2RGLA

Rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
471
structure length
471
Chain Sequence
WLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Structural Insights into Rice BGlu1 beta-Glucosidase Oligosaccharide Hydrolysis and Transglycosylation
pubmed doi rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 196
structure length 471
sequence length 471
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2rglA00
1JD7A 1CBGA 2D0HA 3ZSTA 1D3CA 3POCA 3AS0A 2WKGA 1W3HA 5E0FA 2J77A 3WELA 1QHZA 4PMOA 2Z1SA 1KGXA 3WD3A 3QOKA 1NWUA 3AIEA 3ECQA 2CBIA 1H4PA 2VL4A 2V38A 1QW9A 3NDYA 4A3HA 4ATDA 1VENA 1ZBVA 4GI9A 1C8QA 4HMDA 3CHEA 4AEEA 3WFZA 1XH2A 1C90A 2CBJA 4DUXA 4E4PA 4CGTA 2XWDA 4DM2A 1XC6A 4CVUA 4FLSA 3U57A 2BHZA 1BPLB 2ZXDA 4K68A 3EYPA 4FLQA 1IZKA 1B9ZA 4F9DA 1AVAA 4D72A 1B2YA 3CTTA 1UWIA 3NSMA 3D5HA 3G6LA 5AYIA 1SR0A 4M80A 4CD7A 2XTKA 3LPGA 5AC5A 3E1F1 1OCQA 1W1PA 4AD2A 1E56A 3T2QA 2ZX8A 2WB5A 3CIVA 4M81A 4TVDA 2PWHA 3L4TA 1E6ZA 1UUQA 1V0NA 4OOUA 1TFVA 6A3HA 2WLZA 4UFMA 1WDRA 1CXEA 2PC8A 3OZOA 4U31A 4J3TA 4D6CA 4JHZA 5A6JA 2VCBA 3ZIZA 1G1YA 2VRJA 1D7FA 1VB9A 2EPOA 2XVPA 1ODUA 3N04A 2DDXA 3WNNA 1EOMA 4AXNA 1UHVA 3LPPA 5ABEA 3WDHA 1VF8A 4DM1A 2XM1A 1PIFA 2WCGA 1D2KA 3SUSA 3BAYA 2Y8VA 1V03A 2WMKA 3SUVA 1WZKA 4HOWA 3M6DA 3VU2A 3WH9A 4PMUA 1SYTA 1G5AA 3W29A 4HMEA 3F5LA 1HJVA 1WPCA 3ARSA 2RGLA 2WHMA 5A8PA 5EMYA 3WEZA 3BXWA 3S6TA 2ZUWA 4OOZA 1WO2A 4BF7A 1XYFA 1GOIA 1FHDA 3WF1A 2J8FA 1UD6A 2X05A 1AMYA 3RO8A 1BYCA 3TOPA 3I3BA 4JFVA 1Q6CA 3QOMA 2CERA 1I1WA 2VR5A 4U5KA 3CUFA 2VR4A 3LMYA 1JZ7A 4W87A 4X0VA 3AROA 5AYBA 3GXFA 7CGTA 3UG3A 1DEDA 3VDCA 2UY2A 4IUGA 1TVNA 4FF5A 3T09A 1JF6A 1HKIA 1XGZA 5DO8A 2G8ZA 1CGXA 3IJ8A 4QLLA 3T0AA 3CZGA 3N11A 1UR9A 3WQ6A 1IZJA 1WDSA 4UQBA 3WKZA 3CHDA 3NCOA 3VPLA 3WQVA 4PMDA 1V0MA 3OLDA 1RP9A 3AXXA 5GQBA 1H41A 2WVUA 3CHCA 3L4XA 3AFBA 1OINA 1U33A 3CGTA 3WMSA 3PZIA 5M03A 1DWHM 3A3HA 1KBKA 4W7VA 3O6AA 3OGRA 1OSEA 5A6BD 1HP4A 4UFLA 3RM8A 4UOQA 3W37A 4ZE4A 2YA1A 7TAAA 2UY3A 1UQYA 1TVPA 1UH4A 5CLWA 4DWSB 3RILA 3LPFA 5M5DA 5DEZA 3AHZA 4AWEA 3ZT7A 3VGGA 1XCXA 2IXVA 5DT5A 2CBVA 8A3HA 4UZSA 2YDRA 2C0HA 4TX8A 3FAWA 4URIA 1HX0A 3WMBA 4WKAA 2J25A 2CIPA 4AZ6A 3GNRA 4GI8A 2J62A 1H1NA 4BA0A 3F5JA 1J0IA 1OGSA 3L4WA 4DUVA 3VINA 1EIBA 1LWJA 1PZ3A 1UQZA 4TXEA 2AMGA 4EAMA 1E6QM 1P6WA 4AZ5A 1DWAM 1PX4A 1QPKA 1E1EA 4XZWA 1E4MM 3FW6A 2YBTA 5I0DA 1B3VA 4JCLA 4BQ2A 1VAHA 2WVVA 2YL8A 4RE3A 1A3HA 2Y8KA 1FP8A 3M7SA 2DGAA 1E6SM 5ECUA 4HZ7A 5KEZA 3WENA 3VVGA 1Z32X 5A2CA 2XFRA 1W9DM 2XFFA 3LPOA 1SFSA 1MQPA 4AEFA 2ESCA 4AYSA 1CLXA 1GOWA 2DSKA 1VFFA 3GBDA 4LXFA 5BXTA 3AZSA 3VDAA 5BXRA 2XGBA 4NRSA 1QNRA 1V3HA 4UFIA 5IHRA 4QCEA 3WDJA 3HU7A 1VRXA 2GUYA 2D0FA 4PEEA 4JFWA 1BQCA 1W9UA 4M82A 4GI6A 4HMCA 4IM4A 4YPJA 1BYAA 4UNIA 1CGUA 4JKLA 2PBGA 4OBSA 3KZSA 1BVNP 2TAAA 1NWTA 5E6ZA 3ZO9A 4W7UA 6CGTA 2WCSA 1WZLA 2CXGA 3NSNA 1M7XA 4AD5A 1O7AA 3K46A 5CQ1A 4CD6A 4NF7A 5BRQA 4EE9A 3IK2A 4FK9A 4JFSA 4MAZA 3L4VA 4PMYA 3FN9A 3SCRA 3PZMA 5GNXA 1L0PA 1ISVA 3WEMA 1E43A 2E9MA 4D6IA 2CKRA 1B0IA 2GFTA 4X9YA 5D9OA 3HN3A 2PWFA 1JFHA 3MS8A 2FGZA 3W26A 1GJWA 2XGIA 1DWIM 4LYPA 3CHFA 4WJXA 3VMNA 1CWYA 4Q7NA 4KGLA 5AC4A 4PTMA 1PX3A 4MPKA 4Y7EA 1PEZA 2FHCA 1H11A 2BXZA 1US2A 3PHAA 3VIKA 3CUJA 1UD4A 2OWCA 4ZXOA 1W1YA 1G94A 2FHFA 3K8MA 1GONA 3WN6A 4TOQA 3CZLA 2O9OA 3UESA 4R27A 3VTRA 2Y24A 1E4NA 3OZPA 4TX6A 2BHYA 3L4UA 3CUIA 3OLEA 1Q6FA 2AAAA 1BYBA 1G0CA 1I75A 4CD8A 1EDGA 3WUBA 1XD0A 4UOZA 3BC9A 3AQUA 2GJRA 2DT2A 1KWGA 5FKYA 1V3MA 4NZCA 4MNJA 1VIWA 2FH8A 2E8YA 2CHNA 1GQJA 3MANA 1JZ8A 1NP0A 2JIEA 4PSPA 3VNZA 1E6RA 1ISZA 2OYMA 1ZL1A 4AMCA 3AMCA 2EQDA 1FP9A 3ZM8A 1VFMA 2YJQA 4H04A 2NT0A 1HP5A 2BVDA 1MQRA 4UQDA 3CUGA 2E9BA 2JEPA 3BLKA 1V3IA 2WZIA 3TONA 1J10A 1O6IA 2PWGA 5CJ5A 4HA4A 1HT6A 2VNCA 2JEQA 1C7SA 1W9PA 2VZUA 3BSHA 4ACYA 5A2AA 5C8BB 3U5YA 1ODZA 3WF2A 1CGTA 4AIOA 3GH7A 3NDZA 4M24A 1UKOA 1UWQA 2ZUMA 4RE2A 2GK1B 4P7RA 2G3MA 2J7DA 1EQCA 3VIGA 1RP8A 3ZT5A 1KR0A 3WUFA 4CU7A 2O9TA 1V6UA 2ZUUA 3CZEA 4V2XA 3WQ5A 1XYZA 1PJ9A 4WKFA 4JFUA 5DF0A 3AOFA 1GJUA 1RD6A 4QDMA 1W32A 4C7FA 4P7LA 1HL8A 1VBRA 5A1AA 2WZHA 2O92A 2VUYA 2X0YA 2A3EA 1H5VA 1JNDA 3FAXA 4U3CA 3ZJKA 4LQ1A 1E4LA 3ZMRA 3SCTA 3WL1A 3VD3A 1UZ4A 1HJXA 1OIMA 1BF2A 1XRVA 3KE0A 4PMVA 3AIUA 2Z1KA 1XCWA 1FH7A 2ZOXA 5FCZA 3GZAA 1ITCA 3KL5A 1UG6A 3ARRA 2WC7A 1BTCA 1GOQA 5D8WA 1GOMA 3WQ4A 3EBVA 2AOSA 3N17A 4DWSA 5CPQA 1KFWA 2XVGA 5HNNA 4HZ8A 2EO7A 1MFUA 1JI2A 3AJ7A 4TTUA 2E9LA 3TTQA 3THDA 4ZXLA 1QNQA 4UFJA 1XV8A 4P7QA 1CNVA 3MMWA 3GDBA 2WHKA 2PF0A 1J0JA 2XFYA 1EO7A 3B9DA 2QF8A 4J7RA 5CLTA 5A3HA 1E5JA 1TCMA 1FH9A 3RCNA 4BS0A 1XHGA 4U2YA 1MQQA 1UWUA 1E15A 3IJ7A 4Z2KA 2UWFA 3ZJ6A 1QI5A 4KRUA 2D3NA 3SEPA 1V6XA 4WIWA 2PI6A 3WD2A 5ABFB 2WWCA 1NM9A 3NSXA 2BY2A 1RH9A 1V0KA 2VQTA 4A3YA 3RIKA 2DSVA 3W28A 3OIHA 3VX1A 3ARZA 1GCYA 2YLLA 1XSJA 2W67A 3EMCA 3GNPA 3OA5A 1ZJAA 1PBGA 1E3ZA 1CXHA 4W8LA 2OSXA 2YKKA 4E8CA 4CKQA 3OBAA 2DT0A 1MXDA 3I3EA 1CGVA 1TMQA 1UD8A 4WSKA 5LA2A 4QCFA 1QI4A 3ZT6A 3OB8A 4J3XA 2WM0A 3RPMA 1OGBA 2QLYA 4JHOA 1C3FA 3DYOA 3U7BA 1UD5A 3AZTA 1EHNA 2ZX5A 4OBRA 1PX8A 4PN2A 2QMJA 2D3LA 1NARA 2V5DA 3WFLA 3W81A 3W24A 1EQPA 2WK2A 2IXUA 2WSKA 2DSWA 3DHPA 1VBUA 4KWUA 3ARQA 3W6LA 4KRTA 4KGJA 3GXDA 1LL7A 2O9RA 1HF6A 1L8NA 3CMJA 1GNXA 4Q22A 1LL6A 1ISXA 3SIMA 3BLPX 3PZVA 1FA2A 2NSXA 1HXJA 2WZEA 3WUGA 3BAXA 4D1JA 4W84A 3SCQA 5LYRA 3WBAA 1HJUA 2J4GA 3VIIA 3FY1A 3BCDA 3T0DA 2EJ1A 1RPKA 9CGTA 2BXYA 2DSZA 3AS3A 3CH9A 1YQ2A 1OB0A 3ARXA 1VEOA 1V0LA 1MWOA 2QPSA 4GO8A 1JYNA 2YL6A 1QI0A 2E8ZA 5DMYA 3PZNA 2EXOA 2XG9A 2BS9A 1W2PA 4B9ZA 4D6GA 4F66A 2Q8XA 4H8UA 3VD5A 3T2OA 4IPLA 4RE4A 3TTYA 1Q6GA 4BZYA 2DH2A 2F2HA 1KXQA 4W88A 1E73M 2YDQA 3KWXA 5EFFA 4LGXA 4X0NA 3GXMA 4M29A 4CVWA 4OKDA 4H41A 4OUEA 1CENA 5GNYA 4U2ZA 2ZE0A 1EHAA 4E8DA 2GVYA 4ZENA 1WAWA 1ISYA 4UCFA 5I77A 2DT1A 4CUCA 2CNCA 4PTVA 2J79A 1DTUA 1GOOA 4F9JA 4MNMA 2CITA 4P7NA 1JYXA 2UY4A 1ZU8A 1F4HA 3VMPA 5CSYA 3T2PA 1GHSA 5EB8A 1E55A 4QFUA 5I5RA 1KQYA 2E4TA 4B3KA 1WB0A 1CYGA 4CN1A 1LG2A 2PB1A 5BXSA 1W3LA 2VVSA 4LYRA 5A8QA 5E0CA 5A6LA 2XUCA 1ZBCA 3ZR5A 3AIQA 4TTGA 4C7DA 1DWJM 3B9EA 2IUZA 1MYRA 4AD1A 2WANA 1KQZA 1B3XA 1GZJA 2VURA 2W5FA 1OM0A 2DSUA 1US3A 4XB3A 2RGMA 3VD9A 1E1FA 2E0PA 1C92A 1BVZA 2FH6A 4UQCA 4S3JA 2VCAA 2OSYA 1H49A 2G3NA 1BGAA 4GPNA 2J47A 1A47A 1ZS2A 1U2YA 5A69A 2XVLA 1KXTA 4GIAA 3BAIA 3MO4A 5E09A 3MMUA 3AIVA 2VMFA 2XIIA 4D6HA 2ZX7A 3M46A 4MJ4A 4WF7A 4TVCA 1CXLA 5HPCA 2GK1A 1DP0A 1BG9A 3KL0A 1E6PA 2YL9A 1UD2A 3AIBA 3FNDA 4IISA 1W2VA 2NT1A 3WQWA 3SCUA 3GH4A 1HVQA 4JFTA 1B31A 5ABGA 5A8OA 3AMKA 1JZ4A 1TA3A 3QHOA 4Z2JA 3VGHA 1KWKA 1K9TA 5A6AA 3EMQA 1J18A 1WKYA 1IT0A 1C8XA 3VILA 1Y7VA 2J75A 4AIEA 1J0YA 4QP0A 1C8YA 1ZBWA 6TAAA 1KBBA 3GXIA 2DEPA 2FHBA 3EDFA 1B3ZA 3ARTA 4PTWA 1R85A 1V02E 4AZBA 1VJZA 2XPKA 4JL2A 1C93A 2VX4A 1KR1A 1KCLA 3VKKA 3DC0A 3VD4A 4PMQA 1K9EA 3U7VA 2G3IA 3UCQA 1CGYA 4M1RA 1MW2A 4HTYA 4ATLA 1JD9A 3K4AA 2VOTA 3VIJA 3TP4A 1B90A 3T0BA 3KEHA 1FFQA 4UZUA 3EDKA 1EDTA 4QLJA 2QMKA 5LA0A 1Q6DA 2J7BA 3AICA 3EDDA 1CGWA 2XYLA 1FH8A 1R87A 3GH5A 1WDQA 3NIYA 3AHVA 2A3AA 3CZKA 3UERA 3ZQ9A 1UR0A 2WHLA 1UA7A 3PZQA 1E71M 4W85A 1JNEA 4XUYA 2PWDA 4JIEA 3VIHA 1H0GA 5A8MA 2CHOA 3ZOAA 1QVBA 2VZVA 1QNPA 3FXYA 4AY1A 2D23A 2XVNA 1E6XM 5I78A 4HA1A 3DHUA 3UETA 4EK7A 3EDEA 8CGTA 1X6LA 3W6MA 1LL4A 3RM4A 3VUPA 2WKLA 5CXPA 1UR1A 5ABFA 5D9PA 4H8VA 1EOKA 1TUXA 4GZJA 4W89A 3RMEA 1Q4NX 5EBAA 3GNOA 3VIOA 1KXHA 1BYDA 4GQRA 4P8UA 4GZEA 4WLCA 2YIHA 1NH6A 5A6KA 4P8XA 5I3DA 1LF1A 2V3GA 2HISA 3A4XA 5C71A 3NUKA 5I2UA 1CXIA 4WK9A 4GQQA 1AQ0A 4TUFA 1GOKA 4HZ6A 4GXPA 2OWXA 3JUGA 4OJYA 4CCCA 2X09A 3QR3A 1LJYA 1UZ1A 2VT0A 1MW0A 3F5KA 5DFAA 4TVUA 1WZMA 1R86A 5HBFA 2WMGA 1K9FA 4LX4A 4CN6A 5HPOA 3WSUA 4NI3A 1G01A 5I23A 3WD0A 3WF3A 1HN1A 4JCMA 3SUUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JD7 A;  1CBG A;  2D0H A;  3ZST A;  1D3C A;  3POC A;  3AS0 A;  2WKG A;  1W3H A;  5E0F A;  2J77 A;  3WEL A;  1QHZ A;  4PMO A;  2Z1S A;  1KGX A;  3WD3 A;  3QOK A;  1NWU A;  3AIE A;  3ECQ A;  2CBI A;  1H4P A;  2VL4 A;  2V38 A;  1QW9 A;  3NDY A;  4A3H A;  4ATD A;  1VEN A;  1ZBV A;  4GI9 A;  1C8Q A;  4HMD A;  3CHE A;  4AEE A;  3WFZ A;  1XH2 A;  1C90 A;  2CBJ A;  4DUX A;  4E4P A;  4CGT A;  2XWD A;  4DM2 A;  1XC6 A;  4CVU A;  4FLS A;  3U57 A;  2BHZ A;  1BPL B;  2ZXD A;  4K68 A;  3EYP A;  4FLQ A;  1IZK A;  1B9Z A;  4F9D A;  1AVA A;  4D72 A;  1B2Y A;  3CTT A;  1UWI A;  3NSM A;  3D5H A;  3G6L A;  5AYI A;  1SR0 A;  4M80 A;  4CD7 A;  2XTK A;  3LPG A;  5AC5 A;  3E1F 1;  1OCQ A;  1W1P A;  4AD2 A;  1E56 A;  3T2Q A;  2ZX8 A;  2WB5 A;  3CIV A;  4M81 A;  4TVD A;  2PWH A;  3L4T A;  1E6Z A;  1UUQ A;  1V0N A;  4OOU A;  1TFV A;  6A3H A;  2WLZ A;  4UFM A;  1WDR A;  1CXE A;  2PC8 A;  3OZO A;  4U31 A;  4J3T A;  4D6C A;  4JHZ A;  5A6J A;  2VCB A;  3ZIZ A;  1G1Y A;  2VRJ A;  1D7F A;  1VB9 A;  2EPO A;  2XVP A;  1ODU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1JD7 A;  1CBG A;  2D0H A;  3ZST A;  1D3C A;  3POC A;  3AS0 A;  2WKG A;  1W3H A;  5E0F A;  2J77 A;  3WEL A;  1QHZ A;  4PMO A;  2Z1S A;  1KGX A;  3WD3 A;  3QOK A;  1NWU A;  3AIE A;  3ECQ A;  2CBI A;  1H4P A;  2VL4 A;  2V38 A;  1QW9 A;  3NDY A;  4A3H A;  4ATD A;  1VEN A;  1ZBV A;  4GI9 A;  1C8Q A;  4HMD A;  3CHE A;  4AEE A;  3WFZ A;  1XH2 A;  1C90 A;  2CBJ A;  4DUX A;  4E4P A;  4CGT A;  2XWD A;  4DM2 A;  1XC6 A;  4CVU A;  4FLS A;  3U57 A;  2BHZ A;  1BPL B;  2ZXD A;  4K68 A;  3EYP A;  4FLQ A;  1IZK A;  1B9Z A;  4F9D A;  1AVA A;  4D72 A;  1B2Y A;  3CTT A;  1UWI A;  3NSM A;  3D5H A;  3G6L A;  5AYI A;  1SR0 A;  4M80 A;  4CD7 A;  2XTK A;  3LPG A;  5AC5 A;  3E1F 1;  1OCQ A;  1W1P A;  4AD2 A;  1E56 A;  3T2Q A;  2ZX8 A;  2WB5 A;  3CIV A;  4M81 A;  4TVD A;  2PWH A;  3L4T A;  1E6Z A;  1UUQ A;  1V0N A;  4OOU A;  1TFV A;  6A3H A;  2WLZ A;  4UFM A;  1WDR A;  1CXE A;  2PC8 A;  3OZO A;  4U31 A;  4J3T A;  4D6C A;  4JHZ A;  5A6J A;  2VCB A;  3ZIZ A;  1G1Y A;  2VRJ A;  1D7F A;  1VB9 A;  2EPO A;  2XVP A;  1ODU A; 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