2X1SA

Crystallographic binding studies with an engineered monomeric variant of triosephosphate isomerase
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
238
structure length
231
Chain Sequence
SKPQPIAAANSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADALASLKDFGVNWIVLGHSERRWYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLAGLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE, GLYCOSOMAL
publication title Crystallographic Binding Studies with an Engineered Monomeric Variant of Triosephosphate Isomerase
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 90
structure length 231
sequence length 238
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2010-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2x1sA00
1W5NA 2DZXA 3LHUA 3MYOA 2Y88A 4OWGA 3DHFA 1A53A 3GDMA 3IVTA 3JR2A 3NPVA 2E6FA 5D33A 1XDLA 4I9AA 3CU2A 2YX0A 5D2TA 1I4NA 1EA0A 1P5BA 3HGRA 1VJIA 3MW7A 1RD5A 4Y9AA 1FQ0A 1ZHAA 3ANYA 5LGXA 3JS3A 3GX9A 1EUAA 3L66A 3N14A 1QCWA 5ABTA 3STCA 5KMYA 3W1AA 1QR7A 1C9DA 5D2YA 1A5SA 2WNQA 3GAYA 4JTTA 3KVKA 3N34A 4LVAA 1JQXA 3P60A 3HMJG 2EAWA 2YDAA 3W22A 4KKXA 3MP5A 3IVSA 4NJHA 4E38A 3FFSA 5DN1A 3TSBA 2VOMA 1GT8A 1BTMA 1OABA 3A22A 3VI2A 3G8EA 5K4ZA 1SW3A 1X8FA 1JUEA 3DFOA 5L9FA 4MZ8A 3W1MA 3M9YA 1B4KA 2YGYA 2FPTA 1ME9A 2NX1A 1LDCA 2FQIA 2OMAA 4UTJA 3GNNA 4RJEA 3CPRA 1HFBA 3LTSA 2QDGA 3RNDA 4O1BA 1KV8A 3BW4A 1DJQA 1H51A 2FJKA 3S5ZA 3IGXA 4IPIA 5BW6A 3PF3A 1TPFA 2TMDA 3M7WA 1W31A 4UTTA 2V81A 1KFLA 2Z2UA 3NOEA 3C4UA 1GJPA 3H54A 3S42A 1XI3A 1BEUA 2HTMA 3TU9A 4ICNA 1NAL1 3KRZA 4Y6GA 1R47A 3QMTA 3BV4A 4WUIA 2RKXA 3NVTA 4LU0A 3TW7A 3IIPA 3EX2A 5G2HA 1AW2A 1YPIA 2A85A 3CIWA 1EWEA 3EWXA 1HUVA 1RR2A 1TTJA 2JBMA 3LI1A 3MHGA 2X1RA 4JIQA 3KRUA 1PL9A 5F2GA 1KM5A 4MZYA 4M6QA 4XZ9A 3M16A 3WK3A 4CQAA 1R2RA 3G1HA 3VE9A 2X1UA 3O63A 4U28A 1Z44A 2EKCA 3E02A 4MPQA 5HWMA 4UFKA 2GQ9A 3RMJA 2NZLA 1MXSA 2Q8LA 1WBHA 3OA3A 4O18A 1VCFA 3L5LA 4HT3A 1SO5A 1SQ7A 1TPC1 2B7PA 3C3NA 1K3UA 2PRHA 4N2YA 3N3MA 4QNWA 5FEZA 3O1NA 5HR7A 2YFOA 5FF4A 2E1DA 3SECA 1I2OA 4OV9A 3KX6A 1Q3NA 3ABRA 4WY0A 1ML1A 4O12A 4MY9A 4QAIA 3W7MA 4WY0B 4XTIA 2GPTA 2YCEA 3G0UA 1VC4A 2J9YA 1UUOA 3BVJA 1XL9A 4Y96A 3W7GA 4UNKA 3RK8A 3E0IA 2RHGA 1SSGA 2DZWA 3VE7A 1ZCOA 4JY9A 4A2RA 3GXPA 1EUNA 3LXAA 3GKAA 4M7TA 2WNZA 1TJPA 5DXYA 4JTFA 3G0XA 2FLIA 2ZZ5A 1ONRA 4AHPA 1Q6RA 3G3DA 3NPXA 2FB2A 3E96A 2DZUA 5MHBA 1OFBA 3M1ZA 2Q3RA 2VFGA 5K9CA 4H6KA 3NQAA 2ZA3A 5F1VA 2Y63A 4P61A 1LTDA 2A6NA 3C2EA 4MY1A 1XM3A 3NQEA 1NFBA 3HIJA 1LBMA 4O13A 3CQ0A 3MJYA 4CCDA 1MEIA 1PHWA 2QCGA 3EEGA 4Q32A 3TUUA 3TMQA 1O5KA 2ZZ4A 1MO0A 2GQAA 3U6WA 4HPXA 2WSRA 3KVJA 4Z1AA 4JDBA 1LROA 5L6UA 2E09A 4M19A 3PVFA 3B04A 4K8EA 3E49A 5F2LA 1R2TA 3OBKA 4PEKA 1YDOA 4A29A 3LHYA 4S2BA 4PCFA 1H7NA 5D2XA 4DXVA 5EL1A 4ORIA 2E6YA 2CLIA 2BXVA 1XKYA 1YTKA 2VEKA 5HNRA 2A2IA 3PS7A 3V75A 4RKAA 4RXFA 3NQMA 1G7UA 3DGRA 5CPOA 1TIMA 4RZ5A 5EBUA 1LORA 3P5ZA 2BSLA 2WOQA 3PBUA 4RK8A 2NV1A 4A3UA 1DBTA 2ATSA 3TMLA 3CT7A 4N6FA 5I3GA 1FDYA 3CEPA 3W2NA 1TV5A 4HNUA 3LRLA 4QITA 1ZAHA 1GOXA 1XBYA 4ZMGA 4QNEA 3O15A 4IMEA 4JTJA 4BR1A 1RV8A 2DZSA 3HGOA 3QFEA 4XQ6A 3AJXA 4QQ3A 4BF9A 1ZENA 3NQFA 5AHMA 4QSHA 4UXDA 4UTTC 2VC6A 1G4SA 1A5AA 4JN6A 4JTLA 2VXNA 3F1QA 4RCXA 3WK2A 1FXQA 3FEMA 3IIOA 2DORA 2ZRVA 3OIXA 5G4EA 4BWLC 3C56A 5K9DA 4FEZA 1PCWA 1Z48A 4GFSA 1VYPX 3G1SA 3W1PA 2PURA 3WJSA 1FDZA 4FIRA 1DJNA 3L68A 3P8IA 2R14A 1GG1A 1AL7A 4PA8A 1YDNA 2CZEA 4M6PA 5KZEA 2YSWA 2OT0A 2V2DA 4J9JA 1ME8A 2ZZ2A 1LP6A 1DKWA 3NQCA 4IJBA 1YPFA 2TRSA 3W86A 3F03K 2DZVA 3P80A 4WD0A 3NGJA 3IIVA 1IIHA 3MI2A 4NVTA 2QJHA 3KRSA 2ALDA 2YW3A 4I7WA 3W85A 2F84A 2FFCA 4OGZA 3L67A 4JTEA 3GKFA 3PG9A 4PL2A 5F2MA 2ZA2A 3FS2A 1I8JA 4TMBA 2WKJA 4TO8A 1CI1A 5AC8A 1KFCA 4LVFA 4O16A 3DH7A 4JIPA 4UR8A 3UWWA 3SSJA 2YYUA 4GUFA 4CQ8A 4I7VA 2X1TA 3I7RA 1LM1A 4LUIA 3C2OA 4GUIA 4LC8A 1AW1A 3S5NA 4O15A 3FJLA 4UCGA 2WO5A 2ZCGA 4JR5A 3UXDA 1TYGA 4EVZA 3ZWSA 3G3MA 3PB0A 1PS9A 5DY3A 1W8SA 3HG5A 3B0PA 1K8YA 2Y89A 1T0OA 3PSVA 4L4MA 4JX5A 1K03A 2B7OA 3NXFA 4UUIA 4WXZA 2E6DA 4JX6A 4Q4KA 3DFTA 3CM4A 4AEOA 3KOFA 4S1FA 1OHLA 4M7SA 4LRSA 2YW4A 2ZFAA 3NG3A 3LCFA 1U5JA 4MYXA 2W6RA 3M5ZA 5FF2A 1W3IA 1OX5A 5CKSA 4O57A 1K8XA 4FO4A 1PE1A 4ZQMA 1U83A 1A5CA 4NXKA 2AAMA 3CIXA 4NX0A 2Z1BA 2VENA 3EKZA 3LCHA 4A22A 5AHEA 5D05A 1ZNNA 2HMCA 2C19A 4HNNA 3G1XA 1KFKA 1VQTA 1ME7A 1W54A 1T8XA 1TTQA 3B0VC 3T44A 4ML9A 4LS1A 1IXOA 3CTLA 3MMTA 4UFHA 3W7LA 1T96A 3OVRA 2Y6ZA 2CLFA 2QF7A 5AHIA 4YCPA 3CWOX 1AW5A 1H62A 3EX1A 2J27A 2CLMA 3A21A 3G22A 3FYPA 4EF8A 2ZZ3A 3W1TA 4PODA 5FESA 3WK1A 3LB0A 4NQ1A 4QIUA 1SZFA 1GVRA 4RZ4A 4XBSA 4EWND 4HSNA 1S3HA 1Y0EA 1F76A 1XBZA 4P2VA 3UPWA 4O17A 1JR1A 3L21A 3MYPA 4LT9A 4WOZA 2B7NA 3W70A 1GTHA 2A7RA 3DI1A 1TPUA 4RLIA 1WAUA 3S1XA 1SO4A 5F4WA 2TYSA 3R13A 3HG3A 3C61A 1C8VA 2OX1A 4UTWA 4UC5A 2ZQ0A 5CG7A 1KM6A 2NUXA 1YXCA 3N9SA 1M7PA 2QCNA 4HIBA 4PC8A 3OG3A 4K7VA 3A24A 3NQDA 3RF9A 1VZWA 1UB3A 3QW3A 3GDRA 3HG4A 4ZZ9A 1F6PA 1M5WA 3EX6A 3F4WA 3HPSA 2W79A 3MBFA 4UTHA 5HWNA 3LCIA 4PL1A 3P67A 1Z42A 3FOKA 3NZRA 1TV8A 3PWAA 4Z1BA 4WY0F 2FTPA 1LYXA 3GXNA 3SFKA 5TBOA 3BGJA 4DF1A 1W56A 1S5WA 4D2JA 4CNOA 1HL2A 1KM4A 2CFFA 4M5PA 2TPSA 1EIXA 1OFOA 2NUWA 3W23A 4UTUA 3W1NA 1J5TA 2V5BA 1OX6A 3HPZA 3G1YA 5EA9A 1K02A 4WJEA 3DFNA 1I2NA 2XN1A 4LTSA 3P62A 1H7OA 4X2RA 1X1OA 3PUEA 1JJKA 1FBAA 3O8AA 3HGSA 2CW6A 1PCKA 3NA8A 5HQEA 1GYNA 1QOQA 3C2VA 4QJ1A 3K30A 1CW2A 2YR1A 3D0CA 1MEWA 1THFD 1H1YA 4MUZA 4Z0JA 4LNYA 4TMCA 3W7OA 1A50A 3O6DA 2C1HA 4JICA 4IWWA 5C6MA 5HULA 3GVGA 5DCDA 3STEA 2Y7DA 3UYCA 1TPDA 3FA5A 1Z41A 1WYIA 1JCYA 4GRSA 1O94A 5CZSA 3W07A 2H90A 4ALDA 1WBJA 2I1OA 1TMHA 2AGKA 3KVMA 4TR9A 4LOCA 1P0NA 1YDVA 3EX3A 4IX0A 4HKPA 2J24A 2XN0A 1TB3A 3QJAA 4A21A 1ZFJA 2DP3A 5SWUA 4YL2A 3GR7A 1EB3A 1O95A 3GIYA 4HNTA 1QFEA 3M5VA 3P81A 1OG0A 2YYTA 5FI8A 3NQVA 5AYZA 1P1XA 1L6YA 3WJWA 3ZWTA 5AHFA 3VKJA 1N55A 3L5MA 3W9ZA 3PB2A 1M6JA 1FXPA 3IV3A 4O54A 1ZY9A 4CLMA 4N9BA 2DZPA 3TXZA 2GVLA 5U4NA 2F7FA 4O53A 3EXTA 1RZMA 4JTIA 1H60A 3PULA 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4ADSA 1UASA 3UWVA 4K38A 4O0ZA 5KZDA 1W5PA 3W1RA 4MIMA 1RQBA 5LZLA 1ICQA 3NAVA 1VPXA 1KA9F 3LBCA 1VR6A 3UQNA 1SO3A 2QAPA 3A23A 2Y70A 3QC3A 1H61A 5I3KA 5FEPA 2QUTA 4G1KA 1WDWA 1RVGA 3L65A 3KXQA 2ZZ1A 4MFEA 2CZFA 4H4IA 5C2XA 1I45A 1SZEA 1M7OA 2QCCA 3AO0A 4FNTA 3I65A 5C54A 2DJXA 3B03A 2H3BA 4Z0SA 5BOOA 3PM6A 4JTSA 1SU5A 2QCFA 1OJXA 3UZ5A 1RQEA 3UPBA 4NUWA 5DCBA 2NUYA 2RDWA 4Z08A 4AVFA 3N9RA 3GXTA 1LOLA 3B4UA 4O8RA 5HUPA 3ZFHA 5G1TA 1EP2A 3STGA 3G0SA 3SI9A 2ZRZA 4LVBA 4AXKA 2I14A 3IGSA 7TIMA 5D32A 2GVJA 2YPIA 3BLEA 4JXCA 4EOUA 3B8DA 4ZQNA 1GQNA 1GPWA 3SGUA 4DO4A 3TQ0A 2Z6JA 1FWTA 1TPVA 5CZ0A 5E1QA 4MY8A 1JCJA 4IUOA 3QRHA 3L5AA 2X16A 3WJZA 1LRTA 3BK0A 1KBJA 4JS3A 1XCFA 3TXVA 5E93A 5D04C 1FWNA 1KM1A 4N4PA 3A5FA 4NNBA 4UTLA 1KM2A 1X7FA 3NM1A 2DU2A 1OFQA 2OCZA 4FX6M 4IPJA 3TROA 1YLVA 3CB8A 3U8GA 4CNPA 2YXGA 1Q6OA 4UNLA 1IGSA 3NQ8A 3ATYA 1TQXA 3GNDA 5U7SA 5AHNA 2RH9A 3TX9A 1W0MA 4XWUA 3T78A 5EMUA 5C5YA 3TK7A 1VCVA 3W6YA 1R30A 4R7JA 4UFJA 4MOZA 4N02A 5I3IA 2Y7EA 2FPYA 1OYBA 2RDUA 3O05A 4N6EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1W5N A;  3LHU A;  1G9H A;  1J0J A;  4AZH A;  5HMD A;  1UR3 M;  2Q71 A;  1PX4 A;  3WD0 A;  3JR2 A;  1QI0 A;  2PBG A;  2BS9 A;  3F2D A;  3LNM A;  2YX0 A;  4ZB5 A;  5D2T A;  1XSK A;  3PFM A;  2JAL A;  1EA0 A;  3HGR A;  4E6M A;  2PMQ A;  1RD5 A;  4LAN A;  3ANY A;  3ICJ A;  3F2C A;  1CLK A;  3JS3 A;  3L66 A;  3N14 A;  2VDI A;  3QFW A;  3SCT A;  3STC A;  3W1A A;  1UQZ A;  1DE5 A;  3IAQ A;  5D2Y A;  2P5N A;  2FGB A;  1XLC A;  1JPD X;  4LVA A;  1JQX A;  3P60 A;  1QHP A;  3W22 A;  4KKX A;  2WVU A;  4L9Y A;  1ZGD A;  1VFL A;  3MSG A;  1GT8 A;  1BTM A;  5CGM A;  2QGY A;  4PFH A;  3A22 A;  3EA1 A;  3G8E A;  4FXF A;  4R3U A;  1UZD A;  4M1B A;  1OBA A;  3DFO A;  5L9F A;  1X98 A;  3AAL A;  1DJG A;  3BOF A;  1OEP A;  2YGY A;  1ME9 A;  2NX1 A;  1IHI A;  1R3Y A;  1I6N A;  3GBD A;  5HNN A;  3MUC A;  2QDG A;  1WUE A;  1JGI A;  2QLY A;  4B90 A;  2WBK A;  2WLY A;  1H51 A;  3S5Z A;  4IPI A;  5BW6 A;  3E38 A;  3WQP A;  4C6N A;  1ZS2 A;  1KBB A;  3VTR A;  1MDR A;  3M7W A;  2HVN A;  2NQ5 A;  3C4U A;  1PKY A;  2V3D A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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