2ZZ3A

Covalent complex of orotidine monophosphate decarboxylase d70a mutant from m. thermoautotrophicus with 6-cyano-ump
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIAAFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 85
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz3A00
3FYOA 3L2IA 5D2VA 6TIMA 4Y6GA 1G4SA 4FO4A 3DENA 2ZRWA 3NNTA 3W85A 5HR7A 1SO4A 2VC6A 3G1FA 4UMCA 1WBHA 3GR8A 3BG3A 3NQGA 5CZSA 5F4XA 5D32A 1TJPA 1F76A 2ZDRA 3P8IA 3IVSA 3OHIA 5CZJA 1V5XA 2EF9A 2J6XA 2YGYA 4KWVA 1GZGA 3B03A 2I1OA 4O11A 4POCA 2EHHA 1WQ5A 4IPJA 3KRZA 4LUJA 4Y90A 5IM51 2DU2A 2BLEA 4JICA 5EPDA 3DKJA 4UTUA 1FXQA 3NQEA 4RX0A 1F6KA 3L5AA 3CWOX 3MUXA 3C0JA 1KFJA 3W7DA 4JR5A 4UFMA 3WK2A 5D05A 4NJJA 2BZNA 2NV2A 5HNRA 1AG1O 3VFLA 5HWMA 4HNUA 4E2BA 1VPXA 4N4PA 3ZWSA 1PCWA 4MUZA 3NEVA 3TC7A 3BW4A 4MY1A 2Y85A 5AOUA 1R2SA 1DHPA 1GWJA 1OX4A 4Z0JA 2FFCA 3W7HA 1L6YA 1XFBA 4CCCA 1C29A 3HG3A 1H7NA 3QYQA 3NPVA 3LERA 3NA8A 2C15A 5E93A 5AFDA 1GVOA 2OT1A 4JTUA 4RV8A 3QH2A 1IXQA 3R12A 3C2VA 4MJZA 3I7QA 5KZEA 3TK7A 1TO3A 3Q58A 1XXXA 3CTLA 4O4WA 1ME9A 3L68A 5LNVA 5SWUA 4O1CA 5HWJA 2ZRVA 3M0ZA 1YXCA 5L6UA 1T99A 2QJIA 1H1YA 3YPIA 5KTLA 3PB0A 2ZQ0A 1JVNA 1TPH1 4O15A 2DZTA 5HUPA 3UXDA 3ABQA 1KTCA 3OVQA 2Q3OA 4NXSA 3GDKA 3STCA 3S9YA 3H55A 1YTKA 1R2TA 4ONVA 3TJXA 1LOLA 4DPQA 1XM3A 3LCGA 2FQIA 4GUFA 4QM1A 5FEZA 2NLIA 1FCBA 3ABOA 3PWAA 3HQ1A 2P10A 1VYRA 1EP1A 4K7YA 5I3KA 3HG2A 1QR7A 3NVTA 2NV1A 5C2XA 1OFAA 2BWGA 1F74A 4U28A 4HNTA 4X2RA 4Q4KA 3W76A 3DI0A 3TIMA 2NX1A 3BG5A 1FY6A 1EPXA 4E0CA 3LRMA 2WOQA 2Z2UA 2ZZ6A 4WX2A 5I3JA 2CLMA 1XUZA 2NXIA 2H8XA 4FF7A 3LXBA 3IIPA 4HPJA 3MMTA 5D2WA 1OFQA 1ZENA 4LV9A 4N02A 1K7XA 1XBZA 1B4KA 4FNSA 4DXVA 1I2PA 3KAOA 4UFIA 4DF0A 3QW3A 4NX5A 4WZHA 2JKAA 4UMAA 3KRUA 5F2IA 3INPA 2NX3A 3QSTA 4LTSA 3LCHA 2ISWA 3KX6A 1VJIA 1YXDA 5C55A 1B57A 2X1TA 1NAL1 2E5BA 4LS1A 4O0KA 4ORMA 3PF3A 3DXIA 1OG0A 2WNQA 3EX4A 3P81A 1J2WA 1VR6A 4IPIA 2CLOA 2JGQA 2CZDA 3DFSA 2TSYA 4AWTA 5FI8A 3NQ6A 1AL7A 1AW2A 3IIVA 4X9SA 4ZQMA 3NQMA 4FHAA 2DZSA 1VHNA 2QR6A 5HULA 1J4EA 1LRNA 4MZYA 1Z44A 4EWND 1YTDA 3RFAA 3GDTA 3LRKA 3QQ0A 2A7PA 4C1KA 3NYZA 3BLEA 5D03A 2QAPA 3CC1A 3W3OA 1DQWA 3TU9A 1BWLA 3C2OA 4WY0B 5D30A 3NO5A 3LV5A 4RZ6A 2J24A 1EX5A 2X30A 3TX9A 4YWIA 4XQ6A 3UWWA 1WDWA 1W3NA 4PTNA 1W54A 4IMFA 1C9DA 2H8ZA 1EUAA 4MOZA 4IQLA 3W2KA 3S5OA 1P4CA 1LCOA 1Q6OA 2QDHA 1YDOA 3CLMA 1R30A 1QPOA 1WX0A 2GQ8A 4JX5A 3SW6A 3PAJA 3LM7A 1H62A 3DBPA 1MZHA 3G1SA 3W6YA 1RQEA 2CFFA 4O54A 3BO9A 3W72A 1SW0A 3LI1A 5CGQA 3F4WA 2IQTA 1WYIA 2ZYFA 3BLFA 4H3DA 1HUVA 3GNDA 3W23A 1DORA 1M5WA 4AWSA 5G1YA 4A2SA 4MZ1A 1GTEA 4M6VA 4XUGA 2AAMA 2P1FA 4N4QA 3NQCA 4TR9A 1CX9A 1F2JA 4K36A 4M6PA 3MI3A 2YYUA 4DELA 1S5VA 3W1NA 4FX7A 1QMLA 1GVSA 5T26A 4JTEA 4CNOA 1D9EA 1QAPA 1TREA 1IGSA 1M7PA 1TMHA 3P5YA 5K9DA 5FF0A 4O1AA 3QFEA 1LBLA 2J88A 3GAKA 5K4XA 1JCYA 3EKZA 3M41A 3TC6A 3GAYA 1X6UA 1I2QA 1TQXA 2RHGA 3W1LA 5LNWA 1BEUA 1BKSA 3W74A 1IXNA 3M16A 1EWEA 3IGXA 3TSBA 2C19A 1YXYA 1NEYA 3KXQA 5EBUA 4IX0A 3S5YA 4B5NA 2X1UA 2FB3A 5EA9A 4GWEA 2NX9A 1ICQA 3NXFA 3B0UX 1KM2A 4L4MA 4AHOA 2ZZ4A 3HO8A 5AB3A 1WA3A 1W8SA 1TIMA 4L4LA 3MJYA 3CWNA 1UCWA 1W3IA 4IWWA 1SZGA 3N14A 5A5WA 4NNBA 3RK8A 5DCBA 3O05A 2V2CA 3H53A 2E77A 3FEMA 5K9XA 2V8ZA 3I7RA 2AGKA 4EIVA 1HO1A 3M6YA 1TPVA 8TIMA 4Y96A 1PL9A 5TIMA 3LCLA 1RQHA 3HGOA 1GT8A 3NR0A 3ELFA 4D2JA 4UFJA 1H63A 2ZZ2A 1UASA 1XBXA 3B0VC 3IGUA 1LP6A 3EWZA 1QFEA 3E49A 4XKYB 3LBCA 2ZTJA 3EEGA 3W83A 4LC6A 4UXDA 3CIXA 3UWUA 2R14A 2HTMA 5CZ0A 3QC3A 3CIWA 4O19A 1GJPA 3HGSA 4BWLC 1YYAA 2CZEA 1JUBA 1G4TA 1LRQA 3M9YA 1RPXA 4H4IA 4ZQNA 1D3HA 5E1QA 1QNVA 3FOKA 1XI3A 3PM6A 1OK4A 3EXSA 5MHBA 3O06A 5ABTA 3S8HA 3HOJA 1SPQA 4EF8A 3NQAA 2RDUA 2A0NA 1G69A 4DO4A 4O16A 4O57A 1H60A 4ZZ9A 3EWUA 4NVTA 3G1YA 2ATSA 4XBSA 1XL9A 1F7BA 3CEPA 1Y0EA 4NJIA 1Q6LA 4I7UA 1K3UA 2WO5A 4EF9A 4CNPA 3LGEA 1QDSA 3M44A 1I45A 3O15A 7TIMA 1XUUA 4RK8A 4O52A 5G4WA 1SR9A 4K6AA 3TH6A 2OX1A 2EGZA 3O8AA 2R8WA 1HG3A 3ZWTA 4EOUA 5CSRA 1SO6A 5KINA 4QSHA 3A22A 4JTKA 1SSGA 3MHGA 2XN0A 2V5LA 2QAFA 4R53A 2I9EA 2QF7A 3GLCA 1O95A 3NZRA 2YFNA 4TX9A 3I7SA 1JQXA 1TYGA 1YPFA 3L5MA 3P62A 4OWGA 1JQVA 4JIQA 1QWGA 1P0KA 4NNCA 1YTEA 3U6WA 3W1XA 1LORA 1I2RA 1OYCA 1X7FA 4FIRA 3BLIA 1ZAIA 3W7QA 4YCOA 3HB9A 5K4ZA 1W3TA 3P82A 3N2MA 2B7NA 1HFBA 4N9BA 4O14A 1F73A 1LLWA 2A1YA 3P80A 2BTMA 2A21A 1H7WA 3PULA 3EWWA 2QCGA 1ICSA 2QCLA 3G1AA 2QUVA 3GXTA 3HGRA 5LKYA 3GXNA 3S0CA 1GPWA 2QCEA 4GJ1A 4JXCA 3WJSA 1FCUA 4UTMA 4UNLA 3C3NA 4QNWA 4IMDA 3W2NA 3BW2A 3NM3A 1A5BA 1R47A 4GUJA 2ZRYA 2WPBA 1AK5A 4JTGA 4IMGA 3N3MA 5D2TA 2A85A 5FEXA 1SZFA 4U4MA 5GVJA 5HWNA 4WOQA 1Z42A 2FPTA 4DEFA 4UFHA 1AW1A 1OHLA 2OJPA 1MEIA 3GYEA 3EX1A 3TKFA 1I4NA 2CU0A 2Y7GA 2ZA2A 5F1UA 3P74A 3R89A 3WK0A 1AL8A 1OFRA 3LXCA 4HSOA 4DBEA 3PVFA 5I3IA 3MYPA 4PH6A 2Q8ZA 3PC0A 4EVZA 4IMEA 4O0ZA 4A29A 4JTHA 4G1KA 2CW6A 5CSSA 3P67A 2D73A 2VFIA 3SJ3A 1W5OA 2AQWA 1O94A 1SZEA 5AHMA 4R7JA 1G6CA 3S5NA 3W86A 2NXGA 2Y61A 3TCEA 1LTDA 5LNRA 4XTIA 4NU7A 3TJLA 3NM1A 3ABRA 1DJNA 1MXSA 1LROA 3ABSA 3UZ5A 5H2ZA 4JTSA 4I7VA 4DF1A 3OVPA 4X22A 4H6KA 4GBUA 4JDYA 3V1PA 1PIIA 2DJLA 1TPWA 4CQ9A 4S2BA 2VELA 1EUNA 1VCGA 2YSWA 4FNQA 4HHPA 3W22A 4UTHA 1B9BA 4GXMA 4LU0A 1H61A 4P2VA 1PCKA 2ZRUA 4JN6A 2E6DA 1KM6A 4O1BA 3FYPA 5CG7A 4AH7A 3UZJA 4K37A 4QIUA 1FQ0A 2ZTKA 5BMWA 3SGZA 2J9XA 3T78A 4ZQRA 3W1PA 5LHEA 3I68A 1CI1A 1VYPX 4PA8A 4ORIA 3FIGA 5HR6A 1K8XA 1U83A 2VXNA 1H50A 2VFFA 4A2RA 2VFDA 2ZCGA 5AHNA 2YX0A 1EB3A 3W1TA 3BV4A 3GIYA 3HGJA 2PRHA 3W1RA 1G4EA 3MP4A 1YDNA 5D37A 4JNMA 1RV8A 3R8RA 3TE9A 3F03K 4RKAA 2C18A 1KV5A 3TAOA 3L21A 1GG1A 2NUWA 4JTLA 4WUIA 3B05A 1N55A 1VRDA 1XDLA 1TV5A 2VENA 4UTTA 3T4CA 1NF0A 4HNVA 1Q3NA 3TW7A 5LNSA 2G5WA 4P61A 5L9FA 3S1WA 2ATMA 4Z0SA 5DBTA 1F5ZA 3UWVA 3W88A 3A21A 4NXKA 2YFOA 2A2IA 3UWQA 1W5QA 2DZWA 3W2MA 1SUXA 3WJYA 4BR1A 4QNEA 3UPBA 1RZMA 2G95A 1SW3A 3G1XA 5CPLA 4LVFA 1XBVA 3BVJA 3MP5A 2H3DA 2RFGA 3SGUA 5U7SA 2FPYA 2Z0IA 4RXGA 2A5HA 3VKJA 1A5AA 1L2UA 2A6LA 4KFNA 1J5TA 5D38A 3LHVA 1K8YA 1TRIA 1ZHAA 1YADA 3W87A 4CQ8A 2TMDA 3TXVA 4HNNA 3UYCA 1P0NA 3QMRA 1TPFA 2PRMA 4NX0A 4GRSA 4RR4A 1ALDA 3E02A 1W5MA 4CCEA 1L9WA 2F7FA 4JX4A 4LW7A 3G8EA 3PS7A 3Q2DA 2ZFAA 4HIBA 3G0XA 2QCHA 2CWNA 2YZRA 4UTKA 4W9TA 1SW7A 3IIOA 1HTIA 1H51A 4ML9A 2DZUA 3UXAA 2B7PA 2G96A 1JR1A 3HPXA 3M5XA 4MPQA 3W71A 5BNKA 4CNNA 3GDRA 1W37A 1YLVA 3GB6A 4MY9A 3TAKA 3W1UA 4GFSA 2FIQA 4ZMGA 2Y7DA 2W0UA 4YLWA 3QSRA 1TQJA 3LOTA 3A23A 4QJ1A 3QJAA 3KRSA 2NUXA 3FS2A 3LHWA 2WKJA 3DAQA 5EY5A 3RMJA 5FF7A 1MEWA 3Q94A 2TYSA 5CPMA 1XC4A 1DJQA 4LV4A 3B4UA 2Q8LA 1Q6RA 3CQ0A 1OABA 4UFKA 4FXSA 2A6NA 4LS2A 3C8FA 5E0KA 2DZPA 3MBFA 2QCFA 1DL3A 2W79A 2OMAA 3EWXA 3Q37A 3QPZA 4JYEA 5HINA 1SZNA 2J27A 2RH9A 1GG0A 3KVMA 2CLLA 3N19B 2QCNA 1XDMA 4JTJA 4I9AA 3IVTA 1TPEA 3UQNA 1QOPA 2PURA 3KVLA 2EAWA 3N73A 4IGHA 2Z6IA 5F1VA 4I7WA 2RKXA 5FF3A 3O6YX 3PG8A 1I8JA 2B0MA 4K8EA 4KKXA 1TPUA 3PBWA 2ALDA 1KM1A 2WSYA 3E0IA 1RD5A 3O16A 2RDWA 4N9DA 4RCXA 5F4WA 1DKWA 4Z1BA 2PC4A 3W1QA 1DBTA 1ML1A 3MWAA 4IOTA 2ZZ5A 1ONRA 3MP3A 4FEZA 1G67A 3TQ0A 3NQVA 1TPDA 3L0KA 4ZL1A 5DY3A 4FB7A 3PR2A 1S5WA 4YCPA 1VLWA 3B8DA 4O1DA 3NQ2A 3RU6A 4GUGA 5BMXA 2YW4A 1G4PA 4AB4A 3W07A 3NL2A 4MKNA 1RR2A 1EIXA 5G2HA 3MI2A 3USBA 5IBXA 3QPYA 5G5IA 4ZQPA 4OGZA 2QKFA 2GQ9A 3NQFA 3W7RA 4LVBA 5EMUA 4JTTA 3UNDA 3WK1A 4UC5A 2ZRXA 1TSIA 2BX7A 3IGSA 1H1ZA 1OFBA 3SFKA 4UTLA 1JRBA 2RDTA 1VH7A 1MEHA 3P60A 3W7KA 4NJHA 5DELA 5FESA 1TV8A 5A8GA 1JCJA 2ABBA 3C2EA 2Y62A 1QPNA 4YL2A 3A5VA 3I65A 2ZZ1A 3G0UA 4O12A 4UTWC 2OZ0A 2ISSA 2YR1A 3D0CA 3R13A 4X3ZA 3PUEA 5LSMA 6ALDA 2B7QA 2YPIA 4AAJA 5KMYA 1JUEA 5G2IA 4UTJA 1SFLA 3ZR4A 3EXRA 4AF0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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