2XYLA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase complexed with 2-deoxy-2-fluoro-xylobiose
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-1,4-GLYCANASE
publication title Exploring the cellulose/xylan specificity of the beta-1,4-glycanase cex from Cellulomonas fimi through crystallography and mutation.
pubmed doi rcsb
source organism Cellulomonas fimi
total genus 124
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1997-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xylA00
3OLIA 4P7RA 2J47A 3AZSA 4EKJA 4P8XA 1CGXA 3FXYA 2BXYA 5CPTA 1HJUA 2QV4A 4D6CA 2GJPA 4CKQA 1RD6A 1R7AA 3WH7A 2ZX6A 4ACZA 1VJSA 4HOWA 1E6ZA 3O2LA 1JYVA 4LYPA 4OJYA 1JXJA 4XV0A 4P8VA 5FKYA 1GQLA 1BG9A 1R8LA 4WF7A 4YN5A 4ATWA 3QHMA 1BHGA 3MUY1 3SUUA 2WBKA 1QNPA 1GQJA 3BSHA 4MNJA 3OIHA 1E56A 4R5EA 4CVWA 1M04A 3KEHA 4URIA 1RH9A 5D9NA 4AZCB 4ZE5A 3OZOA 3EBVA 4Z2KA 4BF7A 4B3LA 2VUYA 4MJ2A 2WLYA 4U33A 2VMFA 3G6MA 1EA9C 1N82A 2CBIA 3GNRA 1HKMA 3WNOA 4HMDA 2WC4A 2J8FA 5FL0A 4AD3A 1EO7A 1J9YA 1W32A 3VIIA 4DWSA 1JZ4A 5JBDA 2CBJA 4L4PA 1TA3B 3PZIA 1KGWA 3PN8A 2WLZA 2JE8A 3EDFA 2E9MA 4FLQA 2YOCA 3WIJA 1TG7A 1UKQA 3ECQA 4UFHA 4NRRA 1BVZA 2WNWA 3LPFA 3PBGA 3SCUA 1SR0A 3N18A 1ZBWA 2BY3A 4AZ7A 4U31A 4GQQA 3ALGA 3PZTA 5EB8A 3VILA 1KXVA 5I6SA 4E4PA 1KQZA 3VPLA 4WLCA 1CGVA 1E55A 3A6OA 3GH5A 2VZSA 1XH0A 4ZFMA 3T2PA 2GJXA 4F9DA 3W0KA 1EQPA 2WWCA 3WEMA 3OLEA 4GINA 4GXPA 3ZR6A 1W9BM 1KGUA 3ARSA 2VRQA 1XHGA 1JG9A 1B0IA 3NDZA 4OUEA 5E70A 4PMQA 1W3JA 1R86A 2PI6A 2WSKA 3W37A 1MXDA 1NOUA 5EFFA 3LMYA 1JF5A 2NT1A 3WNLA 4W8AA 3SCOA 3N17A 1EHAA 3IAQA 1EGZA 4PEEA 5AC4A 5BCAA 2VZOA 1EDQA 2PWFA 3WQ6A 3PTKA 3WF2A 2X8RA 2VURA 3M6DA 1C3FA 1XH2A 3FW6A 3QHNA 2OWWA 1MVYA 3ARTA 1Q6CA 4CN4A 4MDPA 3K8KA 2BHZA 5BXTA 4IM4A 4K68A 1PPIA 6TAAA 4FK9A 3BCFA 4OOZA 1M53A 4AZGA 4M1RA 3VIGA 1JAKA 3KL3A 2J7DA 4PMYA 1CGTA 3I3BA 1B31A 3BC9A 1C7TA 5A2AA 3ARYA 1DHKA 4FLOA 4D6HA 3WEOA 1GOQA 3N12A 4BCEA 1CXEA 2QPSA 1DWAM 1A3HA 1R85A 3S6TA 1OM0A 4CU8A 4H8VA 1GQKA 1ISVA 1VB9A 3AROA 3W4RA 3CUFA 4MB3A 3VVGA 1MQPA 3S2CA 2W92A 3L2MA 5A2CA 3SIMA 1XV8A 4B15A 3CUGA 4QAWA 4MADA 2RGLA 1NOWA 3VMNA 3AS1A 2ZX8A 4YHEA 1L0PA 4U2YA 3W81A 3SUTA 4RL3A 2IXVA 3DHPA 3MO4A 2VRJA 2EBNA 4WSKA 1B3XA 1XSJA 4QLJA 2WVVB 1WNOA 2EEXA 3WF1A 4UQCA 1V6XA 1E71M 3NSNA 3ZMRA 5ABGA 3TONA 1C90A 4Q7NA 4PN2A 3WF4A 2YLLA 1UWSA 1IZKA 4PMDA 3AFBA 1EO5A 5CLWA 4Z2JA 2O9PA 2VL4A 3VGEA 2J7FA 4C7FA 4CN6A 3MV11 4CD5A 2BVDA 2YL6A 1C7SA 2PBOA 3WUEA 2HVMA 1XH1A 3AMLA 3BLPX 2WMIB 2A3EA 5I3DA 3GYCA 1QI0A 3GNOA 2ZWYA 5A6AA 4CCCA 4WKFA 4UNIA 1OIFA 1ZBVA 1LG2A 3UG4A 3W24A 2GK1B 5CLTA 5EMYA 1UQZA 1JXKA 1VIWA 4JKMA 3M7SA 1E73M 3VO0A 2FH8A 1Q6DA 5A1AA 1FA2A 2ZX7A 1SYTA 4HU0A 3WH6A 4IISA 4W93A 2IUZA 2CXGA 4QP0A 2DT1A 3MU7A 4V28A 2JF7A 1CXKA 4V27A 2ZUWA 4BQ4A 3RPMA 5HPOA 4XX6A 1SMDA 1CPUA 1TE1A 1E9LA 5I0DA 2NT0A 1EH9A 3MUAA 4N0RA 1MFVA 3EMCA 2QHAA 4UZSA 5I78A 2V5CA 1DWIM 3ARQA 1W1TA 2XJ7A 4PMNA 1BG4A 1VENA 3RMEA 3O6AA 3L4UA 2X0HA 4AIEA 2E9LA 3SCNA 3BAXA 2BY1A 3GXMA 3OBAA 4OOUA 1J0ZA 4PTXA 3AHVA 1W91A 2D3NA 4PMOA 1ESWA 3AIVA 1F4HA 1HIZA 5A8MA 3NSXA 1Y7VA 4H41A 5I79A 4ML4A 3NIYA 1TUXA 3DC0A 1PZ2A 4CGTA 4P8WA 1JZ7A 3ZR5A 4ZENA 4ZE4A 4D1IA 1ZJAA 3WMCA 3IJ7A 1WB0A 8CGTA 1UOKA 1FP9A 1MFUA 2D23A 1VEMA 4N42A 1UD5A 2PC8A 3M07A 4D1JA 4AZBA 3BMWA 4DUWA 4JAWA 3CO4A 4CD6A 1M01A 2NW0A 5HNNA 1Q6GA 1C93A 2ESCA 4PCSA 6CGTA 2J74A 4AZCA 1WE5A 2E0PA 4GZEA 1JDDA 3TP4A 2VT0A 4D6FA 2A3AA 3RCNA 4FLSA 5DFAA 1E0WA 3MV01 1JDAA 3U57A 2DQXA 2ZOXA 3BH4A 1GOKA 2XSAA 3CZGA 4PMRA 3RM4A 1J0JA 1JNDA 2GSJA 4GI9A 2DT0A 3W82A 3I3DA 3DYPA 3N13A 2ZWZA 3VIFA 1B3ZA 1QNSA 2YA1A 2VCBA 2WCGA 1JFHA 1PIGA 2VQUA 2XVLA 4W8BA 1V3LA 1CXIA 1XCWA 4AZHA 5IFPA 2E8YA 2EO7A 1GHRA 3FHAA 5A6BD 1J0IA 1GNXA 4J3UA 4P7QA 1JZ6A 2XM2A 2WM0A 1JFXA 3OLDA 4M82A 4TVDA 4P7LA 4P7OA 2YA2A 2EPKX 1P6WA 4F8XA 5BRQA 2J77A 1GW1A 1M03A 2BNJA 5DT5A 1FP8A 3VKKA 1MYRA 3KL5A 5LA2A 5I23A 4R27A 4JFUA 1WDPA 2XVGA 2EPLX 2WHKA 1VFOA 1QNOA 2DT2A 4AW7A 3W27A 2BVTA 1U2YA 3GH7A 4B9ZA 2X0YA 1MW1A 3QR3A 1XSIA 2VR4A 1NOFA 1NWSA 5A6KA 1TZ7A 3SCTA 4UFKA 3RIKA 1H3GA 3NUKA 4B9YA 1QHPA 2CNCA 2XWDA 4GPNA 5HPCA 1HXJA 4CD8A 1WPCA 5D4YA 3VX0A 1LL4A 5A3HA 2EPMX 5A95A 1CXLA 3ZO9A 1XD1A 2QMJA 1PX8A 2E4TA 2DGAA 3VOCA 1HKKA 2WKGA 3CGTA 2XSBA 4UQBA 1VAHA 2WHLA 4HA3A 2OWCA 4B16A 3SCWA 1AQ0A 2VZVA 2YBUA 3AIWA 4HZ6A 3AS0A 2ZIDA 1W3LA 3DYMA 3OLGA 3WUFA 1HP4A 3UESA 4FLRA 1UR1A 1XC6A 3CZ8A 1DWJM 3JUGA 4HMEA 3B8SA 4BZYA 1E4IA 4YPJA 1YQ2A 1WDRA 4GI6A 3BMVA 3EDKA 1JZ2A 2FHFA 4J7RA 3W28A 3UG3A 3EDJA 5HXMA 1VJZA 1JF6A 1VBUA 2PBGA 3SCRA 1EXPA 3ZJ8A 4TUFA 4QDMA 3BAYA 1E72M 1UKOA 3M46A 1ODUA 3WQ4A 1MW0A 4EANA 2WPGA 1PBGA 3N1AA 1W1VA 2AOSA 2WVTA 5AY7A 3VGFA 3GBDA 2A3CA 5GPRA 3CH9A 4OZOA 4JFTA 2EPOA 1WDQA 1WZAA 3OB8A 2CKSA 1IT0A 3F5JA 1AMYA 3VINA 3ARXA 1PAMA 4OKDA 1HX0A 2AAAA 3CMGA 2DSVA 3FAXA 4U2ZA 2VX7A 2VOTA 3N11A 3HJEA 3SURA 3ARRA 1E15A 1QNQA 1ZU8A 5D9PA 2FH6A 1UWIA 5C70A 1XCXA 2D24A 4E8CA 1KBKA 2G3IA 4AEFA 5AYBA 3LPGA 3PHAA 5I5RA 1OWQA 1W9UA 1V0MA 2J7CA 2OYLA 4LQ1A 4PMZA 1QW8A 1KWGA 1WAWA 2GFTA 1BTCA 4HPHA 1E1EA 4X9YA 3NJ3A 3U5UA 4AISA 1H4PA 1OSEA 1D3CA 3W38A 1U30A 4PSRA 4JKKA 1H1NA 3ZQ9A 4HPGA 1CTNA 3OZPA 2GK1A 4AD1A 1H0GA 3WDJA 1B3VA 5KZ6A 4GO8A 3WENA 1UD6A 5BYWA 1AQHA 4Q22A 1G0CA 1H2JA 3MANA 5ABFA 3GBEA 3ARWA 2VCAA 2DH3A 4W5ZA 4ATDA 3AXIA 2GUYA 3N15A 3SCQA 1BQCA 1ZL1A 2WHJA 4J3XA 2EXOA 1FFRA 1X6LA 3EDDA 5M17A 2J7EA 1HJQA 2JIEA 3VTRA 2HISA 1B9ZA 5ABHA 1KXTA 3T0DA 3CHFA 4QCEA 1UKTA 1FOBA 3VMPA 1LL7A 8A3HA 2UY5A 5CZKA 2E8ZA 4XUYA 2DSKA 2DSUA 2WXDM 1V0LA 4TTUA 1PEZA 5E09A 4HA1A 2E3ZA 2CHOA 3WDIA 1QBBA 3U7VA 5A6MA 2ZICA 1E4NA 4KRTA 2V5DA 1A47A 3L4VA 5TD4A 5FIPA 4WJXA 1V0NA 4UZUA 4S3JA 1PIFA 1W9DM 1GORA 5I77A 1G01A 3VDBA 2J75A 1UWUA 3ZOAA 4UFJA 1YHTA 1OINA 1KCLA 4WKAA 3ARUA 3OGSA 3AMGA 4X0NA 1OB0A 5GQBA 4WK9A 1MXGA 3GZAA 5LYRA 3CBWA 1JZ3A 1JD9A 4MB5A 1CBGA 3FAWA 2JF6A 1E6QM 1US2A 1GVYA 2MANA 4M80A 1DEDA 2J7GA 2YL8A 4JFWA 2JALA 5CXPA 3AIQA 3CUJA 4QFUA 2W67A 1HN1A 3WD2A 1G1YA 1XD0A 2J25A 2CERA 1C8XA 3GXIA 1UWTA 1QPKA 5CJ5A 3VDCA 4HA4A 4CU6A 1XRVA 1KFWA 2WANA 2WSPA 3IAPA 1VFMA 3BAKA 2W91A 3POCA 3WFZA 2V3FA 3WY1A 5M03A 1LF1A 5I2UA 4MAZA 1W9PA 4IPLA 2ZUSA 1I1XA 3PZQA 4DM2A 4V2XA 1HJSA 2AMGA 2CKRA 1E6RA 2W66A 1WZKA 3K1DA 3O9NA 1V3MA 2Y24A 2W63A 2X1IA 1NARA 2YDQA 1W3HA 3RILA 1JIBA 1W2PA 2CETA 1E3ZA 1WP6A 5FL1A 1V02A 4F66A 5CPSA 2FGZA 1HL8A 3K46A 5A8NA 4L4OA 3WDQA 3MUIA 1J0KA 3AS3A 1ISZA 2CESA 1UR2A 3VNZA 2F8QA 2VZTA 4M24A 1LG1A 2FHCA 1UHVA 3VD3A 4ACZB 1G5AA 2Y4SA 1C8QA 1LWJA 4UFLA 1BLIA 3A4WA 7A3HA 2F2HA 2EPNA 4PCTA 4F79A 1KQYA 2D20A 4MJ4A 2OWXA 2BY2A 5IHSA 1MWOA 1I1WA 5GNXA 1W9XA 1EHNA 1UWRA 2FHBA 3VD9A 2G3MA 2D0FA 2YDRA 4CN1A 3ZJ6A 5BXRA 5EBAA 3BCDA 1OT2A 3MMDA 3CHEA 5DO8A 2G4FA 1JL8A 4J27A 1E5NA 3CHCA 3VIPA 4PRWA 3TTQA 1HF6A 1GOWA 1F4AA 3K4AA 4YHGA 4KRUA 2DH2A 3T08A 1OGGA 2WMKA 1K9FA 1TFVA 3T0BA 2YL9A 2YDSA 1MW3A 2ZUNA 3TTOA 4W84A 3CUIA 2XVKA 5D8ZA 1C92A 4PYSA 1X1NA 2ZX9A 3AHYA 1ZB5A 2XIIA 5DF0A 3CUHA 4D6IA 1V6YA 4W88A 2V3DA 3GNPA 1UR8A 5CQ1A 5IHRA 1UQYA 3TTYA 3WH8A 5GNYA 3AIBA 4D6JA 1OD0A 3KWXA 1EQCA 1V6WA 3VU2A 1MW2A 5M5DA 2J7HA 2J4GA 4WIWA 3ZIZA 2G3NA 5GNZA 1RP9A 3L4TA 5DT7A 1CYGA 2UY2A 1UKPA 5F7UA 4MAVA 2PWEA 2J7BA 3WH9A 3WUBA 5AC5A 4JL2A 2FDMA 1BGAA 1UUQA 4MPKA 3KL0A 1W9VA 1JYNA 5A6SA 3LPOA 3WUGA 2WZIA 3ZT6A 3AYSA 4AEEA 1BYDA 3ARPA 3VD4A 2V3EA 1ISWA 5ABEA 3U7BA 1JZ5A 1JYXA 2OYKA 3RM8A 2OLHA 2GJXB 4D6GA 3RO8A 1B3YA 4DM1A 3W6MA 3D3AA 4X0VA 2DIJA 2CHNA 3A3HA 3MS8A 2WZEA 3WDHA 3UG5A 4UQAA 1UR9A 3CZEA 1UH4A 4AXNA 3J7HA 4A3HA 2A3HA 5DEZA 1SMAA 4HZ7A 1VF8A 2VR5A 3WQ5A 3AHXA 3WSUA 2VTFA 4GZIA 5KEZA 2OSYA 1QHOA 1PZ3A 2BXZA 3AQUA 4EAMA 2BFGA 3CZKA 4UTFA 4XZBA 1O7AA 4U5IA 3WBAA 5LA1A 1S46A 1Q6EA 4C7GA 1UA7A 1HKIA 1OBAA 3VM7A 2UY4A 4Z2HA 4UOQA 1ITXA 5A6LA 1KR0A 3DHUA 3FN9A 1UH2A 2DSWA 1JYWA 2G3JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3OLI A;  4P7R A;  2J47 A;  3AZS A;  4EKJ A;  4P8X A;  1CGX A;  3FXY A;  2BXY A;  5CPT A;  1HJU A;  2QV4 A;  4D6C A;  2GJP A;  4CKQ A;  1RD6 A;  1R7A A;  3WH7 A;  2ZX6 A;  4ACZ A;  1VJS A;  4HOW A;  1E6Z A;  3O2L A;  1JYV A;  4LYP A;  4OJY A;  1JXJ A;  4XV0 A;  4P8V A;  5FKY A;  1GQL A;  1BG9 A;  1R8L A;  4WF7 A;  4YN5 A;  4ATW A;  3QHM A;  1BHG A;  3MUY 1;  3SUU A;  2WBK A;  1QNP A;  1GQJ A;  3BSH A;  4MNJ A;  3OIH A;  1E56 A;  4R5E A;  4CVW A;  1M04 A;  3KEH A;  4URI A;  1RH9 A;  5D9N A;  4AZC B;  4ZE5 A;  3OZO A;  3EBV A;  4Z2K A;  4BF7 A;  4B3L A;  2VUY A;  4MJ2 A;  2WLY A;  4U33 A;  2VMF A;  3G6M A;  1EA9 C;  1N82 A;  2CBI A;  3GNR A;  1HKM A;  3WNO A;  4HMD A;  2WC4 A;  2J8F A;  5FL0 A;  4AD3 A;  1EO7 A;  1J9Y A;  1W32 A;  3VII A;  4DWS A;  1JZ4 A;  5JBD A;  2CBJ A;  4L4P A;  1TA3 B;  3PZI A;  1KGW A;  3PN8 A;  2WLZ A;  2JE8 A;  3EDF A;  2E9M A;  4FLQ A;  2YOC A;  3WIJ A;  1TG7 A;  1UKQ A;  3ECQ A;  4UFH A;  4NRR A;  1BVZ A;  2WNW A;  3LPF A;  3PBG A;  3SCU A;  1SR0 A;  3N18 A;  1ZBW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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