2UWFA

Crystal structure of family 10 xylanase from bacillus halodurans
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
356
structure length
356
Chain Sequence
NQPFAWQVASLSERYQEQFDIGAAVEPYQLEGRQAQILKHHYNSLVAENAMKPVSLQPREGEWNWEGADKIVEFARKHNMELRFHTLVWHSQVPEWFFIDENGNRMVDETDPEKRKANKQLLLERMENHIKTVVERYKDDVTSWDVVNEVIDDDGGLRESEWYQITGTDYIKVAFETARKYGGEEAKLYINDYNTEVPSKRDDLYNLVKDLLEQGVPIDGVGHQSHIQIGWPSIEDTRASFEKFTSLGLDNQVTELDMSLYGWPPTGAYTSYDDIPEELFQAQADRYDQLFELYEELSATISSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNNGVGVDAPFVFDHNYRVKPAYWRIIDHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Alkaline Active Xylanase: Insights Into Mechanisms of High Ph Catalytic Adaptation
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus halodurans
molecule keywords ALKALINE ACTIVE ENDOXYLANASE
total genus 135
structure length 356
sequence length 356
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2007-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2uwfA00
3VNZA 5JBDA 1MFUA 1E4IA 2ZIDA 3RILA 1SMAA 2NW0A 2J7GA 2VR4A 3AYRA 2CITA 2DIJA 2XM2A 1W2VA 1OB0A 1TMQA 3MU7A 3ZT6A 2ZXAA 1GJUA 1HKKA 2DT0A 3ZSTA 4J3VA 3EDKA 4W8LA 4A3YA 1WZMA 2GK1A 1PX4A 1DEDA 5E70A 3WD1A 2WM0A 1QHPA 1CDGA 1C8YA 1EHNA 4IPLA 4GZEA 1JXKA 3MS8A 3VGBA 3CO4A 1LG1A 3UEQA 3L4XA 1V0LA 1X6NA 1DTUA 4C7DA 2D1ZA 4J3WA 3AROA 4LGXA 1KR0A 1ODUA 1JL8A 1ODZA 3MV01 1QI0A 3UG5A 5GPRA 4D72A 5M17A 1EOKA 2FGLA 1W1YA 3WUFA 1DWAM 3MV11 1QHZA 3S6TA 1JD9A 4MTVA 3CUFA 1QNOA 2WMJA 4Y7EA 1HIZA 2BV9A 2WBGA 1EOMA 3W25A 1W9PA 2WPGA 5CPSA 1ZJAA 4P8VA 1KWGA 5A8OA 1VIWA 3SCTA 1DP0A 5CPTA 4PTWA 3TTOA 1WKYA 4MDPA 3MMDA 2YA2A 2UWFA 1H41A 2J62A 4B9YA 5BXSA 1UD8A 3A4WA 4AZGA 5A6SA 3UETA 1LL6A 3T0BA 4BA0A 1CXIA 2CBUA 4D1IA 1HJVA 1H2JA 3BAXA 3WFZA 5A3HA 1FP9A 3LPGA 4XZBA 2JFEX 4CD4A 1W1PA 2V3GA 1IZJA 1J0IA 2FHFA 1LQ0A 4OZOA 1W9VA 4H8UA 1ISVA 5IFTA 1CPUA 3WN6A 3KL0A 2QMJA 4E2OA 5LA0A 1K9EA 3CH9A 4B3LA 3AHXA 2WLZA 5A94A 3K4DA 1QBBA 5BCAA 3W4RA 2NSXA 4F8XA 3N15A 1H09A 1KXHA 5DO8A 4CU8A 3AXXA 4MNJA 2WB5A 5E0CA 2WZHA 1HN1A 3UG3A 4OBSA 4LPCA 4XV0A 3ARYA 3WNMA 3FHAA 1RH9A 1SFSA 2YA0A 3OLEA 3T09A 1VEOA 3II1A 1I1XA 1CECA 1E40A 1V03A 1CBGA 2XIBA 3VIHA 2B31A 1PX8A 1VFMA 4Z2HA 4GO9A 3CIVA 1J0JA 2YJQA 3VTRA 3WNKA 2EJ1A 1WDPA 3OLIA 3QGVA 1EGZA 1D2KA 5GQBA 5IXEA 2NT0A 3BSHA 4Z2LA 3O2LA 1FFRA 1C8XA 3BGAA 1XH2A 2GK1B 1GVYA 2NT1A 3WEMA 1E1FA 4HMEA 3IJ8A 1ZU8A 4BQ3A 4MPKA 5HBFA 1W3HA 3ARRA 5A2AA 1VEMA 3WF0A 3VMPA 4Q22A 3NYDA 2Y2WA 3VIIA 2XGIA 2WC4A 1HKJA 2WNWA 5TD4A 2WVTA 2J47A 1E6RA 3OBAA 1KQZA 4JFUA 4UR9A 4NF7A 2E9BA 1BGGA 1XSJA 3CTTA 4W7WA 2OWXA 2GSJA 5JBFA 1J11A 1NM9A 2OSXA 3POCA 5C8BB 3IJ7A 3RIKA 4TXEA 1E71M 1US3A 4PN2A 3VIFA 2IXUA 4JL2A 3WSUA 1H0GA 1B9ZA 2GFTA 4L4OA 3W6LA 2J77A 4KGLA 4PMOA 3VIMA 3WH5A 3N12A 3WEOA 1ISXA 1X1NA 6TAAA 1HKMA 2ESCA 3AHZA 3UR8A 4MDOA 2Z1KA 3G6LA 2A3EA 5EMYA 5A69A 2EO7A 2D0HA 2WMFA 4PMYA 4GQRA 2DPEA 1C7SA 1UZ4A 4MNLA 4H8HA 1CWYA 4AZBA 3WIJA 1MYRA 5D9NA 1LL7A 2EEXA 4PMRA 3DYMA 2XIIA 3K8LA 1H1NA 1WZLA 2PWGA 3GDBA 3TONA 4MAZA 5D9OA 4CU6A 1X6LA 2CPUA 3T0DA 1MW3A 1TVNA 2WCGA 5E09A 1EO7A 4H7VA 2DT2A 2OYMA 4AD5A 1KQYA 3S2CA 5IDIA 2CKRA 2JALA 3KEHA 1V6VA 2J74A 1LLOA 1W32A 1DWJM 1Y7VA 2ZXBA 4EKJA 4FLOA 1WE5A 5M3WA 2IUZA 1UD2A 3UERA 2TAAA 4U5IA 4J3TA 3WQ8A 2EBNA 2XTKA 1JZ7A 2VURA 3K1DA 2ZUNA 2W66A 2DH3A 3D3AA 1NARA 3MUZ1 3WD3A 3W38A 1EH9A 1UKQA 3VIPA 1B2YA 1AVAA 1E6NA 4ZE5A 2X8RA 1IV8A 2D3NA 2WVSA 2A3HA 4R5EA 1UWRA 1EO5A 2AAAA 5CSUA 3QHNA 3F5KA 1J0HA 1XH1A 2WC3A 5E6ZA 4P8WA 3AIEA 2XGBA 5DEZA 1HVQA 1ZJBA 1CZ1A 2X0YA 2HVMA 4D6FA 3GNRA 3L4YA 4OIFA 3MUY1 1HXJA 3ALFA 1SYTA 3SUUA 2D23A 3VM7A 1NP2A 2BY1A 1CXHA 2X09A 4PTVA 1PBGA 1BGAA 3TTQA 1FOBA 1YQ2A 4HOXA 1W9XA 3W82A 1LWJA 2BFGA 3GH7A 3N11A 2Y8VA 3PTQA 2E8ZA 1R86A 1KXQA 1LF1A 2OSWA 3GXIA 1H5VA 2G3NA 4N42A 5ABFB 3DC0A 1QW9A 1Q4NX 3AS1A 2WLYA 1PIFA 4WLCA 3AOFA 5I78A 4WKAA 5HOSA 2VJXA 3EBVA 4IM4A 1PJ9A 1JYXA 4P7OA 5CJ5A 1E4MM 3SUSA 3J7HA 1KXVA 2GVYA 3MSDA 2RGLA 3GBEA 3W26A 3WD4A 4EE9A 3SCVA 3B9EA 2YL5A 1B3YA 4UCFA 2Z1SA 1QBAA 1E72M 1IT0A 2YA1A 3CHFA 5D8ZA 3U5UA 4KH2A 2ZWZA 1E4NA 4M80A 1NOFA 1TR1A 4RE2A 1JZ8A 1MFVA 3VD9A 1JZ4A 1G01A 1EXPA 1UR8A 4MB5A 4J3SA 3TTYA 1KGXA 4J7RA 5IHSA 2CHNA 5A2BA 1OD8A 3FY1A 1JAEA 1NOWA 1PX3A 2WKGA 1E6SM 3VGHA 2V5DA 5AY7A 1HP5A 1UR4A 2VZTA 4HPGA 2ZUTA 2X05A 1QNRA 2C0HA 4MB3A 1N82A 1HJWA 4P7LA 2Y5EA 3NSNA 3PZIA 3ARXA 2DQXA 3T2OA 4D6HA 4P7NA 1SMDA 1XD1A 2FH6A 4JIEA 4HZ8A 3W27A 2F61A 3K8MA 1CXKA 1TVPA 5BXTA 3CHEA 1JFXA 5DT5A 1XYZA 3CZKA 3WUBA 1XRVA 1V3MA 1WDQA 1CGTA 4QLJA 2UY3A 3FW6A 2J78A 1PIGA 3D5HA 4AEEA 4M82A 5I2UA 4NI3A 3WDPP 1KGWA 3AMDA 3BC9A 3AMCA 1AQHA 3SEPA 4UOQA 1K6AA 2ZX5A 3CUGA 1E56A 3EMCA 2OYKA 3SCWA 3ZT5A 1DWIM 3OG2A 3EDJA 2X2YA 5AYIA 3VDHA 3BLKA 2YDRA 1J0YA 5GNYA 1UWTA 2VZUA 4UFIA 1ISYA 2EPMX 1JZ2A 4AY1A 2YOCA 1AMYA 5A6LA 3AMGA 1FH8A 5ECUA 5LA1A 3RM8A 1QVBA 1M7XA 3RDKA 1HJSA 3LPFA 2YBUA 4RE3A 1KXTA 3ZT7A 1GONA 1V6XA 2OWWA 2V3FA 5HPCA 1UKPA 2XVPA 2Y4SA 4TOQA 3KL3A 1KFWA 3ALGA 1TG7A 2FGZA 1TA3B 1UQZA 1KGUA 2MANA 1BYDA 1GOQA 3B8SA 4ATDA 2DDXA 2ZUVA 1NWSA 4LYRA 4UNIA 2VZOA 2ZXDA 1AQ0A 1H11A 1E5NA 4TVUA 1XYFA 3POHA 5CLWA 3AIQA 2ZUMA 3WMSA 1QI5A 4Z2KA 3VINA 5CZKA 2E40A 2XWEA 1L0PA 1V0NA 2JIWA 1VENA 5BROA 3MUAA 1L8NA 5DFAA 3WBEA 4URIA 4M8UA 3W0KA 3G6MA 4GI8A 3HJEA 1HT6A 5IFPA 3GBDA 4M24A 5E0FA 1JAKA 3F5JA 5D4YA 4PMUA 1R7AA 3CZJA 1I75A 2EPKX 1B0IA 3DYOA 5EFFA 3AFBA 3RJXA 3WDQA 5BRPA 2V38A 4MADA 1UR2A 1E1EA 1R87A 1VEPA 3T0AA 4M1RA 4PYSA 3IK2A 4BQ2A 4F66A 1VB9A 5KEZA 3GTNA 2ZUSA 3VDBA 4JZ5A 1C7TA 3QOMA 3OLDA 3KE0A 2DSKA 1BF2A 4XB3A 2QF8A 2VQUA 1B3XA 1UWIA 3AZRA 4UZSA 4ZXLA 1V0KA 1E6XM 4TTUA 3M07A 5FL1A 1RP8A 3RJYA 1ZBWA 4UZUA 4B3KA 1U2YA 3F4VA 1OGSA 4Z2GA 4YHEA 1B30A 4P8XA 2J75A 4V28A 4CCEA 3UCQA 2VI0A 1C8QA 4PTMA 2DH2A 1E4LA 3RM9A 1GNXA 1XCXA 3GM8A 3ZOAA 3WH7A 1KBBA 3BXWA 3ZIZA 4D6CA 2VVSA 4U3AA 4EK7A 3WQVA 3BMWA 2V3DA 1D7FA 2A3AA 3TA9A 2BS9A 1V3LA 1TFVA 1YHTA 4ACZA 4U31A 1E5JA 5D9MA 2VO5A 1BG9A 4J28A 1MQRA 2JF6A 1UD5A 5LYRA 1LL4A 4PMNA 3A4AA 3HU7A 3RM4A 1ZBVA 3AS2A 1E55A 4MJ2A 3WNLA 3AHYA 3WFLA 1QHOA 3PZTA 4ZE4A 2VTFA 5ABGA 3WL1A 3SURA 5CGTA 2DEPA 1U30A 1CXFA 2XHYA 3GYCA 8CGTA 2X0HA 1JDDA 1XSIA 2G3JA 1U33A 4AZ6A 1QW8A 1UUQA 1OBAA 4GKLA 1GCYA 2E9MA 4PBGA 1BYCA 1GQKA 4PTXA 3NSMA 3GZAA 1MW2A 4F79A 2ZWYA 3ARVA 2BY2A 4AZIA 4AIOA 2J7FA 3WH8A 2QLYA 3OZOA 1J01A 3ZR5A 2ZX8A 4JFVA 1BYBA 5I6SA 1MQPA 1WO2A 2ZUWA 1NWRA 1JNDA 5BXRA 3UG4A 3ZSSA 3AIVA 4W7VA 3PZGA 2WAGA 3VGFA 3MMWA 3AJ7A 1QI4A 4AD4A 2GJXA 3WBAA 1WP6A 1F4AA 4UFLA 3WKZA 5A8NA 2XJ7A 3OB8A 2VUYA 1GHRA 1UH4A 1C91A 4AISA 2BHUA 4JFSA 2W62A 5F7UA 1ZB5A 1A3HA 1BFNA 1CNVA 4U2YA 4JCMA 2PWEA 1PZ2A 3BH4A 4AZ7A 3FAWA 4E8CA 1FHLA 3PZMA 1Q6EA 2JIEA 1JF5A 1TUXA 2EPOA 3WL0A 2WMIB 3PZNA 4NRSA 1MQQA 1V02E 2VX6A 1A47A 1UD6A 3N13A 1WDSA 1GUVA 1QI3A 2XFFA 3N17A 3OA5A 4MAVA 4XX6A 1LJYA 3OZPA 4OUEA 4KRTA 4CN6A 1V0MA 1UQYA 4U33A 2DT3A 1W1TA 1JZ6A 3SCNA 2VC9A 1E0VA 1GOWA 3NIYA 4V2XA 2E4TA 5ABFA 4HZ7A 2YKKA 4ZXOA 4JCLA 4PRWA 4ATLA 1WAWA 3CMGA 3ZJ6A 1G0CA 3N1AA 1G5AA 2RGMA 5I24A 2GJPA 2E8YA 3W53A 1B3WA 2VMFA 2J7EA 4ACZB 1W91A 3VGDA 4CVUA 2A3BA 2ZX6A 2WCSA 3FHQA 5CGMA 3CZEA 2WBKA 4NRRA 3B9AA 4LYQA 4AEFA 4R27A 3VIJA 1JYWA 2O9TA 3ARPA 1JI1A 4W87A 2QMKA 2OSYA 3IANA 2BNJA 3SCQA 4ZEPA 3RCNA 1UKSA 6A3HA 4FLRA 3U57A 3I3BA 4BZYA 3SCSA 2XSAA 4RL3A 5FKYA 2GDVA 4Q7NA 1ZBKA 1KBKA 3ZJKA 1E3ZA 1XC6A 4W89A 5CLTA 3MMUA 2ZX7A 3ZM8A 2J7HA 5D9PA 3VGGA 1VFUA 1BYAA 4MNKA 5CQ1A 3BLPX 7TAAA 3I3EA 4HA3A 1QI2A 1CXLA 2WZIA 4NSBA 4PMVA 2GDUA 3WDIA 4IISA 1B31A 1V6YA 3SCPA 1VBUA 3ARZA 3AYSA 4BCEA 1UA3A 5A95A 4H04A 1E73M 2DGAA 1G94A 3CUHA 1KR1A 5EB8A 4S3KA 2GJXB 3TTSA 4D6IA 4CCDA 4XUYA 1JI2A 3AIBA 3WF2A 1PZ3A 4U5KA 3ZMRA 5M5DA 3HMCA 1HJQA 2OWCA 1GPFA 3VOCA 3VX1A 5C71A 3U5YA 3VMOA 1PPIA 1OGGA 1EQPA 4UFHA 3F5LA 3AIRA 4LYPA 3AXHA 1XGZA 2G41A 1J9YA 5BYWA 2QPUA 3BAJA 2PWFA 3WQ6A 1E6QM 1GOOA 3AHVA 1VFFA 3BAYA 2XYLA 5E6YA 1GJWA 4U2ZA 4P7QA 2EXOA 1KCKA 1QOXA 1ECEA 4KMQA 5A8PA 2CKSA 4LXFA 2CYGA 1W9DM 2Y8KA 5JUVA 3CLWA 1QNSA 4M81A 1VAHA 4WKFA 2XUCA 4AC1X 2G4FA 5LA2A 5I23A 1E6ZA 1K9DA 4JHOA 1V3KA 3BCFA 1W3KA 2J7DA 4JKKA 5EBAA 1TA3A 4UQAA 5I0DA 1ESWA 5E9AA 4GXPA 5HNNA 4ML4A 4JFTA 3WELA 4UFJA 2C8NA 1ZBCA 2FHCA 3MANA 3T2QA 3UESA 1BPLB 4UQCA 3ZQ9A 5BWFA 3W37A 4HU8A 7A3HA 1BTCA 1JNEA 4GZIA 4AZ5A 1VF8A 3WENA 1W2PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VNZ A;  5JBD A;  1MFU A;  1E4I A;  2ZID A;  3RIL A;  1SMA A;  2NW0 A;  2J7G A;  2VR4 A;  3AYR A;  2CIT A;  2DIJ A;  2XM2 A;  1W2V A;  1OB0 A;  1TMQ A;  3MU7 A;  3ZT6 A;  2ZXA A;  1GJU A;  1HKK A;  2DT0 A;  3ZST A;  4J3V A;  3EDK A;  4W8L A;  4A3Y A;  1WZM A;  2GK1 A;  1PX4 A;  1DED A;  5E70 A;  3WD1 A;  2WM0 A;  1QHP A;  1CDG A;  1C8Y A;  1EHN A;  4IPL A;  4GZE A;  1JXK A;  3MS8 A;  3VGB A;  3CO4 A;  1LG1 A;  3UEQ A;  3L4X A;  1V0L A;  1X6N A;  1DTU A;  4C7D A;  2D1Z A;  4J3W A;  3ARO A;  4LGX A;  1KR0 A;  1ODU A;  1JL8 A;  1ODZ A;  3MV0 1;  1QI0 A;  3UG5 A;  5GPR A;  4D72 A;  5M17 A;  1EOK A;  2FGL A;  1W1Y A;  3WUF A;  1DWA M;  3MV1 1;  1QHZ A;  3S6T A;  1JD9 A;  4MTV A;  3CUF A;  1QNO A;  2WMJ A;  4Y7E A;  1HIZ A;  2BV9 A;  2WBG A;  1EOM A;  3W25 A;  1W9P A;  2WPG A;  5CPS A;  1ZJA A;  4P8V A;  1KWG A;  5A8O A;  1VIW A;  3SCT A;  1DP0 A;  5CPT A;  4PTW A;  3TTO A;  1WKY A;  4MDP A;  3MMD A;  2YA2 A;  2UWF A;  1H41 A;  2J62 A;  4B9Y A;  5BXS A;  1UD8 A;  3A4W A;  4AZG A;  5A6S A;  3UET A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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