2Y61 | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	249
structure length	249
Chain Sequence	AKPQPIAAANWKCNGTTASIEKLVQVFNEHTISHDVQCVVAPTFVHIPLVQAKLRNPKYVISAQNAIAKSGAFTGEVSMPILKDIGVHWVILGHSERRTYYGETDEIVAQKVSEACKQGFMVIACIGETLQQREANQTAKVVLSQTSAIAAKLTKDAWNQVVLAYEPVWAIGTGKVATPEQAQEVHLLLRKWVSENIGTDVAAKLRILYGGSVNAANAATLYAKPDINGFLVGGASLKPEFRDIIDATR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE SYNONYM TRIOSE-PHOSPHATE ISOMERASE
publication title	High resolution crystal structures of triosephosphate isomerase complexed with its suicide inhibitors: the conformational flexibility of the catalytic glutamate in its closed, liganded active site. pubmed doi rcsb
source organism	Leishmania mexicana
total genus	91
structure length	249
sequence length	249
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2011-01-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00121	TIM	Triosephosphate isomerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2y61A00

1L6SA 4K39A 4MYAA 3FJ6A 2A7NA 3UWYA 4ML9A 5C6MA 3LERA 3TROA 2OZ0A 2NV1A 2X2GA 4HKPA 1P0KA 3IVUA 1BWKA 2R94A 4M6VA 4FNTA 4GWEA 3TXZA 4PCFA 1SZGA 4UTMA 3O6YX 1KFCA 2YX0A 1AL7A 2V82A 3INPA 2OT0A 2FIQA 1JULA 3GNDA 3NPUA 4MZYA 5G2WA 4CCDA 4KFPA 2QDGA 2J88A 4IX2A 1SZFA 3NA8A 4EIVA 1DJQA 1VR6A 2WSQA 1RVGA 1KM2A 5HWMA 3BLEA 2LLEA 3W76A 1ZALA 4RZ5A 2Y63A 2ISSA 4LWWA 4IMDA 1IXOA 1OFPA 1QR7A 4LV9A 5AOUA 3QC3A 3V75A 4RV8A 4N4QA 3CEPA 2RDWA 3LRKA 3PS7A 3TAKA 3TJLA 3BG5A 1OK4A 4O1CA 3NQGA 3NL3A 5T26A 1OG0A 3FKRA 3SI9A 4JXCA 1Q6RA 3C2EA 5D30A 1JCMP 2H3BA 5AFDA 3GX9A 3QSTA 1LBMA 1J4EA 2CLLA 5LNWA 2Z6IA 3GAKA 3EX4A 4MPQA 2E5CA 4CNPA 3W7RA 1TJPA 1JCLA 4KWVA 4WY0B 2QAFA 4XKYB 1OFOA 4QITA 3M5ZA 1ME8A 3KXQA 3DXIA 2JK2A 3UZ5A 3A5VA 1ZAIA 3DZ1A 5EKYA 4BF9A 4AH7A 3UWZA 2E5BA 1G4TA 1WBHA 4B5NA 1H62A 1V5XA 1I4NA 2YDAA 2A0NA 4JYFA 4O13A 2FFCA 2NX1A 3B0VC 2JGYA 1GYNA 4JN6A 1WBJA 1A53A 3LBCA 3UWWA 1GVOA 3W7MA 4O50A 3GZ3A 4LRTA 3W1PA 1TCDA 2QKFA 5F1VA 1LROA 1KM6A 2RHGA 4UNLA 3STEA 3DFOA 3TNOA 2ZRXA 3S0CA 4O4VA 2B7QA 4WXZA 5F4XA 1GPWA 1N7KA 2VFGA 4Z1BA 2CLIA 3QEZA 4IX0A 1TPUA 4JTLA 3QRHA 1WYIA 1W3TA 3HPXA 5HMSA 1RR2A 4OE7A 3SIZA 2QCHA 4A22A 3UPBA 3I68A 3W23A 4S2CA 5LHFA 3U6WA 3KVJA 3TW7A 2HMCA 1W37A 4TR9A 4CQAA 2YW4A 4IXXA 2X1UA 2Y6ZA 2E6YA 3SSJA 1Q3NA 1I2OA 2H90A 1KFKA 2ZZ1A 3Q2DA 1VHCA 5L6UA 3TDFA 5K2ZA 3TK7A 1J2WA 2QEZA 2A5HA 3RU6A 1JCXA 1XKYA 5AHFA 1SO6A 3WFAA 3B03A 1OX4B 1SU5A 1UCWA 4UTKA 4ZQRA 8TIMA 1O5KA 1QPOA 2DZUA 2ZCGA 3PC0A 5G1YA 2C18A 2GVLA 5LNRA 2QUVA 4AWTA 4FXRA 4RR4A 1HO1A 1FCBA 2NX9A 2YFOA 2QJGA 5K9XA 1VCGA 5FF4A 1H7WA 2JGQA 4HT3A 3EEGA 3C8FA 5LZLA 1LBFA 5AHIA 1XFBA 1E51A 2FQIA 2WO5A 4HSNA 1JQVA 3OIXA 5DBTA 2A6NA 3QZEA 3MUXA 5AYYA 5BW6A 3ZWTA 3Q37A 1W54A 3CWOX 3P74A 3ELFA 3M43A 3MI2A 3S5ZA 2H8XA 3EWBX 4BR1A 1VQTA 4JY9A 3HGOA 4O52A 1R46A 1ZY9A 1TMHA 3I65A 2JKEA 2X30A 5TQLA 1LYXA 1PIIA 4L4LA 3W7DA 4JY8A 4LVFA 4QISA 3HQ1A 2VFDA 4OT7A 3M7WA 2A7PA 5TBOA 4NJJA 2V2HA 4CLMA 3P7YA 5J5DA 3N9SA 3HG4A 1JQXA 1Q6OA 1LBLA 2B7OA 4UTUA 4N9DA 4YMZA 3MHGA 4JD4A 5G2IA 1WOAA 4GC4A 2QF7A 2ZZ2A 3GR8A 2J27A 5BNKA 5KITA 3MHFA 2DU2A 1YADA 3LOTA 1M7OA 3DI1A 4K8HA 4RZ4A 2WOQA 3LCXA 4H6KA 1FWRA 1L6YA 2D73A 3G24A 3QMSA 3W2KA 3W72A 1QNVA 2TSYA 1RD5A 3UY7A 3TSMA 3L0GA 4AF0A 2ZZ4A 2VFFA 1TPDA 2J9ZA 1CW2A 1CX9A 2P10A 2FJKA 3ZS4A 2WPBA 5HR6A 3W7LA 4M7TA 3EWYA 5DY3A 4QAIA 1OFQA 2QCLA 1JUKA 1AW1A 4A2RA 2HSAA 4LVAA 1W8SA 4GXMA 4R34A 1M6JA 1IIGA 4N9CA 1XC4A 1OFEA 4JTGA 3LCHA 1K02A 1PE1A 5HNRA 1VLWA 1RZMA 3GXTA 4FX6M 5G2HA 1S5WA 3C2FA 4FNRA 3EXSA 5AHMA 3OBKA 3CT7A 1UUOA 4U4MA 3N19B 2G5WA 4O8RA 3NQFA 1A5BA 2VC6A 3W88A 1AMKA 3LXCA 1AK5A 3GXNA 3GK0A 5CPOA 4DELA 3G1SA 3NQMA 2V5LA 2CZ5A 3TFXA 1SZNA 4Y96A 3WK3A 2CLFA 1VS1A 4KFNA 3NO5A 4UXDA 5EL1A 3VE7A 5FF2A 1OK6A 4G1KA 1ZJIA 3EX1A 1YPFA 1W31A 2G97A 1L2UA 3LHWA 2F84A 1VYPX 3BGJA 1MXSA 2RH9A 2VFIA 4UC5A 1SSGA 3TSBA 4ZQOA 5I3JA 1KTCA 5LKYA 2Y70A 4W9TA 3H54A 3MP5A 3FYPA 1P0NA 4NNAA 4Z1DA 2J6XA 1TQXA 1X1ZA 2ABBA 2ZDRA 1LLZA 3BLFA 2GJLA 2TMDA 2QUTA 4YWIA 5HULA 2CLKA 4JYDA 5L9FA 1H63A 4XZ9A 3M47A 3UZJA 1I8JA 4GUIA 2DP3A 4JGDA 3S5YA 1XDMA 3G22A 3TC7A 2QAPA 2C13A 4ZVJA 1OYCA 3ABSA 4CCCA 5DN1A 4AXKA 3I7SA 3WJWA 4JX5A 2RKXA 4EF8A 2TRSA 1NF7A 2CLOA 3G8EA 1KLZA 4LW7A 4FEZA 3B04A 4LVGA 3KHJA 3W7CA 2VFEA 4LU0A 3QYQA 3GDLA 4HNVA 4X9SA 1BTMA 2ISVA 2QCDB 5D33A 3W22A 2YYUA 3LLFA 1OX6A 2VEKA 1DHPA 1VHNA 4JNMA 3LI1A 4JYEA 1AW5A 5IM51 3M5YA 3GIYA 1OFRA 3LHUA 3LM7A 1LZOA 3LCWA 4O1AA 4PH6A 4IMFA 2NUYA 1ML1A 3N2MA 1JUEA 3IIXA 1W0MA 1KA9F 2H3DA 4DXVA 5LNVA 1G7UA 1DKWA 1FXQA 4E38A 1FWNA 3O07A 4NJGA 2VKZG 3NPXA 4MLJA 5K3VA 1K7XA 1TIMA 4WOQA 5F2LA 2OCZA 4JTTA 3SZ8A 2DZVA 4ALDA 1Q45A 4IUOA 2ZZ6A 4O11A 3UYCA 1W5PA 1NF0A 3M44A 2X1RA 3OVRA 1F74A 2EPHA 4ORIA 1G6CA 4WXYA 4JTUA 2OJPA 2C6QA 3HG5A 3CIWA 3UWVA 4UTJA 4O28A 3PUEA 4MOZA 1NEYA 1JCYA 3KAOA 4PL1A 2Y7GA 2V8ZA 4IXHA 3P84A 1GG0A 3N2XA 2QCNA 1KM1A 2Z0IA 3TV8A 1H7NA 3YPIA 4EVZA 3QW4B 3LV6A 3TSDA 3L65A 3E12A 3G1HA 1LRNA 2AGKA 1HG3A 3G3DA 5D02A 3NVTA 1TYGA 5EA9A 3O6CA 4JEQA 1Z44A 3PR2A 4AWUA 3NQVA 1GWJA 4NJIA 5K9CA 4O4WA 3S5OA 3DI0A 4MIMA 1MEIA 3NPWA 5EBUA 3GDKA 3GDRA 4MZ1A 5DCDA 3B05A 2DZWA 1EIXA 2JBMA 3BPWA 1FXPA 3C0JA 3S5NA 1C9DA 3GVGA 1TPVA 1LRQA 2ZA2A 1EWDA 3NAVA 3NQ8A 2DZXA 4JTFA 1JJKA 5FF0A 1YTDA 2QUUA 2EGZA 3UXDA 4NXKA 1W5MA 3HBLA 5FF7A 5U4NA 2TYSA 3OG3A 4UMAA 3T40A 4QIUA 1NFBA 4Y6GA 4MY9A 3PM6A 1LLWA 4WY0A 4L4MA 5G4WA 1FDZA 2NV2A 4AB4A 4NUWA 4XKYA 3TQKA 4FNPA 3VNDA 4JIQA 4BI5A 2Y61A 3W1UA 3NOEA 1KBIA 4FX7A 2E6AA 3UD6A 2ZRUA 4I7VA 3NG3A 4UTTC 4GJ1A 2YYTA 3AJXA 1MEHA 2NXIA 2Q3RA 2XN1A 3FOKA 1U83A 3QF0A 3LHYA 3GB6A 1CI1A 3W7NA 4AVFA 1ME9A 1R30A 2HTMA 3TA6A 1SO4A 1K3UA 2J9YA 3CM4A 2FLIA 3L66A 4IPJA 1TV7A 2CW6A 1DJNA 4K37A 3OVQA 1ZAHA 1F2JA 5FI8A 5HQEA 1XBYA 4LUJA 2E6FA 2BSLA 5G4EA 3W7GA 4UMCA 5J5RA 3LX9A 3PULA 5HJLA 2PRLA 3NR0A 2OT1A 3W3OA 4DBEA 4MY1A 1LOLA 2ZZ3A 2GJNA 3G3MA 5DBUA 5KINA 1TRDA 4MZ8A 5BMXA 4DBDA 1A5CA 4WY0F 1ADOA 1GYLA 4HPJA 1VGAA 2Z6JA 3P8IA 3ATYA 4UTTA 3KVKA 4P61A 3TU9A 4MFEA 1VLIA 4KFOA 1Y0EA 1VPXA 4DF1A 1RQHA 1VCFA 5C54A 1XUUA 2A7RA 3NQ7A 2W0UA 3PB2A 4I7WA 3PF3A 5DCEA 5FEWA 4OQVA 1P4CA 3W75A 4E2BA 4RCXA 4RJEA 2G96A 2C0AA 1HFBA 3L2IA 4I9AA 3DH7A 1KTNA 3ZFHA 3EKLA 3N14A 2WSRA 2C16A 4MYXA 1OX4A 2X1SA 2DJLA 1H7XA 4Z1CA 1SPQA 2QCFA 3KRZA 2Q8ZA 3ATZA 4NNCA 1OJXA 4QSHA 2W6RA 4P2VA 5AHEA 1X1OA 3UNDA 1W1ZA 1JVNA 1ZAJA 2NXGA 4OU1A 3BLIA 3TH6A 3LTSA 3A23A 2KZHA 1F05A 3VCRA 2PE4A 1OF6A 1YTKA 4CNNA 3KRUA 4H4IA 4NQ1A 1KM4A 4E2DA 3SECA 3CEUA 4UUIA 3PSVA 4ZMGA 1I2QA 3A5FA 4M6QA 1KW1A 1QO5A 1KM3A 3BV4A 1R2SA 3MBFA 1QWGA 3W1XA 1HO4A 1WAUA 2ATMA 3BW4A 4K7YA 3C6CA 3M41A 3W1AA 4MVAA 4PTNA 3GNNA 1C8VA 3W2JA 5C5YA 3TJXA 2I9EA 1KBJA 3EXRA 1H51A 4Z08A 2AAMA 1PCKA 3TX9A 2O7SA 1PL9A 1FWTA 5LNSA 4O10A 4N9EA 1ONRA 4TMBA 3WK2A 1FQ0A 5D32A 1R2TA 4M19A 1PHWA 2V2DA 5H2ZA 3BVJA 1SO5A 4QJ1A 2GUUA 3TKFA 1XBZA 1I2PA 2I14A 3IEBA 3QMTA 3HIJA 1SW7A 1RQEA 1VYSX 3OVPA 4FF7A 3I7QA 3DENA 3HB9A 3NNTA 3CU2A 3IRDA 3IGUA 3LHVA 3DHFA 3W87A 1VZWA 1EWEA 1QPQA 3MI6A 5CPNA 1ZNNA 3L68A 2DORA 2FPTA 3PBUA 3QFEA 3SGZA 3IVTA 2J9XA 3C3NA 2UV8G 1IGSA 3WJSA 2QCMA 5D05A 2RDUA 3NQEA 3UQNA 4EF9A 4I7UA 1R47A 3TQ0A 1TV8A 2A4AA 4O57A 4IMEA 3SR7A 1H50A 2W79A 3USBA 2HS8A 2WV8A 5CGQA 2WNQA 4ADSA 1QFEA 3TUUA 2BXVA 3RLVA 1TPB1 4OV4A 3A21A 2Y85A 1NAL1 3STGA 2E6DA 4LNYA 4FNSA 4ZQPA 2ALDA 1SFLA 1YDNA 2A21A 2XN0A 5FEZA 1GVRA 4FHAA 1TTQA 4DQWA 4NZFA 1XI3A 2GVJA 5D2TA 4IWWA 1SR9A 2YW3A 2QDHA 5AC8A 5DELA 1KFEA 4YCOA 5BOOA 2EAWA 1F73A 3QM3A 3O05A 4DPPA 3HMJG 1KFLA 1ICQA 1YDOA 3M5XA 4TO8A 4O15A 2BLEA 4O19A 1O95A 1WQ5A 4LC6A 3BW3A 3E9AA 1TV5A 1D3GA 5KZMA 2CLHA 3G0SA 4Y9AA 1EP1A 4HSOA 4AHPA 3RNDA 1H7RA 4RXGA 4LVBA 3B0PA 4UFJA 1K8ZA 3BO9A 3LTYA 1G4EA 4EWND 1DL3A 1G7VA 1GZGA 2V9DA 1EPXA 4UFHA 1QAPA 3STCA 1EUNA 1QOQA 5KTLA 3EWUA 2VELA 1Q6QA 3NPVA 3SGUA 4A29A 3BARA 2ZRVA 1B9BA 4LV4A 3W7IA 1TPEA 1ME7A 4NX5A 5D04C 2FB3A 3LLDA 4ZQMA 2V81A 3HOJA 5F2MA 3DFPA 3TXVA 3N34A 3EXTA 3S1UA 5DXYA 3C4UA 1OVDA 4LVDA 2DZSA 3UXAA 2QCDA 3P60A 3CQ0A 2JKAA 4NX0A 3W1RA 1YPIA 1SQ7A 1SUXA 4IJBA 3N73A 1R2RA 3S1WA 3EX2A 5SWUA 3FA5A 1ICPA 1ZFJA 1OABA 1TPFA 3C2VA 1TTPA 1YXDA 4RK8A 1IXNA 4R53A 1YTEA 4R7JA 1FUYA 5AHLA 1AW2A 3L5LA 1H7PA 3MWAA 3L0NA 5KZEA 3W1MA 3G18A 4J9JA 4AWSA 2CZDA 1HL2A 1QMLA 1PV8A 1RV8A 4QNEA 3CWNA 3DFTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2Y61A

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