2QUVA

Phosphate ions in fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
363
structure length
351
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title Stereospecific proton transfer by a mobile catalyst in mammalian fructose-1,6-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 139
structure length 351
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2quvA00
1TTJA 1JUEA 3LV5A 4NVTA 3FEMA 5D04C 3NQVA 1VLIA 4CCEA 3IGUA 1P1XA 5FEXA 4O0ZA 3PBYA 1AW2A 4R34A 3N34A 1TQJA 2R14A 3P7YA 4MOZA 5LHEA 4N9EA 3MYPA 1W3NA 1EIXA 4XUGA 2FPTA 5BMWA 3WJYA 2ZYFA 4O17A 1NEYA 3FFSA 4LVAA 4ZQCA 2HS6A 3C61A 3IIXA 1XDMA 4RXFA 5FF0A 1GOXA 3W73A 5HWNA 1VHCA 3JRKA 4UTKA 4Z0SA 1ICQA 3DFNA 2JKPA 4NQ1A 4YL2A 2A5HA 3S5NA 4BK9A 1V7YA 2J9YA 3N9SA 4N2YA 4JX5A 1ML1A 1OABA 1T8XA 4JTLA 5IBXA 1KM0A 5AHMA 4O50A 2Y88A 1S5VA 1T0OA 3UZ5A 2CU0A 3E0IA 5FF2A 3W71A 3G22A 3QQ1A 2V2CA 3CIWA 5I3FA 3HG5A 3L65A 1W5OA 4UTLA 1XBYA 3G1DA 3W7MA 1W31A 3PS7A 4FHAA 1D3HA 2AGKA 2ZA1A 3DH7A 3A23A 5D05A 3M0ZA 1LDCA 2G95A 4M7SA 4D2JA 4RLIA 3MMTA 3NAVA 4I9AA 4NUWA 4ORMA 4N6EA 2FIQA 4U4MA 1X6UA 1VS1A 4TO8A 2NUWA 1WBHA 4AHOA 2A0NA 2CLOA 2FB2A 1Y0EA 1XUUA 2WKJA 2QUTA 4I7UA 1X1ZA 2B0MA 2JGQA 4O15A 1IXOA 1F74A 3ABRA 3LHUA 3EWYA 3NL5A 1DKWA 1VR6A 5C54A 2ZRYA 5GVJA 1YTDA 2RFGA 3WK1A 5KITA 2DZXA 3MI2A 1ZAIA 3NQCA 5C55A 2NV1A 1ZJIA 3SY5A 1SUXA 3QM3A 4POCA 3UWYA 4UFJA 3R12A 3AJXA 4MIMA 1RPXA 3QC3A 3GVGA 2RHGA 5K9DA 4K6AA 1OFOA 4LT9A 2VFDA 1TV5A 2ATSA 4E2DA 2O7QA 3OVRA 4DF2A 4YXGA 2BWGA 5K3VA 5AFDA 2QAPA 3NL2A 3EKLA 5G5IA 3W7IA 2A4AA 3GR8A 2FLIA 4XBSA 5HWJA 3S1WA 1QOQA 2CLIA 2Z0IA 2DP3A 1QFEA 1P0NA 4LUJA 4FNSA 3ZS4A 2PCQA 4QISA 1UCWA 2JBMA 2ZZ2A 1H7WA 1FX6A 2ZZ5A 1SZEA 2YW4A 1GQNA 1FBAA 1WX0A 1GVFA 3HGJA 2V9DA 2VEMA 3STFA 3FIGA 3BG3A 1ZALA 2X1TA 3HOJA 3NDOA 3QF0A 4RCXA 5FEPA 3TH6A 3NL6A 1R46A 3LCXA 2O7SA 4GE8A 4O10A 1B4EA 2Q8LA 4OE7A 3PG8A 3O6YX 1QPRA 1G67A 3NL3A 3IIVA 3QSTA 2C3ZA 3NM1A 5G2HA 4I7WA 1JCLA 4MLRA 3ZWTA 3K30A 3ZR4A 1ME7A 4DXVA 3OIXA 4HT3A 2DZTA 5BOOA 4YLWA 4HSOA 3ABQA 2WNZA 5CGQA 1TPH1 1EWDA 2GQ8A 2VC6A 3NZ1A 3TMLA 4ZQMA 4E2BA 3VKJA 4MPQA 5ABTA 2Z6JA 4LNYA 1JQXA 2J6XA 2RDTA 3R89A 1KTBA 2E6YA 3TCEA 3QMTA 3BG5A 1DVJA 3B8DA 2BLEA 2YX0A 3KFTA 2C14A 1B57A 4PL1A 3FKRA 3FKKA 2AQWA 2PE4A 3HG3A 4JIQA 3S1VA 5TIMA 4ZZ9A 4RJEA 4FX8A 3W70A 3T44A 4M7TA 1OF8A 3L5LA 2ISWA 1EP2A 4WOQA 4IX0A 1Q6QA 1O95A 4FNUA 3S5OA 3W7HA 4WY0F 1DL3A 3W7QA 4EIVA 1JCNA 3W84A 1I2OA 1TPWA 1FWRA 3G1AA 4FF7A 3B4UA 3HG2A 3M43A 3NQGA 3RMJA 3W1TA 3W1QA 2GJNA 2VEKA 4KFNA 4MYXA 4DEFA 1VCVA 4JNMA 1GT8A 3G18A 1W5MA 2OZ0A 4LRTA 3W22A 3BV4A 4PA8A 3W7KA 1G7UA 4Q32A 1LLZA 3DKJA 5J5DA 3NR0A 3HB9A 4A21A 1JCMP 1I2NA 1G4PA 1OVDA 4QM1A 4H6KA 3TKFA 3NGJA 1YDVA 1K7EA 3GX9A 1KFJA 3ZFHA 4OV4A 2YW3A 3S5ZA 4C1LA 4XKYA 4YCPA 4HN4A 3MI3A 3TAOA 5L9FA 1W3TA 3QEZA 1QCWA 1VCFA 4NNCA 1QO2A 4K37A 3SZ8A 4A2RA 5G2IA 2Y63A 4LC6A 1H60A 4MYAA 5J5RA 2PRHA 3W74A 1ALDA 3PAJA 4MZ1A 3WK3A 4JEQA 4JYFA 4FNPA 1L2UA 1T99A 1EP1A 3EWZA 3C52A 1SO5A 3PC0A 4JDBA 4GFSA 3MUXA 4IMFA 1GVSA 4MKNA 2TYSA 1AK5A 3U6WA 4KWVA 3HGRA 4HNTA 1PS9A 4QSHA 3UZJA 1O60A 1VQTA 4CNPA 1FCBA 3N2XA 1TPDA 2H90A 1B4KA 3OBKA 1OFPA 4FNTA 5KMYA 4JX6A 1QPOA 1MSSA 3TJXA 2H3DA 3PR2A 3A5FA 3W1LA 5DCEA 1JR1A 5AHNA 4MLJA 5L6UA 3VNDA 4XQ6A 3ATZA 2GPTA 1YXCA 1OX4B 1DQXA 3GK0A 1GTHA 3IIOA 3NXFA 2QUVA 2Q3RA 2FPYA 2YGYA 1YDNA 4TMBA 1JRBA 1VRDA 4AAJA 4UTHA 1QOPA 3NG3A 3W2MA 5HR6A 3CQ0A 3W7OA 3E49A 4PC8A 4I7VA 2E09A 2EAWA 3NPWA 3O05A 4GUIA 1KV5A 3F03K 3I6RA 5EMUA 1THFD 3SW6A 3NQDA 5CPMA 1RZMA 3VFLA 2EGZA 1LZOA 2Y7DA 1R30A 1IXQA 4M6QA 3PM6A 2RDWA 4C1KA 4K36A 3A22A 3EXTA 3P80A 5HULA 4MY1A 3TR2A 3MHGA 3N19B 2EPHA 1R2RA 3M5XA 4O1AA 2B4GA 1PE1A 4O11A 1ZFJA 4AWUA 4UTWC 1XBVA 3B06A 5K9XA 5KZEA 1AG1O 3STEA 4PTNA 5KSWA 5G1TA 1F6KA 1KLYA 2GVGA 4HNNA 3LX9A 4QITA 1H7RA 1SU5A 3M47A 4WD0A 2WSRA 5K4ZA 1YPIA 2ZA2A 2FPVA 4RV8A 4OWGA 3OA3A 1TPFA 3GKFA 1R2TA 3P61A 1GYLA 3KVMA 2X1UA 3CM4A 3T55A 1OFDA 4NNAA 2Y62A 4HSNA 3W2NA 3O15A 1EUNA 2BZNA 1LROA 4K39A 1XXXA 4NU7A 4NT0A 1VHNA 1SO6A 1GZGA 3L2IA 3HPSA 1ONRA 3B04A 3VE9A 4BI5A 4FO4A 4U28A 3TFXA 4AHQA 4XWUA 3OHIA 4UTWA 4NJKA 4EF9A 4N9DA 3ELFA 3RNDA 4HNVA 2DZUA 3KOFA 3UWUA 3O06A 4AMAA 2CZFA 1TIMA 3DFTA 4O8RA 4IPJA 3W88A 4ZQPA 5EL1A 3BK0A 2P1FA 5E0KA 4NJIA 4E0CA 4EF8A 1EP3A 3GXNA 1WDWA 2NWSA 4MZYA 4BR1A 2HTMA 4IMDA 2C18A 2C1HA 3SGUA 3GYEA 5A8GA 3W2JA 6ALDA 2HSAA 1C29A 1IXNA 5C2XA 5G4WA 4UMAA 3NEVA 1A50A 5C6MA 4GXMA 2A1YA 3SI9A 2V5LA 1AL8A 1F05A 3QMRA 4UTTC 4UCGA 3QSRA 2Y61A 3P82A 2CLMA 1KW1A 4OHQA 3USBA 5C5YA 2VELA 3W1AA 2W0UA 4QIUA 2QUUA 3NPXA 1I2PA 3S8HA 2QJHA 2ZZ4A 1Z48A 3HF3A 3STCA 4O0KA 1OX4A 3WJXA 4UFMA 5IBXC 2CLEA 1TRIA 1G69A 3TROA 2NZLA 1A53A 2R91A 5FF7A 1F5ZA 3GDMA 4UTUA 1FWNA 4MFDA 3T78A 5LNWA 4O18A 4FNQA 1DHPA 5D30A 1PHWA 1XBZA 2ZTJA 2B7QA 4HPJA 1LTDA 2CZDA 4UTTA 2XN1A 1TV8A 3QFEA 4K7YA 4JYDA 3F4WA 2YYUA 4WY0B 1TQXA 4KWWA 2Y89A 2GVLA 3ABSA 2ZZ6A 5H2ZA 2ISVA 3I65A 1YPFA 1UBSA 1VGAA 4J9JA 2WJZA 3E12A 2QCCA 1J2WA 4LVDA 5EY5A 4PL2A 4Z1BA 5FF4A 1MO0A 1V5XA 2YYTA 3JS3A 3C2FA 4BI6A 3C2VA 4LTSA 3HGSA 3O16A 1W5NA 2NX3A 3EWXA 1VH7A 3BVJA 1G4EA 4GBUA 1CI1A 2E6DA 1SZNA 4BI7A 4OGZA 3KVKA 5AYZA 4GUFA 2QAFA 3HGOA 3I7RA 4ZQOA 3CEUA 2H3BA 1L6SA 2E68A 2V2DA 2WNNA 3THQA 3HPXA 1O5XA 2X1RA 1A5CA 3W7LA 2ZA3A 3NQMA 1OK6A 1D9EA 4N4PA 1H51A 2EHHA 2BSLA 2VEIA 3PBVA 5DCDA 4G1KA 3L67A 1U83A 4HIBA 4R7JA 5HR7A 3DBPA 1FY6A 5AHEA 4WXYA 3GLCA 3GAYA 5AHLA 4FIRA 1TTPA 3S1UA 4P61A 3GDKA 1LOSA 1VCGA 1WAUA 2OJPA 5BNKA 1VJIA 1W56A 2TMDA 4WZHA 5CZSA 3HMJG 1TMHA 2Z1BA 1KLZA 4JX4A 1SFLA 4S2CA 1VPXA 3PUEA 3TU9A 1MZHA 2VFIA 1JCYA 4ALDA 1K7FA 4RX0A 3FJLA 4IX2A 1LRQA 3FJ6A 2WSYA 4LS0A 1TCDA 3UXAA 3EWWA 1TJPA 1GJPA 2ZRWA 1LM1A 2OX1A 4UNKA 3LBMA 5AOUA 1WQ5A 1SSDA 5AC7A 4CQ9A 2RH9A 2FDSA 2QCFA 2NX9A 3C3NA 2FFCA 3I7QA 4PCFA 2DU2A 1VLWA 5DY2A 4JXCA 3WFAA 1XFBA 3QMSA 1XCFA 4JY8A 3P8JA 3MYOA 4UUIA 3CU2A 3E9AA 3W76A 5DXXA 1FCUA 4FEZA 1Q6OA 3CLMA 5AHIA 1SFJA 5E93A 3TW6A 1JCXA 2QJIA 1SPQA 2A7PA 1I2RA 3OVQA 2DJLA 5CG7A 1L6YA 3LLDA 4LVBA 3EWUA 3GAKA 2TSYA 2NXGA 2F84A 2OT0A 4QNEA 4A29A 1XKYA 4AHPA 4FB7A 3UD6A 2NWRA 3HO8A 1KFKA 1W1ZA 3W23A 3R5EA 5AB3A 4WJEA 1KFLA 3LXBA 1OX6A 3P8IA 2WPBA 3INPA 1SR9A 1JRCA 3Q94A 2H8ZA 3H53A 4GWEA 1WOBA 1SSGA 2P0OA 4GUGA 2V2HA 5G1YA 4LC8A 3NPUA 3L0NA 3SFKA 2ZRUA 2ALDA 4Y9AA 2IQTA 4WY0A 4YWIA 3C2OA 4JN6A 2QCDB 2A6NA 3Q2DA 2VFFA 1DORA 3PB0A 1AL7A 1IF2A 3WJWA 3P81A 3W1NA 4O14A 3M9YA 1IGSA 3QPZA 2X30A 2YCEA 3CIXA 1JULA 3PWAA 3O8AA 2E5BA 3M6YA 2JGYA 3BLEA 1H61A 5K2ZA 3M5YA 4A2SA 4JTJA 3G0XA 1FCVA 1C9DA 1ICSA 1LYXA 3L0KA 5LSMA 1TPEA 1GVQA 2YR1A 3LXAA 1WXJA 4ZQRA 3G1SA 1KBIA 1OFEA 4JTHA 3WJSA 2Y7EA 2ZQ0A 3IEBA 1H50A 2CW6A 5D2TA 3KRUA 1KA9F 3RLUA 5CSSA 1VC4A 3TJLA 3I7SA 2E6AA 2VENA 3MP4A 3GB6A 1ZY9A 1LOQA 3O07A 2H8XA 3SIZA 1NF7A 4DO6A 3PSWA 1EB3A 5I3IA 4UFHA 3DFOA 4DO5A 2PC4A 2Y70A 4O53A 1ME8A 2E77A 1TJRA 3TSMA 3O6CA 4Y6GA 3S42A 1FWWA 4NJJA 3LHTA 1RD5A 3PUDA 1ME9A 2FQIA 2X2GA 3CC1A 1YXDA 3KXQA 3LTSA 4JS3A 1FDYA 1QR7A 5D37A 5EA9A 3LHWA 3Q37A 4CLMA 1S3HA 1PL9A 4HKPA 4ORIA 2B7OA 1IIHA 5D03A 4TU1A 1LRNA 1TO3A 2GOUA 4IJBA 1AW1A 3ATYA 3I68A 7TIMA 1GEQA 4M19A 2C19A 2VFGA 1HTIA 2ABBA 1EX5A 3P67A 3QYQA 3LTPA 3M5VA 3LCFA 2V82A 2J9XA 1O4UA 2V81A 3TQ0A 3BPWA 4RZ5A 2QKFA 3AO0A 4UXDA 5D2VA 4Y96A 2YZRA 3YPIA 4EWND 3GDTA 3LRLA 3W7DA 3VCRA 3QZEA 1NFBA 1EEPA 5F1UA 5HNRA 4WXZA 1KM1A 4ONVA 2WV8A 3UNDA 1ZCOA 3OEXA 4EVZA 3LOTA 4ZMGA 5G2WA 4K8EA 4O4WA 1GG1A 3LCHA 3LGEA 4OQVA 5BW6A 4WQ6A 3HJZA 3C2RA 4JTIA 4Z1AA 4XTDA 1QAPA 2QCNA 3S0CA 2V8ZA 3WK0A 3IVUA 3P5ZA 4JIPA 2TPSA 1GWJA 4R53A 1Q3NA 4DBEA 3P5YA 2DZSA 2B7PA 1WA3A 1I8JA 1H5YA 4NXSA 3WK2A 3TQVA 2I9EA 4UFKA 4Z1DA 3QPYA 3GR7A 5K9CA 4ZQNA 4JY9A 1AW5A 3F4NA 4OV9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OCQ A;  1TTJ A;  3BLK A;  3BSG A;  4CCE A;  3IGU A;  2HIS A;  1XSI A;  1MZR A;  3H24 A;  1BG4 A;  4R34 A;  1EFZ A;  2DH3 A;  2R14 A;  4MB5 A;  1CXL A;  1XLE A;  4H7Z A;  2PDH A;  5BMW A;  1LG1 A;  3S3G A;  1NOF A;  2C0H A;  1GOX A;  3SAZ A;  3W27 A;  4ZOE A;  4Z0S A;  4NQ1 A;  3ZVH A;  3H2E A;  3EDK A;  2J9Y A;  4CD8 A;  2PLC A;  2PPG A;  3WQF A;  4JTL A;  3WNL A;  4GX8 A;  3SRK A;  4O50 A;  4MAD A;  4YWS A;  1ZQ5 A;  3E0I A;  4GBD A;  2NLY A;  3G22 A;  3GHR A;  1S1P A;  3QQ1 A;  5I3F A;  3WLM A;  1MI3 A;  3HG5 A;  3IS4 A;  4UTL A;  3G1D A;  2OU4 A;  1XX1 A;  1W31 A;  3RLG A;  3QV8 A;  5D05 A;  4S3A A;  2G95 A;  4DI9 A;  3VNZ A;  4M7S A;  4ZO7 A;  3MMT A;  4NUW A;  4ORM A;  2INZ A;  1UC4 A;  1JAE A;  1VFF A;  1TZ7 A;  4OBS A;  3PJU A;  4U4M A;  1VS1 A;  3UG5 A;  4TO8 A;  1U22 A;  2PTX A;  1E55 A;  4ZFC A;  5JMU A;  2Q09 A;  3CV7 A;  1MMF A;  1Y0E A;  1XIM A;  1PTA A;  3N25 A;  4PMD A;  1JXJ A;  2PEV A;  5GJM A;  1W3H A;  2JGQ A;  3TTQ A;  4O15 A;  3H6O A;  4EPE C;  2GGI A;  1A0D A;  3EWY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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