2QUUA

Dihydroxyacetone phosphate schiff base intermediate in mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
363
structure length
349
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAMWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title Stereospecific proton transfer by a mobile catalyst in mammalian fructose-1,6-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 142
structure length 349
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2quuA00
1OK4A 1EUNA 1W31A 3FYPA 1OX4B 5D2VA 4TMCA 4OU1A 1AL7A 2GVJA 1A53A 2X30A 3IRDA 5CZSA 1FWNA 3RFAA 1XXXA 5T26A 3CWOX 2JK2A 4GFSA 5HMSA 3HJZA 3MO7A 1QR7A 4O1BA 1L6YA 3KVLA 5DCDA 2C1HA 3L5MA 5HWMA 3NQCA 5A5WA 3DFSA 2CLKA 4GWEA 4DF2A 1F2JA 1RZMA 1R46A 2GOUA 1DBTA 3RU6A 2VKZG 1BKSA 5AC6A 1LRNA 1OFBA 2YX0A 3HGRA 3KX6A 3C56A 1VZWA 1O60A 4JIQA 5KTLA 4R33A 4HIBA 1JUBA 4LY8A 3NQDA 4WOZA 3STGA 4JS3A 5CSRA 4OV9A 1U5JA 1X8FA 4YWIA 3W22A 2A2IA 4O1CA 3PUDA 2EAWA 4HNUA 2JGYA 5D03A 3UZJA 4K39A 3PF3A 5AFDA 5G2WA 4JTSA 1ZHAA 5LZLA 1Q3NA 4UTTC 5C5YA 1Z41A 1EX5A 1IIHA 4EIVA 1JQVA 2E6FA 5LHFA 3INPA 1TJRA 2LLEA 3W71A 3EWYA 4GE8A 1TQJA 4CNNA 3PBVA 3FEMA 4RK8A 1HUVA 5FI8A 2Y7GA 2QCCA 1K8XA 3W7KA 1SW0A 4ZL1A 1H7NA 3G3DA 1SZEA 1QO5A 4XZ9A 1OX4A 1RQBA 3STCA 1PL9A 5HJLA 3LV6A 1GVSA 4O50A 1IF2A 1DL3A 4A3UA 1W5PA 4E0CA 4JTLA 2YW4A 5CZJA 5K9XA 3UY8A 4A2RA 3O06A 1G7VA 1FDYA 4AHPA 4UTHA 4LS0A 2FLIA 1EUAA 1WA3A 3LI1A 1KM1A 5DXYA 3PC0A 4LV9A 2HMCA 1OJXA 2Y62A 2OMAA 3W7PA 4M6QA 2G97A 1TB3A 2QEZA 1ADOA 4WXZA 2BWGA 2YR1A 2GQ9A 3B05A 1MEHA 4GUIA 1O95A 3NQ8A 5TBOA 4AMAA 1H7RA 3H54A 5D37A 2VENA 4IMFA 1XBXA 3NL6A 3PG9A 3LCFA 5DBTA 3GKFA 2GPTA 2Y89A 1ZENA 3B06A 2QR6A 1HG3A 3LLFA 1ZCOA 4Q33A 1O5KA 1R47A 3DAQA 3SI9A 2NX3A 1JCLA 2YDAA 3SSJA 2A5HA 1WBHA 2Q8LA 4GUJA 4LNYA 3P81A 4FX8A 2W6RA 1JCYA 4MYAA 3UQNA 3G22A 2ZRVA 1SZGA 4P2VA 3UXDA 3QC3A 3E49A 1SQ7A 4NX5A 1L2UA 3NM1A 4MY1A 2J24A 1W8SA 3BLEA 3HG4A 2Z0IA 3NPXA 3TA6A 1JCJA 2QUTA 1TJPA 1FXPA 1EEPA 2WQPA 5K4ZA 2VEKA 3CC1A 4CCEA 2RHGA 1W5QA 5BMXA 4U4MA 1G7UA 4CQ9A 4YCOA 3O07A 3TJXA 5DELA 1QPQA 5AHEA 2J88A 2E1DA 1F6PA 2HTMA 5KZEA 4ZMGA 4U28A 3W73A 3TJLA 3FJLA 5HNRA 2B7PA 1VYSX 3IIXA 3M1ZA 2J9XA 2ZCGA 2C13A 1SUXA 1QPNA 4OBTA 1VJIA 4TX9A 3UWQA 1G4TA 3C2FA 3EXSA 1NF0A 2Q8ZA 1KLZA 4MYXA 1QDSA 3W3OA 3W2UA 2DU2A 3HPSA 5BMWA 4K6AA 2XFWA 1ME9A 3E9AA 1X1ZA 3ZWSA 1KM0A 1KBJA 4JICA 6TIMA 5FEWA 3QW3A 4MFDA 5I3HA 4CCDA 3V1PA 4CQ8A 3UWYA 2AQWA 3IIVA 1TO3A 2X1TA 3QMRA 4IUOA 4DELA 1K7XA 1YDNA 5CG7A 2PE4A 4LUIA 4MZYA 3OHIA 1YPIA 5CKSA 3K30A 3T55A 2YW3A 5AHMA 4AF0B 1I2PA 3T4CA 4XBKA 3SIZA 1HFBA 4A2SA 1W0MA 5E0KA 4JTFA 1XDLA 3W83A 1NFBA 4ZQOA 4OQVA 4DXVA 1W5MA 3GK0A 5LNRA 2DZXA 4TMBA 1TREA 4UMBA 1A5BA 4HHPA 1N7KA 5J5DA 1XUUA 3DFOA 4IJBA 4FIQA 1S5VA 3EWUA 1H7OA 3D0CA 3HB9A 3NGJA 1B9BA 1SPQA 3W1AA 3R8RA 2TSYA 2RH9A 4ADUA 1ZJIA 3EX2A 3A22A 4JTEA 2ZRXA 1H60A 2EKCA 2ZZ7A 3KOFA 5EPDA 5LGZA 4M6PA 3TMLA 3G8RA 3GYEA 4IPIA 4NJGA 4O19A 3C61A 5HUOA 1TPC1 4J9JA 1XI3A 4S2CA 3DH7A 4GNJA 4NJHA 1Q45A 1X6UA 4ONVA 3WJZA 2GQ8A 4QAIA 2Y85A 5C6MA 2A1YA 2OT0A 2Q3OA 1UB3A 1C29A 5EBUA 4K37A 4ZZ9A 3QMSA 3C3NA 1KV8A 1M7OA 4M7SA 1P0KA 2XN0A 5F2IA 3CLMA 1GVOA 3EXTA 3M5YA 3LCWA 2GVGA 4N6EA 4AHQA 5ABTA 1FWRA 1DJQA 1A50A 3C2RA 1VH7A 1S5TA 3HQ1A 3O6CA 4LV4A 2V82A 1KM2A 1TYGA 1JR1A 3PWAA 1XBVA 3SECA 1VR6A 1R30A 3MHUA 1EPXA 3PS7A 4IGHA 1K7EA 5AYXA 5D38A 5AC8A 3I7SA 3C6CA 5GVJA 1EWEA 1WOAA 2ALDA 3S5NA 3W7OA 3U2OA 1K02A 1AL8A 2C16A 3S9YA 4G1KA 4KWWA 1OG0A 3R12A 3BG9A 2QCFA 4AHOA 3W2MA 1KFKA 4LUJA 5CZTA 3C2VA 5FF3A 1EB3A 1LRTA 2R94A 5G1YA 3QH2A 4KFPA 3M47A 2CLIA 4YLWA 3PBYA 4QJ1A 2ZRZA 1UUMA 1O4UA 4YXGA 3G0SA 1K8YA 4DO4A 3W86A 2ZTJA 3UPBA 4IMDA 5AN7A 3I7QA 4QM1A 1KFLA 4NJJA 1SR9A 1JRBA 1DQWA 1A5SA 2A6NA 3LTPA 5FF4A 5D2TA 4NJIA 4XTIA 2QJGA 3TSBA 1TPH1 1T0OA 2FPTA 5FEXA 2FPVA 1W5NA 3P8JA 1DHPA 4R53A 3L21A 1LYXA 3NQFA 1SSGA 1B57A 3T44A 4HN4A 3L0GA 3PVFA 1QAPA 2VEPA 4HNNA 1H7PA 1GT8A 5H91A 1ME8A 3W7CA 1RVGA 3LBMA 4YL2A 2NXIA 3NQEA 3NXFA 2A6LA 1TV8A 2Z6IA 4WY0A 1M5WA 3AJXA 3HBLA 4QNWA 3TQ0A 2QDHA 1W3IA 4RZ4A 3UWUA 3HF3A 1FCUA 3A5VA 1FQ0A 3LV5A 1XM3A 3TV8A 3LCXA 4L4LA 4H3DA 1V5XA 1YXDA 1LTDA 3ZS4A 1RR2A 4RXGA 1TV5A 3A21A 3R89A 1ICQA 4E2BA 1SZNA 1IXPA 1FDJA 4UCGA 3PR2A 3QFEA 2IQTA 2NUYA 3C4UA 2AGKA 3C0JA 4MPQA 3NAVA 2YPIA 2ZRYA 4NT0A 5DXXA 2XN1A 3EWZA 2V2HA 3DBPA 5KINA 3AO0A 3ATYA 1FCVA 3R2GA 4LRSA 1SU5A 3TC6A 1LBMA 1JUEA 4IQLA 3TQVA 1LDCA 2WSQA 3NQMA 4O11A 1DQXA 3YPIA 2VELA 1WDWA 1J5TA 1MO0A 1WQ5A 1KTNA 4BFAA 3NZ1A 3M41A 1VRDA 3ABSA 3CWNA 4CLMA 5I3IA 1E51A 4IX2A 1TRDA 4Y8FA 4JY8A 1YTKA 3A5FA 1MSSA 3CTLA 5CPNA 1A5CA 4C1KA 1SFJA 3ANYA 3WJSA 5AYYA 5BNKA 1GVFA 3LHZA 3QPZA 3R5EA 1PV8A 4N9DA 4EF8A 5DY2A 4JR5A 4O12A 4UFJA 4TU1A 3HG2A 2NV2A 4ORMA 3Q94A 5DCEA 4XKYB 5L9FA 3NPWA 3O6DA 7TIMA 3S42A 4JTHA 1GQNA 1GEQA 1GYLA 1C9DA 2CLEA 5FF0A 2VFGA 3DFNA 2B0MA 4RZ6A 1M6JA 1YPFA 1IXQA 1KFCA 3UY7A 3PBUA 4D2JA 2Z1BA 4O0ZA 4LRTA 3UYCA 4FEZA 3Q2DA 5CPMA 1KLYA 4Q32A 4OGZA 4LS2A 3L68A 1C8VA 2H8XA 5HWJA 2ZRWA 5AYZA 4I9AA 3HMJG 3M6YA 1RD5A 4OV4A 4AWTA 3N19B 3EWWA 1TPVA 5HUPA 1JQXA 1SW7A 1W5OA 2H90A 2PRLA 2B7QA 3MI3A 3VE9A 1BEUA 3TMQA 3TXVA 1QOQA 3DFTA 4R7JA 3LHWA 3HIJA 4LOCA 4ZQNA 2TPSA 2QCMA 4HPJA 1RQEA 4CCCA 3TUUA 2RDWA 3OIXA 4IXXA 2VEIA 4A29A 1BWKA 1CX9A 5I3JA 3G1XA 1FWWA 1YDOA 3QRHA 1SFLA 3BGGA 3G24A 1CW2A 1TCDA 4O52A 4N4PA 3B8DA 2GJNA 1AW1A 1OVDA 1O94A 3EX4A 3P74A 3LRLA 2A21A 5D05A 1I2OA 2QCNA 1K7FA 1Y0EA 5D09A 3P82A 3G1HA 4DO5A 4MY9A 3KVMA 3G0XA 1Z42A 4NNCA 4AAJA 1GVRA 5C2XA 2DZSA 5EYWA 1A5AA 3KVKA 4XKYA 4NUWA 2WPBA 2ZZ3A 4RKAA 3DHDA 1JJKA 3IIZA 3MYPA 4HPXA 5BRBA 5LNUA 2C0AA 1H50A 2A0NA 2JKPA 2Y70A 1TPB1 5LGXA 4FXRA 4GUFA 2C3ZA 3NQ7A 2RFGA 5EL1A 4NZFA 3TSMA 5KITA 2FDSA 1UBSA 1YTEA 4ML9A 1NEYA 1QFEA 4NNBA 1SO5A 1DV7A 1J2WA 2JKAA 3W75A 1EP3A 1GYNA 4MVAA 4N2YA 3LCGA 3TROA 5F4WA 2ZYFA 3TKFA 4GXMA 2R8WA 3L0KA 3O63A 1LLWA 2FJKA 1KW1A 3UZ5A 1W1ZA 3WJXA 4UTLA 5K4XA 1R2RA 2B7OA 5F1VA 3E0IA 1F05A 3W7IA 4JIPA 4GC4A 1OFAA 3W7LA 4BK9A 4RZ5A 3MJYA 4XTDA 1HO4A 1V7YA 1XBZA 1YXCA 3VE7A 1LRQA 5F4SA 3BVJA 5D2WA 3GNDA 3UD6A 1OYCA 3LHTA 1HO1A 2EHHA 5AHLA 4PA8A 3SZ8A 4LVFA 4CNPA 4FX7A 5F4XA 3NPVA 2B4GA 4O1DA 3SR7A 1IXNA 4RX0A 1KA9F 2NX1A 1HL2A 5D02A 2VFIA 2QF7A 3IGUA 2V81A 2X1SA 4X22A 4QSHA 3TU9A 5DN1A 1W56A 4NNAA 1T8XA 2ZZ1A 3EX3A 3Q37A 2ZA2A 4O57A 4UTUA 1PE1A 1SO4A 1VCGA 1F73A 1AW5A 3W9ZA 1RV8A 3LCLA 5J5RA 3S5OA 3PBWA 2VOMA 1H51A 4LW7A 2J9YA 5EA9A 1VYRA 2HS8A 4AWSA 3P5ZA 3ABRA 1LZOA 4GBUA 1IXOA 1GG0A 2QUUA 4IOTA 3W70A 2V9DA 4UFIA 3VCRA 3KVJA 3TIMA 3W7EA 4RJEA 4JXCA 5CZ0A 1H61A 1OX5A 3PM6A 1MEIA 4ZVJA 4X2RA 3KAOA 3LXBA 1QOPA 1F7BA 2E6YA 1D9EA 3UPWA 2E5CA 2CLHA 2ZZ5A 1TPDA 4UXDA 3HGSA 5LKYA 2ATSA 4MY8A 1GOXA 5D30A 4H4IA 5D32A 3GIYA 3TE9A 5EMUA 1G4EA 4BWLA 1TTPA 3NYZA 3FA5A 3L2IA 4O10A 4IXHA 2VFHA 4N9CA 5I3FA 5KZDA 3LRKA 3P80A 4AXKA 3QZEA 2YFNA 3LTSA 1TPUA 4BI5A 1WV2A 4NQ1A 8TIMA 1G6CA 3L5AA 4IPJA 2CLFA 2CZFA 3T40A 2V30A 3GDLA 5K3VA 1B3OA 2WSYA 4RCXA 2OX1A 3A23A 4WOQA 3QQ0A 3B04A 3S0CA 2EPHA 4O4WA 3W1NA 3W2JA 1RQHA 3GDMA 1H7WA 3DFPA 3I68A 4K7YA 1XUZA 4O53A 1W3NA 3QJAA 3NEVA 2ZZ4A 2ISSA 3M5XA 3GB6A 2QDGA 4QNEA 3CIWA 3DFQA 4DPQA 4QITA 3W1XA 4MUZA 4FF7A 4EVZA 3P60A 3N2MA 4O18A 2E6DA 1LOSA 2NV1A 2FPYA 2XN2A 4YMZA 4JTGA 1KM4A 3RMJA 3W6YA 1AG1O 5C55A 4ICNA 5G5IA 3L9CA 3NL5A 2V0TA 2R91A 1OFDA 1SW3A 3N14A 4LT9A 1TQXA 4OHQA 5G4EA 4IMEA 1TPEA 1PVNA 3W84A 2F84A 1UUOA 1GPWA 3TW7A 1FDZA 1SO6A 2TRSA 1MZHA 2P0OA 3P62A 4FNRA 1KTCA 2G96A 1KFEA 1WAUA 4IX0A 4PODA 3ATZA 3N73A 4XUGA 1KM6A 3NR0A 4RLIA 3FKRA 2CZ5A 3GXNA 2GJLA 4O28A 4AF0A 1TMHA 3JRKA 2CLLA 4ALDA 3W76A 1F74A 2V8ZA 1LP6A 2Y6ZA 3QPYA 5E1QA 3N9RA 3TAKA 5CPOA 1F76A 2PC4A 1ICSA 2Z6JA 2YCEA 1LOQA 1LBLA 1N8FA 4O0KA 2EGZA 3G3MA 3QYQA 2WSRA 2TMDA 4AEOA 3LCHA 2V5LA 3P67A 4FO4A 4X3ZA 1PS9A 2ZRUA 3EX1A 2DZUA 4FX6M 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QTG A;  1W31 A;  3AYR A;  5D2V A;  3OP2 A;  1L0P A;  1GOR A;  3EMZ A;  3IRD A;  1FWN A;  4RNJ A;  3DEC A;  2FZ9 A;  4B2D D;  4HNC A;  4S23 A;  4O1B A;  2JF6 A;  1V6W A;  1SM9 A;  3KVL A;  5DCD A;  2IKG A;  1SMD A;  4C6P A;  2GOU A;  3RU6 A;  2PLC A;  1PEZ A;  3ZVH B;  5AC6 A;  2Y1H A;  3C56 A;  1PJ9 A;  3GSM A;  4HIB A;  3HFY A;  3BSH A;  3KE0 A;  4JS3 A;  3REQ B;  2WCG A;  2VZO A;  3E5B A;  4O1C A;  4HNU A;  3GD6 A;  2JGY A;  2WPG A;  3VNM A;  3PF3 A;  4JFU A;  5AFD A;  5A8P A;  5LZL A;  1EZW A;  1AJZ A;  1Q3N A;  3BJS A;  5C5Y A;  4EIV A;  4AUB A;  3EWY A;  3F5K A;  2EXO A;  5I79 A;  3W7K A;  1SW0 A;  3EEZ A;  2ALR A;  3AHY A;  3G3D A;  1QO5 A;  3WX7 A;  4EAC A;  1RQB A;  4RUB A;  5HJL A;  1PBG A;  4O50 A;  1IF2 A;  2OU4 A;  1DL3 A;  1SGJ A;  3NCO A;  4E0C A;  1LL6 A;  4JTL A;  3UY8 A;  4Q4M A;  3STP A;  1BYB A;  4FZI A;  3LI1 A;  1HZY A;  1M7J A;  4LV9 A;  1BD0 A;  1ZBW A;  2NQ9 A;  2O4Q A;  2QEZ A;  2GQ9 A;  3LPP A;  1E15 A;  4CEU C;  3URN A;  3WLM A;  1H7R A;  1UWQ A;  5A6A A;  2GJR A; 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 4ACY A;  2VRQ A;  4DEL A;  5HOS A;  1B3V A;  4FPS A;  4MNK A;  4JIE A;  5AHM A;  1I2P A;  1R6W A;  4IL2 A;  4B9Y A;  4A2S A;  1X38 A;  4J3V A;  1V6U A;  5E0K A;  1I9C B;  2X05 A;  1VJZ A;  3MSR A;  1QHO A;  1KBB A;  5LNR A;  3QLL A;  3OPS A;  1RCX B;  1A5B A;  5J5D A;  4FIQ A;  1RCQ A;  1TR9 A;  3HB9 A;  3GIP A;  4E4P A;  5FJR A;  4C6L A;  4MB5 A;  4ZO7 A;  4PMR A;  4B16 A;  2EKC A;  2ZZ7 A;  1ECQ A;  4NJG A;  2Y5S A;  2PD5 A;  4HP5 A;  4O19 A;  2NQZ A;  5EML A;  3C61 A;  4M1R A;  2OO6 A;  5E6Z A;  1YNP A;  4AD4 A;  3AUO A;  3DFY A;  4I8Y A;  3EDE A;  1EJT C;  2GQ8 A;  1TV2 A;  3UWE A;  2Y85 A;  4IQJ A;  1J0K A;  5I09 A;  4ZZ9 A;  4KBX A;  4M7S A;  1DE6 A;  3FYY A;  2ISD A;  3VC5 A;  4IIG A;  3EXT A;  4YS1 A;  4H9T A;  3LCW A;  3BV7 A;  1EKO A;  4AZG A;  3LGD A;  1FWR A;  1DJQ A;  3C2R A;  4D71 A;  4LV4 A;  2V82 A;  1QW8 A;  3CL7 A;  2R6O A;  1S3T C;  1TZ7 A;  2XVG A;  1PXG A;  4IGH A;  3WLH A;  3AHZ A;  4D8A A;  3A4J A;  2OPJ A;  2QGH A;  3HFT A;  3C6C A;  5GVJ A;  3V18 A;  1EWE A;  3WDJ A; 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