2WSRA

Monotim mutant rmm0-1, monomeric form.
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVAPRFVMIAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADGLASLKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQETHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Isomerase
molecule keywords TRIOSE PHOSPHATE ISOMERASE, GLYCOSOMAL
publication title Space Group Transition Driven by Temperature and Related to Monomer-Dimer Transition in Solution: The Case of Monomeric Tim of Trypanosoma Brucei Brucei
rcsb
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 96
structure length 242
sequence length 242
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2009-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2wsrA00
3CEUA 4O57A 5C54A 4HPJA 4O1AA 1JQVA 6ALDA 4Z1BA 2A7PA 4XKYA 4BR1A 3W2KA 2Y89A 5DBUA 3LCWA 3HG5A 3IVSA 3P67A 3SGZA 2V82A 5CGQA 4LW7A 2J9YA 1GYLA 3R8RA 5HQEA 1F74A 3B06A 2QCHA 3SFKA 1D3GA 5KMYA 1DL3A 1G67A 1KFCA 1VPXA 5FI8A 4LRSA 1UCWA 1I2NA 3G8RA 5F2MA 2EHHA 4KFPA 3S5NA 2ZZ1A 3MHUA 4NJIA 4AWUA 3MHFA 1H7RA 4UXDA 1PL9A 1WA3A 4YCPA 1IXNA 4N2YA 3CPRA 3UNDA 1TPWA 2ZA1A 1PS9A 5FF4A 1L6SA 5DCBA 3L66A 1AMKA 2HS8A 3CTLA 1R47A 1A50A 5E1QA 3P84A 3GXNA 3M9YA 2NX9A 4UTKA 3OVRA 1O5XA 3KVJA 2GOUA 2Y7DA 3QW4B 4IGHA 3O6CA 4M19A 5EL1A 4O0ZA 1BEUA 3NL5A 2J24A 3QC3A 4MJMA 2Y7FA 4LVFA 4JTKA 2V2HA 3DKLA 3M5XA 3TAKA 3W1AA 5D33A 3GDKA 5LGXA 3TQVA 2QDGA 3T44A 5EYWA 1QPNA 2GJLA 1MO0A 2CLKA 4CQAA 3EWWA 1TYGA 3C6CA 3KOFA 5LGZA 1R2TA 1WAUA 5K9XA 5AC6A 3EKZA 3LM7A 5HWNA 2J88A 1SZFA 2JKPA 3LCGA 5CZTA 5CG7A 5KZEA 3HF3A 4FNQA 1I8JA 1TPC1 2QUUA 4RZ6A 1FQ0A 1OFRA 2F84A 2CLLA 2Q8LA 2QEZA 4Q32A 1W8SA 4RZ5A 4ONVA 4LUJA 1I2OA 1I2QA 3CC1A 4NX5A 4M5PA 4O1DA 2Y85A 3W1UA 1KV8A 3DHFA 1SPQA 3HGOA 3LTSA 2YSWA 2RDWA 4N9BA 4O15A 1R2SA 1KFKA 1FDJA 5CSSA 3G0SA 1T99A 4JYEA 3HO8A 3BLIA 3IIPA 2C6QA 5BOOA 1I2RA 2V30A 4X3ZA 3N9SA 1GT8A 1F2JA 5I3JA 1XM3A 2DORA 3GDTA 4DF2A 1VCVA 5J5RA 3ANYA 4GUFA 3DH7A 2OT0A 3NPUA 5FESA 3DFOA 3UXDA 3HPZA 3LHWA 1OX5A 2H90A 2H8ZA 2FLIA 1B3OA 1B57A 1JCYA 3O1NA 3P5YA 2RDUA 3IV3A 1SFJA 8TIMA 1DVJA 1PCWA 5HULA 4WY0B 2RHGA 2CLFA 2QJIA 4JTGA 3W7PA 2NX1A 5AHMA 3KFTA 3U6WA 3DHDA 4JYFA 3TC7A 2V2DA 5BRBA 2JGYA 2A0NA 3W7JA 3VNDA 1GG0A 3G3DA 5D2WA 2CLMA 3ELFA 1HO1A 1DHPA 3W71A 1YXCA 4M6VA 1LRNA 1XXXA 3BGJA 3TSBA 3E02A 4LRTA 3WJXA 4LT9A 1WX0A 5D30A 1SW0A 2W0UA 4CNOA 3P8JA 1JCXA 1OX4B 2A5HA 2G95A 3N34A 4I9AA 5AFDA 4XZ9A 4UMCA 4JS3A 5MHBA 3DKJA 5F4WA 1EX5A 1WBJA 3HG2A 5AC8A 5F1UA 5TBOA 1L2UA 2CLEA 4PEKA 5D03A 4TO8A 2JGQA 1JJKA 1JVNA 2VEPA 4FX6M 1YTEA 4UTIA 1TCDA 1P0KA 3DBPA 5I3IA 4XKYB 3G1AA 5LHEA 1TPB1 4PA8A 5TIMA 3L9CA 3TMLA 3P61A 4FNUA 3C56A 1AL8A 2CLIA 1SO6A 1W5QA 5D2TA 3TK7A 4RCXA 2YW3A 4DPQA 2BZNA 2CZDA 2PRLA 3TSMA 1F6PA 1OFEA 3LI1A 3CU2A 3W1NA 1OVDA 3FS2A 1QCWA 1XDMA 4Z1CA 4O13A 5BW6A 5DELA 4CNPA 4R34A 5HWMA 3FA5A 1BWLA 4O11A 1GTHA 1TTJA 4LC8A 3GZ3A 3A9IA 1H50A 4EF8A 1YADA 2BSLA 4L4MA 2FB3A 2FPTA 1XBZA 2NWRA 1UASA 4FIRA 3PUEA 4HSNA 5LNUA 1XBYA 3CWNA 3G22A 3TSDA 3LCXA 2FDSA 1TIMA 1X1ZA 1JRCA 1A53A 2FTPA 3C2VA 4K39A 3EWZA 3LHVA 4ICNA 1ONRA 3KRUA 2IQTA 4RR4A 3C2RA 3O06A 1WOBA 1XL9A 1U5JA 1Z48A 3OHIA 1TJRA 2NXHA 2VEIA 3EX1A 4RXGA 4XWUA 3SI9A 1OFDA 4UR7A 4GRSA 4FB7A 4I7WA 1OFOA 1KBJA 2X16A 1HTIA 1QPRA 4I7VA 3LHTA 2CLOA 1X6UA 3S9YA 2HMCA 3S1WA 1W3IA 4JTIA 2V5BA 2QKFA 1VQTA 3NL2A 4JDBA 1P5BA 4H4IA 1F6KA 3NL6A 4FO4A 1S3HA 3FLUA 3G0UA 3G1HA 3P62A 1TJPA 4RLIA 2F7FA 3ZR4A 1EPXA 5HMSA 3LXAA 4UFLA 5IM51 5H91A 3GNDA 1H5YA 1O5KA 3L67A 4LVBA 2WJZA 4AHQA 1W37A 3DI1A 3RU6A 1EB3A 2Y70A 4FX8A 3NQEA 1BTMA 3LHYA 4WD0A 4QJ1A 2V81A 4WZHA 3C2FA 3W74A 5A5WA 1LP6A 1PVNA 2ZA3A 1V7YA 3O05A 4CCDA 4QIUA 3QPZA 5AHEA 4IOTA 3W2JA 5CPMA 3W7GA 3BG3A 5G4WA 2QCEA 4BK9A 4O4WA 2DU2A 3IVUA 1VHCA 3LHUA 1RQHA 3G1VA 2P10A 3G0XA 2DJXA 3UY8A 1GVFA 2NUWA 4CQ9A 3LERA 2DJLA 3IIXA 5IBXC 2D73A 1WDWA 1RQBA 3TE9A 3MUXA 4CQ8A 1I4NA 4LWWA 4UTWC 1VLIA 2QJHA 5CPNA 2WNQA 3TA6A 2NUXA 3M5YA 2WPBA 4IMCA 2QCDB 1DJNA 3FJLA 4M7SA 1H1YA 3MI3A 1A5AA 3NL3A 1FWRA 5J5DA 1ZY9A 4UTTA 4HSOA 4P2VA 4XUGA 3EXSA 3NQAA 4LV4A 3TCEA 1QDSA 1H7OA 4JEQA 3M1ZA 3W7IA 4LU0A 1KLZA 3NO5A 3ZS4A 4UTUA 2QUTA 4JTLA 3W7QA 3CEPA 1WQ5A 5HR7A 2TYSA 1Q6QA 5U7SA 2ZTJA 1GVRA 1J5TA 5KITA 1X7FA 3QQ1A 3W7EA 3V75A 4WXYA 3W1QA 4HNUA 3GB6A 4K36A 3A22A 3N3MA 3PC0A 4FHAA 4OU1A 3EWYA 4BI7A 1W0MA 1SSGA 3C2EA 3QMTA 1TTPA 7TIMA 1RV8A 2B7OA 3CB8A 2ZBTA 5K4XA 4PL2A 3MP4A 3MWAA 1V5XA 2Z6JA 3QW3A 1LM1A 2E6AA 1VLWA 1H1ZA 2W6RA 1SFLA 4GUGA 1ZJIA 1LDCA 4BF9A 1XUZA 4UFMA 3NVTA 3QRHA 5K9CA 2J9ZA 1DQWA 1IIGA 3NEVA 4OHQA 1I2PA 2X30A 3R13A 3W7RA 3QZEA 3GLCA 5E93A 1EEPA 5AYXA 1CW2A 3FJ6A 2OT1A 1R2RA 3LCLA 2NLIA 3SIZA 1FWNA 4OE7A 3STFA 2XFWA 3DU0A 1VZWA 3NNTA 2J6XA 4QNEA 1JRBA 3DI0A 4QM1A 5AHIA 3HQ1A 2C3ZA 2B7NA 4NXKA 3N2XA 2G97A 3DXIA 4FIQA 4Q4KA 3UWWA 4AWSA 3RF9A 1EWDA 1I45A 1LOLA 5C6MA 4Z0SA 2OMAA 4XTDA 1G4PA 2R14A 1G4SA 1QO5A 4PCFA 3M0ZA 3L65A 4I7UA 5CZ0A 2CZFA 1ZALA 1KA9F 4EF9A 3HPXA 2Q3OA 3TXVA 4DELA 3S1VA 4ZQCA 1OFPA 1GOXA 4K7VA 2WKJA 3QSRA 4TU1A 3B03A 3PAJA 4AHPA 3W2MA 4U28A 3S5ZA 2ISWA 4ZQOA 3T40A 3KRZA 5FEWA 3UWUA 3PS7A 5G5IA 1KW1A 4POCA 3ABSA 3DAQA 4OT7A 3UWYA 3LRMA 2NXIA 1WXJA 2NV2A 2GVJA 1OG0A 3LRKA 3MO7A 1Z42A 5DBTA 1GTEA 1T8XA 3ZWSA 3I68A 4ZVJA 3W73A 4MJZA 1GZGA 1QPQA 1W5OA 1W54A 3RMJA 3NQ8A 3GDLA 1VYSX 3RFAA 1AW2A 4BWLA 4RKAA 4MOZA 5EA9A 3LCFA 5TQLA 3PM6A 3STGA 4M6QA 3CLMA 1ADOA 4K8HA 2QCNA 4DQWA 1YXDA 1ZCOA 4JTSA 1XUUA 4ZQPA 1N55A 2GQ9A 1XKYA 4QNWA 3LLFA 2J27A 2JBMA 4BI6A 2XN2A 4AXKA 3TW6A 5F4SA 5HUOA 4DF0A 4FXSA 2EF9A 3LRLA 3HMJG 2VELA 2GUUA 4ZQNA 3PY2A 3W7KA 5DY3A 4NJKA 3L5MA 2QCGA 4A21A 3PBUA 4W9TA 1Y0EA 3WK1A 2QCCA 2V9DA 4UNKA 5LNSA 2EAWA 3NQGA 3PR2A 2E6DA 3OBKA 5EMUA 5K7JA 1FCVA 1IXQA 1LLZA 3DFPA 2Z0IA 1YXYA 2C14A 3FKRA 2A85A 2ZRXA 2QCLA 2AGKA 4WY0F 1YTKA 4R53A 4JTFA 3QMSA 4FF7A 3G8EA 2A7NA 5KZMA 1VCFA 3EB2A 3VCRA 3P81A 4TMCA 5I3KA 4XBKA 4DBEA 1C29A 5AHNA 4JX6A 4Z1AA 3RK8A 1O60A 3VE9A 1CX9A 1DBTA 1P0NA 1MEIA 4QSHA 3PG8A 4PC8A 3SGUA 3TFXA 3W70A 3VFLA 1LROA 2C16A 2ZTKA 1H7XA 3BW4A 5C55A 3LOTA 1VYPX 1K8ZA 3PF3A 4K38A 3SSJA 1GVQA 1OFQA 3TIMA 3OVQA 4WUIA 3PSVA 4BFAA 2E68A 1UUMA 2BX7A 3QYQA 5DY2A 5C2XA 3IGUA 1FWWA 1XCFA 3QH2A 1K7FA 1FDZA 1SO5A 2V5LA 1GG1A 3LV6A 3P7YA 3G1YA 4FNPA 2ALDA 1RZMA 2ABBA 2Q8ZA 3QFEA 3BLFA 3Q37A 3W7MA 4U4MA 1VHNA 1EWEA 4GJ1A 5AOUA 1KTNA 1W1ZA 2CFFA 4O53A 3TC6A 4L4LA 2FFCA 4GXMA 1W3TA 3L0KA 4ORMA 5ABTA 2E5DA 4K6AA 3KHJA 1C9DA 3PB0A 3TNOA 3S0CA 3U8GA 2FB2A 1G4EA 5FEZA 2Z1BA 3Q2DA 3NQFA 2A6NA 1IXOA 4PH6A 3MYPA 2QR6A 4UFHA 4O14A 3IGXA 4AEOA 4O12A 1HFBA 4OV9A 4GC4A 4LOCA 1KFBA 1IXPA 2VXNA 3LHZA 3B0PA 4JY9A 4O28A 1PCKA 4LUIA 5A8GA 4ZZ9A 1TRDA 1T0OA 1TPEA 2UV8G 4MVAA 4S2BA 3TDFA 1LTDA 2I14A 3K30A 4AVFA 3PG9A 2B4GA 5G1YA 1OX6A 1F7BA 2ATMA 3HOJA 5LNRA 2H6RA 1LBFA 2YX0A 4QAIA 3EWBX 3W72A 1JR1A 3NQCA 1W5PA 1N7KA 1TQXA 1W5MA 2ZZ4A 2B0MA 1E51A 3FFSA 3W9ZA 4O19A 2ZZ7A 4UFKA 2XN0A 4JN6A 3HG3A 3OA3A 4PFMA 3KXQA 1TV7A 1FXQA 2E6YA 1W5NA 1L6WA 4UMAA 1Q6RA 4QISA 3QPYA 2E77A 2EPHA 4XQ6A 1Q6LA 3I65A 3STCA 3UXAA 2PE4A 1IIHA 2XN1A 3S42A 3E9AA 1GYNA 4N9EA 4OV4A 4E2BA 4R33A 3TROA 1XBVA 4IPJA 1ALDA 3MW7A 4NVTA 4IQLA 1GQNA 3WJSA 4N9CA 4TR9A 4OBTA 4OWGA 5CZSA 3MI6A 1LBMA 1AW5A 4UMBA 2ABAA 4KFNA 1LOQA 2Y7GA 1QMLA 1KM6A 3AJXA 2Y88A 3IIOA 3NZRA 5CZJA 3C52A 1THFD 1LLWA 3ABQA 3E96A 3W3OA 5CKSA 1T96A 3NM3A 3ATYA 4MYAA 4ZQRA 2E1DA 1OF6A 2LLEA 4LS0A 1SR9A 4KWWA 3W75A 4LS2A 4Z1DA 2ZRYA 2CU0A 4IMDA 4O54A 1JUKA 3C0JA 4DO6A 4M6PA 1DKWA 2AAMA 1M5WA 1JULA 4JX5A 1OABA 2GPTA 3M47A 1A5SA 2QJGA 3C4UA 3W1LA 1GWJA 3W86A 1TPDA 5CSRA 2VFIA 4MYXA 4FX7A 1PE1A 3TQ0A 1KM3A 2ISSA 5LKYA 3DFQA 1M7PA 2FPYA 1OYBA 1L9WA 1DJQA 3CWOX 1LORA 4DO4A 1F5ZA 1MSSA 4ADSA 3L2IA 1VC4A 4MY8A 4N4PA 3CHVA 4AF0A 2BLEA 3OVPA 1TO3A 3IIVA 2A1YA 5EPDA 5D2VA 4JTTA 1S5TA 4X9SA 4NNBA 4PODA 1JQXA 1NFBA 2GVLA 3BW2A 3O8AA 3WK3A 4IJBA 3B04A 2OJPA 3NDOA 3PBWA 4RJEA 4MLRA 3D0CA 2E6FA 4FNTA 4MKNA 1KTBA 1QR7A 4ADTA 3C3NA 3TMQA 4UFJA 3O07A 3FKKA 1B4EA 2QAFA 3O15A 1FCBA 3H54A 3M6YA 2GJNA 3IIZA 1TREA 5FF2A 2TSYA 4RXFA 3MBDA 4HKPA 2NWSA 4HN4A 1MEWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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