2WSY | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	268
structure length	237
Chain Sequence	MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLIEKLKEYHAAPALQGGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPMLAELRSFVSAMKAASRA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Loop closure and intersubunit communication in tryptophan synthase. pubmed doi rcsb
molecule tags	Lyase
molecule keywords	TRYPTOPHAN SYNTHASE
total genus	79
structure length	237
sequence length	268
ec nomenclature	ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date	1998-02-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00290	Trp_syntA	Tryptophan synthase alpha chain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2wsyA00

3W7CA 1TJPA 3OBKA 4KWWA 3VI2A 2DZWA 3W1MA 3OG3A 1QOQA 2CLOA 3QQ0A 3S9YA 1U5JA 1GPWA 4ALDA 4GUFA 4Z0SA 3W7QA 1VQTA 4G1KA 1K02A 2FJKA 3F03K 3LHYA 1NF0A 3JS3A 1JCLA 4PTNA 3EXTA 3W7PA 1PCKA 1Q45A 1WOBA 1MEHA 2ZFAA 3G0SA 1G67A 3DKLA 3GR7A 2ZRVA 1H61A 5F2MA 1X8FA 5C2XA 3LI0A 3KHJA 4Y90A 2B0MA 3A5VA 1TTPA 4NNAA 2RDWA 3W76A 3AJXA 1GT8A 3CPRA 3GDTA 5LNWA 3I7QA 4A22A 3GXNA 1FDJA 4JX4A 2PRLA 3TAOA 1OYBA 3C56A 4UTJA 2DJXA 2ZA3A 3A24A 2Y7FA 2TRSA 1FWWA 4OV9A 4M6QA 4IWWA 2G97A 4K39A 4NVTA 3STFA 2VFDA 4JIQA 1F5ZA 3HB9A 3HMJG 2OMAA 1A5CA 1LROA 4R33A 3M7WA 4OT7A 4JTIA 1RV8A 1G4TA 5I3FA 1Y0EA 3H53A 1TPUA 3QW4B 3BG5A 2ISVA 3FKKA 4AHPA 4M7TA 2NZLA 1XBYA 1NFBA 4LS0A 2X1SA 3INPA 4ML9A 3WK2A 1H7XA 1K7XA 1GZGA 3C3NA 2ZZ5A 2RDUA 5HWMA 3L66A 1W5PA 2E6DA 1TYGA 3W84A 4XZ9A 3DKJA 1OF6A 5G1YA 4DQWA 3CB8A 1H7RA 3FKRA 1GG1A 5C54A 1W5NA 2E68A 4N4QA 3GNNA 3PS7A 3I7SA 4GE8A 3RK8A 2QJIA 1LYXA 1SZEA 3IGXA 1XKYA 5A5WA 1SFJA 3IIPA 1O5XA 2VC6A 4I7UA 3LRLA 2ABBA 4NNBA 1G6CA 4RXFA 2QR6A 3O16A 3LBCA 4UTKA 5D37A 5G2IA 3EEGA 1OABA 5AHIA 2VFIA 2ZYFA 2Q3OA 5L6UA 4LU0A 5KMYA 3E02A 3B8DA 2W6RA 2G5WA 2BTMA 4ZQPA 1NVMA 3MHFA 1LBFA 4ZQMA 2QCHA 4Q33A 3TQKA 3R12A 3HOJA 1JQXA 1RD5A 5FEZA 1CI1A 3NXFA 2C6QA 3NEVA 1KFKA 3M5YA 3NQVA 3CIWA 2Y63A 4B5NA 3L5MA 3A5FA 1THFD 3TA6A 3L5AA 2JKPA 2C19A 1LOSA 2FQIA 3I6RA 3OEXA 1W56A 3CC1A 3FEMA 2R8WA 3Q37A 4O0ZA 3UXDA 3W2NA 4NT0A 1QPQA 2ZRXA 2YYUA 5FF7A 3STCA 4Y6GA 4RKAA 2PRMA 3B03A 3MJYA 3WJSA 3EB2A 4LS1A 3HPZA 1O94A 5DELA 3HG3A 2QCDA 3T55A 1L6SA 3N3MA 1B9BA 3TW6A 5J5RA 3TU9A 1OYAA 1VRDA 1KM4A 4HSNA 3NPVA 3M47A 1ZFJA 5L9FA 4FIRA 4AMAA 1H63A 4K6AA 3KVJA 2YSWA 3DFSA 3PC0A 1JCMP 2R14A 1KTCA 4FNPA 1LLZA 1LOQA 4FXRA 1PHQA 4OE7A 3S5ZA 2XN0A 4UTWC 3QZEA 5BRBA 1A53A 1Q3NA 5EY5A 3C6CA 4HNVA 1S3HA 1TMHA 1F7BA 4YMZA 3LXCA 3E9AA 1X1OA 1IXQA 2V30A 3W1AA 1NF7A 3B04A 2CWNA 3G3MA 1QCWA 3W7DA 3BPWA 4GRSA 2BLEA 1TJRA 3PUEA 3UQNA 1XL9A 1AW5A 3EWBX 2J27A 4JTFA 5A8GA 3PULA 1UCWA 2I9EA 4CLMA 4AWSA 1ML1A 1KA9F 3H55A 1GYNA 1KFJA 1LBLA 1TSIA 1GOXA 1QMLA 4KFNA 4EF9A 4M5PA 4NQ1A 2V0TA 3O1NA 5J5DA 1RQHA 4TR9A 3IIXA 3G8EA 4JX5A 2HS8A 4HPXA 4ORIA 1KV5A 1P0KA 2E5CA 3T44A 3G1XA 3DXIA 3BGJA 3EXSA 1WX0A 4DBDA 4AB4A 4YCOA 1F73A 5BMWA 4O52A 2NX3A 5AC7A 2P1FA 4Q32A 2TYSA 5CGQA 4AH7A 3O15A 1HTIA 1JCJA 4YL2A 3LCGA 3EKLA 3LX9A 4LNYA 3P74A 4UC5A 4POCA 3AO0A 1QDSA 2V81A 4M19A 4MVAA 4DPQA 1QR7A 3KX6A 5IM51 2YW4A 1H1ZA 3ZWTA 3TJXA 5AHLA 4WUIA 3W1NA 3S5YA 3HG4A 4MUZA 1HL2A 4YCPA 4XTIA 4U28A 2I1OA 1GG0A 2ISSA 4IX2A 1LRQA 4BF9A 2ZTJA 5AFDA 4JY9A 3LHZA 1M6JA 2J24A 4GNJA 1F05A 3MO7A 4RR4A 4ZZ9A 4LT9A 1SO5A 3QPZA 1VPXA 2Z1BA 5SWUA 3W2KA 1KM0A 4WOQA 4Z1DA 1IXOA 4H4IA 4MZYA 3O63A 2DORA 5AHMA 3THQA 1VH7A 3P5ZA 4LY8A 4FNUA 4NUWA 2ATMA 2X1UA 2QDGA 1PV8A 2TPSA 3LLDA 3S5OA 3F4WA 3PB2A 1I2NA 4RV8A 5G1TA 5F4SA 4XKYA 3MBDA 3CQ0A 3IRDA 1UBSA 1G4SA 1S5WA 3RF9A 4K8EA 1DBTA 1D3GA 1SZGA 2Y89A 2VENA 3NAVA 1I45A 1OFDA 2ISWA 3S42A 5LHFA 4YWIA 1EX5A 1W54A 2ZZ6A 1N7KA 1KTBA 4AF0B 1DL3A 3LBMA 2DZXA 1JCYA 3QYQA 4UTWA 4K38A 4IOTA 3LHVA 4PH6A 3TMLA 2ZCGA 4EOUA 1FCVA 3MP4A 1DVJA 4KFOA 1SW3A 1S5VA 3NA8A 5K4XA 5G2HA 1ONRA 2E6YA 1VZWA 1KM6A 1VS1A 4BI6A 3GR8A 2OCZA 4L4MA 3E0IA 1OX5A 3SI9A 1EIXA 3TFXA 2YXGA 3W2UA 1SSDA 4OGZA 2C1HA 4MLRA 2H90A 3NG3A 4CQ9A 1WOAA 3DENA 1TB3A 4FNTA 4MFDA 3WK1A 3NQ7A 1YTKA 3P80A 3M41A 4J9JA 1OX6A 1EPXA 2HSAA 5IBXC 1KBIA 2Z2UA 3NPWA 3L2IA 3NPXA 1XDMA 3JRKA 3TV8A 3W87A 3U2OA 1DQXA 3FYOA 3NL3A 1L6WA 1ME9A 4N9CA 3QC3A 2CLIA 5I3KA 3UD6A 3M5VA 4ZVJA 2ZZ1A 4OHQA 4RK8A 3ABRA 4EF8A 3S6DA 1DJQA 4UTLA 2ZBTA 3BG3A 3ABQA 2H6RA 3LLFA 3LXAA 3SZ8A 1SO6A 1PVNA 5DBTA 1AW1A 3DI1A 2ABAA 5TBOA 1EP1A 5HJLA 3LERA 3TR2A 4AHOA 3L0GA 4O1CA 4ADSA 4XKYB 2KZHA 4PA8A 3CU2A 4O12A 3M5ZA 1H60A 2D73A 2VOMA 1E51A 4LW7A 3WK3A 3BVJA 3C0JA 1EP2A 1R30A 1TO3A 2YCEA 3HBLA 4S2BA 3VE9A 1AMKA 2JGYA 4BI7A 2WKJA 4O11A 1W1ZA 5KZDA 4O4VA 2QAFA 3PBYA 4O15A 2B7OA 3U6WA 2VFGA 3HF3A 1JJKA 5KITA 1GVOA 4ADTA 1I4NA 3LTSA 1ADOA 1W5QA 3ATYA 4O1BA 5LHEA 3C4UA 2CZDA 1VR6A 3DBPA 2XN1A 3PBWA 3IGUA 3LHUA 5U7SA 2QJGA 2QCCA 3PBUA 5AHEA 3P62A 4NXKA 3W22A 3HGJA 4ZL1A 4X2RA 2FLIA 3I65A 1BTMA 3G0XA 4MJMA 4UFKA 3TAKA 1H62A 1UJPA 5FEXA 1LDCA 3SGUA 1F76A 2RKXA 1K7EA 3OHIA 1IGSA 4XBKA 5FF3A 5F2LA 2JK2A 1LLWA 1LBMA 4JTSA 3BARA 5DCBA 1UUOA 3W74A 2GQ9A 3DHDA 1VHNA 3G1SA 3SSJA 4NJKA 2C14A 3W7HA 2C18A 2Y88A 2QCEA 4MZ1A 3MBFA 3LXBA 2UV8G 5LKYA 3LTPA 3LTYA 3UPBA 4IMCA 4UFLA 1EB3A 1Z44A 5D02A 4JN6A 1TREA 4N6FA 3MMTA 2G95A 2WQPA 4U4MA 4AXKA 2VELA 2QF7A 3DFPA 2EF9A 1IXNA 3QJAA 4FX7A 4TU1A 3CEPA 1OX4B 2V8ZA 3KVMA 5FEWA 4FX8A 2X1RA 2PE4A 3S1UA 3GXPA 3NQAA 3KRUA 5KINA 3GKAA 1D9EA 3KRZA 3NM1A 4Y96A 3M5XA 2B4GA 4IGHA 3LCIA 4KWVA 2A6NA 3T78A 1NSJA 2WOQA 3N9RA 4L4LA 1H51A 1Q6OA 1ICSA 3LCWA 5IBXA 2YFOA 3L68A 2O7SA 4JY8A 1QFEA 2X30A 1VHCA 1RQBA 1YXDA 5K2ZA 3WJXA 3G0UA 3M16A 1GYLA 1V5XA 2B7QA 4O0KA 1F74A 1K7FA 1MO0A 3SW6A 3WJYA 1R2SA 3PY2A 3BW2A 1LZOA 4LOCA 3HG5A 3FFSA 2Y61A 3MYPA 4LS2A 1ZY9A 2H8XA 2YZRA 3G8RA 2WV8A 4Z1AA 5LNSA 3GDKA 3QMTA 4O4WA 1YYAA 2ALDA 3SIZA 3PWAA 2YPIA 5AN7A 2A7RA 1SW7A 5K9XA 1SUXA 2QKFA 3EKZA 2NUYA 5AYZA 2OX1A 2WNZA 2C16A 2R94A 3GXTA 4NJJA 3IIOA 3CM4A 1MZHA 1N55A 4HNTA 5K4ZA 1T96A 4MY9A 4PC8A 4DBEA 2XFWA 1G4EA 4RCXA 1GVQA 3W85A 2WSYA 2WPBA 1QO2A 4ICNA 2PCQA 4WZHA 3M43A 1LRTA 2VXNA 1TPH1 4IMEA 3W1PA 1JVNA 1LOLA 2CU0A 1ME8A 4E2BA 1T0OA 1R46A 4NZJA 1KV8A 3KFTA 3PB0A 5D05A 4HKPA 4E0CA 4E2DA 1LRNA 4N9EA 5KTLA 3EX4A 2Q8LA 2Y7GA 1QAPA 2ATSA 1G7VA 2FB2A 3FJLA 4GUIA 5LGZA 1TPDA 2YYTA 4JEQA 3QQ1A 5CPNA 2J6XA 1EUAA 3IEBA 3QPYA 4ONVA 1DKWA 2GJLA 4N9DA 1TV8A 3OVRA 3O07A 3G1VA 4LVBA 3C52A 5K9DA 5G5IA 1IIGA 3W7JA 2JKAA 4A21A 1G7UA 4QITA 5KZMA 1VLWA 2CLKA 5EL1A 3N14A 3W7GA 3GDLA 4JICA 4FF7A 1DQWA 1O95A 3G18A 2B7PA 1YXYA 3KOFA 5FF2A 1WQ5A 1A50A 4RXGA 1YTEA 2DZVA 3MI6A 3W07A 1X1ZA 3NQCA 2CLMA 5CSSA 4NJHA 3OVPA 5DCDA 3C8FA 3W1RA 2J9YA 3DFTA 4UTUA 1JUKA 4LUIA 3YPIA 4WQ6A 4IQLA 1TTQA 5D2VA 2YW3A 1UASA 1SU5A 4Z1CA 2A0NA 4Z0JA 3GAKA 1BEUA 3CIXA 3EWUA 4UFJA 2ZRUA 1W5MA 5E93A 3LCHA 5EMUA 1YPFA 1KFBA 1GTEA 3O6YX 3B06A 3SY5A 3BGGA 1FCUA 3OIXA 5D30A 3UZ5A 4PL1A 1CW2A 4JTJA 3NR0A 1BWLA 3QRHA 2F84A 3NQ6A 1TQXA 1L9WA 4JS3A 3W71A 4GC4A 4QNWA 2VFFA 4MLJA 1PE1A 3M1ZA 3VKJA 5CZTA 2CZFA 3BW4A 4AHQA 3PR2A 3BLFA 2A7NA 5HUPA 3HPSA 4NX0A 1K3UA 3TJLA 1H7NA 5D2XA 3TMQA 4JGDA 1KM3A 2QCFA 3C2FA 4GBUA 1YDNA 3E12A 1R2RA 2O7QA 4K36A 3LCFA 4JTKA 5D32A 4LVDA 1T99A 1MEIA 2CLFA 1YDVA 4TIMA 2FB3A 3C2VA 4BR1A 5E0KA 5HUOA 3TK7A 2DP3A 3JR2A 2CFFA 5DY2A 3DH7A 2E09A 4AF0A 3NL6A 1ZAJA 2EPHA 3MYOA 5K9CA 3W1QA 1GWJA 1SO4A 1LORA 3TQ0A 2BXVA 3L9CA 5F2IA 4EWND 1F6KA 2QUTA 4N02A 3IIZA 4JX6A 1XUZA 4JYEA 3W3OA 3W6YA 3G1DA 5I3JA 4QSHA 2R91A 3GDRA 3CTLA 4DEFA 4XTDA 5AYXA 3BW3A 1TPC1 7TIMA 1WBHA 2JGQA 2V5LA 1VYRA 5FI8A 3T7VA 1TRDA 2GVJA 4GXMA 3B0UX 5C6MA 3HJZA 4UFMA 3LM7A 3B4UA 2X1TA 3PM6A 3NQFA 4PFMA 3UWUA 3GZ3A 4O1DA 5CZSA 3P5YA 1TV7A 4O54A 1C9DA 1OFOA 3N2XA 5T26A 2W0UA 2YX0A 3FA5A 5DCEA 2Y62A 4S1FA 3G1YA 4CCCA 3O6DA 1M7OA 2NWRA 4O13A 2YGYA 3PF3A 3A23A 2NX1A 4DF1A 1W3NA 1R47A 1H5YA 1ZJIA 4A2RA 2H3DA 3G24A 3HPXA 1RQEA 2V2HA 4OQVA 1KBJA 3DGRA 1IXPA 4P61A 4LVGA 3N34A 4NJIA 5LNUA 2C0AA 3IVTA 5D03A 3MWAA 1ZAHA 1XFBA 1XBXA 5AC8A 2NX9A 1SZNA 3UPWA 3V1PA 3QH2A 4JTLA 1DOSA 3SJ3A 4UTMA 2GVLA 5EA9A 3IVUA 3LI1A 4QIUA 4WJEA 3WK0A 1AK5A 4I7VA 4A2SA 3W7OA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2WSYA

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