2ZOXA

Crystal structure of the covalent intermediate of human cytosolic beta-glucosidase
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
466
structure length
466
Chain Sequence
MAFPAGFGWAAATAAYQVEGGWDADGKGPCVWDTFTHQGGERVFKNQTGDVACGSYTLWEEDLKCIKQLGLTHYRFSLSWSRLLPDGTTGFINQKGIDYYNKIIDDLLKNGVTPIVTLYHFDLPQTLEDQGGWLSEAIIESFDKYAQFCFSTFGDRVKQWITINQANVLSVMSYDLGMFPPGIPHFGTGGYQAAHNLIKAHARSWHSYDSLFRKKQKGMVSLSLFAVWLEPADPNSVSDQEAAKRAITFHLDLFAKPIFIDGDYPEVVKSQIASMSQKQGYPSSRLPEFTEEEKKMIKGTADFFAVQYYTTRLIKYQENKKGELGILQDAEIEFFPDPSWKNVDWIYVVPWGVCKLLKYIKDTYNNPVIYITENGFPQSDPAPLDDTQRWEYFRQTFQELFKAIQLDKVNLQVYCAWSLLDNFEWNQGYSSRFGLFHVDFEDPARPRVPYTSAKEYAKIIRNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Cytosolic beta-glucosidase
publication title Crystal structure of the covalent intermediate of human cytosolic beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 185
structure length 466
sequence length 466
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2008-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2zoxA00
1CXFA 1KFWA 3KL0A 4J3VA 1D2KA 3UERA 3EBVA 1UOKA 1E40A 2VVSA 2WM0A 2X0HA 5JBFA 2GVYA 2WC4A 4P7OA 5EMYA 3WBEA 3L4YA 4JFUA 3SCVA 3T0AA 3VDHA 1H2JA 5AC4A 4U3CA 2AMGA 2OYMA 1ZB5A 3MSDA 5BRQA 1FP9A 2JALA 2O9PA 1EA9C 1BGGA 3U7BA 3OB8A 1QNOA 3AIRA 1E70M 1GPFA 3AHXA 3L2LA 3MS8A 3POHA 2XG9A 1EOMA 2XPKA 2WHLA 2O9OA 4CVWA 1EDTA 1UD8A 3ECQA 4W86A 1Y7VA 4AIEA 1JZ5A 5BRPA 1EO7A 2UWFA 1V6YA 3CZ8A 3WUEA 3SURA 2ZXAA 5JBEA 1BGAA 2Y8VA 1TE1A 1R8LA 2QV4A 3DHUA 4FMVA 3T09A 4TVDA 1E3ZA 1HJSA 3BAKA 4GKLA 2JE8A 5M03A 3N11A 3CZLA 3KL3A 4PTXA 1J0IA 3LPFA 2VX5A 4W89A 1KXQA 2WPGA 2WMKA 1XV8A 3PHAA 5BYWA 3WN6A 3WDQA 4UTFA 3QOKA 1ESWA 4LYQA 2V3DA 1U2YA 2RGLA 1MWOA 1HP5A 1H09A 1NP0A 1NWRA 4EAMA 4UQEA 3OLGA 1QNQA 1GVIA 3WH9A 2WYSA 1UR2A 1K9EA 3RM8A 3VIKA 4JKMA 2ESCA 3BSGA 2OWWA 1TVPA 3DECA 4GI9A 1C93A 5JIWA 3CZEA 2WMHA 1Z32X 1U30A 4IUGA 4OIFA 2GK1A 3KZSA 4YHEA 1AQMA 3AIUA 3CHEA 3WF1A 2JEPA 1C8QA 2OWCA 1KBKA 1V3LA 2CBJA 3WF0A 1ZU8A 1BHGA 3GNPA 4E4PA 1GHSA 1RH9A 5D9NA 5CJ5A 1CGUA 1J10A 4CN4A 5AC5A 3IK2A 1V08A 1ZBCA 1NM9A 2VX7A 1V6UA 1FOBA 1W9XA 2VOTA 4V28A 5F7UA 3BSHA 5BCAA 1EH9A 2VX6A 3L4XA 3VM7A 4TVCA 1NWTA 2CNCA 3VGHA 4AD1A 1XH2A 4OBSA 4F66A 1J12A 1NWUA 3KE0A 1B90A 1QVBA 2O9TA 3FW6A 3WFLA 1QBAA 2WVTA 1PEZA 1QHOA 1E0VA 2WWCA 5I3DA 4P8UA 3GM8A 1OIMA 2WVVA 1AQ0A 3AQUA 4AZCA 1MVYA 3CZJA 2NW0A 4PMRA 3VDAA 4UNIA 2XVKA 1UKTA 3CIVA 4J3SA 4KMQA 4GI6A 4AWEA 5C8BB 3U5UA 4WJXA 4AISA 4FLSA 1CXHA 3KEHA 1DWJM 5FD0A 5A2AA 4PMQA 1OGGA 2WCSA 5BROA 2J47A 2E9MA 4HOXA 3K1DA 3SCNA 5EFDA 1ITXA 3AOFA 3WDRA 2A3CA 4UFKA 1V3JA 4Z2KA 1BTCA 1P6WA 4PMZA 1V6XA 3FAWA 4Z2JA 3VPLA 3LPPA 3UR8A 1AQHA 1V0KA 1GOKA 1CGXA 3VD4A 2ZE0A 3VILA 4D6JA 1JZ7A 4IPNB 2W67A 3RM4A 4ATWA 4HU8A 4B3KA 1V3KA 4WK9A 1HT6A 3NSMA 2Z1SA 3T2QA 5D8WA 1W1VA 1O7AA 1KXVA 3SCPA 4AD4A 3ZR6A 1R86A 1GJWA 1UG6A 4PTWA 4QDMA 2PBOA 5A94A 4JFVA 5E70A 1HL9A 2Z1KA 1V6WA 4CN6A 4ACZA 1MFVA 4JL2A 2VTFA 3GZAA 2ZX9A 1IT0A 2VCBA 4GZJA 1KGUA 3CZGA 4K68A 4BS0A 1LWHA 5JIPA 3U57A 3B9AA 3NCOA 4CD8A 1UH4A 3TA9A 4PMUA 2XFFA 1J11A 5ABEA 1K6AA 2DGAA 1ISVA 3U7VA 2CCRA 4TTUA 2YL5A 2XSBA 2TAAA 1Q4NX 3WFZA 4W84A 1KBBA 5FL1A 4MNLA 2E0PA 1LL7A 3GXMA 4D1IA 3WSUA 2GJPA 3QHOA 3VU2A 3ARYA 3A4XA 3GDBA 2VQUA 4EE9A 3PN8A 2G3JA 3UCQA 3SCTA 2FHCA 2XFRA 2G3MA 1VRXA 2ZWYA 2WKGA 2EJ1A 1VBRA 5ABHA 3NDZA 1XD0A 4WKAA 1BFNA 2IXVA 3NDYA 1PIGA 2EPNA 3N04A 2DQXA 1J0HA 5C70A 4GXPA 3WDJA 1PZ2A 3ZT5A 1C7TA 1E1FA 3VNZA 3DYOA 4BQ2A 2DT1A 4AEFA 5EFFA 4B3LA 4H41A 1W1TA 3OGRA 4D6CA 4BCEA 2XGIA 2PWHA 1Q6FA 4RE3A 1GQIA 1OT2A 3GTNA 2J74A 2IUZA 2BHZA 4GI8A 3HN3A 1AVAA 1UR4A 4ZE5A 4RE4A 4Q7NA 2O9RA 1UWSA 2EBNA 1ZBWA 1ISYA 2FHFA 4QLKA 1QI3A 3VD5A 1XCXA 3PZUA 3AZTA 3J7HA 2UY3A 1PBGA 3G6LA 1B0IA 2Y8KA 3CPUA 2OSYA 2BY3A 4U2ZA 4N42A 1Q6EA 2PWDA 4NF7A 4LQ1A 4Y7EA 1MXGA 2VR5A 1UD5A 5ABFA 1JAEA 3WD3A 1RP9A 2Y4SA 2YOCA 2XIIA 1EQCA 3CMGA 4YPJA 4MB4A 4W5ZA 5A6JA 3WQ4A 4NZCA 2PWFA 1B30A 4KRTA 1KQYA 1QI5A 3OG2A 2JIWA 3ARTA 2EPLX 2V3EA 1KB3A 5A3HA 1E4NA 3AI0A 3AMGA 4WKHA 3VGEA 1GORA 3W38A 1TA3A 4CVUA 2NT0A 4AZ7A 1X6NA 2WMGA 1JD9A 3WNNA 5A6AA 5FKYA 5A69A 2WWDA 2YJQA 1FHDA 4URIA 1ODZA 4FLOA 1OCQA 3CO4A 3AS2A 2PI6A 1E4MM 1PX8A 1JG9A 4AMCA 3UR7A 3PTQA 5D9OA 4MAVA 2D0FA 2J7FA 1ISWA 1OIFA 4M1RA 2F2HA 4CUCA 2D24A 1LWJA 5HXMA 4GZIA 3ZJ8A 4A4AA 1UYQA 3T0BA 3BLPX 5A6KA 4UZUA 1WZLA 1XRVA 1JF5A 3T08A 1UA7A 1TVNA 4PEEA 5ABGA 2WMIB 4B9ZA 2D0GA 1NOWA 3MO4A 3VIJA 4QLJA 5CPSA 4ZFMA 7A3HA 3TTYA 2PB1A 2EPMX 3WH7A 2E40A 3ARSA 3CZKA 1E4IA 1E6QM 1FH8A 1WDPA 1MXDA 4ZENA 5FCZA 5CSYA 2XM1A 2WZIA 5FL0A 2J8GA 4R27A 3EDEA 1CGYA 3LPOA 5KEZA 2CHOA 4LYPA 4KRUA 2Y2WA 2FH6A 4QCFA 3WUFA 3CMJA 4ZXLA 5E09A 3OA5A 3ALGA 3BH4A 4D6GA 4MB5A 3GXDA 1KCKA 1E6ZA 1HJXA 4HU0A 4TTGA 2CERA 3RCNA 1JYWA 1XGZA 2NT1A 2WNWA 2WK2A 4W7VA 1UWRA 3WDPP 4C7GA 4DWSB 2XIBA 5I6SA 2AAAA 4J28A 3KWXA 2GJXA 3VINA 1GQJA 5D9MA 1WDSA 3G6MA 4J7RA 5LYRA 1QOXA 3WEMA 2V5CA 1UH2A 1JDDA 4GO8A 2QMKA 1KWGA 2D0HA 4AD5A 2PWGA 3ZR5A 5I24A 1BSIA 1E5JA 3UG5A 2J4GA 4D6DA 2BS9A 1UKPA 2BNJA 2VZSA 1ZL1A 5EBAA 1CECA 4PMVA 1CZ1A 2E9BA 4A3YA 3W29A 2YA1A 4U3AA 1W32A 3TONA 1VFUA 3OIHA 5CLTA 1E6PA 4LPCA 1XYZA 1JGIA 4TXEA 3AJ7A 3AICA 3AHVA 3DYPA 5A2CA 4NI3A 5A6MA 2DSWA 1XSJA 2UY2A 3F5KA 1QNPA 2YIHA 4FF5A 1OGBA 3OLIA 1NARA 2VRKA 1PIFA 3AXHA 1HVQA 1FP8A 3THCA 2VMFA 2G3NA 4TX8A 1GNXA 4IM4A 1NOFA 2J25A 3BCDA 3WNKA 2E4TA 3PTMA 1W3JA 3ARQA 3GXIA 3VTRA 3NSXA 3AXXA 3LPGA 1EQPA 3CUGA 3UG3A 4H8HA 1W3KA 3WQVA 1RPKA 1ODUA 2EO7A 4M29A 3SUSA 4JHOA 2CYGA 3ARUA 1HNYA 4UFMA 2DT2A 1E9LA 3GNOA 4CCDA 4EK7A 1OD8A 4D6IA 3TP4A 5BXPA 2VVNA 1CYGA 2WVSA 3MANA 3MUZ1 3WQ6A 5CG0A 1D3CA 4UOJA 3ZSTA 3RJYA 9CGTA 1GOMA 3SUUA 1M03A 1JZ4A 3NUKA 3VMNA 4GQRA 2JEQA 2VO5A 3VIFA 4PMYA 4UFHA 2W62A 2V3GA 1E71M 3CHFA 3BMVA 3W25A 4QCEA 4X0NA 3W27A 2CXGA 2J7CA 1UD4A 1E6NA 2XGBA 1LQ0A 7TAAA 1HJVA 5IHRA 1H1NA 2UY5A 3L4ZA 1H4PA 2WVUA 1MW2A 1Q6GA 2V38A 4HOWA 3ALFA 1MW0A 4J3UA 5D8ZA 3AISA 4WSKA 4OOUA 1OBAA 3O9NA 2VT0A 2DSVA 4BF7A 5IFTA 2YLLA 2QPUA 4WLCA 3ZT7A 4AD0A 4CCCA 4GINA 4OZOA 1JDAA 1BYBA 4AZ5A 3SCSA 1UQYA 2XM2A 3PZQA 4MNMA 2FDMA 2WBGA 1B3XA 1Q6DA 1OT1A 3RJXA 4W7WA 1E56A 2JF7A 2QPSA 5C71A 4RE2A 5LA1A 1JZ3A 1DHKA 4X0VA 5I5RA 1VJSA 4CD6A 1NWSA 1DWGM 1GONA 3OGSA 1HX0A 3JUGA 2ZICA 1IZKA 3W0KA 5FOOA 1H41A 3VOCA 1TZ7A 1HIZA 4GO9A 1N82A 1JXKA 2YA0A 3IAPA 4W88A 2ZOXA 4AZBA 3FY1A 3CUHA 4LYRA 4PRWA 3IJ7A 1F4AA 4W5UA 2VUYA 1UR8A 1H0IA 3VKKA 3VIOA 4PSRA 1VEPA 5BWFA 1BF2A 1OINA 1NQ6A 2ZX8A 2XJ7A 5CXPA 4W85A 2CHNA 2J62A 2V5DA 2YL9A 4U5IA 3AHTA 1UUQA 2ZX6A 3VD7A 3WL1A 1MW3A 2FGLA 5JBDA 4V27A 1QI2A 1ZJBA 4D71A 3FN9A 3BLKA 3SUVA 1VEMA 1CENA 2OYLA 4E8DA 1E3XA 4TUFA 3ZM8A 1V0LA 3VGBA 4EANA 4JFTA 1NH6A 1BVNP 4M56A 3AROA 1CWYA 1VF8A 4RL3A 3UESA 3VX1A 1KXHA 2XUCA 1GHRA 5IFPA 3F4VA 3K46A 2CITA 2XVGA 3BXWA 3NIYA 1QPKA 1PAMA 1VEOA 3PZ9A 4W8BA 1M01A 3BAIA 2YBTA 1SFSA 2Y5EA 5LA0A 4QP0A 1G94A 3N9KA 5D4YA 2JFEX 3WF4A 2OLHA 1J0ZA 2YDSA 1H3GA 4OJYA 4P8VA 3D5HA 2XVLA 4UQAA 5CPTA 3SCOA 3GNRA 5KZ6A 5HPCA 1MQRA 3K8KA 1DTUA 2AOSA 3ZSSA 3KL5A 5I79A 4PSPA 2EPOA 1HF6A 3WNMA 4UQ9A 1ISXA 3L4TA 1CGWA 4J3WA 4D6HA 4JCMA 2X2YA 3VX0A 2WMJA 2ZUUA 1JF6A 2VCCA 2EQDA 1G1YA 1CTNA 2J7DA 1GVYA 1FHLA 3N18A 1HN1A 1WZAA 2YDRA 3E1F1 1NP2A 5I2UA 2BY2A 1E55A 2DH2A 3NYDA 5DT7A 1LG2A 2VI0A 3T2PA 4UFJA 3ARWA 4ATLA 1EDQA 3GBEA 3PZVA 5DO8A 2WC3A 4HPHA 1UKQA 4F9JA 1A47A 2VJXA 4V2XA 5I78A 2A3EA 3W24A 1W3HA 3B8SA 3VD9A 4ATDA 4MJ2A 1JNDA 3W53A 2ZUTA 1M7XA 1O6IA 1KQZA 1EGZA 2WAGA 3BC9A 5LA2A 2WXDM 3I3EA 2OSXA 3AXIA 3SCQA 3VDBA 1TFVA 1C91A 3ARZA 3CGTA 1RD6A 3A6OA 4MDPA 2DSKA 1W9DM 2FH8A 3RIKA 1DP0A 4HTYA 1FH9A 1KGXA 3BAJA 4D1JA 1ZJAA 1JIBA 3OZPA 3BAXA 2J77A 3WQ8A 1C7SA 3RPMA 3WY1A 2J7GA 3VMPA 3LMYA 1W3LA 2DSZA 3A4AA 3OLDA 4H04A 5A6BD 3FHQA 2JF6A 2PC8A 2WC7A 3GXFA 3AFBA 1G5AA 3QR3A 4H7VA 2BFGA 1CXKA 3WEOA 1PJ9A 3VIMA 3WNLA 1XSKA 4AIOA 3II1A 4J3TA 1WCGA 2BXZA 1JYXA 2YL6A 2YKKA 4Z2HA 4D6EA 4MNKA 1EXPA 5DF0A 4OUEA 1W1YA 3FHAA 1BYDA 1MQQA 4QAWA 2YL8A 1FH7A 1E0XA 4S3JA 1MQPA 4L4OA 2W5FA 4WF7A 3TTOA 2XYLA 4JKKA 5HBFA 3WMCA 4UOZA 3AZRA 2VRJA 4AXNA 3WH8A 2WW5A 1TCMA 1NOUA 2DH3A 2DEPA 4JKLA 4DUVA 4HA1A 4HMCA 4JL1A 3ZQ9A 1UWUA 1GOQA 3EDDA 1HJWA 3BMWA 2EEXA 3MMWA 1I1XA 3N12A 1JZ2A 1WNOA 1W9PA 5HDRA 3A47A 4UOQA 2BV9A 1WP6A 1XD1A 3NSNA 5A8QA 4P8WA 3WDIA 3EDJA 1CGTA 1QHZA 2XHYA 3MUIA 2BXYA 2ZUVA 3L4UA 4N0RA 1D7FA 1V3HA 3MUAA 1V3MA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CXF A;  1KFW A;  3KL0 A;  4J3V A;  1D2K A;  3UER A;  3EBV A;  1UOK A;  1E40 A;  2VVS A;  2WM0 A;  2X0H A;  5JBF A;  2GVY A;  2WC4 A;  4P7O A;  5EMY A;  3WBE A;  3L4Y A;  4JFU A;  3SCV A;  3T0A A;  3VDH A;  1H2J A;  5AC4 A;  4U3C A;  2AMG A;  2OYM A;  1ZB5 A;  3MSD A;  5BRQ A;  1FP9 A;  2JAL A;  2O9P A;  1EA9 C;  1BGG A;  3U7B A;  3OB8 A;  1QNO A;  3AIR A;  1E70 M;  1GPF A;  3AHX A;  3L2L A;  3MS8 A;  3POH A;  2XG9 A;  1EOM A;  2XPK A;  2WHL A;  2O9O A;  4CVW A;  1EDT A;  1UD8 A;  3ECQ A;  4W86 A;  1Y7V A;  4AIE A;  1JZ5 A;  5BRP A;  1EO7 A;  2UWF A;  1V6Y A;  3CZ8 A;  3WUE A;  3SUR A;  2ZXA A;  5JBE A;  1BGA A;  2Y8V A;  1TE1 A;  1R8L A;  2QV4 A;  3DHU A;  4FMV A;  3T09 A;  4TVD A;  1E3Z A;  1HJS A;  3BAK A;  4GKL A;  2JE8 A;  5M03 A;  3N11 A;  3CZL A;  3KL3 A;  4PTX A;  1J0I A;  3LPF A;  2VX5 A;  4W89 A;  1KXQ A;  2WPG A;  2WMK A;  1XV8 A;  3PHA A;  5BYW A;  3WN6 A;  3WDQ A;  4UTF A;  3QOK A;  1ESW A;  4LYQ A;  2V3D A;  1U2Y A;  2RGL A;  1MWO A;  1HP5 A;  1H09 A;  1NP0 A;  1NWR A;  4EAM A;  4UQE A;  3OLG A;  1QNQ A;  1GVI A;  3WH9 A;  2WYS A;  1UR2 A;  1K9E A;  3RM8 A;  3VIK A;  4JKM A;  2ESC A;  3BSG A;  2OWW A;  1TVP A;  3DEC A;  4GI9 A;  1C93 A;  5JIW A;  3CZE A;  2WMH A;  1Z32 X;  1U30 A;  4IUG A;  4OIF A;  2GK1 A;  3KZS A;  4YHE A;  1AQM A;  3AIU A;  3CHE A;  3WF1 A;  2JEP A;  1C8Q A;  2OWC A;  1KBK A;  1V3L A;  2CBJ A;  3WF0 A;  1ZU8 A;  1BHG A;  3GNP A;  4E4P A;  1GHS A;  1RH9 A;  5D9N A;  5CJ5 A;  1CGU A;  1J10 A;  4CN4 A;  5AC5 A;  3IK2 A;  1V08 A;  1ZBC A;  1NM9 A;  2VX7 A;  1V6U A;  1FOB A;  1W9X A;  2VOT A;  4V28 A;  5F7U A;  3BSH A;  5BCA A;  1EH9 A;  2VX6 A;  3L4X A;  3VM7 A;  4TVC A;  1NWT A;  2CNC A;  3VGH A;  4AD1 A;  1XH2 A;  4OBS A;  4F66 A;  1J12 A;  1NWU A;  3KE0 A;  1B90 A;  1QVB A;  2O9T A;  3FW6 A;  3WFL A;  1QBA A;  2WVT A;  1PEZ A;  1QHO A;  1E0V A;  2WWC A;  5I3D A;  4P8U A;  3GM8 A;  1OIM A;  2WVV A;  1AQ0 A;  3AQU A;  4AZC A;  1MVY A;  3CZJ A;  2NW0 A;  4PMR A;  3VDA A;  4UNI A;  2XVK A;  1UKT A;  3CIV A;  4J3S A;  4KMQ A;  4GI6 A;  4AWE A;  5C8B B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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