2ZA1 | Genus

Total Genus 102

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	102
sequence length	318
structure length	318
Chain Sequence	MGFKVKLEKRRNAINTCLCIGLDPDEKDIENFMKNEKENNYNNIKKNLKEKYINNVSIKKDILLKAPDNIIREEKSEEFFYFFNHFCFYIINETNKYALTFKMNFAFYIPYGSVGIDVLKNVFDYLYELNIPTILDMKINDIGNTVKNYRKFIFEYLKSDSCTVNIYMGTNMLKDICYDEEKNKYYSAFVLVKTTNPDSAIFQKNLSLDNKQAYVIMAQEALNMSSYLNLEQNNEFIGFVVGANSYDEMNYIRTYFPNCYILSPGIGAQNGDLHKTLTNGYHKSYEKILINIGRAITKNPYPQKAAQMYYDQINAILK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural Basis for the Decarboxylation of Orotidine 5'-Monophosphate (OMP) by Plasmodium Falciparum OMP Decarboxylase pubmed doi rcsb
molecule tags	Lyase
source organism	Plasmodium falciparum
molecule keywords	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus	102
structure length	318
sequence length	318
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date	2007-09-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2za1A00

1G4TA 2ZBTA 2QJGA 3LLDA 4MLRA 4Y6GA 2ZRZA 4ZQMA 5AHMA 2YZRA 3FOKA 5F1VA 4G1KA 4MYAA 2YX0A 1UCWA 3TIMA 3NM3A 1A5SA 2YFNA 1UUOA 1FY6A 4K36A 4XBKA 4Z1BA 1FCQA 2J9YA 1T8XA 3LHYA 3C52A 4ZZ9A 2QCDB 4XWUA 4BR1A 4JY9A 1JCLA 1TRIA 2J6XA 3PM6A 3NPVA 1ME8A 5K9DA 1A5AA 2E09A 4O8RA 3KFTA 4IMFA 1ZY9A 4X9SA 3A5VA 4E2DA 2ATMA 4RJEA 2HS8A 5DBTA 1PL9A 1SW3A 1YPIA 3LCWA 4HPJA 1OFOA 3FIGA 3NQFA 5AYXA 2HSAA 5K9CA 3WJSA 3H53A 4D2JA 4RXGA 4JNMA 4LNYA 1TQXA 3CHVA 3LCXA 3NL5A 1RQEA 5LHEA 1P4CA 1GG1A 3LB0A 3W76A 5HUOA 1O95A 4JN6A 5HR6A 1WYIA 2Y7DA 5D2YA 2B7PA 4KFPA 1FCUA 5BOOA 4UTIA 3W7RA 4ICNA 3E0IA 4BI6A 5AN7A 3GAYA 3L5LA 1SO5A 3GB6A 3GVGA 4RZ5A 3EKZA 3LI0A 2PE4A 2A6LA 1KM6A 1TTPA 4HIBA 4GFSA 2VFGA 3QZEA 1B57A 2XN1A 3OVQA 4TU1A 1OYBA 4OE7A 1QWGA 2C18A 1QMLA 4JEQA 4JGDA 4UTKA 5D09A 1CX9A 3QJAA 1H51A 3A23A 3W2UA 2CW6A 1VC4A 4LWWA 4Y96A 1YPFA 1F74A 3LTYA 5DCDA 3C4UA 4NVTA 3LRKA 4QITA 1W5OA 3C3NA 3LERA 3KRZA 3H54A 2NV2A 1ONRA 4MOZA 4Z1AA 5LNUA 4QJ1A 5D38A 4UFIA 1KBIA 1YTEA 4WY0B 2DZWA 4HKPA 3W3OA 3L2IA 2CZFA 2NX1A 3HF3A 3HG5A 3SY5A 3TC6A 3W7PA 3DBPA 3VE9A 3MBDA 1O5XA 1Q6RA 1TYGA 2Q8LA 4DELA 4EIVA 3NQAA 3O07A 5LNSA 5EL1A 1HG3A 3O15A 2JKPA 4RK8A 5CKSA 4Z0SA 3QRHA 4DEFA 5D2XA 2JGYA 1TPWA 3HG2A 1R2SA 5D33A 4JIPA 1QPQA 1XI3A 3TAOA 1VR6A 5E0KA 3AJXA 4CQAA 4HSNA 5F2GA 3TC7A 3JR2A 4NZFA 2NXHA 1S3HA 2CLOA 4UTTA 5FEXA 4JTSA 1PHWA 2EAWA 3HGRA 3S5YA 4EWND 4Z08A 3A21A 5DY3A 1SZFA 3P61A 1H60A 2UV8G 4RR4A 3LM7A 3W70A 1QOPA 2V5BA 4R53A 1TV8A 3S1XA 1TPEA 3EB2A 1F73A 2OCZA 3O06A 4NXSA 3EXSA 2ABBA 5TIMA 3R13A 1DV7A 3LDVA 4NU7A 3I6RA 2YDAA 1G69A 3P62A 1FXPA 1W8SA 4RKAA 4DF2A 1OFDA 5BRBA 1VS1A 3MMTA 4RZ4A 3C61A 4WOQA 4NJHA 3ANYA 2X1SA 1NF0A 4AHPA 1MZHA 1G67A 2YW4A 3TK7A 3MHFA 1I45A 3RNDA 1DBTA 3CM4A 5LZLA 3HPZA 2I9EA 2C19A 1WOBA 3NEVA 3C2OA 3Q58A 4R33A 1D9EA 3LTSA 1ZAHA 2A5HA 4ORMA 1EWEA 3LRMA 1SSDA 5FESA 1AMKA 4OHQA 2ALDA 4A2RA 1G4PA 1VYRA 3S6DA 4ADSA 1Y0EA 3MHGA 4MPQA 4UFKA 3CB8A 3BGGA 4K7YA 4X22A 3NOEA 3NGJA 5AC7A 1F05A 4O17A 5L9FA 4BWLA 3LXCA 4LY8A 3C8FA 4N4QA 3O8AA 1X7FA 3TAKA 3NL2A 2ZFAA 5F2LA 1WAUA 2A85A 1PHQA 1B4EA 4WQ6A 2Y7FA 2CLFA 2PCQA 1TPB1 4NJJA 1K03A 1KFEA 4JTJA 3HPXA 3LXBA 3R89A 4OBTA 1VYSX 1FDZA 2Y7EA 1FCVA 2PC4A 2AQWA 3IIOA 1ZENA 3T40A 3NA8A 4YWIA 2HS6A 4DBDA 1OG0A 1LZOA 2QKFA 5D30A 1OFAA 2Y70A 2BX7A 4NX5A 4YLWA 1VH7A 3BW2A 1X1OA 1W5QA 3N34A 1ICQA 3LRLA 1VHNA 1ZFJA 4AEOA 1W54A 4JDBA 3PC0A 3W1UA 6ALDA 3P8IA 1XDLA 2PRMA 3NXFA 3QEZA 3WJXA 3EX2A 3EXTA 3I65A 1FDYA 3C2RA 3EWYA 1K3UA 3KRSA 2TSYA 3W7EA 2GVLA 3FJ6A 2A2IA 3FYOA 2Y89A 2ZZ1A 3EWBX 3KHJA 3TXZA 1G7UA 4JXCA 4XZ9A 3TW6A 3BGJA 4LC6A 1W5MA 1RQHA 2H90A 3SECA 3UXAA 4I7WA 1XKYA 3G1HA 3LLFA 1IGSA 4X2RA 1PVNA 1P5BA 1GYNA 2CLIA 2VEIA 1MXSA 1YADA 3RMJA 4PC8A 1IXOA 3TROA 3B04A 5AC6A 1I2PA 1CI1A 4LUIA 2WNZA 3TV8A 2DZVA 3W75A 1YDVA 2NV1A 4RLIA 2YSWA 4M7TA 5ABTA 2H6RA 1BEUA 1ADOA 2CZEA 1A53A 4MFEA 1S5WA 5MHBA 1TJRA 1BWLA 1K7XA 4R7JA 3L66A 3B8DA 4JX5A 4TMCA 4HNTA 4O1DA 1HO1A 2B7OA 3LHUA 3GIYA 2OT1A 3PR2A 5G1YA 2RH9A 4IMDA 4N9CA 3AO0A 3QPYA 1NEYA 3KAOA 5BNKA 2V81A 4ADTA 1J4EA 1UUMA 2ZZ5A 5D04C 2A1YA 5G5IA 1GVSA 4UMCA 7TIMA 3P82A 4CCDA 1EUNA 3FKRA 4FIQA 2GQ8A 1GQNA 3MWAA 4I7UA 5K7JA 4MZ8A 3SI9A 1LOSA 4FF7A 1TPFA 4PL1A 3EX1A 3R8RA 1WQ5A 2G95A 4UTTC 3W74A 2ZRXA 3Q37A 2Z6JA 5FI8A 1HO4A 1IXNA 1EP2A 2VFEA 2Z0IA 1YXDA 1BTMA 2V5LA 4H3DA 1BWKA 1W3TA 5CPLA 5TBOA 4NXKA 2QJHA 5DCEA 4H6KA 3M1ZA 2NWRA 5F2MA 2PRLA 5I3IA 5AHEA 2ISWA 3E12A 2X30A 2F7FA 3B06A 1SZEA 1OJXA 2J9XA 1ME9A 2V30A 3INPA 3NQGA 4M19A 3LHWA 1V5XA 2Z2UA 1F76A 4UTUA 3UQNA 1AW1A 1DKWA 1LDCA 2WV8A 8TIMA 3TSDA 3P80A 3CWOX 3W6YA 2WSQA 3N3MA 3CQ0A 1EPXA 1ZCOA 3DAQA 1J5TA 4MLJA 5CPMA 4O1BA 4S2CA 1XBZA 3M44A 3N2XA 4MY8A 3CLMA 2VFFA 1A5BA 3QQ0A 4HNNA 3FA5A 3G8RA 3DI0A 3R12A 1C8VA 3WJYA 1AG1O 5AHIA 3NQ7A 3PB2A 1JUKA 1W31A 2VFDA 5LNRA 1WX0A 2DORA 3QPZA 3W84A 1TB3A 3DFQA 4UUIA 3CWNA 4MUZA 3E49A 5GVJA 1Q6QA 4I7VA 5D05A 5FEZA 3W7KA 3W85A 5EMUA 2YYUA 1QCWA 4CQ9A 2RDUA 3G1YA 3W72A 1TV5A 2BWGA 4GJ1A 4YCOA 3G0XA 2X2GA 1VLIA 4I9AA 2WO5A 1SR9A 5LGXA 2DU2A 1RV8A 4NQ1A 4UTWC 4LVFA 3W7HA 4FHAA 1XCFA 1K02A 1OK4A 1JULA 1XBYA 1HTIA 1YXCA 1OF8A 1I2QA 2QCNA 2XN0A 1AL8A 1SZNA 1LRNA 5D02A 2Y62A 1FBAA 1KFBA 5G2IA 3SW6A 2ZRYA 4O16A 5EA9A 3GYEA 2H3BA 4NJKA 4P2VA 3TJXA 5LNWA 3TCEA 1R2TA 2C16A 5LHFA 3HG3A 3N9RA 3PB0A 4UTHA 1VCGA 2WOQA 5BMWA 4HPXA 4LS0A 2WKJA 4YMZA 4IXXA 1W37A 2ISVA 3TKFA 3DKJA 2QCMA 4WXZA 1DOSA 5CGQA 3TJLA 4RV8A 5LGZA 3LXAA 2R14A 4N9BA 2KZHA 5J5DA 3GKAA 4UMBA 1DORA 5EY5A 4K6AA 3PS7A 3W2JA 3W7GA 1H1YA 1AW2A 2W0UA 1H5YA 4N4PA 2QCCA 3W7MA 4JX4A 5EBUA 2CLHA 1AL7A 4UFLA 3BW3A 1KW1A 4TX9A 2B7QA 3HO8A 2G5WA 3UWVA 3THQA 5H91A 4O19A 3PBYA 1GTEA 4PODA 3N9SA 3ABSA 3NPWA 4JX6A 4C1KA 5D37A 1SQ7A 2P1FA 3MP5A 2QEZA 3W2NA 2E6FA 1KM1A 2ZZ2A 4ZQRA 5AHNA 1H7WA 3B05A 3PBVA 3NZRA 1TQJA 2V8ZA 1TRDA 2GVJA 1C9DA 4UXDA 3W22A 5AHFA 1LOLA 1SPQA 3W1RA 5H2ZA 3SJ3A 5I3KA 2C6QA 4NX0A 2NXIA 2Z6IA 4LC8A 4DQWA 3TQVA 5SWUA 1I8JA 1K8ZA 4FNQA 3ZWSA 3DHFA 3STFA 1I2NA 3IRDA 4LS2A 4OWGA 2BSLA 3OG3A 3KVLA 3W1AA 4S1FA 3FKKA 3G3MA 1SZGA 1QPOA 5D2TA 3M9YA 1SO6A 1E51A 3W7QA 4O4WA 4OGZA 4GNJA 1TTJA 3NQCA 4O12A 4AB4A 1WBJA 1GEQA 4UNLA 4IMCA 2E77A 1GWJA 2OT0A 2X16A 1EA0A 1A50A 3S9YA 1DJNA 1OFBA 1QR7A 1XDMA 2Z1BA 4MJMA 3MHUA 1VCVA 4JTUA 5EPDA 2QUUA 4LUJA 3YPIA 1OFQA 3BK0A 3UXDA 2JBMA 3MP3A 5I3JA 3S8HA 4YL2A 3NVTA 4FIRA 3VCRA 5K9XA 4FX6M 2B4GA 1UJPA 2QCHA 3SR7A 3TU9A 4FNRA 5CPOA 1F5ZA 5AC8A 3UPBA 2ZDRA 3NO5A 5C5YA 3MI6A 2NX3A 1GOXA 4L4MA 1LYXA 1XBXA 3O63A 3W1MA 3UWWA 3DFSA 1L2UA 4ZL1A 3DFTA 3HGSA 3PG9A 2X1UA 3PUOA 3TUUA 2HTMA 5A8GA 3CT7A 1VGAA 1NFBA 5AFDA 2JK2A 3WK2A 1VCFA 2GVGA 4Y8FA 3PUDA 2QJIA 1LRQA 1DVJA 2IQTA 5DELA 3TH6A 3ELFA 2VOMA 3IEBA 5AB3A 3OVRA 3NPUA 2NLIA 3GNNA 3S5ZA 3Q2DA 5KZDA 5G4WA 5CZJA 2QF7A 4ML9A 1JUEA 1KLZA 2C15A 2OZ0A 4KWVA 3W2MA 1QPRA 1FWRA 2E5CA 1G4EA 3S5NA 4K37A 1O94A 1MEHA 3SGUA 2OMAA 3VE7A 3W7OA 4OU1A 4BI7A 3B0VC 4TO8A 1WA3A 4QSHA 3QMTA 3M43A 2ZZ7A 2F84A 5G1TA 1GG0A 4O14A 4A21A 4GWEA 1TPC1 3W71A 2CFFA 1LBFA 3PY2A 4IUOA 1KV5A 2ZA3A 5FF3A 3HOJA 4PA8A 2AAMA 3ABOA 4JICA 4B5NA 2YYTA 4POCA 5T26A 2GOUA 2CLMA 4AWUA 3LTPA 4ALDA 1YTDA 4AMAA 4NNCA 5DY2A 1XL9A 3SGZA 3ABQA 2ISSA 4O4VA 3EWZA 3NQ8A 4GC4A 3RLUA 2DJLA 4FXSA 3M6YA 4AHQA 5DXYA 1TPH1 3QW4B 4O11A 4QQ3A 3DH7A 3M16A 4OV9A 4WJEA 5C54A 2B0MA 1SW0A 2RFGA 3T55A 4CQ8A 5KTLA 3HGJA 4MKNA 1LORA 3H55A 1LROA 6TIMA 1SSGA 3IVTA 4HNVA 2C13A 4XTDA 4MZYA 4O15A 5IBXA 3RLVA 3TW7A 3S0CA 2YFOA 3MBFA 3HPSA 1JQXA 2A7PA 4FXRA 4U4MA 1N8FA 4PTNA 3W7CA 1H7RA 3WK1A 2A7RA 3KVMA 5G2WA 3LCHA 3NZ1A 3QC3A 3LHZA 2DJXA 2FJKA 3EEGA 3W73A 5HQEA 2GQAA 2TPSA 3O6DA 3S1VA 1KFKA 1VYPX 1OFRA 1LBLA 1VJIA 3PUEA 3U8GA 5DN1A 1DHPA 3L0GA 4Q33A 3DZ1A 4GBUA 2ZRVA 3P60A 5D2WA 3EWUA 1H7XA 5HJLA 2CZDA 1L6YA 1EWDA 3NG3A 1OYCA 3B03A 3GKFA 2BZNA 3MUXA 4PH6A 1O5KA 3BVJA 2Q3OA 3LHTA 4DO4A 3WJWA 4IJBA 3WFAA 3PSVA 4IPJA 3VNDA 1NF7A 2DZPA 3TSMA 4QNEA 1GYLA 3W1XA 1OFPA 4LU0A 4QM1A 1CW2A 1Q6LA 3C56A 4LOCA 3G0UA 2E6DA 3TE9A 3GR7A 1W5PA 3EX4A 2A4AA 1W3IA 3O16A 1FWWA 3NQ2A 4AF0A 3GDMA 2VKZG 3P84A 4E2BA 5FF7A 3W7NA 1D3GA 4WY0F 3MW7A 3EKLA 2DZUA 2Y6ZA 3MJYA 5K4XA 4IQLA 3LHVA 4MVAA 1YYAA 1FDJA 3GX9A 4YXGA 2WPBA 4XUGA 2W79A 1JCNA 3B4UA 3A5FA 5U7SA 3G22A 4M6VA 1RVGA 2P0OA 4IX2A 4JTGA 1OFEA 4JTIA 2FLIA 1IF2A 2YPIA 3W23A 4J9JA 1W56A 1OABA 3N14A 3GZ3A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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