2X1TA

Crystallographic binding studies with an engineered monomeric variant of triosephosphate isomerase
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
238
structure length
233
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADALASLKDFGVNWIVLGHSERRWYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLAGLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE, GLYCOSOMAL
publication title Crystallographic Binding Studies with an Engineered Monomeric Variant of Triosephosphate Isomerase
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 88
structure length 233
sequence length 238
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2010-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2x1tA00
1XBXA 3KFTA 4UC5A 4OWGA 4UTWC 4JTSA 1TO3A 2VFFA 5BMXA 2CLFA 1H61A 2PE4A 4TIMA 2CZFA 3UQNA 1KV5A 3CWNA 2ZA2A 2YW4A 3PM6A 1TPEA 4R7JA 5HR6A 5G2WA 2VEPA 4UMAA 1IGSA 1VH7A 1QPRA 4DQWA 5D2VA 4RR4A 1Q6RA 1W5OA 3FYPA 3BGJA 3W85A 2GQ8A 2XN0A 1PE1A 1ALDA 3TA6A 5A5WA 3CQ0A 5KTLA 3GKAA 4FO4A 3C2FA 1B4KA 1MO0A 4JY9A 3DKJA 3E0IA 4NNCA 3P74A 4PCFA 4EVZA 1WQ5A 4GUFA 1S3HA 3S5OA 5HUPA 1EUAA 3UYCA 3ABQA 3PF3A 3L68A 3W7GA 3GDRA 3CC1A 1FWWA 3C3NA 1SUXA 3BW4A 1EWEA 4CLMA 1P1XA 4LV4A 2RKXA 1OX6A 1MZHA 4Y8FA 3FIGA 1F2JA 2Y63A 4A22A 3NQAA 4JX6A 3F4NA 5AHEA 5E93A 2VXNA 4JGDA 1GVSA 1C9DA 2Z2UA 3NNTA 1ZY9A 2R91A 3PBVA 3L5AA 4UCGA 2H3DA 3IGSA 4UUIA 3CIWA 2V2DA 1XC4A 4FNUA 1JCXA 3QRHA 3L0GA 3IIVA 1FY6A 1ICPA 5AC6A 1WBJA 3LM7A 3EWUA 2FB3A 3MO7A 1FCBA 3G3MA 1TPB1 1W0MA 3P81A 3PBYA 1IIHA 3NQVA 2ISSA 4QNWA 4QJ1A 3P62A 3GNNA 3UWWA 4ICNA 4UTMA 4LUIA 3O6CA 3W72A 4WD0A 1L9WA 1F6PA 1YDVA 2GVLA 3SW6A 3JRKA 2VFEA 3UY8A 1M7PA 3N9RA 5DXYA 3NR0A 3W9ZA 4JDBA 2PCQA 3PAJA 4Z1DA 1U83A 1DQWA 5F2MA 2PRLA 1TPUA 4UMBA 3M0ZA 3LCGA 1KFBA 4JNMA 1HL2A 4OBTA 3E12A 4E38A 2NUXA 4FIQA 4IXXA 4LS2A 5DCDA 1IXQA 4DF2A 3MMTA 4MZ8A 4ADTA 4BFAA 1F74A 5FF0A 4WY0A 5E0KA 3HBLA 2A6NA 3GAYA 2DZPA 1HO4A 3UWZA 4O1DA 2Z1BA 3N34A 1I2QA 4FX6M 1AW1A 2A4AA 4EWND 2X16A 3UXAA 1YYAA 3NQ2A 4FEZA 1Q6QA 2ZRUA 3BGGA 5DCEA 1W5QA 3G1VA 4XQ6A 1K7XA 3GDTA 1EEPA 3W7NA 4CQ8A 2QCMA 4FNPA 5LNRA 1W5NA 5AHIA 4ZQMA 2ZA3A 1QMLA 3RF9A 1OYAA 5BW6A 2ABBA 3C2RA 3KXQA 3I7QA 1KM3A 4EIVA 3SZ8A 3M1ZA 5D2WA 3S0CA 2J9XA 1OX4A 1PL9A 3LGEA 1XM3A 4RXGA 3P8JA 1DORA 1KW1A 5A8GA 2A1YA 3O6DA 1GQNA 3KVKA 3MI2A 3TK7A 4LS0A 2QUUA 4HHPA 5D32A 3M47A 1IIGA 5T26A 2BX7A 1K8YA 1OFDA 3W7OA 3LI1A 3BLFA 3TFCA 2KZHA 1Y0EA 1YTKA 5BRBA 3NM3A 2C3ZA 2QCDB 3W1TA 4AMAA 4N6EA 2RHGA 4LVAA 1DHPA 3W75A 1TTIA 2F84A 1MSSA 1YTEA 1XDLA 1EIXA 1LBFA 2D73A 3ABOA 3W2KA 3TQVA 2FJKA 2Q8ZA 5KZDA 3G1DA 1KM6A 1L2UA 2NV1A 5CZSA 4JTTA 3A23A 4O1AA 1OJXA 1K02A 4DO5A 1OG0A 1RD5A 5GVJA 2FPYA 3BW3A 4MY8A 4A21A 1A5AA 3MP3A 2TPSA 3C4UA 4YCOA 1WYIA 3KOFA 2QCHA 2F7FA 3BLEA 1SFLA 1QDSA 1H5YA 1RQEA 3PUEA 1JCYA 1GT8A 5K7JA 2O7QA 1QFEA 1TQXA 5KINA 3O8AA 3R13A 4E0CA 1H7WA 4AH7A 4BR1A 3GXNA 3KHJA 1DKWA 3VFLA 1LRNA 3G0XA 3NGJA 3HPSA 2C15A 3KRZA 3W3OA 5G2IA 3ZR4A 4AEOA 4TMBA 4O0ZA 2FLIA 3TR2A 3N73A 2V5LA 1I2PA 1Q3NA 3SR7A 1MXSA 3OVRA 3MW7A 1V7YA 3KRSA 3KVJA 1QPNA 4FXSA 3PG9A 2R8WA 4FNTA 5EL1A 4I7UA 2Z6JA 1RR2A 3LTYA 1PHQA 3LCFA 1JUKA 3PUDA 3IIXA 1N55A 1X1OA 2DZVA 2EF9A 4BF9A 4ORMA 4Z1CA 2V81A 4UTHA 4Y96A 1LTDA 1SFJA 3C52A 2W0UA 2I1OA 3KVLA 1GVOA 1ZAHA 4PH6A 5HJLA 5L6UA 4ZL1A 3Q37A 3DI0A 1BEUA 3DFOA 3G0SA 2A6LA 5DXXA 3TCEA 1H7RA 1PCWA 1SO5A 4EF9A 3AO0A 4JTKA 3G1FA 4JDYA 3OEXA 1KBIA 2VC6A 4ONVA 1MEHA 4E2DA 3YPIA 4PTNA 1TQJA 2AQWA 4ORIA 3N2MA 4PL2A 5AC8A 3L66A 5K3VA 3O15A 3U6WA 4BI7A 3W71A 2E6YA 4ZQCA 4IWWA 5LGZA 1LORA 1TJPA 4WXYA 1LZOA 3GDLA 4QISA 3RNDA 3TNOA 2FPVA 2ZZ1A 2JGYA 2Z0IA 3OHIA 5HQEA 4FHAA 3NXFA 3KRUA 5HNRA 2JK2A 3E02A 4DF0A 3WK1A 2E5DA 1VHNA 2ZZ4A 2ALDA 2A85A 3LOTA 5F2GA 5F4WA 4HSNA 1AW2A 4OT7A 1H7PA 3HQ1A 2G97A 3D0CA 3PUOA 5EPDA 3B03A 4JN6A 1JQVA 1Q6LA 3R5EA 5AB3A 3C8FA 1KTNA 3ANYA 1YXYA 4O14A 2NWSA 3W74A 2WSRA 4A2SA 2E77A 3NOEA 4LRSA 1N7KA 1W3IA 4UTJA 1HUVA 2CLLA 3MWAA 3CPRA 1TRDA 4Z1BA 4NJJA 2A7RA 4O1BA 5L9FA 2X1TA 1M6JA 4DELA 4C1KA 4K37A 1XBYA 1X8FA 4AF0A 4HNUA 4JX5A 1GZGA 4X2RA 3DKLA 4UFLA 2ZCGA 3BO9A 3M5ZA 2J6XA 1TMHA 5I3HA 5DBTA 3S5NA 4LTSA 3L5LA 3V1PA 3P5ZA 4Q32A 3HG3A 2W79A 2Y88A 1BWLA 5AYZA 4FX7A 3EWYA 1Z44A 3LHZA 1P0NA 1EX5A 2QAPA 4DF1A 3W1UA 4R53A 3IIOA 4Z0JA 1VS1A 4RKAA 4YMZA 3HGJA 3EXRA 4O1CA 4UTWA 3W7QA 2WJZA 4DPPA 2C13A 1WXJA 3H55A 3HGRA 3STFA 2R14A 3M5XA 1F05A 3K30A 3SGUA 1OYBA 2B7QA 1GJPA 1ZENA 3UWYA 4K6AA 3TSBA 1AMKA 2YFOA 5FESA 4O4VA 5DCBA 1DBTA 1BWKA 4GWEA 3DXIA 3HPZA 3M41A 1UJPA 1SZEA 1XBVA 2Y7GA 2JKEA 4MOZA 1X7FA 3HO8A 2ATSA 5CKSA 4QSHA 5TBOA 3THAA 3NPUA 4MLJA 2OCZA 1WAUA 2WNZA 3W7IA 1ML1A 1MEWA 3I65A 1JCNA 4K36A 1W5MA 3A21A 3DI1A 2ZRZA 3R2GA 3NVTA 3E9AA 1O60A 4IPIA 4M7TA 1JCMP 4YXGA 3W7MA 2ZDRA 2GVJA 4HKPA 3LLFA 3M6YA 3DFNA 5AHMA 2B7OA 2Y7DA 3QMTA 3TJLA 3F1QA 2V9DA 4CNOA 1TIMA 3IVSA 2QF7A 4O53A 1SO3A 3LCHA 2YYTA 4I9AA 1RQBA 1F73A 1GTHA 4RX0A 3QQ1A 2Y7EA 3W2LA 1AL7A 4RCXA 4ALDA 4LNYA 3FKKA 3EX1A 2BZNA 2ZZ6A 2CLIA 4UTIA 2NZLA 5FI8A 3NPXA 3EX6A 4RJEA 4LVDA 4XTIA 3TAKA 2XFWA 3W6YA 3CU2A 1AW5A 4R33A 1KTCA 1ME7A 1GEQA 3M9YA 4OQVA 2TYSA 3Q58A 2EPHA 3G22A 3UWUA 4YLWA 4UNKA 1K03A 4X22A 3TE9A 4GUJA 5D30A 3QF0A 1JVNA 1XBZA 4DO4A 5K9DA 1KV8A 1UUMA 3LXCA 3HOJA 4N9EA 4JTLA 1SZNA 1VHCA 5H2ZA 4ADUA 1HO1A 4O4WA 4GUHA 1T99A 3TQ0A 2C16A 1JR1A 3NG3A 3FS2A 5D33A 3CB8A 3NZRA 1FWTA 5D2XA 3WJSA 3G8EA 2V30A 1W54A 1XL9A 4K8EA 3VNDA 5E1QA 3A9IA 3IRDA 3RFAA 1GOXA 4XKYB 3W7RA 4NZJA 3HMJG 3QYQA 4HN4A 3A5VA 2CZDA 3GDKA 3PS7A 4MPQA 5F4SA 3CWOX 3KAOA 1PS9A 1W1ZA 3TW7A 3B0PA 5AFDA 1W31A 2QJHA 2C6QA 2IQTA 4FXRA 2FB2A 4L4MA 5EA9A 1Q45A 2DZUA 2G96A 3NQ8A 2PRHA 4N02A 1G7UA 1THFD 4QITA 3STGA 3NO5A 1L6SA 4OGZA 4ZQOA 1OFRA 1E51A 5D2TA 4C1LA 4JYFA 1TV8A 4O19A 5LKYA 1JUEA 1WX0A 4D2JA 3S6DA 1LYXA 3PG8A 1C29A 2FDSA 3HF3A 4I7VA 5G1TA 3ZWTA 5I3GA 3NYZA 2WNQA 3MHGA 4DEFA 4IQLA 1SO6A 1QCWA 4JIPA 2ZRVA 4UR8A 2YDAA 1J2WA 4FNSA 4K7YA 2QJIA 1QO2A 3W76A 3P5YA 2VFIA 1TTJA 4RXFA 1KM5A 3QZEA 3ATZA 1L6YA 1LRTA 5FF3A 5KMYA 4PA8A 3LTPA 1BTMA 2LLEA 3EKZA 5KZMA 3IEBA 2E5BA 1KM1A 5SWUA 3S8HA 4RZ5A 1KLYA 3W1AA 3P8IA 3INPA 2UV8G 1S5WA 4HSOA 3IVUA 4NJIA 3QW3A 3WJWA 1JCLA 2NLIA 1FQ0A 5LSMA 2VOMA 3I7SA 1X6UA 2YGYA 3PR2A 4UTTA 3MJYA 3EWXA 1SSGA 4MKNA 2WOQA 1I4NA 4WQ6A 3UXDA 5LNSA 3GVGA 1FWSA 4J9JA 4K8HA 1QOPA 1FX6A 2C1HA 1DL3A 3G1SA 2WO5A 3TMLA 3S1XA 3T55A 5HULA 3CEUA 1TRIA 1R47A 3Q94A 3TFXA 3N14A 1BKSA 1H1ZA 1LOSA 5HMSA 3ZS4A 5LNWA 2CLKA 4NJKA 3W7JA 4LVFA 5LNUA 1XUUA 4PFMA 3MYOA 3GX9A 2HS6A 3EWWA 3GXPA 4LU0A 3A5FA 4ZVJA 3S1VA 4K38A 1T0OA 1VZWA 4K7VA 5IBXC 2ZQ0A 3NDOA 4M6QA 4KKXA 2HS8A 4M6PA 3LBMA 5C54A 4CNNA 2VELA 3Q2DA 3DFQA 4UFIA 5HR7A 5HWMA 3TDFA 1QNVA 3W70A 2B0MA 1P0KA 4LY8A 3TQKA 1Z41A 2CU0A 1NFBA 2VEMA 1CW2A 3QC3A 2QCEA 2Y61A 3CM4A 3OBKA 1VYSX 4N6FA 5D37A 1EPXA 2X30A 3LHVA 1F7BA 1B4EA 5FEPA 1OK4A 4OE7A 1EB3A 6TIMA 1SPQA 3QPYA 3DENA 1JJKA 1KLZA 2QAFA 3ABSA 3I6RA 1ZCOA 4NJGA 1GG1A 3MBFA 2V82A 3IIPA 2ZYFA 2J9ZA 4IGHA 5FF4A 5AHNA 1F76A 3G3DA 4JEQA 3QM3A 2E5CA 1A50A 4UTTC 1DV7A 3I68A 1Q6OA 3QW4B 2X1UA 1VLWA 1T8XA 5J5RA 3SIZA 3IIZA 2GQ9A 3O1NA 4LC6A 3B8DA 3FYOA 2J27A 3QJAA 3H54A 3IVTA 2DZXA 5F2IA 5F1VA 1SZFA 3C2VA 4HT3A 1KM0A 1KFCA 5DN1A 2B7PA 4AB4A 1OFOA 3TJXA 2I14A 4RLIA 2FPTA 2NX9A 4ZZ9A 2YCEA 4HPXA 3W73A 2Q3RA 2XN2A 3PB2A 4LUJA 4JTUA 3NQCA 3GKFA 1WV2A 5C6MA 3NQMA 3W7HA 2PC4A 3DHFA 1TB3A 2PRMA 2QCFA 1LDCA 3UZJA 2Y62A 1KFEA 4UFKA 4NX5A 3TX9A 5F2LA 4GFSA 3WJYA 3W7LA 4EOUA 1W56A 3M5YA 3C56A 3EEGA 6ALDA 1DJNA 4S2BA 2CW6A 3DBPA 5DLCA 4RK8A 4A29A 3TU9A 4GC4A 4O17A 4QNEA 1W37A 4MFDA 1G6CA 3S5ZA 3SFKA 4GNJA 3OVQA 3CIXA 3DFSA 5D05A 1OK6A 2OJPA 3ELFA 2XN1A 4AAJA 1TTQA 1T96A 1RVGA 2OX1A 1LOQA 2EKCA 4O50A 2P0OA 2Y6ZA 4TU1A 3B04A 2AGKA 1KFLA 5KZEA 3W1MA 5CSSA 1XI3A 1I2NA 2ZRYA 3W7KA 4JX4A 4NU7A 3W22A 4QAIA 4AWUA 8TIMA 1PHWA 1N8FA 4ZQRA 1WOAA 4R34A 3ABRA 5I3FA 3GZ3A 1VR6A 5EKYA 3R89A 3QEZA 2QCDA 2WV8A 3P61A 5FEZA 3STEA 3NQEA 1OFAA 4TX9A 5HWJA 4IMEA 1FDYA 3P82A 4E2BA 3W1PA 3PVFA 3PBWA 1VGAA 3NL3A 4O8RA 4ZQNA 2QEZA 2NUWA 1H51A 2Q8LA 3LRKA 2BLEA 3L0KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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