2ZZ2A

Orotidine monophosphate decarboxylase k72a mutant from m. thermoautotrophicum complexed with 6-cyano-ump
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFAVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 82
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz2A00
4R7JA 1W37A 2W6RA 1XDMA 3LCHA 5G2HA 4K39A 3W7IA 4R53A 1PE1A 2YYTA 4DBEA 2CZ5A 2O7QA 3LLFA 3OVRA 1W5QA 1JUBA 3SI9A 1VC4A 4Q4KA 1N55A 1GWJA 1YADA 5FEWA 3W7JA 1RQEA 2JBMA 2QCCA 1F5ZA 3O1NA 2V0TA 3W7QA 2QCDA 2ZZ7A 3L9CA 4DF2A 3NQMA 4NU7A 3C56A 3LB0A 3DFNA 3QPYA 2GQAA 3KVMA 3IGSA 5D2TA 4LVGA 1JCNA 1FCUA 2RHGA 2TPSA 3IGXA 2Y61A 2QEZA 2FPYA 1B4EA 1TO3A 2DZWA 1RQHA 4M5PA 1OVDA 2XN1A 3O15A 4LRSA 3W1NA 3RF9A 3FEMA 1WBJA 4NJHA 4O52A 1DV7A 3PVFA 1OX5A 4O17A 5K2ZA 4L4MA 1PCWA 1KFJA 3NO5A 3UYCA 3H55A 1KA9F 4WY0B 4FXSA 4K8HA 4IGHA 1FWNA 3BLIA 2YPIA 1SU5A 1FWSA 3QSTA 2ALDA 1SO5A 3THAA 4GE8A 5D03A 3U8GA 5AYZA 5TIMA 1OFBA 4G1KA 3ZWTA 3RMJA 3E96A 2Y85A 3EWYA 2CWNA 1H7OA 5L6UA 5L9FA 1GTHA 1FBAA 4UIOA 3L0GA 4U4MA 1KFCA 5G2IA 3W1LA 4N6FA 1FXQA 4MJMA 4UTJA 3ZR4A 1RV8A 1VPXA 3P5ZA 4KFPA 3W7EA 1EP1A 2ISSA 1G6CA 5H91A 4DPQA 3GYEA 4ORMA 4RXFA 4JTJA 1DORA 1ZJIA 5GVJA 6ALDA 3R89A 4O11A 1X8FA 1SO3A 1Q3NA 4RXGA 1FXPA 3B03A 3TDFA 1QDSA 3HG2A 1R46A 1QWGA 4X9SA 4KWVA 1OJXA 2A5HA 1K7EA 3S1VA 4BI5A 4IJBA 1OABA 5IBXA 3PUOA 4UFHA 2G97A 3D0CA 4Y96A 4AAJA 3GR7A 2NXIA 3O6YX 1VRDA 4BI6A 3RNDA 4AMAA 3W2LA 2B0MA 1KLZA 3C61A 1EUAA 5LNRA 4UFMA 5HR6A 3FIGA 2ZZ6A 1K03A 1ZALA 5CGQA 5H2ZA 1O5XA 2ATMA 4AWTA 3E02A 3LCFA 2C1HA 3W9ZA 1P4CA 2ZRZA 1GZGA 2KZHA 2FQIA 2Q3RA 3ELFA 1YXDA 3KRUA 4IMDA 1GPWA 3PUEA 2C15A 3WK1A 3O63A 4LC6A 2BX7A 4UR8A 3RU6A 1M5WA 1YDNA 5AFDA 4XQ6A 4CNNA 4HT3A 1FCQA 4KFOA 1UB3A 3SJ3A 3G1XA 4JS3A 4LVAA 5FF3A 4AH7A 1ZAIA 1OX6A 2QAFA 4E2DA 2FTPA 2QCNA 2ZA2A 2VENA 4MZ1A 3GZ3A 1F6KA 4OQVA 5J5DA 2VKZG 4DO6A 3NG3A 3WFAA 1OFEA 3LHTA 2RFGA 3HB9A 3QQ1A 1L9WA 4O54A 1F2JA 2UV8G 1KM4A 3L67A 2JK2A 4LNYA 1YTKA 5G1TA 1LTDA 1DHPA 1K3UA 1AW2A 4GUHA 2ZRWA 1WXJA 3BGGA 3O16A 1OYBA 2EHHA 1R47A 1K8ZA 5F2MA 1YDVA 3W76A 5C2XA 3FFSA 4OE7A 4LU0A 3HGJA 3OIXA 3TROA 2NXHA 1VZWA 5TQLA 3MI2A 5DY3A 1H7XA 5G4WA 4ADUA 1GOXA 4LC8A 5LNVA 1ZCOA 1YDOA 1R2TA 3QZEA 4AHOA 4E2BA 1JRBA 3GDTA 4N02A 2EF9A 2VXNA 2X1TA 1EX5A 2HSAA 4WZHA 4M6PA 1A5AA 3QQ0A 2FB2A 3R2GA 1H51A 2B7PA 1GEQA 3NZ1A 1GYNA 1TYGA 4N9BA 2RDTA 5EY5A 1WAUA 2Y7DA 4LS1A 3W7MA 5DLCA 1ZAHA 3LLDA 5FEXA 1F6PA 1SR9A 3W75A 2Y7GA 4AWUA 2ZZ1A 4IOTA 1LRTA 4Z1AA 3NQ6A 1H1YA 1QAPA 1G4PA 1SZGA 2NXGA 4O28A 2WNNA 3QMTA 3MWAA 3P5YA 3O8AA 3CHVA 5TBOA 4O57A 3UZ5A 1X1OA 3QRHA 3G1YA 4I7WA 5KITA 1F74A 4RR4A 3NQEA 5LNWA 1AL8A 2G96A 1KFKA 3TKFA 2H6RA 4JDBA 3TE9A 4P2VA 4WXZA 5FF0A 4NNBA 1KM2A 4LVBA 3M5VA 1KM6A 3IVTA 3ZS4A 3TQKA 3QW4B 4K7VA 2YW4A 2A21A 4J9JA 1BEUA 2VELA 5CG7A 2ZFAA 2C13A 1K7XA 2V5BA 4S2CA 3IGUA 1MEIA 1DKWA 3I7QA 5CSSA 3CTLA 4TU1A 3C2RA 4DEFA 2V30A 1FWWA 4QQ3A 4MYAA 5CPMA 5F2GA 1W1ZA 4NXSA 3LGEA 3TR2A 3W1QA 2EPHA 1X1ZA 3YPIA 1CX9A 2BSLA 4QNEA 3ABRA 4ZQPA 4O16A 2A7RA 4N9DA 3HJZA 5CPLA 3VFLA 2PC4A 1O5KA 3TAKA 4NZFA 2WV8A 3PWAA 4MY8A 1C8VA 2OMAA 2YW3A 2FLIA 4NX0A 3TA6A 3UY7A 4LVFA 3TW6A 2C3ZA 3UQNA 3HIJA 2X30A 1HFBA 4X2RA 4ONVA 3S5OA 3EWXA 2J27A 4IXHA 4FX7A 3U2OA 1L6WA 5D09A 3LTSA 3R5EA 3QC3A 5D05A 1KFBA 5AC6A 2C6QA 3EXRA 1I45A 2X1SA 2HTMA 4TR9A 4XKYA 2VC6A 3W1RA 3DI0A 4JTLA 4UXDA 4A21A 3LXAA 2FPVA 3O6DA 3QW3A 3TXZA 4O18A 3WJSA 1O94A 3EKLA 4FX8A 4JTUA 4Z1DA 3A5FA 4AHQA 3UXAA 5BMWA 3T4CA 4GC4A 3VE9A 3W71A 2HMCA 1GYLA 2ABAA 3FOKA 1MEWA 3STGA 1Z44A 5FF4A 3KOFA 3NXFA 1H7WA 1YXYA 4RZ6A 4LT9A 3B4UA 1ZHAA 2A1YA 5E1QA 5AHIA 4WX2A 4NNCA 3DAQA 2QUVA 1GVFA 2CU0A 3GIYA 3PBWA 2BTMA 2YXGA 1GVQA 3LTPA 3STFA 4UFJA 2CLFA 3W84A 1EP3A 1DVJA 3TSBA 3I6RA 3A23A 3O07A 3LXCA 1G7UA 3MI6A 1LP6A 1W0MA 4NJJA 4RX0A 2Q8LA 1TMHA 4EF9A 1TTIA 2Y88A 3NL5A 1XFBA 2QKFA 4QIUA 5AC7A 1IXPA 1WV2A 3OVPA 4JIQA 5HNRA 2ZRVA 4WY0F 4MYXA 3Q37A 3L0NA 4UTWA 3G3MA 2FDSA 4AF0B 4MFEA 3FJ6A 4UTUA 1K8XA 3TFCA 5D02A 3N3MA 2XFWA 2QAPA 3HGOA 3NQVA 4TX9A 1XBXA 3H54A 5EKYA 3R13A 3I65A 2J24A 3NA8A 1QO2A 2WSQA 3MP4A 2YFOA 1S5VA 1JVNA 2E68A 2I9EA 2P0OA 1R2RA 2J9XA 4U28A 4KKXA 3CIXA 2DZXA 1W54A 3W2UA 3E0IA 5SWUA 5HMSA 1G4TA 3P8JA 1VHNA 3ABSA 1Q45A 1WA3A 3TAOA 3EWBX 1KFEA 4CNPA 2WNQA 4ZQRA 1TRIA 3M6YA 2E5BA 4OGZA 2NLIA 1AW1A 5AN7A 2I1OA 5EYWA 1FY6A 4A2SA 4N4PA 2TRSA 3BPWA 1JUEA 4O0ZA 5HULA 4O4VA 3LRMA 3BVJA 3CB8A 1LBFA 3M44A 4ML9A 5J5RA 1QPNA 4PTNA 3IIOA 2ZTKA 2H3DA 4NJKA 1WDWA 3WK2A 3W07A 4UTHA 4FX6M 1JRCA 3OG3A 3TJXA 1MZHA 2E5CA 2CLOA 2NX3A 2Z6IA 2RDWA 3STEA 2VEKA 4IMEA 3N9RA 2GJNA 4FB7A 1AW5A 2V2DA 2QDGA 3WJXA 4Q32A 4EOUA 3G1FA 3NPVA 1LROA 3CLMA 3NNTA 4UCGA 3GNDA 1WBHA 1UASA 3BW4A 1LBLA 4FNTA 5A5WA 1E51A 1FX6A 4OBTA 3KXQA 1DQWA 2DZSA 3M5YA 3G3DA 4PCFA 1T8XA 3NYZA 2C0AA 5DXXA 3LM7A 4JDYA 4MPQA 4JYEA 5AOUA 2V9DA 2ZTJA 4FEZA 2EGZA 1EWEA 3G18A 1SW3A 3FYPA 4KFNA 5IM51 1LORA 2CZDA 5AHEA 4JY9A 1W5PA 2V2HA 1VR6A 4DO5A 1MO0A 3QYQA 3K30A 3EX3A 5BNKA 5D04C 1WX0A 3S1XA 5BMXA 2CLEA 1ZY9A 2R91A 3TSMA 3TK7A 1ICSA 3PSWA 4AVFA 4FHAA 4C1KA 5HINA 1TIMA 3TNOA 3HPXA 3LCLA 3NQ2A 3W1XA 4LS2A 2FB3A 1W3TA 5DCBA 3T55A 3UY8A 2ZDRA 1KM1A 2CZEA 4FNRA 3QJAA 2PURA 3PC0A 3TSDA 2V82A 1I8JA 2GVLA 3LHYA 4IX0A 3QSRA 3NL3A 4EF8A 1TV5A 3S5YA 3BG9A 5LNSA 4O13A 1LYXA 5EL1A 5AHLA 4JIPA 2NUXA 3M1ZA 5HWNA 3LERA 4O12A 3L0KA 3N19B 3VE7A 1T99A 1M7OA 1ML1A 2E09A 2JGYA 4PODA 3BW2A 4XBSA 3HG5A 3IV3A 4GUJA 5MHBA 4IUOA 1OFRA 5I3FA 1JUKA 4UTLA 4O4WA 1QPRA 1KTNA 1Z41A 2V81A 1JCLA 3EXSA 2E5DA 4ADSA 2AQWA 2JKAA 4JTSA 2A6NA 3W7CA 3STCA 3G22A 5C54A 1PL9A 3UWYA 3AO0A 1VLWA 3UPBA 1I2RA 3DFSA 2JKPA 2FJKA 1H61A 2J6XA 3EX1A 4HN4A 4L4LA 2Y62A 3Q2DA 4PL1A 1QOQA 1ME9A 2Q8ZA 2JKEA 1L2UA 4Y8FA 4TMCA 1MXSA 1YYAA 2GVJA 3LCWA 3P84A 1TPWA 1B9BA 1UUMA 3UWVA 1H1ZA 2X1UA 1PS9A 4K37A 1L6SA 3M43A 3IIPA 3LCXA 3UWUA 3W3OA 3EWUA 2OJPA 3W7PA 3M9YA 3MUXA 3NQDA 3KVKA 3C2OA 5G4EA 3BLEA 4POCA 4RV8A 4S1FA 5F4SA 2TYSA 4HNUA 3CM4A 4XWUA 2YGYA 1JJKA 3DZ1A 3DENA 5U4NA 2YSWA 2Z2UA 4ZL1A 2W0UA 4YMZA 2ATSA 3UD6A 3TV8A 2E6DA 4ZZ9A 1W5NA 3LCIA 4D2JA 1SZNA 3B05A 4O15A 3RLUA 3WK0A 1ZNNA 4UMAA 1P5BA 2BLEA 5G1YA 1IXOA 2Y89A 1W3IA 2NWRA 1MEHA 4N6EA 2J9YA 5C6MA 3T78A 4BR1A 5CSRA 1H7RA 1L6YA 1QOPA 4O10A 1ME8A 4RZ5A 1DJQA 3MJYA 3W2KA 3S1UA 5LGXA 2LLEA 4NJGA 2C16A 1UCWA 3VNDA 1NEYA 3LXBA 2QCMA 4W9TA 3HG4A 4LS0A 1JCXA 2A2IA 5I3IA 4UTWC 3HO8A 1OX4B 3ZFHA 3NPUA 3E49A 3DKJA 1UUOA 3M47A 4ORIA 3W73A 4DELA 3IIXA 4MFDA 5FF7A 2G95A 3TMLA 3L68A 2VFDA 5LNUA 5F4WA 3L5AA 3IVUA 1K8YA 3R8RA 4UNLA 4UR7A 5E93A 4Z0SA 3W1AA 1CW2A 5I3HA 1LM1A 3SIZA 4PFMA 2QCFA 4O53A 2OX1A 2VFFA 5EBUA 5EMUA 3W86A 1VCFA 2DZPA 2EAWA 5KMYA 3GB6A 1ADOA 1IGSA 3L2IA 1JQXA 4HPJA 3UWZA 5T26A 4CLMA 4N9CA 3LV6A 3N14A 5KSWA 3C6CA 3W1UA 4K38A 2DU2A 1LOSA 4P61A 3NDOA 3BG3A 3TC6A 3GXPA 1MSSA 3CPRA 1ALDA 4O1CA 3W74A 2VOMA 1C29A 3LTYA 3BARA 1SO6A 4ZQNA 3C2EA 2TSYA 3QPZA 1VYRA 2H3BA 5CZSA 3LRLA 1ZENA 3UPWA 3P82A 3IEBA 1OYAA 1TTJA 2ZRYA 2B7QA 4M6VA 4Z08A 4HKPA 3NQFA 4UTTC 4EWND 5HR7A 3NOEA 3L5MA 4MUZA 4FNUA 3C2FA 3M16A 3TJLA 4IQLA 4GFSA 5F2LA 1EB3A 4MZYA 3EWWA 1F73A 3KVLA 4LV4A 5F4XA 5DBUA 1GG0A 3PY2A 3O05A 1TPVA 4I7VA 3HBLA 3JS3A 1VHCA 5D38A 4DF1A 1SSDA 4PH6A 1K7FA 3B8DA 4JTFA 1J5TA 5K9CA 3CEUA 1GVOA 3DHDA 4HSOA 2RH9A 1XDLA 3FA5A 1QNVA 3T44A 2A6LA 5G2WA 3HGSA 3FKRA 2X2GA 3O06A 1RPXA 4GBUA 5EPDA 3LCGA 4PL2A 1QPQA 5D33A 4S2BA 2FPTA 4UFLA 1KW1A 2CLKA 1TREA 3P80A 4UUIA 1H7NA 3L5LA 1SW7A 4FF7A 4LTSA 3Q58A 4ZQOA 3CC1A 1PHQA 5C5YA 3ATYA 3W7DA 3MI3A 1VCGA 2VEMA 4N2YA 1SQ7A 1TJPA 2QCEA 3EX4A 3N34A 3NR0A 4BWLC 3W1TA 3GXNA 4GUIA 5CZJA 1G4EA 5HJLA 2C18A 2BZNA 3W70A 1O95A 7TIMA 2QDHA 2NV2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4C6N A;  5G2H A;  1XDM A;  1FWB C;  4AIU A;  2CXG A;  3LLF A;  4C1N A;  1N55 A;  4GVH A;  1YAD A;  2QZR A;  4E3V A;  3W7J A;  1NOW A;  1RQE A;  4CN4 A;  1EDG A;  4ZO9 A;  4JTC A;  3O1N A;  3ENL A;  2QCD A;  2ZZ7 A;  3L9C A;  1F8M A;  4AVN A;  4E4P A;  3DFN A;  1H11 A;  3KVM A;  3CMF A;  5D2T A;  3AUJ A;  3CQI A;  2V68 A;  5JQ9 A;  2RHG A;  3ALF A;  4B16 A;  3IGX A;  4PBG A;  2QEZ A;  3OA5 A;  2FPY A;  3AFB A;  1LUC A;  2OEM A;  3U5U A;  2DZW A;  2O4Q A;  4QCE A;  2XN1 A;  2G41 A;  3FEM A;  1WBJ A;  4PMY A;  4DZ5 A;  2JIE A;  5K2Z A;  4AD5 A;  1P7T A;  2F2K A;  3UYC A;  4A3Q A;  3WQ8 A;  3UJ2 A;  4IGH A;  4YPJ A;  5CG0 A;  3HV8 A;  4QDM A;  1A3W A;  1SO5 A;  3CZG A;  3CQJ A;  3U8G A;  4ML4 A;  4HU4 A;  5TIM A;  1GOR A;  1OFB A;  3QN3 A;  6REQ B;  3WF3 A;  3F2B A;  2VRQ A;  2Y85 A;  1V3J A;  1I1X A;  1GTH A;  2XHY A;  4S3B A;  4UIO A;  3L0G A;  3OG2 A;  4MJM A;  4N6F A;  3ZR4 A;  6XIA A;  4WJ8 A;  1EJT C;  3TNB A;  5A95 A;  4MSS A;  1FWC C;  4ORM A;  4DYK A;  4JTJ A;  3S2J A;  3EB3 A;  1D2K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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