2Y61 | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	249
structure length	249
Chain Sequence	AKPQPIAAANWKCNGTTASIEKLVQVFNEHTISHDVQCVVAPTFVHIPLVQAKLRNPKYVISAQNAIAKSGAFTGEVSMPILKDIGVHWVILGHSERRTYYGETDEIVAQKVSEACKQGFMVIACIGETLQQREANQTAKVVLSQTSAIAAKLTKDAWNQVVLAYEPVWAIGTGKVATPEQAQEVHLLLRKWVSENIGTDVAAKLRILYGGSVNAANAATLYAKPDINGFLVGGASLKPEFRDIIDATR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	High resolution crystal structures of triosephosphate isomerase complexed with its suicide inhibitors: the conformational flexibility of the catalytic glutamate in its closed, liganded active site. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE SYNONYM TRIOSE-PHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags	Isomerase
source organism	Leishmania mexicana
total genus	91
structure length	249
sequence length	249
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2011-01-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00121	TIM	Triosephosphate isomerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2y61A00

3W84A 3LCXA 2XFWA 1JQXA 2V0TA 1KFKA 4JDBA 2QCHA 5KMYA 5D30A 3TAKA 3TSMA 3TX9A 4Y8FA 1OFQA 3NL2A 1UUMA 3EX4A 3BW4A 4N6EA 3R13A 3W7HA 2E6YA 1B4KA 4CCDA 3NQAA 1HL2A 7TIMA 1MEHA 3GR8A 1KBIA 4UTHA 4JS3A 1TREA 2FB2A 1OABA 2ZRVA 3W7QA 5H91A 3DKJA 1WYIA 4KKXA 3M47A 4CCCA 3MWAA 4O19A 4BK9A 2RKXA 1JCMP 3LLDA 4H3DA 3S5ZA 1K03A 4O0KA 3NQCA 4CNOA 5KINA 2RDUA 4OT7A 1TQXA 5I3HA 2VFGA 4WJEA 5CPMA 3S6DA 5J5DA 2HTMA 3KRSA 4PEKA 2PE4A 3M7WA 4UR8A 1K02A 4A21A 1YXCA 4UFJA 3CHVA 3MMTA 3RLUA 3IRDA 2H3BA 3C2RA 4A3UA 3W2NA 1KW1A 3QQ1A 3MHUA 3WJYA 3AO0A 1ZAIA 4I9AA 5G2WA 3CPRA 4O52A 5CG7A 2A21A 3C8FA 2ZTKA 3PG8A 4FX7A 1P0NA 4Y96A 4ONVA 1OX4B 3LHYA 3HIJA 2I1OA 1L9WA 3TH6A 2G5WA 1ZNNA 4CNNA 2QCFA 1I2QA 3P7YA 4UMAA 3L5AA 3VNDA 2E09A 3SIZA 2NUXA 2X1UA 3HG5A 4WZHA 1NEYA 3S5YA 3EWXA 4WD0A 1OFPA 3KVKA 3V1PA 2QEZA 5AHMA 4K38A 1H7WA 3Q37A 1P1XA 4RX0A 1Q3NA 1VLIA 3O1NA 3G1SA 1FXQA 5FF7A 3G0SA 4RKAA 1XBXA 3GKFA 1FWNA 4FX6M 3BG3A 4QITA 5IBXC 3G1FA 1GQNA 3W2MA 2BSLA 1I8JA 5HWNA 4NXSA 5FF2A 3W7JA 2V2DA 1TRDA 2CLMA 5LHEA 3B04A 2G95A 1J5TA 5HJLA 3W1NA 4PA8A 4WUIA 2H8ZA 3S9YA 4GBUA 4G1KA 2C6QA 3CEUA 2PC4A 5FEXA 4N4QA 4QJ1A 3W73A 5LGXA 3NOEA 2CLOA 4IMFA 1H50A 4K37A 3KRUA 3LHWA 3STFA 3T44A 1W5PA 1OJXA 4EF9A 2WV8A 5G2HA 4MZ1A 2Y70A 5A5WA 2YFOA 5AN7A 1VGAA 4HPXA 2WNNA 1RQHA 4GC4A 3DI1A 3W7EA 3LCGA 4M6VA 2EF9A 4MKNA 1GVQA 3GYEA 5LGZA 3QZEA 1A53A 4DF1A 2QCDB 1XXXA 2HSAA 3BV4A 4FNSA 1JCNA 2Y88A 1GVSA 2RDWA 1IIGA 1BEUA 3LGEA 3LRLA 3T40A 4UTUA 3E96A 3HOJA 1GTEA 4IQLA 5GVJA 4OWGA 3VKJA 2QDHA 2BTMA 1B4EA 1F05A 4P61A 1LROA 3C2EA 4MIMA 1AW2A 5FEPA 1XC4A 3PSVA 4ADUA 3W22A 3M6YA 4ORMA 1GWJA 3DHFA 5EY5A 2QAFA 1K8ZA 3FJ6A 2NXHA 3QSRA 1VYRA 3N9SA 5LNRA 3MYPA 3BLIA 4O57A 4BI5A 3PUOA 1LYXA 1WV2A 1OFRA 3GDLA 4LV4A 1C8VA 3E12A 4OQVA 4O18A 3M5VA 1UCWA 2A4AA 3W23A 2ZYFA 3A22A 4Q33A 2P1FA 3NG3A 1HFBA 1BWKA 2GVGA 3BARA 3MP3A 3T7VA 2Z1BA 3UPWA 2YYUA 3CWNA 2E5BA 3DFTA 1VR6A 1JRCA 1ZJIA 3M43A 1M7OA 4GUHA 4XUGA 4Z1AA 4HT3A 1H7OA 1RQBA 2GVJA 2QCCA 1VCFA 1R2SA 4JTLA 2VFDA 3QMTA 1TPFA 5HINA 4O1BA 3QQ0A 4IX0A 3EXRA 3G8EA 4O54A 3UPBA 3LI1A 4XZ9A 2E6AA 3D0CA 1ZFJA 3LHTA 3TDFA 3W72A 1VJIA 4HSOA 6ALDA 3W1RA 2RDTA 1QCWA 1TV7A 3GZ3A 1O94A 1DKWA 3TC6A 1S3HA 2VFFA 4XKYA 1U83A 3SY5A 3TK7A 3NQ6A 3LCLA 1NFBA 4O4VA 5AHLA 1D3GA 1BTMA 1LRQA 3FYPA 2E5DA 4K39A 4OV4A 3E02A 3OVRA 5EA9A 1H1YA 4BI6A 2Q3RA 3NQEA 1JCYA 4LUJA 5L9FA 1ZAHA 2J88A 3LCFA 3LOTA 3RMJA 4DXVA 1W5OA 1F74A 3THAA 4LS1A 3TXVA 4JXCA 3LERA 3IIVA 4LTSA 2A6LA 3LB0A 2Z2UA 2Y63A 4TU1A 3NL5A 5C2XA 4O16A 3TR2A 2WJZA 3NA8A 1FX6A 1R30A 3S8HA 2J24A 3W2JA 2VELA 3BG5A 1K8YA 5I3FA 4M6QA 4LS2A 5F1UA 4NJIA 1Z44A 5BW6A 1J2WA 3P8JA 3UY8A 3SJ3A 4LRSA 4YCOA 2YW4A 4FX8A 1OVDA 2W0UA 4ICNA 4N9EA 5HR6A 3C4UA 1F73A 4NNCA 4JDYA 1VQTA 1M7PA 1KA9F 4LY8A 1DQWA 3N3MA 4LU0A 1VCVA 4UIOA 2CLHA 5D2VA 3BGJA 2ZA1A 3MUXA 2JBMA 3BK0A 1O5KA 1IGSA 1TTQA 3DAQA 4HSNA 3O16A 2FJKA 4RJEA 3M5XA 2CZEA 3FLUA 3BGGA 5LNSA 4WXYA 4U4MA 4N9DA 4DO5A 3P81A 2DZTA 3ATYA 1BKSA 4UXDA 1TJRA 3H54A 1FDYA 1XUUA 5HUOA 1OFOA 1W8SA 2EKCA 3TQ0A 5C55A 4WQ6A 2Y7GA 3W7OA 5CZ0A 2R14A 2QDGA 2ALDA 4JTHA 1QPRA 1H62A 3DZ1A 4WY0A 4UFMA 4JD4A 1TJPA 4XQ6A 1SSGA 1VHNA 4M5PA 3W7IA 5K7JA 5I3GA 1RZMA 5F1VA 5KTLA 1PHQA 3W3OA 4FXSA 1LBMA 2Z0IA 3LHZA 1VYPX 2QCLA 2ZBTA 3LI0A 1LCOA 4O50A 3E0IA 4RXGA 3UXDA 1PS9A 5C6MA 4RZ5A 2FB3A 1TTJA 4WXZA 4WY0F 4O10A 2C14A 3NM3A 2GJNA 1TPC1 2NX1A 4N6FA 3TJXA 3EX3A 2H3DA 2Y61A 3NDOA 1K7XA 5CPNA 1GYLA 4AF0A 3OG3A 3GX9A 5FF0A 5AHIA 2E77A 3FA5A 1NF0A 3JS3A 3P84A 4DO4A 1EIXA 2Y7FA 3C2VA 3S1XA 4M7TA 1OFAA 5F4WA 3WJXA 4BF9A 3ABQA 3KHJA 4CQAA 1MEWA 2X2GA 4N9BA 2QCDA 3GDRA 5BNKA 5G5IA 5DBTA 3G0UA 3LHUA 3S5NA 3EX6A 3ZFHA 1OX6A 1KTBA 3HJZA 3WJSA 3A9IA 2FFCA 3W7LA 1ICPA 2BX7A 1D9EA 2A1YA 1H1ZA 2X30A 3CU2A 4UFIA 3QMRA 4IX2A 2Y6ZA 1ZALA 4O4WA 4LRTA 3U2OA 3UWVA 1W37A 2QJGA 1SFJA 3DENA 4AHPA 4PL1A 1KM1A 1TYGA 1Q45A 2VFEA 3W88A 1KTCA 1M5WA 4O14A 3LXCA 3W7NA 4LV9A 1X7FA 4JY8A 1SFLA 3DGRA 4YL2A 1AK5A 5DXYA 2I14A 4Y90A 3GAYA 1OK4A 3O6DA 3N19B 4FEZA 3RF9A 1QPOA 2CW6A 5T26A 5LSMA 4QISA 1ZY9A 2AGKA 4XWUA 3BVJA 4MJZA 4ADTA 5K3VA 3QPZA 2ZA3A 3OEXA 3C6CA 4LW7A 4XKYB 4AWTA 3SZ8A 2W6RA 3B0PA 4QNWA 5CZSA 4BFAA 2QKFA 1SU5A 4UTMA 1FY6A 1LZOA 5KZEA 1AL7A 4GNJA 4JICA 1GTHA 2OT1A 5AYZA 3NXFA 1KFLA 5TBOA 3B03A 4FF7A 3TA6A 5IBXA 1U5JA 1W5NA 3PUDA 1A5SA 1NF7A 4FIQA 3L5LA 1DJNA 1SO5A 4R33A 4YWIA 4JTJA 1IXNA 3FKRA 3IVSA 5HULA 3EX2A 1YTDA 2JK2A 3M9YA 3L5MA 3PBVA 1VCGA 3R2GA 4UFHA 4IMCA 1MXSA 3V75A 3HB9A 1GG1A 1W0MA 1ZHAA 2DZWA 2KZHA 5AC6A 5G2IA 4OE7A 1UB3A 3WK0A 3W85A 1O5XA 2E68A 1T96A 1Q6OA 2CZ5A 4M7SA 2C1HA 1Y0EA 4HNNA 1FWRA 2ZZ2A 3W7GA 2WSQA 3JR2A 4UTWC 3GXTA 3I7QA 4MY1A 4UNLA 1KM2A 4UFLA 3W87A 3PSWA 3W74A 2NX3A 1H5YA 1FXPA 3ZWSA 3M41A 2VXNA 1KFJA 3PVFA 3I68A 4NXKA 1KBJA 3BG9A 3STGA 4MY8A 3UXAA 1X1OA 4LC8A 4HNTA 3R5EA 1GOXA 5EYWA 3NO5A 4NJJA 3TW7A 3A21A 1S5TA 5HUPA 3UWWA 5E0KA 1QR7A 1F6PA 2OMAA 1L6SA 4DPPA 2YCEA 4TMCA 1JCLA 3DFSA 3DFQA 3CIWA 4MPQA 3HPSA 3O06A 3QW4B 1K3UA 2OJPA 4WY0B 3VCRA 3W1QA 2P0OA 3W1MA 1KFEA 4EWND 4LOCA 4ZMGA 2YXGA 4AAJA 1EPXA 1T0OA 4UTJA 4TIMA 1SO3A 2NZLA 4AMAA 3WJWA 1RQEA 4JYFA 1OYCA 2HS8A 4K7YA 4HKPA 4LVBA 1YDOA 3TSBA 3TNOA 1KV8A 3OA3A 1SO4A 2YGYA 2DZPA 3W1UA 3W7PA 3G1HA 3LBMA 2RHGA 5G1TA 1LP6A 2AAMA 2WO5A 3LV6A 4LNYA 5ABTA 5D2YA 5KZMA 5CPLA 1ALDA 2DZXA 3B8DA 3HGRA 3NQDA 2QCGA 4X9SA 4JTIA 5FF4A 2NWSA 3NQVA 4AF0B 4AHQA 1XUZA 2ABAA 2WKJA 3L9CA 4HN4A 3N73A 5KSWA 1Z48A 3S42A 1WOAA 4UTLA 3G1VA 3A23A 4NJGA 1G7VA 4XBSA 3TV8A 3OVPA 2EAWA 1G6CA 1ME7A 4IXHA 4B5NA 3BLEA 3F4WA 4DELA 3TAOA 3MBDA 4EF8A 3R12A 4CLMA 2A0NA 1TO3A 1Z41A 3BW3A 4LT9A 4LVFA 3IEBA 4NJHA 3ZS4A 4FNRA 5F4SA 1OFDA 3TFCA 3H55A 2E5CA 2NWRA 3ABSA 4QQ3A 1S5VA 3QSTA 3E49A 1I2RA 3KRZA 3PC0A 1LOLA 3G3MA 2NXGA 4KWWA 2ISSA 2F84A 5K9XA 3M0ZA 4QSHA 2YDAA 1CI1A 2B7PA 2VFIA 3L66A 4JEQA 4Q4KA 2CLIA 1UASA 4C1KA 5LNVA 5KZDA 4CNPA 4Z1BA 1YPFA 1WA3A 3QJAA 1GZGA 2VEKA 2CLFA 3TQVA 1GPWA 3NQ2A 4AVFA 1FBAA 4LUIA 1A5CA 3MI6A 1PCWA 1SW3A 1QAPA 5D04C 3ANYA 4MY9A 3N2XA 4O15A 1RR2A 2GJLA 3N2MA 4RXFA 3TC7A 2RH9A 3MHFA 1I2PA 4BR1A 3QFEA 4IUOA 2C15A 3TMLA 3Q2DA 5LHFA 3UY7A 2G96A 1X8FA 5EPDA 5BOOA 3L0KA 1KLYA 2CFFA 4ZZ9A 4FO4A 3THQA 4BWLC 3UYCA 2ABBA 2VKZG 4K6AA 2ZZ1A 2X1RA 3F03K 3LTPA 3P74A 3UNDA 3VE7A 4OHQA 1F5ZA 5BMWA 3W7DA 3LM7A 3PB2A 2QUUA 4JTKA 4H6KA 3U8GA 3TMQA 3TXZA 5HMSA 3S1WA 1HTIA 1KM5A 1RV8A 1PE1A 1UBSA 3EWUA 2V8ZA 2FTPA 3TFXA 4GXMA 3NQ7A 1QPNA 4TMBA 4TO8A 1PIIA 2VOMA 3DH7A 3FFSA 3S1UA 1H51A 1NSJA 4I7UA 3O6CA 1B57A 2ZRUA 1I4NA 4XBKA 4AWUA 1VPXA 3UWYA 4IMGA 3YPIA 3W1XA 3FIGA 5EMUA 2PRLA 3BW2A 3LXAA 3LRMA 4O1AA 5AC7A 3W76A 2VFHA 2ZRZA 4AB4A 1XBZA 3IVUA 4JTUA 3S1VA 4MUZA 1DV7A 1W54A 4NZJA 2BXVA 2RFGA 5TQLA 2E1DA 1H7NA 2JGYA 3WK1A 3MP5A 4O11A 3GAKA 1AMKA 1VLWA 4WOZA 3LHVA 4AH7A 1XFBA 4Q32A 4DBEA 3GKAA 4GUIA 5KITA 3EKZA 2F7FA 1DL3A 4DF2A 1P0KA 1SW7A 1R2RA 4JGDA 1ML1A 4Y9AA 3BPWA 5K9CA 5EBUA 3W2LA 1H7PA 3M1ZA 3O15A 1EB3A 2C18A 4MLJA 1FDJA 4ZQMA 1O95A 4JNMA 1W1ZA 3H53A 3HPXA 1ZCOA 1V5XA 1H7XA 2ZRXA 3W2KA 3DFNA 3MYOA 1JUKA 3B4UA 4Y6GA 4QAIA 5AHFA 3PR2A 4O1DA 3KAOA 3W1LA 5U7SA 3P5YA 2ZCGA 3NL3A 1YDNA 1KTNA 1Q6QA 3LCHA 2VEPA 3QW3A 2EPHA 2YSWA 1QNVA 3LRKA 1TRIA 4JTTA 3SGZA 4MFEA 4K8HA 2A7NA 1LLZA 3HQ1A 1KFBA 1HO1A 1W5QA 3SSJA 4FB7A 5K9DA 2R91A 2YPIA 4TR9A 1AW5A 1G7UA 3P60A 3WJZA 1VC4A 2O7SA 2B0MA 4Z08A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2Y61A

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