3A4WA

Crystal structures of catalytic site mutants of active domain 2 of thermostable chitinase from pyrococcus furiosus complexed with chito-oligosaccharides
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
GPNANPIPEHFFAPYIDMSLSVHKPLVEYAKLTGTKYFTLAFILYSSVYNGPAWAGSIPLEKFVDEVRELREIGGEVIIAFGGAVGPYLCQQASTPEQLAEWYIKVIDTYNATYLDFDIAAGIDADKLADALLIVQRERPWVKFSFTLPSDPGIGLAGGYGIIETMAKKGVRVDRVNPMTMDYYWTPSNAENAIKVAENVFRQLKQIYPEKSDEEIWKMIGLTPMIGVNDDKSVFTLEDAQQLVDWAIQHKIGSLAFWSVDRDHPGPTGEVSPLHRGTNDPDWAFSHVFVKFMEAFGYTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Kinetic and crystallographic analyses of the catalytic domain of chitinase from Pyrococcus furiosus- the role of conserved residues in the active site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 112
structure length 301
sequence length 301
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3a4wA00
5I5RA 1E71M 5A6BA 1EA9C 3WUGA 2ZWZA 2X0YA 4E8DA 3VIGA 2Y8KA 1JFXA 5DT5A 1BGGA 1OGBA 4UQDA 1MQQA 2XHYA 5C8BB 3MUY1 1FA2A 3WH9A 2VL4A 1X6NA 1UKTA 2EJ1A 5D8WA 3VDAA 5AY7A 3WH8A 4DWSB 4QAWA 1TMQA 3HU7A 5A2BA 4HOZA 1OCQA 2WVSA 2GDUA 3AXXA 2FGZA 4TUFA 2DSZA 3VIPA 1C93A 1J0IA 4TX6A 2WPGA 5A2AA 3NSMA 3POHA 5GNXA 3ARSA 2HVMA 2VO5A 3QOKA 2DIEA 4OKDA 1V6WA 2CBJA 3AYRA 1R86A 2WCSA 2XVPA 2BV9A 5IHRA 3WMBA 1KXHA 3U57A 2XFRA 3VO0A 5C70A 4LPCA 2VVNA 3VGGA 3AYSA 1EDQA 5ABFB 1AMYA 4AZ7A 4BCEA 1IV8A 8A3HA 1JD7A 1F4HA 4HPHA 2YL5A 1Q4NX 1MW1A 4Y7EA 2WMIA 4W8BA 1S46A 3VM5A 2YA2A 1PX3A 3BSGA 5CLWA 1UD5A 3WD3A 5A6KA 3PTKA 4D6JA 2X0HA 1E4IA 3GH4A 3WUFA 2DPEA 4GPNA 2WHKA 2OYMA 4ML4A 1CGXA 1H4PA 2XGIA 3RILA 4AZIA 3SUSA 2EQDA 2VX4A 3BAWA 4CGTA 2WZEA 4D6EA 5BROA 2WMJA 2GSJA 1E43A 1PZ3A 1UWSA 4C7GA 2ZX6A 3A4AA 2J7EA 1V3JA 4NRRA 1XH1A 1BQCA 1CIUA 4GQQA 1KGWA 2WSKA 1QNOA 1MWOA 1MQRA 3SCRA 1QI3A 1KFWA 3B8SA 3GNPA 3UESA 1DHKA 4UFKA 5HBFA 1CXHA 4GI9A 3AMDA 3L2MA 4QLJA 2Y8VA 1J01A 2V3EA 3WDHA 1TZ7A 4DUVA 3VDBA 1QBBA 4P7NA 4Z2HA 5E0FA 1HJVA 3LPOA 2GJXB 1VEMA 1UD6A 1UZ1A 5CZKA 1KGXA 4D6IA 1U30A 4PTWA 1V3IA 1B31A 1FH8A 1UR2A 1W9DM 4ZEPA 4M82A 4Z2KA 2VZUA 2ZXAA 2WVTA 4UFLA 1V6XA 3HMCA 3GH7A 1QW9A 2WC4A 3ARVA 3BGAA 1CZ1A 3IAQA 1IZJA 1QHPA 2G3JA 4PMDA 3OGSA 3MMDA 5CPSA 1V03A 5GQBA 3RIKA 3WF0A 1XC6A 1H41A 2WAGA 2OYKA 4H2CA 1IT0A 2CCRA 3I3BA 3W24A 4D71A 3MO4A 3BSHA 3SIMA 1H11A 2YDSA 3QHMA 4AWEA 2XVGA 4PSPA 1HL9A 3GTNA 3UR8A 1NWRA 3WN6A 1C91A 3IJ7A 3PHAA 4CN6A 2VZOA 2WW5A 3QHOA 3WSUA 3WNNA 4CU7A 1FOBA 1H2JA 3BAXA 3PZGA 1JF5A 1MQPA 3VD5A 2A3BA 2Z1KA 1KBBA 2VCBA 3CH9A 1C90A 4AZHA 5AC4A 3GBDA 4TVUA 4UQ9A 3CMJA 2O9PA 2D23A 3AFBA 1X1NA 3M46A 4RE2A 1BYAA 4BQ3A 2E4TA 1CXLA 2F61A 4MNKA 2VX6A 1MXGA 1W2PA 4JFUA 4MJ4A 1Y7VA 3D5HA 3K8LA 1G0CA 2D20A 3PZTA 5A6BD 4ACYA 5CG0A 3AJ7A 3WDJA 1KGUA 3VX0A 3O9NA 4UZSA 3WNLA 4UOJA 2J7BA 1C8YA 3RM9A 3VOCA 2DEPA 4HZ6A 4S3KA 1AQ0A 2WNWA 3ARTA 4J27A 3WBAA 1UOKA 4QCFA 3PZNA 1WE5A 5A6MA 1FH7A 1FHLA 5BXTA 3ZMRA 4QP0A 4AZCA 1UR1A 4TVCA 4CVWA 3N04A 1J0HA 1SR0A 5CSUA 4PRWA 5ABHA 2WMIB 4A3YA 3TTSA 3ARRA 4ATDA 4AZBA 2EPMX 1E15A 4LGXA 1B3WA 1NWSA 1CGVA 4FLSA 3AS2A 4RE4A 4KWUA 4F79A 3E1F1 1J0YA 1E6RA 2GJPA 2EPNA 1I75A 1UR9A 5GPRA 4Q22A 2WK2A 2YA1A 3ARUA 4D1IA 1HJQA 1BLIA 4V2XA 1NOUA 5HOSA 5FL1A 1BVNP 1K9FA 3FHQA 4TX8A 1UWTA 4LYQA 4J3WA 5JIWA 3K1DA 1KBKA 1GHRA 1LWHA 4F66A 1ISXA 1E3XA 3VD4A 4MAZA 3SCWA 3BAYA 4AD5A 2VT0A 3U7BA 1N82A 1RP9A 3LPGA 2ZUTA 3T0BA 5A69A 2E9BA 1DWJM 4BF7A 4B9YA 2G3MA 1XRVA 4Z2LA 4OIFA 1CXKA 1SMAA 4UNIA 4B3KA 3WF4A 2OLHA 3J7HA 5D4YA 1B30A 1UZ4A 2J75A 3IAPA 1LLOA 1JDAA 4DWSA 4MNJA 5I23A 2CESA 4D6GA 2RGLA 1D2KA 4AD2A 1BAGA 2BHZA 2V5DA 5DMYA 1VIWA 7A3HA 4B16A 4MNLA 4CN4A 3QGVA 1JDCA 5BXSA 5D9OA 5I77A 4J3TA 1XYZA 4P8XA 2WXDM 3ALGA 1JAKA 1RPKA 2DDXA 4FMVA 1PIFA 3PN8A 1UR8A 1CGWA 3BLKA 1JI1A 4GZEA 5BRPA 3GNOA 2DSUA 4M1RA 1YHTA 4V28A 3FXYA 2BHUA 1VRXA 2UWFA 4PTVA 3WQWA 5EFFA 3MANA 5I2UA 2PWGA 2D1ZA 1QNSA 1PEZA 2V3FA 1ITCA 3WNKA 1V0LA 2FHBA 2WC3A 3ARQA 1WDQA 2OSWA 4P8WA 1G5AA 4XB3A 4PMQA 1TA3B 3F4VA 4HA4A 1ZJAA 1LQ0A 1H0IA 4ZXLA 3AMCA 3W82A 1EGZA 2NSXA 2X1IA 1K9EA 1UH2A 1A3HA 3FW6A 3W81A 3W27A 1JL8A 3KWXA 3UR7A 1E70M 2DH2A 3SCQA 1XGZA 1EQPA 4W8LA 5I78A 1JDDA 2YL9A 1PJ9A 3N12A 4R5EA 3L2LA 3VILA 4MB1A 1WNOA 4W7VA 1TVNA 5AC5A 1JXJA 2CITA 3KE0A 1JZ7A 2Z1SA 2XVNA 1KXVA 4JHZA 1AQMA 2XWDA 2AOSA 4CD4A 5LA0A 3AQUA 1V0NA 3ARWA 4U31A 4W5ZA 4AY1A 9CGTA 4FLQA 3K4AA 3ARXA 4S3JA 1KWKA 2BY0A 2E0PA 3CBWA 2E8ZA 4HTYA 1F4AA 1W3HA 2ZOXA 4FF5A 1OM0A 2VVSA 4HZ8A 4AZCB 4KGLA 2ESCA 1E73M 3VM7A 3K46A 3VIHA 3OZOA 3A47A 2FH8A 2GJXA 4TTUA 4HU8A 5A2CA 3TONA 2CBVA 2BY1A 2Y2WA 1JAEA 4PTMA 5A8OA 2W67A 1TUXA 1JFHA 4AIUA 2JALA 2JE8A 2UY4A 3DYPA 2D24A 2PWHA 4PMRA 3HN3A 2Y24A 3BAIA 5A6AA 3AIWA 1V08A 1E9LA 4FLOA 1XD1A 1HXJA 4MB3A 1JG9A 5FOOA 5A6JA 3N18A 2V5CA 3APGA 3CZKA 1W3LA 1HVQA 3OGRA 1E55A 3WL0A 1W9BM 1B3VA 2OWWA 4CCDA 1NP2A 5HPCA 3AIBA 5LYRA 2W62A 1JZ3A 1WDPA 1QNPA 5ECUA 4AEFA 1XH2A 3WL1A 3CGTA 4EK7A 3CZJA 4JHOA 1KR0A 4X0VA 3EDDA 1UD3A 4H41A 2QHAA 3CLWA 4JFVA 3W28A 1ODUA 1BYDA 4KH2A 4Z2GA 3AXHA 5GNZA 2XSBA 1CBGA 3CO4A 7CGTA 5FIPA 1JYXA 4M8UA 2IXVA 1Q6DA 4OOZA 4W87A 3WUBA 2W5FA 3F5LA 4ZE5A 3SCUA 1G94A 4UR9A 3PZOA 1H3GA 1UR4A 2B31A 2QPUA 1JZ2A 4AZGA 2WMFA 2ZIDA 3VU2A 3ZT5A 2VTFA 2XWEA 1R85A 3CZ8A 4BA0A 3AZTA 4XX6A 1B2YA 1TCMA 3UCQA 1JYNA 4EANA 1HF6A 3RO8A 4W8AA 1Q6CA 3WD4A 2PBOA 1VENA 2C7FA 1R8LA 3W53A 1W9VA 3B9DA 2BVTA 3EBVA 3AICA 1XSIA 4CD5A 1KXQA 2YLAA 2DQXA 3DHPA 3SEPA 4WSJA 2WZIA 3WDIA 2CXGA 4UFIA 2OWCA 1OSEA 1VFMA 2EEXA 3N17A 3VNYA 1JZ8A 3F5KA 3WQVA 1LG2A 1WZAA 2HISA 2VRJA 3MMUA 4AIOA 4DWSD 2CEQA 2XUCA 1SYTA 4UFJA 1CGTA 2VRQA 3N11A 4JL2A 5M17A 1H49A 3U5UA 2JIWA 3GBEA 1EO7A 1QI0A 3SCTA 1NM9A 5CLTA 3WQ8A 5A8PA 4HMCA 1BYCA 2J25A 1EDTA 1GQLA 1PX8A 1ZJBA 3VIJA 1GCYA 4GO8A 1UUQA 3PZMA 3L4WA 3WDQA 3ALFA 4XV0A 4ZE4A 1V6UA 5F7UA 1QBAA 3CZGA 1XHGA 4GINA 3NDZA 2OSYA 5E6YA 4WKHA 3WENA 1HJXA 4WF7A 2ZXQA 1BG4A 3PZUA 1VFOA 2XIBA 2ZUUA 1HL8A 2JFEX 1XSJA 4U33A 4TOQA 3VD3A 5C71A 1WCGA 4IUGA 2XSAA 2ZX9A 3VNZA 5A1AA 3AISA 1GQJA 1BF2A 3MV11 1V3HA 3LPFA 1VBUA 4C7FA 4TTGA 1JIBA 1GW1A 1E6NA 3MS8A 3WDRA 4OBSA 1ESWA 3BMWA 1BVZA 3VTRA 5ABGA 3A6OA 1DEDA 4B9ZA 2G3NA 1RH9A 3OGVA 1QI4A 2XFFA 3CTTA 1CWYA 2ZUSA 4P7QA 2ZX5A 1M7XA 3N9KA 3OZPA 1HKMA 5BWFA 1E6ZA 1O7AA 4D6DA 4M56A 1UKSA 2XM2A 3ZT6A 4U5IA 2WHMA 2YLLA 4WLCA 1B3XA 2JF7A 3TTOA 3AS1A 1U33A 3GYCA 5IXEA 3QOMA 5A6SA 2J4GA 4F9DA 5IHSA 2WANA 2JEPA 3MUAA 3W6LA 3CIVA 4HA3A 5BYWA 4HMEA 4M29A 2AMGA 1NQ6A 1FFRA 1XCXA 1E4LA 1CXEA 1G9HA 3VIMA 1R7OA 3OA5A 4AYSA 3SCSA 3WD0A 1V3MA 3CUJA 1ZBKA 3WQ6A 4DM1A 1W2VA 3MU7A 1UWRA 4E2OA 3QR3A 1E40A 3FNDA 1UH4A 1JI2A 1WZMA 3KL5A 2VI0A 3PTQA 1FP8A 1V02E 4HOWA 3WEMA 5I24A 4DUWA 1TA3A 3FHAA 1GPFA 3WNOA 3ZR6A 4RE3A 2ZE0A 1H09A 1OIMA 3WBEA 3U7VA 2BY3A 1QPKA 3PZVA 1V02A 1VJSA 4F9JA 2EXOA 5JBFA 3OLEA 1C8XA 1MXDA 3MUZ1 1UQYA 2VCCA 2X2YA 4R27A 4ZENA 2PBGA 3GXIA 2PWEA 1GVIA 1HP5A 4UZUA 3SCPA 1VEPA 3W0KA 1W1VA 2J8FA 2QMKA 2ZWYA 1EOMA 1WPCA 1PX4A 3ZM8A 1GORA 5I0DA 4PYSA 1E6PA 1ZBWA 2J79A 1R7AA 3W38A 1B1YA 2NT1A 3AS0A 1HJWA 1V0MA 1H5VA 3VMNA 3AHTA 3EYPA 1OGGA 2J7GA 1OWQA 1J10A 2GK1B 4XUYA 4U3AA 4QLKA 3N1AA 4P8UA 2A3CA 3NUKA 2QMJA 1XCWA 2GVYA 3T0DA 4IISA 2XPKA 2GDVA 3PZQA 4X9YA 3DYOA 5E0CA 1GOKA 1SMDA 2J47A 3CPUA 3WUEA 3VGFA 4NSBA 1B9ZA 1JZ4A 3W25A 3TTYA 2W63A 2A3AA 3AXIA 3WFLA 1W3JA 1VAHA 5I79A 1J0KA 1E4MM 2XJ7A 4UQCA 3BAKA 4N0RA 4LYPA 2WKGA 4GKLA 2AAAA 4WIWA 4WKAA 2JEQA 2Y4SA 1PPIA 4OZOA 1VFFA 5CPTA 4KMQA 1GQKA 1V6YA 2CKRA 3OBAA 4D6HA 3T09A 1W1YA 4UQBA 1ODZA 1QI2A 2PB1A 3UEQA 5EFDA 2NW0A 3WH5A 2WBKA 5E70A 3FY1A 5CQ1A 2O9OA 3BH4A 4ATWA 2DSKA 5D9MA 2G4FA 2WVVB 3ZJ6A 4BZYA 3VX1A 5A8QA 5JBDA 2DT1A 2CKSA 3WY1A 4DWSC 4JKKA 5AYBA 4NI3A 3T0AA 3VINA 1M53A 2VQTA 4HP5A 1BSIA 1EHNA 2VRKA 3BAJA 4PMYA 4A4AA 5A94A 4W85A 2O92A 2CERA 3SUTA 4AD0A 1CNVA 2V3DA 3OLIA 3VIFA 1GOQA 1MFVA 3NSNA 1JXKA 1QOXA 1H1NA 1M03A 3PZ9A 2W4XA 1QNQA 1MW3A 3MV01 3WDPP 2ZXDA 1U2YA 4ZXOA 4MTVA 4L4PA 1QW8A 1W32A 3EDEA 3HJEA 3THDA 3AHZA 1OINA 1LL6A 3BXWA 3SCOA 3B9EA 3ARYA 1CLVA 4J3UA 3ZOAA 3GXDA 4J3XA 1J12A 2VR4A 3LMYA 2VJXA 2YDQA 1C92A 4DUXA 3W37A 1O6IA 1KR1A 4E4PA 2D2OA 1EQCA 1L0PA 2CETA 1JNEA 2FDMA 2CYGA 1GUVA 4WJXA 1E1FA 2ZX7A 3VGHA 3M07A 5M3WA 5FD0A 4M81A 1Q6FA 2VC9A 1TG7A 1KQZA 3AZRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5I5R A;  1E71 M;  5A6B A;  1EA9 C;  3WUG A;  2ZWZ A;  2X0Y A;  4E8D A;  3VIG A;  2Y8K A;  1JFX A;  5DT5 A;  1BGG A;  1OGB A;  4UQD A;  1MQQ A;  2XHY A;  5C8B B;  3MUY 1;  1FA2 A;  3WH9 A;  2VL4 A;  1X6N A;  1UKT A;  2EJ1 A;  5D8W A;  3VDA A;  5AY7 A;  3WH8 A;  4DWS B;  4QAW A;  1TMQ A;  3HU7 A;  5A2B A;  4HOZ A;  1OCQ A;  2WVS A;  2GDU A;  3AXX A;  2FGZ A;  4TUF A;  2DSZ A;  3VIP A;  1C93 A;  1J0I A;  4TX6 A;  2WPG A;  5A2A A;  3NSM A;  3POH A;  5GNX A;  3ARS A;  2HVM A;  2VO5 A;  3QOK A;  2DIE A;  4OKD A;  1V6W A;  2CBJ A;  3AYR A;  1R86 A;  2WCS A;  2XVP A;  2BV9 A;  5IHR A;  3WMB A;  1KXH A;  3U57 A;  2XFR A;  3VO0 A;  5C70 A;  4LPC A;  2VVN A;  3VGG A;  3AYS A;  1EDQ A;  5ABF B;  1AMY A;  4AZ7 A;  4BCE A;  1IV8 A;  8A3H A;  1JD7 A;  1F4H A;  4HPH A;  2YL5 A;  1Q4N X;  1MW1 A;  4Y7E A;  2WMI A;  4W8B A;  1S46 A;  3VM5 A;  2YA2 A;  1PX3 A;  3BSG A;  5CLW A;  1UD5 A;  3WD3 A;  5A6K A;  3PTK A;  4D6J A;  2X0H A;  1E4I A;  3GH4 A;  3WUF A;  2DPE A;  4GPN A;  2WHK A;  2OYM A;  4ML4 A;  1CGX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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