2V2HA

The a178l mutation in the c-terminal hinge of the flexible loop-6 of triosephosphate isomerase (tim) induces a more closed conformation of this hinge region in dimeric and monomeric tim
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKSGSPDSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADALASLKDFGVNWIVLGHSERRWYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVLTPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Studies Show that the A178L Mutation in the C-Terminal Hinge of the Catalytic Loop-6 of Triosephosphate Isomerase (Tim) Induces a Closed-Like Conformation in Dimeric and Monomeric Tim.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Trypanosoma brucei brucei
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE GLYCOSOMAL
total genus 91
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2007-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2v2hA00
3G1AA 1NAL1 2GQAA 4BR1A 3E12A 4LW7A 3LRMA 1SFLA 2JKEA 3DI1A 1C8VA 3O16A 4NX0A 2H6RA 3ABOA 3OG3A 1AW2A 4OWGA 1XBYA 5D37A 1TRDA 5FESA 3B03A 1OYCA 3CEPA 5I3HA 5BW6A 3C56A 2Y7DA 4N02A 3G0SA 1T96A 3DFSA 1LYXA 3PG9A 2E09A 5CZSA 1H51A 4FHAA 1G4PA 4HNTA 4LVGA 3LRKA 4LV4A 2BTMA 1H1YA 4UTLA 4TU1A 3WJWA 4H4IA 1T0OA 2J27A 4IMFA 2YSWA 3TJXA 4GUIA 1H62A 2VXNA 2WNNA 3H54A 4ALDA 1K02A 2Y7EA 3I7SA 4QQ3A 1L6YA 4UTUA 5LNUA 3GXPA 5DCBA 3E9AA 2I9EA 3TW7A 1PCWA 1FWNA 1TTPA 4YWIA 4X9SA 2QR6A 4X3ZA 1TYGA 1FY6A 2D73A 4MYAA 5LNWA 3S1VA 1KFLA 3M6YA 1SO5A 3GR7A 3B06A 2WJZA 3FYPA 3SGZA 1LRQA 5HR6A 4ZQMA 5CZJA 5KZEA 4N4PA 4JTSA 4M7TA 1JRCA 3DI0A 2ZFAA 2DJLA 3N73A 3L21A 4PA8A 3C6CA 2ZRWA 3GKAA 3T4CA 1TV5A 3LM7A 3ZS4A 4YXGA 2CFFA 4DO5A 3MWAA 1KBIA 3F1QA 4OT7A 1GWJA 1I2NA 3SGUA 4NZJA 1LOQA 3OVRA 4M7SA 4BK9A 1OX4B 1PE1A 1P1XA 3KRZA 2WQPA 3W76A 1OFBA 3N14A 4Y96A 3NQAA 3PULA 3FIGA 4WOQA 3N2XA 2B4GA 3S1XA 3W1UA 3NQEA 2XN0A 4WUIA 3NYZA 4DBEA 3IIPA 3QF0A 4O1DA 5HWJA 2ZRYA 2EHHA 3QMRA 4NNCA 4AWUA 3P5YA 1OX5A 3NPWA 1TO3A 3ZWTA 1IGSA 3LRLA 4M6PA 2OT1A 4LRTA 3VNDA 3IIXA 2QCGA 4LVDA 3S9YA 3Q37A 5EMUA 1XXXA 2C13A 1GYNA 3NZ1A 3W7GA 2QCDA 3P62A 4UMBA 3IV3A 5HUPA 1VJIA 3LHUA 2BXVA 2G96A 1F74A 1IXQA 1A53A 1GT8A 1F76A 2H8XA 4YL2A 1K7XA 1VPXA 2QEZA 4BWLA 3HG3A 2I1OA 3BK0A 1LCOA 5DCEA 2QJGA 3LXBA 2TSYA 3NM1A 4O1CA 4R34A 3KRUA 3QSRA 5F1UA 3A21A 3W7QA 2RDWA 4YCOA 1ZFJA 1I2OA 3NDOA 1UJPA 4IWWA 2VC6A 2Y70A 1LBLA 4OV9A 3QQ1A 1D3HA 3NQGA 2WPBA 5H91A 2Y61A 2A7NA 1ME8A 2H3BA 3UZ5A 4AXKA 1GZGA 4UIOA 1R2RA 4N9DA 3C4UA 4UTHA 1F7BA 1T99A 5DXXA 3TUUA 1DV7A 3IGXA 4BFAA 3L68A 1P4CA 4GUHA 1FDZA 4KKXA 4MLRA 1EX5A 3W1LA 2QJIA 3W1MA 2E5CA 4DBDA 1V5XA 2VEMA 5HWNA 3MMTA 2NXIA 3CM4A 4D2JA 1LM1A 1XBVA 2P10A 1W3NA 1TQXA 3C2RA 1SW0A 3S1WA 2CLEA 3G1XA 1FCUA 3BV4A 1ZAJA 1Z44A 1W3TA 4FXRA 4OU1A 3ZFHA 5D2VA 4L4MA 2HMCA 5IM51 3T40A 1JCNA 3M41A 2V8ZA 2Y62A 4TMBA 3HOJA 2W0UA 4K39A 4H3DA 3T44A 2X16A 4RJEA 4HHPA 5AHNA 5LHEA 2Q3RA 5CZ0A 5D30A 3NGJA 2FFCA 2AQWA 3A5FA 2Z6IA 2AGKA 4ZQNA 1DVJA 3NQCA 3LCXA 1H7WA 3PS7A 1OF6A 3DAQA 5TIMA 4CCCA 4O4VA 1UCWA 4R33A 3E96A 1I2PA 1HO4A 1SFJA 2E6DA 1VR6A 3QPYA 3W2JA 2J9XA 4OHQA 5E0KA 1OFRA 4ZQRA 4I7VA 3IIVA 4NNBA 1W5OA 1I2RA 1EIXA 1A5AA 5DBTA 3TFCA 1NF7A 2DORA 5HWMA 1XC4A 3OBKA 4UR8A 2VEPA 1KM2A 3L2IA 4N6FA 2CZFA 4HSOA 4FX8A 2QCFA 3W1AA 1XCFA 1SR9A 4TO8A 3PUOA 1TPFA 4PH6A 5BMWA 4JTHA 4NX5A 4JR5A 3WFAA 5AYYA 1HG3A 3NQ7A 4JTFA 4MFEA 5LGXA 2GVLA 3PB0A 3G1YA 1DBTA 1KA9F 3QRHA 1YYAA 4WOZA 4LT9A 3WK1A 2FPTA 4NJHA 3W7CA 3UWWA 4MKNA 1VYRA 2C14A 5F2GA 3TQKA 2FB3A 1FCVA 1XM3A 2TPSA 1EWDA 1M7OA 3ZWSA 3M7WA 3L5LA 3MBDA 1GVSA 3TJLA 1N8FA 2YXGA 5A8GA 3UWZA 4LUJA 4XWUA 5K4ZA 4AEOA 4K8EA 3OA3A 3EWUA 2VFHA 3DGRA 1ICPA 5D38A 4DF0A 3P5ZA 2NV1A 1R30A 4JN6A 3G1DA 3QH2A 4IJBA 4O1BA 1XKYA 4ZQOA 3TMQA 1SUXA 3QW4B 2P1FA 3OHIA 4DO4A 4XKYA 1HTIA 4FIQA 4YMZA 4I9AA 4CQ8A 1TJPA 3GDKA 1QPQA 3CIXA 3I7QA 2VELA 4A29A 3B04A 1H63A 3OVPA 3FLUA 4IX2A 5FF7A 4QNWA 3P67A 3LGEA 1LOSA 1F6PA 1OYAA 5AHMA 3G8EA 4WZHA 2LLEA 1ME7A 1CX9A 5K3VA 5I3KA 1VC4A 4IMDA 2FLIA 1L6WA 1QWGA 2QDGA 1X1ZA 5BRBA 2DZXA 1EUAA 2R94A 2RDTA 1H7OA 1EWEA 3M5VA 1H7XA 3S42A 1DJNA 4N9EA 4FNUA 4QAIA 3GDRA 1U5JA 2JGYA 2X1RA 3HB9A 1IXOA 1TSIA 3HQ1A 4P2VA 3FOKA 4PCFA 3FFSA 4IOTA 3P60A 4RZ6A 5F2MA 1SW7A 2CLMA 5CKSA 2CW6A 4JTUA 2PRMA 3G8RA 4FF7A 5E93A 3KOFA 4KWWA 3F4WA 3WJZA 3NQ6A 2X1SA 1TB3A 4IXXA 4PTNA 2NUXA 3WJSA 3W85A 3CU2A 4JXCA 3TMLA 1QOQA 3UZJA 4OE7A 2WO5A 2PC4A 2DZWA 1L9WA 1S5WA 1AK5A 3QEZA 4RZ4A 1KM4A 2OX1A 4QITA 4TR9A 3WJYA 1LRNA 5I3GA 4FNRA 4GNJA 1KM6A 2RH9A 5LNVA 1IXNA 4RK8A 3TIMA 2GJLA 3EXRA 3PM6A 1TPWA 3OEXA 3I68A 1R2TA 3G18A 3EX4A 2RHGA 2QDHA 2E6FA 2PE4A 3NQ2A 1TCDA 2TMDA 1YLVA 2E6AA 4BWLC 3TH6A 1WOBA 1VHCA 4E0CA 1QNVA 4TX9A 2VFIA 2R91A 3M5XA 5CPOA 4UUIA 1RQHA 3O6DA 4FX6M 3TFXA 2QAPA 3M43A 3BG5A 1OG0A 5D2YA 1WX0A 4Q33A 3NA8A 4QIUA 1ZAHA 3BPWA 4WXYA 5D02A 4R53A 3VFLA 2C16A 1TPB1 4XQ6A 3CHVA 3USBA 3UWVA 4O50A 4NXSA 4O18A 1QO2A 4A2SA 1GVRA 4MY8A 1GG0A 1YXCA 5C54A 3P8IA 2R8WA 3NQFA 4MYXA 3R12A 3M44A 1I2QA 3RNDA 5AB3A 3SI9A 4NJIA 2JBMA 3PY2A 3WK3A 1VQTA 3B0PA 1RVGA 1M7PA 4IMCA 3E49A 4JYDA 4PC8A 5FF2A 4N4QA 4HNVA 3L66A 3MI2A 4NT0A 1P0KA 1KM1A 3BLIA 3UWYA 2ZZ1A 5CG7A 4Y6GA 4E2BA 4CNPA 1VYPX 4GUJA 1KTCA 3W22A 1W56A 2E68A 4O54A 1KLYA 4FNTA 3H53A 5HQEA 3PG8A 4IPJA 5AC7A 1W5NA 3L9CA 1FCBA 5D2TA 2A6LA 3B8DA 3W2UA 3WK0A 3HG5A 4BI6A 1LDCA 3LLFA 4HN4A 1B4EA 4ADTA 3DENA 2NWSA 4S2BA 3WJXA 4O10A 1FBAA 3W1RA 1G67A 3T7VA 1QCWA 2BSLA 1EA0A 1GJPA 3MP4A 2ZDRA 3LTYA 2C18A 1Q45A 3EXSA 4GWEA 3G22A 4G1KA 5MHBA 1A50A 5EPDA 5F1VA 1YDOA 1LRTA 4QISA 5C2XA 1GYLA 1CI1A 4XZ9A 2A85A 1SW3A 3DFNA 4PEKA 4AWSA 4GUGA 1AL7A 1Q6OA 3W7KA 3G1SA 1LBMA 2BWGA 2JK2A 3C2EA 1LOLA 1Z48A 3U6WA 3UY7A 2Y6ZA 1XDLA 2PRLA 1SO4A 2ZTKA 3PR2A 5DELA 3N9SA 3THAA 3W86A 1YADA 3W87A 1OFDA 3C52A 3W2NA 4CQ9A 2QKFA 4AHQA 4MOZA 3S0CA 3PBUA 3THQA 3QMTA 4UFLA 2ZRZA 4UCGA 3NXFA 5HULA 3UD6A 3PF3A 5C5YA 3VE9A 2VFFA 2JKPA 1H5YA 4ONVA 1KV8A 4RCXA 1YDVA 3STCA 1A5SA 4LVBA 3B05A 3C3NA 3O15A 5HUOA 1SPQA 2J9ZA 1KV5A 3LHZA 2B7QA 4LY8A 1VS1A 3SZ8A 4MIMA 3W1NA 3LCHA 2ZRVA 3UY8A 2ATSA 4IUOA 4NZFA 4WY0A 4DELA 2YYTA 3KVJA 3LCWA 4M19A 1P0NA 3KX6A 3JR2A 3A9IA 1EUNA 3O05A 4WJEA 3KAOA 1GVQA 4K36A 4NQ1A 4O16A 3IVTA 3GKFA 4GBUA 4UTMA 3BG3A 3W3OA 2TRSA 5AYZA 1MEWA 3NPUA 4O8RA 4UTWA 4HPJA 3VCRA 1JUBA 2YDAA 3W1PA 1TTIA 3IGUA 4JIPA 4LUIA 1D3GA 5DN1A 1BEUA 5J5DA 3UXAA 5AYXA 5T26A 3R89A 3L67A 3FJ6A 4TMCA 4O52A 3G3DA 4HPXA 2KZHA 5U4NA 1LLZA 3NEVA 4MUZA 2C0AA 4LVFA 3GIYA 2YW3A 2QF7A 2V0TA 4JTIA 5I3IA 5FEPA 4C1LA 2VKZG 3M47A 1X6UA 4FB7A 3NVTA 3HGSA 4JY9A 2W79A 1WBHA 1H7PA 1NEYA 2CLOA 1ONRA 2C19A 5L9FA 1K8YA 3IEBA 3EEGA 3LCFA 3NL2A 3I6RA 3HBLA 2DZVA 3NM3A 3TSMA 4HT3A 3M0ZA 4O15A 5AC6A 3GNNA 1ZHAA 4EOUA 3TROA 4DQWA 4Y9AA 2E5DA 2J24A 3GAKA 1MO0A 1RQEA 4CQAA 3LTPA 4Y8FA 3GXNA 2QUTA 5DY3A 4O11A 4U28A 1TPC1 1XUUA 4O12A 4JDYA 1F05A 2Y88A 3CB8A 4AHPA 1YPFA 2A7PA 4FX7A 3TKFA 3EWBX 3TAOA 2B7OA 1JCXA 1FWTA 3A23A 3W70A 1F6KA 1QFEA 3PC0A 3HPZA 1G4TA 5D03A 4A3UA 3TU9A 1U83A 2V9DA 5CZTA 1NFBA 1CW2A 1R47A 3TDFA 3GDTA 3DFQA 4JTTA 5K9XA 5LHFA 3P84A 1VLIA 1EEPA 3W72A 3L5MA 3G0XA 4LC6A 2OJPA 1QOPA 3RLUA 1EB3A 2ALDA 2O7SA 1H7NA 1OJXA 2E6YA 5K9DA 2YCEA 1XBZA 4CLMA 1GVFA 3QC3A 4Q4KA 4MY1A 4FO4A 4JS3A 1VCVA 2FTPA 3ANYA 3MYPA 5EKYA 4MFDA 4AB4A 2F84A 3W9ZA 3NQVA 1K8XA 3G3MA 2YPIA 3BW4A 1PS9A 4ORIA 4AH7A 2FIQA 3LDVA 1FDYA 4TIMA 3UPBA 2RDUA 3W6YA 5EA9A 1AMKA 1L2UA 3T78A 3B4UA 2DZTA 4K38A 2YR1A 2PCQA 3HJZA 4LVAA 1VGAA 2NX1A 4Q32A 4EIVA 4ZQCA 1DL3A 3FKKA 4UTKA 1PIIA 2RFGA 2GPTA 5CPNA 1X1OA 3TXZA 4DF1A 1ICQA 2H8ZA 3P82A 1O95A 3S5ZA 1SZEA 3QPZA 3EXTA 4AHOA 2ZCGA 3NL3A 1BTMA 1KFEA 3O63A 1EP2A 1KFKA 5LNRA 2W6RA 1I45A 5LNSA 1DORA 4XTIA 4OV4A 4DEFA 3O6YX 3N9RA 3W7OA 2QCDB 4NU7A 1G6CA 2V82A 3DFOA 4LC8A 4E38A 3M16A 3GR8A 4UFJA 4UFMA 2HTMA 3QQ0A 3PWAA 2ZA2A 1O5XA 3I7RA 1O5KA 3CIWA 1QMLA 3MP3A 2YGYA 4ORMA 3NQ8A 3SY5A 2QUVA 4ML9A 4HIBA 4AF0A 3Q2DA 3C8FA 1A5BA 5G1YA 2DZPA 1S5TA 3PSVA 3V75A 2NX9A 1SSGA 3W7JA 2CLKA 3MHGA 4Y90A 5DCDA 1W0MA 3OVQA 2CLIA 4JICA 4IX0A 1FDJA 3E0IA 3EWYA 1F2JA 2P0OA 5G2WA 2JGQA 5L6UA 1MSSA 5LZLA 2DZUA 3W7EA 2YFOA 5BOOA 1D9EA 1QPRA 3NL6A 2HS6A 4FNSA 1TPDA 4JDBA 3EWWA 2NV2A 1ZAIA 1LLWA 4O53A 3QMSA 1JUEA 2VOMA 1FCQA 3STEA 2VFGA 2ATMA 3HPSA 5D32A 4IMGA 3PSWA 1YTKA 4KFOA 4JTLA 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 3TAK A;  1B3O A;  2YYU A;  1TIM A;  3NNT A;  4O17 A;  2CLH A;  4O13 A;  5KIN A;  1FQ0 A;  5K4X A;  3FEM A;  1ALD A;  4O14 A;  1JRB A;  3A5V A;  2GQ9 A;  4RXG A;  3VKJ A;  3DHD A;  3UPW A;  3OIX A;  4WY0 F;  1QPN A;  3W71 A;  3GAY A;  1K3U A;  1F5Z A;  2QCE A;  3SSJ A;  3W1T A;  1KW1 A;  5AHE A;  3ELF A;  2ZRU A;  2C15 A;  2HSA A;  2ABB A;  1W5Q A;  4RKA A;  4RR4 A;  5J5R A;  1OX6 A;  2QJH A;  2ZZ6 A;  2NZL A;  5CPM A;  1WV2 A;  3P80 A;  4AWT A;  4N2Y A;  3DFT A;  2VEN A;  1FXP A;  3QFE A;  3S6D A;  3TV8 A;  2CLF A;  3IIO A;  1WYI A;  3NR0 A;  3O1N A;  3AJX A;  3GND A;  4Z0J A;  5HR7 A;  2A21 A;  4UNL A;  4E2D A;  4GXM A;  1LRO A;  4L4L A;  3LCL A;  4MZY A;  2BLE A;  4JYF A;  1FWS A;  3IRD A;  5CSR A;  1GTE A;  1J4E A;  3P8J A;  2GVJ A;  1OHL A;  2A6N A;  5TQL A;  3B0U X;  3QJA A;  5AOU A;  5U7S A;  5G1T A;  3A22 A;  3GDL A;  5E1Q A;  4K6A A;  5DY2 A;  3KVL A;  2OMA A;  2A7R A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZVH A;  2I16 A;  2PDM A;  4LUY A;  4A8R A;  1M03 A;  1QHP A;  4BR1 A;  3LRM A;  4YTU A;  2JKE A;  1R3V A;  4PUW A;  1DP0 A;  1V0M A;  1CEC A;  3W81 A;  5FD0 A;  5FES A;  1P0D A;  4LJ3 A;  4Y2W A;  4ATL A;  4XSM A;  4H9T A;  4WJX A;  3G0S A;  3AIC A;  3DFS A;  3PG9 A;  4O1E A;  4HHH A;  4YVV A;  1G4P A;  4HNT A;  4LVG A;  4LV4 A;  1ADD A;  4UTL A;  1WP6 A;  4H4I A;  4UNI A;  3MCN A;  2ON3 A;  4IMF A;  3KP0 A;  3TJX A;  4GUI A;  4J3W A;  2WNN A;  1K02 A;  4MWA E;  1L6Y A;  1E73 M;  4WVX A;  5DCB A;  3GQY A;  3TW7 A;  1PCW A;  1FWN A;  4XK2 A;  1BHG A;  2QUM A;  4X3Z A;  2PD5 A;  3CAS A;  3OP2 A;  2OYM A;  1J0Y A;  3B06 A;  3FYP A;  1WDS A;  4HCD A;  3SGZ A;  1LRQ A;  5HR6 A;  4ZQM A;  2WK2 A;  5KZE A;  3S2M A;  3QN3 A;  4AIU A;  5JUV A;  4QJ4 B;  3BQ5 A;  5A6M A;  3N73 A;  3PNU A;  4DXK A;  3C6C A;  2ZRW A;  3T4C A;  4DM2 A;  3ZS4 A;  1URO A;  2PEV A;  1YDY A;  3WLR A;  5LIW X;  2BVW A;  3MWA A;  3F1Q A;  3KOX A;  3ARZ A;  1ISZ A;  1OFB A;  2QGY A;  4Y96 A;  3NQA A;  3EOE A;  2WAG A;  3WEM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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