2ZZ6A

Covalent complex of orotidine monophosphate decarboxylase from m. thermoautotrophicum with 6-azido-ump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz6A00
4JEQA 3S1VA 2ZTKA 1YTEA 1QNVA 4HIBA 3LHYA 5L9FA 1UJPA 5K3VA 3NQCA 3IGXA 1J4EA 5EL1A 1JCXA 3VCRA 5HWJA 5LHEA 4L4MA 1SSDA 2Y70A 3B4UA 5G2IA 1ZAHA 1AW2A 3KVJA 5F2GA 3DFPA 2QCDA 3FS2A 1I2NA 1SFJA 3N9SA 4MJZA 4PTNA 2ZZ1A 1SZFA 1OFQA 4O50A 4UTTA 1EWDA 2ZRXA 3TH6A 4JTJA 2H90A 1X1ZA 2C1HA 1SO5A 4PC8A 2FIQA 3PUOA 1TQXA 1GEQA 5J5DA 3TCEA 1J5TA 1EB3A 2FDSA 5DBUA 3PS7A 3HG2A 1A53A 1V7YA 1JCYA 4O0KA 1SFLA 4QNWA 2YXGA 1GQNA 3FLUA 1QPOA 3W83A 3L0GA 2ATMA 3LXAA 3W7DA 4IMGA 2FB3A 1UBSA 5LHFA 3VE9A 1KM5A 3NL3A 4UFLA 1TJRA 1XC4A 1XCFA 2FPTA 4WOZA 1EUAA 1WBHA 4N02A 4LV4A 3U6WA 3VKJA 1VC4A 4LUIA 3V75A 2Y89A 3V1PA 4K38A 1TSIA 4MUZA 5AFDA 3IIZA 1EP1A 3IEBA 3BARA 1GTEA 3DFQA 4OWGA 3OVQA 1SO4A 1SR9A 1ICQA 3O6CA 4ADSA 4DPPA 2QDGA 3C6CA 4FX6M 3GKFA 5DBTA 3ATZA 1SZEA 1VYPX 5EKYA 4UTLA 4DF1A 1K8ZA 1XDLA 3EX6A 1HFBA 4CNOA 3A9IA 3JRKA 2ZQ0A 2QCGA 1J2WA 4P61A 2A7PA 3LBMA 1FDJA 4JR5A 3I6RA 3NDOA 3HOJA 5G4EA 1GYLA 3MBFA 3EX3A 2G97A 3LHZA 1LBMA 2ZZ2A 1S3HA 1EP3A 3DI0A 4O17A 1EEPA 4OQVA 5LNUA 1VYRA 1QFEA 3MWAA 4UUIA 2V2HA 4LVAA 4E2BA 4MY9A 4JTKA 2NWRA 4XQ6A 1VCGA 4FNQA 4ZQRA 4AEOA 4OT7A 3S42A 4KFOA 2RFGA 4A22A 3P80A 5FF7A 1GPWA 1LROA 3QF0A 3CEUA 1JCLA 2NX1A 3LRLA 5TIMA 2CZFA 1TPH1 4IJBA 3GXNA 2NUWA 3W7QA 4XUGA 3RMJA 4PH6A 2E6YA 1W1ZA 4CNPA 4JD4A 4CNNA 4GWEA 2C19A 3N9RA 3W2UA 1H61A 1PHWA 4AHQA 1IF2A 3IIOA 3KRZA 3RFAA 2WQPA 2ZTJA 5G1TA 3TQVA 1JR1A 3INPA 1GJPA 2ZRWA 2ZZ4A 1FCVA 1MO0A 4ADTA 3M43A 2GUUA 5D09A 3S8HA 3QW3A 4UC5A 3EKLA 1TPDA 1XBZA 3GR7A 4NU7A 3UY7A 1TTJA 2RDUA 5CPNA 3DU0A 4XZ9A 5HQEA 5A8GA 1K7EA 3EWBX 2V82A 2GQ9A 2I1OA 2E5CA 3E02A 3Q2DA 5CGQA 1RQHA 1W37A 3ANYA 5BMXA 4Y90A 3YPIA 2NV2A 4X2RA 3RLVA 2WOQA 4ZQNA 4R34A 3DKJA 3TV8A 4WY0B 2H8ZA 2X30A 3M47A 2NX9A 1GVOA 3P62A 1FWWA 1LYXA 3PAJA 5KZEA 2QJIA 3TJXA 2D73A 3QZEA 4JTLA 4KFNA 4MIMA 1JQVA 5FEWA 2Y7EA 3C2EA 3PULA 2NX3A 3EX4A 3G18A 2QCCA 1DJQA 3QJAA 4MY8A 3TROA 3DFNA 2VFGA 1D9EA 3EWWA 3UPWA 2GJNA 5CKSA 4IPIA 3UZJA 3NYZA 4IXHA 5F1UA 4NZFA 3LTPA 4M6VA 3GDMA 2VOMA 2CZEA 5BW6A 1KM4A 5K2ZA 4HSNA 1XBYA 1TPWA 2JKAA 3GKAA 5ABTA 4H4IA 1ZALA 4AMAA 3BO9A 2UV8G 3A22A 1QOPA 1XL9A 3W2MA 5KITA 3H54A 1OFBA 4ZQMA 2GJLA 5F2LA 2B7QA 3W2NA 4O15A 1ALDA 1DBTA 3P60A 3TDFA 2A6NA 3O6DA 2AGKA 5AC6A 3BV4A 2J27A 1P1XA 1KM3A 3B03A 2Z1BA 3QMSA 2EF9A 4K36A 4RZ6A 2PURA 3SIZA 2PCQA 3DENA 1MEIA 3UXAA 3IRDA 2Q8ZA 1FUYA 1X1OA 1C9DA 1W5NA 4RR4A 3SSJA 1O95A 2BSLA 2ISSA 1H7OA 1KM2A 3KXQA 1W0MA 3HG3A 2NLIA 5AC8A 4N4QA 4N9EA 3L9CA 4W9TA 4O0ZA 2OJPA 2E09A 3G24A 2C13A 3T40A 2YSWA 4QSHA 3F4NA 4AXKA 5H91A 3FA5A 5G5IA 5CG7A 3CQ0A 2RHGA 1O60A 1XXXA 1DKWA 4E38A 2HS6A 4DXVA 1LBFA 2B7NA 5EPDA 3W7KA 3MP5A 1QWGA 1KV8A 3DHDA 3UPBA 4JTEA 3W71A 3NGJA 3SFKA 2WSRA 3MUXA 4N4PA 4LVDA 3LXBA 3NAVA 3UD6A 4CQ9A 3IVTA 1O5XA 4R33A 5FESA 1FXPA 1HUVA 4MYXA 2A85A 3GDKA 4BWLC 2YDAA 4TO8A 4I9AA 1JCNA 1MEWA 1ONRA 4WY0A 2F84A 4Z1CA 2CLHA 1VZWA 3C2FA 4K8HA 4AF0B 1IXNA 3EXTA 1GOXA 4ZVJA 4JTIA 3JS3A 3LCFA 3GNNA 4A3UA 5DY2A 4MKNA 1IXOA 1Q6LA 2FJKA 2Z6IA 3DZ1A 3HIJA 1VHNA 3NQGA 4MFEA 3AJXA 3QEZA 1X6UA 5C6MA 1KTCA 3N73A 4HNTA 4D2JA 2YR1A 5LSMA 4NJKA 2ZZ7A 1HO1A 2TSYA 2FQIA 5LNSA 3W1UA 2G5WA 1YLVA 3T7VA 4GJ1A 4O52A 5KSWA 2P10A 3S1UA 3P8JA 3PR2A 1KA9F 3UWYA 3CM4A 3S9YA 1Z41A 4WUIA 2YCEA 3C52A 4CCDA 3NXFA 3W7JA 5HWNA 3T4CA 4AWTA 3O15A 1LLZA 1FCQA 1ICPA 3B04A 5KZMA 4NXSA 1KLYA 1W3IA 2RDTA 3WJYA 5K7JA 3L68A 3Q58A 1LLWA 2Q8LA 5CSSA 4O1DA 1OABA 4LS2A 1Q6OA 2ATSA 2E6FA 1LOLA 3O07A 2ALDA 2JKPA 2Y88A 1SZNA 1JCMP 3MP4A 1E51A 4EIVA 4K37A 2A6LA 4GE8A 4IMFA 3W2KA 5D38A 1PCWA 2EHHA 4R53A 4YXGA 3I7QA 3FJLA 1DV7A 3W76A 1TB3A 4RCXA 4JDYA 2ABBA 4UXDA 1W5OA 3NM1A 3KVLA 4NQ1A 3SECA 1F76A 2VXNA 3IIVA 3W1RA 4QIUA 4A2RA 1CW2A 2Y63A 2W6RA 1H50A 1KBJA 2BX7A 4FXSA 4LOCA 4NNAA 5AHEA 1TYGA 3C2RA 1GG0A 1OK4A 3STCA 3CU2A 2ZZ3A 1I4NA 2XN2A 3BK0A 2VEIA 4IMEA 4AAJA 3HPZA 5HINA 3HF3A 3EEGA 3EWXA 1XI3A 3F1QA 1K02A 4U4MA 3B05A 3ATYA 5F1VA 4IUOA 1XKYA 4FIRA 3TSMA 4O57A 5I3GA 2J24A 3B8DA 1N8FA 1RPXA 1OFEA 2VFIA 2PRMA 4LRSA 1YYAA 5D30A 1MSSA 2TPSA 3LV5A 1QR7A 3W7IA 2NXHA 3I7SA 2LLEA 1A5CA 1RQEA 3DKLA 5E1QA 1HTIA 4AF0A 1VRDA 4O14A 1S5WA 3P74A 4I7UA 3N3MA 4N9CA 3PG9A 2P0OA 3R12A 3O16A 1R30A 2WO5A 3DAQA 3CEPA 2DZVA 3GLCA 1IIGA 2CLEA 4GUJA 3LXCA 1H1ZA 1L6WA 1B3OA 3UWQA 3HPXA 3LCIA 3GK0A 2Q3RA 1KM1A 3LM7A 1PIIA 1LOQA 4CCEA 4EF9A 5LNWA 4XTIA 4KWVA 4RZ4A 3W6YA 2EKCA 2R8WA 2QEZA 2QAPA 5CSRA 1JCJA 2DJXA 2A1YA 2GQAA 3MI6A 1LORA 4JTGA 4TIMA 3I65A 1TPVA 2FFCA 4S1FA 2X1UA 5EMUA 3TFXA 2GVLA 1P0NA 1JRCA 3GAYA 4KFPA 3NOEA 4C1LA 1Z44A 2PE4A 1ZENA 5I3JA 1W8SA 4GUIA 3MBDA 4BF9A 4LNYA 5U4NA 3R5EA 5D2WA 2Y62A 3NQ2A 5DCBA 3CHVA 3T55A 1M5WA 3JR2A 2OMAA 4RKAA 5D2VA 1ME7A 4UFIA 3USBA 3W88A 3M1ZA 2TRSA 1CI1A 4YMZA 2ZZ5A 4N2YA 1XUZA 4PL1A 5CZJA 2I9EA 1H60A 1H7PA 2XFWA 4UFMA 1SO3A 5MHBA 4DBEA 1OG0A 1QOQA 3P61A 1XFBA 1VJIA 3MP3A 2VC6A 5CZ0A 3W2LA 4ADUA 4AHPA 1WQ5A 2B0MA 1K8YA 3STFA 1DOSA 1QO2A 1TMHA 3NG3A 4X3ZA 2A5HA 3GDRA 2H3DA 1LM1A 2ZDRA 2NWSA 3RK8A 4PCFA 1OK6A 3NQ7A 1L6YA 4HPXA 1H7WA 1WOAA 3A5VA 1TPB1 1GYNA 2WJZA 4NNCA 2VFHA 1SQ7A 3M9YA 5FF2A 3S6DA 4IXXA 1A5BA 1GVFA 4DBDA 5C55A 3BPWA 3S5NA 3PBYA 4O13A 4YCOA 3TQ0A 4NJIA 5EBUA 1IGSA 3UZ5A 4CLMA 1RV8A 4ZL1A 3N14A 1R46A 5DCDA 4WX2A 1SSGA 3PF3A 2ISWA 2I14A 3IGSA 1H51A 5E93A 3HG4A 4GXMA 2JGYA 1V5XA 1UB3A 2CW6A 3R2GA 4XWUA 3W72A 4E2DA 2CZDA 3NQDA 3QM3A 3GB6A 1G4EA 1M7PA 2CLIA 1AG1O 1W56A 3O05A 4RJEA 4UMCA 3ZFHA 4CQ8A 4LVBA 1GVRA 3A24A 1FXQA 3G1XA 1G4SA 3GX9A 2AQWA 3GAKA 3EWUA 1LDCA 1P0KA 1TV7A 3LHTA 1YTDA 4RXGA 3W9ZA 4M19A 4POCA 2NZLA 3C4UA 4M5PA 2GQ8A 1T99A 3FYOA 4Y6GA 2YW3A 3W7CA 1Q6QA 2DZUA 4LW7A 1OFOA 1QO5A 5G1YA 2V8ZA 2ISVA 3B0UX 4MPQA 5DELA 2ZZ6A 3T78A 1SU5A 4MZYA 2E77A 2QKFA 2V2CA 3S0CA 4N9DA 5AHIA 2ZBTA 3LHVA 1W5MA 3W7OA 5DCEA 5SWUA 1K03A 1T0OA 2KZHA 5I3IA 2QAFA 3IVUA 4UTKA 4EOUA 5IBXC 5LKYA 4JTHA 2Y61A 4MY1A 4WXZA 1G69A 3DH7A 3PBWA 2BZNA 1F6PA 3M41A 3ELFA 4ZMGA 1OFDA 1AW1A 4BI5A 4MOZA 6TIMA 4UTWC 2ZRUA 4HKPA 2VENA 3LX9A 4O8RA 3WK1A 4JIPA 3IV3A 2GVGA 1UASA 2A4AA 4GUHA 3CC1A 1GT8A 3TX9A 2DZXA 5K9DA 3M5XA 3QQ1A 4FNPA 4IMDA 3W7NA 1ZHAA 1FX6A 1YXCA 3LI1A 1FWSA 1P4CA 1KLZA 3ABQA 1NEYA 3NL2A 3PSVA 2VEPA 3LHWA 5F2IA 3H53A 4JIQA 4RX0A 4UMBA 3FJ6A 3W85A 3G3MA 5AC7A 1N55A 4JICA 2OT1A 4FNTA 4MLJA 4HT3A 3K30A 3TMLA 4JYEA 3PY2A 1EUNA 4GRSA 1PE1A 3I7RA 2C15A 1VH7A 5D2YA 2G95A 3PC0A 5FI8A 2B7PA 3ABOA 1B4KA 5H2ZA 1B4EA 4IWWA 2VFDA 2OZ0A 4DO5A 4UTIA 4MZ8A 3TQKA 5LGXA 2GOUA 1GZGA 3N19B 3C0JA 4M7TA 3TK7A 1HO4A 3HGOA 3OA3A 1PHQA 1I2PA 4GC4A 4ML9A 1I2QA 2PRHA 2QCMA 4DQWA 1A5SA 1QAPA 3UWVA 3HGSA 5T26A 3W7GA 2E68A 2DZPA 4PFMA 2C16A 1HL2A 2HSAA 5LNVA 2RKXA 5LGZA 2DZSA 2HTMA 1SZGA 3TIMA 2BWGA 3MHGA 4Z1AA 1UUMA 5HR6A 8TIMA 3HGJA 3ZWTA 3A23A 3UNDA 2XN1A 3OG3A 3MHFA 3OIXA 3QMTA 4A2SA 2HMCA 3NQMA 4NJGA 3KAOA 3BLFA 4FNRA 2R91A 3FOKA 1H62A 4IOTA 4LTSA 3NVTA 4LVFA 4O4VA 4MFDA 4NVTA 3TE9A 4RK8A 1KV5A 3W7MA 3SGZA 3MYOA 1AW5A 3VI2A 1KFEA 3SI9A 3BG9A 5BRBA 3MYPA 1WA3A 5GVJA 1UCWA 4FO4A 3NNTA 1X8FA 4S2BA 5D32A 2RDWA 4K39A 1R2RA 3R13A 2WV8A 1RD5A 3QSRA 3L0KA 5A5WA 3P81A 2ZA1A 2ZFAA 3TMQA 4ORMA 1YDOA 2A2IA 1MZHA 3LGEA 3HJZA 1A5AA 1OFPA 3OVPA 1VPXA 5AHNA 1K3UA 2YW4A 1NFBA 1SPQA 1ZNNA 2X1TA 1IXPA 3PUDA 3O06A 1WV2A 2J9XA 2V81A 3PB0A 3NQ8A 2NUXA 1G7UA 3MO7A 3NPUA 4EF8A 4Z08A 1BTMA 1AMKA 1MXSA 2YX0A 4BI6A 1KW1A 1Y0EA 3HGRA 5HWMA 3G0UA 1Z48A 3NPXA 3CIXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FYY A;  3WDJ A;  3C5Q A;  2GLK A;  1UJP A;  2HWG A;  5XIM A;  5K3V A;  1MFU A;  3NQC A;  3IGX A;  5EL1 A;  1JCX A;  2WWD A;  3RME A;  2WZI A;  4C6C A;  3VZY A;  2WMK A;  4QJ5 B;  2NQZ A;  3B4U A;  1PX8 A;  5F2G A;  5RUB A;  2QCD A;  3HQO A;  4PTN A;  1SZF A;  3EB3 A;  2ZRX A;  3GTI A;  3P93 A;  3UFY A;  3L23 A;  1VBG A;  5LA1 A;  3F2B A;  5DBU A;  3DHU A;  4G56 A;  4O0K A;  4QNW A;  4F0S A;  2YXG A;  1QPO A;  3PN8 A;  4IMG A;  1A49 A;  4QEH A;  1UBS A;  3VE9 A;  3W38 A;  4FSA A;  2NQL A;  3EMZ A;  4HMD A;  4WOZ A;  1EUA A;  3VKJ A;  3U6W A;  1VC4 A;  4LUI A;  3FY1 A;  1B3X A;  4HGX A;  3IAC A;  3BAR A;  4Z2J A;  2GWN A;  1GTE A;  1UOZ A;  3QVQ A;  4OWG A;  4Z1Y A;  3JZU A;  1SR9 A;  4HZ7 A;  3O6C A;  2BHY A;  2QDG A;  3KBN A;  4GBD A;  5BWA A;  4PRW A;  4FX6 M;  5DBT A;  3ARW A;  3ATZ A;  2Z26 A;  5FOO A;  3HM7 A;  7A3H A;  5EKY A;  4UTL A;  4DF1 A;  3T8Q A;  1K8Z A;  3VDC A;  1QPK A;  4CU7 A;  3SCN A;  3OG2 A;  3PWG A;  2Y8K A;  1O6I A;  3RUB L;  1J2W A;  1YQ2 A;  2QYG A;  2AMG A;  3VDG A; 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