 3TW6A 4QNWA 1GPWA 2TSYA 3W7JA 5K3VA 4CQ9A 3NL6A 2NWSA 4K38A 3MUXA 2PE4A 4IMCA 2CWNA 4I9AA 1KM1A 4N6FA 2NUXA 2VEMA 4IUOA 3P80A 4O4WA 4Z0JA 1KFEA 1N8FA 1R30A 4JNMA 3TC6A 4TX9A 1TV7A 5TBOA 1FDZA 4GUHA 5KITA 3T78A 2FPVA 4PCFA 2FLIA 1FY6A 4GE8A 4LC8A 1K03A 3LCLA 4O1CA 5G2WA 4Z08A 3P60A 3QMSA 4IWWA 5EL1A 3QRHA 4KFPA 2QCFA 4BI6A 4PA8A 4CCDA 4UUIA 1TV8A 1R2SA 5DXXA 1H7OA 3EWZA 3LTPA 4RX0A 3STFA 3I7SA 3A5FA 3T44A 4JX6A 1XDLA 4UTJA 1ADOA 2EGZA 4UTLA 4JS3A 1L6SA 4OU1A 3U8GA 3JR2A 2F7FA 1UUMA 2P10A 2X1RA 1SUXA 2FTPA 2TYSA 4C1LA 1WAUA 2YPIA 1H61A 4DEFA 3BW4A 1DJQA 3PBVA 5AOUA 5D38A 2NXHA 4J9JA 5G1TA 3WK1A 3EWBX 1KFLA 1H5YA 3DFQA 2QCHA 3VFLA 1HL2A 1YXDA 5FF0A 4JYDA 1GQNA 2WSYA 5I3HA 1VC4A 4Q32A 5F4WA 4BWLC 1L6WA 3W7CA 3C56A 4QJ1A 2FB2A 1SFLA 4O28A 3W1MA 1YLVA 3DU0A 3LHTA 3W7LA 1J5TA 3UZJA 5HJLA 3G1DA 1QWGA 4MJMA 1XBZA 3EWXA 2TRSA 3W1PA 3LLFA 3UNDA 2ISVA 1VS1A 1KFBA 1JR1A 4LRTA 3CEPA 5BW6A 3TX9A 4NJKA 3HGRA 3S1XA 1WOAA 3EX1A 3LHYA 2J88A 1A50A 3R2GA 1YXYA 4XTDA 2GOUA 1TTIA 4MZYA 2NX9A 4A21A 2VEPA 3ZR4A 1G4TA 3KVMA 3NG3A 4YLWA 3LTSA 3TUUA 3MBFA 4LVDA 1KM3A 4AWSA 3E0IA 3DFOA 1I2NA 4CCEA 1X1OA 3TXVA 3LERA 1FCQA 4AAJA 1EIXA 4PFMA 3A21A 5HMSA 3IRDA 2OJPA 3NQ8A 1X8FA 1L2UA 4JTUA 3CIWA 4FEZA 4YL2A 4FHAA 4JN6A 5C2XA 3NOEA 3C2VA 3UYCA 1TTPA 3HPZA 5LSMA 5D32A 4MZ8A 3OVQA 3ZS4A 1QPQA 5H2ZA 4CNOA 1SZNA 4JR5A 1LOLA 3PSVA 4MIMA 1QPNA 3E9AA 1PL9A 1VYRA 3MYPA 4UTTC 1K02A 1Q3NA 5DCBA 4O1AA 2V81A 4LVBA 2X16A 2QR6A 4C1KA 5F2GA 2PRLA 5KTLA 1EP1A 2B7QA 3U6WA 1F2JA 5LNRA 2NV2A 2RFGA 4MPQA 3OHIA 3LTYA 4O0KA 3SI9A 1YYAA 2YW3A 3GXPA 4BR1A 4LNYA 1GOXA 5HR7A 5DXYA 1QDSA 4PODA 1HUVA 2QCDB 4XBSA 3G1VA 1WX0A 2CLOA 3ZWTA 5DY2A 1TPDA 1FWSA 3GXTA 1ZJIA 3QZEA 3W7RA 5LGZA 3G3DA 4AMAA 2GPTA 3W07A 3TH6A 3G24A 1XI3A 1RQEA 4NUWA 1KLYA 1H60A 4RR4A 4EWND 1O95A 3W7KA 2HS6A 3M6YA 1DVJA 5C55A 2E68A 2QJHA 3WK2A 1R2TA 3TROA 4EF9A 5LHEA 4HN4A 5EKYA 2DZPA 5IM51 2WPBA 3NGJA 2W0UA 3E49A 5D09A 4FX6M 1DOSA 4M5PA 3F4NA 3EX2A 1WDWA 3RLUA 4GRSA 3S5YA 1M6JA 2D73A 2YCEA 1M7OA 4EF8A 3ELFA 1B57A 1H7WA 1UB3A 4UTHA 3GLCA 5IBXA 5LNSA 5AFDA 5F1VA 4A29A 3QJAA 3O8AA 5DELA 1XC4A 2A6LA 3FFSA 1Z48A 4GBUA 4N2YA 3RFAA 3CT7A 1RR2A 4N02A 4ICNA 3HPXA 3LV5A 1XL9A 3STCA 2OMAA 3ZFHA 4CNPA 3RF9A 2G97A 4LTSA 3TIMA 2YGYA 1VCGA 1JQVA 1W0MA 2WNZA 3D0CA 4UFKA 2ZYFA 2ZZ6A 3MP4A 3C2EA 2NX1A 1VYSX 3FOKA 3EX4A 3ABSA 5D02A 1XUUA 2I9EA 3QF0A 4O19A 5FF7A 2X1UA 2ZRZA 4NNBA 4UFMA 2DU2A 2YX0A 4IXXA 2CLLA 1XDMA 2CLFA 1KM6A 3L5LA 3L67A 4NU7A 3V1PA 3EX6A 1S5WA 4S2BA 3HOJA 2FQIA 4O15A 5D2XA 3T55A 3PB0A 2YR1A 2ZRUA 4K37A 4N9DA 2X2GA 4GC4A 4I7WA 3GDRA 1FWWA 3GIYA 1WA3A 3NM1A 4JTFA 3TMQA 3FIGA 4Y90A 3QPYA 3UWYA 2CZEA 2ZFAA 3NNTA 3W7OA 4MY8A 1Q6QA 1QCWA 2QAFA 1FUYA 4WY0B 3QC3A 1TRIA 5D03A 4BF9A 4GJ1A 3TNOA 1S3HA 2OCZA 2PURA 4JDYA 2OT0A 2ABBA 3DFPA 3IIVA 3W85A 2GQ8A 3NQGA 3B04A 1F76A 3S9YA 3L5AA 3TAOA 1TQXA 3T4CA 3TC7A 4DBDA 4QISA 2FIQA 1TPVA 3CWOX 3SFKA 1TPFA 2WO5A 3GYEA 4AH7A 5G1YA 1YTKA 3MBDA 1XUZA 1O94A 3NPUA 1CW2A 4ZQPA 5FEWA 1ZNNA 2JBMA 4FIQA 3IIPA 3KXQA 1WBJA 1OFQA 4KWWA 3ANYA 4M6VA 3SGZA 3QSRA 4DELA 1R2RA 1XBXA 3NEVA 3KRUA 1ZAIA 2WOQA 5F2MA 3S5OA 1TYGA 1JCNA 5F2LA 3NL5A 2CU0A 3PUEA 4AF0B 5SWUA 1XBYA 4LVAA 1JJKA 2C3ZA 5U4NA 5EBUA 1FWNA 3PULA 5D2WA 3NQMA 4ZQCA 3TSMA 1W5MA 1SO3A 4WXZA 4JTKA 4K36A 3BLEA 1ZHAA 5FI8A 1KTNA 4GWEA 4XQ6A 1SU5A 1U83A 4WJEA 4AEOA 1F5ZA 3W2JA 2Y63A 3TFCA 3NZRA 3Q2DA 3TJXA 1MSSA 3L0KA 2C15A 1ONRA 2BTMA 4FNSA 4Y6GA 2V8ZA 3LXAA 3W74A 3PUOA 1LLWA 4IMFA 3W2KA 4AHPA 3M5YA 4IXHA 3CPRA 2QKFA 3P7YA 4ORIA 4H3DA 3U2OA 4JDBA 4K6AA 2VFEA 4KKXA 3MP5A 4DO5A 4O8RA 1H7RA 3NYZA 1SZGA 4LU0A 3UY8A 3GKAA 4EVZA 4G1KA 1I2PA 3VE9A 2DP3A 3G0SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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