2Y61 | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	249
structure length	249
Chain Sequence	AKPQPIAAANWKCNGTTASIEKLVQVFNEHTISHDVQCVVAPTFVHIPLVQAKLRNPKYVISAQNAIAKSGAFTGEVSMPILKDIGVHWVILGHSERRTYYGETDEIVAQKVSEACKQGFMVIACIGETLQQREANQTAKVVLSQTSAIAAKLTKDAWNQVVLAYEPVWAIGTGKVATPEQAQEVHLLLRKWVSENIGTDVAAKLRILYGGSVNAANAATLYAKPDINGFLVGGASLKPEFRDIIDATR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	High resolution crystal structures of triosephosphate isomerase complexed with its suicide inhibitors: the conformational flexibility of the catalytic glutamate in its closed, liganded active site. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE SYNONYM TRIOSE-PHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags	Isomerase
source organism	Leishmania mexicana
total genus	91
structure length	249
sequence length	249
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2011-01-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00121	TIM	Triosephosphate isomerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2y61A00

3G1HA 1SW3A 1ZAHA 2FPVA 4X3ZA 5D33A 4ADTA 4EF8A 2PRHA 2EF9A 2QJHA 5AC8A 3RNDA 3U2OA 4Q32A 3YPIA 3T40A 5K2ZA 2WNNA 1OF8A 1B4KA 1M6JA 2X1RA 5F2MA 4IWWA 4UR8A 3PS7A 4K36A 4Y9AA 3VNDA 4LV9A 1TYGA 3R13A 4DQWA 2ZRWA 1FXQA 1G7VA 1LRNA 3E12A 2X1TA 1OVDA 5G4EA 4YL2A 3UWZA 1EPXA 2VFGA 1GOXA 3P81A 4HNVA 3R89A 1WYIA 3QRHA 1FWRA 2BXVA 1FWSA 1BEUA 3LHVA 1H7WA 1L2UA 5CPLA 1P4CA 4AHPA 5LSMA 5D2YA 3O8AA 2G96A 1BWKA 2FJKA 1LYXA 3STGA 4GC4A 1IXOA 1EP2A 1WOAA 5F4XA 3HIJA 5HINA 2E09A 3LHZA 4LNYA 4HN4A 2RDTA 2GJNA 2C0AA 4UTHA 3QMTA 5LGXA 2H6RA 4P61A 5C54A 4M5PA 1VJIA 2YPIA 1GVRA 2WV8A 3A24A 3MHFA 3E9AA 1W31A 5F4SA 3UYCA 1LZOA 3MHUA 2ZCGA 2G97A 1TB3A 4QQ3A 4UFHA 1TQXA 2A5HA 4AMAA 3NL2A 1QNVA 3GZ3A 4JTHA 1O5XA 3NQFA 5G4WA 3B04A 2VELA 1TTJA 4Z0JA 2CZ5A 5D02A 3GYEA 4Z1BA 4AAJA 2VEKA 4S2BA 3STFA 3VKJA 2C19A 2X2GA 4MLJA 3KVKA 4CCDA 1A53A 1G67A 2FTPA 4MYXA 3HGJA 1KV8A 5H91A 2EGZA 1G6CA 3P62A 3NQGA 2YYUA 4WX2A 1H7PA 4LTSA 4UFKA 2JBMA 5K9DA 3CHVA 4M6PA 4UTTC 5D04C 3RFAA 4JGDA 1MO0A 2DZWA 3LLDA 3MWAA 4NT0A 1ZCOA 1VGAA 3OG3A 4UR7A 5C2XA 2GVJA 1H7RA 1LRQA 4L4MA 3LHYA 4LVAA 2ZZ7A 1OABA 4N2YA 3H54A 1H61A 1W56A 4LWWA 2FLIA 1SSGA 3N9RA 1XI3A 2C6QA 4TMCA 2YR1A 5HWMA 3NPUA 3LM7A 3VCRA 3E49A 4XBSA 1LBMA 2C13A 2E5BA 5BNKA 2Y85A 2TYSA 1KM0A 4M6QA 4ICNA 4QNEA 5J5DA 3NQ2A 2ZZ5A 3LB0A 3M1ZA 3SGZA 4JIQA 3TJLA 1OFOA 1DQXA 3P5YA 4UTWA 5CPNA 1SQ7A 3LGEA 5DELA 4A3UA 3GKFA 4O50A 5KSWA 2VFEA 1JR1A 3QZEA 3CEPA 4S1FA 1KV5A 3GK0A 2EAWA 2QCMA 4NJKA 2WJZA 3S6DA 4NX0A 3U6WA 4WD0A 4R7JA 3N14A 5LNUA 1A5CA 3HG5A 4FX6M 3W2MA 3SY5A 5KINA 5D30A 2A21A 2A7NA 4FX8A 1FY6A 1VLWA 2CLFA 2H90A 1ICQA 1QPOA 4JD4A 5GVJA 2ZYFA 4ZQPA 1JVNA 3NOEA 3L0GA 4WQ6A 4O1BA 4ADSA 3PWAA 1U5JA 1ML1A 3NXFA 5F1VA 2ISWA 2QCEA 1FBAA 4O11A 2Y7FA 1SPQA 2PE4A 3M5XA 2C14A 4XZ9A 2FB2A 2JGQA 1D3GA 4O1DA 1Y0EA 4JS3A 3CC1A 3E96A 4PC8A 4BI6A 3EX1A 3G22A 1TRDA 2HS8A 3LX9A 4MUZA 1XCFA 2GVLA 1KFJA 5FF2A 5SWUA 3DH7A 4H4IA 3NQCA 4JX4A 4FNQA 5CKSA 3G3MA 2VENA 3I7SA 3MBDA 4WUIA 3TDFA 6TIMA 4Y8FA 2F7FA 4HSNA 5BRBA 3O6YX 2J9YA 4A22A 3DBPA 2QCLA 3UNDA 3MJYA 1W5OA 1QPRA 2ISVA 2CLLA 3C52A 4U4MA 1KM5A 3I7QA 1Z42A 5BOOA 3SIZA 2OJPA 4Z08A 1IIGA 1VHCA 3S5ZA 3F03K 1FWTA 3I7RA 4I7VA 5LHEA 5AHMA 1JUEA 3LBMA 1LORA 3CPRA 3NQVA 1QMLA 2CZDA 3PBYA 3HGOA 1RZMA 2NXGA 5K4XA 1VCFA 5G2IA 1OYCA 1YLVA 4POCA 4UCGA 3F4NA 3QF0A 2ZA3A 2V5LA 3W73A 4NNCA 3MBFA 3UY7A 1GG1A 2Q3RA 3G0UA 3PY2A 1H7XA 5F2GA 4CNPA 3PG9A 2QJGA 5D03A 3QW3A 3HG4A 3FKKA 1ZAIA 2BZNA 3C61A 3L0NA 4L4LA 3H53A 3W9ZA 3CB8A 2QUVA 3A9IA 4RLIA 5CZTA 1JQXA 1AG1O 3TQKA 3LXBA 2Y70A 5HMSA 3W1PA 2ZRUA 3R8RA 3BPWA 3TV8A 1ZJIA 3N9SA 1JCLA 3N2MA 4DPPA 1HO4A 1OX4A 5AYYA 3NGJA 3KAOA 3ZWSA 3P80A 3GAKA 1JUKA 1C29A 4MOZA 3W2JA 2A2IA 3H55A 1GVQA 2IQTA 1BKSA 1OFEA 2PC4A 2NZLA 4UFIA 5DCEA 5H2ZA 3EXTA 4DEFA 2I14A 2I9EA 4NZJA 3UY8A 2V9DA 3W7KA 1UUOA 3WJYA 1WX0A 2BWGA 4TIMA 4EIVA 1DOSA 1PVNA 1F5ZA 2X1SA 3SECA 3RU6A 2TPSA 3G1AA 1ZENA 5BMWA 3DKJA 3B06A 3W1NA 4FX7A 2Z0IA 3GX9A 5E93A 3NM3A 4JYDA 1XBYA 1GG0A 1TSIA 1KTCA 3W22A 2Y88A 1FCVA 1WDWA 3BARA 3NDOA 1ZAJA 1KTBA 3W76A 3M5YA 2CW6A 3LTYA 1TPDA 4XTDA 4BI5A 1FDZA 2ZZ3A 3TFXA 2WSRA 4NX5A 2EHHA 4N02A 2QUUA 4O10A 1P0NA 3GDKA 1LCOA 4EOUA 2BLEA 3KVJA 2H8ZA 4HIBA 4IPJA 3WFAA 3MI6A 4RCXA 2C3ZA 3VE9A 3T44A 3HMJG 1A5AA 4YMZA 1EP3A 4K7VA 5F2IA 1VYSX 4AHQA 5D05A 5G1YA 1LOQA 3ZS4A 2NUWA 5DN1A 2DZTA 2V5BA 1I2QA 4N6EA 4QNWA 3UWYA 1TV5A 2DJLA 1JJKA 1K8ZA 2CWNA 3G18A 3HPXA 1T8XA 4O15A 1H7NA 3TX9A 4AH7A 2LLEA 3TU9A 3GKAA 4FNRA 3TXZA 5I3JA 1LOLA 3LOTA 4IJBA 1FDJA 4TR9A 1TV8A 5LHFA 3LERA 2A6NA 5D32A 1RPXA 1DBTA 4LC8A 4CCEA 1VZWA 5DY3A 3L9CA 4JX5A 2NV2A 1PHWA 2CLKA 1DV7A 5FF0A 2Y7EA 4O14A 3DFPA 3LCHA 3EWUA 1ZHAA 2Y61A 4O16A 3L0KA 3EWYA 3HPSA 1AW2A 4I7WA 4NNBA 4GWEA 3W7NA 1SZEA 4WY0A 4FNTA 1NEYA 4NXKA 1MEHA 1V5XA 2ATSA 2GUUA 2C1HA 1Z41A 3GXPA 1LLWA 1B57A 4RR4A 1HO1A 1O94A 5CZSA 4JTFA 2JGYA 5K9CA 3PB2A 5LNWA 2NUYA 3UD6A 2ZZ2A 5ABTA 5A5WA 2ZZ6A 4XBKA 1DJQA 4LVGA 3N3MA 3UPBA 3MMTA 1DKWA 3TAKA 3A5FA 3GXNA 3GR7A 4CCCA 3B0VC 3JRKA 4MZ8A 4YCPA 3TNOA 3GR8A 3W7EA 1VLIA 3CQ0A 4A2RA 2J24A 2QR6A 2VEMA 3MP3A 4P2VA 3S8HA 1H1YA 3DHFA 3W7OA 4DO6A 5AC6A 2BTMA 3O6CA 4X9SA 1FUYA 3NA8A 4JYFA 3TC6A 3ABOA 2FPYA 3LXAA 3P8IA 5C55A 3O05A 1W8SA 4Z1AA 2CLMA 3PBUA 2PRMA 4RZ6A 5D2WA 4CNNA 1QOQA 1GTEA 4HT3A 4UTKA 3LTSA 3NQAA 1Q6OA 1WXJA 3TQVA 2FPTA 1QDSA 1SU5A 1KM2A 1DORA 3A23A 3N2XA 1WAUA 1XBXA 3GNDA 4C1KA 3CWNA 2VEIA 2ZFAA 5AHLA 3ZFHA 3IV3A 1MEIA 4WY0B 3EXRA 2VFHA 1TO3A 1LTDA 4ZMGA 5HQEA 5EL1A 1MZHA 4JY9A 4N9CA 5K9XA 3W1LA 3IGXA 4OBTA 5KTLA 2QCFA 2VC6A 2ZRZA 3NG3A 3BLIA 3NL6A 4LS1A 3W7CA 1XKYA 3BGJA 4X2RA 3QEZA 3L5LA 3Q37A 1CW2A 4ZQNA 2QCGA 2ZA1A 4O54A 4ZL1A 3N19B 3W2KA 4HPJA 4JTSA 1FDYA 1F05A 1JCXA 2ALDA 2Y6ZA 1EWDA 3SW6A 1YDVA 4UUIA 4PH6A 4FHAA 1BTMA 2GQAA 2QUTA 5HR6A 3PSVA 4JTJA 2TRSA 4D2JA 4CNOA 3S5YA 1RQBA 2E6DA 2YYTA 1SO3A 2YSWA 4PL1A 4JR5A 2ZTKA 1TRIA 5E0KA 3UWUA 1ZNNA 2O7SA 1JCNA 4LVFA 3WJSA 1JCYA 3HB9A 1VYRA 1TPB1 4OQVA 3TSDA 3TSBA 1NSJA 1VPXA 3E0IA 4MKNA 3S5NA 5LNSA 2QEZA 3ABSA 5DXYA 2A4AA 2W6RA 1W0MA 4JTTA 5FI8A 1J5TA 1THFD 1W5QA 3TIMA 3GXTA 4NVTA 4ZQCA 3MW7A 5KMYA 2J6XA 4MJZA 1TJRA 2HS6A 2ATMA 1LBLA 1TPEA 1YDOA 1FCBA 4M7SA 1RQHA 4JTGA 1B9BA 5CPOA 3SFKA 3DZ1A 1M5WA 8TIMA 1TCDA 1K8YA 1H50A 4IMDA 1K7EA 5AOUA 1OX5A 1OFAA 3G1FA 1NVMA 4MY1A 3EB2A 4J9JA 4PCFA 3HPZA 3OHIA 5EY5A 4FO4A 2R91A 5D2VA 1BWLA 4IGHA 3BW3A 3DFNA 3NEVA 4K7YA 1H62A 3JR2A 3O1NA 1NF7A 2JK2A 2ZDRA 1SO4A 2V8ZA 2ABBA 3L5MA 4FNSA 2GQ9A 4UFMA 1O5KA 3PG8A 1IIHA 4AWUA 3LDVA 4DF2A 4ADUA 1PL9A 1KFEA 2DZVA 1R46A 3PVFA 3O63A 3RMJA 3KRZA 5G2HA 2ZRXA 4RZ4A 1W3NA 3SI9A 3MI3A 3TMQA 3U8GA 2DZXA 4ZQOA 2V81A 3EX2A 5J5RA 2NXHA 1NFBA 3ATZA 3UWVA 4QJ1A 4DF1A 4EVZA 2PRLA 1XFBA 4DO4A 4IPIA 5HWJA 4YWIA 4C1LA 5HUPA 4BR1A 3HQ1A 1S5WA 1OF6A 2QJIA 2ZA2A 2R8WA 1X8FA 2V2CA 3GLCA 1DJNA 3TXVA 3C4UA 3R2GA 2WNZA 3C8FA 1G7UA 1QOPA 4FNUA 1TQJA 3LHWA 4BF9A 3BG9A 5LGZA 3BG5A 1WOBA 3W7LA 5L9FA 3QPZA 3BLEA 1KA9F 5IBXC 3QJAA 3T4CA 2AQWA 2YCEA 3V1PA 4JX6A 1HTIA 5AB3A 1TPUA 4Z0SA 4FXSA 3FS2A 1SZNA 3RLVA 3GDRA 3M47A 3DU0A 4KWWA 4DELA 4Y6GA 3M44A 3GIYA 3FJ6A 4GRSA 2HTMA 1TPFA 1XBZA 2CLIA 3G1SA 3A22A 1SUXA 4ONVA 3W87A 4K8EA 2CZFA 1R30A 2VFDA 2Y7GA 4XUGA 5I3KA 1GT8A 3GNNA 3CEUA 3OA3A 2WKJA 1LRTA 1X1OA 1SFLA 2QCNA 1OG0A 1O60A 2YGYA 3W70A 3S42A 3NPVA 1TPVA 4MFDA 2B7PA 2V2DA 4UTJA 5EA9A 2JKEA 4TU1A 5AHFA 2VFFA 3STCA 3TR2A 5I3IA 4LV4A 3C2OA 5CZ0A 3LHUA 1GZGA 3O15A 1PE1A 5AHIA 1H63A 1G4TA 1R2RA 3N34A 4MJMA 5HWNA 2P1FA 1X1ZA 4O0ZA 2YZRA 5K7JA 3NM1A 1TTPA 1JCJA 3I65A 4N9DA 1K7FA 1JRCA 2VFIA 4JTEA 1RD5A 4UC5A 1TPWA 3EXSA 3EWZA 2DZSA 3HOJA 3NQEA 3C0JA 2FQIA 4UIOA 3W72A 1H5YA 3GAYA 3EKZA 2CLOA 1T99A 3W75A 4AWSA 5D2XA 3G0XA 3USBA 1VHNA 1ADOA 3OBKA 4YLWA 4KWVA 2BX7A 3SJ3A 4UMAA 3G1XA 4JICA 1K3UA 1L9WA 3B4UA 3AJXA 4LRSA 4O17A 2JKPA 3G8RA 4NQ1A 4E2DA 2OZ0A 3GDTA 1PV8A 1XXXA 3LBCA 3ABQA 5FEPA 1Q6LA 4Q4KA 2ZRVA 1KTNA 5C6MA 2E5CA 1XUUA 1Q3NA 4YXGA 3P8JA 1L6SA 2V30A 2YXGA 2GQ8A 3VI2A 4LS0A 2E1DA 1C8VA 1OK6A 3DFSA 5HR7A 3S0CA 3MHGA 3MYPA 5C5YA 3DFOA 1XDMA 4AEOA 2X16A 3THAA 4CQAA 1ALDA 4LUIA 3NZ1A 2DU2A 5G5IA 4LC6A 4TMBA 3BW4A 5MHBA 2E5DA 1PIIA 1OYAA 4DF0A 2B7OA 4E38A 2QDHA 4IXXA 2NX1A 3LV6A 2FIQA 3WK3A 5EMUA 1D3HA 2XFWA 1EA0A 5CPMA 4K6AA 2XN2A 3W7IA 1ME7A 1T96A 2GJLA 2RHGA 2E77A 2O7QA 5EBUA 1KLYA 2Q8LA 3QMSA 3TQ0A 2DJXA 3T78A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2Y61A

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