3A4XA

Crystal structures of catalytic site mutants of active domain 2 of thermostable chitinase from pyrococcus furiosus complexed with chito-oligosaccharides
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
300
structure length
299
Chain Sequence
GPNANPIPEHFFAPYIDMSLSVHKPLVEYAKLTGTKYFTLAFILYSSVYNGPAWAGSIPLEKFVDEVELREIGGEVIIAFGGAVGPYLCQQASTPEQLAEWYIKVIDTYNATYLDFAIEAGIDADKLADALLIVQRERPWVKFSFTLPSDPGIGLAGGYGIIETMAKKGVRVDRVNPMTMDYYWTPSNAENAIKVAENVFRQLKQIYPEKSDEEIWKMIGLTPMIGVNDDKSVFTLEDAQQLVDWAIQHKIGSLAFWSVDRDHPGPTGEVSPLHRGTNDPDWAFSHVFVKFMEAFGYTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Kinetic and crystallographic analyses of the catalytic domain of chitinase from Pyrococcus furiosus- the role of conserved residues in the active site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 112
structure length 299
sequence length 300
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3a4xA00
4AD0A 2VX6A 3ZR5A 2QPSA 3SCVA 3WL0A 1W3HA 3BAWA 3EMCA 1E73M 1CXHA 2WWCA 3VIGA 3ZMRA 2DT0A 2CBJA 2BVTA 2DSWA 1B3WA 1LL7A 4AD3A 4AZCB 1EOMA 1CXKA 4FLOA 1UUQA 3II1A 4P8VA 2WMGA 3AMCA 1ZJAA 1QPKA 2XIIA 4CCDA 1HP5A 4GI6A 1HKKA 4JKMA 3WD1A 2ZE0A 3LPGA 1G9HA 1D2KA 3QHNA 3VUPA 3L2LA 4GXPA 1QI0A 5BWFA 2X0HA 3VX1A 1OGGA 2XSAA 1JZ7A 3M07A 3ARQA 4W7WA 5A2AA 4KMQA 4LGXA 1G5AA 4DWSA 1KCLA 1GCYA 5HPCA 1QOXA 3MV01 1E1FA 4MNLA 1UKSA 2XVGA 2PWGA 1GPFA 5ABHA 3AIEA 3AQUA 2PI6A 3NUKA 3KE0A 4NRRA 1JDCA 2ESCA 1E6RA 1GHRA 2WYSA 4JZ5A 4JKLA 5GNYA 1JZ3A 4HMCA 2OLHA 1JZ5A 1OSEA 1MYRA 1DWFM 2X2YA 1RP9A 2BHYA 3PTKA 5BXPA 4H41A 4AD1A 1NWUA 5E0CA 1JD7A 3T2QA 1V02E 2WC4A 5HPOA 5A3HA 1OD0A 1FH9A 2YA1A 3M7SA 5D9OA 1AVAA 2AMGA 2PBOA 3CHEA 1GVIA 4AYSA 3K1DA 2J62A 1KBKA 1W3LA 4FLSA 3VGGA 1JFXA 1O7AA 3PZ9A 2CIPA 3WNMA 2GJXB 2FGLA 4HZ7A 1IV8A 4D6GA 1ISVA 4MJ4A 4D6EA 5BROA 2UY4A 2W91A 3PZNA 5E0FA 3WQ8A 3VILA 1VBRA 1VJSA 4PMYA 3VD9A 5JIPA 2DSUA 3S2CA 4B9YA 1W1YA 1UR2A 1J11A 1KQZA 5AYBA 2WBKA 4GQQA 5I0DA 2WLZA 1CGTA 5I23A 3B8SA 2VQTA 4BQ4A 4OOZA 3ARTA 4PSRA 2OWXA 2UWFA 2W62A 2ZX6A 2YBUA 3UESA 1ZS2A 1ZJBA 4U5IA 5JBFA 2GK1B 2WVTA 3VVGA 2WKLA 2IXVA 4U5KA 4XB3A 3GTNA 2WVSA 3RCNA 1NWTA 5EFFA 3WY1A 3L4UA 1EH9A 1BYDA 3VD7A 1GUVA 1WO2A 2JE8A 1WKYA 2JF7A 1PJ9A 1PZ2A 3AHYA 3MU7A 2BVYA 1QI5A 4M56A 4CU8A 4MTVA 1BPLB 2X05A 4TVUA 1H4PA 2VI0A 3GH4A 3WNOA 1ZBWA 2W5FA 1VBUA 4D6DA 1HL8A 3BLPX 1FA2A 1UH3A 1PX8A 3FHQA 3WL1A 2RGLA 1TMQA 3BMWA 4TX8A 3MKKA 2J75A 1G0CA 2V5DA 3CLWA 3GXDA 3WH7A 2PC8A 2E8ZA 3CHDA 1V6XA 2XGBA 5I24A 3BSGA 3EYPA 3WEZA 3ZIZA 3VD4A 5A6BD 1C8YA 3ZOAA 5E9AA 4TTGA 1V3HA 1J0YA 3BC9A 1E56A 2JIWA 3WDQA 1H0GA 4QDMA 4Z2KA 3W81A 3KL5A 3ARVA 1VJZA 5BYWA 2VX5A 1JZ2A 3L4VA 1QNRA 3MMUA 1UD5A 2QHAA 3VX0A 1B3ZA 1V6UA 5A6AA 3N17A 3AIVA 1V03A 4UFKA 1DWGM 3M46A 1E55A 1J0HA 5DEZA 4M80A 3WFLA 1U2YA 4ML4A 2XGIA 4CGTA 4W85A 3PZMA 1KGUA 3J7HA 2X0YA 4Y7EA 1TG7A 4RL3A 1C91A 4R27A 4BS0A 5CGTA 3WQVA 3ZT7A 2FHFA 2YBTA 3M6DA 1BYBA 3OZPA 2Z1SA 5CJ5A 1SR0A 1EHAA 1Z32X 4LQ1A 4W5UA 4AZHA 2C0HA 1CXIA 1JD9A 2D0HA 5HOSA 3EDFA 4B15A 4MAZA 4P7NA 5HNNA 4YHEA 5C70A 2VMFA 4W88A 5BXTA 1R85A 5GNZA 4UOQA 1JIBA 5M03A 1SMDA 4AZGA 4HZ8A 4WKFA 4K68A 1HVQA 1WDQA 3ZR6A 4U3CA 5A8MA 2X1IA 5CZKA 1QW8A 4UOZA 2GJRA 2EXOA 4U3AA 4OZOA 2YLLA 2FDMA 4XZBA 4CD7A 1AMYA 1FHLA 1KXTA 1V3KA 2XVNA 1UWUA 3ZM8A 3AXHA 4DM1A 2J74A 1US3A 3CIVA 4PTWA 1WE5A 3CZKA 1FH7A 3CTTA 4E4PA 2WMIB 1I75A 1J9YA 1JDDA 5CQ1A 3VGEA 2DSVA 1HVXA 5D8WA 3WMSA 3AIQA 1W9XA 3QHMA 4L4OA 2G3MA 3VMNA 3BXWA 4PSPA 2XWEA 1OGSA 4CD5A 4D6HA 3ARSA 2O9TA 4J3XA 3E1F1 3SCTA 2YL5A 1W3KA 3ARWA 3A4XA 3AMLA 4UFJA 4GO9A 4UZSA 4GZEA 4LYQA 4LPCA 1M03A 1B3XA 4UFHA 4UR9A 4F8XA 4XZWA 5CLWA 5HXMA 1OBAA 5A94A 2GJXA 2JALA 2V3FA 3VO0A 3BCFA 2WHKA 3K8LA 1CDGA 1UZ1A 1C3FA 1E9LA 2NSXA 1A47A 4W7UA 2CBUA 3WQWA 1JXKA 1H41A 1E6XM 4PMNA 2VUYA 1HT6A 2O9RA 1E70M 1CYGA 3I3EA 1NOFA 1FFRA 4AZ6A 4DWSC 3DYPA 3SUSA 5I78A 1WZAA 4TVDA 1JNEA 2A3AA 3G6MA 1UZ4A 1CECA 4W87A 3HMCA 1CGYA 5LA0A 1AQ0A 3W29A 2YOCA 1VAHA 2GK1A 1HKIA 3MUIA 2ZIDA 4W8LA 1CIUA 4PEEA 4CD6A 3U5YA 3WNPA 1HXJA 2XIBA 5A6KA 4DUVA 1ZBKA 1VF8A 1P6WA 5IFPA 3T2OA 3F5JA 3VIKA 5CPSA 1NQ6A 3A4AA 1OIFA 3CZ8A 1UWTA 2XM2A 3AS3A 5DT5A 4B3LA 4CD8A 5ABEA 2VCAA 5A8NA 3OGVA 1V02A 2DT2A 4ZFMA 4BQ3A 1UWRA 4W86A 4S3JA 3WELA 3WUBA 1QHOA 1WNOA 3AYSA 1XGZA 1C8QA 3SEPA 1KGXA 4BQ5A 1UOKA 2DGAA 1UD4A 2YKKA 1B31A 1EXPA 3PTQA 2ZICA 4R5EA 2EPLX 1W1PA 3NYDA 1H2JA 1UR9A 1E5NA 2WZIA 9CGTA 2YL6A 1BYCA 3O2LA 4Q7NA 4AZ7A 1CZ1A 5CPQA 4AIUA 1OGBA 3A47A 4GO8A 2F2HA 4QLKA 4M29A 4KRUA 3WDIA 3WD3A 1ISXA 1H09A 1X6NA 1WCGA 3WEOA 1WZMA 5F7UA 1US2A 3WUEA 2DEPA 2YLAA 1GOMA 3T09A 2EPOA 3QGVA 5LA1A 2D23A 2YDQA 2CBIA 4Q22A 5KZ6A 4J3TA 3ZJ6A 2VJXA 1VFOA 1CENA 2WKGA 4AD2A 3UERA 1QHZA 2Q8XA 3LMYA 3NSNA 4JHOA 1E6ZA 3B9AA 1ZL1A 1PBGA 3VGHA 4FMVA 4KRTA 3FNDA 4WSKA 1UR4A 4CN1A 2W92A 1X6LA 3RIKA 3CUGA 4HOWA 4UFLA 4HA3A 2Y2WA 3OLEA 1BTCA 1PIFA 4HA4A 1UKQA 2WMFA 2CESA 1UA3A 1W9PA 4H8UA 3UETA 3K4DA 1J18A 3UG4A 3IJ8A 1HJXA 4JCMA 1UA7A 4F9DA 3K46A 3TOPA 3UR7A 5JBEA 4GI8A 1K6AA 2DSKA 4JL1A 4TTUA 1DTUA 1RH9A 5D4YA 1JZ4A 1QNOA 1W2VA 3L4XA 4MB3A 2WM0A 3N18A 1JYXA 4GZJA 2O92A 3O9NA 4P8XA 2VRQA 2BHUA 3TONA 4GIAA 3TTSA 3WDHA 2X09A 1W9BM 5IFTA 1UQZA 4WSJA 2XUCA 2J7DA 4P7LA 3D5HA 3D3AA 2V38A 5ABGA 4PUDA 2XYLA 1UYQA 1YHTA 3BGAA 4A3YA 1QI3A 1V0NA 3AXXA 2BHZA 3VOCA 1NP2A 2OSXA 4HMDA 3W24A 4IPLA 2WMIA 3EDDA 5FL1A 2DT3A 2WCAA 4V28A 4JIEA 2G3JA 3T0AA 1LQ0A 4TVCA 2D2OA 4GZIA 2BFGA 4HP5A 2VCBA 1Q6CA 4AISA 4GI9A 3MSDA 4IPNB 5IXEA 4QP0A 2XTKA 3AIUA 5KEZA 2GSJA 4M81A 4MNMA 4X0NA 1HN1A 2E0PA 5FOOA 3BMVA 4OKDA 2XFRA 1E3XA 2QLYA 3QOKA 3ZJ7A 1W3JA 3VIPA 1ZBCA 4PRWA 1QBAA 1UD2A 2XG9A 2J7EA 3CZEA 1WB0A 5I2UA 1XHGA 4RE2A 2BV9A 1ISWA 3K8KA 3KL3A 3VMPA 4C7DA 4PMVA 1E0XA 2EQDA 4TX6A 2OYLA 4UQBA 3MSGA 4WKHA 5BCAA 5M17A 3W4RA 3OG2A 4QLJA 4U33A 1YQ2A 3PBGA 3U7BA 3T0DA 4JFWA 4CVUA 2VR5A 1BHGA 5DMYA 1CTNA 4J3SA 1UR8A 3CUIA 4OUEA 3GNRA 1GOIA 3TA9A 1NWRA 1V3IA 4W89A 4QFUA 3RMEA 1BSIA 1LL6A 3L4WA 1CGWA 1CLXA 5A1AA 3AHVA 2ZUWA 1F4AA 1DEDA 2WVVA 3N9KA 1L0PA 4OBSA 3W26A 1GOOA 5FD0A 3MUAA 1FH8A 4D6CA 5A2BA 1KXVA 3GXIA 3GXFA 1ITXA 1X1NA 1EDQA 1BG9A 1UKOA 2NW0A 2XFFA 5I77A 2O9PA 1MW2A 1I1WA 3CUHA 4BF7A 3GYCA 3WMBA 2CXGA 1MW0A 1BAGA 2J7FA 1JYNA 3WDRA 1R7AA 4W5ZA 5JBDA 2D0GA 3A3HA 1UHVA 4HOXA 3AIWA 5CXPA 4GQRA 4PTXA 3WF3A 2E9BA 4DUWA 1QNPA 1VFMA 2WHLA 2DH3A 5GQBA 2WW5A 3VNYA 2EJ1A 4ZE5A 1XYFA 1V0LA 1W91A 3UG3A 1U33A 2YDRA 3ZJ8A 1EA9C 1TCMA 4P7OA 4KWUA 2J25A 1MQPA 2FH6A 1UR1A 5LYRA 2OWWA 1C90A 1HIZA 3TTYA 1FHDA 1RD6A 1BLIA 4KGLA 1HL9A 1Q6FA 2NT0A 1EHNA 1L8NA 4HZ6A 3WF0A 1VEOA 4D6FA 3IJ7A 4FK9A 2PWDA 1XSJA 4A4AA 4PMXA 2GUYA 1TZ7A 3RO8A 2J8GA 2OSWA 4V2XA 4AWEA 1WDSA 3WD2A 1NOUA 1PPIA 3IJ9A 3RJYA 3CH9A 2WSKA 1S46A 4JFSA 4J3WA 3THCA 4DWSD 1ZU8A 1OCQA 1EDGA 1FP8A 1E6QM 2VOTA 1GJUA 1JXJA 1CXLA 1H11A 3VIFA 1PX4A 2BS9A 2J7CA 4QCEA 1WDRA 2OYMA 3PTMA 2VRJA 2CHNA 2ZXBA 3T08A 1LJYA 1VRXA 5LA2A 1OWQA 3PZUA 1SFSA 2WB5A 5A95A 2CNCA 4IISA 3VTRA 4TXEA 1JAKA 2B31A 4H8HA 5E6YA 1KXQA 1TA3A 1OT1A 2VZTA 2HISA 2D24A 2YIHA 5D9PA 1WZLA 4JFVA 5M5DA 1C92A 1LG1A 5JIWA 1OD8A 4D6JA 1JYVA 2JEQA 3ZT6A 2WNWA 5BRPA 4QCFA 3OB8A 2BNJA 1MW1A 3FHAA 4HU0A 3RM8A 4JKKA 3PZGA 4AZ5A 2DPEA 1QBBA 2XVKA 1CXEA 2WK2A 1V0MA 4EANA 2GVYA 2VRKA 3AS0A 3DYOA 2WMHA 3ARPA 3VIHA 4BQ2A 4ACZB 4CN4A 1FOBA 1KCKA 2FGZA 1ODZA 1GW1A 2D22A 2WWDA 3AIBA 1MQRA 4Z2IA 3NIYA 2QMJA 1D3CA 1UKTA 1C7TA 2JF6A 3KEHA 4XX6A 5EBAA 3AHTA 4OIFA 1E6SM 3W25A 4LYRA 1GQJA 4JL2A 3WNKA 1WDPA 1VFFA 4FLRA 3JUGA 3W38A 4NZCA 3DHUA 2D3LA 1J01A 1CPUA 3GZAA 4P8WA 3ARRA 4MPKA 5DO8A 3N11A 3BAJA 5FCZA 2ZXDA 3BAKA 3WBEA 4UQCA 5JUVA 4JFUA 1XSIA 3WDPP 1GZJA 1B3VA 4CVWA 1CNVA 1J0IA 1JNDA 1VENA 1GQIA 3LPOA 2WAGA 1OINA 4EKJA 1W32A 4YHGA 2WC3A 3GH5A 3F5LA 3BAIA 4AD5A 4DUXA 4WKAA 4UZUA 4F79A 1G94A 3ZSSA 3CZJA 1J10A 4E8CA 4LXFA 3W28A 3OA5A 1HKMA 4UQ9A 1A3HA 2AAAA 8CGTA 1J0ZA 2VVSA 3N12A 3WUGA 1G01A 1KGWA 1QW9A 1B2YA 1OB0A 1SYTA 1B30A 2E9LA 2XVLA 5HDRA 2J7HA 2VX4A 1B0IA 3EDKA 1UWIA 8A3HA 2ZWZA 3KL0A 3OGSA 3AHZA 4OOUA 5DT7A 4Z2GA 1GNXA 4CN6A 1V0KA 2CBVA 1NM9A 3U5UA 4Z2JA 5HBFA 4ZXLA 2J7BA 2BY0A 3VGBA 1XH2A 4V27A 2CHOA 6A3HA 3EMZA 3BSHA 2ZUVA 4LX4A 3SCSA 1M53A 2WVVB 3PZIA 1E0VA 2CETA 3RJXA 4W8AA 1GQKA 3WF4A 4W84A 3PN8A 1OIMA 4X9YA 3ZO9A 1KR0A 3ZT5A 2D1ZA 4E8DA 5FIPA 4UCFA 2ZUSA 2F8QA 1BQCA 3AHXA 3MMWA 2WCGA 1Q6GA 2DDXA 4ZENA 1AQMA 1UD8A 3I3DA 2YJQA 1DP0A 1M01A 3N13A 1HF6A 5A8OA 3L4ZA 2QPUA 4JHZA 1N82A 4Z2HA 3UCQA 2V5CA 5DF0A 1BFNA 3VIJA 2CKRA 1TVNA 1XD0A 5BXSA 1BG4A 1HJVA 2J78A 1DWJM 2J7GA 4XV0A 1J0KA 2BY2A 1J0JA 4BZYA 1ESWA 2V3EA 1GOKA 1H3GA 3AI0A 3AZRA 5E09A 3N04A 1DWIM 1WP6A 2XVPA 1CGXA 3SCWA 3RM4A 5IHRA 2E9MA 3TP4A 4PMZA 2GFTA 1CBGA 3MO4A 1R86A 1VFUA 3ARYA 4QAWA 3G6LA 4UQDA 3AMGA 2V3GA 1UD6A 4X0VA 3AMKA 1JG9A 1TE1A 3CPUA 2HVMA 5I3DA 1E15A 1O6IA 2G4FA 2OWCA 3F5KA 3I3BA 4W7VA 2YA0A 3PZOA 1WZKA 4RE4A 3SCPA 5CGMA 4ATDA 4M8UA 3FAXA 1HKJA 4D6IA 1LL4A 3VINA 3T0BA 2WC7A 4AIOA 4D1IA 3VGFA 4PCTA 4W8BA 2PWFA 2G3NA 5I5RA 3L4YA 1XC6A 2O9OA 2YA2A 2ZWYA 1V3LA 4J7RA 3CBWA 2FHCA 1ZBVA 1MW3A 1DWHM 1UWQA 1QNSA 5M3WA 1GOQA 2J4GA 3POHA 3WKZA 4AY1A 3CMJA 1EO5A 1XCWA 1UWSA 1ISYA 3WD4A 3WEMA 3K8MA 1E0WA 4WLCA 5IDIA 3U57A 2WBGA 4AW7A 3DECA 4ZXOA 3VDCA 4ACZA 1K9FA 3BCDA 2ZX9A 2PBGA 1NARA 1RPKA 3PZQA 5EB8A 3AICA 1TA3B 4RE3A 1W1VA 1W9VA 1VEPA 4PCSA 2J8FA 2CYGA 5A6BA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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